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文檔簡介
生物化學核酸分解代謝第1頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一第十一章、核苷酸代謝第2頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一第一節(jié)、核苷酸的分解代謝
生物體普遍存在的磷酸單酯酶或核苷酸酶可催化核苷酸的水解,而特異性強的磷酸單酯酶只能水解3’-Nt或5’-Nt。
催化核苷水解的酶有2類,即核苷磷酸化酶和核苷水解酶
Nsphosphorylase Ns+PiPuorPy+pentose-1-P
Nshydrolase Ns+H2OPuorPy+pentose Nsphosphorylase存在廣泛,反應可逆
Nshydrolase主要存在于植物和微生物,只對核糖核苷起作用,對脫氧核糖核苷無作用。
第3頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一
核酸酶(Nuclease)
核酸酶是作用于核酸磷酸二酯鍵的水解酶,包括:1、核糖核酸酶(RNase),2、脫氧核糖核酸酶(DNase),其中能水解核酸分子內磷酸二酯鍵的酶又稱為核酸內切酶(endonuclease),從核酸的一端逐個水解下核苷酸的酶稱為核酸外切酶(exonuclease)。第4頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一
食物核酸與蛋白結合為核蛋白體(Nucleoproteins)的形式,在胃中受胃酸作用水解為NAs和Proteins,NA在小腸被胰nuclease(包括DNase、RNase)降解為Pu-Nt、Py-Nt和Oligonucleotide。腸黏膜釋放的phosphodiesterase并協同胰核酸酶進行消化,水解為單核苷酸腸黏膜細胞中還有nucleotidase(phosphomonoesterase),水解Nt為Ns和Pi。脾、肝等組織中的nucleosidase進一步水解Ns為戊糖和堿基。
第5頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一一、核苷酸分解第6頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一二、核苷酸三級水平的降解第7頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一三、嘌呤核苷酸分解的三級脫氨第8頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(一)、嘌呤堿的分解
不同生物嘌呤堿的分解能力不同,代謝產物也不同,人和猿類及一些排尿酸的動物(鳥類、某些爬行類和昆蟲)嘌呤的代謝產物為尿酸。
第9頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一1、嘌呤分解中的脫氨作用
嘌呤堿的分解首先在各種脫氨酶的作用下水解脫氨,脫氨作用也可以在核苷或核苷酸的水平上進行。動物組織腺嘌呤脫氨酶含量極少,而腺嘌呤核苷脫氨酶及腺嘌呤核苷酸脫氨酶的活性較高,因此腺嘌呤的脫氨分解主要在核苷或核苷酸水平上進行。鳥嘌呤脫氨酶分布廣,脫氨分解主要在該酶的作用下進行。第10頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(1)、鳥嘌呤脫氨第11頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(2)、黃嘌呤的分解第12頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(3)、尿酸生成第13頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(二)、嘌呤核苷酸的分解第14頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一1、不同生物嘌呤核苷酸的
分解產物不同鳥、昆蟲、人類非靈長類哺乳動物硬骨魚魚、兩棲類甲殼類、無脊椎第15頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一2、黃嘌呤氧化酶
(XanthineOxidase)
催化次黃嘌呤和黃嘌呤氧化生產尿酸。酶為復合黃素酶,由兩個相同的亞基組成,分子量260,000,每個亞基含一個FAD、一個鉬原子和一個Fe4S4中心。反應要求分子氧作為電子受體,還原產物是H2O2,進入尿酸的氧來自水。底物與酶結合后,Mo(VI)被還原為Mo(IV),電子經黃素、鐵硫中心等傳給O2,與氫離子生成H2O2,Mo(IV)氧化為Mo(VI)。第16頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一3、痛風(Gout)
嘌呤堿分解代謝產生過多的尿酸,由于其溶解性很差,易形成尿酸鈉結晶,沉積于男性的關節(jié)部位引起疼痛或灼痛――痛風和腎結石。
第17頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一痛風的尿酸鈉晶體第18頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一4、別嘌呤醇與次黃嘌呤第19頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(1)、別嘌呤醇的作用別嘌呤醇別黃嘌呤第20頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(2)、別嘌呤醇的作用機理第21頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(3)、自殺底物(SuicideSubstrate)
結構與次黃嘌呤很相似的別嘌呤醇(allopurinol),在黃嘌呤氧化酶的作用下氧化為別黃嘌呤(alloxanthine),后者與酶中心的Mo(IV)牢固結合,使Mo(IV)不易轉變成Mo(VI)而成為酶的滅活物,這種底物類似物被稱為自殺作用(底)物,這種作用被稱為自殺作用。第22頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一四、嘧啶堿的分解
