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文檔簡介

遺傳(heredity

):

上一代生物將自身的一整套遺傳基因穩(wěn)定地傳遞給下一代的特性。變異(variation):

生物體在某種外因或內(nèi)因的作用下,發(fā)生遺傳物質(zhì)結(jié)構(gòu)或數(shù)量的改變,而且這種改變穩(wěn)定,具有可遺傳性。引言1.遺傳與變異遺傳保證了微生物種的相對穩(wěn)定性、種的存在和延續(xù),而變異則推動了種的進(jìn)化和發(fā)展。2.遺傳型和表型遺傳型(genotype)表型(phenotype)某一生物體個體所含有的全部遺傳因子,即基因的總和

,又稱為基因型。某一生物體所具有的一切外表特征及內(nèi)在特性的總和。

表型的實現(xiàn)是由生物體的遺傳型和環(huán)境條件共同作用的結(jié)果。飾變(modification)

表型的差異只與環(huán)境有關(guān)。不涉及遺傳物質(zhì)結(jié)構(gòu)改變而只發(fā)生在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)譯水平上的表型改變。

谷氨酸發(fā)酵的溫度敏感菌株在30℃時菌體生長而不產(chǎn)生氨基酸,但是當(dāng)溫度提高到37℃時,菌體大量合成谷氨酸。變異遺傳物質(zhì)改變,導(dǎo)致表型改變

3.飾變與變異(遺傳型變異,基因突變)特點:遺傳性、群體中極少數(shù)個體的行為

(自發(fā)突變頻率通常為10-6-10-9)特點:暫時性、不可遺傳性、表現(xiàn)為全部個體的行為。第一節(jié)遺傳變異的物質(zhì)基礎(chǔ)一、證明核酸是遺傳物質(zhì)基礎(chǔ)的三個經(jīng)典實驗二、遺傳物質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)存在部位和方式經(jīng)典轉(zhuǎn)化實驗:

證明DNA是遺傳變異的物質(zhì)基礎(chǔ)。Avery在四十年代以更精密的實驗設(shè)計重復(fù)了以上實驗分別用S型菌中提取的DNA、RNA和蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)化R型菌且DNA被酶降解破壞的抽提物無轉(zhuǎn)化活性DNA是轉(zhuǎn)化所必需的轉(zhuǎn)化因子一、三個經(jīng)典實驗T2噬菌體感染實驗2.噬菌體感染實驗(1952年,A.D.Hershey和M.Chase)3.植物病毒的重建實驗證明雜種病毒的蛋白質(zhì)外殼來自TMV還是HRV,可用血清學(xué)反應(yīng)鑒定證明核酸(RNA)是遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)血清學(xué)反應(yīng)說明病毒蛋白質(zhì)的特性由核酸而定H.Fraenkel-Conrat(1956年)病斑的特性和病毒核酸一致二、遺傳物質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)存在的部位和方式(一)七個水平細(xì)胞水平(單核,多核)細(xì)胞核水平(真核,擬核)染色體水平核酸水平(DNA,部分病毒為RNA;雙鏈,少數(shù)病毒為單鏈)基因水平(遺傳功能單位)密碼子水平(遺傳信息單位)核苷酸水平(最低突變單位和交換單位)周德慶p192-197;自學(xué)(一套,兩套,核外染色體)基因(gene)是什么?

是實體,其物質(zhì)基礎(chǔ)是DNA

(或RNA);

是一個含有特定遺傳信息的DNA分子區(qū)段;

是遺傳信息傳遞和性狀分化發(fā)育的依據(jù);

基因是可分的,根據(jù)功能不同,分為:編碼蛋白質(zhì)的基因結(jié)構(gòu)基因(結(jié)構(gòu)蛋白,酶)調(diào)節(jié)基因(阻遏蛋白或激活蛋白)無翻譯產(chǎn)物的基因tRNA基因(簡稱tDNA

rRNA基因(簡稱rDNA

不轉(zhuǎn)錄的DNA區(qū)段啟動子(promotor)操縱基因(operator)基因是一個含有特定遺傳信息的核苷酸序列,它是遺傳的功能單位。第二節(jié)質(zhì)粒P196質(zhì)粒(plasmid)一種獨立于染色體外,能進(jìn)行自主復(fù)制的細(xì)胞質(zhì)遺傳因子,主要存在于各種微生物細(xì)胞中。附加體(episome)指哪些既可以整合到核染色體上,作為染色體的一部分而進(jìn)行復(fù)制,又可以再游離出來或攜帶一些寄主的染色體基因游離出來,這類質(zhì)粒被稱為附加體。

1、質(zhì)粒的分子結(jié)構(gòu)(1)結(jié)構(gòu)通常以共價閉合環(huán)狀(covalentlyclosedcircle,簡稱CCC)的超螺旋雙鏈DNA分子存在于細(xì)胞中;也發(fā)現(xiàn)有線型雙鏈DNA質(zhì)粒和RNA質(zhì)粒;質(zhì)粒分子的大小范圍從1kb左右到1000kb;(細(xì)菌質(zhì)粒多在10kb以內(nèi))2.質(zhì)粒的分離堿提取法:①菌體的培養(yǎng)和收集:一般采用豐富培養(yǎng)基對菌體進(jìn)行培養(yǎng),當(dāng)細(xì)胞生長到指數(shù)期后期時,離心收集細(xì)胞。②溶菌:一般用溶菌酶去壁以形成原生質(zhì)體或原生質(zhì)球。③堿變性處理:在SDS等表面活性劑存在下加NaOH液使pH升至12.4,可使菌體蛋白質(zhì)、染色體DNA以及質(zhì)粒DNA變性。④質(zhì)粒復(fù)性:加入pH4.8的KAc-HAc緩沖液,將提取液調(diào)至中性,由于質(zhì)粒分子量小而容易復(fù)性,并穩(wěn)定存在于溶液中;染色體DNA分子量太大,在復(fù)性過程中形成DNA之間的交聯(lián)導(dǎo)致其形成更大分子的不溶性物質(zhì)。⑤離心分離:經(jīng)高速離心可以使細(xì)胞碎片和已變性的菌體蛋白及染色體DNA一起沉淀,上清液中主要是質(zhì)粒DNA,經(jīng)乙醇沉淀后,可獲得質(zhì)粒DNA。(參見P197)3.質(zhì)粒的檢測提取所有胞內(nèi)DNA后電鏡觀察;氯化銫-溴化乙啶密度梯度超速離心;

對于實驗室常用菌,可用質(zhì)粒所帶的某些特點,如抗藥性初步判斷。對于由于三種構(gòu)型同時存在時造成的多帶現(xiàn)象(提取質(zhì)粒時造成或自然存在),可以進(jìn)行特異性單酶切,使其成為一條帶。

