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文檔簡介
4.5細(xì)菌的遺傳分析與基因定位4.5.1細(xì)菌的轉(zhuǎn)化和基因定位轉(zhuǎn)化:指某些細(xì)菌能通過其細(xì)胞膜攝取周圍供體的染色體片段,將此外源DNA片段通過重組加入自己染色體組的過程。1928年,格里費(fèi)斯(GriffithF.)在肺炎雙球菌中發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化現(xiàn)象。1944年,阿委瑞(AveryO.T.)成功地進(jìn)行了肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化試驗(yàn);證實(shí)遺傳物質(zhì)是DNA;轉(zhuǎn)化是細(xì)菌交換基因的方法之一。
細(xì)菌中的大部分的轉(zhuǎn)化工作是用下面三種細(xì)菌完成的:肺炎雙球菌,枯草桿菌和流感嗜血桿菌。轉(zhuǎn)化主要分為二個步驟進(jìn)行:(一)供體DNA與受體細(xì)胞間的接觸與互作肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化:DNA片斷至少有800個堿基對;枯草桿菌的轉(zhuǎn)化:DNA片斷至少有16000個堿基對。轉(zhuǎn)化的第一步是使轉(zhuǎn)化DNA與受體細(xì)菌間的成功地相互作用,這包括:轉(zhuǎn)化片段的大小、形態(tài)、濃度和受體細(xì)胞的生理狀態(tài)。
①.轉(zhuǎn)化片斷的大小:②.供體DNA分子存在的數(shù)目:對特定基因來說,供體DNA分子數(shù)目與成功轉(zhuǎn)化有關(guān)。鏈霉素抗性基因轉(zhuǎn)化:在每個細(xì)胞含有10個DNA分子之前,抗性轉(zhuǎn)化體數(shù)目一直與DNA分子存在數(shù)目成正比。原因:在細(xì)菌的細(xì)胞壁或細(xì)胞膜上有固定數(shù)量的DNA接受座位,故一般細(xì)菌攝取的DNA分子數(shù)小于10個。③.受體的生理狀態(tài):受體細(xì)胞必須在生理上處于感受態(tài)。這種感受態(tài)只能發(fā)生在細(xì)菌生長周期的某一時間范圍內(nèi),在感受態(tài)內(nèi),活躍合成的蛋白質(zhì)的細(xì)菌細(xì)胞壁多少發(fā)生改變而易于接受轉(zhuǎn)化DNA。(三)轉(zhuǎn)化和基因重組作圖例如:黎德伯格等用枯草桿菌進(jìn)行轉(zhuǎn)化和重組試驗(yàn)DNA片段進(jìn)入受體細(xì)胞之后,可與受體染色體發(fā)生重組。緊密連鎖的兩個基因有較多的機(jī)會包括在同一個DNA片段中,并同時整合到受體染色體中。Trp2his2tyr1<-----------34-----------><----13-------><--------------------40--------------------->三者并發(fā)轉(zhuǎn)化的頻率最高,故這3個基因是連鎖的,其中his2和tyr1連鎖緊密:單交換時,染色體開環(huán)易降解,故不存在單交換類型;只有雙交換和偶數(shù)的多交換才有效的。B菌株:Met+bio+thr-leu-,需加蘇氨酸和亮氨酸。不同營養(yǎng)缺陷型的大腸桿菌:A菌株:Met-bio-thr+leu+,需加甲硫氨酸和生物素。4.5.2.1黎德伯格和塔特姆(1946年):A菌株和B菌株?duì)I養(yǎng)缺陷型,不能在基本培養(yǎng)上生長。A+B菌株混合培養(yǎng),在完全培養(yǎng)基上,幾小時后離心,涂布基本培養(yǎng),長出原養(yǎng)型(Met+bio+thr+leu+)菌落。這種原養(yǎng)型細(xì)胞如何出現(xiàn)?轉(zhuǎn)化?細(xì)胞間直接接觸而發(fā)生遺傳物質(zhì)交換和重組?A、B菌株分別培養(yǎng)在基本培養(yǎng)基上
一邊加壓和吸引使培養(yǎng)液充分混合
結(jié)果任何一臂的培養(yǎng)基上均未長出原養(yǎng)型細(xì)菌?!嘀苯咏佑|(接合)是原養(yǎng)型細(xì)胞出現(xiàn)的必要條件。大分子可通過,細(xì)菌不能通過Hayes(1952)試驗(yàn)證明:接合過程是一種單向轉(zhuǎn)移,A菌株遺傳物質(zhì)