不同生物嘧啶堿的分解過程也不一樣,一般情況下含氨基的嘧啶要先水解脫去氨基,脫氨基也可以在核苷或核苷酸水平上進行。
第23頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(一)、嘧啶還原途徑的分解第24頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(二)、嘧啶氧化途徑的分解第25頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一1、尿嘧啶、胞嘧啶分解第26頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一2、胸腺嘧啶的分解返回第27頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一第二節(jié)、核苷酸生物合成
可以通過兩條完全不同的途徑進行,1、從頭合成途徑:由磷酸戊糖先和尚未完成的Pu或Py環(huán)結合,在未完成的環(huán)上添加必要的部分,然后閉合成環(huán)。
2、補救途徑:由現成的Pu,Py,Pentose及Pi在酶的作用下直接合成核苷酸(Nt——SalvagePathway);第28頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一一、嘌呤核苷酸的從頭合成途徑
碳14標記的HCOOH和氮15標記的氨基酸與鴿肝勻漿物共培養(yǎng),得到Pu各元素的來源,1950s由J.Buchanan和G.RobertGreenberg提出Hypoxanthinedenovosynthesis假說,并證明HypoxanthineNt是Ade-Nt及Gua-Nt合成的前體。第29頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一一、嘌呤核苷酸的從頭合成途徑
合成所需物質: -D-ribose-5-P,ATP,Gln,Asp,GTP,N5,N10-methyleneTHFA,CO2。
另需輔助因子:
Mg2+,Mn2+,NAD+,THFA-CHO
合成中先生成IMP,然后轉變?yōu)锳MP和GMP。第30頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一1、嘌呤環(huán)元素的來源第31頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一2、嘌呤核苷酸的全程合成總圖第32頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一嘌呤核苷酸的全程
合成(反應1)5-磷酸核糖焦磷酸5-磷酸核糖胺第33頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一嘌呤核苷酸的全程
合成(反應2)甘氨酰胺核甘酸5-磷酸核糖胺第34頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一嘌呤核苷酸的全程
合成(反應3)1甲酰甘氨酰胺核甘酸甘氨酰胺核甘酸第35頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一嘌呤核苷酸的全程
合成(反應4)甲酰甘氨酰胺核甘酸甲酰甘氨咪唑核甘酸第36頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一嘌呤核苷酸的全程
合成(反應5)甲酰甘氨咪唑核甘酸5-氨基咪唑核甘酸第37頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一嘌呤核苷酸的全程
合成(反應6)5-氨基咪唑4-羧基核甘酸
5-氨基咪唑4-N琥珀酸氨甲酰核甘酸第38頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一嘌呤核苷酸的全程合成(反應7)
5-氨基咪唑4-N琥珀酸氨甲酰核甘酸115-氨基咪唑甲酰胺核甘酸第39頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一嘌呤核苷酸的全程合成(反應8)
5-氨基咪唑甲酰胺核甘酸5-甲酰胺基咪唑-4-氨甲酰核甘酸第40頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一嘌呤核苷酸的全程
合成(反應9)
5-甲酰胺基咪唑-4-氨甲酰核甘酸次黃嘌呤核甘酸第41頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一3、由IMP合成AMP和GMP第42頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一磷酸核糖基焦磷酸(PRPP)第43頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一5、嘌呤核苷酸合成的調節(jié)第44頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(1)、大腸桿菌腺苷酸和鳥苷酸合成的調節(jié)第45頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(2)、氨甲蝶呤第46頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(3)氮絲氨酸等Gln類似物第47頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一二、補救途徑
利用現成的嘌呤、嘧啶堿基、核甘通過腺嘌呤磷酸核糖基轉移酶(APRT)及次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖基轉移酶(HGPRT)實現AMP、IMP、GMP的補救合成。
人體細胞大多為全程合成,但腦中多通過補救途徑合成。第48頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(一)、嘌呤核苷酸的補救合成第49頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(二)、Lesch-NyhanSyndrome(自毀容貌綜合癥)
