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文檔簡介
真核基因與基因組詳解演示文稿當(dāng)前1頁,總共45頁。優(yōu)選真核基因與基因組當(dāng)前2頁,總共45頁。遺傳信息傳遞的中心法則
遺傳信息傳遞的中心法則(TheGeneticCentralDogma)主要闡述了遺傳信息的傳遞方式,即闡述了遺傳信息的流動方向。它包括了DNA的復(fù)制、RNA的轉(zhuǎn)錄、蛋白質(zhì)的翻譯,以及RNA的逆轉(zhuǎn)錄及RNA的復(fù)制等過程。當(dāng)前3頁,總共45頁。遺傳信息傳遞的中心法則
蛋白質(zhì)雖然不能作為DNA、RNA、蛋白質(zhì)自身合成的模板,指導(dǎo)DNA、RNA或自身蛋白質(zhì)的合成,但蛋白質(zhì)參與了DNA、RNA及蛋白質(zhì)自身的合成及合成調(diào)節(jié)的全過程。DNARNA蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄翻譯復(fù)制RNA復(fù)制【RNA病毒】當(dāng)前4頁,總共45頁。第十三章真核基因與基因組
EukaryoteGeneandGenome當(dāng)前5頁,總共45頁。主要內(nèi)容一、基因、基因組的概念二、真核生物基因的結(jié)構(gòu)與功能三、真核生物基因組的結(jié)構(gòu)與功能四、原核生物基因、基因組的結(jié)構(gòu)當(dāng)前6頁,總共45頁。一、基因、基因組的概念(一)基因
基因(gene)是編碼蛋白質(zhì)或RNA等具有特定功能產(chǎn)物的、負(fù)載遺傳信息的基本單位。
除了某些以RNA為基因組的RNA病毒外,基因通常是指染色體或基因組的一段DNA序列。
基因包括編碼序列(外顯子)、調(diào)控序列和間隔序列(內(nèi)含子)。當(dāng)前7頁,總共45頁。基因表達(dá)的調(diào)控區(qū)(II類啟動子)轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)TATA盒CAAT盒GC盒增強(qiáng)子AATAAA剪接加尾轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)修飾點(diǎn)外顯子翻譯起始點(diǎn)內(nèi)含子OCT-1OCT-1:ATTTGCAT八聚體+1結(jié)構(gòu)基因啟動子上游啟動子元件當(dāng)前8頁,總共45頁。一、基因、基因組的概念(一)基因
基因(gene)是編碼蛋白質(zhì)或RNA等具有特定功能產(chǎn)物的、負(fù)載遺傳信息的基本單位。
除了某些以RNA為基因組的RNA病毒外,基因通常是指染色體或基因組的一段DNA序列。
基因包括編碼序列(外顯子)、調(diào)控序列和間隔序列(內(nèi)含子)?;蚴荄NA分子上的一個最小的功能片段當(dāng)前9頁,總共45頁?;虻墓δ芾脡A基的不同排列荷載遺傳信息。通過復(fù)制將遺傳信息穩(wěn)定、忠實(shí)地遺傳給子代細(xì)胞,在這一過程中為適應(yīng)環(huán)境變化,可能會發(fā)生基因突變。作為基因表達(dá)(geneexpression)的模板,使其所攜帶的遺傳信息通過各種RNA和蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)有序合成而表現(xiàn)出來?;虮磉_(dá)(geneexpression)就是基因轉(zhuǎn)錄及翻譯的過程,即生成具有生物學(xué)功能的產(chǎn)物的過程。(p356)當(dāng)前10頁,總共45頁。一、基因、基因組的概念(二)基因組
基因組(genome)是一個生物體內(nèi)所有遺傳信息的總和。
