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文檔簡(jiǎn)介
1、BDFACSCalibur流式細(xì)胞儀FACS101Handbook本課程推薦表面抗原流式分析有關(guān)之基礎(chǔ)工作原理。如希望進(jìn)一步了解流式細(xì)胞技術(shù)應(yīng)用,請(qǐng)至本公司網(wǎng)站訂閱FACSinformation電子報(bào).tw/bdb/index.html如需要本課程手冊(cè),歡迎至本公司網(wǎng)站下載.tw/bdb/10-5-3-1.html。如需要免疫熒光染色方法,請(qǐng)至本公司網(wǎng)站下載.tw/bdb/10-5-4-1.html一、BDFACSCalibur基本結(jié)構(gòu)1.1儀器本體:1 .電源開(kāi)關(guān):在BDFACSCalibur儀器右側(cè)下方,先啟動(dòng)儀器本體,再打開(kāi)計(jì)算機(jī)。鞘流液液流遇油器2 .光學(xué)系統(tǒng):BDFACSCalibu
2、r基本配有一支波長(zhǎng)488nm的僦離子雷射以BDFACSCalibur基本型為例FSCDiode只收488nm波長(zhǎng)散射光SSCPMT只收488nm波長(zhǎng)散射光FL1PMT熒光光譜峰值落在綠色范圍(波長(zhǎng)515-545nm)FL2PMT熒光光譜峰值落在橙紅色范圍(波長(zhǎng)564-606nm)FL3PMT熒光光譜峰值落在深紅色范圍(波長(zhǎng)>650nm)產(chǎn),l#li卡總rtfinclivtif3.LO:樣品流速:12/minMED:樣品流速:35日/minHI:樣品流速:60日/minRTC£JFPFMLPCFSlEBOTHHduiPrm抵itsTOTO-ImPRdlF1WKJCfeil0vii
3、LAJvXt仲R儀器面板:儀器前方面板的右下方有三個(gè)流速控制鍵、及三個(gè)功能控制鍵。流速控制:功能控制:RUN:此時(shí)上樣管加壓,使細(xì)胞懸液從進(jìn)樣針進(jìn)入流動(dòng)室。(正常顯示綠色。黃色時(shí)表示儀器不正常,請(qǐng)檢查是否失壓。) STANDBY:無(wú)樣品或暖機(jī)時(shí)之正常位置,此時(shí)鞘液停止流動(dòng),雷射功率自動(dòng)降低。 PRIME:去除流動(dòng)室中的氣泡,流動(dòng)室施以反向壓力,將液流從流動(dòng)室沖入樣品管,持續(xù)一定進(jìn)度后,以鞘液回注滿流動(dòng)室。PRIME結(jié)束,儀器恢復(fù)STANDBY狀態(tài)。4.儲(chǔ)液箱抽屜:在主機(jī)左下方之儲(chǔ)液箱抽屜??上蚯袄_(kāi),內(nèi)含鞘流液筒、廢液筒、鞘液過(guò)濾器SheathFilter,及空氣濾網(wǎng)Airfilter。請(qǐng)注意
4、氣路減壓閥VENTTOGGLE之位置。 鞘液筒:位于抽屜左側(cè),容積4升。裝八分滿鞘液筒,儀器可以運(yùn)行大約3小時(shí)。筒上裝有液面感應(yīng)器,鞘液用完時(shí),儀器軟件上會(huì)有顯示。鞘液筒蓋上有金屬環(huán)扣,保證鞘液筒密閉。 廢液筒:位于抽屜右側(cè),容積4升。筒上裝有液面感應(yīng)器,廢液盛滿時(shí),儀器軟件上會(huì)有顯示。注意廢液可能有潛在的生物傳染性。 鞘液過(guò)濾器:0.22Mm過(guò)濾器,去除鞘液中的雜質(zhì),保證進(jìn)入流動(dòng)室的鞘液是干凈的。 氣路減壓閥:沿箭頭方向移動(dòng)閥門開(kāi)關(guān),鞘液筒減壓,氣壓恢復(fù)正常。在鞘液筒添加鞘液時(shí),需要減壓。 空氣過(guò)濾網(wǎng):用于過(guò)濾冷卻雷射的空氣。5.上樣品區(qū):上棟管支撐架上樣品區(qū)是樣本管的上樣位置。它包括三個(gè)部
5、分,一個(gè)是進(jìn)樣針SampleInjectionTube,將樣本輸入流動(dòng)室,還有就是支撐架TubeSupportArm、和液滴存留系統(tǒng)DropletContainmentSystem。進(jìn)樣針:是一根不銹鋼管,將細(xì)胞從樣本針中吸入流動(dòng)室。進(jìn)樣管外有一套管,是液滴保留系統(tǒng)的一部分。支撐架:用于支撐樣本管、并負(fù)責(zé)啟動(dòng)液滴存留系統(tǒng)。支撐架有三個(gè)位置:位于樣本管之下的中位,樣本管左側(cè)或右側(cè)。液滴存留系統(tǒng):系統(tǒng)由支撐架、真空幫浦和外套管組成。當(dāng)支撐架位于左側(cè)或右側(cè)位置時(shí),真空幫浦就會(huì)啟動(dòng),將液體從外管吸入廢液筒內(nèi)。上樣時(shí),須注意將支撐架位于中位,以避免過(guò)多樣品被抽吸到廢液筒內(nèi)(當(dāng)支撐架位于中位,真空幫浦停止
6、工作)。更換樣品時(shí),讓儀器保持RUN勺模式,使得進(jìn)樣針可以反沖。切換到STANDB模式前,確保液路已沖洗徹底以免碎片沈積到流動(dòng)室中。1.2Macintosh計(jì)算機(jī)與打印機(jī):準(zhǔn)備您的細(xì)胞樣品1.2.夢(mèng)想樣品濃度調(diào)至細(xì)胞樣品務(wù)必放至1-10X105cells/ml?一般實(shí)驗(yàn)只需0.5ml的樣品。BDFALCON352052試管中,否則無(wú)法上機(jī)。3.上機(jī)前務(wù)必去除樣品中之細(xì)胞團(tuán)塊,以防止管路堵塞?可使用附濾網(wǎng)BD4.5.二、開(kāi)機(jī)、FALCON試管(Cat.No.352235)或35-55Mm的尼龍篩網(wǎng)。供流式分析的樣品是單細(xì)胞懸浮液,而且大部分樣品都需經(jīng)熒光染色。表面抗原熒光染色的方法大致有兩種:直