瓊脂糖凝膠電泳后觀察;4.質(zhì)粒的特性(1)位于核基因組外;(3)自主復(fù)制;(2)cccDNA鏈霉菌和酵母菌中發(fā)現(xiàn)了線狀dsDNA質(zhì)粒和RNA質(zhì)粒(4)有的質(zhì)??烧系胶巳旧w上;(5)可重組(質(zhì)粒與質(zhì)粒間,質(zhì)粒與染色體間);(6)人為消除(丫叮類,UV,電離輻射,利福平等)(7)有的質(zhì)粒可在細(xì)胞間轉(zhuǎn)移(F因子,R因子)質(zhì)粒所含的基因?qū)λ拗骷?xì)胞一般是非必需的;有時能賦予宿主細(xì)胞以特殊的機能,從而使宿主得到生長優(yōu)勢5、質(zhì)粒的主要類型根據(jù)質(zhì)粒所編碼的功能和賦予宿主的表型效應(yīng)分類:致育因子(Fertilityfactor,F(xiàn)因子)抗性質(zhì)粒(Resistancefactor,R因子)產(chǎn)細(xì)菌素的質(zhì)粒(Bacteriocinproductionplasmid)毒性質(zhì)粒(virulenceplasmid)代謝質(zhì)粒(Metabolicplasmid)隱秘質(zhì)粒(crypticplasmid)2μm質(zhì)粒(參見P197)(1)致育因子(Fertilityfactor,F(xiàn)因子)又稱F質(zhì)粒,其大小約100kb,這是最早發(fā)現(xiàn)的一種與大腸桿菌的有性生殖現(xiàn)象(接合作用)有關(guān)的質(zhì)粒。攜帶F質(zhì)粒的菌株稱為F+菌株(相當(dāng)于雄性),無F質(zhì)粒的菌株稱為F-菌株(相當(dāng)于雌性)。F因子能以游離狀態(tài)(F+)和以與染色體相結(jié)合的狀態(tài)(Hfr)存在于細(xì)胞中,所以又稱之為附加體(episome)。在志賀氏菌屬(Shigella)、沙門氏菌屬(Salmonella)和鏈球菌屬(Streptococcus)等其他細(xì)菌中也發(fā)現(xiàn)了與大腸桿菌類似的致育因子。在放線菌中,天藍(lán)色鏈霉菌含有SCP1和SCP2兩種致育質(zhì)粒,這兩種質(zhì)粒在天藍(lán)色鏈霉菌的接合過程中起重要作用,帶動染色體從供體細(xì)胞向受體細(xì)胞轉(zhuǎn)移。(參見P197)(2)抗性因子(Resistancefactor,R因子)包括抗藥性和抗重金屬二大類,簡稱R質(zhì)粒。R100質(zhì)粒(89kb)可使宿主對下列藥物及重金屬具有抗性:汞(mercuricion,mer)四環(huán)素(tetracycline,tet)鏈霉素(Streptomycin,str)、磺胺(Sulfonamide,sul)、氯霉素(Chlorampenicol,cml)夫西地酸(fusidicacid,fus)負(fù)責(zé)這些抗性的基因是成簇地存在于抗性質(zhì)粒上??剐再|(zhì)粒在細(xì)菌間的傳遞是細(xì)菌產(chǎn)生抗藥性的重要原因之一。(3)Col質(zhì)粒:產(chǎn)細(xì)菌素的質(zhì)粒(Bacteriocinproductionplasmid)細(xì)菌素結(jié)構(gòu)基因、涉及細(xì)菌素運輸及發(fā)揮作用(processing)的蛋白質(zhì)的基因、賦予宿主對該細(xì)菌素具有“免疫力”的相關(guān)產(chǎn)物的基因一般都位于質(zhì)?;蜣D(zhuǎn)座子上,因此,細(xì)菌素可以殺死同種但不攜帶該質(zhì)粒的菌株。細(xì)菌素:許多細(xì)菌都能產(chǎn)生某些代謝產(chǎn)物,抑制或殺死其他近緣細(xì)菌或同種不同菌株,因為這些代謝產(chǎn)物是由質(zhì)粒編碼的蛋白質(zhì),不象抗生素那樣具有很廣的殺菌譜,所以稱為細(xì)菌素(bacteriiocin)細(xì)菌素種類很多,一般根據(jù)產(chǎn)生菌的種類進(jìn)行命名:大腸桿菌(E.coli)產(chǎn)生的細(xì)菌素為colicins(大腸桿菌素),而質(zhì)粒被稱為Col質(zhì)粒。此外還有枯草桿菌素、乳酸菌素、根瘤菌素等。由G+細(xì)菌產(chǎn)生的細(xì)菌素或與細(xì)菌素類似的因子與colicins有所不同,但通常也是由質(zhì)?;蚓幋a,有些甚至有商業(yè)價值,例如一種乳酸細(xì)菌產(chǎn)生的細(xì)菌素NisinA能強烈抑制某些G+細(xì)菌的生長,而被用于食品工業(yè)的保藏。大腸桿菌素是產(chǎn)自大腸桿菌的一種蛋白質(zhì),具有專一性地殺死其親緣關(guān)系很近的、不具Col質(zhì)粒的其它腸道細(xì)菌的功能。(4)毒性質(zhì)粒(virulenceplasmid)許多致病菌的致病性是由其所攜帶的質(zhì)粒引起的,這些質(zhì)粒具有編碼毒素的基因,其產(chǎn)物對宿主(動物、植物)造成傷害。產(chǎn)毒素大腸桿菌是引起人類和動物腹瀉的主要病原菌之一,其中許多菌株含有為一種或多種腸毒素編碼的質(zhì)粒。蘇云金桿菌含有編碼δ內(nèi)毒素(伴孢晶體中)的質(zhì)粒根癌土壤桿菌所含Ti質(zhì)粒是引起雙子葉植物冠癭瘤的致病因子(5)

代謝質(zhì)粒(Metabolicplasmid)

質(zhì)粒上攜帶有有利于微生物生存的基因,如能降解某些基質(zhì)的酶,進(jìn)行共生固氮,或產(chǎn)生抗生素(某些放線菌)等。將復(fù)雜的有機化合物降解成能被其作為碳源和能源利用的簡單形式,環(huán)境保護(hù)方面具有重要的意義。假單胞菌:具有降解一些有毒化合物,如芳香簇化合物(苯)、農(nóng)藥(2,4dichlorophenoxyaceticacid)、辛烷和樟腦等的能力。降解質(zhì)粒TOL質(zhì)粒:含分解甲苯的基因;CAM-OCT質(zhì)粒:含分解樟腦辛烷的基因(6)隱秘質(zhì)粒(crypticplasmid)它們存在的生物學(xué)意義,目前幾乎不了解。在應(yīng)用上,很多隱秘質(zhì)粒被加以改造作為基因工程的載體(一般加上抗性基因)隱秘質(zhì)粒不顯示任何表型效應(yīng),它們的存在只有通過物理的方法,例如用凝膠電泳檢測細(xì)胞抽提液等方法才能發(fā)現(xiàn)。(7)2μm質(zhì)粒

大多數(shù)酵母菌含有一種稱為2μm的質(zhì)粒

,屬隱秘質(zhì)粒意義:2μm質(zhì)粒是酵母菌中進(jìn)行分子克隆和基因工程的重要載體,因此以它為基礎(chǔ)構(gòu)建的克隆和表達(dá)載體已得到廣泛的應(yīng)用。另一方面,該質(zhì)粒也是研究真核基因調(diào)控和染色體復(fù)制的一個十分有用的模型

-長為2m的6kb的環(huán)狀雙鏈DNA分子-位于酵母細(xì)胞核內(nèi),50~100拷貝-只攜帶與復(fù)制和重組有關(guān)的4個基因,無遺傳表型-質(zhì)粒上有兩個600bp長的IR,被一個2.7kb區(qū)域和一個2.3kb小區(qū)域所間隔-兩個IR上都有一個專一重組位點(FRT),經(jīng)過重組,可使質(zhì)?;プ儺悩?gòu)成A型和B型。根據(jù)拷貝數(shù)或復(fù)制特點,質(zhì)??煞譃椋焊呖截悢?shù)(highcopynumber)質(zhì)粒(每個細(xì)胞中可以有10~100個拷貝,其復(fù)制和染色體的復(fù)制不同步)如ColE1、ColE2等

———————松弛型質(zhì)粒(relaxedplasmid)低拷貝數(shù)(lowcopynumber)質(zhì)粒(每個細(xì)胞中只有1~2個拷貝,其復(fù)制行為與染色體的復(fù)制同步)如F因子,R100

———————嚴(yán)謹(jǐn)型質(zhì)粒(stringentplasmid)窄宿主范圍質(zhì)粒(narrowhostrangeplasmid)(只能在一種特定的宿主細(xì)胞中復(fù)制)廣宿主范圍質(zhì)粒(broadhostrangeplasmid)(可以在許多種細(xì)菌中復(fù)制)第三節(jié)基因突變的規(guī)律及類型野生型:

------從自然界分離到的菌株一般稱野生型菌株(wildtypestrain),簡稱野生型。突變株:

-----野生型經(jīng)突變后形成的帶有新性狀的菌株,稱為突變株(mutant)。一、突變(mutation)突變指細(xì)胞內(nèi)遺傳物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)或數(shù)量發(fā)生變化的現(xiàn)象。包括基因突變(又稱點突變)和染色體畸變。基因突變(genemutation):是指一個基因內(nèi)部遺傳結(jié)構(gòu)或DNA序列的任何改變,涉及一對或少數(shù)幾對堿基的置換、缺失或插入,因其發(fā)生的范圍很小,所以又稱點突變(pointmutation)。染色體畸變(chromosomalaberration):是指染色體較大范圍內(nèi)結(jié)構(gòu)的變化,如缺失、重復(fù)、倒位、易位等以及染色體數(shù)目的變化。同種堿基的置換不同種堿基的置換只涉及1對堿基被另1對堿基所置換1個或少數(shù)幾個堿基對的插入或缺失,使該部位后面遺傳密碼的閱讀框架發(fā)生改變,并進(jìn)一步引起轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)譯錯誤的突變。遺傳物質(zhì)在染色體水平發(fā)生較大范圍的變化DNA分子中1對或少數(shù)幾對堿基的突變微生物遺傳學(xué)的幾個基本概念核酸是遺傳物質(zhì)基礎(chǔ)的三個經(jīng)典實驗原理質(zhì)粒、質(zhì)粒分離及質(zhì)粒分類舉例基因及其突變的基本定義二、基因突變的特點(規(guī)律)(參見P199)自發(fā)性菌種衰退的根本原因不對應(yīng)性突變的性狀與突變的原因無關(guān)系稀有性自發(fā)突變幾率低(10-6~10-10)突變率:每一個細(xì)胞在每一世代中發(fā)生某一性狀突變的幾率。(某一單位群體在每一世代中產(chǎn)生突變株的數(shù)目)獨立性某基因的突變率不受它種基因突變率的影響可誘變性自發(fā)突變的頻率可因誘變劑的影響而提高(10-3~10-6)穩(wěn)定性基因突變后的新性狀是穩(wěn)定的可逆性野生型菌株某一性狀可發(fā)生正向突變,也可發(fā)生反向的回復(fù)突變。證明突變的性狀與引起突變的原因間無直接對應(yīng)關(guān)系!如何證明基因突變的非對應(yīng)性?三個經(jīng)典實驗:1.變量實驗、2.涂布實驗、3.影印實驗三、基因突變自發(fā)性和不對應(yīng)性的實驗證明1)變量實驗(fluctuationanalysis)SalvadorLuria&MaxDelbruck(1943)對噬菌體T1敏感的E.coli對數(shù)期培養(yǎng)物,稀釋至103/mL,分裝兩試管,各10mL