人類基因組包含了細(xì)胞核染色體DNA(常染色體和性染色體)及線粒體DNA所攜帶的所有遺傳物質(zhì)。當(dāng)前11頁,總共45頁。主要內(nèi)容一、基因、基因組的概念二、真核生物基因的結(jié)構(gòu)與功能三、真核生物基因組的結(jié)構(gòu)與功能四、原核生物基因、基因組的結(jié)構(gòu)當(dāng)前12頁,總共45頁。二、真核生物基因的結(jié)構(gòu)與功能(一)真核基因的基本結(jié)構(gòu)真核基因中的DNA序列可以分成兩部分結(jié)構(gòu)編碼序列:基因中經(jīng)轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄加工后生成的mRNA所對應(yīng)的DNA序列。非編碼序列:基因中編碼區(qū)兩側(cè)的調(diào)控序列和編碼序列間的間隔序列所對應(yīng)的DNA序列。 調(diào)控序列又可以分為啟動子、終止子及其他調(diào)控序列。當(dāng)前13頁,總共45頁。真核mRNA基因的結(jié)構(gòu)DNA5'3'基因上游調(diào)控序列下游調(diào)控序列5'3'hnRNA轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄后加工mRNAAAA...AAA5'3'外顯子內(nèi)顯子起始密碼子終止密碼子NC蛋白質(zhì)翻譯啟動子多聚A信號(原核:終止子)當(dāng)前14頁,總共45頁。外顯子、內(nèi)含子、斷裂基因、基因組構(gòu)外顯子(exon)——在基因序列中出現(xiàn),并出現(xiàn)在成熟mRNA分子上的序列。內(nèi)含子(intron)——位于外顯子之間、在mRNA剪接過程中被刪除部分相對應(yīng)的間隔序列。斷裂基因(splitegene)——真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因。當(dāng)前15頁,總共45頁。外顯子、內(nèi)含子、斷裂基因、基因組構(gòu)基因組構(gòu)(geneorganization)——單個基因的組成結(jié)構(gòu)及一個完整的生物體內(nèi)基因的組織排列方式統(tǒng)稱為基因組構(gòu)。血紅蛋白基因家族的基因組構(gòu)圖當(dāng)前16頁,總共45頁。二、真核生物基因的結(jié)構(gòu)與功能(二)基因編碼區(qū)的功能——編碼多肽鏈或特定的RNA分子5′···GCAGTACATGTC···3′3′···cgtcatgtacag···5′5′···GCAGUACAUGUC···3′mRNAN······Ala·Val·His·Val······C蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄翻譯基因(DNA)當(dāng)前17頁,總共45頁。二、真核生物基因的結(jié)構(gòu)與功能(三)調(diào)控序列參與真核基因表達(dá)調(diào)控1.基因表達(dá)的調(diào)控區(qū)(順式作用元件)
位于基因轉(zhuǎn)錄區(qū)前后,對基因表達(dá)起調(diào)控作用的區(qū)域稱為基因表達(dá)的調(diào)控區(qū)。
因其是緊鄰基因轉(zhuǎn)錄區(qū)的DNA序列,又稱旁側(cè)序列(flankingsequence)或稱為順式作用元件(cis-actingelement)。
常見的順式作用元件包括:啟動子、上游調(diào)控元件、增強(qiáng)子、加尾信號、各種細(xì)胞反應(yīng)元件等等。當(dāng)前18頁,總共45頁?;虮磉_(dá)的調(diào)控區(qū)(II類啟動子)轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)TATA盒CAAT盒GC盒增強(qiáng)子AATAAA剪接加尾轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)修飾點(diǎn)外顯子翻譯起始點(diǎn)內(nèi)含子OCT-1OCT-1:ATTTGCAT八聚體+1結(jié)構(gòu)基因啟動子上游啟動子元件當(dāng)前19頁,總共45頁。二、真核生物基因的結(jié)構(gòu)與功能(三)調(diào)控序列參與真核基因表達(dá)調(diào)控1.基因表達(dá)的調(diào)控區(qū)(順式作用元件)2.啟動子