B菌株,從供體“donor”到受體“receptor”。4.5.2.3F因子的三種狀態(tài):以大腸桿菌為例:②.一個自主狀態(tài)F因子,即F+;
③.帶有一個整合的F因子的細(xì)胞叫高頻重組細(xì)胞,Hfr細(xì)胞。①.沒有F因子,即F-;⑷.自主狀態(tài)時F因子獨(dú)立進(jìn)行分裂。F+×F-:先形成接合管,F(xiàn)因子的DNA邊轉(zhuǎn)移邊復(fù)制,F(xiàn)-細(xì)胞
F+細(xì)胞。F因子整合到細(xì)菌染色體上(F+
Hfr細(xì)胞),其繁殖與細(xì)菌染色體同步進(jìn)行。此時,細(xì)菌基因的重組頻率增加4倍以上,因此染色體上整合有F因子的菌株,稱為Hfr菌株。㈡、Hfr細(xì)胞的形成及染色體的轉(zhuǎn)移:部分二倍體中發(fā)生交換:單數(shù)交換:打開環(huán)狀染色體,產(chǎn)生一個線性染色體,這種細(xì)胞是不能成活的。偶數(shù)交換:產(chǎn)生可遺傳的重組體和片段。部分二倍體:當(dāng)F+或Hfr的細(xì)菌染色體進(jìn)入F-后,在一個短時期內(nèi),F(xiàn)-細(xì)胞內(nèi)的某些位點(diǎn)就會成為二倍體的DNA。4.5.2.5中斷雜交作圖一、中斷雜交實(shí)驗(yàn)原理
基因從Hfr細(xì)胞按次序轉(zhuǎn)入F-細(xì)胞,可根據(jù)基因進(jìn)入F-細(xì)胞的時間和次序制作基因圖譜。Wollman和Jacob于1954年在大腸桿菌中曾進(jìn)行了以下雜交實(shí)驗(yàn):Hfr:thr+leu+azsTislac+gal+strs×F-:thr-leu-azrTirlac-gal-strr把接合中的細(xì)菌在不同時間取樣,并把樣品猛烈攪拌以中斷接合中的細(xì)菌,然后分析受體菌的基因型,這是在大腸桿菌等細(xì)菌中用來測定基因位置的一種方法。二、中斷雜交作圖中斷雜交實(shí)驗(yàn)結(jié)果基因轉(zhuǎn)入時間(min)頻率thr+8100leu+8.5100azs990Tis1170lac+1840gal+2525不同基因在F-中出現(xiàn)的時間和達(dá)到的穩(wěn)定轉(zhuǎn)移頻率不同,表明它們同轉(zhuǎn)移起始點(diǎn)之間,以及它們之間的順序和距離不同。
0510152025
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OazTilacgalE.coli中斷雜交作圖基因距離以分鐘為單位同一個Hfr菌株的轉(zhuǎn)移的起始點(diǎn)在以及轉(zhuǎn)移順序在不同實(shí)驗(yàn)中都是相同的。但一個F+品系可產(chǎn)生許多Hfr品系,這是因?yàn)镕因子在細(xì)菌染色體上有許多插入位點(diǎn)而且其插入取向不同而形成的。用這些不同Hfr菌株進(jìn)行中斷雜交實(shí)驗(yàn),則它們的轉(zhuǎn)移起點(diǎn)、基因轉(zhuǎn)移順序以及轉(zhuǎn)移方向都不相同。4.5.2.6細(xì)菌的重組作圖
如果2個基因間的轉(zhuǎn)移時間<2min則用中斷雜交作圖不可靠,應(yīng)采用傳統(tǒng)的重組作圖法?!耠s交Hfrlac+ade+×F-lac-ade-
lac+乳糖不發(fā)酵ade-胸嘌呤缺陷型用完全培養(yǎng)基但不加腺嘌呤,可選出F-ade+的菌落●由于lac+ade-近,兩者相繼進(jìn)入時間相距很短,難以準(zhǔn)確界定,所以只能根據(jù)產(chǎn)物確定。●如果選出ade+同時也選出lac+,說明lac-ade間沒有發(fā)生過交換;如果是lac-ade+說明發(fā)生交換。Hfr
lac+ade+F-lac-ade-
F-lac-ade-Hfr
lac+ade+F-lac+ade+
F-lac-ade-Hfr
lac+ade+F-lac-ade+F-lac-ade-
A:外基因子與內(nèi)基因子之間未發(fā)生重組;B:lac-ade兩基因之外發(fā)生雙交換;C:lac-ade兩基因間發(fā)生交換產(chǎn)生重組子?!裰亟M率=lac-ade+/(lac+ade+)+(lac-ade+)×100%=22%
