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文檔簡介
基因與基因組突變第1頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四一基因的組織結(jié)構(gòu)(一)基因的概念1.基因的研究簡史孟德爾(Mendel)的顆粒因子:
一個因子決定一個性狀(1865年)。約翰森(Johannsen):首先提出基因一詞(1909年)摩爾根(Morgan)的基因論:
一個基因控制一個性狀(1926年),明確了基因存在于染色體上。2第2頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四Beadle-Tatum:一個基因一個酶學(xué)說(1941年)。Avery等:轉(zhuǎn)化實驗證實了遺傳物質(zhì)的本質(zhì)是DNA(1944年)。Hershey-Chase:噬菌體感染細(xì)菌實驗,
只有DNA能進(jìn)入細(xì)菌細(xì)胞(1952年)。Benzer:互補(bǔ)測驗,
提出一個順反子,一條多肽鏈的概念(1955年)。3第3頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四Watson和Crick:DNA右手雙螺旋理論(1953年)。
Crick:中心法則(1957年)。Jacob-Monod:操縱子模型(1961年)。Nirenberg-Matthaei:三聯(lián)密碼子學(xué)說(1966年)
將DNA結(jié)構(gòu)與生物功能結(jié)合起來。McClintocK:遺傳因子可以轉(zhuǎn)移位置(1950)。Sharp:真核生物基因中的斷裂現(xiàn)象(1977年)。
Sanger:
噬菌體中發(fā)現(xiàn)了重疊基因(1978,ΦX174).
4第4頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四2.基因gene:含有特定遺傳信息的核苷酸序列,是遺傳物質(zhì)的最小功能單位。合成有功能的蛋白質(zhì)多肽鏈或RNA所必需的全部核酸序列。編碼序列+調(diào)控序列(啟動子、終止子;5′非翻譯序列、內(nèi)含子以及3′非翻譯序列等)。3.基因組genome一個細(xì)胞或者生物體所攜帶的一套完整的單倍體序列,包括全套基因和間隔序列。5第5頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四(二)基因的組織結(jié)構(gòu)6第6頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四(三)基因的功能分析1互補(bǔ)測驗(Benzer,1955)互補(bǔ)測驗(complementationtest)
互補(bǔ)測驗是確定突變的功能關(guān)系的一種常用方法。
用不同的rⅡ突變型成對組合同時去感染大腸桿菌K(λ)菌株。
如果被雙重感染的細(xì)菌中產(chǎn)生兩種親代基因型的子代噬菌體外,也有少量重組型的噬菌體,那么就必然是一個突變型補(bǔ)償了另一個突變型所不具有的功能,這兩個突變型就稱為彼此互補(bǔ)。如果雙重感染的細(xì)菌不產(chǎn)生子代噬菌體,那么這兩種突變型一定有一個相同功能受到損傷。7第7頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四
類型不同大腸桿菌菌斑平板上表型E.coliBE.coliK()
E.coliS野生型小噬菌斑小噬菌斑小噬菌斑rI大噬菌斑大噬菌斑大噬菌斑rⅡ
大噬菌斑無噬菌斑(致死)小噬菌斑rⅢ小噬菌斑大噬菌斑大噬菌斑T4突變型8第8頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四9第9頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四10第10頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四反式排列:用于互補(bǔ)測驗中所用的兩個突變
分別位于兩條染色體上順式排列:用于互補(bǔ)測驗中所用的兩個突變
同時位于一條染色體上順反子:通過順反測驗將不同突變之間沒有互補(bǔ)
的功能區(qū)稱為一個順反子。順反子就是一個功能水平上的基因。11第11頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四順反位置效應(yīng)測驗12第12頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四2互補(bǔ)測驗的方法斑點(diǎn)測試法(spottest):
