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文檔簡介

1、DNA甲基化的特征Chen Yan 20160829一.DNA甲基化與羥甲基化1.胞嘧啶2.第五個(gè)C原子上3.甲基或羥甲基的修飾二.DNA甲基化分布DNA甲基化發(fā)生在CpG dinucleotides 低頻率! 在人基因組中的頻率為1%，而含有42% GC ， 理論值上為（0.21 * 0.21 = 4.41 %）2. CpG island I.不被甲基化 II.長度為500-2000bp III.常分布在看家基因和特異性基因啟動子區(qū)域二.DNA甲基化的分布 1 基因內(nèi)甲基化抑制轉(zhuǎn)錄延伸，但與基因表達(dá)為正相關(guān)。 2 CpG island 不被甲基化可能與使得基因維持可以轉(zhuǎn)錄狀態(tài)有關(guān)二.DNA甲

2、基化分布的特殊情況1.在非CpG環(huán)境下的低水平甲基化 （功能未知） ES cells, oocytes, and brain （不發(fā)生DNA復(fù)制）2.啟動子中CpG island 發(fā)生甲基化 imprinted and pluripotency-related genes （長期轉(zhuǎn)錄沉默）四. DNMTs-功能名稱作用 位置缺失后果蛋白結(jié)構(gòu)DNMT1S期DNA復(fù)制的位置1全基因組甲基化降低2半甲基化CpG升高3早期胚胎死亡 CXXC domainDNMT3A1參與發(fā)育過程中甲基化重編程2協(xié)助DNMT1 生殖細(xì)胞甲基化印記建立已分化細(xì)胞出生后4周死亡PWWP domainCys-rich ADD

3、 domainDNMT3B受精卵著床后建立甲基化早期胚胎妊娠期死亡DNMT3L作為DNMT3的輔因子并激活DNMT3的活動生殖細(xì)胞生殖細(xì)胞DNA不能甲基化，從而不育四. DNMTs-結(jié)構(gòu)五.TET蛋白-結(jié)構(gòu)六.Reprogramming of DNA methylation duringpreimplantation development第一次卵裂前幾次卵裂后不發(fā)生Reprogramming of DNA methylation： 1. imprinted loci2. repeats intracisternal A particles (IAPs), L1Md_A elements, LTR ERV1 elements3. CpG

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