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第十三章真核基因與基因組第十三章真核基因與基因組1優(yōu)選第十三章真核基因與基因組優(yōu)選第十三章真核基因與基因組2遺傳信息傳遞中心法則(TheCentralDogma)RNA蛋白質(zhì)DNA復(fù)制轉(zhuǎn)錄翻譯逆轉(zhuǎn)錄RNA復(fù)制遺傳信息傳遞中心法則(TheCentralDogma)3生物體內(nèi)的遺傳信息傳遞遵循中心法則
271頁DNA以半保留復(fù)制的方式將親代細(xì)胞的遺傳物質(zhì)高度忠實(shí)地傳遞給子代。以DNA為模板轉(zhuǎn)錄生成的mRNA作為信使,其核苷酸序列構(gòu)成的密碼子在合成蛋白質(zhì)時(shí)被翻譯為肽鏈中氨基酸的排列順序。細(xì)胞內(nèi)所有蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的信息全部來源于DNA序列。生物體內(nèi)的遺傳信息傳遞遵循中心法則271頁DNA以半保留4真核基因與基因組
第十三章EukaryoteGeneandGenome真核基因與基因組第十三章EukaryoteGenean5真核生物是所有單細(xì)胞或多細(xì)胞的、其細(xì)胞具有細(xì)胞核的生物的總稱,它包括所有動物、植物、真菌和其他具有由膜包裹著的復(fù)雜亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的生物。真核生物與原核生物的根本性區(qū)別是前者的細(xì)胞內(nèi)含有成形的細(xì)胞核,因此以真核來命名這一類細(xì)胞。許多真核細(xì)胞中還含有其它細(xì)胞器,如線粒體、葉綠體、高爾基體等
。真核生物是所有單細(xì)胞或多細(xì)胞的、其細(xì)胞具有細(xì)胞核的生物的總稱6染色體主要類群細(xì)胞器細(xì)胞核細(xì)胞大小真核細(xì)胞原核細(xì)胞細(xì)菌、藍(lán)藻、衣原體、放線菌有核膜,有成形的細(xì)胞核沒有核膜,稱為擬核較?。?μm~10μm)較大(10μm~100μ)有核糖體、線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體、葉綠體(植物)等只有核糖體有染色體,染色體由DNA和蛋白質(zhì)結(jié)合無染色體,環(huán)狀DNA不與蛋白質(zhì)結(jié)合動物、植物、真菌等真核生物和原核生物的區(qū)別比較:染色體主要類群細(xì)胞器細(xì)胞核細(xì)胞大小真核細(xì)胞原核細(xì)胞細(xì)菌、藍(lán)7特征原核生物真核生物
DNA量少多基因數(shù)幾千大于幾萬、十萬轉(zhuǎn)錄和翻譯的時(shí)空關(guān)系同時(shí)進(jìn)行核內(nèi)轉(zhuǎn)錄,細(xì)胞質(zhì)中翻譯特征原核生物8除了某些以RNA為基因組的RNA病毒外,基因通常是指染色體或基因組的一段DNA序列?;虬ň幋a序列(外顯子)、調(diào)控序列和間隔序列(內(nèi)含子)?;颍╣ene):編碼蛋白質(zhì)或RNA等具有特定功能產(chǎn)物的、負(fù)載遺傳信息的基本單位。除了某些以RNA為基因組的RNA病毒外,基因通常是指染色體或9基因組(genome):一個(gè)生物體內(nèi)所有遺傳信息的總和。人類基因組包含了細(xì)胞核染色體DNA(常染色體和性染色體)及線粒體DNA所攜帶的所有遺傳物質(zhì)?;蚪M(genome):一個(gè)生物體內(nèi)所有遺傳信息的總和。人類10人類基因組包含了細(xì)胞核染色體DNA(常染色體和性染色體)及線粒體DNA所攜帶的所有遺傳物質(zhì)。能夠在相對于啟動子的任何方向和位置(上游或者下游)上發(fā)揮這種增強(qiáng)作用,大部分位于上游。ACGTGCGTACGUAUGU一、真核基因組具有獨(dú)特的結(jié)構(gòu)275頁假基因(psuedogene)反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)高度重復(fù)序列(highlyrepetitivesequence)具有II類啟動子的基因主要是編碼蛋白質(zhì)(mRNA)的基因和一些小RNA基因。原核細(xì)胞的基因基本沒有內(nèi)含子。平均長度為3500bp~5000bp,與長度約為13000bp的單拷貝序列間隔排列。存在于DNA復(fù)制起點(diǎn)區(qū)的附近,是一些蛋白質(zhì)(包括酶)的結(jié)合位點(diǎn)。三、真核基因組中存在大量的多基因家族與假基因真核生物和原核生物的區(qū)別比較:斷裂基因(splitegene)基因包括編碼序列(外顯子)、調(diào)控序列和間隔序列(內(nèi)含子)。雙鏈DNA中含有的兩個(gè)結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列稱為反向重復(fù)序列,也稱為回文結(jié)構(gòu),每條單鏈以任一方向閱讀時(shí)都與另一條鏈以相同方向閱讀時(shí)的序列是一致的。真核基因的結(jié)構(gòu)與功能
第一節(jié)TheStructureandFunctionofEukaryoteGene人類基因組包含了細(xì)胞核染色體DNA(常染色體和性染色體)及線11利用堿基的不同排列荷載遺傳信息。通過復(fù)制將遺傳信息穩(wěn)定、忠實(shí)地遺傳給子代細(xì)胞,在這一過程中為適應(yīng)環(huán)境變化,可能會發(fā)生基因突變。作為基因表達(dá)(geneexpression)的模板,使其所攜帶的遺傳信息通過各種RNA和蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)有序合成而表現(xiàn)出來。
基因的功能272頁利用堿基的不同排列荷載遺傳信息?;虻墓δ?7212單個(gè)基因的組成結(jié)構(gòu)及一個(gè)完整的生物體內(nèi)基因的組織排列方式統(tǒng)稱為基因組構(gòu)(geneorganization)。
與基因功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)編碼區(qū)序列(codingregionsequence
)非編碼序列(non-codingsequence)基因表達(dá)需要的調(diào)控區(qū)(regulatoryregion)序列,包括啟動子(promoter)、增強(qiáng)子(enhancer)等。在細(xì)胞內(nèi)表達(dá)為蛋白質(zhì)或功能RNA的DNA序列單個(gè)基因的組成結(jié)構(gòu)及一個(gè)完整的生物體內(nèi)基因的組織排列方式統(tǒng)稱13一、真核基因的基本結(jié)構(gòu)編碼蛋白質(zhì)或RNA的編碼序列。非編碼序列,包括編碼區(qū)兩側(cè)的調(diào)控序列和編碼序列間的間隔序列。一、真核基因的基本結(jié)構(gòu)編碼蛋白質(zhì)或RNA的編碼序列。非編碼序14真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因。斷裂基因(splitegene)CABD編碼區(qū)A、B、C、D非編碼區(qū)能產(chǎn)生初級轉(zhuǎn)錄,但后加工被去掉了真核基因結(jié)構(gòu)真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開但又連續(xù)15真核基因結(jié)構(gòu)不連續(xù),為斷裂基因(splitgene)。真核基因結(jié)構(gòu)外顯子(exon):在基因序列中,出現(xiàn)在成熟mRNA分子上的序列。內(nèi)含子(intron):外顯子之間、與mRNA剪接過程中被刪除部分相對應(yīng)的間隔序列。真核基因結(jié)構(gòu)不連續(xù),為斷裂基因(splitgene)。