兩個位點(diǎn)之間的時間單位約為1min,可見1個時間單位(分鐘)大約相當(dāng)于20%的重組值。用重組率與中斷雜交法測的基因距離大致符合的,根據(jù)接合的實(shí)驗(yàn),用中斷雜交法基因重組等方法已繪制出大腸桿菌K12環(huán)狀遺傳圖(圖4-42)。A:B:C:
LT22phe-try-tyr-
×
LT2met-his-
(苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸)
(甲硫氨酸、組氨酸)營養(yǎng)缺陷型↓
營養(yǎng)缺陷型
原養(yǎng)型的菌落(即出現(xiàn)個別正常型的細(xì)菌)
那么這些原養(yǎng)型菌落的出現(xiàn)是由接合引起的?還是由轉(zhuǎn)化引起的?他們先進(jìn)行U形管實(shí)驗(yàn)(P159),結(jié)果在LT22一臂獲得原養(yǎng)型的菌株,由此推測可能有一種可通過濾膜的過濾性因子(FA)在起作用。進(jìn)一步利用DNA酶處理,結(jié)果FA不受DNA酶影響,從而消除了轉(zhuǎn)化作用的可能性。最后認(rèn)為FA是一種噬菌體,發(fā)現(xiàn)了轉(zhuǎn)導(dǎo)。3.轉(zhuǎn)導(dǎo)的機(jī)制轉(zhuǎn)導(dǎo)是在噬菌體包裝中因?yàn)殄e誤將細(xì)菌染色體片段包裝進(jìn)去成為內(nèi)含細(xì)菌染色體片段“假噬菌體”而發(fā)生的。具體過程如下:
(1)噬菌體侵染細(xì)菌。(2)噬菌體DNA使細(xì)菌染色體形成片段,合成噬菌體DNA和外殼。(3)新噬菌體包裝,偶爾將細(xì)菌染色體片段也包裝進(jìn)去成為內(nèi)含細(xì)菌染色體片段“假噬菌體”。“假噬菌體”和真噬菌體一起釋放出來。
若同時觀察3因子轉(zhuǎn)導(dǎo)分析,則只做一次實(shí)驗(yàn)就可推出其次序。舉例:利用普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)測知leu,thr,azi三個基因順序。方法:(1)用噬菌體P1侵染帶leu+,thr+和azi+的大腸桿菌。(2)用從該大腸桿菌釋放出來的噬菌體,再侵染leu-、thr-和azi-的大腸桿菌。
(3)把受體菌接種到不含thr的選擇培養(yǎng)基上對thr+進(jìn)行選擇,凡具thr+的細(xì)菌都可生長,把此菌接種到其他培養(yǎng)基上,結(jié)果在選出的thr+重組子只有3%leu+,但無一個同時也是azi+。若選擇leu+重組子,則約有50%同時也是azi+,因此3基因次序應(yīng)為thr+leu+azi+。P1652.特異性(局限性)轉(zhuǎn)導(dǎo)1概念:只能轉(zhuǎn)移細(xì)菌染色體特定部分基因的轉(zhuǎn)導(dǎo).2局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)的過程3轉(zhuǎn)導(dǎo)的機(jī)制:是因?yàn)槭删w在細(xì)菌染色體的特定位點(diǎn)上整合。4低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)與高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)
噬菌體
↓感染供體菌→裂解液(轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體)→非溶源
(溶源菌)
(10-6)
性細(xì)菌溶源性轉(zhuǎn)導(dǎo)子重組性轉(zhuǎn)導(dǎo)子低頻轉(zhuǎn)導(dǎo):指溶源性細(xì)菌經(jīng)誘導(dǎo)所釋放的噬菌體所
進(jìn)行的轉(zhuǎn)導(dǎo).
4.6 噬菌體的重組作圖
4.6.1噬菌體的結(jié)構(gòu)和形態(tài)二.λ噬菌體
1951年EstherLederberg發(fā)現(xiàn)K12中有原噬菌體,并命名為λ。
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