醫(yī)學文獻檢索與利用a 第2講pubmed檢索-交大醫(yī)2014版新教材

第二講

文摘型生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫信息資源中心醫(yī)學文獻檢索教研室1精選課件主講內(nèi)容MEDLINE&PubMed檢索系統(tǒng)SinoMed中國生物醫(yī)學文獻服務系統(tǒng)EM&EMB荷蘭醫(yī)學文摘BA&BIOSISPreviews美國生物學文摘

(基于OVID/ISIWebofKnowledge系統(tǒng)平臺)CA&SciFinderScholar美國化學文摘CINAHL美國護理學數(shù)據(jù)庫2精選課件數(shù)據(jù)庫檢索

AP153精選課件一、PubMed數(shù)據(jù)庫簡介PubMed是美國國家醫(yī)學圖書館(NLM)下屬的國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)的、基于WWW的醫(yī)學數(shù)據(jù)庫查詢系統(tǒng)。網(wǎng)址：http://www.

/pubmed4精選課件PUBMED免費5000種左右來源期刊,其中英文期刊約占85%2000萬余條高質(zhì)量的文獻題錄/摘要每日完成來自全球的檢索>200萬次醫(yī)學\護理\牙科\獸醫(yī)\保健\臨床前生命科學的期刊全文鏈接超過3000+種數(shù)據(jù)更新迅速:每日更新（星期二—星期六）特點：收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備，可部分獲取原文。5精選課件二、通過PubMed可檢索如下信息

oldMedlineMEDLINEPreMedline

出版商提供的書目信息

NCBI其它數(shù)據(jù)庫的相關(guān)記錄6精選課件oldMedline1950-1965年間發(fā)表的200多萬篇文獻沒有MeSH字段和摘要記錄中用[PubMed-OLDMEDLINEforPre1966]標記表示。7精選課件MEDLINE

是美國國立醫(yī)學圖書館MEDLARS系統(tǒng)中最大的生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫，收錄1966年以來70多個國家4000種左右生物醫(yī)學期刊的書目信息和著者文摘，每周更新。每條記錄均帶有[PubMed--IndexedforMEDLINE]標志。8精選課件收集未正式給予MeSH詞、出版類型等深度標引信息的一個臨時庫。NLM每天把最新記錄加入到PreMedline庫中，每條記錄均帶有[PubMed--inProcess]標志。工作人員在一周內(nèi)將這些記錄標引，然后轉(zhuǎn)入MEDLINE，同時從PreMedline中刪去。PreMedline9精選課件Pre-MedlineMedlineNewDataCollectPubMedProcess10精選課件出版商提供的書目信息出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分沒有被MEDLINE收錄，PubMed仍保存，在記錄中做如下標記：[PubMed--assuppliedbypublisher]

。11精選課件PubMed建立了與NCBI其他數(shù)據(jù)庫之間聯(lián)系。它們是雙向網(wǎng)絡互連的關(guān)系（見下頁圖）。NCBI其它數(shù)據(jù)庫的相關(guān)記錄12精選課件13精選課件Affiliation[AD]ArticleIdentifier[AID]AllFields[ALL]Author[AU]Book[book]CommentCorrectionsCorporateAuthor[CN]CreateDate[CRDT]CompletionDate[DCOM]EC/RNNumber[RN]Editor[ED]EntrezDate[EDAT]Filter[FILTER]FirstAuthorName[1AU]FullAuthorName[FAU]FullInvestigatorName[FIR]GrantNumber[GR]Investigator[IR]ISBN[ISBN]Issue[IP]Journal[TA]Language[LA]LastAuthor[LASTAU]LocationID[LID]MeSHDate[MHDA]MeSHMajorTopic[MAJR]MeSHSubheadings[SH]MeSHTerms[MH]ModificationDate[LR]NLMUniqueID[JID]OtherTerm[OT]OwnerPagination[PG]PersonalNameasSubject[PS]PharamcologicalAction[PA]PlaceofPublication[PL]PMID[PMID]Publisher[PUBN]PublicationDate[DP]PublicationType[PT]SecondarySourceID[SI]Subset[SB]SupplementaryConcept[NM]TextWords[TW]Title[TI]Title/Abstract[TIAB]TransliteratedTitle[TT]UID[PMID]Volume[VI]三、PubMed記錄字段說明精選課件四、PubMed基本檢索自由詞檢索組合檢索字段限制檢索著者檢索刊名檢索日期或日期范圍檢索

……截詞檢索強制檢索15精選課件PubMed基本檢索

在檢索框中鍵入一個或多個英文單詞（大寫或小寫均可），點擊檢索按鈕，PubMed系統(tǒng)會自動在主題詞表，期刊名表，短語表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動詞匯匹配功能”。自由詞檢索16精選課件PubMed對輸入檢索框中的檢索詞進行智能化地校對，將其逐步地與其數(shù)據(jù)庫中的各類術(shù)語匹配的原則。MeSHTranslationTable主題詞注釋表JournalsTranslationTable期刊注釋表CommonPhraseList常用詞組表AuthorIndex作者索引表NoMapping檢索詞拆分AND自動詞匯匹配17精選課件備注：

如果在上述4個表或索引中仍找不到相匹配的詞時，PubMed就將短語劈開，再重復以上順序單獨分別查找，直到找到相匹配的詞。如果仍找不到匹配詞，則用AND將短語中的單個詞連接起來在全部字段中查找。例：檢索h1n1influenza轉(zhuǎn)換為:

h1n1[AllFields]AND("influenza,human"[MeSHTerms]OR("influenza"[AllFields]AND"human"[AllFields])OR"humaninfluenza"[AllFields]OR"influenza"[AllFields])18精選課件PubMed主頁:h1n1influenza19精選課件結(jié)果篩選檢索表達式結(jié)果處理結(jié)果顯示20精選課件21精選課件Medline顯示格式22精選課件PubMed基本檢索組合檢索，常用的邏輯關(guān)系詞有AND,OR,NOT等。ABAB

邏輯與（AND）--檢出記錄中同時含有檢索詞A和檢索詞B.

