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第五章遺傳信息的表達(dá)第一頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日1中心法則:prDNARNA轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄翻譯

第一節(jié)轉(zhuǎn)錄(transcription)以DNA為模板合成RNA的過(guò)程第二頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日2第三頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日3(4)模板:復(fù)制:兩條全部DNA分子;轉(zhuǎn)錄:一條DNA分子的部分與復(fù)制的相同之處:(1)都以DNA為模板.(2)都以nt為原料,合成方向都是5'3'.(3)都服從堿基配對(duì)原則不同之處:(1)四種原料不同:DNAdNTP,RNANTP(2)配對(duì)堿基不同:A=T;A=U(3)酶不同: DNA聚合酶;RNA聚合酶第四頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日4一、原核生物RNA的生物合成(一)RNA聚合酶(RNApolymerase):1種RNA合成的錯(cuò)誤率為10-6(DNA合成的錯(cuò)誤率為10-9-10-10)大腸桿菌中:全酶為:五聚體(2'):

:識(shí)別結(jié)合啟動(dòng)子

2:?jiǎn)?dòng)子上游

:催化形成二酯鍵

':酶與模板的結(jié)合部位需Mg2+,Mn2+,無(wú)校對(duì)功能第五頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日5(二)轉(zhuǎn)錄模板基因1:鏈2:轉(zhuǎn)錄模板鏈(templatestrand)or反意義鏈(antisensestrand)鏈1:信息鏈or有意義鏈(sensestrand)or編碼鏈(codingstrand)基因2:鏈1:轉(zhuǎn)錄模板鏈(templatestrand)or反意義鏈(antisensestrand)鏈2為信息鏈or有意義鏈(sensestrand)or編碼鏈(codingstrand)第六頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日6(三)轉(zhuǎn)錄過(guò)程

1、起始階段:不需要引物,全酶中識(shí)別并結(jié)合啟動(dòng)子DNA構(gòu)象發(fā)生變化RNA聚合酶催化兩個(gè)相鄰的nt與模板配對(duì)第一個(gè)nt為5'pppGorpppA,第二個(gè)nt有游離3'-OH繼續(xù)加入NTP,延長(zhǎng)幾個(gè)nt之后因子脫落全酶-DNA-pppGpN'-OH稱(chēng)為起始復(fù)合物第七頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日72、延長(zhǎng)階段:核心酶(coreenzyme)沿模板3'5'滑行,RNA按5'3'方向合成>12nt,RNA5'端與DNA模板脫離mRNA:45nt/sec,rRNA:90nt/sec3、.終止階段兩種方式:因子不依賴(lài)終止

因子依賴(lài)終止第八頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日8RNA酶行進(jìn)到模板的終止子部位(富含GC,可在RNA上形成發(fā)夾結(jié)構(gòu))發(fā)夾結(jié)構(gòu)影響RNA酶的行進(jìn)RNA鏈先從DNA上釋放,再與核心酶分離終止轉(zhuǎn)錄(1)因子不依賴(lài)終止圖5-1第九頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日9

因子與RNA聚合酶結(jié)合(終止子)使RNA-DNA雜交體解開(kāi)因子、RNA聚合酶與DNA分離轉(zhuǎn)錄終止(2)因子依賴(lài)終止圖5-2第十頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日10第十一頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日11(四)、轉(zhuǎn)錄后加工初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(primarytranscrips):一個(gè)操縱子轉(zhuǎn)錄出的一條完整RNA。mRNA:不需要加工rRNA:需加工、修飾tRNA:需加工、修飾6個(gè)基因:3個(gè)tRNA16srRNA23srRNA稱(chēng)為30sRNA5srRNA間隔序列如大腸桿菌rrnD操縱子(rRNA、tRNA混排)圖5-3第十二頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日12第十三頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日1330sRNA核酸內(nèi)切酶(RNaseP)16s、23s、5srRNA前體+tRNA前體