用一種rⅡ突變型以0.1的感染比(噬菌體1/細(xì)菌10)去感染大腸桿菌K(λ)菌株。噬菌體和細(xì)菌在溫?zé)岬沫傊谢旌希坎荚跔I養(yǎng)平板上,瓊脂凝固后,在平板上所劃出的一定位置上再加一滴含有另一種rⅡ突變型的培養(yǎng)基,在這一滴培養(yǎng)基的范圍內(nèi),一些細(xì)菌就會被兩種噬菌體所感染。如在這范圍內(nèi)形成噬菌斑,就證明這兩種突變型互補(bǔ),相反就不能互補(bǔ)。在一個培養(yǎng)皿平板上可做6~8個斑點(diǎn)試驗。13第13頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四3互補(bǔ)測驗的條件
兩個突變引入同一細(xì)胞內(nèi):
大腸桿菌:性導(dǎo),轉(zhuǎn)導(dǎo)(局限性轉(zhuǎn)導(dǎo),流產(chǎn)轉(zhuǎn)導(dǎo)),轉(zhuǎn)化真菌:準(zhǔn)性生殖中的雜合二倍體
排除重組的影響:recA
排除基因內(nèi)互補(bǔ):基因工程中l(wèi)acZα-互補(bǔ)
排除回復(fù)突變的影響
排除其它影響,如極性突變,lacIs14第14頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四15第15頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四4基因內(nèi)互補(bǔ):lacZβ-半乳糖苷酶
X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷):藍(lán)色5-溴-4-靛藍(lán)
麥康凱培養(yǎng)基:MacConkeyAgar紅色伊紅美蘭培養(yǎng)基:eosin-methylenebluemedium,EMB紫黑色帶金屬光澤伊紅為酸性染料,美藍(lán)為堿性染料。當(dāng)大腸桿菌分解乳糖產(chǎn)酸時細(xì)菌帶正電荷被染成紅色,再與美藍(lán)結(jié)合形成紫黑色菌落,并帶有綠色金屬光澤。X-galMacConkeyEMB16第16頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四α-互補(bǔ):
載體上含有l(wèi)acZ’的部分基因
lacZ’中包括:一段β-半乳糖苷酶的啟動子;編碼α肽鏈的區(qū)段;一個多克隆位點(diǎn)(MCS)。MCS位于編碼α肽鏈的區(qū)段中,是外源DNA的選擇性插入位點(diǎn),但其本身不影響載體編碼α肽鏈的功能活性。
質(zhì)粒載體常用的篩選標(biāo)記:
受體菌含有特定的lacZ缺失
DH5a菌株:F-,φ80d
lacZΔM15,Δ(lacZYA-argF)U169,deoR,recA1,endA1,dR17(rk-,mk),phoA,supE44,λ-,thi-1,gyrA96,relA1JM109菌株:F-,recA1,endA1,gyrA96,thi-1,hsdR17,supE44,relA1,Δlac-proAB)/F’[traD36,proAB,lacIq,lacZΔM15]
17第17頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四基因功能研究的方法
互補(bǔ)測驗一般用于確定順反子功能研究其它方法:
缺失或突變后,功能是否改變;重新引入后,功能是否回復(fù);回補(bǔ)體外翻譯體系:invitrotranslation
又稱無細(xì)胞蛋白質(zhì)合成系統(tǒng),是分子生物學(xué)中一種常規(guī)的表達(dá)系統(tǒng)。有兩種體外翻譯的基本方法:以RNA為模板,或以DNA為模板(即偶聯(lián)的轉(zhuǎn)錄/翻譯)。RNA模板可以是總RNA、mRNA或體外合成的轉(zhuǎn)錄子。DNA模板可以是一個質(zhì)粒,或一個PCR/RT-PCR產(chǎn)物,這個PCR/RT-PCR產(chǎn)物在轉(zhuǎn)錄啟動子和翻譯起點(diǎn)下游含有需要翻譯的基因。選擇哪一個體外翻譯系統(tǒng)取決于許多因素,這些因素包括要翻譯的基因的來源(真核/原核),可提供的模板(如RNA或DNA),和所生產(chǎn)的蛋白質(zhì)的下游應(yīng)用。18第18頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四二、細(xì)菌的基因組及特點(diǎn)(一)組成:細(xì)菌染色體和質(zhì)粒(二)細(xì)菌基因組的特征
1.
