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實(shí)驗(yàn)四電泳技術(shù)及詳解演示文稿目前一頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)(優(yōu)選)實(shí)驗(yàn)四電泳技術(shù)及目前二頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)+-1.許多生物分子帶有電荷,在電場(chǎng)中可以發(fā)生移動(dòng)。2.每種分子遷移率不同,一定時(shí)間內(nèi)在電場(chǎng)中的遷移距離不同。在一定pH條件下,每一種分子都具有特定的電荷(種類和數(shù)量)、大小和形狀,在一定時(shí)間內(nèi)它們?cè)谙嗤妶?chǎng)中泳動(dòng)速度不同,各自集中到特定的位置上而形成緊密的泳動(dòng)帶。這就是帶電粒子可以用電泳技術(shù)進(jìn)行分離、分析和鑒定的基本原理。原理目前三頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)二、電泳遷移率設(shè)一帶電粒子在電場(chǎng)中所受的力為F,則F=QE(Q為粒子所帶電荷,E為電場(chǎng)強(qiáng)度)根據(jù)Stoke定律,一球形分子在溶液中運(yùn)動(dòng)所受的阻力f為:f=6πrηv(v為分子移動(dòng)速度;r為分子半徑;η為介質(zhì)黏度)目前四頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)當(dāng)分子達(dá)到動(dòng)態(tài)平衡時(shí),F(xiàn)=f即QE=6πrηv移項(xiàng)得v/E=Q/6πrηv/E:表示單位電場(chǎng)強(qiáng)度時(shí)粒子運(yùn)動(dòng)速度,稱為遷移率,也稱電泳速度,以表示。
因此上式也可表示為:=Q
/6πrη從上式可推知,帶電粒子在電場(chǎng)中的移動(dòng)與:粒子大小有關(guān),顆粒愈小愈快粒子的電荷有關(guān),電荷愈多愈快粒子的形狀有關(guān),愈接近球形愈快目前五頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)三、影響遷移率的因素1.電場(chǎng)強(qiáng)度(E)
電場(chǎng)強(qiáng)度是指每厘米的電位降。電泳速度與電場(chǎng)強(qiáng)度成正比。電場(chǎng)強(qiáng)度越高電泳速度越快。
根據(jù)電場(chǎng)強(qiáng)度大小,電泳可分為:常壓電泳:2~10V/cm高壓電泳:20~200V/cm2.溶液的pH值
pH值決定帶電顆粒的解離程度,決定物質(zhì)所帶凈電荷的多少。選擇合適pH,使混合物中各成分所帶電量差別較大。
pH>pI帶負(fù)電pH<pI帶正電目前六頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)3.溶液的離子強(qiáng)度
緩沖液的離子強(qiáng)度越高,電泳速度越慢一般在0.02-0.2mol/L。4.電滲現(xiàn)象
在電場(chǎng)中液體對(duì)固體支持物的相對(duì)移動(dòng)。電泳介質(zhì)多孔,且?guī)в锌山怆x的化學(xué)基團(tuán),吸附正離子或負(fù)離子,使溶液相對(duì)帶電。應(yīng)盡量避免選用有電滲作用的支持物。目前七頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)四、電泳的分類按電泳的原理來(lái)分,可分為二類:自由界面電泳:又稱移動(dòng)界面電泳,是指在沒(méi)有支持介質(zhì)的溶液中進(jìn)行的電泳。其裝置復(fù)雜,價(jià)格昂貴,費(fèi)時(shí)費(fèi)力,不便于推廣應(yīng)用。區(qū)帶電泳:是指有支持介質(zhì)的電泳,待分離物質(zhì)在支持介質(zhì)上分離成若干區(qū)帶。支持介質(zhì)的作用主要是防止電泳過(guò)程中的對(duì)流和擴(kuò)散,以使被分離的成分得到最大分辨率的分離。區(qū)帶電泳由于采用的介質(zhì)不同以及技術(shù)上的差異,又可分為不同的類型。目前八頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)根據(jù)支持介質(zhì)物理形狀不同(1)濾紙及其它纖維素薄膜電泳(2)凝膠電泳(3)粉末電泳(4)線絲電泳