(內(nèi)、外切酶)(1)剪切作用:多余序列切除原間隔序列(2)添加和修復(fù)3‘端CCA序列(3)某些堿基的化學(xué)修飾

成熟16s、23s、5srRNA成熟tRNA第十四頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日14二、真核生物RNA的生物合成(一)RNA聚合酶pol1:核仁:5.8S、18S、28SrRNApol2:核漿:mRNApol3:核漿:tRNA(二)轉(zhuǎn)錄單位:為一個(gè)基因(一個(gè)結(jié)構(gòu)基因加相應(yīng)調(diào)控元件)三、轉(zhuǎn)錄過(guò)程:第十五頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日151.起始階段:需一些蛋白質(zhì)參與,稱(chēng)轉(zhuǎn)錄因子(transcrptionfactor,TF)(1)mRNA前體的轉(zhuǎn)錄圖5-4:pol2TF2D(含一個(gè)TATAbox結(jié)合蛋白(TBP)和多個(gè)TBP結(jié)合因子(TAF))+TATAboxTF2A,TF2B結(jié)合TF2DTF2F+pol2結(jié)合TF2BTF2E、TF2H加入,形成起始復(fù)合物第十六頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日16第十七頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日17人基因:核心啟動(dòng)子+上游調(diào)控元件(UCE)轉(zhuǎn)錄因子:上游結(jié)合因子(UBF1)、選擇因子1(selectivityfactor1,SL1)(含一個(gè)TBP和3個(gè)TBP結(jié)合因子)(2)rRNA前體的轉(zhuǎn)錄:pol1UBF1與核心啟動(dòng)子和UCE結(jié)合SL1與UBF1結(jié)合pol1與SL1中的TBP結(jié)合起始轉(zhuǎn)錄第十八頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日18第十九頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日19基因:Abox、BboxTF3C結(jié)合與BboxTF3B結(jié)合與啟動(dòng)子pol3進(jìn)入(3)tRNA、5SrRNA:pol3第二十頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日203、終止階段:機(jī)制不清2、延長(zhǎng)階段:與原核生物相似,方向5'3'第二十一頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日217mG:5'-5'磷酸二酯鍵(正常:3'-5'磷酸二酯鍵)(四)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的加工5'端加帽子1.mRNA前體的加工:3'端加尾巴(polyA)去除內(nèi)含子拼接外顯子(1)5'端加帽子(capping)圖5-51型帽子結(jié)構(gòu):m7G-nt1(2'-OH被甲基化)2型帽子結(jié)構(gòu):m7G-nt1(2'-OH被甲基化)-nt2(2’-OH被甲基化)兩種:第二十二頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日22(2)3'端加尾巴(polyAtail)圖5-6mRNA中AAUAAA序列被核酸內(nèi)切酶識(shí)別并在其下游11nt-30nt處切斷,在polyA聚合酶作用下加入polyA.第二十三頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日23(3)去除內(nèi)含子拼接外顯子(splicing):圖5-7剪接反應(yīng):在剪接體(spliceosome)中進(jìn)行(兩步)SnRNA:U1,U2,U3…..U6蛋白質(zhì)內(nèi)含子的結(jié)構(gòu):5'GU------------------A-------AG3'(5'剪切位點(diǎn))(分支點(diǎn))(3'剪切位點(diǎn))第二步:5'外顯子攻擊3'剪接位點(diǎn),兩個(gè)外顯子拼接,同時(shí)釋放套索狀中間產(chǎn)物.第一步:分支點(diǎn)A攻擊5'側(cè)剪接位點(diǎn)G,釋放5'外顯子.第二十四頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日24mRNA內(nèi)含子的自我剪接第二十五頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日25特點(diǎn):內(nèi)含子自我剪接/核酶產(chǎn)物:套索結(jié)構(gòu)(4)化學(xué)修飾:主要是甲基化修飾(5)RNA的編輯(RNAediting)隱蔽基因(cryptogene)產(chǎn)物如線粒體細(xì)胞色素氧化酶C亞基mRNA:在145個(gè)不同位點(diǎn)插入407個(gè)U,在9個(gè)不同位點(diǎn)刪除19個(gè)U,編輯nt占成熟mRNA的一半以上。第二十六頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日26(2)tRNA前體的加工A:tRNA前體的剪接:去除內(nèi)含子和5'側(cè)先導(dǎo)序列。B:添加或修復(fù)3'端CCA序列。C:化學(xué)修飾:形成稀有堿基。(3)rRNA前體的加工:A:rRNA前體的剪接;B:化學(xué)修飾第二十七頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日27第三節(jié)翻譯一、原核生物蛋白質(zhì)的生物合成(一)蛋白質(zhì)生物合成體系1、mRNA:(1)密碼子(codon):每三個(gè)相鄰的nt決定一個(gè)氨基酸。(2)開(kāi)放閱讀框(openreadingframe,ORF):從起始密碼子到終止密碼子。第二十八頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日28(3)遺傳密碼:64個(gè)密碼子的統(tǒng)稱(chēng)。密碼子表(P78)