基因組相對較?。?.6×106bp,4000個基因),只有一個復(fù)制啟始位點(diǎn)。
2.具有操縱子結(jié)構(gòu):功能上相關(guān)的幾個基因往往在一起組成操縱子結(jié)構(gòu),即幾個結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起,受它們上游的共同調(diào)控區(qū)控制。當(dāng)基因開放時,這幾個基因轉(zhuǎn)錄在一條mRNA鏈上,然后分別翻譯合成各自的蛋白肽鏈。操縱子的末端具有特殊的終止序列。
3.基因是連續(xù)的:結(jié)構(gòu)基因中沒有內(nèi)含子(intron)成分,在轉(zhuǎn)錄后不需剪接加工,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的壽命較短。19第19頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四4.大部分DNA是用于編碼蛋白質(zhì)的,只有一小部分是不翻譯的。不翻譯區(qū)中含有間隔區(qū)(Spacer)和基因表達(dá)的調(diào)控序列。
5.基因組中僅有少數(shù)基因存在基因重疊現(xiàn)象。
6.結(jié)構(gòu)基因是單拷貝,rRNA基因是多拷貝。
7.非編碼的重復(fù)序列Chi5-GCTGGTGG-3REP(repeatedextrogenicpalinodrome)基因外重復(fù)的回文序列20第20頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四21第21頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四22第22頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四23第23頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四24第24頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四①種類單一;形式多樣;大小不一②單倍體基因組:每個基因都是單拷貝③基因常常成簇排列,沒有間隔序列,或間隔序列很小
(功能相關(guān)基因排列在一起)④動物病毒與真核基因相似,有內(nèi)含子;
細(xì)菌病毒與原核基因相似⑤有基因重疊三病毒基因組的特點(diǎn)25第25頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四⑥具有不規(guī)則的結(jié)構(gòu)基因
某些結(jié)構(gòu)基因無帽狀結(jié)構(gòu);有翻譯增強(qiáng)子。某些結(jié)構(gòu)基因編碼區(qū)無間隔,因此有些結(jié)構(gòu)基因沒
有翻譯起始序列。通過宿主及病毒本身酶切。有些結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄后產(chǎn)物沒有翻譯功能,需要在轉(zhuǎn)
錄后進(jìn)行加工剪接,成為有翻譯功能的mRNA。26第26頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四27第27頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四28第28頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四29第29頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四有增強(qiáng)子
轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物加工后,成為成熟的mRNA30第30頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四T抗原控制病毒的復(fù)制,起動晚期轉(zhuǎn)錄31第31頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四乙肝病毒
±DNA長短不一重疊基因32第32頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四脊髓灰質(zhì)炎病毒——單鏈(+)RNA33第33頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四34第34頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四逆轉(zhuǎn)錄病毒35第35頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四36第36頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四四、真核生物基因組的特點(diǎn)1.基因組含有更大的DNA分子,以染色體形式儲存于細(xì)胞核內(nèi),除配子細(xì)胞外,體細(xì)胞內(nèi)的基因的基因組是雙份的。(1)并非生物越高等,基因組越大。即并非進(jìn)化的復(fù)雜程度與DNA含量成正比。如某些植物和兩棲類的DNA含量是人的幾十乃至上百倍。C值矛盾。(2)同一類復(fù)雜性差不多,形態(tài)也相似的生物,理論上其基因組也應(yīng)比較接近,其實不然。如同是兩棲類可相差十倍以上。(3)基因組中DNA的量遠(yuǎn)大于編碼蛋白質(zhì)所需要的量。37第37頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四2.基因組結(jié)構(gòu)復(fù)雜,有多個復(fù)制啟始位點(diǎn),但每個復(fù)制子的長度較小。3.基因是不連續(xù)的。斷裂基因,內(nèi)含子/外顯子。4.轉(zhuǎn)錄單位一般是單順反子的。即一個基因一種mRNA一種蛋白質(zhì),但蛋白質(zhì)的最終產(chǎn)物可因剪接方式的不同而有差異(如Bcl-x:Bcl-x1Bcl-xs)5存在重復(fù)序列38第38頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四
單一順序(Uniquesequence)重復(fù)順序
