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文檔簡介
1、基因工程上課糖代謝第一節(jié) 新陳代謝的一般概念 新陳代謝細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行的所有化學(xué)反應(yīng)的總稱。包括(1)分解代謝自生的或從外界攝取的蛋白質(zhì)、脂肪和碳水化合物等有機(jī)大分子氧化降解為簡單小分子,同時伴隨作能量的釋放的過程。釋放能量的相當(dāng)一部分常以ATP(為主)、FADH2、NADH(可通過呼吸鏈產(chǎn)生ATP)和NADPH(主要作為還原性生物合成反應(yīng)的原動力,即還原力)等形式被捕獲;(2)合成代謝以小分子前體為原料合成復(fù)雜的生物大分子的過程。分解代謝和合成代謝基本上采取不同的途徑,往往是在不同的細(xì)胞分隔中進(jìn)行。但也有一些代謝環(huán)節(jié)是可共同利用的,故將可共用的代謝環(huán)節(jié)稱為兩用代謝途徑。檸檬酸途徑是典型的例子。 第
2、1頁/共72頁葡萄糖CO2+H2O過程的能量釋放第2頁/共72頁代謝途徑概述第3頁/共72頁新陳代謝中的主要化學(xué)反應(yīng) 氧化還原反應(yīng)通常由脫氫酶和氧化酶催化。 如: C-C鍵的形成和斷裂是分解代謝與合成代謝的基礎(chǔ)反應(yīng)過程。如合成代謝中的C-C鍵的形成涉及到親核的負(fù)碳離子對親電的正碳離子的進(jìn)攻。 分子重排、異構(gòu)化和消除反應(yīng) 如分子重排: 消除反應(yīng): 基團(tuán)轉(zhuǎn)移反應(yīng)主要包括?;⑻腔?、磷酸基等的轉(zhuǎn)移。常表現(xiàn)為親電子基團(tuán)(如A)從從一個親核體(如X?)轉(zhuǎn)移到另一個親核體(如Y? )。 如: 第4頁/共72頁第二節(jié) 新陳代謝的調(diào)控及研究方法 新陳代謝的調(diào)控包括(1)分子水平酶水平的調(diào)控;(2)細(xì)胞水平的調(diào)
3、控;(3)整體水平的調(diào)控。酶水平的調(diào)控 包括酶活性的調(diào)控、酶濃度的調(diào)控和酶水平的其他方面的調(diào)節(jié) 酶活性的調(diào)控常見方式有變構(gòu)調(diào)節(jié)(別構(gòu)酶多為代謝途徑的第一、二個酶或分支點(diǎn)處的酶)、共價調(diào)節(jié)(有磷酸化/去磷酸化、腺苷酰化/脫腺苷?;龋罢咴谛盘栟D(zhuǎn)導(dǎo)途徑中最常見,后者是細(xì)菌中的另一種重要方式)。特點(diǎn):調(diào)節(jié)酶活性的大小或有無,調(diào)節(jié)快速、靈敏,屬細(xì)調(diào)。 酶濃度的調(diào)控包括合成調(diào)節(jié)(涉及到基因表達(dá)調(diào)控)和降解調(diào)節(jié)兩類。特點(diǎn):調(diào)節(jié)酶數(shù)量的增減,屬粗調(diào)。 酶水平的其他方面的調(diào)節(jié)包括酶的組織形式調(diào)控(游離狀態(tài)、多酶復(fù)合物、膜上的有序分布等不同的組織形式使得代謝速率可有較大差別)和相反途徑的協(xié)同調(diào)控(即一條途徑的
