臨床分子生物學(xué)檢驗課程教學(xué)大綱

1、 臨床分子生物學(xué)檢驗課程教學(xué)大綱一、課程基本信息【課程名稱】臨床分子生物學(xué)檢驗 【英文名稱】(Clinical molecular biology technology ) 【課程編碼】YXZX3430【課程類別】專業(yè)選修課【總 學(xué) 時】22學(xué)時【總 學(xué) 分】1學(xué)分【適用專業(yè)】醫(yī)學(xué)檢驗專業(yè)【開課院系】醫(yī)學(xué)院二、課程的性質(zhì)和任務(wù)【課程性質(zhì)】分子生物學(xué)是研究生命化學(xué)的科學(xué)，它在分子水平探討生命的本質(zhì)，即研究生物體的分子結(jié)構(gòu)與功能、物質(zhì)代謝與調(diào)節(jié)、及其在生命活動中的作用。由于分子生物學(xué)越來越多地成為生命科學(xué)的共同語言，當(dāng)今分子生物學(xué)已成為生命科學(xué)領(lǐng)域的前沿學(xué)科。臨床分子生物學(xué)檢驗的教學(xué)任務(wù)主要是介紹

2、核酸與分子標志物、核酸雜交、擴增及序列分析、芯片技術(shù)、生物信息分析技術(shù)以及應(yīng)用分子生物學(xué)技術(shù)較多的有關(guān)病毒、細菌、真菌感染的分子生物學(xué)檢驗。課程涵蓋最新的有關(guān)單基因病檢測、腫瘤、線粒體病、染色體病分子檢測技術(shù)，同時目前臨床上技術(shù)要求很高的藥物相關(guān)基因、胚胎植入前以及移植配型和法醫(yī)物證學(xué)的相關(guān)分子生物學(xué)檢驗的內(nèi)容也有詳細講解，對于解決精準醫(yī)療的相關(guān)問題提供了實驗室檢測依據(jù)?！窘虒W(xué)目標】 通過臨床分子生物學(xué)檢驗課程的學(xué)習(xí)，學(xué)生將能夠：（1）描述生物體(主要是人體)內(nèi)的主要物質(zhì)的組成、分子生物學(xué)功能。（2）基本掌握核酸雜交技術(shù)和核酸擴增技術(shù)及核酸序列分析。（3）學(xué)會初步通過生物芯片技術(shù)和蛋白質(zhì)組學(xué)技

3、術(shù)的學(xué)習(xí)，運用生物信息學(xué)技術(shù)可以進行簡單的數(shù)據(jù)結(jié)果分析。（4）結(jié)合分子生物學(xué)的基本理論掌握病毒學(xué)、細菌感染、真菌等的分子生物學(xué)檢測。（5）了解有關(guān)單基因遺傳病、腫瘤、線粒體疾病、染色體病、藥物相關(guān)性基因、胚胎植入前及移植配型相關(guān)技術(shù)。【教學(xué)任務(wù)】（1）要求學(xué)生掌握臨床分子生物學(xué)檢驗的基礎(chǔ)理論、知識和方法。（2）通過實驗課，使學(xué)生能夠了解分子生物學(xué)檢驗基本技術(shù)的臨床應(yīng)用。三、課程教學(xué)基本要求（一）理論教學(xué)內(nèi)容和基本要求緒論教學(xué)內(nèi)容： 1、臨床分子生物學(xué)檢驗的定義及其發(fā)展歷史。 2、臨床分子生物學(xué)檢驗的分子靶標及在病原生物基因組、基因變異、基因多態(tài)性、循壞游離核酸檢測中的應(yīng)用。 3、臨床分子生物學(xué)

4、檢驗在感染性疾病、遺傳性疾病、腫瘤及個體化醫(yī)學(xué)上的發(fā)展與應(yīng)用。 知識點：分子生物學(xué)理論和技術(shù)的發(fā)展趨勢及其在醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用。臨床分子生物學(xué)檢驗的定義及其發(fā)展歷史。臨床分子生物學(xué)檢驗的分子靶標及在病原生物基因組、基因變異、基因多態(tài)性、循壞游離核酸檢測中的應(yīng)用。臨床分子生物學(xué)檢驗在感染性疾病、遺傳性疾病、腫瘤及個體化醫(yī)學(xué)上的發(fā)展與應(yīng)用。 重點：臨床分子生物學(xué)檢驗的定義和基本概念； 難點：臨床分子生物學(xué)檢驗的分子靶標及應(yīng)用；第一章 核酸與分子標志物一、學(xué)習(xí)目的要求教學(xué)內(nèi)容：1、核酸的結(jié)構(gòu)和功能（DNA的結(jié)構(gòu)和功能、RNA的結(jié)構(gòu)和功能）。2、表觀遺傳與基因功能，基因突變。3、基因組結(jié)構(gòu)與特征，原核生物、