根據(jù)支持介質(zhì)的裝置形式(1)平板式電泳
(2)垂直板式電泳(3)連續(xù)式電泳(4)圓盤電泳
根據(jù)pH連續(xù)性與否(1)連續(xù)pH電泳(2)非連續(xù)pH電泳
目前九頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)瓊脂糖凝膠電泳:一般用于核酸的分離分析。瓊脂糖凝膠孔徑度較大,對(duì)大部分蛋白質(zhì)只有很小的分子篩效應(yīng)。聚丙烯酰胺凝膠電泳:可用于核酸和蛋白質(zhì)的分離、純化及檢測(cè)。其分辨率較高。聚丙烯酰胺和瓊脂糖是目前實(shí)驗(yàn)室最常用的支持介質(zhì)目前十頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)五、瓊脂糖凝膠電泳特點(diǎn)1.具有大量微孔
孔徑大小取決于濃度:0.075%濃度孔徑800nm0.16%濃度孔徑500nm1%濃度孔徑150nm2.具有較高的機(jī)械強(qiáng)度可以在1%或更低濃度下使用3.無(wú)毒,不需要催化劑4.具有熱可逆性,低熔點(diǎn)瓊脂糖回收樣品容易5.膠凝溫度34-43℃熔化溫度75-90℃低熔點(diǎn)瓊脂糖膠凝溫度低于30℃(融化溫度高于30℃)目前十一頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)電極緩沖液TAE:40mM/LTris-醋酸1mM/LEDTA5×:24.2克Tris5.7ml冰醋酸10ml0.5M/LEDTATBE:
45mM/LTris-硼酸1mM/LEDTA5×:54克Tris27.5克硼酸10ml0.5M/LEDTA目前十二頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)瓊脂糖凝膠電泳優(yōu)點(diǎn):1.雙重效應(yīng):電泳效應(yīng)、分子篩效應(yīng)。2.操作簡(jiǎn)單,電泳速度快,樣品無(wú)需預(yù)處理。3.電泳圖譜清晰,分辨率高,重復(fù)性好。4.凝膠透明且無(wú)紫外吸收,可在紫外燈下觀看結(jié)果。5.易染色,易洗脫,便于定量。
瓊脂糖凝膠電泳一般用于核酸的分離分析。目前十三頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)瓊脂糖凝膠分離范圍瓊脂糖濃度%線狀DNA分子分離范圍Kb0.35-600.61-200.70.8-100.90.5-71.20.4-61.50.2-32.00.1-2目前十四頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前十五頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)六、等點(diǎn)聚焦1.用兩性電解質(zhì)建立電場(chǎng)中連續(xù)線性pH梯度2.只適用于兩性解離的物質(zhì)電泳pH1018642pI—+目前十六頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前十七頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前十八頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)七、雙向電泳
(2-DE)目前十九頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)蛋白印跡(westernblotting)檢測(cè)血清中的免疫球蛋白目前二十頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)一、概念
通過(guò)PAGE/SDS分離樣品中不同的蛋白質(zhì)組分,利用電轉(zhuǎn)移法將電泳分離的蛋白質(zhì)從凝膠轉(zhuǎn)移至一種固相支持物,然后用免疫學(xué)原理來(lái)檢測(cè)目的蛋白質(zhì)。常用于檢測(cè)樣品中特異蛋白的存在、以及半定量分析。目前二十一頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)制備蛋白樣品SDS轉(zhuǎn)膜免疫學(xué)檢測(cè)二、工作流程