真核16多數(shù)啟動子位于真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)的上游,啟動子本身通常不被轉(zhuǎn)錄。平均長度為3500bp~5000bp,與長度約為13000bp的單拷貝序列間隔排列。作為基因表達(dá)(geneexpression)的模板,使其所攜帶的遺傳信息通過各種RNA和蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)有序合成而表現(xiàn)出來。超家族基因(superfamilygene)少數(shù)啟動子(如編碼tRNA基因的啟動子)位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的下游,這些DNA序列可以被轉(zhuǎn)錄。高度重復(fù)序列(highlyrepetitivesequence)增強(qiáng)子增強(qiáng)鄰近基因的轉(zhuǎn)錄反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)DNARNA人類的rRNA基因位于13、14、15、21和22號染色體的核仁組織區(qū),每個(gè)核仁組織區(qū)平均含有50個(gè)rRNA基因的重復(fù)單位。高等真核生物基因組含有大量的重復(fù)序列,雙鏈DNA中含有的兩個(gè)結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列稱為反向重復(fù)序列,也稱為回文結(jié)構(gòu),每條單鏈以任一方向閱讀時(shí)都與另一條鏈以相同方向閱讀時(shí)的序列是一致的。第十三章真核基因與基因組人類基因組包含了細(xì)胞核染色體DNA(常染色體和性染色體)及線粒體DNA所攜帶的所有遺傳物質(zhì)。重復(fù)頻率可達(dá)106以上,不編碼蛋白質(zhì)或RNA。重復(fù)序列中含有限制性內(nèi)切酶KpnⅠ(CTTAA↑G)的位點(diǎn)衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)原核細(xì)胞的基因基本沒有內(nèi)含子。主要存在于染色體的著絲粒區(qū)域,重復(fù)單位一般由2~10bp組成,成串排列,在人基因組中約占5%~6%。高等真核生物絕大部分編碼蛋白質(zhì)的基因都有內(nèi)含子。原核細(xì)胞的基因基本沒有內(nèi)含子。編碼rRNA和一些tRNA的基因也都有內(nèi)含子。內(nèi)含子的數(shù)量和大小決定了真核基因的大小。不同種屬中,外顯子序列通常比較保守,而內(nèi)含子序列則變異較大。外顯子與內(nèi)含子接頭處有一段高度保守的序列,這一共有序列是真核基因中RNA剪接的識別信號。多數(shù)啟動子位于真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)的上游,啟動子本身通常不被175′PdAPdCPdGPdTOH3′5′PAPCPGPUOH′
或5′ACGTGCGT3′5′ACGUAUGU3′
ACGTGCGTACGUAUGUDNARNAT5′3′OHU5′3′OHOHOHOHOH5′PdAPdCPdGPdTOH3′18基因的5端稱之為上游,3端稱為下游基因序列中開始RNA鏈合成的第一個(gè)核苷酸所對應(yīng)的堿基記為+1,此堿基上游的序列記為負(fù)數(shù),下游的序列記為正數(shù)?;虻?端稱之為上游,3端稱為下游19二、基因編碼區(qū)編碼多肽鏈和特定的RNA分子273頁
基因編碼區(qū)中的DNA堿基序列決定特定的成熟RNA分子的序列,即DNA的一級結(jié)構(gòu)決定著其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA分子的一級結(jié)構(gòu)。二、基因編碼區(qū)編碼多肽鏈和特定的RNA分子20基因的編碼序列決定其編碼產(chǎn)物的序列和功能。編碼序列中一個(gè)堿基的改變或突變,可能使基因功能發(fā)生重要的變化。相同的DNA序列因起始位點(diǎn)的變化或不同的剪接方式而編碼不同的蛋白質(zhì)多肽鏈?;虻木幋a序列決定其編碼產(chǎn)物的序列和功能。21順式作用元件(cis-actingelement):在轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控的DNA序列。不同物種、不同細(xì)胞或不同的基因,轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游可以有不同的DNA序列,但這些序列都可統(tǒng)稱為順式作用元件(cis-actingelement)。三、調(diào)控序列參與真核基因表達(dá)調(diào)控順式作用元件(cis-actingelement):不同物22順式作用元件包括啟動子、上游調(diào)控元件、增強(qiáng)子、加尾信號和一些細(xì)胞信號反應(yīng)元件等。順式作用元件包括啟動子、上游調(diào)控元件、增強(qiáng)子、加尾信號和一些23位于基因轉(zhuǎn)錄區(qū)前后,對基因表達(dá)起調(diào)控作用的區(qū)域,因其是緊鄰的DNA序列,又稱旁側(cè)序列?;虻恼{(diào)控區(qū)(順式作用元件)273頁位于基因轉(zhuǎn)錄區(qū)前后,對基因表達(dá)起調(diào)控作用的區(qū)域,因其是緊鄰的24通過復(fù)制將遺傳信息穩(wěn)定、忠實(shí)地遺傳給子代細(xì)胞,在這一過程中為適應(yīng)環(huán)境變化,可能會發(fā)生基因突變。非編碼序列,包括編碼區(qū)兩側(cè)的調(diào)控序列和編碼序列間的間隔序列。重復(fù)序列中含有限制性內(nèi)切酶KpnⅠ(CTTAA↑G)的位點(diǎn)第十三章真核基因與基因組5'GTACGTAC3‘真核生物與原核生物的根本性區(qū)別是前者的細(xì)胞內(nèi)含有成形的細(xì)胞核,因此以真核來命名這一類細(xì)胞。反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)真核基因組的結(jié)構(gòu)與功能DNA以半保留復(fù)制的方式將親代細(xì)胞的遺傳物質(zhì)高度忠實(shí)地傳遞給子代。衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)基因編碼區(qū)中的DNA堿基序列決定特定的成熟RNA分子的序列,即DNA的一級結(jié)構(gòu)決定著其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA分子的一級結(jié)構(gòu)。衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)雙鏈DNA中含有的兩個(gè)結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列稱為反向重復(fù)序列,也稱為回文結(jié)構(gòu),每條單鏈以任一方向閱讀時(shí)都與另一條鏈以相同方向閱讀時(shí)的序列是一致的。外顯子(exon):在基因序列中,出現(xiàn)在成熟mRNA分子上的序列。多基因家族是指由某一祖先基因經(jīng)過重復(fù)和變異所產(chǎn)生的一組在結(jié)構(gòu)上相似、功能相關(guān)的基因。重復(fù)序列中含有限制性內(nèi)切酶KpnⅠ(CTTAA↑G)的位點(diǎn)高度重復(fù)序列(highlyrepetitivesequence)細(xì)胞內(nèi)所有蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的信息全部來源于DNA序列。DNA以半保留復(fù)制的方式將親代細(xì)胞的遺傳物質(zhì)高度忠實(shí)地傳遞給子代。非編碼區(qū)增強(qiáng)子序列距離所調(diào)控基因距離近者幾十個(gè)堿基對,遠(yuǎn)的可達(dá)幾千個(gè)堿基對。轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)TATA盒CAAT盒GC盒增強(qiáng)子AATAAA剪接加尾轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)修飾點(diǎn)外顯子翻譯起始點(diǎn)內(nèi)含子OCT-1OCT-1:ATTTGCAT八聚體+1結(jié)構(gòu)基因啟動子上游啟動子元件順式作用元件通過復(fù)制將遺傳信息穩(wěn)定、忠實(shí)地遺傳給子代細(xì)胞,在這一過程中為25啟動子上游調(diào)控元件增強(qiáng)子加尾信號細(xì)胞信號反應(yīng)元件順式作用元件啟動子順式作用元件261.啟動子提供轉(zhuǎn)錄起始信號
