外文期刊論文的檢索工具(2013)課件

1、南方醫(yī)圖書(shū)館系列講座課件下載地址/Article.aspx?id=13中科院圖書(shū)館開(kāi)放信息素質(zhì)教育服務(wù)平臺(tái) /index.php/%E9%A6%96%E9%A1%B5網(wǎng)易云課堂-中科大“文獻(xiàn)管理與信息分析”課/course/introduction.htm?courseId=304003#/courseDetail用于檢索外文期刊論文的摘要型數(shù)據(jù)庫(kù)SMU圖書(shū)館 文獻(xiàn)采編部許四洋2013-10-21 Outline:1 數(shù)據(jù)庫(kù)介紹（生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域外文期刊論文）2 不同數(shù)據(jù)庫(kù)之間在收錄文獻(xiàn)方面的對(duì)比3 在PubMed中 如何檢索一個(gè)課題的相關(guān)文獻(xiàn)？4 對(duì)PubMed檢出文獻(xiàn)的分析？1 數(shù)據(jù)庫(kù)介紹（生

2、物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域外文期刊論文）摘要型數(shù)據(jù)庫(kù) (bibliographic database) PubMed （MEDLINE） BIOSIS Preview(生物學(xué)文摘) EMBASE.com Science Citation Index (Web of Science) Engineering Index ( Engineering Village) Chemical Abstract (化學(xué)文摘) SciFINDER更細(xì)分專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)護(hù)理 The British Nursing Index (BNI)心理 PsycLIT藥學(xué) International Pharmaceutical Abstra

3、ct 。數(shù)據(jù)庫(kù)介紹（藥學(xué)領(lǐng)域外文論文）Derwent Drug FileInternational Pharmaceutical AbstractDrug Information Fulltext1 數(shù)據(jù)庫(kù)介紹（生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域外文期刊論文）摘要型數(shù)據(jù)庫(kù) (bibliographic database) EMBASE.com Science Citation Index (Web of Science) Engineering Index ( Engineering Village) 聯(lián)系61648053 預(yù)約使用 。 。1 數(shù)據(jù)庫(kù)介紹（生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域外文期刊論文）摘要型數(shù)據(jù)庫(kù) (bibliogra

4、phic database) Chemical Abstract (化學(xué)文摘) SciFINDER 只能到中大或華工等圖書(shū)館使用2 不同數(shù)據(jù)庫(kù)之間在收錄文獻(xiàn)方面的對(duì)比 1999年英國(guó)循證醫(yī)學(xué)中心和MCDONALD對(duì)有關(guān)“PSYCHIATRY AND NEUROLOGY”學(xué)科方面的4個(gè)生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)收錄期刊進(jìn)行了比較，收錄相關(guān)專業(yè)期刊多寡順序?yàn)椋篜sycLIT(73)EMBASE(67)MEDLINE(47)BIOSIS(48)75%91%BP and MEDLINE and EMBASEBiosis Previews and EMBASEBP and MEDLINE (PubMed)跨庫(kù)檢索的

5、平臺(tái)EMBASE.com EMBASE MEDLINEWeb of Knowledge MEDLINE, BP, SCI, PubMed ScienceDirect SMU讀者可用 PubMed 開(kāi)放獲取期刊 PubMed簡(jiǎn)介 National Library of Medicine管理下的 National Center for Biotechnology Information (NCBI)建立的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)，使用NCBI的Entrez檢索平臺(tái)。NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)生物信息學(xué)資源推薦華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 生物信息學(xué) /kech/swxxx/北京大學(xué)生物信息中心 /chinese/生物信息學(xué)研

6、究論壇網(wǎng) /forum.php生物信息學(xué)天空 /portal.phpPubMed簡(jiǎn)介(contd)檢索生物醫(yī)學(xué)期刊論文的摘要數(shù)據(jù)庫(kù)；收錄文獻(xiàn)的時(shí)間范圍： 1800？- Update everyday (Tuesday - Saturday)外文文獻(xiàn)起始：PubMed摘要型數(shù)據(jù)庫(kù)全文數(shù)據(jù)庫(kù)ScieneDirectSpringerLinkEbscoOvid LWWScience onlineWiley 最老的？最新的！PubMed簡(jiǎn)介(contd)來(lái)源期刊 5376 English 4806 （約占85%) Chinese 69 French Japanese Italy Germany 期刊論文

