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文檔簡介
第八章原核生物基因的表達(dá)及其調(diào)控生物體的每個(gè)活細(xì)胞都含有相同的一整套基因?;虮磉_(dá)具有高度的時(shí)空專一化:如肌紅蛋白基因(肌細(xì)胞)基因表達(dá)的調(diào)控:生物有機(jī)體對(duì)其基因表達(dá)的時(shí)空程序、表達(dá)速率等所進(jìn)行的調(diào)節(jié)和控制。本底水平表達(dá):調(diào)控處于關(guān)閉狀態(tài),只翻譯極少量的蛋白質(zhì)第一頁,共七十八頁。第一節(jié)原核生物基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯原核生物的DNA:單個(gè)裸露的DNA不編碼占5%轉(zhuǎn)錄和翻譯同一時(shí)間,地點(diǎn)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控(主),兼有翻譯水平調(diào)控第二頁,共七十八頁。根據(jù)基因表達(dá)產(chǎn)物可劃分:
組成型蛋白:基因表達(dá)不受時(shí)期、部位、環(huán)境影響——組成型表達(dá)。
調(diào)節(jié)型蛋白/適應(yīng)型蛋白:基因表達(dá)受時(shí)期、部位、環(huán)境影響——非組成型表達(dá)。一種生物的整套遺傳密碼可以比作一本密碼字典,該種生物的每個(gè)細(xì)胞中都有這本字典。為什么基因只有在它應(yīng)該發(fā)揮作用的細(xì)胞內(nèi)和應(yīng)該發(fā)揮作用的時(shí)間才能呈現(xiàn)活化狀態(tài)?結(jié)論:必然有一個(gè)基因調(diào)控系統(tǒng)在發(fā)揮作用。
第三頁,共七十八頁。基因調(diào)控主要在三個(gè)水平上進(jìn)行:①.DNA水平②.轉(zhuǎn)錄水平③.翻譯水平第四頁,共七十八頁。一、轉(zhuǎn)錄的起始
轉(zhuǎn)錄是原核生物基因表達(dá)的主要調(diào)控點(diǎn),主要涉及兩個(gè)方面:1、RNA合成的酶系;2、RNA合成起始和終止信號(hào),即DNA分子上的特定序列。通過RNA聚合酶、轉(zhuǎn)錄因子和啟動(dòng)子的相互作用實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄調(diào)控,改變細(xì)胞的表型,從而實(shí)現(xiàn)細(xì)胞生理狀態(tài)和環(huán)境的變化。第五頁,共七十八頁。(一)RNA聚合酶(RNApolymerase):
大腸桿的的RNA聚合酶:由5個(gè)亞基組成,即α2ββ’σ,有時(shí)還有2個(gè)ω亞基。以α2ββ’σ組成的酶稱全酶。σ亞基與其他亞基結(jié)合較松弛,易從全酶上解離;其余部分α2ββ’稱為核心酶(coreenzyme)。第六頁,共七十八頁。在大腸桿菌中還發(fā)現(xiàn)一種新的σ因子,稱為σ’因子,因此將含有σ亞基的全酶稱為全酶I,含有σ’亞基的稱為全酶Ⅱ。二者的不同在于:全酶Ⅱ可以利用雙鏈DNA為模板合成po1y〔A)。σ亞基作用:參與啟動(dòng)子的識(shí)別和結(jié)合以及轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的異構(gòu)化。細(xì)胞內(nèi)哪條DNA鏈被轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄方向與轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)的選擇都與σ亞基有關(guān)。第七頁,共七十八頁。離體實(shí)驗(yàn)表明:全酶所轉(zhuǎn)錄的RNA和細(xì)胞內(nèi)所轉(zhuǎn)錄出的RNA,其起始點(diǎn)相同,序列相同,若僅用核心酶進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,則模扳鏈和起始點(diǎn)的選擇都有很大的隨意性,而且往往同一段DNA的兩條鏈都被轉(zhuǎn)錄。由此可見:σ亞基對(duì)識(shí)別DNA鏈上的轉(zhuǎn)錄信號(hào)是不可缺少的,它是核心酶和啟動(dòng)子之間的橋梁。σ因子的取代在細(xì)胞發(fā)育和對(duì)環(huán)境應(yīng)答的反應(yīng)中起主導(dǎo)作用。如在枯草桿菌中就有不同相對(duì)分子質(zhì)量的σ因子(P227表9—1)第八頁,共七十八頁。第九頁,共七十八頁。