啟動子是DNA分子上能夠介導(dǎo)RNA聚合酶結(jié)合并形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合體的序列。多數(shù)啟動子位于真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)的上游,啟動子本身通常不被轉(zhuǎn)錄。少數(shù)啟動子(如編碼tRNA基因的啟動子)位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的下游,這些DNA序列可以被轉(zhuǎn)錄。1.啟動子提供轉(zhuǎn)錄起始信號啟動子是DNA分子上能夠介導(dǎo)R27真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA聚合酶和相關(guān)蛋白質(zhì)。274頁具有I類啟動子的基因主要編碼rRNA的基因上游啟動子元件核糖體起始因子
富含GC堿基對真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA28真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA聚合酶和相關(guān)蛋白質(zhì)。起始元件具有II類啟動子的基因主要是編碼蛋白質(zhì)(mRNA)的基因和一些小RNA基因。下游啟動子元件真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA29真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA聚合酶和相關(guān)蛋白質(zhì)。具有III類啟動子的基因主要是5SrRNA、tRNA、U6snRNA等RNA分子的編碼基因。真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA302.增強(qiáng)子增強(qiáng)鄰近基因的轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子是增強(qiáng)真核基因啟動子工作效率的順式作用元件,是真核基因中最重要的調(diào)控序列,決定著每一個(gè)基因在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)水平。2.增強(qiáng)子增強(qiáng)鄰近基因的轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子是增強(qiáng)真核基因啟動子工作31能夠在相對于啟動子的任何方向和位置(上游或者下游)上發(fā)揮這種增強(qiáng)作用,大部分位于上游。增強(qiáng)子序列距離所調(diào)控基因距離近者幾十個(gè)堿基對,遠(yuǎn)的可達(dá)幾千個(gè)堿基對。通常數(shù)個(gè)增強(qiáng)子序列形成一簇。有時(shí)增強(qiáng)子序列也可位于內(nèi)含子之中。不同的增強(qiáng)子序列結(jié)合不同的調(diào)節(jié)蛋白。能夠在相對于啟動子的任何方向和位置(上游或者下游)上發(fā)揮這種32沉默子(silencer)是抑制基因轉(zhuǎn)錄的特定DNA序列,當(dāng)其結(jié)合一些反式作用因子時(shí)對基因的轉(zhuǎn)錄起阻遏作用,使基因沉默。3.沉默子是負(fù)調(diào)節(jié)元件沉默子(silencer)是抑制基因轉(zhuǎn)錄的特定DNA序列,當(dāng)33真核基因組的結(jié)構(gòu)與功能
第二節(jié)TheStructureandFunctionofEukaryoteGenome真核基因組的結(jié)構(gòu)與功能第二節(jié)TheStructurea34基因組:細(xì)胞或生物體的一套完整單倍體遺傳物質(zhì)的總和。275頁基因組:細(xì)胞或生物體的一套完整單倍體遺傳物質(zhì)的總和。275頁35一、真核基因組具有獨(dú)特的結(jié)構(gòu)275頁基因的編碼序列所占比例遠(yuǎn)小于非編碼序列。高等真核生物基因組含有大量的重復(fù)序列,真核基因組中存在多基因家族和假基因。大多基因具有可變剪接,80%的可變剪接會使蛋白質(zhì)的序列發(fā)生改變?;蚪MDNA與蛋白質(zhì)結(jié)合形成染色體,儲存于細(xì)胞核內(nèi),除配子細(xì)胞外,體細(xì)胞的基因組為二倍體。結(jié)構(gòu)特點(diǎn):一、真核基因組具有獨(dú)特的結(jié)構(gòu)275頁基因的編碼序列所占比例36二、真核基因組中存在大量重復(fù)序列高度重復(fù)序列(highlyrepetitivesequence)中度重復(fù)序列(moderatelyrepetitivesequence)單拷貝序列(singlecopysequence)或低度重復(fù)序列二、真核基因組中存在大量重復(fù)序列高度重復(fù)序列(highly37(一)高度重復(fù)序列275頁重復(fù)頻率可達(dá)106以上,不編碼蛋白質(zhì)或RNA。反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)分類:(一)高度重復(fù)序列275頁重復(fù)頻率可達(dá)106以上,不編碼38反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)兩個(gè)相同順序的互補(bǔ)拷貝在同一DNA鏈上反向排列而成,重復(fù)單位長度約300bp,多數(shù)散在于基因組中,總長度約占人基因組的5%。反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequenc39反向重復(fù)序列:在同一多核苷酸鏈內(nèi)的相反方向上存在的一段重復(fù)的核苷酸序列。在雙鏈DNA中反向重復(fù)可能引起十字形結(jié)構(gòu)的形成。
反向重復(fù)序列:在同一多核苷酸鏈內(nèi)的相反方向上存在的一段重復(fù)的40形成RNA時(shí)容易形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)形成RNA時(shí)容易形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)41
5'ATGACTCACGGTTCAGTA3'
3'TACTGAGTGCCAAGTCAT
5'
反向重復(fù)序列:5'ATGACTCACGGTTCAGTA3'
42回文結(jié)構(gòu)
結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列。雙鏈DNA中含有的兩個(gè)結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列稱為反向重復(fù)序列,也稱為回文結(jié)構(gòu),每條單鏈以任一方向閱讀時(shí)都與另一條鏈以相同方向閱讀時(shí)的序列是一致的?;蚪M某一DNA由于自身單鏈DNA上有反向重復(fù)序列而自已配對,形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)或莖環(huán)結(jié)構(gòu)。