短片段的重復(fù)順序可分為三種類型:(1)正向重復(fù)(directrepeats)又叫順向重復(fù);(2)反向重復(fù)(invertedrepeats);(3)回文順序
(Palindromicsequence)5‘GTGAGCTCAC3’3’CACTCGAGTG5’
39第39頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四
輕度重復(fù)順序和中度重復(fù)順序輕度重復(fù)順序
在基因組中含有2-10拷貝,酵母tRNA基因、人和小鼠的珠蛋白基因等。中度重復(fù)順序
長約300bp
基因組中約有10-幾千個拷貝的順序如rRNA和tRNA基因,組蛋白基因等40第40頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四41第41頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四42第42頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四高度重復(fù)序列(>105次)。
(1)衛(wèi)星DNA:根據(jù)長度可將其分為3類★衛(wèi)星(satellite)DNA:重復(fù)長度5-10bp,多態(tài)性不強(qiáng)。★小衛(wèi)星DNA:重復(fù)長度15-70bp,有高度的特異性?!镂⑿l(wèi)星DNA(簡單串聯(lián)重復(fù)序列):重復(fù)長度2-5bp,存在個體
間的高度變化,是DNA指紋的形成基礎(chǔ)。43第43頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四(2)倒位(反向)重復(fù)序列又稱零時復(fù)性部分,重復(fù)單位約長300bp,兩個單位之間有一平均1.6kb的片段相隔,多數(shù)散布于基因組中。(3)較復(fù)雜的重復(fù)單位組成的重復(fù)順序
靈長類所獨(dú)有,用HindⅢ消化非洲綠猴DNA,可以得到重復(fù)單位為172bp的高度重復(fù)順序,這種順序大部份由交替變化的嘌呤和嘧啶組成,又稱為α衛(wèi)星DNA。44第44頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四(4)高度重復(fù)順序的功能
a.參與復(fù)制水平的調(diào)節(jié)。
b.參與基因表達(dá)的調(diào)控
c.參與轉(zhuǎn)位作用
d.與進(jìn)化有關(guān)
e.DNA指紋
f.α衛(wèi)星DNA成簇的分布在染色體著絲粒附近,可能
與染色體減數(shù)分裂時染色體配對有關(guān)45第45頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四46第46頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四
6.存在多基因家族和超基因家族
(1)多基因家族(multigenefamily):亦稱基因家族。是指一組具有類似功能,核苷酸序列又有同源性的基因?!锓诸悾骸椿虻慕K產(chǎn)物分為兩類:一類編碼RNA,另一類編碼蛋白質(zhì)?!丛诨蚪M中的分布分為兩類:一類串聯(lián)排列在一起,形成基因簇,亦稱串聯(lián)重復(fù)基因。另一類家族成員則可以分散在不同的部位上。(2)超基因家族(supergenefamily):由多基因家族及單基因組成的更大的基因家族。成員間有不同程度的同源,但它們的功能并不相似,這是與多基因家族的差別所在。如Ig超家族。47第47頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四7.基因類型多樣(1)假基因:在多基因家族中,不產(chǎn)生有功能基因產(chǎn)物的基因。即序列與有功能的基因相似,但或者不能轉(zhuǎn)錄,或者轉(zhuǎn)錄后生成無功能的基因產(chǎn)物。用Ψ表示。造成原因是基因在進(jìn)化過程中,發(fā)生突變所致(如缺失、倒位、點(diǎn)突變等)。假基因往往缺少正常基因的內(nèi)含子,兩側(cè)有順向重復(fù)序列。(2)斷裂基因(不連續(xù)基因):編碼序列稱外顯子(exon),非編碼序列稱內(nèi)含子(intron,orinterveningsequence)。(3)非剪接基因(連續(xù)基因):原核和真核細(xì)胞都有。真核rRNA基因也是非剪接基因。48第48頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四(4)跳動(躍)基因(可轉(zhuǎn)移的DNA成分、轉(zhuǎn)座子):
是指可在DNA分子間進(jìn)行轉(zhuǎn)移的DNA片段。與一般轉(zhuǎn)移概念不同,轉(zhuǎn)移后仍保留原來位置上的DNA序列,只是把一個新合成的復(fù)本插入到另外的位置上。真核和原核細(xì)胞都有??煞譃閮深悺?/p>
簡單轉(zhuǎn)座子(插入序列,insertionsequence,IS):較小,只有與轉(zhuǎn)位有關(guān)的序列和促進(jìn)轉(zhuǎn)座過程所要的蛋白質(zhì)如轉(zhuǎn)座酶的基因?!?/p>
復(fù)雜轉(zhuǎn)座子(Tn):除轉(zhuǎn)位序列和蛋白質(zhì)基因外,在其中心區(qū)還含有一個或多個基因。49第49頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四(5)基因重疊:
是一種轉(zhuǎn)錄單位,一個基因可決定多種mRNA和蛋白質(zhì),如Bcl-X基因8.自私DNA(selfishDNA):
指非編碼序列,包括分散的高度、中度重復(fù)序列,內(nèi)含子和間隔序列等。這些序列極少轉(zhuǎn)錄成mRNA并翻譯成蛋白質(zhì),對細(xì)胞存活、代謝等不做任何貢獻(xiàn),它們存在的唯一目的似乎就是復(fù)制自己。故稱之為自私DNA。
而且有些成分還通過轉(zhuǎn)錄成mRNA,生成cDNA,再通過轉(zhuǎn)位插入到基因組,頗象機(jī)體內(nèi)寄生蟲的繁殖、生活,故也有人稱之為寄生DNA(parasiteDNA)。50第50頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四