核心酶的β亞基作用:對(duì)RNA聚合酶的功能至關(guān)重要,參與RNA合成、終止信號(hào)的識(shí)別。由于β亞基與RNA的前體核昔三磷酸具有很高親和力,推測它可能參與底物的結(jié)合,以及催化磷酸二酯鍵的形成。β’亞基作用:可使聚合酶結(jié)合到模板DNA上。α亞基作用:游離狀態(tài),常以二聚體的形式存在,參與全酶同啟動(dòng)子的牢固結(jié)合。第十頁,共七十八頁。RNA聚合酶體積很大,橫跨近60個(gè)堿基,而解旋的DNA區(qū)域可能不到17個(gè)堿基。當(dāng)聚合酶按5′→3′方向延伸RNA鏈時(shí),解旋的DNA區(qū)域也隨之移動(dòng)??拷?′端的DNA不斷解旋。同時(shí)在5′端重新形成DNA雙鏈,不斷將RNA-DNA雜合鏈中的RNA鏈擠出。第十一頁,共七十八頁。(二)啟動(dòng)子(promoter):
轉(zhuǎn)錄的起始是基因表達(dá)的關(guān)鍵階段,啟動(dòng)子就是連接在基因3’端上游的DNA序列,其長度從100bp到200bp不等,是轉(zhuǎn)錄起始時(shí)RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合的特定部位,但其本身并不被轉(zhuǎn)錄。第十二頁,共七十八頁。在啟動(dòng)子與終止子之間是一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,通常將mRNA開始的一個(gè)核苷酸定為o點(diǎn)(即+1).由此向右常稱為下游(downstream),其核苷酸依次編為正序號(hào);起始點(diǎn)左例稱為上游(upstream).其核苷酸則依次以負(fù)號(hào)表示.緊接起始點(diǎn)左側(cè)的核昔酸為-1。第十三頁,共七十八頁。原核生物啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)含有同源序列。整個(gè)啟動(dòng)子包括兩個(gè)部分:其上游部分是CAP-cAMP結(jié)合位點(diǎn),下游部分是RNA聚合酶的進(jìn)入位點(diǎn)。第十四頁,共七十八頁。二、轉(zhuǎn)錄的終止(一)終止子及其結(jié)構(gòu):1、概念:
DNA上提供轉(zhuǎn)錄停止信號(hào)的一段序列稱為終止子(terminator),是一個(gè)基因的末端或是一個(gè)操縱子的末端的一段特定序列。2、類型:強(qiáng)終止子和弱終止子強(qiáng)終止子:不依賴于Rho蛋白質(zhì)輔助因子而能實(shí)現(xiàn)終止作用,這類終止子屬于強(qiáng)終止子;弱終止子:依賴于Rho蛋白糖助因子才能實(shí)現(xiàn)終止作用,這類終止子屬于弱終止子。蛋白質(zhì)輔助因子稱為釋放因子,通常稱為ρ因子。第十五頁,共七十八頁。所有原核生物的終止子共同的序列特征:即在轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)之前有一段回文結(jié)構(gòu),因而所產(chǎn)生的mRNA可形成莖環(huán)狀的發(fā)夾結(jié)構(gòu),它可使RNA聚合酶的移動(dòng)停止或減緩?;匚慕Y(jié)構(gòu)中富含GC對(duì),在回文序列的下游常有6—8個(gè)AU對(duì),因此這段終止子轉(zhuǎn)錄后形成的RNA具有與A相對(duì)應(yīng)的寡聚U,是使RNA聚合酶脫離模板的信號(hào)。第十六頁,共七十八頁。