例如DNA雙鏈:5'GTACGTAC3‘3'CATGCATG5'
回文結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列。雙鏈DNA43主要存在于染色體的著絲粒區(qū)域,重復(fù)單位一般由2~10bp組成,成串排列,在人基因組中約占5%~6%。衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)主要存在于染色體的著絲粒區(qū)域,重復(fù)單位一般由2~10bp組44真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA聚合酶和相關(guān)蛋白質(zhì)?;虮磉_(dá)需要的調(diào)控區(qū)(regulatoryregion)序列,包括啟動子(promoter)、增強(qiáng)子(enhancer)等。重復(fù)序列中含有限制性內(nèi)切酶KpnⅠ(CTTAA↑G)的位點(diǎn)基因序列中開始RNA鏈合成的第一個(gè)核苷酸所對應(yīng)的堿基記為+1,此堿基上游的序列記為負(fù)數(shù),下游的序列記為正數(shù)。5'GTACGTAC3‘編碼區(qū)序列(codingregionsequence)OCT-1:ATTTGCAT八聚體利用堿基的不同排列荷載遺傳信息。衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)編碼區(qū)A、B、C、D非編碼區(qū)多基因家族是指由某一祖先基因經(jīng)過重復(fù)和變異所產(chǎn)生的一組在結(jié)構(gòu)上相似、功能相關(guān)的基因。外顯子與內(nèi)含子接頭處有一段高度保守的序列,這一共有序列是真核基因中RNA剪接的識別信號。內(nèi)含子的數(shù)量和大小決定了真核基因的大小。平均長度為3500bp~5000bp,與長度約為13000bp的單拷貝序列間隔排列。非編碼序列,包括編碼區(qū)兩側(cè)的調(diào)控序列和編碼序列間的間隔序列?;蛐蛄兄虚_始RNA鏈合成的第一個(gè)核苷酸所對應(yīng)的堿基記為+1,此堿基上游的序列記為負(fù)數(shù),下游的序列記為正數(shù)。少各重復(fù)單位中的rRNA基因都是相同的。平均長度約300bp~500bp,與長度約為1000bp的單拷貝序列間隔排列。衛(wèi)星DNA按其重復(fù)單元的核苷酸的多少,分為兩類1、小衛(wèi)星DNA(minisatelliteDNA):由大約25bp的DNA序列頭-尾串聯(lián)重復(fù)組成的重復(fù)DNA片段,又稱可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)(variablenumbertandemrepeat,VNTR)。2、微衛(wèi)星DNA(microsatelliteDNA):又稱為短串聯(lián)重復(fù)序列(ShortTandemRepeatSTR)。廣泛分布于基因組中,其中富含A-T堿基對,由2-20個(gè)左右的核苷酸對的單元重復(fù)成百上千次所組成。
真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA45第十三章真核基因與基因組課件46參與復(fù)制水平的調(diào)節(jié)
存在于DNA復(fù)制起點(diǎn)區(qū)的附近,是一些蛋白質(zhì)(包括酶)的結(jié)合位點(diǎn)。參與基因表達(dá)的調(diào)控
可以轉(zhuǎn)錄到核內(nèi)不均一RNA分子中,有些反向重復(fù)序列可以形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),有助于穩(wěn)定RNA分子。參與染色體配對
如衛(wèi)星DNA成簇樣分布在染色體著絲粒附近,可能與染色體減數(shù)分裂時(shí)染色體配對有關(guān)。高度重復(fù)序列的功能:276頁參與復(fù)制水平的調(diào)節(jié)高度重復(fù)序列的功能:276頁47(二)中度重復(fù)序列276頁重復(fù)數(shù)十至數(shù)千次,大多數(shù)與單拷貝基因間隔排列。短分散重復(fù)片段長分散重復(fù)片段平均長度約300bp~500bp,與長度約為1000bp的單拷貝序列間隔排列??截悢?shù)可達(dá)數(shù)十萬。如Alu家族、KpnI家族、Hinf家族。平均長度為3500bp~5000bp,與長度約為13000bp的單拷貝序列間隔排列。(二)中度重復(fù)序列276頁重復(fù)數(shù)十至數(shù)千次,大多數(shù)與單48重復(fù)達(dá)30~50萬次,每個(gè)成員的長度約300bp。每個(gè)單位長度中一個(gè)限制性內(nèi)切酶Alu的切點(diǎn)(AG↓CT),將其切成長130bp和170bp的兩段。Alu家族僅次于Alu家族的第二大家族,重復(fù)序列中含有限制性內(nèi)切酶KpnⅠ(CTTAA↑G)的位點(diǎn)呈散在分布,拷貝數(shù)約為3000~4800個(gè)KpnI家族以319bp長度的串聯(lián)重復(fù)存在于人基因組中重復(fù)序列中含有限制性內(nèi)切酶HinfI的位點(diǎn)。Hinf家族短分散重復(fù)片段包括:重復(fù)達(dá)30~50萬次,每個(gè)成員的長度約300bp。Alu家49rRNA基因重復(fù)序列屬于中度重復(fù)序列各重復(fù)單位中的rRNA基因都是相同的。rRNA基因集中成簇存在,這樣的區(qū)域稱為rDNA區(qū)。人類的rRNA基因位于13、14、15、21和22號染色體的核仁組織區(qū),每個(gè)核仁組織區(qū)平均含有50個(gè)rRNA基因的重復(fù)單位。5SrRNA基因似乎全部位于1號染色體,每個(gè)單倍體基因組約有1000個(gè)5SrRNA基因。rRNA基因重復(fù)序列屬于中度重復(fù)序列各重復(fù)單位中的rRNA基50在單倍體基因組中只出現(xiàn)一次或數(shù)次,大多數(shù)為蛋白質(zhì)編碼的基因。(三)單拷貝序列(低度重復(fù)序列)在單倍體基因組中只出現(xiàn)一次或數(shù)次,大多數(shù)為蛋白質(zhì)編碼的基因。51三、真核基因組中存在大量的多基因家族與假基因多基因家族是指由某一祖先基因經(jīng)過重復(fù)和變異所產(chǎn)生的一組在結(jié)構(gòu)上相似、功能相關(guān)的基因?;蚣易宄纱氐胤植荚谀骋粭l染色體上,同時(shí)發(fā)揮作用,合成某些蛋白質(zhì)。如組蛋白基因家族?;蚣易宓牟煌蓡T成簇地分布于不同染色體上,編碼一組功能上緊密相關(guān)的蛋白質(zhì)。如球蛋白基因家族。
三、真核基因組中存在大量的多基因家族與假基因多基因家族是指由52DNA序列相似,但功能不一定相關(guān)的若干個(gè)單拷貝基因或若干組基因家族總稱。超家族基因(superfamilygene)基因組中存在的一段與正?;蚍浅O嗨频荒鼙磉_(dá)的DNA序列。以來表示。假基因(psuedogene)DNA序列相似,但功能不一定相關(guān)的若干個(gè)單拷貝基因或若干組基53基因編碼區(qū)中的DNA堿基序列決定特定的成熟RNA分子的序列,即DNA的一級結(jié)構(gòu)決定著其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA分子的一級結(jié)構(gòu)。富含GC堿基對大多基因具有可變剪接,80%的可變剪接會使蛋白質(zhì)的序列發(fā)生改變。非編碼區(qū)每個(gè)單位長度中一個(gè)限制性內(nèi)切酶Alu的切點(diǎn)(AG↓CT),將其切成長130bp和170bp的兩段。反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)增強(qiáng)子序列距離所調(diào)控基因距離近者幾十個(gè)堿基對,遠(yuǎn)的可達(dá)幾千個(gè)堿基對。