7、接免疫熒光、間接免疫熒光染色。研究生可至本公司網(wǎng)站下載染色方法.tw/bdb/10-5-4-1.html直接免疫熒光染色 Lysed-No-WashProcedure Lysed-And-WashProcedure,SimulTEST&HLA-B27 PeripheralBloodMononuclearCellProcedure LeukemiaandLymphomaProcedure1 LeukemiaandLymphomaProcedure2,B-cellClonalityAssay 間接免疫熒光染色 滴定抗體濃度 常用試劑e-mail:.tw。如因特殊因素?zé)o法下載上述實(shí)驗(yàn)方法,請(qǐng)
8、關(guān)機(jī)標(biāo)準(zhǔn)制作2.1 FACSCalibur開(kāi)機(jī)1 .開(kāi)啟細(xì)胞儀電源。2 .開(kāi)啟其它周邊配備電源,如打印機(jī)及MO機(jī)。3 .開(kāi)啟計(jì)算機(jī)。4 .確認(rèn)鞘流液筒有八分滿的FACSFlow,確實(shí)旋緊(鞘液筒容量為4L)。5 .將廢液倒掉,并在廢液筒中加入200ml家用漂白水(廢液筒容量為4L)。6 .將減壓閥方向調(diào)在加壓(Pressurize)位置。7 .排除液流管路與過(guò)濾器中的氣泡。8 .取下樣品管,執(zhí)行PRIME功能兩次。9 .使用1mlPBS,HIGHRUN兩分鐘。10 .可開(kāi)始分析樣品。2.2 FACSCalibur關(guān)機(jī)關(guān)機(jī)前必要?jiǎng)幼鳎呵逑催M(jìn)樣管和外套管,防止進(jìn)樣管堵塞、或有染料殘留。1. 將樣品
9、支持架左移,取2mlFACSClean(10%Bleach)上樣品,讓儀器的真空系統(tǒng)抽取約1ml的液體。2. 將樣品支持架回正,按HIRUN,然后讓FACSClean清洗管路10分鐘。3. 按Standby,取下樣品管,執(zhí)行PRIME功能兩次。4. 取2mldH2O,重復(fù)上述步驟1-3。5. 注意最后只留約1mldH2O在試管中。6. 按STANDBY五分鐘,使風(fēng)扇冷卻雷射后,關(guān)閉細(xì)胞儀(必要?jiǎng)幼?,以保護(hù)雷射光源。)7. 倒掉廢液,并回填200ml漂白水。8. 將減壓閥放在VENT漏氣位置。將鞘流液筒充填至八分滿。9. 退出軟件“File”“Quit”(如有對(duì)話選項(xiàng),選擇“Dontsave”)
10、。確認(rèn)退出計(jì)算機(jī)中所有BD應(yīng)用軟件,所有數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)已儲(chǔ)存?zhèn)浞荨?0. 關(guān)閉計(jì)算機(jī)?!癝pecial”“Shutdown”。三、上機(jī)分析進(jìn)程安建議首次試機(jī)避免進(jìn)行大量試驗(yàn),僅需準(zhǔn)備下列樣品。(1)NegativeControl(不加任何抗體)。( 2) CD3-FITC(FL1單染)。( 3) CD19-PE(FL2單染)。( 4) CD3-FITC/CD19-PE(FL1/FL2雙染)。1.1 Calibur開(kāi)機(jī)1. 先開(kāi)啟細(xì)胞儀本體再打開(kāi)計(jì)算機(jī)。*秘技1:如順序相反,儀器和計(jì)算機(jī)之間無(wú)法建立正常通訊,無(wú)法執(zhí)行“connecttocytometer”。解決之道,兩者都關(guān)機(jī)、然后以正確方式重開(kāi)。2
11、. 向前拉開(kāi)儲(chǔ)液箱抽屜,檢查鞘液筒、廢液筒水量,如需充填鞘液,將減壓閥方向調(diào)在VENT位置(箭頭方向)。3. 儀器會(huì)對(duì)鞘流液筒打氣加壓,請(qǐng)確認(rèn)筒蓋確實(shí)旋緊。*秘技2:將減壓閥方向調(diào)在加壓(向前)位置。減壓閥如在VENT(箭頭方向)位置,按RUN功能鍵時(shí)將顯示橙黃色(表示儀器不正常,請(qǐng)檢查是否失壓),正常為綠色顯示。1.2 開(kāi)啟CellQuest軟件、編輯實(shí)驗(yàn)文件4 .在蘋果菜單下點(diǎn)擊CELLQuest啟動(dòng)軟件。桌面會(huì)出現(xiàn)一Untitled'實(shí)驗(yàn)文件,可點(diǎn)擊實(shí)驗(yàn)文件的右上角的放大鈕,將實(shí)驗(yàn)文件窗口放大。5 .從工具板中點(diǎn)擊散點(diǎn)圖圖示。在實(shí)驗(yàn)文件的空白區(qū)點(diǎn)擊,拖曳對(duì)角線至適當(dāng)大小,然后放開(kāi)
12、鼠標(biāo)。出現(xiàn)散點(diǎn)圖對(duì)話方框。散&四6 .在出現(xiàn)的散點(diǎn)圖對(duì)話方框中點(diǎn)擊PlotSource,選擇Acquisition(收?。?,確認(rèn)X和Y軸參數(shù)預(yù)設(shè)為FSC-H1024、SSC-H1024。在顏色方框中點(diǎn)擊MulticolorGating(收取樣品時(shí),門內(nèi)細(xì)胞將出現(xiàn)顏色)。點(diǎn)擊OK。此時(shí)實(shí)驗(yàn)文件會(huì)出現(xiàn)FSC/SSC散點(diǎn)圖。7 .說(shuō)明:散點(diǎn)圖(Dotplot),又稱二維散點(diǎn)圖是流式分析最常用圖譜,它可以顯示兩個(gè)獨(dú)立參數(shù)的相互關(guān)系。在圖中,橫坐標(biāo)X軸為為熒光1強(qiáng)度的相對(duì)值,單位是道數(shù),縱坐標(biāo)Y軸則通常表示熒光2或光散射強(qiáng)度的相對(duì)值。儀器使用者可因應(yīng)實(shí)驗(yàn)需求來(lái)修改所有圖譜中顯示之參數(shù)。第一圖X和