依賴子ρ因子的終止子其回文序列中GC對(duì)含量較少,回文序列下方?jīng)]有固定結(jié)構(gòu),其AU對(duì)含量也較低,因而是弱終止子,必需有ρ因子存在時(shí)才發(fā)生終止作用;這也就是說依賴于ρ因子的終止子由于其莖環(huán)結(jié)構(gòu)常較短,在沒有ρ因子時(shí)這種莖環(huán)結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定。即如果沒有ρ因子存在.RNA聚合酶會(huì)繼續(xù)轉(zhuǎn)錄下去,這就稱為通讀(readthrough),當(dāng)ρ因子存在時(shí),轉(zhuǎn)錄才能終止。
第十七頁,共七十八頁。在強(qiáng)終止子中,由于其DNA模板上富含GC而使轉(zhuǎn)錄出的RNA上富含C和G,于是RNA與模板之間可以形成較強(qiáng)的氫鍵,成為DNA—RNA雜合分子,從而阻礙DNA聚合酶的前進(jìn)而有利于終止。(二)ρ因子輔助終止作用的機(jī)理第十八頁,共七十八頁。(三)基因表達(dá)的極性現(xiàn)象在正常情況下原核基因表達(dá)時(shí),其轉(zhuǎn)錄出來的mRNA隨即進(jìn)行翻譯,這時(shí)整個(gè)mRNA都覆蓋著核糖體,ρ因子無法接近mRNA.而RNA聚合酶早已越過前面的基因的依賴ρ因子的終止子,所以轉(zhuǎn)錄實(shí)際上并不停止.而是繼續(xù)轉(zhuǎn)錄后續(xù)基因。如果在某一基因的依賴于ρ的終止子之前發(fā)生無義突變,核糖體便從無義密碼子上解離下來,翻譯停止,核糖體不再進(jìn)入到mRNA上無義密碼子以后的位置上。于是ρ就可以自由進(jìn)入RNA并移動(dòng),直到趕上停留在終止子上的RNA聚合酶。結(jié)果使RNA聚合酶釋放,不能再轉(zhuǎn)錄下游基因。第十九頁,共七十八頁。第二十頁,共七十八頁。概念:基因表達(dá)的極性現(xiàn)象:在某些情況下同一轉(zhuǎn)錄單位里,由于一個(gè)基因的無義突變,阻礙了其后續(xù)基因表達(dá)的效應(yīng).就稱為基因表達(dá)的極性現(xiàn)象。除了無義突變可以導(dǎo)致極性現(xiàn)象外,插入序列IS1、IS2等DNA片段插入到操縱子的基因中也會(huì)發(fā)生極性現(xiàn)象。第二十一頁,共七十八頁。ρ因子也可發(fā)生突變,其效應(yīng)的基本性質(zhì)是使終止作用出現(xiàn)故障。突變??梢种茦O性效應(yīng),這是因?yàn)槠渫蛔兒芸赡軠p弱了ρ對(duì)無義密碼子后面的中間終止子的作用,這樣翻譯的終止并不會(huì)使轉(zhuǎn)錄也停頓,且遠(yuǎn)離無義突變的DNA區(qū)段還可以被重新覆蓋的核糖體繼續(xù)翻譯第二十二頁,共七十八頁。(四)抗終止作用
ρ因子的作用可以被抗終止因子所抵消,這樣,RNA聚合酶便可通過終止子(依賴于ρ因子的)繼續(xù)轉(zhuǎn)錄后面的基因。這種現(xiàn)象稱為抗終止作用(anti一termination)。第二十三頁,共七十八頁??菇K止作用最有代表性的例子見于λ噬菌體的時(shí)序控制。λ噬菌體基因在裂解過程中的表達(dá)分前早期、晚早期和晚期3個(gè)階段進(jìn)行,其早期基因與晚期基因以終止子相隔。λ噬菌體侵入敏感細(xì)胞,首先借助宿主的RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄前早期基因,由此獲得的表達(dá)產(chǎn)物N蛋白是一種抗終止因子,它與RNA聚合酶作用使后者越過左右兩個(gè)終止子繼續(xù)轉(zhuǎn)錄,實(shí)現(xiàn)晚早期基因表達(dá)。第二十四頁,共七十八頁。第二十五頁,共七十八頁。三、原核生物RNA的加工四、SD序列與翻譯效率核糖體結(jié)合保護(hù)降解法:測定mRNA上核糖體起始蛋白質(zhì)合成的部位。在抑制多肽鏈伸長的條件下,當(dāng)翻譯起始時(shí),核糖體與mRNA的結(jié)合位點(diǎn)已形成穩(wěn)定的復(fù)合體,于是加入核酸酶使未與核糖體結(jié)合的mRNA的區(qū)段降解,而有核糖體結(jié)合區(qū)域則受到保護(hù)。