HGPRT(次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖基轉移酶)缺陷的男性兒童表現為一種自毀容貌綜合癥,為先天性遺傳疾?。ㄈ狈GPRT),行為對立,侵略性強,自咬手指、腳趾、嘴唇等,智力低下。第50頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一自毀容貌綜合癥機理第51頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一三、嘧啶核苷酸的合成從頭合成途徑生物有機體利用CO2、NH3及天冬氨酸合成核苷酸的途徑。嘧啶核苷酸的合成包括:補救途徑生物有機體利用堿基或核苷和磷酸核糖合成核苷酸的途徑。第52頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(一)、從頭合成途徑1、嘧啶環(huán)元素的來源第53頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一2、氨甲酰磷酸合成氨甲酰Asp第54頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一3、乳清酸的合成第55頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一4、乳清酸合成UMP第56頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一5、嘧啶核苷酸的全程合成:由乳清酸合成
UTP和CTP第57頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一6、UTP合成CTP第58頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一7、嘧啶核苷酸合成的調節(jié)第59頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一8、嘧啶核苷酸的合成受到反饋抑制的調節(jié)
細菌嘧啶核苷酸合成速度的調節(jié)很大程度受到Asp羧甲基轉移酶(ATCase)的調節(jié),產物CTP對反應為抑制作用。細菌ATCase分子有6個催化亞基和6個調節(jié)亞基組成,催化亞基與底物分子結合,變構調節(jié)亞基與變構調節(jié)物CTP結合。與亞基一樣,整個酶分子有兩種構象:活性形式和非活性形式,CTP未與調節(jié)亞基結合時,酶的活性最大;CTP積累并與調節(jié)亞基結合時,調節(jié)亞基構象改變并帶動催化亞基構象改變,酶變?yōu)闊o活性形式。ATP阻止由CTP所引起改變的改變。第60頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一CTP和ATP對天門冬氨酸羧甲基轉移酶的變構調節(jié)第61頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(二)、嘧啶核苷酸的補救合成
UMP磷酸核糖基轉移酶
Ura+PRPPUMP+PPi
尿嘧啶磷酸化酶
Ura+1-P-RUridine+Pi
尿苷激酶
Uridine+ATPUMP+ADP
Cytosine不能與PRPP作用。第62頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一三、三磷酸核苷酸的合成1.AMP生成ATP
核甘酸激酶
AMP+ATP2ADP
glycolyticenzymesoroxidativephosphorylation ADPATP2.ATP通過核苷單磷酸激酶生成其他NDP
ATP+NMPADP+NDP3.NTP的生成
Nsdiphosphatekinase NTPD+NDPANDPD+NTPA第63頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一四、脫氧核糖核苷酸的合成
以核糖核苷酸為原料,通過NDP還原酶將核糖分子還原為脫氧核糖。核糖核苷酸必須先行轉化為二磷酸核苷酸(NDP)水平,再還原為脫氧核苷二磷酸水平。 除需還原酶外,還需另兩種氧還蛋白參與,即硫氧還蛋白(thioredoxin)和谷氧還蛋白(glutaredoxin)。 產物為dNDP。 進一步在激酶的作用下形成相應的dNTP。第64頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(一)、脫氧核苷酸的合成第65頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一1、核糖核苷酸還原酶催化核糖核苷酸還原為脫氧核糖核苷酸第66頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一2、核糖核苷酸還原酶TyrFe2+第67頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一3、核糖核苷酸還原酶作用的可能機制第68頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一4、脫氧核苷酸合成機理第69頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一5、硫氧還蛋白第70頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一7、硫氧還蛋白還原酶第71頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一8、谷氧還蛋白還原酶第72頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一9、脫氧核苷三磷酸對核糖核苷酸還原酶的調節(jié)第73頁,共86頁,2023年,2月20日,星期一(二)、dTMP的生物合成
存在兩
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