13、Y軸參數(shù)分別設(shè)為FSC-H1024、SSC-H1024。第二圖X和丫軸參數(shù)分別設(shè)為FL1-H1024、FL2-H1024。修改動(dòng)作為輕擊圖譜上X和Y軸參數(shù),并依需要選擇之(FSC:細(xì)胞大小,SSC:細(xì)胞折射率,F(xiàn)L1:FITC綠色熒光,F(xiàn)L2:PE橙色熒光,F(xiàn)L3:PerCP紅色熒光)。8 .從屏幕上方Plots菜單中選擇DotPlot功能,可復(fù)制一個(gè)同樣大小的散點(diǎn)圖,在出現(xiàn)的對(duì)話方框內(nèi)選擇X軸:FL1-H1024,Y軸:FL2-H1024。點(diǎn)擊OK,FL1/FL2的散點(diǎn)圖出現(xiàn)。完成后可將重制圖移至原圖右方。9 .在工具板中選擇四象限工具,在FL1/FL2散點(diǎn)圖上拖動(dòng)Quadrant的中心將它
14、設(shè)定在(x,y)=(101,101)處,這些象限將指定陰性/陽(yáng)性區(qū)域。建立儀器和計(jì)算機(jī)之間通訊10 .從Acquire菜單中選擇ConnecttoCytometer,此時(shí)會(huì)出現(xiàn)AcquisitionControl對(duì)話方框。如果無(wú)法選擇ConnecttoCytometer,參考秘技#1。如果沒(méi)見(jiàn)到AcquisitionControl對(duì)話,可到屏幕上方Windows菜單中選擇ShowAcquisitionControlo口中二:二二正;二二:植ionContTMDFile:HSetup|AcquireRestartAbort儀器設(shè)置文件注意:實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)質(zhì)量,取決于最適化儀器設(shè)定文件。儀器設(shè)定文件不能
15、在數(shù)據(jù)收取后再更改,研究人員必須在第一次就使用正確的儀器設(shè)定文件。儀器設(shè)定文件(Instrumentsettings),含信號(hào)器高壓(Detector/Amps),閾值(Threshold),熒光補(bǔ)償(Compensation)等儀器條件的組合。一般而言,儀器設(shè)定的順序?yàn)镈etector/Amps-Threshold-Compensation。11.檢查現(xiàn)有儀器條件,從Cytometer菜單中選擇Detectors/AmpsDetectors/Amps性放大),其它拖至空白區(qū)。出現(xiàn)Detectors/Amps窗口。在窗口確認(rèn)FSC與SSC為L(zhǎng)IN(線FL1-3為L(zhǎng)OG(對(duì)數(shù)放大)Cytomet
16、erPlatsGenetecfors/flmpsThreshold妹CompensationStatusInstrumentSetting:SortCountersTime-Del。目Clibr©tak4LJk4':.:.:Threshold-1-»I-I181-1S-1-S1|7JPrimarySecondaryszgP-rom:®FSC-HS2gjQSSC-KOSSC-Hs.j0FL1-HOFL1-HQFLZ-HOFL2-H5,QFL3-HOFL3-HS26JQFL4-HNone12 .從Cytometer菜單中選擇Threshold,出現(xiàn)Thresh
17、old窗口在Threshold窗口:確認(rèn)FSC為設(shè)閾參數(shù),初步確認(rèn)預(yù)設(shè)閾值52。將其拖至空白區(qū)。13 .從Cytometer菜單中選擇Compensation,確認(rèn)所有預(yù)設(shè)數(shù)值皆為零。將其拖至空白區(qū)。3.3上樣品、設(shè)置儀器14 .使儀器處于HighRUN,支撐架左移,上陰性對(duì)照管樣品,支撐架回位。確認(rèn)AcquisitionControl窗口中Setup前需打叉或打勾(即不儲(chǔ)存數(shù)據(jù)),點(diǎn)擊Acquire。調(diào)節(jié)FSC/SSC探測(cè)器(電壓)15 .觀察FSC/SSC圖的變化。FSC電壓(Voltage)預(yù)設(shè)為E00,可調(diào)節(jié)AmpGain從1.009.99使主要細(xì)胞群得以清楚顯示(如細(xì)胞較大,將FSC
18、電壓設(shè)置于E-1。較小細(xì)胞,將FSC電壓設(shè)置于E01)。調(diào)節(jié)SSC電壓使主要細(xì)胞群得以清楚呈現(xiàn)。調(diào)節(jié)FSC/SSC圖的原則,在于能得到一獨(dú)立離散的細(xì)胞族群,該細(xì)胞群不與其它族群、細(xì)胞碎片有重迭現(xiàn)象。調(diào)整定位后,點(diǎn)擊AcquisitionControl窗口中的Pause。Gating圈選細(xì)胞檢品中,常含有大小不同、性質(zhì)相異的細(xì)胞群體。我們常用前方散射與側(cè)方散射的二維位圖,即散射光圖譜(ScatterPlot),來(lái)圈選出不同細(xì)胞群的范圍,選擇性顯示出有意義的細(xì)胞群體,如下圖圈選白血球之淋巴細(xì)胞族群。16 .在工具板中選才i多邊形的Region,在FSC/SSC散點(diǎn)圖上劃定淋巴細(xì)胞R1區(qū)域(如下圖)
19、。分析樣品時(shí),區(qū)域內(nèi)細(xì)胞應(yīng)會(huì)呈現(xiàn)成紅色,可移動(dòng)或改變形狀來(lái)圈選有意義的細(xì)胞。如果要?jiǎng)h除R1區(qū)域,您可以在工具列中點(diǎn)選GatesRegionFormatdotplot望Gate的FoG1=R1。點(diǎn)擊IOK。量核球淋巴球plo5.5-OJ£17.至i一黑苞性球【圖,從Plots菜單中選擇的對(duì)話方框內(nèi),將FSCFSC-H255在出現(xiàn)品.二.調(diào)節(jié)FL1、FL2山黃翎能沁擊J睇9/24list,以鼠標(biāo)點(diǎn)選R1,再按Delete鍵刪除R1區(qū)域。刪除R1區(qū)域后,可用繪圖工具板,重畫R1。18 .點(diǎn)擊AcquisitionControl窗口中的Restart。在Detector/Amps窗口中調(diào)節(jié)F