第二十六頁,共七十八頁。在細(xì)菌中受核糖體保護(hù)的起始序列約35~40個(gè)堿基長,其中包含起始密碼子AUG。在起始密碼子上游約4~7個(gè)核苷酸之前還有一段富含嘌吟的5′…AGGAGG…3′短小序列,它可以與16SrRNA3′端的3′…UCCUCC…5′區(qū)段完全互補(bǔ)。mRNA上的這段序列稱為ShineDalgarno序列(簡稱SD序列)。第二十七頁,共七十八頁。SD序列與16SrRNA序列互補(bǔ)的程度以及從起始密碼子AUG到嘌呤片段的距離也都強(qiáng)烈地影響翻譯起始的效率。不同基因的mRNA有不同的SD序列,它們與16SrRNA的結(jié)合能力也不同,從而控制著單位時(shí)間內(nèi)翻譯過程中起始復(fù)合物形成的數(shù)目,最終控制著翻譯的速度。第二十八頁,共七十八頁。第二節(jié)大腸桿菌乳糖操縱子的正負(fù)調(diào)控一、操縱子與操縱子模型操縱子學(xué)說/操縱子模型:F.JacobJ.Mond(1960)E.colilacoperon(1965諾貝爾醫(yī)學(xué)生理學(xué)獎(jiǎng))操縱子:核酸分子上調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄活性的基本單元,由結(jié)構(gòu)基因、操作子(O)和啟動(dòng)子(P)組成。轉(zhuǎn)錄、翻譯、合成蛋白結(jié)合調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合RNA聚合酶第二十九頁,共七十八頁。promoterstructuralgenesoperator啟動(dòng)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因操縱子(operon)模型第三十頁,共七十八頁。調(diào)控(節(jié))蛋白操縱子RNARPOstructuralgenesDNAProtein+正調(diào)控(positiveregulation)-負(fù)調(diào)控(negativeregulation)調(diào)控蛋白的作用機(jī)制注:R:RegulatorP:PromoterO:Operator正調(diào)控系統(tǒng)中的正調(diào)控蛋白又被稱為無輔基誘導(dǎo)蛋白(apoinducer)負(fù)調(diào)控系統(tǒng)中的負(fù)調(diào)控蛋白又被稱為阻遏蛋白(repressor)第三十一頁,共七十八頁。二、正調(diào)控與負(fù)調(diào)控調(diào)節(jié)基因RNA調(diào)節(jié)蛋白
正調(diào)節(jié)蛋白+操作子結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄、表達(dá)基因失活,結(jié)構(gòu)基因不表達(dá)(正控制/正調(diào)節(jié)
)
負(fù)調(diào)節(jié)蛋白+操作子結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄、表達(dá)基因失活,結(jié)構(gòu)基因組成型表達(dá)(負(fù)控制/負(fù)調(diào)節(jié))第三十二頁,共七十八頁。根據(jù)調(diào)節(jié)蛋白基因突變失活所產(chǎn)生的后果,可分:隱性的組成型表達(dá)——負(fù)控制系統(tǒng)
結(jié)構(gòu)基因處于不可誘導(dǎo)狀態(tài)——正控制系統(tǒng)
根據(jù)輔因子(小分子)結(jié)合后調(diào)控效果,可分:
開啟調(diào)控系統(tǒng)中結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄活性——誘導(dǎo)
關(guān)閉調(diào)控系統(tǒng)中結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄活性——阻遏