與甲管分裝的各小管同時保溫24~36h甲管乙管2)Newcombe的涂布實驗(1949)在涂布過的一組中,共長出抗性菌落353個,比未經(jīng)涂布過的(28個菌落)高得多約繁殖了12.3代選用對T1噬菌體敏感的E.coli,以相等數(shù)目涂布于12個平板上3)影印實驗(replicaplating)JoshuaLederbergandEstherLederberg(1952)通過使菌不接觸抗性環(huán)境而檢查其抗性菌落的方法

營養(yǎng)缺陷型抗性突變型條件致死突變型

形態(tài)突變型抗原突變型產(chǎn)量突變型下面介紹幾種常用的突變型及其分離1.

按照突變的表型分類:選擇性突變株(能在選擇性培養(yǎng)基上或其它的選擇性條件下迅速選出或鑒別出)非選擇性突變株四、基因突變的類型(1)營養(yǎng)缺陷型(auxotroph)一種缺乏合成其生存所必須的營養(yǎng)物(包括氨基酸、維生素、堿基等)的突變型,只有從周圍環(huán)境或培養(yǎng)基中獲得這些營養(yǎng)或其前體物(precursor)才能生長。營養(yǎng)缺陷型是微生物遺傳學(xué)研究中重要的選擇標(biāo)記和育種的重要手段表型判斷的標(biāo)準(zhǔn):在基本培養(yǎng)基上能否生長特點:在選擇培養(yǎng)基(一般為基本培養(yǎng)基)上不生長負(fù)選擇標(biāo)記突變株不能通過選擇平板直接獲得營養(yǎng)缺陷型的表示方法:基因型:所需營養(yǎng)物的前三個英文小寫斜體字母表示:hisC(組氨酸缺陷型,其中的大寫字母C同一表型中不同基因的突變)表型:同上,但第一個字母大寫,且不用斜體:HisC在具體使用時多用hisC-和hisC+,分別表示缺陷型和野生型。(2)抗藥性突變型(resistantmutant)基因突變使菌株對某種或某幾種藥物,特別是抗生素,產(chǎn)生抗性。特點:正選擇標(biāo)記(突變株可直接從抗性平板上獲得-----在加有相應(yīng)抗生素的平板上,只有抗性突變能生長。所以很容易分離得到。)表示方法:所抗藥物的前三個小寫斜體英文字母加上“r”表示strr和strs分別表示對鏈霉素的抗性和敏感性(3)條件致死突變型(conditionallethalmutant)203

在某一條件下具有致死效應(yīng),而在另一條件下沒有致死效應(yīng)的突變型。常用的條件致死突變是溫度敏感突變,用ts(temperaturesensitive)表示,這類突變在高溫下(如42℃)是致死的,但可以在低溫(如25-30℃)下得到這種突變。特點:負(fù)選擇標(biāo)記這類突變型常被用來分離生長繁殖必需的突變基因(4)形態(tài)突變型(morphologicalmutant)造成形態(tài)改變的突變型特點:非選擇性突變突變株和野生型菌株均可生長,但可從形態(tài)特征上進(jìn)行區(qū)分。舉例:產(chǎn)蛋白酶缺陷突變株的篩選菌落顏色變化β半乳糖苷酶基因的插入失活,使重組子菌落為白色而與蘭色的非重組子分開。形成芽孢缺陷菌株(5)抗原突變型指由于基因突變引起的細(xì)胞抗原結(jié)構(gòu)發(fā)生的變異類型,包括細(xì)胞壁缺陷變異、莢膜或鞭毛成分變異等。(6)產(chǎn)量突變型通過基因突變而引起的目標(biāo)代謝產(chǎn)物的產(chǎn)量發(fā)生變化的變異菌株,其在產(chǎn)量上高于或低于原始出發(fā)菌株。如果產(chǎn)量提高的突變株,被稱為“正突變”(plus-mutant),也稱為“高產(chǎn)突變株”(highproducingmutant);如果產(chǎn)量低于出發(fā)菌株的突變株,則稱為“負(fù)突變”(minus-mutant)。2.按照突變所引起的遺傳信息的改變情況可分為三種:同義突變表型不發(fā)生改變(密碼子是簡并的,如CGU變成CGC,但都編碼精氨酸);錯義突變改變的密碼子編碼的氨基酸改變了;無意義突變終止密碼子(UAA,UAG,UGA)其它突變類型

毒力、生產(chǎn)某種代謝產(chǎn)物的發(fā)酵能力的變化等在實際應(yīng)用中具有重要意義突變類型,一般都不具有很明顯或可直接檢測到的表型。其突變株的獲得往往需要較大的工作量。

第四節(jié)基因突變的機制一、基因突變的分子基礎(chǔ)(一)自發(fā)突變

(二)誘發(fā)突變引起自發(fā)突變的原因主要有以下幾方面:

背景輻射和環(huán)境因素引起;有害代謝產(chǎn)物引起;互變異構(gòu)效應(yīng)引起的堿基配對錯誤;

DNA復(fù)制過程中堿基配對錯誤;轉(zhuǎn)座因子的作用。通過人為的方法,利用物理、化學(xué)或生物因素顯著提高自發(fā)突變頻率的手段。生物體在無人工干預(yù)下自然發(fā)生的低頻率突變(10-6-10-9)。它是生物進(jìn)化的根源。(二)、誘發(fā)突變誘變劑(mutagen):凡能提高基因突變頻率的因素統(tǒng)稱為誘變劑誘變劑的種類物理誘變劑化學(xué)誘變劑生物誘變劑堿基類似物誘變劑;與堿基起化學(xué)反應(yīng)的誘變劑;嵌入誘變劑;

:輻射和熱:轉(zhuǎn)座因子(1)堿基類似物----間接引起置換的誘變劑它們在DNA復(fù)制中能摻入DNA分子中,由于其產(chǎn)生異構(gòu)體的頻率高,因此發(fā)生的錯誤配對可引起堿基的置換。一類與正常堿基結(jié)構(gòu)相似的物質(zhì),稱為堿基類似物。如:5-BU,8-NG,2-AP等。A-TA-TA-BUA-TG-BUG-CA-BU加入5-BU1.化學(xué)誘變劑(2)與堿基起化學(xué)反應(yīng)的誘變劑-----直接引起堿基置換該類誘變劑與堿基起化學(xué)反應(yīng),改變堿基的結(jié)構(gòu),導(dǎo)致錯配。亞硝酸:G-CA-T轉(zhuǎn)換互變各種烷化劑:G-CA-T互變羥胺:只引起G-CA-T轉(zhuǎn)換(專一性與C起反應(yīng))亞硝酸:對堿基的主要作用是氧化脫胺作用(使氨基變?yōu)橥淖兣鋵π再|(zhì),引起堿基轉(zhuǎn)換)。

HNO2

AH(次黃嘌呤)ATGCCUGCATGX(黃嘌呤)不引起突變A-TH-TH-CA-TH-CG-C烷化劑甲基磺酸乙酯(EMS)甲基磺酸甲酯(MMS)硫酸二乙酯(DES)N-甲基-N’-硝基-N-亞硝基胍

(NTG)