20、L1、FL2的電壓,使NegativeControl細(xì)胞群著落在所選直方圖或散點(diǎn)圖之100-101處。19 .在Threshold窗口,適當(dāng)?shù)靥岣逨SC閾值52,以去除碎片或低階噪音。唯需注意不要切掉主要細(xì)胞族群。20 .點(diǎn)擊AcquisitionControl窗口中的Pause、Abort。移去陰性對(duì)照管,關(guān)閉Detector/Amps、Threshold窗口,我們已設(shè)定好有意義細(xì)胞群之自體熒光。調(diào)節(jié)熒光補(bǔ)償說(shuō)明:最適化的最后一步是調(diào)節(jié)光譜重迭。(如是單色熒光實(shí)驗(yàn)可跳過(guò)此步驟)如是2色樣本,必要時(shí)需調(diào)節(jié)FL2-%FL1,FL1-%FL2(若3色樣本,必要時(shí)需調(diào)節(jié)FL2-%FL1、FL1-%F
21、L2、FL3-%FL2、FL2-%FL3的補(bǔ)償)。FL2-。礁毒FL1FL3FL3-。姍%FL2FL3-Q創(chuàng)fl密:感:%FL4FL4-%FL3FLI-0.0®鬟FL221 .HighRUN,換上單染CD3-FITC管。點(diǎn)擊AcquisitionControl窗口中的Acquire。調(diào)節(jié)FL2-%FL1使FITC陽(yáng)性細(xì)胞在FL1/FL2散點(diǎn)圖的右下象限。補(bǔ)償調(diào)節(jié)可通過(guò)點(diǎn)擊J來(lái)選擇或直接拖動(dòng)滑標(biāo)上下移動(dòng)。調(diào)節(jié)完畢,點(diǎn)擊AcquisitionControl窗口中的Pause。22.移去單染CD3,換上單染CD19-PE管。點(diǎn)擊AcquisitionControl窗口中的Restart。調(diào)
22、節(jié)FL1-%FL2使PE+細(xì)胞在FL1/FL2散點(diǎn)圖的左上象限。調(diào)節(jié)完畢,點(diǎn)擊AcquisitionControl窗口中的Pause。23.最后以CD3-FITC/CD19-PE雙染樣本上機(jī),點(diǎn)擊AcquisitionControl窗口中的Restart,確定三群細(xì)胞工整垂直。當(dāng)您已完成2色熒光之光譜重迭時(shí),點(diǎn)擊AcquisitionControl窗口中的Pause、Abort。3Fit-0.3#霽FL2FLZ-36.哪落FL1FL?-o.olfl客FL3FL5-zz.elfl塞fL2FL3-需FL4FL4-立礴%fL3旦:二二”g則廳口51小二二:回CratedonLymphos10
23、6;101103103FL1,H口BLmoL工CN-JIL.10*24.移去樣本管,換上dH2O管,讓儀器暫且處于Standby狀態(tài)。關(guān)閉Compensation窗口。您已完成2色熒光之最適化。3.4收集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)決定儲(chǔ)存細(xì)胞總數(shù)25.預(yù)設(shè)之儲(chǔ)存細(xì)胞總數(shù)為10000。如需修改,從Acquire菜單中選擇Acquisition&Storage,并在出現(xiàn)的窗口功,確認(rèn)CollectionCriteria從10000ofAll,再點(diǎn)擊OK。Require|flequisitipnPforageParameterDesEriptionEustomKeyiuardsCountersEditReag
24、entlist,.EditPanels.QuantiQuestDisconnectfromCytom;jevcnls.FACSCalikurC-lI匕通tiuiiCrittriikjeYtnts中乾»iinU4舄w4llvbei>StaraqBGale:PatafinewillctnUln-IEancel1IResoPullion.L-2J1UN4PflirameteFSSaved.gtwIFlowEventCount:Jcvcnt4.26 .找個(gè)檔案匣準(zhǔn)備儲(chǔ)存數(shù)據(jù)。從Acquire菜單中選擇ParameterDescription,出現(xiàn)ParameterDescription
25、對(duì)話方框。點(diǎn)擊Folder,并在隨后出現(xiàn)之對(duì)話方框,選擇YourFolder或新建活頁(yè)夾,點(diǎn)擊此對(duì)話方框的Select'YourFolder'。27 .命名即將儲(chǔ)存之文件名:點(diǎn)擊ParameterDescription對(duì)話方框的File,出現(xiàn)文件名編輯窗口。在CustomPrefix中:輸入文件名20031231,點(diǎn)擊此對(duì)話方框的OK。日期為最常用之文件名系統(tǒng)。28.Optional:如有需要,可選擇或在P1-P5后的空格中輸入相關(guān)參數(shù)名。如P1:Size,P2:Granularity,P3:CD3FITC。輸入?yún)?shù)名會(huì)存入實(shí)驗(yàn)檔案中,顯示在圖譜上。ParameterOescr
26、iption;:目Windov:itniHledFolder:FACStitioirG.eslFolder:.FalderJFHcNamt:Data.ODI|SarapfeID:|PatientIt:.ICornmentsjCDa©©(1)1313口PanelIMK卬.11|拿1ube:;IJLW計(jì)數(shù)器Counters口口三五三;三"三三江五/CQunters江王三常;三不評(píng)二三國(guó)ToUIEvents:38?5vent3/Second:150ResMElapsedTime:0:Oi24'29 .從Acquire菜單中選擇Counters.窗口會(huì)顯示樣品分析