5′PdAPdCPdGPdTOH3′5′PAPCPGPUOH′基因組(genome):一個(gè)生物體內(nèi)所有遺傳信息的總和。重復(fù)序列中含有限制性內(nèi)切酶KpnⅠ(CTTAA↑G)的位點(diǎn)多基因家族是指由某一祖先基因經(jīng)過重復(fù)和變異所產(chǎn)生的一組在結(jié)構(gòu)上相似、功能相關(guān)的基因。同時(shí)進(jìn)行基因包括編碼序列(外顯子)、調(diào)控序列和間隔序列(內(nèi)含子)?;蚪M(genome):一個(gè)生物體內(nèi)所有遺傳信息的總和?;蚪M:細(xì)胞或生物體的一套完整單倍體遺傳物質(zhì)的總和。真核基因組的結(jié)構(gòu)與功能OCT-1:ATTTGCAT八聚體DNA以半保留復(fù)制的方式將親代細(xì)胞的遺傳物質(zhì)高度忠實(shí)地傳遞給子代。5'GTACGTAC3‘5'GTACGTAC3‘通過復(fù)制將遺傳信息穩(wěn)定、忠實(shí)地遺傳給子代細(xì)胞,在這一過程中為適應(yīng)環(huán)境變化,可能會發(fā)生基因突變?;蛐蛄兄虚_始RNA鏈合成的第一個(gè)核苷酸所對應(yīng)的堿基記為+1,此堿基上游的序列記為負(fù)數(shù),下游的序列記為正數(shù)。重復(fù)達(dá)30~50萬次,每個(gè)成員的長度約300bp。上游啟動子元件核糖體起始因子反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)編碼區(qū)序列(codingregionsequence)真核基因組的結(jié)構(gòu)與功能5'GTACGTAC3‘能夠在相對于啟動子的任何方向和位置(上游或者下游)上發(fā)揮這種增強(qiáng)作用,大部分位于上游。假基因(psuedogene)二、真核基因組中存在大量重復(fù)序列基因編碼區(qū)中的DNA堿基序列決定特定的成熟RNA分子的序列,即DNA的一級結(jié)構(gòu)決定著其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA分子的一級結(jié)構(gòu)。通過復(fù)制將遺傳信息穩(wěn)定、忠實(shí)地遺傳給子代細(xì)胞,在這一過程中為適應(yīng)環(huán)境變化,可能會發(fā)生基因突變。重復(fù)序列中含有限制性內(nèi)切酶KpnⅠ(CTTAA↑G)的位點(diǎn)1、小衛(wèi)星DNA(minisatelliteDNA):外顯子與內(nèi)含子接頭處有一段高度保守的序列,這一共有序列是真核基因中RNA剪接的識別信號。外顯子(exon):在基因序列中,出現(xiàn)在成熟mRNA分子上的序列。人類基因組包含了細(xì)胞核染色體DNA(常染色體和性染色體)及線粒體DNA所攜帶的所有遺傳物質(zhì)。反向重復(fù)序列:在同一多核苷酸鏈內(nèi)的相反方向上存在的一段重復(fù)的核苷酸序列。幾千四、線粒體DNA結(jié)構(gòu)有別于染色體DNA線粒體DNA(mitochondrialDNA,mtDNA)是核外遺傳物質(zhì),能獨(dú)立編碼線粒體中的一些蛋白質(zhì)。mtDNA的結(jié)構(gòu)為環(huán)狀分子,與原核生物的DNA類似,結(jié)構(gòu)特點(diǎn)也與原核生物相似?;蚓幋a區(qū)中的DNA堿基序列決定特定的成熟RNA分子的序列,54第十三章真核基因與基因組第十三章真核基因與基因組55優(yōu)選第十三章真核基因與基因組優(yōu)選第十三章真核基因與基因組56遺傳信息傳遞中心法則(TheCentralDogma)RNA蛋白質(zhì)DNA復(fù)制轉(zhuǎn)錄翻譯逆轉(zhuǎn)錄RNA復(fù)制遺傳信息傳遞中心法則(TheCentralDogma)57生物體內(nèi)的遺傳信息傳遞遵循中心法則
271頁DNA以半保留復(fù)制的方式將親代細(xì)胞的遺傳物質(zhì)高度忠實(shí)地傳遞給子代。以DNA為模板轉(zhuǎn)錄生成的mRNA作為信使,其核苷酸序列構(gòu)成的密碼子在合成蛋白質(zhì)時(shí)被翻譯為肽鏈中氨基酸的排列順序。細(xì)胞內(nèi)所有蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的信息全部來源于DNA序列。生物體內(nèi)的遺傳信息傳遞遵循中心法則271頁DNA以半保留58真核基因與基因組
第十三章EukaryoteGeneandGenome真核基因與基因組第十三章EukaryoteGenean59真核生物是所有單細(xì)胞或多細(xì)胞的、其細(xì)胞具有細(xì)胞核的生物的總稱,它包括所有動物、植物、真菌和其他具有由膜包裹著的復(fù)雜亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的生物。真核生物與原核生物的根本性區(qū)別是前者的細(xì)胞內(nèi)含有成形的細(xì)胞核,因此以真核來命名這一類細(xì)胞。許多真核細(xì)胞中還含有其它細(xì)胞器,如線粒體、葉綠體、高爾基體等
。真核生物是所有單細(xì)胞或多細(xì)胞的、其細(xì)胞具有細(xì)胞核的生物的總稱60染色體主要類群細(xì)胞器細(xì)胞核細(xì)胞大小真核細(xì)胞原核細(xì)胞細(xì)菌、藍(lán)藻、衣原體、放線菌有核膜,有成形的細(xì)胞核沒有核膜,稱為擬核較?。?μm~10μm)較大(10μm~100μ)有核糖體、線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體、葉綠體(植物)等只有核糖體有染色體,染色體由DNA和蛋白質(zhì)結(jié)合無染色體,環(huán)狀DNA不與蛋白質(zhì)結(jié)合動物、植物、真菌等真核生物和原核生物的區(qū)別比較:染色體主要類群細(xì)胞器細(xì)胞核細(xì)胞大小真核細(xì)胞原核細(xì)胞細(xì)菌、藍(lán)61特征原核生物真核生物
DNA量少多基因數(shù)幾千大于幾萬、十萬轉(zhuǎn)錄和翻譯的時(shí)空關(guān)系同時(shí)進(jìn)行核內(nèi)轉(zhuǎn)錄,細(xì)胞質(zhì)中翻譯特征原核生物62除了某些以RNA為基因組的RNA病毒外,基因通常是指染色體或基因組的一段DNA序列?;虬ň幋a序列(外顯子)、調(diào)控序列和間隔序列(內(nèi)含子)?;颍╣ene):編碼蛋白質(zhì)或RNA等具有特定功能產(chǎn)物的、負(fù)載遺傳信息的基本單位。除了某些以RNA為基因組的RNA病毒外,基因通常是指染色體或63基因組(genome):一個(gè)生物體內(nèi)所有遺傳信息的總和。人類基因組包含了細(xì)胞核染色體DNA(常染色體和性染色體)及線粒體DNA所攜帶的所有遺傳物質(zhì)?;蚪M(genome):一個(gè)生物體內(nèi)所有遺傳信息的總和。人類64人類基因組包含了細(xì)胞核染色體DNA(常染色體和性染色體)及線粒體DNA所攜帶的所有遺傳物質(zhì)。能夠在相對于啟動子的任何方向和位置(上游或者下游)上發(fā)揮這種增強(qiáng)作用,大部分位于上游。ACGTGCGTACGUAUGU一、真核基因組具有獨(dú)特的結(jié)構(gòu)275頁假基因(psuedogene)反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)高度重復(fù)序列(highlyrepetitivesequence)具有II類啟動子的基因主要是編碼蛋白質(zhì)(mRNA)的基因和一些小RNA基因。原核細(xì)胞的基因基本沒有內(nèi)含子。平均長度為3500bp~5000bp,與長度約為13000bp的單拷貝序列間隔排列。存在于DNA復(fù)制起點(diǎn)區(qū)的附近,是一些蛋白質(zhì)(包括酶)的結(jié)合位點(diǎn)。三、真核基因組中存在大量的多基因家族與假基因真核生物和原核生物的區(qū)別比較:斷裂基因(splitegene)基因包括編碼序列(外顯子)、調(diào)控序列和間隔序列(內(nèi)含子)。雙鏈DNA中含有的兩個(gè)結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列稱為反向重復(fù)序列,也稱為回文結(jié)構(gòu),每條單鏈以任一方向閱讀時(shí)都與另一條鏈以相同方向閱讀時(shí)的序列是一致的。真核基因的結(jié)構(gòu)與功能
