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文檔簡介
1、關(guān)于分子生物學(xué)實驗第1頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四基因多態(tài)性多態(tài)性是指在一個生物群體中,同時和經(jīng)常存在兩種或多種不連續(xù)的變異型或基因型(genotype)或等位基因(allele),亦稱遺傳多態(tài)性(genetic polymorphism)或基因多態(tài)性。DNA片段長度多態(tài)性基因多態(tài)性DNA重復(fù)序列多態(tài)性單核苷酸多態(tài)性 第2頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四DNA片段長度多態(tài)性(FLP):即由于單個堿基的缺失、重復(fù)和插入所引起限制性內(nèi)切酶位點的變化,而導(dǎo)致DNA片段長度的變化,又稱限制性片段長度多態(tài)性。DNA重復(fù)序列的多態(tài)性(RSP) :主要
2、表現(xiàn)于重復(fù)序列拷貝數(shù)的變異 ,如小衛(wèi)星DNA和微衛(wèi)星DNA。單核苷酸多態(tài)性(SNP) :即散在的單個堿基的不同,基因組中單核苷酸的缺失,插入與重復(fù)序列不屬於SNP,但更多的是單個堿基的置換。 第3頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四CLEC 是C type lectin(C型凝集素)家族基因 CLEC4M基因是19號染色體上C型凝集素家族中的一員,它被證明是多種傳染性疾病病毒的受體,如HIV-1, SARS-Cov, HCV等。該基因的第4外顯子的VNTR (Variable Number of Tandem Repeats,VNTR )在全球人類群體中存在3-9次重復(fù)的
3、多態(tài)現(xiàn)象,并被認(rèn)為這種不同長度的多態(tài)可能和宿主對病毒的易感性有關(guān)。 第4頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四第5頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四CLEC4M 與SARS體內(nèi)存在一種SARS冠狀病毒的受體L-SIGN,由CLEC4M基因所編碼。該基因第4外顯子存在3-9個69bp的重復(fù)片段,人群中超過50%的人以7個重復(fù)為主,常見的基因型為7/7,5/5,7/5 等不同的純合或雜合狀態(tài),這個重復(fù)區(qū)編碼位于胞外受體的頸部。研究表明,純合型如7/7或 5/5的個體較雜合型7/5的個體較少感染SARS病毒。第6頁,共18頁,2022年,5月20日,11點
4、13分,星期四CLEC 4M基因序列第7頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四實驗原理原理:用裂解液和蛋白酶K裂解口腔黏膜細(xì)胞,釋放DNA,用濃鹽法沉淀蛋白質(zhì),離心去除蛋白質(zhì),再用異丙醇沉淀DNA。裂解液配方:10mM Tris-HCl,10mM KCl, 10mM MgCl2, 2mM EDTA, 0.4M NaCl, 1%SDS.第8頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四第9頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四2PCR mixddH2O引物1,引物22PCR mix 10l引物1,引物2 各0.4lddH2O 6.2l DNA樣
5、品 3l PCR反應(yīng)體系, 總共20 l第10頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四在PCR管蓋上標(biāo)記號碼,便于辨認(rèn)第11頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四放入PCR儀,并設(shè)置程序變性 95 5min 95 20s30循環(huán) 59 30s 72 45s延伸 72 5min第12頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四PCR過程大概100分鐘第13頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四PCR儀器界面和參數(shù)第14頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四紫外透射分析第15頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四點 樣將PCR擴增產(chǎn)物加入瓊脂糖凝膠孔內(nèi),點樣量10l第16頁,共18頁,2022年,5月20日,11點13分,星期四100bp DNA marker,最亮的為500bp500bp雜合子,根據(jù)位置判斷為589和727bp。雜帶,分子量小,或是引物二聚體結(jié)果分析同學(xué)們,你們的基因是
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