如：AANDB

邏輯非（NOT）--在含檢索詞A的記錄中，去掉含檢索詞B的記錄。如：ANOTB

邏輯或（OR）--檢出記錄中含有檢索詞A或檢索詞B或同時含有檢索詞A和B的文獻。如：AORBAB23精選課件PubMed基本檢索

采用字段限制方式進行檢索，檢索規(guī)則：檢索詞[字段標識]或“檢索詞組”[字段標識]字段限制檢索24精選課件例：查找作者為crick在1993年發(fā)表有關(guān)DNA方面的文獻.

檢索式：DNA[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]25精選課件PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標識(1)Title[ti]：篇名字段Abstract[ab]：摘要字段Affiliation[ad]：著者地址字段。Authorname[au]：文章的作者，檢索格式：姓+名。如："smithja"[au]Journaltitle[ta]：期刊名稱。如：cell[ta]Language[la]：論文出版語種。語種檢索時可只輸入前3個字母，如：chi[la]=chinese[la]；English[lang]=eng[la]比如：檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻檢索式:hypertension[ti]ANDchi[la]26精選課件例：檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻檢索式：hypertension[ti]ANDchi[la]27精選課件PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標識(2)Publicationdate[dp]:出版日期指論文所在期刊的出版日期日期檢索的形式為：YYYY/MM/DD[DP]要檢索一段時期內(nèi)的文章，日期之間可以加冒號，如：1993/01:1995/06[DP]Publicationtype[pt]:出版類型。有綜述，新聞，傳記，臨床試驗等。如：review[pt]MeSHterms[mh]：主題詞字段。如：hypertension[mh]Subheadings[sh]:副主題詞。與主題詞組配檢索.28精選課件PubMed基本檢索

按照姓氏+空格+名首字母縮寫（不用標點）的格式鍵入作者姓名，如：smithja或jonesk,系統(tǒng)會自動在作者字段內(nèi)進行檢索。姓名第一個字母可用大寫也可用小寫，姓前名后,姓用全稱，名字一般用縮寫?？紤]到作者姓名的不同形式，PubMed采用自動轉(zhuǎn)換功能進行作者姓名檢索，如：smithj將檢索成smithja,smithjb,smithjr等。精確檢索：可以用雙引號將作者名引起來，再加作者字段限定[AU]，如："smithj"[au]，這樣可避免PubMed自動轉(zhuǎn)換，實現(xiàn)精確查找。作者姓名檢索29精選課件PubMed基本檢索作者姓名檢索按照姓(全寫)+名(縮寫)，之間不用標點鍵入作者姓名smithj30精選課件PubMed基本檢索精確檢索避免PubMed自動詞匯轉(zhuǎn)換，實現(xiàn)精確查找"smithj"[au]31精選課件PubMed基本檢索在檢索框中鍵入期刊名，如：Europeanjournalofimmunology，系統(tǒng)的“自動詞語匹配”功能會將它轉(zhuǎn)換成“EurJImmunol[journal]”進行檢索。也可直接輸入Medline的期刊標準縮寫形式EurJImmunol，或輸入該刊的ISSN號（國際標準連續(xù)出版物代碼）檢索，即：1521-4141。如果一個雜志名恰好是主題詞或關(guān)鍵詞，如：cancer，science，cell等，PubMed會首先將這些詞轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中的主題詞進行檢索。因此，需要將檢索請求進行標準化處理，即

：“cell”[journal]或“cell”[ta]。期刊檢索32精選課件PubMed基本檢索期刊的一般檢索，是在檢索輸入框中鍵入期刊名或期刊的ISSN號EurJImmunol33精選課件PubMed基本檢索

截詞檢索的作用：擴大檢索范圍，提高查全率。截詞符：

*

----代表零到多個字符，只可用于詞尾。如：bacter*，可以檢出bacter，bacteria，bacteriophage，bacterium等單詞。截詞檢索34精選課件PubMed基本檢索截詞檢索可以擴大檢索范圍提高查全率。bacter*[TI]35精選課件PubMed基本檢索PubMed允許使用雙引號來強制系統(tǒng)進行短語檢索。如：在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“singlecell”，并用雙引號引起來。點擊“GO”按鈕，系統(tǒng)會將其作為一個不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫的全部字段中進行檢索。如果不使用雙引號進行強制檢索，系統(tǒng)就會將其分成2個詞：single和cell檢索，其檢索表達式為：singleANDcell.很明顯這樣的檢索結(jié)果是不符號要求的。強制檢索36精選課件PubMed基本檢索強制檢索普通檢索"singlecell"singlecell37精選課件MeSHDatabase五、MeSH檢索例：請檢索有關(guān)中草藥治療胃癌方面的文獻。38精選課件通過Herbal,plantdrugs,Chinesedrugs,Chineseplant,Chineseherbal等均可檢索到中草藥的MESH詞。39精選課件("Drugs,ChineseHerbal/therapeuticuse"[Mes