氮芥、硫芥環(huán)氧乙烷NTG:誘變作用強,稱為超強誘變劑(突變率1%);能誘發(fā)鄰近位置的基因同時發(fā)生突變,即所謂并發(fā)突變。很多烷化劑除了能誘發(fā)點突變外,還能誘發(fā)染色體畸變。由于染色體畸變常為輻射所誘發(fā),所以這些物質(zhì)又稱為擬輻射物質(zhì)。烷化劑作用的主要機理是引起堿基上某些能形成氫鍵的集團(tuán)發(fā)生烷基化。烷化位點主要在鳥嘌呤的N‐7位和腺嘌呤的N‐3位上,烷化后的堿基也像堿基結(jié)構(gòu)類似物一樣能引起堿基配對的錯誤。烷化劑的另一作用是使嘌呤整個地從DNA鏈上脫下來,產(chǎn)生一個缺口,在與缺口相對應(yīng)的位點上就能配上任何一個堿基,從而引起轉(zhuǎn)換或顛換。(3)移碼突變的誘變劑-嵌入誘變劑吖啶類染料(如原黃素,吖叮黃(橙),ICR類等)具有類似堿基對的扁平結(jié)構(gòu),能插入DNA分子的堿基對之間,使DNA結(jié)構(gòu)變形,導(dǎo)致DNA在復(fù)制過程中的滑動,引起DNA鏈中插入或缺失一個或幾個核苷酸,產(chǎn)生移碼突變。ICR:一系列烷化劑和吖啶分子相結(jié)合的化合物2.物理誘變劑及其誘變機制紫外線,x-射線,γ–射線,快中子,超聲波等(1)紫外線(UV)紫外線是實驗室中常用的非電離輻射誘變因子,其作用機制主要是能引起:DNA鏈的斷裂、DNA分子雙鏈的交聯(lián)、嘧啶的水合作用相鄰堿基形成嘧啶二聚體(TT,TC,CC)等。

其中最主要的效應(yīng)是胸腺嘧啶二聚體的形成。胸腺嘧啶二聚體通常出現(xiàn)在同一DNA單鏈上兩個相鄰的胸腺嘧啶之間,也可出現(xiàn)在兩條DNA單鏈之間。兩種情況導(dǎo)致結(jié)果不同。X‐射線、γ‐射線、快中子等屬于電離輻射。以X‐射線為例解釋該類誘變劑誘變機理:X‐射線的誘變作用有直接和間接兩種方式:

(1)直接作用是引起DNA雙鏈間氫鍵的斷裂、DNA單鏈的斷裂、不同DNA分子之間的交聯(lián)等。

(2)間接作用是電離輻射能從水或有機分子中產(chǎn)生自由基,這些自由基作用于DNA分子,引起缺失和損傷。自由基對嘧啶的作用更強烈。此外,X射線還可能使細(xì)胞中形成一些堿基類似物,突變由這些堿基類似物所誘發(fā)。與紫外線不同的是,電離輻射可通過玻璃和其他物質(zhì),穿透力強,能達(dá)到生殖細(xì)胞,因此常用于動植物的誘變育種。(2)X‐射線、γ‐射線、快中子短時間的熱處理也可誘發(fā)突變,熱的作用是使胞嘧啶脫氨基而成為尿嘧啶,從而通過堿基配對錯誤而引起GC→AT的轉(zhuǎn)換;另外,熱也可引起鳥嘌呤‐脫氧核糖鍵的移動,從而在DNA復(fù)制時出現(xiàn)包括兩個鳥嘌呤的堿基對,在下一次的DNA復(fù)制中該堿基對錯配就會引起GC→CG的顛換。(3)熱(1).轉(zhuǎn)座因子(transposableelement)定義:位于染色體或質(zhì)粒上的一段能改變自身位置的DNA序列。廣泛分布于原核和真核細(xì)胞中。又稱“跳躍基因”(2).轉(zhuǎn)座因子的特點1)在轉(zhuǎn)座時,通過轉(zhuǎn)座因子的復(fù)制,可將新形成的拷貝以非同源重組的方式轉(zhuǎn)移到染色體的新部位上;

2)都攜帶有編碼轉(zhuǎn)座酶的基因,該酶具有轉(zhuǎn)移位置的功能,是轉(zhuǎn)座所必需的;3)兩端都有正向或反向末端重復(fù)序列。

3.生物誘變劑(轉(zhuǎn)座因子)及其誘變機制(3)根據(jù)分子結(jié)構(gòu)和遺傳性質(zhì),轉(zhuǎn)座因子可分為3類:插入序列(Insertionsequence,IS)僅含有編碼轉(zhuǎn)座所必需的轉(zhuǎn)座酶的基因,兩端存在9~41bp的反向重復(fù)序列

。但其插入可干擾基因的正常讀碼序列,導(dǎo)致基因失活或引起突變。轉(zhuǎn)座子(Transposon,Tn)除轉(zhuǎn)座基因外,還有抗藥性基因。分為復(fù)合轉(zhuǎn)座子和復(fù)雜轉(zhuǎn)座子Mu噬菌體是以大腸桿菌為宿主的溫和性噬菌體。它在幾方面不同于另一種溫和噬菌體λ:第一、MuDNA幾乎可以插入到宿主染色體的任何一個位點上;第二、DNA兩端沒有粘性末端;第三、會引起宿主的被插入基因的基因突變。

(4)轉(zhuǎn)座的過程:插入突變

(基因失活和極性作用)染色體畸變(染色體的缺失\重復(fù)和倒位)

(5)轉(zhuǎn)座的遺傳學(xué)效應(yīng):二、誘變及化學(xué)致癌物質(zhì)的檢測——Ames試驗“生物化學(xué)統(tǒng)一性”法則:

人和細(xì)菌在DNA的結(jié)構(gòu)及特性方面是一致的,能使微生物發(fā)生突變的誘變劑必然也會作用于人的DNA,使其發(fā)生突變,最后造成癌變或其他不良的后果。Ames試驗的依據(jù)誘變劑的共性原則:

化學(xué)藥劑對細(xì)菌的誘變率與其對動物的致癌性成正比?;貜?fù)突變(reversemutation或backmutation):

突變體失去的野生型性狀,可以通過第二次突變得到恢復(fù),這種第二次突變稱為回復(fù)突變。美國加利福尼亞大學(xué)的BruceAmes教授于1966年發(fā)明,因此稱為Ames試驗標(biāo)準(zhǔn)菌株要求:

檢測鼠傷寒沙門氏菌(Salmonellatyphmurium)組氨酸營養(yǎng)缺陷型菌株(his-)的回復(fù)突變率(為了增加試驗的敏感性,該菌株還應(yīng)包括另外兩個突變,一個是造成細(xì)胞表面透性增加的深度粗糙突變型,另一個是喪失切除修復(fù)能力的缺失型)。Ames試驗斑點試驗和平板摻入試驗

方法步驟1.菌株鑒定用于測試的菌株,需經(jīng)基因型和生物學(xué)性狀鑒定,符合要求才能投入使用。菌種:TA97、TA98、TA100和TA102

鑒定項目:(1)脂多糖屏障丟失

(2)R因子

(3)紫外線損傷修復(fù)缺陷

(4)自發(fā)回變(5)回變特性——診斷性試驗應(yīng)用:

1.斑點試驗只局限于能在瓊脂上擴散的化學(xué)物質(zhì),大多數(shù)多環(huán)芳烴和難溶于水的化學(xué)物質(zhì)均不適宜用此法。此法敏感性較差,主要是一種定性試驗,適用于快速篩選大量受試化合物。

2.平板摻入試驗可定量測試樣品致突變性的強弱。此法較斑點試驗敏感,獲陽性結(jié)果所需的劑量較低。點試獲陽性結(jié)果的濃度用于摻入試驗(每皿0.1ml),往往出現(xiàn)抑(殺)菌作用。

3.致變作用遲緩或有抑菌作用的試樣,培養(yǎng)時間延長至72h。

4.揮發(fā)性的液體和氣體試樣,可用干燥器內(nèi)試驗法進(jìn)行測試。

5.目前,Ames試驗作為檢測環(huán)境誘變劑的一組試驗中的首選試驗,廣泛應(yīng)用于致突變化學(xué)物的初篩。但是,與今天快信息、高效率的社會要求相比,該試驗程序還嫌繁瑣,方法不夠簡便,有待于創(chuàng)建新的更為快速靈敏、簡單易行的環(huán)境誘變劑短期生物測試法。用途:廣泛用于檢測環(huán)境和食品中是否存在化學(xué)致癌物。特點:快速、準(zhǔn)確、費用廉價三、DNA損傷的修復(fù)

除了DNA聚合酶進(jìn)行校正外,還通過幾種不同的機制進(jìn)行DNA的修復(fù):(1)光復(fù)活作用(2)切除修復(fù)(3)重組修復(fù)(4)SOS修復(fù)紫外線誘變時必須在暗室、紅光下進(jìn)行(1)光復(fù)活作用(photoreactivation)可見光可大大降低經(jīng)紫外線照射后微生物死亡率的現(xiàn)象。機理:經(jīng)UV照射后帶有嘧啶二聚體的DNA分子,在黑暗中會和一種光激活酶——光解酶結(jié)合,形成酶‐DNA復(fù)合物,該復(fù)合物暴露在可見光下時,光解酶會因獲得光能而被激活,并使二聚體重新分解成單體,光解酶也從復(fù)合物中釋放出來,再結(jié)合到其它二聚體上。