第一節(jié)TheStructureandFunctionofEukaryoteGene人類基因組包含了細(xì)胞核染色體DNA(常染色體和性染色體)及線65利用堿基的不同排列荷載遺傳信息。通過復(fù)制將遺傳信息穩(wěn)定、忠實(shí)地遺傳給子代細(xì)胞,在這一過程中為適應(yīng)環(huán)境變化,可能會發(fā)生基因突變。作為基因表達(dá)(geneexpression)的模板,使其所攜帶的遺傳信息通過各種RNA和蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)有序合成而表現(xiàn)出來。
基因的功能272頁利用堿基的不同排列荷載遺傳信息?;虻墓δ?7266單個(gè)基因的組成結(jié)構(gòu)及一個(gè)完整的生物體內(nèi)基因的組織排列方式統(tǒng)稱為基因組構(gòu)(geneorganization)。
與基因功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)編碼區(qū)序列(codingregionsequence
)非編碼序列(non-codingsequence)基因表達(dá)需要的調(diào)控區(qū)(regulatoryregion)序列,包括啟動子(promoter)、增強(qiáng)子(enhancer)等。在細(xì)胞內(nèi)表達(dá)為蛋白質(zhì)或功能RNA的DNA序列單個(gè)基因的組成結(jié)構(gòu)及一個(gè)完整的生物體內(nèi)基因的組織排列方式統(tǒng)稱67一、真核基因的基本結(jié)構(gòu)編碼蛋白質(zhì)或RNA的編碼序列。非編碼序列,包括編碼區(qū)兩側(cè)的調(diào)控序列和編碼序列間的間隔序列。一、真核基因的基本結(jié)構(gòu)編碼蛋白質(zhì)或RNA的編碼序列。非編碼序68真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因。斷裂基因(splitegene)CABD編碼區(qū)A、B、C、D非編碼區(qū)能產(chǎn)生初級轉(zhuǎn)錄,但后加工被去掉了真核基因結(jié)構(gòu)真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開但又連續(xù)69真核基因結(jié)構(gòu)不連續(xù),為斷裂基因(splitgene)。真核基因結(jié)構(gòu)外顯子(exon):在基因序列中,出現(xiàn)在成熟mRNA分子上的序列。內(nèi)含子(intron):外顯子之間、與mRNA剪接過程中被刪除部分相對應(yīng)的間隔序列。真核基因結(jié)構(gòu)不連續(xù),為斷裂基因(splitgene)。真核70多數(shù)啟動子位于真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)的上游,啟動子本身通常不被轉(zhuǎn)錄。平均長度為3500bp~5000bp,與長度約為13000bp的單拷貝序列間隔排列。作為基因表達(dá)(geneexpression)的模板,使其所攜帶的遺傳信息通過各種RNA和蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)有序合成而表現(xiàn)出來。超家族基因(superfamilygene)少數(shù)啟動子(如編碼tRNA基因的啟動子)位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的下游,這些DNA序列可以被轉(zhuǎn)錄。高度重復(fù)序列(highlyrepetitivesequence)增強(qiáng)子增強(qiáng)鄰近基因的轉(zhuǎn)錄反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)DNARNA人類的rRNA基因位于13、14、15、21和22號染色體的核仁組織區(qū),每個(gè)核仁組織區(qū)平均含有50個(gè)rRNA基因的重復(fù)單位。高等真核生物基因組含有大量的重復(fù)序列,雙鏈DNA中含有的兩個(gè)結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列稱為反向重復(fù)序列,也稱為回文結(jié)構(gòu),每條單鏈以任一方向閱讀時(shí)都與另一條鏈以相同方向閱讀時(shí)的序列是一致的。第十三章真核基因與基因組人類基因組包含了細(xì)胞核染色體DNA(常染色體和性染色體)及線粒體DNA所攜帶的所有遺傳物質(zhì)。重復(fù)頻率可達(dá)106以上,不編碼蛋白質(zhì)或RNA。重復(fù)序列中含有限制性內(nèi)切酶KpnⅠ(CTTAA↑G)的位點(diǎn)衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)原核細(xì)胞的基因基本沒有內(nèi)含子。主要存在于染色體的著絲粒區(qū)域,重復(fù)單位一般由2~10bp組成,成串排列,在人基因組中約占5%~6%。高等真核生物絕大部分編碼蛋白質(zhì)的基因都有內(nèi)含子。原核細(xì)胞的基因基本沒有內(nèi)含子。編碼rRNA和一些tRNA的基因也都有內(nèi)含子。內(nèi)含子的數(shù)量和大小決定了真核基因的大小。不同種屬中,外顯子序列通常比較保守,而內(nèi)含子序列則變異較大。外顯子與內(nèi)含子接頭處有一段高度保守的序列,這一共有序列是真核基因中RNA剪接的識別信號。多數(shù)啟動子位于真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)的上游,啟動子本身通常不被715′PdAPdCPdGPdTOH3′5′PAPCPGPUOH′
或5′ACGTGCGT3′5′ACGUAUGU3′
ACGTGCGTACGUAUGUDNARNAT5′3′OHU5′3′OHOHOHOHOH5′PdAPdCPdGPdTOH3′72基因的5端稱之為上游,3端稱為下游基因序列中開始RNA鏈合成的第一個(gè)核苷酸所對應(yīng)的堿基記為+1,此堿基上游的序列記為負(fù)數(shù),下游的序列記為正數(shù)?;虻?端稱之為上游,3端稱為下游73二、基因編碼區(qū)編碼多肽鏈和特定的RNA分子273頁
