PubMed使用指南專題知識專家講座

醫(yī)學文件資源檢索與利用PubMed數(shù)據(jù)庫檢索中山大學醫(yī)學文件檢索教研室朱偉麗

zhuweili5月PubMed使用指南專題知識專家講座第1頁Outline數(shù)據(jù)庫概況數(shù)據(jù)庫檢索檢索結果處理ＭyNCBIPubMed使用指南專題知識專家講座第2頁1、PubMed------概況紙質(zhì)版（IndexMedicus,IM美國醫(yī)學索引）-----光盤版（MEDLARSonLine,MEDLINE）------網(wǎng)絡版(PubMed)，收錄時間范圍：1947-，部分期刊回溯至創(chuàng)刊年。數(shù)據(jù)每日更新(Tuesday–Saturday)世界上權威性生物醫(yī)學書目型數(shù)據(jù)庫，收錄全世界范圍內(nèi)70多個國家和地域近5000種生物醫(yī)學相關期刊論文，主要收錄英語語種期刊，少部分其它語種期刊。-學科范圍涵蓋基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、護理學、口腔醫(yī)學、獸醫(yī)學、營養(yǎng)衛(wèi)生、藥理和藥劑學、預防醫(yī)學、衛(wèi)生管理、醫(yī)療保健和情報科學領域，年起新增生物、環(huán)境科學、海洋生物、植物和動物學、生物物理學和生物化學等生命科學領域-全球無償使用，部分文件無償獲取全文-集成在NCBI平臺，訪問網(wǎng)址(/pubmed)PubMed使用指南專題知識專家講座第3頁PubMed使用指南專題知識專家講座第4頁1PubMed------概況統(tǒng)計組成-OldMEDLINE[PubMed-OLDMEDLINE]：1947-1965年間MEDLINE數(shù)據(jù)，正在做回溯加工，補充主題詞及部分全文鏈接-MEDLINE[PubMed-indexedforMEDLINE]：標引了主題詞被MEDLINE正式收錄文件數(shù)據(jù)。-PreMEDLINE[PubMed-inprocess]：已被MEDLINE錄用，正處于加工標引狀態(tài)文件數(shù)據(jù)。-[Epubaheadofprint][PubMed-assuppliedbypublisher]：由出版商提供紙質(zhì)版還未正式出版文件，大部分最終會轉(zhuǎn)入PubMed-inprocess，再正式轉(zhuǎn)入MEDLINE，部分不在MEDLINE收錄學科范圍內(nèi)數(shù)據(jù)，最終會轉(zhuǎn)化為PubMed-assuppliedbypublisher/PubMed狀態(tài)。-Publisher-Supplied[PubMed-assuppliedbypublisher/PubMed]：由出版商提供但因其學科不在MEDLINE收錄學科范圍內(nèi)，而最終未進入MEDLINE但保留在PubMed中文件數(shù)據(jù)。PubMed使用指南專題知識專家講座第5頁OLDMEDLINEMEDLINEPreMEDLINE[Epubaheadofprint]suppliedbypublisherPubMed/suppliedbypublisher未入選數(shù)據(jù)PubMed標引主題詞入選數(shù)據(jù)PubMED形成示意圖PubMed使用指南專題知識專家講座第6頁檢索區(qū)PubMed使用指南專題知識專家講座第7頁2PubMed------檢索-基本檢索-Limit限定檢索-MeSH詞檢索（主題檢索）-檢索史組配檢索-ClinicalQueries（臨床咨詢模塊）-SingleCitationMatcher（單篇引文匹配）PubMed使用指南專題知識專家講座第8頁①PubMed基本檢索-支持布爾邏輯運算AND,OR,NOT支持截詞檢索*支持字段檢索：如livercancer[ti]-支持短語檢索“”自動詞語匹配(字段限定、詞組、截詞檢索時該功效失效)PubMed使用指南專題知識專家講座第9頁案例1(自動詞語匹配）請利用PubMed檢索相關結腸造口術后患者護理相關文件。檢索詞：結腸造口術---------colostomy

護理-------nursingPubMed使用指南專題知識專家講座第10頁colostomynursingPubMed使用指南專題知識專家講座第11頁PubMed使用指南專題知識專家講座第12頁PubMed使用指南專題知識專家講座第13頁自動詞語匹配:

