項(xiàng)目名稱小菜蛾基因組的研究

項(xiàng)目名：菜蛾基因組的研究提名推獎(jiǎng)種：建省自然科學(xué)獎(jiǎng)提名推單位：家提名項(xiàng)目簡(jiǎn)：小菜蛾是為害十字花科蔬菜的一種重要的世界性害蟲，由于其分布范圍廣、繁殖速度快、抗性水平高，已經(jīng)成為最難防治的害蟲之一世界每年因小菜蛾造成的損失和防治費(fèi)用達(dá)億美在我國(guó)高達(dá)億美元由于缺乏基因組信息，制約了小菜蛾猖獗危害和災(zāi)變過程分子遺傳機(jī)理的系統(tǒng)研究項(xiàng)目組克服了小菜蛾基因組高度雜合的特點(diǎn)成功破譯小菜蛾基因組示了其廣泛適應(yīng)性的遺傳學(xué)基礎(chǔ)以及解毒寄主植物化學(xué)防御物質(zhì)和化學(xué)農(nóng)藥的分子機(jī)理，為小菜蛾的有效防治和可持續(xù)控制奠定了重要理論基礎(chǔ)。（）自主研發(fā)拼接件Rabbit率先破小菜蛾基因，為研復(fù)雜基因組提供范例針對(duì)小菜蛾基因組高度雜合的特點(diǎn)采用結(jié)WGS的測(cè)序和組裝技術(shù)，自主研發(fā)配套的基因組組裝軟件Rabbit，解決了大片段重疊序列組裝和雜合區(qū)域排除的技術(shù)難題成功破譯小菜蛾基因343Mb；N50=737kb面臨國(guó)際上多個(gè)單位幾乎同時(shí)啟動(dòng)小菜蛾基因組研究項(xiàng)目的激烈競(jìng)爭(zhēng)中率先完成并在Nature發(fā)表了小菜蛾基因組的研究成果在國(guó)際上得到廣泛的應(yīng)用。（）發(fā)現(xiàn)并解析基組的結(jié)變異，闡明小菜蛾適應(yīng)性并成一種世界性害的遺傳學(xué)基。在轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和表達(dá)譜分析的基礎(chǔ)上項(xiàng)目組開展了小菜蛾基因組的注釋和比較基因組的研究，鑒定了個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因，新增小菜蛾基因16,619（92%建了小菜蛾基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)，奠定了我國(guó)在小菜蛾基因組研究領(lǐng)域的國(guó)際領(lǐng)先地位用已有的基因組信息構(gòu)建了昆蟲系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn)小菜蛾是鱗翅目昆蟲中一個(gè)基礎(chǔ)物種通過個(gè)體間基因組的比較研究發(fā)現(xiàn)小菜蛾種群內(nèi)部存在著大量的基因組變異闡明了小菜蛾廣適應(yīng)性并成為一種世界性害蟲的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。（）挖掘小菜蛾基組中與毒相關(guān)的基，揭示小菜蛾與寄植物協(xié)同進(jìn)化抗藥性的分機(jī)理篩選和解析了小菜蛾幼蟲階段偏好表達(dá)的基因發(fā)

現(xiàn)硫代葡萄糖苷硫酸酯酶基因（）與硫酸酯酶修飾因子1（在幼蟲期的協(xié)同表達(dá)對(duì)小菜蛾取食十字花科蔬菜起了決定性的關(guān)鍵作用定并研究了細(xì)胞色素谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶、羧酸酯酶A轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白4基因家族，發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族的顯著擴(kuò)張，多數(shù)成員在抗性品系中上調(diào)表達(dá)，揭示了小菜蛾抗藥性快速發(fā)展和適應(yīng)進(jìn)化的分子機(jī)理。該項(xiàng)目的系列成果受到國(guó)內(nèi)外同行和媒體的高度關(guān)注產(chǎn)生較好的影響成果涉及的18研究論文累計(jì)他引次中小菜蛾基因組論文年發(fā)表至今他引190括NatureBiotechnologyNatureCommunicationsAnnualReviewofEntomology和AnnualEvolutionandSystematics等有重要影響力的學(xué)術(shù)期刊。項(xiàng)目組舉辦昆蟲基因組國(guó)際學(xué)術(shù)會(huì)議1，3次受邀國(guó)際學(xué)術(shù)會(huì)議報(bào)告。主要完單位：1.福建農(nóng)林大學(xué)2.深圳華大基因科技服務(wù)有限公司主要完人及其貢獻(xiàn)1.尤民生（福建農(nóng)林大學(xué)作為項(xiàng)目主持人，負(fù)責(zé)項(xiàng)目的規(guī)劃、實(shí)施和總結(jié)；在小菜蛾基因組解析、食性和抗藥性的功能基因組研究等方面做出貢獻(xiàn)。2.楊福建農(nóng)林大學(xué)項(xiàng)目的規(guī)劃施和總結(jié)小菜蛾基因組解析、食性和抗藥性的功能基因組研究等方面做出貢獻(xiàn)。3.何瑋（福建農(nóng)林大學(xué)責(zé)項(xiàng)目的實(shí)施和總結(jié)在小菜蛾基因組解析和食性的功能基因組研究等方面做出貢獻(xiàn)。4.謝（福建農(nóng)林大學(xué)責(zé)項(xiàng)目的實(shí)施和總結(jié)在小菜蛾基因組解析和抗藥性的功能基因組研究等方面做出貢獻(xiàn)。5.岳（深圳華大基因科技服務(wù)有限公司責(zé)項(xiàng)目的實(shí)施在小菜蛾基因組測(cè)序、組裝和注釋等方面做出貢獻(xiàn)。代表性文目錄：1.MinshengYue,WeiyiHe,XinhuaGuangYang,Xie,

Zhan,W.Baxter,Vasseur,GeoffGurr,CarlJ.JianlinBai,PingKaiShiguoLi,QingZhangyanWu,QilinChunhuiLiu,BoWang,Li,XiufengXu,ChangxinLu,MinJohnDavey,M.MingshunChen,XiaofengWeiqiTang,Zheng,YulanHu,FengqinYanchunMa,LuYunkaiYongLiang,YaqiongYu,Zhang,YuanyuanGuoqingLi,LinLi,Xinzhou,YadanLuo,Wang,JianJunWang.AheterozygousmothgenomeprovidesintoGenetics220-225.2.He,Min-ShengYou,LietteGuangXie,KaiChun-HuiLi,Xiu-FengXu,Shi-GuoDevelopmentalfromthedenovoassembledtranscriptomeofdiamondbackmoth,PlutellaGenomics2012,99(3):3.WeiqiYu,WeiyiYang,FushiW.Baxter,ShijunYou,CarlJ.MinshengDBM-DB:thediamondbackdatabase.,2014,4.YanchunYou,NanaRen,Li,Ma,MinmingZou,MGurr,expressionprofilingofindiamondbackxylostella(L.).Genomics152.5.Yu,WeiqiWeiyiHe,Ma,Liette