但自私DNA并非真的自私,毫無功能。如有些調(diào)控序列雖不編碼任何蛋白,但對細(xì)胞代謝也有很大影響。如在Ig和MHC基因的內(nèi)含子部分發(fā)現(xiàn)有增強(qiáng)子的存在,可以增強(qiáng)該基因的轉(zhuǎn)錄。9.DNA序列組織的可變性:DNA序列并非一成不變。如B細(xì)胞成熟過程中Ig基因結(jié)構(gòu)的重排及TCR基因在分化過程中的重排。51第51頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四52第52頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四第二章基因突變和損傷DNA的修復(fù)基因符號基因突變的規(guī)律基因突變的分子基礎(chǔ)自發(fā)突變和誘發(fā)突變的機(jī)制DNA復(fù)制的準(zhǔn)確性與損傷DNA的修復(fù)誘變育種技術(shù)53第53頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四第一節(jié)基因突變的類型、符號和規(guī)律遺傳型(genotype):又稱基因型,指某一生物個體所含有的全部基因的總和;是一種內(nèi)在可能性或潛力。遺傳型+環(huán)境條件表型表型(phenotype):指生物體所具有的一切外表特征和內(nèi)在特性的總和;是一種現(xiàn)實存在,是具一定遺傳型的生物在一定條件下所表現(xiàn)出的具體性狀。代謝發(fā)育54第54頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四1Escherichiacoli
ATCC31343F-
hadS20(r-Bm-B)ara-14
leuB6
proA2lacY1galK2rpsL
xyl-5mtl-1supE44λ-
rpsL=strr2E.coliJM105K12λ-
hasR4(r-
m+)thisupE44rspL20endAsbcB15Δ(lac-proA)X111F’traDproABlacIQ
Δ(lacZ)M15
一基因符號與遺傳標(biāo)記55第55頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四SalmonellatyphimuriumTSM112zgc-7206::Tn10d(Cm)S.typhimuriumTSM118proAB47/F’pro+lac+zzf-
1834
::Tn10d(Km)VibriocholereaCS2-1O395
Φ(tcpA-proA)2-1(Hyb)SmrKmrCm(氯霉素)Sm(鏈霉素)Tc(四環(huán)素)Ap(氨芐青霉素)Km(卡那霉素)cmlrstrrtetramprkanr56第56頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四VibriocholereaTSM360recAthiprohsdR-m+(RP4-2Tc::Mu-Km::Tn7),λpir(TprSmr)
替考拉寧
teicoplanin
VibriocholereaTSM361TSM360(pKAS37)質(zhì)粒pNK972
AprPtac-tnpA
轉(zhuǎn)座酶pPY190AprTcrpBR322EcoRI::P22mnt-pant-SmaI/XmaI-antpPC39TcrpPY190SmaI::SmaI-HincIIK.aerogenesputcontrolregion
產(chǎn)氣克雷伯氏菌57第57頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四
Δ
缺失
??
插入(質(zhì)粒,轉(zhuǎn)座子)
易位
相互易位
Φ
融合58第58頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四59第59頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四二基因突變的類型1按突變體的表型分類(1)形態(tài)突變(2)生化突變(3)致死突變(4)條件致死突變60第60頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四野生型(wildtype)與原養(yǎng)型(prototroph)野生型是指存在于自然界中沒有經(jīng)過基因突變,具有正常生化代謝功能的遺傳類型;原養(yǎng)型指具有與野生型相同營養(yǎng)需求與表現(xiàn)的遺傳類型,有時特指突變型恢復(fù)為與野生型相同的個體。營養(yǎng)缺陷型(auxotroph)因基因突變喪失了某種生活物質(zhì)合成能力,在基本培養(yǎng)基上不能正常生長,需加入相應(yīng)營養(yǎng)成分的突變型。61第61頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四2按遺傳信息的改變分為錯義突變
missencemutation同義突變
samesencemutation無義突變
nonsencemutation
琥珀突變amberUAG赭石突變ocherUAA乳白突變opalUGA62第62頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四3按基因突變機(jī)制分類堿基置換突變substitution
堿基顛換transversion堿基轉(zhuǎn)換transition移碼突變frameshift
缺失deletion重復(fù)repetition63第63頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四三基因突變的規(guī)律自發(fā)性稀有性隨機(jī)性獨(dú)立性穩(wěn)定性可逆性64第64頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四1基因突變的自發(fā)性兩種觀點(diǎn):突變的性狀與引起突變的原因間呈對應(yīng)性,定向突變;突變是自發(fā)產(chǎn)生的,與環(huán)境是否存在該物質(zhì)無關(guān)。突變無方向65第65頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四1)Fluctuationtest彷徨試驗時間:1943年設(shè)計者:S.E.Luria&M.Delbrück實驗材料:對T1噬菌體敏感的大腸桿菌實驗?zāi)康尿炞C突變的性狀(對T1抗性)與引起突變的原因(與T1噬菌體接觸)間有無直接的對應(yīng)關(guān)系實驗設(shè)計:66第66頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四彷徨試驗的設(shè)計原理