4、激活加速必然伴隨另一條相反途徑的減慢和關(guān)閉)第5頁/共72頁酶活性的變構(gòu)調(diào)節(jié) 前饋和反饋代謝(中間)底物對代謝(中間)產(chǎn)物的效應(yīng)稱為前饋;代謝產(chǎn)物對前面的代謝(起始或分支點(diǎn)處)底物的效應(yīng)稱為反饋。如效應(yīng)為正,使代謝速度 ,則稱為激活,反之稱為抑制。反饋抑制是最常見的形式。 反饋抑制的常見類型 線形通路的反饋抑制 逐步反饋抑制 同功酶的調(diào)節(jié) 第6頁/共72頁 協(xié)同反饋抑制 舉例: 天冬氨酸代謝的同功酶調(diào)節(jié)第7頁/共72頁酶活性的共價調(diào)節(jié) 定義:指被修飾酶的特定氨基酸殘基在酶催化下發(fā)生可逆共價修飾,從而改變酶活性的調(diào)節(jié)作用。又稱為酶的化學(xué)修飾。主要有磷酸化/脫磷酸(最常見)、乙?;?脫乙酰、腺苷化
5、/脫腺苷、甲基化/脫甲基。第8頁/共72頁蛋白激酶的調(diào)節(jié)作用第9頁/共72頁指由于細(xì)胞內(nèi)膜系統(tǒng)的分隔形成的不同區(qū)域(線粒體、葉綠體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、細(xì)胞核、溶酶體等)而使得不同代謝過程可以在不同的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)區(qū)域中有條不紊的進(jìn)行。代謝的調(diào)節(jié)在分隔中進(jìn)行,并與細(xì)胞整體的生命活動保持協(xié)調(diào)。這對于細(xì)胞的正常的生命活動過程非常必要。 舉例 胞液:糖酵解途徑、脂肪酸合成 線粒體:三羧酸循環(huán)、呼吸鏈、 -氧化 葉綠體:光合作用 細(xì)胞水平的調(diào)節(jié)第10頁/共72頁代謝途徑的形式a. 自由擴(kuò)散(氨基酸合成) b. 膜上進(jìn)行(三羧酸循環(huán)) c. 多酶復(fù)合物(脂肪酸合成)第11頁/共72頁整體水平的調(diào)節(jié) 主要指由激素和神經(jīng)介
6、質(zhì)引起的對生物體的整體調(diào)節(jié)作用,包括細(xì)胞間、細(xì)胞內(nèi)的調(diào)節(jié)過程等。已在激素和細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)一章中介紹。第12頁/共72頁第九章第九章 糖代謝糖代謝 第一節(jié) 糖酵解(EMP) 第二節(jié) 葡萄糖異生作用 第三節(jié) 檸檬酸循環(huán)(TCA循環(huán)) 第四節(jié) 磷酸戊糖途徑(PPP) 第五節(jié) 糖原的代謝第13頁/共72頁糖酵解 定義指一分子葡萄糖轉(zhuǎn)變?yōu)?分子丙酮酸的一系列酶促反應(yīng)過程。(廣義概念) 代謝途徑反應(yīng)主要分為途經(jīng)的第一階段(5步反應(yīng),1分子葡萄糖轉(zhuǎn)變?yōu)?分子的甘油醛-3-磷酸。特點(diǎn):需能過程,消耗2分子ATP)、途經(jīng)的第二階段(5步反應(yīng), 2分子甘油醛-3-磷酸2分子丙酮酸。特點(diǎn):放能過程,生成4分子ATP)