27、速率、與總數(shù)進(jìn)度。收集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)30 .你可以開(kāi)始收集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)了。HIGHRUN,將第一管樣品放到檢測(cè)區(qū),在AcquisitionControl窗口中,將Setup改成Setup,此時(shí)CellQuest會(huì)自動(dòng)顯示YourFolder:20031231.001為資料文件名。點(diǎn)擊“Acquire”便可啟動(dòng)樣品之分析測(cè)定與數(shù)據(jù)儲(chǔ)存。當(dāng)計(jì)算機(jī)成功地收取足夠數(shù)據(jù),會(huì)自動(dòng)儲(chǔ)存數(shù)據(jù)文件20031231.001,并會(huì)以“嘟”聲告知,CellQuest會(huì)自動(dòng)升哥附加檔名成20031231.002。等待下一指示。31 .你可以換上下一管樣品,點(diǎn)擊“Acquire”啟動(dòng)樣品之分析測(cè)定與數(shù)據(jù)儲(chǔ)存。可繼續(xù)分析直到所有檢品
28、都分析完畢。3.5實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)之儲(chǔ)存與備份:32 .不建議長(zhǎng)期使用硬盤儲(chǔ)存數(shù)據(jù)數(shù)據(jù),可考慮以燒光盤(如配有CD-RW)、口袋硬盤(FlashDrive)來(lái)備份大量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),以免占用原有硬盤的內(nèi)存,影響數(shù)據(jù)處理速度。可將備份后之?dāng)?shù)據(jù),拿到另一蘋果計(jì)算機(jī)或我PC進(jìn)行離機(jī)分析。33 .確認(rèn)所有檔案皆己備份后,以鼠標(biāo)圈選欲刪除數(shù)據(jù),將其拖拉至Trash筒。退出軟件34 .檢品分析完畢后,記得從屏幕上方File指令欄選擇SaveAs,儲(chǔ)存實(shí)驗(yàn)文件,以備日后使用,不需每次重新編輯。35 .從屏幕上方Cytometer指令欄,選擇InstrumentSetting,出現(xiàn)InstrumentSetting窗口。點(diǎn)
29、系print打印此次實(shí)驗(yàn)條件,可貼入實(shí)驗(yàn)筆記留底,再點(diǎn)擊Save以儲(chǔ)存此一實(shí)驗(yàn)的儀器條件,供日后再使用。點(diǎn)系SAVE后會(huì)出現(xiàn)文件保存對(duì)話方框,選擇文件目錄及文件名(例:YourFolder:/YourSetting1),點(diǎn)擊Save。點(diǎn)擊Done。InstrumentSe1tinq$Type:VoltageIE80ISO15H15B158FHC5CQLibtirflapGainI.69A.HB1.SBV.69ft.09*nodeLogLogLogLogLogLinIJH.RevertDisplaying:CurrentStatusPrimUJPmPpn二36 .檢品分析完畢后,用鼠標(biāo)從屏幕上方
30、Acquire指令欄中,選取DisconnecttoCytometer以斷絕計(jì)算機(jī)與儀器間之聯(lián)機(jī)。之后如不分析數(shù)據(jù),您可退出軟件“File”“Quit”(遇有選項(xiàng)永遠(yuǎn)選擇"Dont'save”),進(jìn)行關(guān)機(jī)程序。管路清洗37 .以2ml10%漂白水取代樣品,將樣品架置于左位以外管吸除約1ml,再將樣品架置于中位HIRUN十分鐘。改用2mlDIwater。重復(fù)上述程序,樣品架上留約1mlDIwater。按STANDBY五分鐘。關(guān)主機(jī)、關(guān)計(jì)算機(jī)四、數(shù)據(jù)分析FCSlistmode數(shù)據(jù)文件:說(shuō)明:FCSlistmode數(shù)據(jù)文件是流式細(xì)胞儀的標(biāo)準(zhǔn)格式檔案(FCS2.0)。該文件含有從流式
31、細(xì)胞儀收取的平均10,000個(gè)細(xì)胞數(shù)的資料,含有46個(gè)參數(shù)。一般軟件無(wú)法打開(kāi)listluul01010mode數(shù)據(jù)文件,需藉助如CellQuest,WinList,WinMDI,等Flow分析軟件,才可開(kāi)啟、繪圖、并進(jìn)行分析統(tǒng)計(jì)。mil01(11007219g.0014.1 開(kāi)啟一CellQuest實(shí)驗(yàn)文件1 .從屏幕上方File菜單中選擇New。桌面會(huì)出現(xiàn)一Untitled'實(shí)驗(yàn)文件,可點(diǎn)擊實(shí)驗(yàn)文件的右上角的放大鈕,將實(shí)驗(yàn)文件窗口放大。4.2 散點(diǎn)圖之統(tǒng)計(jì)分析(雙色)2.從工具板中點(diǎn)擊散點(diǎn)圖圖示。在實(shí)驗(yàn)文件的空白區(qū)點(diǎn)擊,然后拖動(dòng)對(duì)角線至適當(dāng)大小。Plot拖曳完成后可以在右方看到Dot
