演示文稿數(shù)據(jù)庫的使用與功能介紹

（優(yōu)選）數(shù)據(jù)庫的使用與功能介紹現(xiàn)在是1頁\一共有35頁\編輯于星期五NCBI分子生物學數(shù)據(jù)庫

美國國立醫(yī)學圖書館(NLM)于1988年11月4日建立國家生物技術(shù)信息中心(NationalCenterofBiotechnologyInformation，簡稱NCBI)現(xiàn)在是2頁\一共有35頁\編輯于星期五NationalCenterofBiotechnologyInformationNCBI的任務：建立關(guān)于分子生物學，生物化學，和遺傳學知識的存儲和分析的自動系統(tǒng)實行關(guān)于用于分析生物學重要分子和復合物的結(jié)構(gòu)和功能的基于計算機的信息處理的先進方法的研究加速生物技術(shù)研究者和醫(yī)藥治療人員對數(shù)據(jù)庫和軟件的使用全世界范圍內(nèi)的生物技術(shù)信息收集的合作努力現(xiàn)在是3頁\一共有35頁\編輯于星期五NCBI首先創(chuàng)建GenBank數(shù)據(jù)庫，在重點開發(fā)GenBank的同時，又于1991年開發(fā)了Entrez數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng)。該系統(tǒng)整合了GenBank、EMBL、PIR和SWISS-PROT等數(shù)據(jù)庫的序列信息以及MEDLINE有關(guān)序列的文獻信息，并通過相關(guān)鏈接，將他們有機地結(jié)合在一起。NationalCenterofBiotechnologyInformation現(xiàn)在是4頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是5頁\一共有35頁\編輯于星期五以IL6基因為例：如何查找基因序列、mRNA、Promoter如何查找連續(xù)的mRNA、cDNA、蛋白序列現(xiàn)在是6頁\一共有35頁\編輯于星期五Mapviewer是NCBI網(wǎng)站上提供的一個非常有用的尋找基因的工具，通過Mapviewer你可以了解你感興趣基因在基因組中所處的位置、基因序列、內(nèi)含子及外顯子的排列、基因的細胞遺傳學圖、EST、SNP等等許多有用的信息。利用Mapviewer查找基因序列、mRNA序列、啟動子Promoter現(xiàn)在是7頁\一共有35頁\編輯于星期五利用Mapviewer查找基因序列、mRNA序列、啟動子Promoter現(xiàn)在是8頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是9頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是10頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是11頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是12頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是13頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是14頁\一共有35頁\編輯于星期五如何查找連續(xù)的mRNA、cDNA、蛋白序列現(xiàn)在是15頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是16頁\一共有35頁\編輯于星期五蛋白序列：mRNA序列：現(xiàn)在是17頁\一共有35頁\編輯于星期五已知一基因序列：CCCCTGCCTGGCAGCCCTTTCTCAAGGACCACCGCATCTCTACATTCAAGAACTGGCCCTTCTTGGAGGGCTGCGCCTGCACCCCGGAGCGGATGGCCGAGGCTGGCTTCATCCACTGCCCCACTGAGAACGAGCCAGACTTGGCCCAGTGTTTCTTCTGCTTCAAGGAGCTGGAAGGCTGGGAGCCAGATGACGACCCCATAGAGGAACATAAAAAGCATTCGTCCGGTTGCGCTTTCCTTTCTGTCAAGAAGCAGTTTGAAGAATTAACCCTTGGTGAATTTTTGAAACTGGACAGAGAAAGAGCCAAGAACAAAATTGCAAAGGAAACCAACAATAAGAAGAAAGAATTTGAGGAAACTGCGGAGAAAGTGCGCCGTGCCATCGAGCAGCTGGCTGCCATGGATTGAGGCCTCTGGC1、這是哪個基因？2、編碼的蛋白質(zhì)序列是怎么樣的?3、有沒有保守的功能結(jié)構(gòu)域？4、它的功能是怎樣的？5、有沒有三級結(jié)構(gòu)？現(xiàn)在是18頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是19頁\一共有35頁\編輯于星期五BLAST可以對核酸和蛋白的多種數(shù)據(jù)庫操作。有幾種比較方法可選擇：Blastp：一個氨基酸序列與一個蛋白數(shù)據(jù)庫比較Blastn：一個核酸序列與一個核酸數(shù)據(jù)庫比較。Blastx：一個核酸的所有讀框與一個蛋白數(shù)據(jù)庫比較，可以用來發(fā)現(xiàn)未知核酸可能的蛋白產(chǎn)物。Tblastn：一個蛋白序列與翻譯成所有讀框的核酸數(shù)據(jù)庫比較。Tblastx：一個核酸的六種讀框與一個核酸據(jù)庫的六種讀框比較，但由于計算太復雜在網(wǎng)頁中不能應用?，F(xiàn)在是20頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是21頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是22頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是23頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是24頁\一共有35頁\編輯于星期五Geneinfo：17號染色體現(xiàn)在是25頁\一共有35頁\編輯于星期五功能注釋：GeneOntology該基因定位于人體第17條染色體，基因表示符為：NM-001168.2初步的功能分析：細胞周期，caspase酶的抑制因子等現(xiàn)在是26頁\一共有35頁\編輯于星期五獲取蛋白質(zhì)的序列信息該蛋白質(zhì)中包含142個氨基酸，序列標識符為：NP-001159.2現(xiàn)在是27頁\一共有35頁\編輯于星期五獲取FASTA序列現(xiàn)在是28頁\一共有35頁\編輯于星期五Finddomain現(xiàn)在是29頁\一共有35頁\編輯于星期五填入蛋白質(zhì)的FASTA序列并提交現(xiàn)在是30頁\一共有35頁\編輯于星期五BIRdomain具