7、。 總反應(yīng)式: 葡萄糖+2ADP+2Pi+2NAD+ 2丙酮酸+2ATP+2NADH+2H+2H2O 丙酮酸的去向包括(1)有氧條件下,轉(zhuǎn)化為乙酰CoA,進(jìn)入TCA循環(huán)或用于其它大分子物質(zhì)的合成反應(yīng);(2)無氧條件下,進(jìn)行發(fā)酵,產(chǎn)物多種,取決于生物類型等。第14頁/共72頁糖酵解途徑第15頁/共72頁糖酵解途徑(1)第16頁/共72頁糖酵解途徑(2)第17頁/共72頁肝臟種G-6-P的中心作用第18頁/共72頁糖酵解的調(diào)控 糖酵解的調(diào)控位點(diǎn)有三個:己糖激酶、磷酸果糖激酶、丙酮酸激酶。 己糖激酶/葡萄糖激酶肌肉細(xì)胞中己糖激酶受G-6-P的反饋抑制,肝細(xì)胞中葡萄糖激酶無此反饋抑制,但受血糖水平調(diào)控
8、。此外,長鏈脂酰CoA(別構(gòu)抑制)。 磷酸果糖激酶(PFK)PFK1催化G-6-P1,6-FBP,是EMP的限速酶,調(diào)節(jié)物:ATP(高濃度)和檸檬酸,AMP、ADP和2,6-FBP。 丙酮酸激酶有同工酶。(1)別構(gòu)調(diào)節(jié)調(diào)節(jié)物:ATP、乙酰CoA和長鏈脂肪酸(對所有形式的同工酶), 2,6-FBP;(2)共價調(diào)節(jié) 肝細(xì)胞的丙酮酸激酶(L型)受磷酸化調(diào)節(jié),血糖胰高血糖素cAMPPKA丙酮酸激酶(L型)磷酸化失活EMP,糖異生。丙酮酸激酶(L型)去磷酸化酶活 EMP。第19頁/共72頁糖酵解途徑的調(diào)控第20頁/共72頁胰高血糖素(胰高血糖素(GlucagonGlucagon)對肝臟糖酵解的效應(yīng))對肝
9、臟糖酵解的效應(yīng)第21頁/共72頁磷酸果糖激酶(PFK)調(diào)控位點(diǎn)(1)第22頁/共72頁糖酵解的生理意義 EMP是單糖分解代謝的一條最重要的基本途徑。 EMP能提供能量使機(jī)體或組織有效地適應(yīng)缺氧情況。 EMP是在正常氧供應(yīng)情況下,某些組織或細(xì)胞的主要獲能方式。如無線粒體的紅細(xì)胞,代謝活躍的白細(xì)胞和骨髓細(xì)胞。 EMP是葡萄糖完全氧化分解成二氧化碳和水的必要準(zhǔn)備階段。第23頁/共72頁糖異生與糖酵解的比較(左)糖酵解;(右)糖異生糖異生中除了要繞過糖酵解中的三步不可逆反應(yīng)外,其余都是糖酵解的可逆反應(yīng)。糖異生中的三步不可逆反應(yīng)過程是:(1)丙酮酸羧化酶和PEP羧激酶協(xié)同完成丙酮酸草酰乙酸 PEP(2)
10、果糖-1,6-二磷酸酶催化1,6-FDP F-6-P(3)葡萄糖-6-磷酸酶催化G-6-P G糖異生(2丙酮酸G)的能量消耗:6個高能鍵。不同起始底物的糖異生的能量消耗隨經(jīng)過的代謝途徑的差異而不同。第24頁/共72頁糖異生途徑第25頁/共72頁糖異生作用與糖酵解的協(xié)同調(diào)控糖異生作用與糖酵解的協(xié)同調(diào)控 EMP 糖異生 ,反之亦然。兩條途徑是通過三個不可逆反應(yīng)的調(diào)節(jié)酶的調(diào)節(jié)(見前述)進(jìn)行的。此外2,6-FDP參與調(diào)控。 2,6-FDP參與的調(diào)控機(jī)制 PFK-1催化EMP中的F-6-P1,6-FDP,PFK-2則催化F-6-P2,6-FDP。2,6-FDPPFK-1和EMP ,F(xiàn)BPase-1和糖異