基因編碼區(qū)中的DNA堿基序列決定特定的成熟RNA分子的序列,即DNA的一級結(jié)構(gòu)決定著其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA分子的一級結(jié)構(gòu)。二、基因編碼區(qū)編碼多肽鏈和特定的RNA分子74基因的編碼序列決定其編碼產(chǎn)物的序列和功能。編碼序列中一個(gè)堿基的改變或突變,可能使基因功能發(fā)生重要的變化。相同的DNA序列因起始位點(diǎn)的變化或不同的剪接方式而編碼不同的蛋白質(zhì)多肽鏈?;虻木幋a序列決定其編碼產(chǎn)物的序列和功能。75順式作用元件(cis-actingelement):在轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控的DNA序列。不同物種、不同細(xì)胞或不同的基因,轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游可以有不同的DNA序列,但這些序列都可統(tǒng)稱為順式作用元件(cis-actingelement)。三、調(diào)控序列參與真核基因表達(dá)調(diào)控順式作用元件(cis-actingelement):不同物76順式作用元件包括啟動子、上游調(diào)控元件、增強(qiáng)子、加尾信號和一些細(xì)胞信號反應(yīng)元件等。順式作用元件包括啟動子、上游調(diào)控元件、增強(qiáng)子、加尾信號和一些77位于基因轉(zhuǎn)錄區(qū)前后,對基因表達(dá)起調(diào)控作用的區(qū)域,因其是緊鄰的DNA序列,又稱旁側(cè)序列?;虻恼{(diào)控區(qū)(順式作用元件)273頁位于基因轉(zhuǎn)錄區(qū)前后,對基因表達(dá)起調(diào)控作用的區(qū)域,因其是緊鄰的78通過復(fù)制將遺傳信息穩(wěn)定、忠實(shí)地遺傳給子代細(xì)胞,在這一過程中為適應(yīng)環(huán)境變化,可能會發(fā)生基因突變。非編碼序列,包括編碼區(qū)兩側(cè)的調(diào)控序列和編碼序列間的間隔序列。重復(fù)序列中含有限制性內(nèi)切酶KpnⅠ(CTTAA↑G)的位點(diǎn)第十三章真核基因與基因組5'GTACGTAC3‘真核生物與原核生物的根本性區(qū)別是前者的細(xì)胞內(nèi)含有成形的細(xì)胞核,因此以真核來命名這一類細(xì)胞。反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)真核基因組的結(jié)構(gòu)與功能DNA以半保留復(fù)制的方式將親代細(xì)胞的遺傳物質(zhì)高度忠實(shí)地傳遞給子代。衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)基因編碼區(qū)中的DNA堿基序列決定特定的成熟RNA分子的序列,即DNA的一級結(jié)構(gòu)決定著其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA分子的一級結(jié)構(gòu)。衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)雙鏈DNA中含有的兩個(gè)結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列稱為反向重復(fù)序列,也稱為回文結(jié)構(gòu),每條單鏈以任一方向閱讀時(shí)都與另一條鏈以相同方向閱讀時(shí)的序列是一致的。外顯子(exon):在基因序列中,出現(xiàn)在成熟mRNA分子上的序列。多基因家族是指由某一祖先基因經(jīng)過重復(fù)和變異所產(chǎn)生的一組在結(jié)構(gòu)上相似、功能相關(guān)的基因。重復(fù)序列中含有限制性內(nèi)切酶KpnⅠ(CTTAA↑G)的位點(diǎn)高度重復(fù)序列(highlyrepetitivesequence)細(xì)胞內(nèi)所有蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的信息全部來源于DNA序列。DNA以半保留復(fù)制的方式將親代細(xì)胞的遺傳物質(zhì)高度忠實(shí)地傳遞給子代。非編碼區(qū)增強(qiáng)子序列距離所調(diào)控基因距離近者幾十個(gè)堿基對,遠(yuǎn)的可達(dá)幾千個(gè)堿基對。轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)TATA盒CAAT盒GC盒增強(qiáng)子AATAAA剪接加尾轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)修飾點(diǎn)外顯子翻譯起始點(diǎn)內(nèi)含子OCT-1OCT-1:ATTTGCAT八聚體+1結(jié)構(gòu)基因啟動子上游啟動子元件順式作用元件通過復(fù)制將遺傳信息穩(wěn)定、忠實(shí)地遺傳給子代細(xì)胞,在這一過程中為79啟動子上游調(diào)控元件增強(qiáng)子加尾信號細(xì)胞信號反應(yīng)元件順式作用元件啟動子順式作用元件801.啟動子提供轉(zhuǎn)錄起始信號
啟動子是DNA分子上能夠介導(dǎo)RNA聚合酶結(jié)合并形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合體的序列。多數(shù)啟動子位于真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)的上游,啟動子本身通常不被轉(zhuǎn)錄。少數(shù)啟動子(如編碼tRNA基因的啟動子)位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的下游,這些DNA序列可以被轉(zhuǎn)錄。1.啟動子提供轉(zhuǎn)錄起始信號啟動子是DNA分子上能夠介導(dǎo)R81真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA聚合酶和相關(guān)蛋白質(zhì)。274頁具有I類啟動子的基因主要編碼rRNA的基因上游啟動子元件核糖體起始因子
富含GC堿基對真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA82真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA聚合酶和相關(guān)蛋白質(zhì)。起始元件具有II類啟動子的基因主要是編碼蛋白質(zhì)(mRNA)的基因和一些小RNA基因。下游啟動子元件真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA83真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA聚合酶和相關(guān)蛋白質(zhì)。具有III類啟動子的基因主要是5SrRNA、tRNA、U6snRNA等RNA分子的編碼基因。真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA842.增強(qiáng)子增強(qiáng)鄰近基因的轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子是增強(qiáng)真核基因啟動子工作效率的順式作用元件,是真核基因中最重要的調(diào)控序列,決定著每一個(gè)基因在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)水平。2.增強(qiáng)子增強(qiáng)鄰近基因的轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子是增強(qiáng)真核基因啟動子工作85能夠在相對于啟動子的任何方向和位置(上游或者下游)上發(fā)揮這種增強(qiáng)作用,大部分位于上游。增強(qiáng)子序列距離所調(diào)控基因距離近者幾十個(gè)堿基對,遠(yuǎn)的可達(dá)幾千個(gè)堿基對。通常數(shù)個(gè)增強(qiáng)子序列形成一簇。有時(shí)增強(qiáng)子序列也可位于內(nèi)含子之中。不同的增強(qiáng)子序列結(jié)合不同的調(diào)節(jié)蛋白。能夠在相對于啟動子的任何方向和位置(上游或者下游)上發(fā)揮這種86沉默子(silencer)是抑制基因轉(zhuǎn)錄的特定DNA序列,當(dāng)其結(jié)合一些反式作用因子時(shí)對基因的轉(zhuǎn)錄起阻遏作用,使基因沉默。3.沉默子是負(fù)調(diào)節(jié)元件沉默子(silencer)是抑制基因轉(zhuǎn)錄的特定DNA序列,當(dāng)87真核基因組的結(jié)構(gòu)與功能