這種修復(fù)機制不是移去和取代核苷酸,而是胸腺嘧啶二聚體直接被修復(fù),所以是一種無錯誤的修復(fù)。(2)切除修復(fù)(excisionrepair,又稱暗修復(fù))一種普遍的修復(fù)系統(tǒng)。能移去胸腺嘧啶二聚體和修復(fù)大多數(shù)引起的DNA扭曲損傷。該修復(fù)系統(tǒng)不需要可見光,通過酶切作用移去損傷的堿基(包括損傷位點附近的一些堿基),隨后合成一段正常DNA鏈。

內(nèi)切核酸酶

4種酶參與外切核酸酶

DNA聚合酶DNA連接酶(3)重組修復(fù)這是一種越過損傷而進(jìn)行的修復(fù)。這種修復(fù)不將損傷的堿基除去,而是通過復(fù)制后,經(jīng)染色體交換,使子鏈上的空隙部位不再面對著嘧啶二聚體,而是面對著正常的單鏈,在這種情況下,DNA聚合酶和連接酶便能起作用,把空隙部分進(jìn)行修復(fù)。留在親鏈上的二聚體仍要依靠再一次的切除修復(fù)加以除去,或經(jīng)細(xì)胞分裂而稀釋掉。(4)SOS修復(fù)這是在DNA分子受到較大范圍的重大損傷時誘導(dǎo)產(chǎn)生的一種應(yīng)急反應(yīng)。涉及幾個基因:recA、lexA、uvrA、uvrB、uvrC的共同作用。此外,經(jīng)紫外線照射的大腸桿菌還可能誘導(dǎo)產(chǎn)生一種稱為錯誤傾向(error-prone)的DNA聚合酶,催化空缺部位的DNA修復(fù)合成,但由于它們識別堿基的精確度低,所以容易造成復(fù)制的差錯,這是一種以提高突變率來換取生命存活的修復(fù),又稱錯誤傾向的SOS修復(fù)。第五節(jié)微生物的誘變育種一、誘變育種中的幾個原則

指利用物理或化學(xué)誘變劑處理微生物群體細(xì)胞,促進(jìn)其突變率顯著提高,然后設(shè)法從中選取少數(shù)符合育種目的的突變株。2個主要環(huán)節(jié):誘變(隨機)選用合適的誘變劑和誘變劑量處理大量均勻、分散的微生物細(xì)胞,以引起絕大多數(shù)細(xì)胞致死的同時,使存活個體中的突變頻率大大提高。篩選(定向)設(shè)計有效的篩選方法,將少量正變株中的優(yōu)良菌株挑選出來。(一)出發(fā)菌株(originalstrain)出發(fā)菌株指用于誘變育種的起始菌株。具有有利性狀(如高產(chǎn)、生長速度快、營養(yǎng)要求粗放、標(biāo)記明顯等);對誘變劑敏感野生型菌株;從生產(chǎn)中選育的自發(fā)突變菌株;誘變獲得的高產(chǎn)菌株出發(fā)菌株的選擇標(biāo)準(zhǔn):出發(fā)菌株的來源:(二)菌懸液的制備1.選用單細(xì)胞或單孢子懸液(均勻、分散)目的:①使每個細(xì)胞能均勻接觸誘變劑;

②減少表型延遲現(xiàn)象(誘變后性狀的分離及退化現(xiàn)象)2.同步培養(yǎng)(生理狀態(tài)一致)3.菌齡:對誘變劑最敏感時期

營養(yǎng)細(xì)胞:對數(shù)期孢子或芽孢:萌發(fā)前期4.菌懸液的制備方法

物理誘變:生理鹽水配制化學(xué)誘變:緩沖液配制5.菌懸液的濃度

酵母菌,霉菌的孢子:106個/mL

細(xì)菌,放線菌孢子:108個/mL

(三)誘變劑的選擇及處理方法1.誘變劑的選擇(高效,簡便)物理誘變劑:頻度低、大損傷,難修復(fù),且操作簡便;

化學(xué)誘變劑:頻度高,點突變,易回復(fù)突變,操作麻煩。(NTG——超誘變劑)UV是最常用的一種誘變劑2.劑量的選擇突變率隨劑量的增加而提高,但到達(dá)一定程度后,再提高劑量,反而會使突變率下降。正變較多出現(xiàn)在偏低劑量中,而負(fù)變較多出現(xiàn)在偏高劑量中。在產(chǎn)量變異工作中,常采用相對殺菌率為70~75%,甚至30~70%的劑量。UV的劑量:固定UV功率和照射距離,以照射時間長短來確定劑量多少。最適劑量:在提高突變率的基礎(chǔ)上,既能擴大變異幅度,又能使變異向正突變范圍移動的劑量。常以殺菌率來表示相對劑量(劑量-存活率曲線)3.誘變處理方法單因素處理或多因素的復(fù)合處理:①同一誘變劑的重復(fù)使用;②兩種或多種誘變劑的先后使用;③兩種或多種誘變劑的同時使用.(四)中間培養(yǎng)(CM,培養(yǎng)過夜)目的:克服表型延遲表型延遲(phenotypiclag):表型的改變落后于基因型改變的現(xiàn)象.

分離性延遲:

突變的基因經(jīng)DNA復(fù)制和細(xì)胞分裂后變成純合狀態(tài),表型才能表現(xiàn)出來。

生理性延遲:

由雜合狀態(tài)變?yōu)榧兒蠣顟B(tài),突變表型仍不能表現(xiàn)出來。分離性延遲的原因:對數(shù)生長期中,單核細(xì)胞常出現(xiàn)雙核現(xiàn)象,多核細(xì)胞的核也成倍增加,誘變對數(shù)期的細(xì)胞時,突變通常發(fā)生在一個核上,故其變異或非變異的細(xì)胞必須經(jīng)過一代或幾代繁殖才能分離,這種純種變異細(xì)胞出現(xiàn)的推遲現(xiàn)象稱為分離延遲現(xiàn)象。生理性延遲的原因:當(dāng)變異細(xì)胞由雜合狀態(tài)變?yōu)榧兒蠣顟B(tài)時,由于雜合期所合成的非變異的蛋白或酶仍然發(fā)揮作用,必須經(jīng)過細(xì)胞多代分離后,才能將這些非變異的酶稀釋掉,最終達(dá)到變異后應(yīng)該表現(xiàn)的形態(tài),如營養(yǎng)缺陷型突變株的篩選過程。生理性延遲:(五)突變株的篩選

初篩復(fù)篩1.初篩(以量為主)(1)利用形態(tài)變異:需預(yù)先測定形態(tài)與產(chǎn)量的相關(guān)性(2)根據(jù)平板顏色反應(yīng)直接挑選透明圈法(蛋白酶、脂肪酶、纖維素酶);抑菌圈法(抗生素);變色圈法(檸檬酸)、顯色圈(氨基酸);沉淀圈法(外毒素)透明圈直徑(H)/菌落直徑(C):產(chǎn)量高低(初篩指標(biāo))2.復(fù)篩(以質(zhì)為主,定量測定)搖瓶培養(yǎng),直接檢測所需產(chǎn)物方法需簡便、快速2步誘變育種的基本原則:選擇簡便有效的誘變劑;挑選優(yōu)良的出發(fā)菌株;處理單細(xì)胞或單孢子懸液;選用最適的誘變劑量;充分利用復(fù)合處理的協(xié)同效應(yīng);利用和創(chuàng)造形態(tài)、生理與產(chǎn)量間的相關(guān)指標(biāo);設(shè)計高效篩選方案;創(chuàng)造新型篩選方法。二、幾種重要突變株的篩選方法1.抗性突變株的篩選(1)抗終代謝物結(jié)構(gòu)類似物突變株的篩選(2)抗藥性突變株篩選2.營養(yǎng)缺陷型的篩選

1.抗性突變株的篩選

(1)抗終代謝物結(jié)構(gòu)類似物的突變株

用途:篩選相應(yīng)代謝物的高產(chǎn)菌株(2)抗藥性突變株

用途:篩選相應(yīng)藥物(抗生素)的高產(chǎn)菌株或遺傳標(biāo)記制作

篩選的方法:

a.高于臨界濃度的平板進(jìn)行分離;

b.梯度平板法

敏感菌苔

抗性菌落加入含異煙肼的上層

加入不含異煙肼的底層

所謂結(jié)構(gòu)類似物(又稱代謝拮抗物)是指那些在結(jié)構(gòu)上和代謝終產(chǎn)物(氨基酸、嘌呤、維生素等)相似的物質(zhì)。如:異煙肼(“雷米封”)是吡哆醇的結(jié)構(gòu)類似物,利用含異煙肼梯度平板篩選異煙肼抗性突變株,可達(dá)到定向培育吡哆醇高產(chǎn)突變株的目的。為什么在篩選突變株時,不能直接用代謝產(chǎn)物,而必須用其結(jié)構(gòu)類似物?2.營養(yǎng)缺陷型突變株的篩選(1)幾個概念:三類培養(yǎng)基:基本培養(yǎng)基(MM,minimalmedium)[-]:某野生型能生長的最低成分的組合培養(yǎng)基。完全培養(yǎng)基(CM,completemedium)[+]:各種營養(yǎng)缺陷型能生長的天然或半組合培養(yǎng)基補充培養(yǎng)基(SM,supplementalmedium)[A]:[-]+A[B]:[-]+B相應(yīng)營養(yǎng)缺陷型能生長的組合或半組合培養(yǎng)基三種遺傳型:野生型(wildtype)從自然界分離到的、發(fā)生營養(yǎng)缺陷型突變前的原始菌株。[A+B+],可在[-]生長。營養(yǎng)缺陷型(auxotroph)野生型菌株經(jīng)誘變劑處理后,由于發(fā)生了喪失某種酶合成能力的突變,因而只能在加有該酶合成產(chǎn)物的培養(yǎng)基中才能生長的突變菌株(主要指合成維生素、氨基酸及嘌呤、嘧啶的能力)。