11、生 。 FBPase-1催化1,6-FDPF-6-P,而FBPase-2催化2,6-FDPF-6-P。 PFK-2+ATPFBPase-2+ADP,cAMP-PK激活正向反應(yīng)。 血糖 胰高血糖素 FBPase-2 2,6-FDP PFK-1和EMP ,糖異生 血糖 ; 血糖 胰島素 蛋白的脫磷酸 PFK-2 2,6-FDP PFK-1和EMP ,糖異生 血糖 。第26頁/共72頁肝臟中糖酵解和糖異生的調(diào)控肝臟中糖酵解和糖異生的調(diào)控第27頁/共72頁丙酮酸的去路丙酮酸的去路 無氧條件下丙酮酸的去路 1. 生成乳酸 乳酸脫氫酶催化丙酮酸乳酸,需一分子NADPH+H+ 2. 生成乙醇 丙酮酸乙醛乙醇
12、,分別由丙酮酸脫羧酶、乙醇脫氫酶催化,需一分子NADPH+H+ 此外,隨微生物菌株和營養(yǎng)環(huán)境條件的不同,厭氧發(fā)酵的產(chǎn)物還有多種。如丙二醇、乙酸、甘油、丁醇、丁酸、異丙醇等。 有氧條件下的丙酮酸的去路 生成乙酰輔酶A,進(jìn)入TCA循環(huán)第28頁/共72頁丙酮酸脫氫酶復(fù)合物E1:丙酮酸脫氫酶 E2:二氫硫辛酰轉(zhuǎn)乙酰基酶 E3:二氫硫辛酰脫氫酶第29頁/共72頁丙酮酸脫氫酶復(fù)合物E1:丙酮酸脫氫酶 E2:二氫硫辛酰轉(zhuǎn)乙?;?E3:二氫硫辛酰脫氫酶第30頁/共72頁丙酮酸脫氫酶的調(diào)控 1. 別構(gòu)調(diào)節(jié)ATP、NADH、乙酰CoA和脂肪酸, AMP、coASH和NAD(+)。 2. 共價調(diào)節(jié)酶的脫磷酸化為活
13、性態(tài),酶的磷酸化為失活態(tài),相互轉(zhuǎn)變由特定的蛋白激酶控制。第31頁/共72頁丙酮酸脫氫酶復(fù)合物的調(diào)控(1)第32頁/共72頁丙酮酸脫氫酶復(fù)合物的調(diào)控(2)第33頁/共72頁TCATCA循環(huán)循環(huán)第34頁/共72頁三羧酸循環(huán)中加入的三羧酸循環(huán)中加入的2C2C單位的命單位的命運(yùn)運(yùn)第35頁/共72頁三羧酸循環(huán)的調(diào)控 三羧酸循環(huán)的調(diào)節(jié)主要體現(xiàn)在兩個水平上: 1. 底物的可用性調(diào)節(jié)乙酰CoA水平對丙酮酸氧化和TCA循環(huán)都有重要調(diào)控作用。草酰乙酸的水平對TCA循環(huán)的速度也有重要影響。 2. 乙酰CoA進(jìn)入檸檬酸循環(huán)的調(diào)節(jié)取決于三羧酸循環(huán)的三個調(diào)節(jié)酶:(1)檸檬酸合酶檸檬酸、ATP、NADH和琥珀酰CoA,AD
14、P。(2.)異檸檬酸脫氫酶ATP、NADH,ADP和Ca2+。(3) 酮戊二酸脫氫酶琥珀酰CoA和NADH,Ca2+。第36頁/共72頁第37頁/共72頁E.Coli異檸檬酸脫氫酶的共價修飾調(diào)節(jié)第38頁/共72頁TCA循環(huán)的調(diào)控 表示激活 表示抑制 表示反饋第39頁/共72頁三羧酸循環(huán)的生理意義 1. TCA循環(huán)是生物機(jī)體獲得能量的主要途徑; 2. TCA循環(huán)是有機(jī)物質(zhì)完全氧化的共同途徑; 3. TCA循環(huán)是分解代謝和合成代謝途徑的樞紐; 4. TCA循環(huán)產(chǎn)生的CO2,其中一部分排出體外, 其余部分供機(jī)體生物合成需要。第40頁/共72頁葡萄糖代謝的能量(ATP)生成第41頁/共72頁TCA循環(huán)