啟動子(promoter)是DNA分子上能夠介導(dǎo)RNA聚合酶結(jié)合并形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合體的序列。多數(shù)啟動子位于真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)的上游,啟動子本身通常不被轉(zhuǎn)錄。少數(shù)啟動子(如編碼tRNA基因的啟動子)位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的下游,這些DNA序列可以被轉(zhuǎn)錄。當(dāng)前20頁,總共45頁。真核生物有三類啟動子
真核生物有三大類RNA聚合酶,分別對應(yīng)有三種不同類型的啟動子。RNA聚合酶IRNA聚合酶IIRNA聚合酶III啟動子I類啟動子II類啟動子III類啟動子轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物rRNA(除5SrRNA)hnRNA(即mRNA的前體)tRNA前體、5SrRNA、snRNA當(dāng)前21頁,總共45頁。真核生物有三類啟動子
真核生物有三大類RNA聚合酶,分別對應(yīng)有三種不同類型的啟動子。當(dāng)前22頁,總共45頁。二、真核生物基因的結(jié)構(gòu)與功能(三)調(diào)控序列參與真核基因表達(dá)調(diào)控1.基因表達(dá)的調(diào)控區(qū)(順式作用元件)2.啟動子3.增強(qiáng)子
增強(qiáng)子(enhancer)是增強(qiáng)真核基因啟動子工作效率的順式作用元件,是真核基因中最重要的調(diào)控序列,決定著每一個基因在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)水平。當(dāng)前23頁,總共45頁。增強(qiáng)子作用的特點(diǎn)能夠在相對于啟動子的任何方向和位置(上游或者下游)上發(fā)揮這種增強(qiáng)作用,大部分位于上游。增強(qiáng)子序列距離所調(diào)控基因距離近者幾十個堿基對,遠(yuǎn)的可達(dá)幾千個堿基對。通常數(shù)個增強(qiáng)子序列形成一簇。有時(shí)增強(qiáng)子序列也可位于內(nèi)含子之中。不同的增強(qiáng)子序列結(jié)合不同的調(diào)節(jié)蛋白。增強(qiáng)子有組織特異性。當(dāng)前24頁,總共45頁。增強(qiáng)子作用示意圖當(dāng)前25頁,總共45頁。二、真核生物基因的結(jié)構(gòu)與功能(三)調(diào)控序列參與真核基因表達(dá)調(diào)控1.基因表達(dá)的調(diào)控區(qū)(順式作用元件)2.啟動子3.增強(qiáng)子4.沉默子
沉默子(silencer)是抑制基因轉(zhuǎn)錄的特定DNA序列,當(dāng)其結(jié)合一些反式作用因子時(shí)對基因的轉(zhuǎn)錄起阻遏作用,使基因沉默。
沉默子作用特點(diǎn)類似增強(qiáng)子。當(dāng)前26頁,總共45頁。二、真核生物基因的結(jié)構(gòu)與功能(三)調(diào)控序列參與真核基因表達(dá)調(diào)控1.基因表達(dá)的調(diào)控區(qū)(順式作用元件)2.啟動子3.增強(qiáng)子4.沉默子5.其他一些調(diào)控序列絕緣子(insulator)——位于增強(qiáng)子或沉默子與基因之間抑制增強(qiáng)子或沉默子的作用細(xì)胞反應(yīng)元件(應(yīng)答元件)當(dāng)前27頁,總共45頁。應(yīng)答元件(responseelements)