32、Plot對(duì)話框。3 .在DotPlot方框中,PlotSource應(yīng)預(yù)設(shè)為Analysis,可點(diǎn)擊SelectFile鈕,并用隨后之方框來(lái)開(kāi)啟預(yù)存之SampleFiles,它們的路徑位于MacHD:BDApplications:CellQuestFolder:SampleFiles。連續(xù)雙擊鼠標(biāo)來(lái)打開(kāi)次目錄,找到檔案后,點(diǎn)擊Open來(lái)開(kāi)啟NORM001檔案。X與Y參數(shù)項(xiàng)會(huì)出現(xiàn)默認(rèn)值一FSC-H256與SSC-H256,在Color方框中點(diǎn)擊MulticolorGating,確認(rèn)無(wú)誤之后,點(diǎn)擊OK便完成了一個(gè)NORM001的FSC/SSC散點(diǎn)圖。4 .工具板中選擇多角形區(qū)隔工具,將Cursor移
33、至FSC/SSC散點(diǎn)圖上,并沿著淋巴球聚落周邊畫出范圍,連點(diǎn)擊兩次可關(guān)閉該區(qū)域。你已完成R1區(qū)域的界定,我們將以此區(qū)域來(lái)圈選淋巴細(xì)胞。(如果要?jiǎng)h除R1區(qū)域,您可以在工具列中點(diǎn)選GatesRegionlist,以鼠標(biāo)點(diǎn)選R1,再按Delete鍵刪除R1區(qū)域。刪除R1區(qū)域后,可用繪圖工具板,重畫R1。)5 .從Plots菜單中選擇DotPlot可復(fù)制一個(gè)同樣大小的散點(diǎn)圖,屏幕上會(huì)出現(xiàn)一DotPlot對(duì)話方框。點(diǎn)擊XParameter鈕來(lái)顯示NORM001檔案中所有的參數(shù)項(xiàng)(FSC,SSC,FL1,FL2)將X參數(shù)項(xiàng)改成FL1-H256Gamma-1,Y參數(shù)項(xiàng)改成FL2-H256Gamma-2。從G
34、ate輸入欄中將NoGate改成G1=R1。6 .點(diǎn)擊OK便完成了一個(gè)以G1圈選的FL1/FL2散點(diǎn)圖,可將復(fù)制圖移至原圖右方。NORM001檔案為本組實(shí)驗(yàn)之陰性對(duì)照組,我們將以之來(lái)界定陰性與陽(yáng)性之界限。7 .從屏幕左列工具板中,選取QuadrantMarker工具,然后在FL1/FL2散點(diǎn)圖中心處點(diǎn)擊并拖曳至定點(diǎn),一般而言是緊挨著陰性細(xì)胞聚落。8 .FL1/FL2二維散點(diǎn)圖現(xiàn)在被區(qū)隔出四個(gè)象限,欲計(jì)算各象線中細(xì)胞的數(shù)據(jù)數(shù)據(jù),從屏幕上方Stats菜單中選擇QuadrantStats??梢缘玫皆搱D之四象限統(tǒng)計(jì)結(jié)果。UL:左上象限,UR:右上象限,LL:左下象限,LR:右下象限SlatsBatch
35、Acquire>togramStats<-SSt已l號(hào)”,RegionStatsGmteStatsQuadrantStatsEdit一NswExpressionEditIExpi§s酊onFfeJNonn.Ofta$ampleID:Sample1Tube:CD3O19AcuifltlonD«it;08-Sep-00GatedEvents:2661XPsraneter:CD3FITC(Log)QuadLqg趾ion二1芭12Ou44Ekenis為R觸松舞ToLogDataUnits:LinearYsduesPatientID:Panel:2ColorPwelGm&
36、#171;:Q1TotalEvents:6W0¥Parameter:CD19PE(Log)XMt&nVM&M¥屯MfeimUL29610.354.932.7724227428刈26UR70.240.12168.05192J772的LL4如4魅4g32358IR22M79.1357.7322?.J2215.13"喏1.41打印報(bào)告、輸出統(tǒng)計(jì)數(shù)值9 .從屏幕上方File菜單中選擇PrintOne,可以打印工作中實(shí)驗(yàn)文件。10 .點(diǎn)選四象限統(tǒng)計(jì)表,從屏幕上方File菜單中選擇ExportStatistics可輸出統(tǒng)計(jì)數(shù)值至Excel檔案。在出現(xiàn)方框中命名
37、檔案,并決定欲存放檔案匣,點(diǎn)擊Save。CancelSgueHustin'st-TzoaoatZooFauto.seaCDtoLELLQUESrSaueas:12H5Data.ae4.3開(kāi)啟其它ListModeData11 .如欲接著分析存在同一檔案匣之系列檔案,可用鼠標(biāo)以拖曳方式選取所有圖表(文件中所有圖譜的四角會(huì)出現(xiàn)黑色方塊,表示被選擇上),接著從Plots菜單選擇NextDataFile,軟件會(huì)自動(dòng)以新檔案來(lái)替換現(xiàn)有檔案,您只要確認(rèn)圈選范圍、與QuadrantMarker的位置是否恰當(dāng),即可打印報(bào)告、或輸出統(tǒng)計(jì)數(shù)值。12 .對(duì)于存在不同檔案匣之系列檔案,可用鼠標(biāo)以拖曳方式選取所有
38、圖表(文件中所有圖譜的四角會(huì)出現(xiàn)黑色方塊,表示被選擇上),接著從Plots菜單選擇ChangeDataFiles,并在隨后出現(xiàn)之對(duì)話方框,選擇所在新目錄與欲分析檔案。點(diǎn)擊OPEN。可調(diào)整圈選區(qū)域,QuadrantMarker陰陽(yáng)界限,軟件會(huì)重新計(jì)算、統(tǒng)計(jì)報(bào)告。openaDataFile.bdiE01020300i0031903.001購(gòu)II2S02.00I112702.001.121202d12160213 .常規(guī)使用之實(shí)驗(yàn)文件(內(nèi)含散點(diǎn)圖、圈選區(qū)格、四象限分界、以及統(tǒng)計(jì)報(bào)告),我們建議您將它另存新檔File-SaveAs,以備后需,分析其它檔案便輕而易舉。4.3直方圖之統(tǒng)計(jì)分析(單色)1 .