5、病毒、人類基因組結(jié)構(gòu)特點。4、核酸分子標志物的分類及未來發(fā)展。 知識點：核酸分子標志物的分類及發(fā)展。DNA的結(jié)構(gòu)和功能、RNA的結(jié)構(gòu)和功能。表觀遺傳與基因功能，基因突變?；蚪M結(jié)構(gòu)與特征，原核生物、病毒、人類基因組結(jié)構(gòu)特點。 重點：DNA的結(jié)構(gòu)和功能、RNA的結(jié)構(gòu)和功能。DNA甲基化，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，基因突變的概念及類型。； 難點：原核生物、病毒、人類基因組結(jié)構(gòu)特點；第二章 核酸雜交技術(shù)一、學(xué)習(xí)目的要求教學(xué)內(nèi)容：1、核酸探針的種類、長度、標記方法及檢測。2、核酸分子雜交技術(shù)中的原位雜交技術(shù)、Southern及Northern印記雜交技術(shù)。3、長探針和短小寡核苷酸探針雜交的影響因素。 知識點：核酸探

6、針的標記和檢測、Southern及Northern印記雜交技術(shù)。核酸探針的種類、長度、標記方法及檢測。原位雜交技術(shù)、Southern及Northern印記雜交技術(shù)。長探針和短小寡核苷酸探針雜交的影響因素。 重點：掌握核酸探針的種類及影響雜交的因素。 難點：原位雜交技術(shù)。第3章 核酸擴增技術(shù)教學(xué)內(nèi)容：1、聚合酶鏈反應(yīng)的基本原理、反應(yīng)過程、擴增體系和擴增條件。2、以PCR為基礎(chǔ)的逆轉(zhuǎn)錄PCR、巢式PCR、多重PCR、定量PCR、單細胞PCR、原位PCR等技術(shù)。3、實時PCR技術(shù)的原理及參照系統(tǒng)。4、PCR產(chǎn)物常見的分析技術(shù)、臨床基因擴增檢驗的質(zhì)量管理、實驗室設(shè)置和人員資質(zhì)的要求； 知識點：PCR-

7、RELP、等位基因、特異性寡核苷酸、單鏈構(gòu)象多態(tài)性、聚合酶鏈反應(yīng)的基本原理、反應(yīng)過程、擴增體系和擴增條件。逆轉(zhuǎn)錄PCR、巢式PCR、多重PCR、定量PCR、單細胞PCR、原位PCR技術(shù)。實時PCR技術(shù)的原理及參照系統(tǒng)。PCR產(chǎn)物常見的分析技術(shù)、臨床基因擴增檢驗的質(zhì)量管理、實驗室設(shè)置和人員資質(zhì)的要求； 重點:聚合酶鏈反應(yīng)的基本原理、實時PCR的原理、臨床基因擴增檢驗的質(zhì)量管理； 難點：PCR為基礎(chǔ)的相關(guān)PCR技術(shù)。第四章 核酸序列分析教學(xué)內(nèi)容：1、第一代測序技術(shù)的原理、染料、反應(yīng)體系、自動測序儀的使用及測序策略。2、二代測序技術(shù)的基本原理和工作流程、特點及應(yīng)用。3、三代測序技術(shù)的發(fā)展趨勢。 知識

8、點：一代測序技術(shù)的原理、染料、反應(yīng)體系、自動測序儀的使用及測序策略。二代測序技術(shù)的基本原理和工作流程、特點及應(yīng)用。三代測序技術(shù)的發(fā)展趨勢。 重點:二代測序技術(shù)的原理、特點及應(yīng)用 難點:一代測序的原理。第五章 生物芯片技術(shù)教學(xué)內(nèi)容：1、DNA芯片的檢測原理、DNA芯片技術(shù)的特點、DNA芯片檢測技術(shù)在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用2、表達譜芯片的技術(shù)原理、表達譜芯片技術(shù)在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用。蛋白質(zhì)芯片的技術(shù)原理和在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用。3、芯片序列捕獲技術(shù)的原理、芯片序列捕獲技術(shù)的技術(shù)優(yōu)點及應(yīng)用。 知識點：DNA芯片的檢測原理、特點、醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用。表達譜芯片的技術(shù)原理、表達譜芯片技術(shù)在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用。蛋白質(zhì)芯片的技術(shù)原理和在醫(yī)學(xué)中