15、的回補(bǔ)反應(yīng) 當(dāng)TCA循環(huán)的中間產(chǎn)物被抽走用于其它物質(zhì)的合成時,為了保證TCA循環(huán)的正常進(jìn)行,必須通過其他反應(yīng)來補(bǔ)充中間產(chǎn)物的消耗,這些反應(yīng)被稱為回補(bǔ)反應(yīng)。回補(bǔ)反應(yīng)的常見類型有: 1. 丙酮酸羧化生成草酰乙酸 丙酮酸+ATP+CO2+H2O草酰乙酸+Pi+ADP 丙酮酸羧化酶催化,乙酰CoA。 2. 磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)羧化生成草酰乙酸 PEP+CO2+GDP草酰乙酸+GTP PEP羧激酶催化該反應(yīng) 3. 丙酮酸羧化生成蘋果酸 丙酮酸+CO2+NADPH+H(+) 蘋果酸+NADP(+) 蘋果酸酶催化 該反應(yīng) 4. PEP羧化生成草酰乙酸 PEP+CO2+H2O草酰乙酸+Pi PEP羧化酶
16、催化該反應(yīng) 5. 氨基酸降解產(chǎn)生的碳架(-酮戊二酸、草酰乙酸、丙酮酸)可回補(bǔ) TCA循環(huán)。第42頁/共72頁三羧酸循環(huán)是中心代謝途徑三羧酸循環(huán)是中心代謝途徑第43頁/共72頁TCA循環(huán)于其它代謝的關(guān)系第44頁/共72頁發(fā)酵產(chǎn)品生產(chǎn)中的代謝調(diào)節(jié)控制 發(fā)酵的代謝調(diào)節(jié) 1自然發(fā)酵和代謝調(diào)節(jié)的發(fā)酵 2發(fā)酵的代謝調(diào)節(jié)思路 檸檬酸發(fā)酵原理 1阻斷順烏頭酸酶的催化反應(yīng) 使用以順烏頭酸酶為靶點(diǎn)的抑制劑 通過誘變造成生產(chǎn)菌種順烏頭酸酶 缺失或活力很低 2強(qiáng)化草酰乙酸回補(bǔ)途徑第45頁/共72頁發(fā)酵的代謝調(diào)節(jié)思路 選育出相關(guān)代謝途徑旺盛的菌種 設(shè)法阻斷代謝途徑,使所要求的中間產(chǎn)物 不能進(jìn)一步反應(yīng)而實(shí)現(xiàn)積累。(如酶活
17、抑制或菌種誘變成營養(yǎng)缺陷型) 必須有適當(dāng)?shù)?補(bǔ)充機(jī)制,以滿足代謝活動的最低需求,維持細(xì)胞生長,才能維持發(fā)酵持續(xù)進(jìn)行。第46頁/共72頁乙醛酸循環(huán)第47頁/共72頁乙醛酸循環(huán)第48頁/共72頁TCA循環(huán)與其它代謝途徑的關(guān)系第49頁/共72頁磷酸戊糖途徑(PPP)PPP的調(diào)控6-磷酸葡萄糖脫氫酶是該途徑的限速酶,NADP+激活該酶,即NADP+/NADPH比值該酶酶活第50頁/共72頁磷酸戊糖途徑(磷酸戊糖途徑(PPP) PPP的發(fā)生場所:脂肪組織、乳腺、腎上腺、紅細(xì)胞等的細(xì)胞胞漿中。 PPP的反應(yīng)歷程 PPP的生理意義 1. PPP是細(xì)胞產(chǎn)生還原力NADPH的主要途徑 NADPH作為供氫體,主要