封閉一抗雜交二抗雜交底物顯色/發(fā)光目前二十二頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)1.蛋白樣品的獲得來(lái)源:組織、細(xì)胞、體液方法:可用各種蛋白裂解液目前二十三頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)聚丙烯酰胺凝膠是由單體丙烯酰胺(簡(jiǎn)稱Acr)和交聯(lián)劑N,N-甲叉雙丙烯酰胺(簡(jiǎn)稱Bis)聚合交聯(lián)成三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的凝膠。以此凝膠為支持物的電泳稱為聚丙烯酰胺凝膠電泳(polyacrylamidegelelectrophoresis,簡(jiǎn)稱PAGE)。PAGE靈敏度高(ug),分辨率高(幾個(gè)bp)。
PAGE電泳體系中加入SDS--→SDSPAGE應(yīng)用范圍廣,可用于蛋白質(zhì)、酶、核酸等生物大分子的分離、定性、定量及少量制備,還可測(cè)定分子量、等電點(diǎn)等。2.SDS目前二十四頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)2.1聚丙烯酰胺凝膠的優(yōu)點(diǎn)(1)在一定濃度時(shí),凝膠透明,有彈性,機(jī)械性能好;(2)化學(xué)性能穩(wěn)定,與被分離物不起化學(xué)反應(yīng);(3)對(duì)pH和溫度變化較穩(wěn)定;(4)幾乎無(wú)吸附和電滲作用;(5)樣品不易擴(kuò)散,且用量少,其靈敏度可達(dá)10-6g;(6)凝膠孔徑可調(diào)節(jié),根據(jù)被分離物的分子量選擇合適的濃度,通過(guò)改變單體及交聯(lián)劑的濃度調(diào)節(jié)凝膠的孔徑;(7)分辨率高,尤其在不連續(xù)凝膠電泳中,集濃縮、分子篩和電荷效應(yīng)為一體。目前二十五頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)分子量范圍與凝膠濃度的關(guān)系分子量范圍適用的凝膠濃度(%)蛋白質(zhì)1041~4×1044×104~1×1051~5×1055×10520~3015~2010~155~102~5核酸104104~105105~2×10615~205~102~2.6目前二十六頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)2.2聚丙烯酰胺凝膠的制備
Acr和Bis單獨(dú)存在或混合在一起時(shí)是穩(wěn)定的,但在自由基存在時(shí)就會(huì)發(fā)生聚合反應(yīng)形成凝膠。引發(fā)產(chǎn)生自由基的方法有化學(xué)和光聚合兩種方法。1)化學(xué)聚合常用的催化劑系統(tǒng)有:
(1)過(guò)硫酸胺(AP)——TEMED(四甲基乙二胺);(2)過(guò)硫酸胺——DMPN(二甲基氨基丙腈);(3)過(guò)硫酸胺——三乙醇胺。2)光聚合由光敏物質(zhì)核黃素代替過(guò)硫酸銨作催化劑。目前二十七頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)影響聚合反應(yīng)的因素:(1)大氣氧能淬滅自由基,抑制聚合。在進(jìn)行化學(xué)聚合前,一般在膠液表面,覆蓋一層水或溶液,隔絕空氣,可加速聚合。(2)低溫、低pH都會(huì)減慢聚合反應(yīng)速度。(3)有些材料如聚丙烯酸甲酯有機(jī)玻璃,一些金屬等可抑制聚合反應(yīng)。(4)過(guò)硫酸銨易潮解失效。目前二十八頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)2.3SDS分離蛋白的原理電泳體系由濃縮膠、分離膠及電極緩沖液組成。
①濃縮膠是由AP催化聚合而成的大孔膠,凝膠緩沖液為pH6.8的Tris-HCl。
②分離膠是由AP催化聚合而成的小孔膠,凝膠緩沖液為pH8.8Tris-HCl。③電極緩沖液是pH8.3Tris-甘氨酸緩沖液。
2種孔徑的凝膠、2種緩沖體系、3種pH值形成了凝膠孔徑、pH值、緩沖液離子成分的不連續(xù)性→→樣品濃縮的主要因素。