第三十三頁,共七十八頁。操縱子調(diào)控系統(tǒng)的基本類型可誘導(dǎo)負(fù)控制系統(tǒng)可誘導(dǎo)正控制系統(tǒng)可阻遏負(fù)控制系統(tǒng)可阻遏正控制系統(tǒng)第三十四頁,共七十八頁。第三十五頁,共七十八頁。正調(diào)控與負(fù)調(diào)控并非互相排斥的兩種機(jī)制,而是生物體適應(yīng)環(huán)境的需要,有的系統(tǒng)既有正調(diào)控又有負(fù)調(diào)控;
原核生物以負(fù)調(diào)控為主,真核生物以正調(diào)控為主;
降解代謝途徑中既有正調(diào)控又有負(fù)調(diào)控;合成代謝途徑中一般以負(fù)調(diào)控來控制產(chǎn)物自身的合成。
第三十六頁,共七十八頁。如:大腸桿菌乳糖代謝的調(diào)控需要三種酶參加:①.β-半乳糖酶:將乳糖分解成半乳糖和葡萄糖②.滲透酶:增加糖的滲透,易于攝取乳糖和半乳糖③.轉(zhuǎn)乙酰酶:β-半乳糖轉(zhuǎn)變成乙酰半乳糖大量乳糖時(shí):大腸桿菌三種酶的數(shù)量急劇增加,幾分鐘即可達(dá)到千倍以上,這三種酶能夠成比例地增加.乳糖消耗完:這三種酶的合成也即同時(shí)停止.第三十七頁,共七十八頁。三、大腸桿菌乳糖操縱子的負(fù)調(diào)控(可誘導(dǎo))乳糖操縱子的組成:1個(gè)啟動(dòng)子(promoter)、2個(gè)操作子(operator)、3個(gè)結(jié)構(gòu)基因誘導(dǎo)因子:(異乳糖、?-半乳糖苷、異丙基硫代半乳糖苷IPDG)乳糖操縱子突變類型:無誘導(dǎo)因子,組成型表達(dá),突變位點(diǎn)位于調(diào)節(jié)基因和操作子上。第三十八頁,共七十八頁。乳糖操縱元表達(dá)受阻狀態(tài)(缺乏誘導(dǎo)物)Thelactoseoperonintherepressedstate(intheabsenceofaninducer)第三十九頁,共七十八頁。A:乳糖操縱子組成部分;B:野生型基因型(I+O+Z+Y+A+),
無乳糖時(shí),基因不表達(dá);
C.野生型基因型(I+O+Z+Y+A+),
有乳糖時(shí),基因表達(dá);
D.調(diào)節(jié)基因突變(I-O+Z+Y+A+),
無乳糖時(shí),基因組成型表達(dá);
E.操縱基因突變型(I+OcZ+Y+A+),
無乳糖時(shí),基因組成型表達(dá)。第四十頁,共七十八頁。第四十一頁,共七十八頁。順式顯性(cis-dominant):顯性效應(yīng)只對(duì)處于同一染色體上它所調(diào)控的結(jié)構(gòu)基因才起作用的現(xiàn)象,稱為~。如O。P240表9-2第四十二頁,共七十八頁。PstructuralgenesOlacZlacYlacAR
β-半乳糖苷酶β-半乳糖苷通透酶β-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶lacZlacYlacA乳糖操縱子的負(fù)控制-可誘導(dǎo)機(jī)制異乳糖等誘導(dǎo)物阻遏蛋白單體阻遏蛋白四聚體第四十三頁,共七十八頁。四、大腸桿菌乳糖操縱子的正調(diào)控葡萄糖效應(yīng)—培養(yǎng)基中有葡萄糖存在時(shí),即使有乳糖存在,不誘導(dǎo)靶基因表達(dá)。這樣的操縱子稱葡萄糖敏感操縱子。這種效應(yīng)由一種正控制機(jī)制決定。葡萄糖抑制操縱子的原理:
葡萄糖腺苷酸環(huán)化酶活性降低ATP無法轉(zhuǎn)變成cAMP不能形成CAP-cAMP復(fù)合蛋白R(shí)NA酶無法結(jié)合在DNA上結(jié)構(gòu)基因不表達(dá)。
第四十四頁,共七十八頁。無葡萄糖時(shí):ATPcAMPcAMP-CAP復(fù)合物
結(jié)合CAP
乳糖操縱子:兩個(gè)開關(guān)第一:cAMP-CAP復(fù)合物——受葡萄糖影響第二:異乳糖復(fù)合物——受乳糖影響第四十五頁,共七十八頁。第四十六頁,共七十八頁。第三節(jié)其他類型的操縱子一、具有雙啟動(dòng)子的半乳糖操縱子半乳糖(gal)操縱子組成:2個(gè)互相重疊的啟動(dòng)子galP1和galP2、3個(gè)操作子(CAP位點(diǎn)、2個(gè)阻遏蛋白位點(diǎn)(galOe)galOi)、3個(gè)結(jié)構(gòu)基因)galP1依賴cAMP-CAP轉(zhuǎn)錄始于S1