PubMed對檢索用戶輸入檢索詞,假如不限定檢索字段,系統(tǒng)依次到MeSH轉(zhuǎn)換表、刊名轉(zhuǎn)換表、作者全名轉(zhuǎn)換表、作者索引表、合作者全名轉(zhuǎn)換表、合作者轉(zhuǎn)換表進行詞語查對、轉(zhuǎn)換和檢索，假如在上述六個表中都找不到匹配短語，系統(tǒng)將短語拆開，繼續(xù)到這六個表中搜索，短語斷開部分為AND關系。假如拆到單詞在上述五個表中還是找不到匹配詞，將到全部字段中去搜索這些單詞，單詞之間邏輯關系也是AND。PubMed使用指南專題知識專家講座第14頁案例2（截詞檢索）

請利用PubMed檢索相關肝移植患者術后生活質(zhì)量相關文件。檢索詞：肝移植---------livertransplant*

生活質(zhì)量-------qualityoflifePubMed使用指南專題知識專家講座第15頁livertransplant*qualityoflifePubMed使用指南專題知識專家講座第16頁PubMed使用指南專題知識專家講座第17頁PubMed使用指南專題知識專家講座第18頁案例3（準確檢索）

利用PubMed檢索相關胎兒染色體異常產(chǎn)前診療研究。

產(chǎn)前診療：PrenatalDiagnosis

胎兒染色體異常：FetalChromosomalAbnormalitiesPubMed使用指南專題知識專家講座第19頁“PrenatalDiagnosis”“FetalChromosomalAbnormalities”PubMed使用指南專題知識專家講座第20頁PubMed使用指南專題知識專家講座第21頁案例4（字段檢索）檢索cell雜志上發(fā)表相關干細胞移植方面文件檢索詞：stemcelltransplant*cell[ta]慣用字段：ti(題名）、tiab（題名或摘要）、au（作者）、1au(第一作者）、lastau(最終一位作者）、ta（刊名）、ad(地址）、all（全部字段）、majr(主要主題詞）、mh（主題詞)……PubMed使用指南專題知識專家講座第22頁PubMed使用指南專題知識專家講座第23頁②PubMed限定檢索功效：a字段限定

b時間限定

c文件類型限定

d語種限定

e年紀性別限定

f全文獲取限定g檢索子集限定

……PubMed使用指南專題知識專家講座第24頁案例1作者與文件語種限定

檢索年以來PubMed收錄葛堅教授發(fā)表青光眼漢字文件。檢索詞：作者：gejian[年以后作者檢索能夠用全稱]

主題概念：glaucomaLimits：-出版年限

Chinese語種限定

PubMed使用指南專題知識專家講座第25頁作者檢索tips作者輸入格式:姓前名后,姓用全稱,名字用首字母,姓與名之間不加標點符號。如MichaelR,Nash---------NashMR自動轉(zhuǎn)換作者名檢索:輸入Smithj[au]將檢索出Smithja,Smithjb,Smithjr等作者準確檢索:“

”將作者名引發(fā)來,再加[au]

如輸入“smithj”[au]則僅檢索出姓為Smith,名首字母為j作者文件.PubMed使用指南專題知識專家講座第26頁gejianglaucomaPubMed使用指南專題知識專家講座第27頁PubMed使用指南專題知識專家講座第28頁PubMed使用指南專題知識專家講座第29頁案例2文件時間與類型限定

利用PubMed檢索近十年來干擾素β治療多發(fā)性硬化癥綜述文件干擾素β——interferonbeta

多發(fā)性硬化癥——multiplesclerosis

限定：last10yearsReviewPubMed使用指南專題知識專家講座第30頁PubMed使用指南專題知識專家講座第31頁PubMed使用指南專題知識專家講座第32頁檢索肝移植患者術后生活質(zhì)量研究，要求檢索詞出現(xiàn)在篇名中，檢索結果能夠獲取全文。檢索詞：livertransplantation、qualityoflife

檢索字段：篇名限定：linktofulltext案例3全文獲取限定PubMed使用指南專題知識專家講座第33頁LivertransplantationqualityoflifePubMed使用指南專題知識專家講座第34頁PubMed使用指南專題知識專家講座第35頁PubMed使用指南專題知識專家講座第36頁案例4文件子集限定護理類雜志上發(fā)表有關循證護理研究文件檢索詞：evidencebasednursing

檢索字段：MeSH限定：subset-----nursingjournalsPubMed使用指南專題知識專家講座第37頁PubMed使用指南專題知識專家講座第38頁PubMed使用指南專題知識專家講座第39頁③PubMed-----主題詞檢索