目前二十九頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)SDS分離蛋白的特點(diǎn)1)樣品濃縮效應(yīng)(a)凝膠孔徑不連續(xù)性;(b)緩沖體系離子成分及pH值的不連續(xù)性;(2)分子篩效應(yīng)(3)電荷效應(yīng)8.38.38.86.8目前三十頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)2.4十二烷基磺酸鈉(SDS)的作用SDS:陰離子表面活性劑,能夠使蛋白質(zhì)的氫鍵和疏水鍵打開(kāi),并結(jié)合到蛋白質(zhì)上(結(jié)合比為1.4gSDS/1g蛋白質(zhì))使各種蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物都帶有相同密度的負(fù)電荷,其數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)了蛋白質(zhì)分子原有的電荷量,從而掩蓋了不同種類蛋白質(zhì)間原有的電荷差別。此時(shí)蛋白質(zhì)分子的電泳遷移率主要取決于其分子量大小。可以利用SDS測(cè)定蛋白質(zhì)分子量。實(shí)驗(yàn)中同時(shí)加入巰基乙醇(強(qiáng)還原劑),使蛋白質(zhì)分子中的二硫鍵保持還原狀態(tài),利于蛋白質(zhì)和SDS定量結(jié)合。目前三十一頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)3.轉(zhuǎn)膜實(shí)現(xiàn)蛋白從凝膠到膜的轉(zhuǎn)移常用的固相支持物:NC膜,PVDF膜轉(zhuǎn)膜方法:電轉(zhuǎn)移法(濕法、半干法)轉(zhuǎn)膜裝置:夾心三明治結(jié)構(gòu)(陰極碳極板、海綿、濾紙、凝膠、NC膜、濾紙、海綿、陽(yáng)極碳極板),180mAX2hrs/100vX1hr轉(zhuǎn)膜效果檢測(cè):①膜的檢測(cè):麗春紅染膜;應(yīng)用預(yù)染蛋白Marker②凝膠的檢測(cè):考馬斯亮藍(lán)染色轉(zhuǎn)膜后的膠目前三十二頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)4.免疫學(xué)檢測(cè)封閉:5%脫脂奶粉或BSA,封閉非特異結(jié)合位點(diǎn)。一抗孵育:一抗與封閉液以一定稀釋度配比。二抗孵育:用與一抗種屬相同的二抗進(jìn)行孵育。檢測(cè):利用二抗上的標(biāo)記物(AP/HRP)可以使底物顯色或發(fā)光來(lái)檢測(cè)蛋白。注意事項(xiàng):①一抗、二抗的稀釋度、作用時(shí)間和溫度對(duì)不同的蛋白質(zhì)要經(jīng)過(guò)預(yù)實(shí)驗(yàn)確定。②底物溶液要新鮮配制。③帶手套操作,避免樣品污染,也保護(hù)自己。目前三十三頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)SDS-目前三十四頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)三、儀器、原料和試劑試劑:10%SDS、凝膠貯存液(30%ACr-Bis)、分離膠緩沖液(1.5mol/LpH8.8Tris-HCl緩沖液)、濃縮膠緩沖液(1.0mol/LpH6.8Tris-HCl緩沖液)、10%過(guò)硫酸銨、TEMED、pH8.3Tris-Gly電極緩沖液、0.05%考馬斯亮蘭R250器材:垂直板電泳槽、穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀、脫色搖床原料:血清蛋白樣品目前三十五頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前三十六頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)四、實(shí)驗(yàn)步驟1、安裝夾心式垂直板電泳槽
:注意:安裝前,膠條、玻璃板都要潔凈干燥;勿用手接觸灌膠面的玻璃。2、配膠:根據(jù)所測(cè)蛋白質(zhì)分子量范圍,選擇適宜的分離膠濃度。3、制備凝膠板(1)分離膠制備(10%分離膠,20ml/電泳槽)(2)濃縮膠的制備(5%濃縮膠,10ml/電泳槽)目前三十七頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前三十八頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)目前三十九頁(yè)\總數(shù)四十五頁(yè)\編于二十二點(diǎn)4、樣品的處理及加樣將血清樣品
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