18、參與合成代謝的反應(yīng),此外還參與保護(hù)細(xì)胞和某些蛋白的巰基,防止H2O2和超氧自由基對細(xì)胞的損傷。 2. PPP為DNA、RNA和多種輔酶的合成提供5-磷酸核糖,也為氨基酸的合成提供4-磷酸赤蘚糖。第51頁/共72頁磷酸戊糖途徑(PPP)第52頁/共72頁糖原降解 需要糖原磷酸化酶(降解從非還原端開始)、脫支酶和磷酸葡萄糖變位酶(G-1-PG-6-P)。終產(chǎn)物是G-6-P 。 糖原磷酸化酶為途徑的調(diào)節(jié)酶。其別構(gòu)激活劑是AMP,別構(gòu)抑制劑是ATP和G-6-P。在共價調(diào)節(jié)中,其磷酸化狀態(tài)是活性態(tài),非磷酸化狀態(tài)是無活性態(tài)。 淀粉磷酸解時需要的酶是淀粉磷酸化酶(降解從非還原端開始) 、轉(zhuǎn)移酶與脫支酶,降解
19、從非還原端開始,終產(chǎn)物是G-1-P。 淀粉水解需要淀粉酶( -淀粉酶作用于淀粉或糖原內(nèi)部的 -1,4-糖苷鍵; -淀粉酶從淀粉的非還原端開始水解,釋放出麥芽糖)、脫支酶和麥芽糖酶,終產(chǎn)物是G。第53頁/共72頁第54頁/共72頁糖原合成 單糖的活化形式:NDP-單糖(糖原或淀粉合成中常用UDPG) 合成引物:糖原引物連接在糖原蛋白上 糖元合成需要糖原合酶、UDP-葡萄糖焦磷酸化酶、糖原分支酶。糖原合酶是調(diào)節(jié)酶第55頁/共72頁糖元合成與降解的協(xié)同調(diào)控 糖原磷酸化酶和糖原合酶分別是糖原合成與降解兩條途徑的限速酶。兩者的協(xié)同調(diào)控維持了血糖水平的穩(wěn)定,協(xié)同調(diào)控體現(xiàn)在兩方面: (1)糖原磷酸化酶和糖原
20、合酶的別構(gòu)調(diào)節(jié) G和G-6-P是兩種酶的別構(gòu)抑制劑,在激活糖原合酶的同時也抑制糖原磷酸化酶,對兩條途徑進(jìn)行相反的調(diào)節(jié)。第56頁/共72頁 (2)磷酸化/脫磷酸化對糖原磷酸化酶和糖原合酶的協(xié)同調(diào)控 a)磷酸化調(diào)節(jié)磷酸化作用使無活性的糖原磷酸化酶b轉(zhuǎn)變?yōu)橛谢钚缘奶窃姿峄竌,而使有活性的糖原合酶a轉(zhuǎn)變?yōu)闊o活性的糖原合酶b。(胰高血糖素和腎上腺素cAMPPKAPKA信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑) b)脫磷酸化調(diào)節(jié)磷酸蛋白磷酸酶1可催化糖原合酶、糖原磷酸化酶和磷酸化酶b激酶的脫磷酸化,使糖原合酶被激活,而糖原磷酸化酶和磷酸化酶b激酶被抑制,導(dǎo)致糖原合成途徑開啟,糖原降解途徑關(guān)閉。第57頁/共72頁第58頁/共72頁
21、肝臟中葡萄糖對糖原降解的調(diào)控作用第59頁/共72頁肝臟中糖酵解和糖異生的調(diào)控第60頁/共72頁糖原磷酸化酶的激活與糖原合成酶的失活第61頁/共72頁糖原合成酶的激活與糖原磷酸化酶的失活第62頁/共72頁糖原磷酸化酶的結(jié)構(gòu)第63頁/共72頁糖酵解 定義指一分子葡萄糖轉(zhuǎn)變?yōu)?分子丙酮酸的一系列酶促反應(yīng)過程。(廣義概念) 代謝途徑反應(yīng)主要分為途經(jīng)的第一階段(5步反應(yīng),1分子葡萄糖轉(zhuǎn)變?yōu)?分子的甘油醛-3-磷酸。特點(diǎn):需能過程,消耗2分子ATP)、途經(jīng)的第二階段(5步反應(yīng), 2分子甘油醛-3-磷酸2分子丙酮酸。特點(diǎn):放能過程,生成4分子ATP)。 總反應(yīng)式: 葡萄糖+2ADP+2Pi+2NAD+ 2丙
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