galP2阻遏蛋白調(diào)節(jié)開啟轉(zhuǎn)錄始于S2位于CAP位點(diǎn)內(nèi)位于galE內(nèi)第四十七頁,共七十八頁。正控制可誘導(dǎo)系統(tǒng)(第一系統(tǒng)):
galP1、cAMP-CAP復(fù)合物、cAMP-CAP位點(diǎn)S1無葡萄糖時(shí):ATPcAMPcAMP-CAP復(fù)合物結(jié)合CAP有葡萄糖時(shí):系統(tǒng)關(guān)閉負(fù)控制可誘導(dǎo)系統(tǒng)(第二系統(tǒng)):
galP2、阻遏蛋白-半乳糖復(fù)合物、galOe、galOiS2
無半乳糖:阻遏蛋白結(jié)合操作子——阻遏有半乳糖:復(fù)合物構(gòu)象改變——開啟(從S2開始轉(zhuǎn)錄)CAP位點(diǎn)激活gal操縱子,轉(zhuǎn)錄從S1開始,結(jié)構(gòu)基因表達(dá)第四十八頁,共七十八頁。galEgalTgalKP2S1P1S2a.半乳糖操縱子結(jié)構(gòu)示意圖galEgalTgalKP2S1P1S2b.只有GcAMP-CAPgalactoserepressor雙啟動(dòng)子的半乳糖操縱子galEgalTgalKP2S1P1S2c.只有GalgalEgalTgalKP2S1P1S2c.有Gal有G第四十九頁,共七十八頁。有G,有g(shù)al:1.阻遏2.誘導(dǎo)
無G,無gal:1.誘導(dǎo)2.阻遏:cAMP-CAP與阻遏蛋白競爭無G,有g(shù)al:1.誘導(dǎo)2.誘導(dǎo):高水平表達(dá)
有G,無gal:1.阻遏2.阻遏第五十頁,共七十八頁。二、阿拉伯糖操縱子的雙向控制Ara操縱子是控制分解代謝途徑的另一調(diào)控系統(tǒng)。特點(diǎn):調(diào)節(jié)蛋白既可起正調(diào)控作用,又可起負(fù)調(diào)控作用。組成:R:araC基因編碼調(diào)節(jié)蛋白AraC蛋白;O:O1不參與調(diào)控;O2:AraC蛋白負(fù)調(diào)控結(jié)合位點(diǎn);I:調(diào)節(jié)位點(diǎn),CAP-cAmP復(fù)合物結(jié)合位點(diǎn),AraC蛋白正調(diào)控結(jié)合位點(diǎn)。第五十一頁,共七十八頁。調(diào)控:①.誘導(dǎo)物阿拉伯糖和cAMP同時(shí)存在:Ara與AraC蛋白復(fù)合物結(jié)合在I位點(diǎn),CAP-cAmp復(fù)合物結(jié)合I位點(diǎn),基因轉(zhuǎn)錄開啟;②.在沒有誘導(dǎo)物阿拉伯糖和cAMP時(shí):AraC蛋白同時(shí)與I和O2結(jié)合,DNA構(gòu)型發(fā)生改變,形成一個(gè)緊密的環(huán)結(jié)構(gòu),抑制表達(dá)。第五十二頁,共七十八頁。第五十三頁,共七十八頁。三、色氨酸操縱子的轉(zhuǎn)錄調(diào)控及衰減作用1.色氨酸操縱子模型:
由雅各布(JacobF.)和莫諾(MonodJ.)提出,具有合成代謝途徑典型的操縱子模型。
操縱子:包括色氨酸合成有關(guān)的5種酶的結(jié)構(gòu)基因;
大量色氨酸時(shí):大腸桿菌5種酶的轉(zhuǎn)錄同時(shí)受到抑制;
色氨酸不足時(shí):這5種酶的基因開始轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)錄;
色氨酸:作為阻遏物而不是誘導(dǎo)物參與調(diào)控結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄。
∴trp操縱子是一個(gè)典型的可阻遏操縱元模型(repressibleoperon)。第五十四頁,共七十八頁。色氨酸操縱子模型結(jié)構(gòu):