[A+B-]:能在[+]、[B]生長[A-B+]:能在[+]、[A]生長[A-B-]:能在[+]生長原養(yǎng)型(prototroph)營養(yǎng)缺陷型經(jīng)回復(fù)突變或重組,回到原來野生型的營養(yǎng)要求[A+B+],可在[-]生長(2)篩選步驟(5步)誘變處理中間培養(yǎng)淘汰野生型檢出缺陷型鑒定缺陷型①中間培養(yǎng)CM或SM培養(yǎng)基,培養(yǎng)過夜??朔硇脱舆t。②淘汰野生型即濃縮缺陷型,以提高檢出率方法

抗生素法(G+細(xì)菌:青霉素;酵母菌和霉菌:制霉菌素)

菌絲過濾法(絲狀真菌、放線菌)

饑餓培養(yǎng)(無N)MM6~12h2N培養(yǎng)(2N)MM1~2h加抗生素(或菌絲過濾),培養(yǎng)過夜③營養(yǎng)缺陷型的檢出方法逐個檢出法夾層培養(yǎng)法限量補充培養(yǎng)法影印平板法④營養(yǎng)缺陷型的鑒定生長譜法:快速,直觀分兩步:a.三大類營養(yǎng)要求(氨基酸、維生素、核苷酸)的鑒定b.具體到某一種營養(yǎng)要求的鑒定(哪一種氨基酸,哪一種維生素,或哪一種堿基)具體操作:一般采用“濾紙片法”

a.不含維生素的酪素水解液或氨基酸混合液

b.維生素混合液

c.0.1%堿水解酵母核酸液abc三大類營養(yǎng)要求的鑒定:以氨基酸缺陷為例進(jìn)行說明將18種氨基酸按右表分為6組特點:每2組只有一種共同物質(zhì)單一營養(yǎng)物質(zhì)要求的鑒定:組別化合物代號117891011227121314153381216171844913161920551014171921661115182021135246(3)營養(yǎng)缺陷型的用途生產(chǎn)菌(氨基酸、核苷酸、維生素等高產(chǎn)菌需求);研究代謝途徑和雜交、轉(zhuǎn)化等遺傳規(guī)律的遺傳標(biāo)記。

誘變育種的程序:實驗講義p175

出發(fā)菌株(純化)前培養(yǎng)(CM,培養(yǎng)至對數(shù)期)

菌懸液制備活菌計數(shù)

誘變預(yù)備實驗(劑量存活率曲線)

誘變處理(相對殺菌率為70-75%,30-70%)活菌計數(shù)

中間培養(yǎng)(CM,培養(yǎng)過夜,克服表型延遲)

突變株分離

初篩

復(fù)篩

生產(chǎn)性能試驗菌種(鑒定與)保藏

1.從生產(chǎn)中選育

2.定向培育優(yōu)良品種一般指用特定因素長期處理微生物群體,同時不斷地對它們進(jìn)行移種傳代,以達(dá)到積累并選擇相應(yīng)的自發(fā)突變株的目的。

例:卡介苗(牛型結(jié)核分枝桿菌的減毒活菌苗)三、自發(fā)突變與育種第六節(jié)原核生物的基因重組基因重組(generecombination):將兩個不同性狀個體的基因通過一定的方式轉(zhuǎn)移到一起,并發(fā)生重新組合,產(chǎn)生新的遺傳性狀的過程,稱為基因重組(generecombination)或遺傳重組。

重組:遺傳物質(zhì)在分子水平上發(fā)生的交換;雜交:在細(xì)胞水平上遺傳物質(zhì)的交換.

雜交必然包含著重組,但重組不僅限于雜交這一形式。原核生物的基因重組類型

4種形式:1)轉(zhuǎn)化2)轉(zhuǎn)導(dǎo)3)接合4)原生質(zhì)體融合一、

轉(zhuǎn)化(transformation)定義:受體細(xì)胞直接吸收供體細(xì)胞的DNA片段,并與其染色體同源片段進(jìn)行遺傳物質(zhì)交換,從而使受體細(xì)胞獲得新的遺傳性狀的現(xiàn)象。

轉(zhuǎn)化子(transformant):經(jīng)轉(zhuǎn)化后出現(xiàn)了供體性狀的受體細(xì)胞稱為轉(zhuǎn)化子,即轉(zhuǎn)化成功的菌落。

目前已知有二十多個種的G+和G-細(xì)菌具有自然轉(zhuǎn)化的能力此過程可以發(fā)生在土壤和海洋環(huán)境中,可能是自然界遺傳交換的重要方式。自然遺傳轉(zhuǎn)化(naturalgenetictransformation)人工轉(zhuǎn)化(artificialtransformation)感受態(tài)細(xì)胞(competentcell):具有攝取外源

DNA能力的細(xì)胞1.感受態(tài)感受態(tài):是指受體細(xì)胞最易接受外源DNA片段并能實現(xiàn)轉(zhuǎn)化的一種生理狀態(tài)。一個細(xì)菌能否出現(xiàn)感受態(tài)是由其遺傳性決定的,但受環(huán)境條件的影響也很大,因而表現(xiàn)差別很大。

感受態(tài)因子:調(diào)節(jié)感受態(tài)的一類特異蛋白,它包括三種主要成分:膜相關(guān)DNA結(jié)合蛋白、細(xì)胞壁自溶素和幾種核酸酶。

自然感受態(tài)與人工感受態(tài)的不同?自然感受態(tài)的出現(xiàn)是細(xì)胞一定生長階段的生理特性(如肺炎鏈球菌的感受態(tài)出現(xiàn)在對數(shù)生長期)受細(xì)菌自身的基因控制人工感受態(tài)則是通過人為誘導(dǎo)的方法,使細(xì)胞具有攝取DNA的能力,或人為地將DNA導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi)。

(該過程與細(xì)菌自身的遺傳控制無關(guān)!)進(jìn)行自然轉(zhuǎn)化,需要二方面必要的條件:(1)建立了感受態(tài)的受體細(xì)胞(2)外源游離DNA分子感受態(tài)的機理研究:局部原生質(zhì)體化假說:處于感受態(tài)的細(xì)胞局部失去了細(xì)胞壁,使外源DNA能順利經(jīng)膜進(jìn)入菌體。酶受體假說:受體細(xì)胞表面出現(xiàn)了一種能結(jié)合DNA并使之進(jìn)入細(xì)胞的酶。2.轉(zhuǎn)化模型(1)轉(zhuǎn)化因子

本質(zhì)是離體的DNA片斷或質(zhì)粒DNA。轉(zhuǎn)化因子進(jìn)入細(xì)胞前還會被酶解成更小的片段,約8kb。在不同的微生物中,轉(zhuǎn)化因子的形式不同,dsDNA,ssDNA.