9、的應(yīng)用。芯片序列捕獲技術(shù)的原理、芯片序列捕獲技術(shù)的技術(shù)優(yōu)點及應(yīng)用。 重點:DNA芯片的原理和在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用。 難點:表達譜芯片、蛋白質(zhì)芯片的技術(shù)原理和在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用。第六章 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)教學(xué)內(nèi)容：1、蛋白質(zhì)印記技術(shù)的原理、蛋白質(zhì)印記技術(shù)的方法學(xué)特點。2、雙向凝膠電泳的原理、凝膠上蛋白質(zhì)的檢測、雙向凝膠電泳圖像分析、雙向凝膠電泳方法的特點。3、生物質(zhì)譜的基本原理、生物質(zhì)譜技術(shù)的特點、生物質(zhì)譜的應(yīng)用。 知識點：蛋白質(zhì)印記技術(shù)的原理、方法學(xué)特點。雙向凝膠電泳的原理、凝膠上蛋白質(zhì)的檢測、雙向凝膠電泳圖像分析、雙向凝膠電泳方法的特點。生物質(zhì)譜的基本原理、生物質(zhì)譜技術(shù)的特點、生物質(zhì)譜的應(yīng)用。 重點:蛋白

10、質(zhì)印記技術(shù)的原理和方法特點。 難點:熟悉生物質(zhì)譜技術(shù)的原理及應(yīng)用。第七章 生物信息學(xué)技術(shù)教學(xué)內(nèi)容：1、生物信息數(shù)據(jù)庫查詢、文獻檢索的方法。2、核酸序列的基本分析、核酸序列的比對分析、開放閱讀框的分析、啟動子預(yù)測。3、蛋白質(zhì)的基本性質(zhì)分析、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)預(yù)測、蛋白質(zhì)的功能預(yù)測。 知識點：生物信息數(shù)據(jù)庫查詢、文獻檢索的方法。核酸序列的基本分析、核酸序列的比對分析、開放閱讀框的分析、啟動子預(yù)測。蛋白質(zhì)的基本性質(zhì)分析、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)預(yù)測、蛋白質(zhì)的功能預(yù)測。 重點:生物信息數(shù)據(jù)庫查詢、文獻檢索的操作。 難點:核酸數(shù)據(jù)分析。第八章 病毒感染的分子生物學(xué)檢驗一、學(xué)習(xí)目的要求教學(xué)內(nèi)容：1、乙肝病毒的基因組結(jié)構(gòu)、分

11、子生物學(xué)檢驗、檢測的臨床意義。2、人乳頭瘤病毒的基因組結(jié)構(gòu)特征、分子生物學(xué)檢驗、檢測的臨床意義。3、丙型肝炎病毒、人類免疫缺陷病毒、流行性感冒病毒的分子生物學(xué)檢驗及臨床意義。 知識點：乙肝病毒的基因組結(jié)構(gòu)、分子生物學(xué)檢驗、檢測的臨床意義。人乳頭瘤病毒的基因組結(jié)構(gòu)特征、分子生物學(xué)檢驗、檢測的臨床意義。丙型肝炎病毒、人類免疫缺陷病毒、流行性感冒病毒的分子生物學(xué)檢驗及臨床意義。 重點:乙型肝炎病毒的檢測和臨床意義、人乳頭瘤病毒的檢驗及臨床意義。 難點:人類免疫缺陷病毒檢驗及其臨床意義。第九章 細菌感染的分子生物學(xué)檢驗教學(xué)內(nèi)容 1、細菌感染的一般檢出策略和完整檢出策略。 2、結(jié)核分枝桿菌的基因組結(jié)構(gòu)特