39、從屏幕上方File菜單中選擇New。桌面會(huì)出現(xiàn)一Untitled'實(shí)驗(yàn)文件,可點(diǎn)擊實(shí)驗(yàn)文件的右上角的放大鈕,將實(shí)驗(yàn)文件窗口放大。2 .從工具板中點(diǎn)擊散點(diǎn)圖圖示。在實(shí)驗(yàn)文件的空白區(qū)點(diǎn)擊,然后拖曳對(duì)角線至適當(dāng)大小。Plot拖曳完成后可以在右方看到DotPlot對(duì)話框。3 .在DotPlot方框中,PlotSource應(yīng)預(yù)設(shè)為Analysis,可點(diǎn)擊SelectFile鈕,并用隨后之方框來(lái)開(kāi)啟預(yù)存之SampleFiles,它們的路徑位于MacHD:BDApplications:CellQuestFolder:SampleFiles。連續(xù)雙擊鼠標(biāo)來(lái)打開(kāi)次目錄,找到檔案后,點(diǎn)擊Open來(lái)開(kāi)啟NO
40、RM001檔案。X與Y參數(shù)項(xiàng)會(huì)出現(xiàn)默認(rèn)值一FSC-H256與SSC-H256,在Color方框中點(diǎn)擊MulticolorGating,確認(rèn)無(wú)誤之后,點(diǎn)擊OK便完成了一個(gè)NORM001的FSC/SSC散點(diǎn)圖。4 .工具板中選擇多角形區(qū)隔工具,將Cursor移至FSC/SSC散點(diǎn)圖上,并沿著淋巴球聚落周邊畫出范圍,連點(diǎn)擊兩次可關(guān)閉該區(qū)域。你已完成R1區(qū)域的界定,我們將以此區(qū)域來(lái)圈選淋巴細(xì)胞。(如果要?jiǎng)h除R1區(qū)域,您可以在工具列中點(diǎn)選GatesRegionlist,以鼠標(biāo)點(diǎn)選R1,再按Delete鍵刪除R1區(qū)域。刪除R1區(qū)域后,可用繪圖工具板,重畫R1。)5 .從Plots菜單中選擇Histogra
41、m,屏幕上會(huì)出現(xiàn)一HistogramFile鈕,再點(diǎn)擊Open來(lái)開(kāi)啟NORM001檔案。對(duì)話方框。點(diǎn)擊Select說(shuō)明:直方圖(Histogram)表明一個(gè)參數(shù)與細(xì)胞數(shù)量之間的關(guān)系,在圖中,橫坐標(biāo)X軸為熒光或光散射強(qiáng)度的相對(duì)值,單位是道數(shù)(channelnumber),縱坐標(biāo)Y軸則通常表示細(xì)胞出現(xiàn)的頻率,即相對(duì)細(xì)胞數(shù)。6 .點(diǎn)擊Parameter鈕來(lái)顯示NORM001檔案中所有的參數(shù)項(xiàng),將參數(shù)項(xiàng)改成FL2-H256Gamma-2。從Gate輸入欄中將NoGate改成G1=R1,點(diǎn)擊OK便完成了一個(gè)以G1圈選的FL2直方圖,圖形的X軸為橙黃色熒光強(qiáng)度,Y軸為細(xì)胞頻率,NORM001n君后一m口g
42、£55jacnfra-!檔案為本組實(shí)驗(yàn)之陰性對(duì)照組,我們將以之來(lái)界定陰性與陽(yáng)性之界限。7 .從屏幕左列工具板中,選取HistogramMarker工具,然后在圖的左緣處點(diǎn)擊并拖曳至定點(diǎn),一般而言是陰性信號(hào)的右緣。放開(kāi)鼠標(biāo)后即完成Marker1(M1)。重復(fù)前述步驟以增畫另一Marker,一般而言M2始自M1的右緣,終于圖的右界。8.FL2直方圖現(xiàn)在被區(qū)隔出兩個(gè)區(qū)域,欲計(jì)算各區(qū)域中細(xì)胞的數(shù)據(jù)數(shù)據(jù),可從Stats指令欄中選擇HistogramStats。StatsBatchAcquireK-SStats.RegionStatsGateStatsQuadrantStatsNewExpres
43、sionEditExpressimiG和mxl*rt<reMIteJCt",,1jF(4111(*»曲anSf.N?TpII用;1;xheubinrm工工1ui,n1443WI7I4£/口"也幃*K鼻CitfriCorral*>“,口”Um中:ip,rifuivFLUrtSwTTFrI(JLw網(wǎng)(:帆T:也Emd打印報(bào)告、輸出統(tǒng)計(jì)數(shù)值9 .從屏幕上方File菜單中選擇PrintOne,可以打印工作中實(shí)驗(yàn)文件。10 .點(diǎn)選四象限統(tǒng)計(jì)表,從屏幕上方File菜單中選擇ExportStatistics可輸出統(tǒng)計(jì)數(shù)值至Excel檔案。在出現(xiàn)方框中命名檔
44、案,并決定欲存放檔案匣,點(diǎn)擊Save。|Humin's£|T205Data.D0T12白4.日白2911auto.sea4CDtoCELLQUEST4.3開(kāi)啟其它ListModeData11 .如欲接著分析存在同一檔案匣之系列檔案,可用鼠標(biāo)以拖曳方式選取所有圖表(文件中所有圖譜的四角會(huì)出現(xiàn)黑色方塊,表示被選擇上),接著從Plots菜單選擇NextDataFile,軟件會(huì)自動(dòng)以新檔案來(lái)替換現(xiàn)有檔案,您只要確認(rèn)圈選范圍、與QuadrantMarker的位置是否恰當(dāng),即可打印報(bào)告、或輸出統(tǒng)計(jì)數(shù)值。12 .對(duì)于存在不同檔案匣之系列檔案,可用鼠標(biāo)以拖曳方式選取所有圖表(文件中所有圖譜的