革蘭氏陰性的嗜血桿菌中,細(xì)胞只吸收dsDNA形式的轉(zhuǎn)化因子,但進(jìn)入細(xì)胞后需經(jīng)酶解為ssDNA,才能與受體菌的基因組整合;革蘭氏陽性的鏈球菌和芽孢桿菌中,dsDNA的一條鏈必須在胞外降解,只有ssDNA形式的轉(zhuǎn)化因子才能進(jìn)入細(xì)胞。

但不管何種情況,最易與細(xì)胞表面結(jié)合的仍是dsDNA。由于每個細(xì)胞表面能與轉(zhuǎn)化因子相結(jié)合的位點有限(如肺炎鏈球菌約10個),因此,從外界加入無關(guān)的dsDNA就可競爭并干擾轉(zhuǎn)化作用。質(zhì)粒DNA也是良好的轉(zhuǎn)化因子,但它們通常并不能與核染色體組發(fā)生重組。

轉(zhuǎn)化的頻率通常為0.1%~1%,最高為20%。(2)轉(zhuǎn)化過程供體(strR)dsDNA感受態(tài)受體(strS)酶解與吸收單鏈同源區(qū)段配對單鏈整合復(fù)制與分離轉(zhuǎn)化子(strR)非轉(zhuǎn)化子(strS)肺炎鏈球菌轉(zhuǎn)化的主要過程轉(zhuǎn)化因子進(jìn)入細(xì)胞

轉(zhuǎn)化因子單鏈配對與整合

復(fù)制

分離

自然轉(zhuǎn)化過程的特點:a)對核酸酶敏感;c)轉(zhuǎn)化是否成功及轉(zhuǎn)化效率的高低主要取決于轉(zhuǎn)化(DNA)

給體菌株和轉(zhuǎn)化受體菌株之間的親源關(guān)系;d)通常情況下質(zhì)粒的自然轉(zhuǎn)化形成轉(zhuǎn)化子效率要低得多;提高質(zhì)粒的自然轉(zhuǎn)化效率的二種方法:1)使質(zhì)粒形成多聚體,這樣進(jìn)入細(xì)胞后重新組合成有活性的質(zhì)粒的幾率大大提高;2)在質(zhì)粒上插入受體菌染色體的部分片段,或?qū)①|(zhì)粒轉(zhuǎn)化進(jìn)含有與該質(zhì)粒具有同源區(qū)段的質(zhì)粒的受體菌-------重組獲救b)不需要活的DNA給體細(xì)胞;定義:噬菌體DNA被感受態(tài)細(xì)胞攝取并產(chǎn)生有活性的病毒顆粒。4.轉(zhuǎn)染(transfection):現(xiàn)在把DNA轉(zhuǎn)移至動物細(xì)胞的過程也稱轉(zhuǎn)染提純的噬菌體DNA以轉(zhuǎn)化的(而非感染)途徑進(jìn)入微生物細(xì)胞并表達(dá)后產(chǎn)生完整的病毒顆粒。特點:5、人工轉(zhuǎn)化用CaCl2處理細(xì)胞,PEG介導(dǎo)、電穿孔、基因槍法等是常用的人工轉(zhuǎn)化手段(使細(xì)胞膜更易于透過DNA)。在自然轉(zhuǎn)化的基礎(chǔ)上發(fā)展和建立的一項細(xì)菌基因重組手段,是基因工程的奠基石和基礎(chǔ)技術(shù)。不是由細(xì)菌自身的基因所控制;用多種不同的技術(shù)處理受體細(xì)胞,使其人為地處于一種可以攝取外源DNA的“人工感受態(tài)”。質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化效率高(不像線型DNA那樣易于降解,而且還能在宿主中復(fù)制。任何來源的DNA將其連接到質(zhì)粒上都能進(jìn)入受體細(xì)胞).二、轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)轉(zhuǎn)導(dǎo):利用完全或部分缺陷噬菌體為媒介,把供體細(xì)胞的小片段DNA攜帶到受體細(xì)胞中,通過交換與整合,使后者獲得前者部分遺傳性狀的現(xiàn)象。

由轉(zhuǎn)導(dǎo)作用而獲得供體細(xì)胞部分遺傳性狀的重組受體細(xì)胞稱為轉(zhuǎn)導(dǎo)子(transductant)

攜帶供體部分遺傳物質(zhì)(DNA片段)的噬菌體稱為轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體。細(xì)菌轉(zhuǎn)導(dǎo)的二種類型:普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)1、普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)(generalizedtransduction)通過極少數(shù)完全缺陷噬菌體對供體菌基因組上任何小片段DNA進(jìn)行誤包,而將其遺傳性狀傳遞給受體菌的現(xiàn)象,稱普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)。(1)意外的發(fā)現(xiàn)1951年,JoshuaLederberg和NortonZinder為了證實大腸桿菌以外的其它菌種是否也存在接合作用,用二株具不同的多重營養(yǎng)缺陷型的鼠傷寒沙門氏菌LT22A(trp-)(P22)和LT2(his-)進(jìn)行實驗:用“U”型管進(jìn)行同樣的實驗時,在供體和受體細(xì)胞不接觸的情況下,同樣出現(xiàn)原養(yǎng)型細(xì)菌!沙門氏菌LT22A(trp-)是攜帶P22噬菌體的溶源性細(xì)菌另一株LT2(his-)是非溶源性細(xì)菌一個表面看起來的常規(guī)研究卻導(dǎo)致一個驚奇和十分重要發(fā)現(xiàn)的重要例證!基因的傳遞很可能是由可透過“U”型管濾板的P22噬菌體介導(dǎo)的(在接種LT22A的一端出現(xiàn)了原養(yǎng)型)(普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)這一重要的基因轉(zhuǎn)移途徑的發(fā)現(xiàn))(2)轉(zhuǎn)導(dǎo)模型轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體為什么“錯”將宿主的DNA包裹進(jìn)去?噬菌體的DNA包裝酶也能識別染色體DNA上類似pac的位點并進(jìn)行切割,“headful”的包裝機制包裝進(jìn)P22噬菌體外殼,形成只含宿主DNA的轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體顆粒(假噬菌體)。因為染色體上的pac與P22DNA的pac序列不完全相同,利用效率較低,這種“錯裝”機率一般僅約10-6-10-8

形成轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的噬菌體可以是溫和的,也可以是烈性的,但必須具有能偶爾識別宿主DNA的包裝機制,并在宿主基因組完全降解以前進(jìn)行包裝。普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的基本要求:普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的三種后果:進(jìn)入受體的外源DNA通過與細(xì)胞染色體的重組交換而形成穩(wěn)定的轉(zhuǎn)導(dǎo)子流產(chǎn)轉(zhuǎn)導(dǎo)(abortivetransduction)轉(zhuǎn)導(dǎo)DNA不能進(jìn)行重組和復(fù)制,但其攜帶的基因可經(jīng)過轉(zhuǎn)錄而得到表達(dá)。特點:在選擇培養(yǎng)基平板上形成微小菌落外源DNA被降解,轉(zhuǎn)導(dǎo)失敗。如果受體菌通過普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)獲得了供體菌DNA片段后,在其體內(nèi)不發(fā)生基因的交換、整合和復(fù)制,只進(jìn)行轉(zhuǎn)錄、翻譯和性狀的表達(dá)。這種轉(zhuǎn)導(dǎo)被稱為流產(chǎn)轉(zhuǎn)導(dǎo).2.局限轉(zhuǎn)導(dǎo)(restrictedtransduction)

定義:通過部分缺陷的溫和噬菌體把供體菌的少數(shù)特定基因攜帶到受體菌中,并與后者的基因組整合、重組,形成轉(zhuǎn)導(dǎo)子的現(xiàn)象。

媒介:

部分缺陷噬菌體(丟失自身一部分基因,并被同等長度的宿主基因所取代)

只能轉(zhuǎn)導(dǎo)個別特定基因

大腸桿菌中λ噬菌體的正常裂解及半乳糖基因轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體的形成過程低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)(LFT)的定義:

誘導(dǎo)溶源性大腸桿菌而產(chǎn)生的細(xì)胞裂解產(chǎn)物中,除含有正常的噬菌體外,還有少數(shù)(10-6)轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體顆粒,因此,用誘導(dǎo)λ溶源性菌株得來的噬菌體進(jìn)行轉(zhuǎn)導(dǎo)時的轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率不過10-6,稱為低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)。高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)(HFT):

如果細(xì)菌染色體中整合有一個正常的λ噬菌體時,缺陷λ噬菌體也能整合到同一細(xì)菌染色體上(因為正常λ噬菌體整合后,產(chǎn)生兩個細(xì)菌/噬菌體雜合att位點,缺陷λ噬菌體可以在該位點插入),這種細(xì)菌稱為雙重溶源菌.雙重溶源菌中,正常λ噬菌體稱為輔助噬菌體,因為它幫助缺陷噬菌體整合和繁殖。雙重溶原菌在紫外輻射等因子的誘導(dǎo)下,原噬菌體容易被切割下來,產(chǎn)生等量的缺陷噬菌體和正常噬菌體,該裂解物稱為高頻率轉(zhuǎn)導(dǎo)裂解物,用這樣的裂解物去感染細(xì)菌,將比低頻率轉(zhuǎn)導(dǎo)裂解物產(chǎn)生多得多的轉(zhuǎn)導(dǎo)子。這一過程稱為高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)。大腸桿菌的低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)和高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)比較:

uvE.coliK12(λ)LFT

裂解物

λ

λdg(10-5

~10-6)

轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體

uvE.coliK12(λ/λdg)HFT裂解物

50%λ

(雙重溶源菌)

50%λdg轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體

低頻率轉(zhuǎn)導(dǎo)(LFT):

LFT裂解物E.coligal-E.coligal-/λdgal+

(極少量轉(zhuǎn)導(dǎo)子菌落)E.coligal-

高頻率轉(zhuǎn)導(dǎo)(HFT):

