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文檔簡介
基因組dna提取的學(xué)習(xí)課件第1頁/共11頁預(yù)備知識核酸是重要的生物大分子之一,脫氧核糖核酸(DNA)是核酸的一種,DNA是絕大多數(shù)生物(除少數(shù)RNA病毒外)記錄、存儲、傳遞遺傳信息的分子。近年來,分子生物學(xué)技術(shù)迅速發(fā)展,在分子遺傳學(xué)研究領(lǐng)域的諸多方面涉及到抽提基因組DNA的方法。DNA的提取是進(jìn)行PCR擴(kuò)增、Southern雜交、限制性片段長度多態(tài)性分析等實驗的基礎(chǔ)。第2頁/共11頁二、實驗原理
使用消化緩沖液使DNA從細(xì)胞內(nèi)釋放出來,65度溫育可以加速DNA溶解,酚——氯仿異戊醇抽提可以將蛋白質(zhì)與DNA分離,冷的異丙醇沉淀DNA,70%的乙醇洗去DNA表面的殘留有機(jī)溶劑。第3頁/共11頁三實驗材料新鮮存活的果蠅或-20℃凍存的果蠅5~10個。
四實驗儀器及用具玻璃棒、燒杯、離心管、量筒、分析天平、水浴鍋、臺式高速離心機(jī)、4℃冰箱、長玻璃吸管、微量加樣器、槍頭、紫外分析儀、瓊脂糖電泳裝置。第4頁/共11頁五、藥品和試劑酚(Tris飽和酚)、氯仿、異戊醇、十二烷基硫酸鈉(SDS)、Tris堿、乙二胺四乙酸(EDTA)、異丙醇。溶液配制:消化緩沖液:含100mM的Nacl,10mMTris.cl(PH8.0),25mM的EDTA(PH8.0),0.5%的SDS。TE緩沖液(PH8.0):含10mMTris.cl(PH8.0),1mM的EDTA(PH8.0)。電泳緩沖液TAE(50×TAE):取Tris24.2g,冰醋酸5.7ml,0.25mol/LEDTA(pH8.0)20ml,加蒸餾水至100ml。1×TAE為配制瓊脂糖凝膠及其電泳的應(yīng)用緩沖液。0.8%瓊脂糖凝膠的配制:稱取0.32g瓊脂糖,加入40ml1×TAE,于電爐上加熱至沸騰,待凝膠冷卻至50℃左右(手試微燙),加入3μlGoldViewTW熒光染料,混勻后將膠倒入插好梳子的制膠板上,冷卻后備用。第5頁/共11頁六、實驗步驟
1)取6只麻醉的果蠅(讓乙醚揮發(fā)干凈)放入1.5ml離心管中,加入消化緩沖液30μl,用200μlTip槍頭迅速搗碎。
2)補(bǔ)加消化緩沖液400μl,混勻,置65℃溫浴30分鐘每10分鐘搖蕩一次,以使樣品被充分消化。
3)取出離心管加入400μl酚:氯仿:異戊醇(25:24:1)的混合物,蓋緊管蓋,上下顛倒充分混勻,抽提樣品5min,12000rpm離心5分鐘。
4)小心吸取上清轉(zhuǎn)移至新的離心管中。加入400μl異丙醇,輕輕混勻3min,此時可見白色線團(tuán)狀物質(zhì)出現(xiàn)。第6頁/共11頁5)14000rpm離心10分鐘,讓線團(tuán)狀物質(zhì)沉到管底或管壁,小心倒出液體。6)用400μl70%的乙醇洗滌沉淀,12000rpm離心5min,倒掉乙醇,倒置晾干至乙醇味道消失,沉淀用50μlTE緩沖液溶解。7)取5-8μlDNA溶液,與2μl上樣buffer混合,然后上樣于0.7%的瓊脂糖凝膠上,120伏電壓下電泳30min。8)將瓊脂糖凝膠置于紫外分析儀中觀察DNA條帶的綠色熒光。第7頁/共11頁注意事項:A
實驗前將部分藥品(酚、氯仿、異戊醇、異丙醇)4℃預(yù)冷。
B
消化液要預(yù)熱,以抑制DNase,加速蛋白變性,促進(jìn)
DNA溶解
C
避免在操作過程中機(jī)械振動過于劇烈,以免造成DNA的斷裂。D
使用離心機(jī)要注意安全,先定時,再將轉(zhuǎn)速從零慢慢增大。E
乙醇洗滌DNA后一定要晾干,否則電泳點樣時樣品容易上漂。第8頁/共11頁基因組DNA的提取圖片第9頁/共11頁實驗報告要求:1
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