67第67頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四103/mL24-36h68第68頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四小概率隨機(jī)事件與Poisson分布
當(dāng)一個隨機(jī)事件發(fā)生的幾率很小,而事件可在其中發(fā)生的試驗次數(shù)又很大,該事件的發(fā)生概率遵循Poisson分布。
K=0,1,2,...e≈2.7183,:.69第69頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四70第70頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四71第71頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四2)涂布試驗(Newcombeexperiment)1949年H.B.Newcombe實驗材料對T1噬菌體敏感的大腸桿菌采用固體平板培養(yǎng)實驗過程72第72頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四73第73頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四3.54430158074第74頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四3)平板影印試驗(replicaplating)1952年,美國的萊德伯格夫婦JoshuaLederberg&EstherLederberg實驗材料E.coliK12strr實驗過程75第75頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四Lederberg的平板培養(yǎng)法76第76頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四4)適應(yīng)性突變概念的重新提出非致死選擇條件長期培養(yǎng)固體平板突變時間依賴性:生長非依賴性;有利突變高頻率發(fā)生:方向性;符合Poisson分布77第77頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四沒有方向性
Jinetal.2002BMCGnentics,3:6有利突變和中性突變都能高頻率產(chǎn)生表型DNA序列改變生長依賴性Jinetal.2002BMCGnentics,3:6細(xì)胞密度依賴性涂布與點(diǎn)種青霉素固體平板Poisson分布液體試管Poisson分布和非Poisson分布同時存在
Jinetal.2012,中國科學(xué)C,42:809。
78第78頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四79第79頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四80第80頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四81第81頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四選擇條件與突變的關(guān)系不良環(huán)境,觸發(fā)細(xì)菌生長代謝改變,其中涉及DNA復(fù)制保真性和損傷修復(fù)體系的酶可能發(fā)生變化,使細(xì)胞處于一種“超誘變態(tài)”,即細(xì)胞本底水平的自發(fā)突變率提高,各種突變都能以高頻率產(chǎn)生,但是哪種突變是否發(fā)生仍然是隨機(jī)的,自發(fā)的。82第82頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四2突變的稀有性突變率mutationrate
每一個細(xì)胞在每一世代中發(fā)生某一性狀突變的幾率;自發(fā)突變幾率一般在10-6~10-9范圍內(nèi);突變頻率
mutationfrequency
mutantproportion
突變細(xì)胞在總細(xì)胞中的比例83第83頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四若干細(xì)菌的自發(fā)突變率菌名 突變性狀 突變率Escherichia
coli
抗T1噬菌體 3×10–8E.coli
抗T3噬菌體 1×10–7
E.coli
不發(fā)酵乳糖 1×10–10E.coli
抗紫外線 1×10–5Staphylococcusaureus
抗青霉素 1×10–7S.aureus
抗鏈霉素 1×10–9
Salmonellatyphi
抗25g/L鏈霉素 1×10–6
Bacillusmegaterium
抗異煙肼 5×10–5
84第84頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四突變率的計算世代generation
每個細(xì)胞每分裂一次為一個世代。division
代:generationcycle:
群體中每個個體繁(分裂)殖一代。細(xì)胞數(shù)與世代數(shù)的關(guān)系
n代后N0個細(xì)胞分裂成為N0
·2n
個細(xì)胞所經(jīng)歷的世代數(shù)為N0·(2n
-1)
85第85頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四1→2→4→8→16→32→64→128→…2n
細(xì)胞數(shù)
137153163127…2n-1世代數(shù)
1234567…n
代數(shù)
同步生長(同步分裂)金建玲等突變率計算中細(xì)菌群體生長不同步系數(shù)的修正微生物學(xué)通報2009,36(3):446-452.86第86頁,共94頁,2023年,2月20日,星期四突變率計算公式固體培養(yǎng)條件下
μ=(M2-M1)/(N2-N1)
其中,M2和M1分別是培養(yǎng)后和培養(yǎng)前突變菌落的數(shù)目。
N2和N1分別
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