(1)起始密碼子:AUG-met;(2)終止密碼子:UAG,UAA,UGA(3)讀寫(xiě)方向:5'3';(4)連續(xù)性;(5)兼并性:幾個(gè)密碼子決定同一個(gè)氨基酸;(6)通用性;特點(diǎn):(7)擺動(dòng)性(wobble):密碼子的第三位與反密碼子的第一位堿基的配對(duì)不十分嚴(yán)格。第二十九頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日29第一位(5端)堿基第二位(中間)堿基第三位(3端)堿基

A

G

U

C

AAAA賴(lài)氨酸AAG賴(lài)氨酸

AAU天冬酰胺AAC天冬酰胺AGA精氨酸AGG精氨酸

AGU絲氨酸AGC絲氨酸AUA異亮氨酸AUG甲硫氨酸+起始信號(hào)AUU異亮氨酸AUC異亮氨酸ACA蘇氨酸ACG蘇氨酸

ACU蘇氨酸ACC蘇氨酸AG

UC

GGAA谷氨酸GAG谷氨酸GAU天冬氨酸GAC天冬氨酸GGA甘氨酸GGG甘氨酸GGU甘氨酸GGC甘氨酸GUA纈氨酸GUG纈氨酸GUU纈氨酸GUC纈氨酸GCA丙氨酸GCG丙氨酸GCU丙氨酸GCC丙氨酸AGUC

UUAA終止信號(hào)UAG終止信號(hào)UAU酪氨酸UAC酪氨酸UGA終止信號(hào)UGG色氨酸UGU半胱氨酸UGC半胱氨酸UUA亮氨酸UUG亮氨酸UUU苯丙氨酸UUC苯丙氨酸UCA絲氨酸UCG絲氨酸UCU絲氨酸UCC絲氨酸AGUC

CCAA谷氨酰胺CAG谷氨酰胺CAU組氨酸CAC組氨酸CGA精氨酸CGG精氨酸CGU精氨酸CGC精氨酸CUA亮氨酸CUG亮氨酸CUU亮氨酸CUC亮氨酸CCA脯氨酸CCG脯氨酸CCU脯氨酸CCC脯氨酸AGUC第三十頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日30主要活性部位:A位(受位acceptorsite):氨酰tRNA(tRNA-a.a)進(jìn)入的部位.P位(供位donorsite,peptidesite):肽酰tRNA(tRNA-a.a-a.a-a.a-a.a…a.a)占據(jù)的部位.2.核糖體(ribosome):rRNA+prs:是蛋白質(zhì)合成的場(chǎng)所3.tRNA:氨基酸的運(yùn)輸工具,細(xì)菌中約30種-40種。4.各種蛋白質(zhì):起始因子:IF:IF-1;IF-2;IF-3。延伸因子:EF:EF-Tu;EF-Ts;EF-G。終止因子:RF:RF-1;RF-2;RF-3。第三十一頁(yè),共三十七頁(yè),2022年,8月28日315.氨基酰-tRNA合成酶:催化氨基酸與tRNA結(jié)合形成tRNA-a.a,具有特異性.1.起始階段:IF-3+30SmRNAfmet-tRNAfmet-IF-2-GTP(IF-1促進(jìn)該三元復(fù)合物形

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