HFT裂解物E.coligal-E.coligal-/λdgal+

(50%轉(zhuǎn)導(dǎo)子菌落)E.coligal-(50%)普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)與局限轉(zhuǎn)導(dǎo)的特性比較普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)局限轉(zhuǎn)導(dǎo)轉(zhuǎn)導(dǎo)的發(fā)生自然發(fā)生人工誘導(dǎo)(uv)噬菌體形成誤包前噬菌體的“誤切”內(nèi)含DNA只含宿主DNA含噬菌體和宿主DNA轉(zhuǎn)導(dǎo)性狀供體的任何性狀前噬菌體兩端鄰近基因轉(zhuǎn)導(dǎo)過程雙交換(轉(zhuǎn)導(dǎo)DNA替換受體DNA同源區(qū))轉(zhuǎn)導(dǎo)DNA插入,使受體菌為部分二倍體

溶源轉(zhuǎn)變(lysogenicconversion):一個與轉(zhuǎn)導(dǎo)相似又不同的現(xiàn)象定義:溫和噬菌體感染細(xì)胞后使之發(fā)生溶源化,因噬菌體的基因整合到宿主染色體上,而使后者獲得了新性狀的現(xiàn)象。溶源轉(zhuǎn)變與轉(zhuǎn)導(dǎo)的不同?a)噬菌體不攜帶任何供體菌的基因;b)這種噬菌體是完整的,而不是缺陷的;三、

接合(conjugation)通過細(xì)胞與細(xì)胞的直接接觸而產(chǎn)生的遺傳信息的轉(zhuǎn)移和重組過程1.接合現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)和證實1946年,JoshuaLederberg和EdwardL.Taturm細(xì)菌的多重營養(yǎng)缺陷型雜交實驗中間平板上長出的原養(yǎng)型菌落是兩菌株之間發(fā)生了遺傳交換和重組所致!為了減少所培養(yǎng)的結(jié)果是回復(fù)突變的機會,采用了雙重或三重營養(yǎng)缺陷型。該實驗是建立在不大可能同時發(fā)生兩種或三種回復(fù)突變的設(shè)想上的。證實接合過程需要細(xì)胞間的直接接觸的“U”型管實驗(BernardDavis,1950)2.能進(jìn)行接合的微生物種類主要在細(xì)菌和放線菌中存在。在細(xì)菌中,G-細(xì)菌尤為普遍,如E.coli、沙門氏菌屬、志賀氏菌屬、克雷伯氏菌屬、沙雷氏菌屬、弧菌屬、固氮菌屬和假單胞菌屬等;放線菌中,以鏈霉菌屬和諾卡氏菌屬最為常見,其中研究得最為詳細(xì)的是天藍(lán)色鏈霉菌(Streptomycescoeilcolor)。在不同屬的一些菌種之間也可發(fā)生接合現(xiàn)象,如大腸桿菌與鼠傷寒沙門氏菌間或沙門氏菌與痢疾志賀氏菌間。在所有對象中,接合現(xiàn)象研究得最多、了解得最清楚的是E.coli

。E.coli

是有性別分化的,決定性別的是其中的F質(zhì)粒,F(xiàn)質(zhì)粒還是合成性菌毛基因的載體。3.大腸桿菌的接合型與接合細(xì)菌遺傳重組單向過程和F因子的提出F-菌株F+菌株

Hfr菌株F因子結(jié)構(gòu)圖:相對分子質(zhì)量通常為5×107,上面有編碼細(xì)菌產(chǎn)生性菌毛及控制接合過程進(jìn)行的20多個基因。

圖中黃色區(qū)域表示轉(zhuǎn)座子,通過這些部位可以整合進(jìn)細(xì)菌染色體上形成各種Hfr菌株。Hfr菌株:細(xì)胞中的F質(zhì)粒整合到核染色體組上,與F-菌株相接合后,發(fā)生基因重組的頻率比任何已知的F+與F-接合后的頻率高出幾百倍,這種“雄性”菌株稱為Hfr。在Hfr菌株與F-細(xì)胞進(jìn)行接合時,OriT序列被缺刻螺旋酶識別而產(chǎn)生缺口后,F(xiàn)因子的先導(dǎo)區(qū)(leadingregion)結(jié)合著染色體DNA向受體細(xì)胞轉(zhuǎn)移,F(xiàn)因子除先導(dǎo)區(qū)以外,其余絕大部分是處于轉(zhuǎn)移染色體的末端,由于轉(zhuǎn)移過程常被中斷,因此F因子不易轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞中,故Hfr×F-雜交后的受體細(xì)胞大多數(shù)仍然是F-(即不能使受體菌變成供體)。接合中DNA轉(zhuǎn)移過程有著穩(wěn)定的速度和嚴(yán)格的順序性。染色體上越靠近F因子的先導(dǎo)區(qū)的基因,進(jìn)入的機會就越多,在F-中出現(xiàn)重組子的的時間就越早,頻率也高。中斷雜交(interruptedmating)技術(shù)和基因定位利用Hfr×F-的接合過程,在不同時間取樣,并把樣品猛烈攪拌以分散接合中的細(xì)菌,然后分析受體細(xì)菌基因型,以時間(分鐘)為單位繪制遺傳圖譜,該圖譜是細(xì)菌染色體上基因順序的直接反映。左圖:不同Hfr菌株的形成方式,以不同的起點不同的順序轉(zhuǎn)移基因。(a)細(xì)菌染色體為環(huán)狀,可以不同的IS位點打開,F(xiàn)質(zhì)粒插入進(jìn)去。(b)Hfr菌株的部分基因順序。大腸桿菌基因組很大(全部轉(zhuǎn)移需要100分鐘),其遺傳圖譜須用多株F因子整合在不同位置的Hfr菌才能完成基因定位:通過遺傳重組等手段確定不同的基因在染色體上的位置及相對距離,從而獲得遺傳圖譜。連鎖的二基因間的距離與其共轉(zhuǎn)化,或共轉(zhuǎn)導(dǎo)的頻率成反比,因此,可根據(jù)二個基因被共轉(zhuǎn)化或共轉(zhuǎn)導(dǎo)的頻率判斷它們在染色體上的相對距離。

接合作用(中斷雜交)作圖只能判斷相距較遠(yuǎn)的基因間的相對位置;轉(zhuǎn)導(dǎo)、轉(zhuǎn)化則可用于對相隔很近的基因進(jìn)行定位;大腸桿菌遺傳圖譜目前對大腸桿菌的染色體已定位了1000多個基因F′菌株F′菌株:

Hfr菌株內(nèi)的F因子因不正常切割而脫離染色體時,形成游離的但攜帶一小段染色體基因的F因子,特稱為F′因子。細(xì)胞表面同樣有性菌毛。F′×F-與F+×F-的不同:給體的部分染色體基因隨F′一起轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞細(xì)胞基因通過F′和F-的接合而實現(xiàn)轉(zhuǎn)移的過程常稱為性導(dǎo)(sexduction)、F因子轉(zhuǎn)導(dǎo),或F因子介導(dǎo)的轉(zhuǎn)導(dǎo)(F-mediatedtransduction)。F′所帶的基因可以與染色體發(fā)生重組;也可以繼續(xù)存在于F′因子上。F質(zhì)粒的四種存在方式及相互關(guān)系接合(conjugation):細(xì)胞與細(xì)胞的直接接觸(由F因子介導(dǎo))轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction):由噬菌體介導(dǎo)自然遺傳轉(zhuǎn)化(naturalgenetictransformation):游離DNA分子+感受態(tài)細(xì)胞“接合”“轉(zhuǎn)導(dǎo)”及“自然轉(zhuǎn)化”這三種在自然界中存在的細(xì)菌遺傳重組過程各自的特點:a)外源DNA的來源及進(jìn)入途徑有差異;b)決定因素也各有不同;如何設(shè)計實驗對三種途徑進(jìn)行區(qū)分?四、原生質(zhì)體融合(protoplastfusion)1.定義:通過人為的方法,使遺傳性狀不同的兩個細(xì)胞的原生質(zhì)體進(jìn)行融合,以獲得兼有雙親遺傳性狀的穩(wěn)定重組子的過程。

融合子(fusant)意義:打破了微生物的種界界限,可實現(xiàn)遠(yuǎn)緣菌株的基因重組??墒惯z傳物質(zhì)傳遞更為完整、獲得更多基因重組的機會??膳c其他育種方法相結(jié)合,如把常規(guī)誘變和原生質(zhì)體誘變所獲得的優(yōu)良性狀,組合到一個單株中。

兩親本菌株的選擇和遺傳標(biāo)記的制作(選擇不同的營養(yǎng)缺陷型,

(A:[a+b-],B:[a-b+])

對藥物抗性差異)

原生質(zhì)體的制備(高滲條件)

原生質(zhì)體再生(測定再生率)

融合(PEG、離心沉淀、電脈沖等)

融合子的檢出(直接檢出法和

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