第二節(jié)TheStructureandFunctionofEukaryoteGenome真核基因組的結(jié)構(gòu)與功能第二節(jié)TheStructurea88基因組:細(xì)胞或生物體的一套完整單倍體遺傳物質(zhì)的總和。275頁基因組:細(xì)胞或生物體的一套完整單倍體遺傳物質(zhì)的總和。275頁89一、真核基因組具有獨(dú)特的結(jié)構(gòu)275頁基因的編碼序列所占比例遠(yuǎn)小于非編碼序列。高等真核生物基因組含有大量的重復(fù)序列,真核基因組中存在多基因家族和假基因。大多基因具有可變剪接,80%的可變剪接會使蛋白質(zhì)的序列發(fā)生改變?;蚪MDNA與蛋白質(zhì)結(jié)合形成染色體,儲存于細(xì)胞核內(nèi),除配子細(xì)胞外,體細(xì)胞的基因組為二倍體。結(jié)構(gòu)特點(diǎn):一、真核基因組具有獨(dú)特的結(jié)構(gòu)275頁基因的編碼序列所占比例90二、真核基因組中存在大量重復(fù)序列高度重復(fù)序列(highlyrepetitivesequence)中度重復(fù)序列(moderatelyrepetitivesequence)單拷貝序列(singlecopysequence)或低度重復(fù)序列二、真核基因組中存在大量重復(fù)序列高度重復(fù)序列(highly91(一)高度重復(fù)序列275頁重復(fù)頻率可達(dá)106以上,不編碼蛋白質(zhì)或RNA。反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)分類:(一)高度重復(fù)序列275頁重復(fù)頻率可達(dá)106以上,不編碼92反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequence)兩個(gè)相同順序的互補(bǔ)拷貝在同一DNA鏈上反向排列而成,重復(fù)單位長度約300bp,多數(shù)散在于基因組中,總長度約占人基因組的5%。反向重復(fù)序列(invertedrepeatsequenc93反向重復(fù)序列:在同一多核苷酸鏈內(nèi)的相反方向上存在的一段重復(fù)的核苷酸序列。在雙鏈DNA中反向重復(fù)可能引起十字形結(jié)構(gòu)的形成。
反向重復(fù)序列:在同一多核苷酸鏈內(nèi)的相反方向上存在的一段重復(fù)的94形成RNA時(shí)容易形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)形成RNA時(shí)容易形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)95
5'ATGACTCACGGTTCAGTA3'
3'TACTGAGTGCCAAGTCAT
5'
反向重復(fù)序列:5'ATGACTCACGGTTCAGTA3'
96回文結(jié)構(gòu)
結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列。雙鏈DNA中含有的兩個(gè)結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列稱為反向重復(fù)序列,也稱為回文結(jié)構(gòu),每條單鏈以任一方向閱讀時(shí)都與另一條鏈以相同方向閱讀時(shí)的序列是一致的?;蚪M某一DNA由于自身單鏈DNA上有反向重復(fù)序列而自已配對,形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)或莖環(huán)結(jié)構(gòu)。
例如DNA雙鏈:5'GTACGTAC3‘3'CATGCATG5'
回文結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列。雙鏈DNA97主要存在于染色體的著絲粒區(qū)域,重復(fù)單位一般由2~10bp組成,成串排列,在人基因組中約占5%~6%。衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)主要存在于染色體的著絲粒區(qū)域,重復(fù)單位一般由2~10bp組98真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA聚合酶和相關(guān)蛋白質(zhì)?;虮磉_(dá)需要的調(diào)控區(qū)(regulatoryregion)序列,包括啟動子(promoter)、增強(qiáng)子(enhancer)等。重復(fù)序列中含有限制性內(nèi)切酶KpnⅠ(CTTAA↑G)的位點(diǎn)基因序列中開始RNA鏈合成的第一個(gè)核苷酸所對應(yīng)的堿基記為+1,此堿基上游的序列記為負(fù)數(shù),下游的序列記為正數(shù)。5'GTACGTAC3‘編碼區(qū)序列(codingregionsequence)OCT-1:ATTTGCAT八聚體利用堿基的不同排列荷載遺傳信息。衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)編碼區(qū)A、B、C、D非編碼區(qū)多基因家族是指由某一祖先基因經(jīng)過重復(fù)和變異所產(chǎn)生的一組在結(jié)構(gòu)上相似、功能相關(guān)的基因。外顯子與內(nèi)含子接頭處有一段高度保守的序列,這一共有序列是真核基因中RNA剪接的識別信號。內(nèi)含子的數(shù)量和大小決定了真核基因的大小。平均長度為3500bp~5000bp,與長度約為13000bp的單拷貝序列間隔排列。非編碼序列,包括編碼區(qū)兩側(cè)的調(diào)控序列和編碼序列間的間隔序列。基因序列中開始RNA鏈合成的第一個(gè)核苷酸所對應(yīng)的堿基記為+1,此堿基上游的序列記為負(fù)數(shù),下游的序列記為正數(shù)。少各重復(fù)單位中的rRNA基因都是相同的。平均長度約300bp~500bp,與長度約為1000bp的單拷貝序列間隔排列。衛(wèi)星DNA按其重復(fù)單元的核苷酸的多少,分為兩類1、小衛(wèi)星DNA(minisatelliteDNA):由大約25bp的DNA序列頭-尾串聯(lián)重復(fù)組成的重復(fù)DNA片段,又稱可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)(variablenumbertandemrepeat,VNTR)。2、微衛(wèi)星DNA(microsatelliteDNA):又稱為短串聯(lián)重復(fù)序列(ShortTandemRepeatSTR)。廣泛分布于基因組中,其中富含A-T堿基對,由2-20個(gè)左右的核苷酸對的單元重復(fù)成百上千次所組成。
真核生物有3類啟動子,分別對應(yīng)于細(xì)胞內(nèi)存在的三種不同的RNA99第十三章真核基因與基因組課件100參與復(fù)制水平的調(diào)節(jié)
存在于DNA復(fù)制起點(diǎn)區(qū)的附近,是一些蛋白質(zhì)(包括酶)的結(jié)合位點(diǎn)。參與基因表達(dá)的調(diào)控
可以轉(zhuǎn)錄到核內(nèi)不均一RNA分子中,有些反向重復(fù)序列可以形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),有助于穩(wěn)定RNA分子。參與染色體配對
如衛(wèi)星DNA成簇樣分布在染色體著絲粒附近,可能與染色體減數(shù)分裂時(shí)染色體配對有關(guān)。高度重復(fù)序列的功能:276頁參與復(fù)制水平的調(diào)節(jié)高度重復(fù)序列的功能:276頁101(二)中度重復(fù)序列276頁重復(fù)數(shù)十至數(shù)千次,大多數(shù)與單拷貝基因間隔排列。短分散重復(fù)片段長分散重復(fù)片段平均長度約300bp~500bp,與長度約為1000bp的單拷貝序列間隔排列。拷貝數(shù)可達(dá)數(shù)十萬。如Alu家族、KpnI家族、Hinf家族。平均長度為3500bp~5000bp,與長度約為13000bp的單
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