7、發(fā)表時(shí)所用的語(yǔ)言PubMed檢索基本檢索功能 利用不同字段，高效完成檢索 利用MeSH，進(jìn)一步提高檢索效率 針對(duì)臨床的兩個(gè)檢索工具 clinical query topic-specific queryGene targetingGene targeting你的檢索詞被處理后，變成這樣的檢索式PubMed檢索Automatic Term Mapping 對(duì)于用戶在檢索框中輸入的檢索詞或詞組，系統(tǒng)將依次到MeSH詞轉(zhuǎn)換表、短語(yǔ)表（Phrase list）、作者索引、期刊名稱索引中進(jìn)行詞語(yǔ)匹配查找。Automatic Term Mapping的基礎(chǔ)PubMed使用的詞表：2013版的MeSH詞表收

8、錄有26 853個(gè)主題詞（Medical Subject Heading）213 000個(gè)入口詞(entry term)PubMed檢索PubMed檢索 有關(guān)高頻心電圖的自動(dòng)分析的文獻(xiàn) high frequency electrocardiography AND automatic analysis這樣一個(gè)檢索式，會(huì)被處理成什么樣？(AutomaticAll Fields AND (analysisSubheading OR AnalysisText Word) AND (HighAll Fields AND (epidemiologySubheading OR (epidemiologyTI

9、AB NOT MedlineSB) OR epidemiologyMeSH Terms OR FrequencyText Word) AND (electrocardiographyTIAB NOT MedlineSB) OR electrocardiographyMeSH Terms OR ElectrocardiogramText Word)提高檢索的效率：詞組檢索 在詞組的首尾加“ ” 在詞組最后一個(gè)詞的末尾加* 在詞組后限定檢索字段，如TI如何實(shí)現(xiàn)詞組檢索 gene targeting Gene targeting*Gene targeting* Gene targetingTIABG

10、ene targetingTIPubMed高級(jí)檢索tagField nameTag field nameABAbstract摘要TI TitleADAffiliation 單位MHMeSH Terms主題詞AUAuthorPTPublication TypeDPPublication DateSOSourceTWText WordTAJournal TitleTIABTItle/ABstractLA LanguageISISSNCPPublication CountryPubMed 常用字段檢索有關(guān)粘脂質(zhì)累積癥的相關(guān)文獻(xiàn)mucolipidoses 粘脂貯積癥(mucolipidoses)又稱包

11、涵體細(xì)胞病(inclusion cell disease)，簡(jiǎn)稱I-cell病。其臨床特征表現(xiàn)為出生時(shí)就有明顯的臨床和X線異常，反應(yīng)遲鈍，皮膚成纖維細(xì)胞培養(yǎng)有大量粗大細(xì)胞質(zhì)包涵體。 Leroy等(1967)最早發(fā)現(xiàn)此病,Spranger(1970)將其分類為黏脂貯積癥型.全！準(zhǔn)？提高檢出文獻(xiàn)的相關(guān)度 （檢準(zhǔn)率）特定字段檢索 （Fields Search）Title 題目MeSH Major Topic 主要醫(yī)學(xué)主題詞MeSH 醫(yī)學(xué)主題詞Title/Abstract 題目或摘要Text word 文本詞或關(guān)鍵詞文獻(xiàn)太多，如何保證查全和查準(zhǔn)？Mesh(Medical Subject Heading

12、s) 詞表！ 美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館編制的權(quán)威性主題詞表。 MeSH在文獻(xiàn)檢索中的重要作用主要表現(xiàn)在兩個(gè)方面：準(zhǔn)確性（準(zhǔn)確標(biāo)識(shí)文獻(xiàn)內(nèi)容的主題）和唯一性。PubMed檢索主題詞關(guān)鍵詞流感, 禽禽流感、鳥(niǎo)流感、家禽瘟癥、雞瘟NeoplasmsNeoplasm、Tumors、Tumor、CancerAspirinAspirin、Acetylsalicylic Acid、Micristin、Solprin為什么要用MeSH主題詞檢索？為什么要用MeSH主題詞檢索？MeSH term Mucolipidoses（mucolipidosisTIAB OR mucolipidosesTIAB） OR （muco