12、點、分子生物學(xué)檢驗內(nèi)容和臨床意義。 3、淋病奈瑟菌檢測、O157型大腸埃希菌分子生物學(xué)檢驗的內(nèi)容和臨床意義。 4、醫(yī)院細菌感染的特征及分子生物學(xué)檢測內(nèi)容。 知識點：細菌感染的一般檢出策略和完整檢出策略。結(jié)核分枝桿菌的基因組結(jié)構(gòu)特點、分子生物學(xué)檢驗內(nèi)容和臨床意義。淋病奈瑟菌檢測、O157型大腸埃希菌分子生物學(xué)檢驗的內(nèi)容和臨床意義。醫(yī)院細菌感染的特征及分子生物學(xué)檢測內(nèi)容。 重點:結(jié)核分枝桿菌的分子生物學(xué)檢驗及臨床意義。 難點:淋病奈瑟菌檢測及其臨床意義。第10章 真菌與其他病原體的分子生物學(xué)檢驗教學(xué)內(nèi)容：1、白假絲酵母菌和新型隱球菌的分子生物學(xué)檢驗。 2、沙眼衣原體、肺炎衣原體的分子生物學(xué)檢驗及臨

13、床意義。 3、肺炎支原體、解脲支原體的分子生物學(xué)檢驗及臨床意義。 4、梅毒螺旋體和原蟲檢測的臨床意義。 知識點：白假絲酵母菌和新型隱球菌的分子生物學(xué)檢驗。沙眼衣原體、肺炎衣原體的分子生物學(xué)檢驗及臨床意義。肺炎支原體、解脲支原體的分子生物學(xué)檢驗及臨床意義。梅毒螺旋體和原蟲檢測的臨床意義。 重點：衣原體和支原體的分子生物學(xué)檢驗和臨床意義； 難點：常見真菌、梅毒螺旋體、原蟲的分子生物學(xué)檢驗。第11章 單基因遺傳病的分子生物學(xué)檢驗教學(xué)內(nèi)容： 1、單基因遺傳病的直接和間接診斷策略。 2、血紅蛋白病的檢驗和臨床意義；3、 血友病凝血因子、血友病A和B的分子生物學(xué)檢驗及臨床意義；4、了解迪謝內(nèi)營養(yǎng)不良的相關(guān)

14、檢驗和臨床意義。5、了解脆性X綜合癥的分子生物學(xué)檢驗的臨床意義。 知識點：單基因遺傳病的直接和間接診斷策略。血紅蛋白病的檢驗和臨床意義；血友病凝血因子、血友病A和B的分子生物學(xué)檢驗及臨床意義； 重點：血紅蛋白病的分子生物學(xué)檢驗和臨床意義。 難點：單基因遺傳病的診斷策略、血友病的分子生物學(xué)檢驗和臨床意義。第12章 腫瘤的分子生物學(xué)檢驗教學(xué)內(nèi)容：1、腫瘤相關(guān)的染色體異常、基因異常、單核苷酸多態(tài)性、表觀遺傳異常。 2、腫瘤的分子生物學(xué)檢驗在乳腺癌、結(jié)直腸癌、白血病中的應(yīng)用。 知識點：腫瘤相關(guān)的染色體異常、基因異常、單核苷酸多態(tài)性、表觀遺傳異常。腫瘤的分子生物學(xué)檢驗在乳腺癌、結(jié)直腸癌、白血病中的應(yīng)用。

15、 重點：腫瘤相關(guān)的染色體異常。 難點：腫瘤相關(guān)的基因異常、表觀遺傳異常。 第13章 線粒體疾病的分子生物學(xué)檢驗教學(xué)內(nèi)容：1、線粒體基因組及其表達系統(tǒng)、基因組變異與疾病的相關(guān)性。 2、與耳聾相關(guān)的mtDNA突變和檢測。3、線粒體與leber遺傳性視神經(jīng)病變的檢測。 知識點：線粒體與leber遺傳性視神經(jīng)病變及糖尿病的相關(guān)性。線粒體基因組及其表達系統(tǒng)、基因組變異與疾病的相關(guān)性。與耳聾相關(guān)的mtDNA突變和檢測。 重點：耳聾相關(guān)的mtDNA突變和檢測 難點：線粒體基因組及其表達系統(tǒng)、線粒體基因組變異與疾病的關(guān)系。 第十四章 染色體疾病的分子生物學(xué)檢驗教學(xué)內(nèi)容： 1、染色體異常、人類染色體數(shù)目、結(jié)構(gòu)和