PubMed依據(jù)MeSH詞表（醫(yī)學主題詞表）對所收錄數(shù)據(jù)進行主題標引利用主題詞檢索能夠提升文件檢索效率MeSH網(wǎng)絡版本集成在PubMed數(shù)據(jù)庫中PubMed使用指南專題知識專家講座第40頁案例

檢索相關結腸造口(colostomy)患者護理（nursing)文件PubMed使用指南專題知識專家講座第41頁colostomyPubMed使用指南專題知識專家講座第42頁

主題詞注釋

可組配副主題詞

主題詞加權與擴展入口詞

主題詞樹PubMed使用指南專題知識專家講座第43頁PubMed使用指南專題知識專家講座第44頁PubMed使用指南專題知識專家講座第45頁PubMed使用指南專題知識專家講座第46頁主要主題詞限定檢索(加權檢索)PubMed使用指南專題知識專家講座第47頁PubMed使用指南專題知識專家講座第48頁

檢索近十年以來PubMed收錄甘精胰島素治療2型糖尿病臨床研究文件。檢索詞：甘精胰島素：insulinglargine2型糖尿?。簍ype2diabetesmellitus④PubMed-----檢索史組配檢索PubMed使用指南專題知識專家講座第49頁同義詞如2型糖尿病noninsulindependentdiabetesmellitusNIDDMType2Diabetes（Mellitus）Adult-OnsetDiabetesMellitusMaturity-OnsetDiabetesMellitusStableDiabetesMellitusSlow-OnsetDiabetesMellitusKetosisresistantdiabetesPubMed使用指南專題知識專家講座第50頁PubMed使用指南專題知識專家講座第51頁PubMed使用指南專題知識專家講座第52頁PubMed使用指南專題知識專家講座第53頁PubMed使用指南專題知識專家講座第54頁PubMed使用指南專題知識專家講座第55頁PubMed使用指南專題知識專家講座第56頁PubMed使用指南專題知識專家講座第57頁PubMed使用指南專題知識專家講座第58頁PubMed使用指南專題知識專家講座第59頁PubMed使用指南專題知識專家講座第60頁PubMed使用指南專題知識專家講座第61頁PubMed使用指南專題知識專家講座第62頁PubMed使用指南專題知識專家講座第63頁PubMed使用指南專題知識專家講座第64頁⑤.PubMed------ClinicalQueries

為幫助臨床醫(yī)生更有效地獲取PubMed數(shù)據(jù)庫中普通疾病病因?qū)W、預后、診療、治療及預防等方面信息，PubMed設置了ClinicalQueries功效。該功效具備特殊過濾器裝置能將上述主題文件集中提供檢索。PubMed使用指南專題知識專家講座第65頁PubMed使用指南專題知識專家講座第66頁PubMed使用指南專題知識專家講座第67頁PubMed使用指南專題知識專家講座第68頁⑥.PubMed------SingleCitationMatcher功效:輸入題錄信息，查找特定文件，參考文件補缺。注意:刊名要準確，縮寫要標準作者字段第一作者與最終一名作者需用簡寫Example:查找：smithiesoliver

發(fā)表在blood第12期上關Hematopoieticstemcells文件篇名、其它作者、頁碼等信息。PubMed使用指南專題知識專家講座第69頁PubMed使用指南專題知識專家講座第70頁PubMed使用指南專題知識專家講座第71頁PubMed使用指南專題知識專家講座第72頁PubMed使用指南專題知識專家講座第73頁3PubMed------檢索結果處理檢索結果顯示檢索輸出、保留全文鏈接：LinkoutPubMed使用指南專題知識專家講座第74頁Summary：默認格式，包含作者、篇名、出處、相關文件鏈接Summary(text)：summary文本形式Abstract：篇名、作者、摘要、出處、主題詞、全文鏈接標識等Abstract（text）：篇名，作者，摘要，出處MEDLINE：全部統(tǒng)計字段XML格式、PMIDlist可經(jīng)過Display下拉菜單項選擇擇其它顯示方式七種檢索結果顯示格式PubMed使用指南專題知識專家講座第75頁①檢索結果顯示PubMed使用指南專題知識專家講座第76頁PubMed使用指南專題知識專家講座第77頁②檢索結果輸出、保留PubMed使用指南專題知識專家講座第78頁PubMed使用指南專題知識專家講座第79頁剪貼板:Clipboard(暫時保留）PubMed使用指南專題知識專家講座第80頁PubMed使用指南專題知識專家講座