在真核生物細(xì)胞處于某一特定環(huán)境時(shí),在基因上游有一些DNA序列能和專一性蛋白質(zhì)因子結(jié)合,從而控制基因特異表達(dá),這些DNA序列稱為應(yīng)答元件。如:結(jié)合于反應(yīng)元件的特殊轉(zhuǎn)錄因子調(diào)節(jié)劑組件保守順序DNA長度因子大小(kDa)熱休克HSECNNGAANNTCCNNG27bpHSTF93糖皮質(zhì)激素GRETGGTACAAATGTTCT20bp受體94弗波酯TREGACTCA22bpAP139血清SRECCATATTAGG20bpSRF52當(dāng)前28頁,總共45頁。總結(jié):真核mRNA基因的結(jié)構(gòu)當(dāng)前29頁,總共45頁。主要內(nèi)容一、基因、基因組的概念二、真核生物基因的結(jié)構(gòu)與功能三、真核生物基因組的結(jié)構(gòu)與功能四、原核生物基因、基因組的結(jié)構(gòu)當(dāng)前30頁,總共45頁。三、真核生物基因組的結(jié)構(gòu)與功能(一)真核基因組的結(jié)構(gòu)與特點(diǎn)人類基因組細(xì)胞核基因組2800Mb線粒體基因組16.6kb約25%約75%編碼蛋白質(zhì)基因序列基因外序列2個rRNA基因22個tRNA基因13個蛋白編碼基因外顯子內(nèi)含子基因間序列中度至高度重復(fù)序列約1%約24%當(dāng)前31頁,總共45頁。三、真核生物基因組的結(jié)構(gòu)與功能(一)真核基因組的結(jié)構(gòu)與特點(diǎn)基因的編碼序列所占比例遠(yuǎn)小于非編碼序列高等真核生物基因組含有大量的重復(fù)序列真核基因組中存在多基因家族和假基因大多基因具有可變剪接,80%的可變剪接會使蛋白質(zhì)的序列發(fā)生改變基因組DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合形成染色體,儲存于細(xì)胞核內(nèi)除配子細(xì)胞外,體細(xì)胞的基因組為二倍體當(dāng)前32頁,總共45頁。三、真核生物基因組的結(jié)構(gòu)與功能(二)重復(fù)序列重復(fù)序列低度重復(fù)序列(單拷貝序列)中度重復(fù)序列高度重復(fù)序列反向重復(fù)序列衛(wèi)星DNA短分散重復(fù)片段(SINES)長分散重復(fù)片段(LINES)當(dāng)前33頁,總共45頁。反向重復(fù)序列軸向?qū)ΨQ鏡像對稱當(dāng)前34頁,總共45頁。經(jīng)CsCl密度梯度離心后的小鼠DNA當(dāng)前35頁,總共45頁。rRNA基因的重復(fù)序列屬于中度重復(fù)序列各重復(fù)單位中的rRNA基因都是相同的。rRNA基因集中成簇存在,這樣的區(qū)域稱為rDNA區(qū)。人類的rRNA基因位于13、14、15、21和22號染色體的核仁組織區(qū),每個核仁組織區(qū)平均含有50個rRNA基因的重復(fù)單位。5SrRNA基因似乎全部位于1號染色體,每個單倍體基因組約有1000個5SrRNA基因。DNA內(nèi)含子內(nèi)含子28S5.8S18SrDNA當(dāng)前36頁,總共45頁。三、真核生物基因組的結(jié)構(gòu)與功能(二)重復(fù)序列重復(fù)序列的功能參與復(fù)制水平的調(diào)節(jié):存在于DNA復(fù)制起點(diǎn)區(qū)的附近,是一些蛋白質(zhì)(包括酶)的結(jié)合位點(diǎn)。參與基因表達(dá)的調(diào)控:可以轉(zhuǎn)錄到核內(nèi)不均一RNA分子中,有些反向重復(fù)序列可以形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),有助于穩(wěn)定RNA分子。參與染色體配對:如衛(wèi)星DNA成簇樣分布在染色體著絲粒附近,可能與染色體減數(shù)分裂時(shí)染色體配對有關(guān)。當(dāng)前37頁,總共45頁。三、真核生物基因組的結(jié)構(gòu)與功能(三)多基因家族與假基因1.多基因家族(multigenefamily)
多基因家族是指由某一祖先基因經(jīng)過重復(fù)和變異所產(chǎn)生的一組在結(jié)構(gòu)上相似、功能相關(guān)的基因。
如血紅蛋白多基因家族。當(dāng)前38頁,總共45頁。血紅蛋白基因?qū)儆诙嗷蚣易濡伶湥?6號染色體)β鏈(11號染色體)珠蛋白基因的順序表達(dá)GA1
21
21當(dāng)前39頁,總共45頁。三、真核生物基因組的結(jié)構(gòu)與功能(三)多基因家族與假基因1.多基因家族(multigene
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