16、形態(tài)。 2、染色體病的分類及其特點、常染色體病、性染色體病、染色體微缺失疾病的檢測。3、染色體病的分子生物學(xué)檢驗技術(shù)。 知識點：染色體異常、人類染色體數(shù)目、結(jié)構(gòu)和形態(tài)。 染色體病的分類及其特點、常染色體病、性染色體病、染色體微缺失疾病的檢測。染色體病的分子生物學(xué)檢驗技術(shù)。 重點：染色體病的分類及其特點、常染色體病、性染色體病和染色體微缺失； 難點：染色體與染色體異常。第十五章 藥物相關(guān)基因檢測教學(xué)內(nèi)容： 1、藥物基因組學(xué)概念、研究范疇、藥物相關(guān)基因分類。 2、藥物作用靶點相關(guān)基因、代謝酶基因、藥物副反應(yīng)相關(guān)基因。 知識點：藥物基因組學(xué)概念、研究范疇、藥物相關(guān)基因分類。藥物作用靶點相關(guān)基因、代謝

17、酶基因、藥物副反應(yīng)相關(guān)基因。 重點：藥物作用靶點相關(guān)基因、藥物代謝酶基因及藥物副反應(yīng)相關(guān)基因。 難點：藥物基因組學(xué)的概念及研究范疇、藥物相關(guān)基因分類；第16章 胚胎植入前的分子生物學(xué)檢驗教學(xué)內(nèi)容： 1、試管嬰兒、胚胎植入前的相關(guān)檢驗； 2、胚胎取材途徑及常用的分子生物學(xué)技術(shù)。 3、胚胎植入前診斷的應(yīng)用評價。 知識點：試管嬰兒、胚胎植入前的相關(guān)檢驗；胚胎取材途徑及常用的分子生物學(xué)技術(shù)。胚胎植入前診斷的應(yīng)用評價。 重點：試管嬰兒植入前遺傳學(xué)診斷的檢驗。 難點：胚胎植入前診斷的技術(shù)和方法。第17章 移植配型及法醫(yī)物證學(xué)的分子生物學(xué)檢驗教學(xué)內(nèi)容： 1、免疫學(xué)及分子生物學(xué)基礎(chǔ)、分子生物學(xué)技術(shù)在HLA分型

18、中的應(yīng)用。 2、個體識別和親子鑒定、遺傳學(xué)及分子生物學(xué)基礎(chǔ)。 知識點：免疫學(xué)及分子生物學(xué)基礎(chǔ)、分子生物學(xué)技術(shù)在HLA分型中的應(yīng)用。個體識別和親子鑒定、遺傳學(xué)及分子生物學(xué)基礎(chǔ)。 重點：個體識別和親子鑒定的概念。 難點：移植配型的檢驗、法醫(yī)物證學(xué)的檢驗。（2） 實驗教學(xué)內(nèi)容和基本要求 實驗教學(xué)內(nèi)容及要求見臨床分子生物學(xué)檢驗4、 課程教學(xué)要求及考核方式1. 教學(xué)方法：多媒體+板書。2. 作業(yè)及實踐環(huán)節(jié)：乙肝病毒感染的PCR檢測。3. 考試形式：期末考核采用閉卷、筆試的方式評定。總評成績的核算辦法是：期末考試占總成績的80%，平時考核占總成績的20%。五、學(xué)時分配章節(jié)主要內(nèi)容各教學(xué)學(xué)時分配備注講授習(xí)題見習(xí)討論合計 緒論分子生物學(xué)的定義及發(fā)展應(yīng)用0.5學(xué)時第 一 章核酸與分子標志物0.5學(xué)時第 二 章核酸雜交技術(shù) 1學(xué)時第 三 章核酸擴增技術(shù) 2學(xué)時第 四 章核酸序列分析技術(shù) 1學(xué)時第 五 章生物芯片技術(shù)1學(xué)時第 六 章蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)1學(xué)時第 七 章生物信息學(xué)技術(shù)1學(xué)時第 八 章病毒感染的分子生物學(xué)檢驗2學(xué)時第 九 章細菌感染的分子生物學(xué)檢驗1學(xué)時第 十 章真菌與其他病原體的分子生物學(xué)檢驗1學(xué)時第十一章單基因遺傳病的分子生物學(xué)檢驗1學(xué)時第十二章腫瘤的分子生物學(xué)檢