13、lipidosisText Word OR mucolipidosesText Word ）OR mucolipidosesMeSH 提高檢出文獻(xiàn)的數(shù)量與相關(guān)度PubMed都有些什么數(shù)據(jù)內(nèi)容呢？Publisher Supplied CitationsPreMedlinePubMedMEDLINEOLDMEDLINEPubMed not MedlineMEDLINE-記錄中用indexed for MEDLINE 數(shù)據(jù)來(lái)源于1966年始美國(guó)和其他70多個(gè)國(guó)家(包括中國(guó)在內(nèi))出版的4800余種生物醫(yī)學(xué)期刊，內(nèi)容涉及醫(yī)學(xué)、護(hù)理、健康保健等學(xué)科，目前已達(dá)1 500萬(wàn)余條，并以年30余萬(wàn)條遞增。OLDM

14、EDLINE-記錄中用PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966以早期印刷版美國(guó)醫(yī)學(xué)索引（CIM）為主要收集對(duì)象，目前收錄約200萬(wàn)條1951一1965年間生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)，無(wú)文摘、未經(jīng)主題詞標(biāo)引。PreMedline-記錄中用PubMedin Process 未及加工、標(biāo)引(尚未規(guī)范化處理）的新收文獻(xiàn)，這部分文獻(xiàn)每日更新一次。Publisher Supplied Citations-記錄中用PubMed-as supplied by publisher 。 由出版商直接傳輸?shù)碾娮有臀墨I(xiàn)，每日都有新加入文獻(xiàn)。PubMed not Medline- 記錄中用PubMed 部分Medl

15、ine期刊(如一些科學(xué)通論期刊和化學(xué)期刊)未收錄的文獻(xiàn),全文電子期刊PMC ( PubMed Central)上發(fā)表的文獻(xiàn)。減肥藥的副作用方面的英文文獻(xiàn)？ （要求涉及的研究對(duì)象為19-24歲的年輕女性。）Anti-Obesity Agents/adverse effectsMeshLimits: 時(shí)間、語(yǔ)言、實(shí)驗(yàn)對(duì)象、性別PubMed檢索PubMed檢索請(qǐng)利用PubMed檢索2000年以來(lái)有關(guān)65歲以上老人阿爾茨海默?。ˋlzheimer Disease）死亡率（mortality）的多元分析 (meta analysis)文獻(xiàn)。 Filters：發(fā)表時(shí)間；實(shí)驗(yàn)對(duì)象；Alzheimer Dis

16、ease/mortalityMesh#1 meta - analysisMeSH# 2 review literatureMeSH# 3 meta analy* TW# 4 (systematic* AND (review* or overview) # 5 meta - analysis PT# 6 review PT# 7 review TI# 8 review literature PT# 9 #1 OR #2 OR #3 OR #4 OR #5 OR #6 OR #7 OR #8PubMed檢索檢索拉赫散依爾瑪茲(Rahsan Yilmaz)的文獻(xiàn) Yilmaz, R zhong sz

17、 利用 author index ，結(jié)合作者的單位， 全面檢索一位作者發(fā)表的文章。 PubMed檢索：輔助檢索的功能鍵Filters 條件的增、減Detail 檢查系統(tǒng)執(zhí)行的檢索式History 檢索歷史Index 索引PubMed檢出結(jié)果的顯示檢出結(jié)果的顯示格式 summary 填寫(xiě)參考文獻(xiàn)的基本信息 abstract 提供全文鏈接 medline 可以幫助查看MeSH字段 保存、輸出到EndnoteDisplay: SummaryPubMed中的非英文文獻(xiàn)Display: AbstractDisplay: MEDLINEPubMed檢出結(jié)果的處理檢出結(jié)果保存到EndNote或NoteExp

18、ress 以MEDLINE格式保存，選擇濾鏡導(dǎo)入檢出結(jié)果的全文獲取 SMU圖書(shū)館已經(jīng)購(gòu)買(mǎi)的全文 free fulltext 圖書(shū)館的文獻(xiàn)傳遞服務(wù) 丁香園文獻(xiàn)求助4 對(duì)PubMed 檢出文獻(xiàn)的分析（1） 提供文獻(xiàn)分析功能的平臺(tái) ISI Web of Knowledge （2）文獻(xiàn)內(nèi)容分析軟件 文本信息分析軟件RefViz 全文分析軟件Quosa 。/GoPubmedGO+MeSH 知識(shí)挖掘工具GoPubMed是德國(guó)Transinsight公司和德國(guó)德累斯頓大學(xué)合作，利用生物信息學(xué)相關(guān)知識(shí)開(kāi)發(fā)的一個(gè)可以對(duì)PubMed檢索結(jié)果進(jìn)行探索、分析的工具。/ Gene Ontology (GO)Controlled vocabulary for the annotation of gene products/19,468 term