45、四角會(huì)出現(xiàn)黑色方塊,表示被選擇上),接著從Plots菜單選擇ChangeopenaDdlaFlitDataFiles,并在隨后出現(xiàn)之對(duì)話方框,選擇所在新目錄與欲分析檔案。點(diǎn)擊OPEN??烧{(diào)整圈選區(qū)域,Markers界限,軟件會(huì)重新計(jì)算、統(tǒng)計(jì)報(bào)告。E30102030010031903.001QI12502.00I施)112702.001CJ121202d12160213 .常規(guī)使用之實(shí)驗(yàn)文件(內(nèi)含散點(diǎn)圖、圈選區(qū)格、四象限分界、以及統(tǒng)計(jì)報(bào)告),我們建議您將它另存新檔File-SaveAs,以備后需,分析其它檔案便輕而易舉。五、不對(duì)信號(hào)、疑難排除5.1 儀器狀態(tài)(Status)I15«&g
46、t;-"SSJji一>>>«>二:常::::力:黑門;副閾HIEStatus:LflserPower:LaserCurrent:SampleVoltage:SheathFluid:WasteTantTestPulses:Standby5JS3.78An|Q310.Z3OKOK在CELLQuest菜單位于Cytometer菜單中。用來(lái)在收取的任何時(shí)候查看流式細(xì)胞儀的運(yùn)行狀態(tài),以利解決儀器運(yùn)行中出現(xiàn)的問(wèn)題。狀態(tài):顯示儀器運(yùn)行模式NotReady:激光器正在預(yù)熱、鞘液桶空、廢液桶滿。Ready:樣本管放置在進(jìn)樣區(qū),且支撐臂位于中位,樣本管加壓,儀器在RUN
47、狀態(tài)。Standby:儀器在Standby狀態(tài)、或儀器在Run狀態(tài)而無(wú)樣本管在進(jìn)樣區(qū)上、或支撐架位于側(cè)位、或樣本管未完全加壓。Standby時(shí)儀器的雷射電源降低。5.2 常見(jiàn)故障排除程序5.2.1 樣品試管上不去誤用不適合的試管。(請(qǐng)用BDFalcon352052)試管支持架需調(diào)整。旋轉(zhuǎn)調(diào)整試管支持架(順時(shí)鐘向下、逆時(shí)鐘向上)。BalSeal磨損。(汰換Balseal)5.2.2 儀器處于N0TREADY狀況檢查以下情況:鞘液筒中的鞘液是否用完。廢液筒中的廢液是否已裝滿。開(kāi)機(jī)需要5分鐘進(jìn)度預(yù)熱。鞘液筒的液面檢測(cè)器連接是否松動(dòng)、或未連接。5.2.3 儀器處于STANDBY狀況(儀器失壓)如果儀器
48、未加壓,上樣管放好后,雖然控制面板處于RUN模式,但儀器仍未能達(dá)到READY狀況,此時(shí)儀器仍處于STANDBY狀況。這可能是由于鞘液筒蓋漏氣、壓力閥未加壓,樣本管不能被加壓等原因造成的壓力問(wèn)題。此時(shí),樣本不能良好地進(jìn)入流動(dòng)室,無(wú)法檢測(cè)。此時(shí),檢查以下情況:壓力閥未加壓。鞘液筒是否漏氣(蓋緊鞘液筒蓋)。樣本管是否有破損。上樣針上的Balseal是否己磨損。鞘液筒上的藍(lán)色接頭是否連接好。5.2.4 儀器訊號(hào)噪聲過(guò)高鞘液過(guò)濾器中有氣泡,儀器記錄了氣泡產(chǎn)生的信號(hào),造成了噪聲數(shù)據(jù)的干擾。氣泡還可以改變樣本流,造成檢測(cè)結(jié)果不夢(mèng)想。此時(shí),儀器需要做PRIME,排除液路中的氣泡干擾。如果鞘液筒吸干了,應(yīng)該重新
49、裝滿鞘液,然后先取下樣品管進(jìn)行5-10次PRIME,再換上3mldH2O上樣管HIRUN30分鐘,待鞘液流中的氣泡排除之后,再進(jìn)行樣本測(cè)定。5.2.5 計(jì)算機(jī)屏幕上見(jiàn)不到細(xì)胞顯示檢查以下情況:如果儀器一直處于STANDBY狀態(tài),則檢查SystemStatus。如果STATUS窗日顯示READY,則檢查樣本管中細(xì)胞濃度是否夠,上樣前是否混勻了。檢查實(shí)驗(yàn)的InstrumentSettings是否正確。檢查閾值是否設(shè)置過(guò)高,導(dǎo)致無(wú)法檢測(cè)目標(biāo)細(xì)胞群。檢查CELLQuest軟彳Cytometer目錄下的Status窗口,是否己被更新。如果未更新,說(shuō)明儀器與計(jì)算機(jī)之間的通訊發(fā)生了故障,此時(shí),應(yīng)關(guān)閉計(jì)算機(jī)和FACSCalibur,重新打開(kāi)儀器,繼續(xù)實(shí)驗(yàn)。PRIME儀器液流,去除流動(dòng)室中可能存在的氣泡。若流動(dòng)室中存在氣泡,可能使樣本流的位置偏離激光
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