5種結(jié)構(gòu)基因:trpE、D、C、B、A;
調(diào)控結(jié)構(gòu):啟動(dòng)子、操縱子、前導(dǎo)序列、弱化子;
阻遏物trpR基因:與trp操縱子相距較遠(yuǎn);第五十五頁,共七十八頁。2.色氨酸操縱子的負(fù)調(diào)控:
⑴.阻遏調(diào)控:
trpR基因編碼無輔基阻遏物與色氨酸結(jié)合形成有活性的色氨酸阻遏物與操作子結(jié)合阻止轉(zhuǎn)錄;
色氨酸不足:阻遏物三維空間結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,不能與操作子結(jié)合,操縱元開始轉(zhuǎn)錄;
色氨酸濃度升高:色氨酸與阻遏物結(jié)合,空間結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,可與操作子結(jié)合,阻止轉(zhuǎn)錄。第五十六頁,共七十八頁。⑵.弱化子調(diào)控:
當(dāng)有色氨酸存在而trp操縱子受抑制時(shí),仍有一段前導(dǎo)序列發(fā)生轉(zhuǎn)錄,可能存在另一種的機(jī)制來抑制trp操縱元的轉(zhuǎn)錄。
色氨酸高濃度存在時(shí),轉(zhuǎn)錄的前導(dǎo)序列140bp長,其中有一28bp的弱化子區(qū)域;形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),為內(nèi)部終止子,RNA酶從DNA上脫落,不能轉(zhuǎn)錄;
色氨酸低濃度或不存在時(shí),RNA聚合酶能通過弱化子區(qū)域,轉(zhuǎn)錄完整的多順反子mRNA序列;第五十七頁,共七十八頁。問題:弱化子如何進(jìn)行調(diào)控?前導(dǎo)序列可翻譯出一段14個(gè)氨基酸的短肽,在該短肽的第10、11位置上是兩個(gè)色氨酸密碼子;兩個(gè)密碼子之后是一段mRNA序列,該序列可分為四個(gè)區(qū)段,區(qū)段間可互補(bǔ)配對(duì),形成不同的二級(jí)結(jié)構(gòu)。原核生物為邊轉(zhuǎn)錄邊翻譯,前導(dǎo)序列中核糖體位置決定形成哪種二級(jí)結(jié)構(gòu),從而決定弱化子是否可形成終止信號(hào)。第五十八頁,共七十八頁。①.當(dāng)有色氨酸時(shí),完整翻譯短肽核糖體停留在終止密碼子處,鄰近區(qū)段2位置阻礙了2,3配對(duì)使3,4區(qū)段配對(duì)形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)終止子RNA酶在弱化子處終止,不能向前移動(dòng)。
第五十九頁,共七十八頁。②.如缺乏色氨酸,核糖體到達(dá)色氨酸密碼子時(shí)由于沒有色氨酰tRNA的供應(yīng)停留在該密碼子位置,位于區(qū)段1使區(qū)段2與區(qū)段3配對(duì)區(qū)段4無對(duì)應(yīng)序列配對(duì)呈單鏈狀態(tài)RNA聚合酶通過弱化子,繼續(xù)向前移動(dòng),轉(zhuǎn)錄出完整的多順反子序列。第六十頁,共七十八頁。第六十一頁,共七十八頁。衰減作用的生物學(xué)意義
從衰減機(jī)制的分析來看,它不僅能夠把幾種水平如DNA和RNA的構(gòu)象變化、mRNA上內(nèi)部終止(衰減)子的重建以及核糖體上tRNA對(duì)終止密碼的識(shí)別等統(tǒng)一起來,嚴(yán)格控制表達(dá),而且衰減子還可依細(xì)胞內(nèi)某一氨基酸水平的高低而行止。所以它是一種應(yīng)答靈敏、調(diào)節(jié)靈活的多重調(diào)控方式。第六十二頁,共七十八頁。
就像在色氨酸操縱子中,阻遏作用與衰減機(jī)制一起協(xié)同控制其基因表達(dá),顯然比單一的阻遏負(fù)調(diào)控系統(tǒng)更為有效。一方面,當(dāng)有活性的阻遏物向無活性阻遏物的轉(zhuǎn)變速度極低時(shí).衰減系統(tǒng)能更迅速地作出反應(yīng),使色氨酸從較高濃度快速下降到中等濃度;
第六十三頁,共七十八頁。
另一方面,若外源色氨酸濃度實(shí)在太低,細(xì)菌本身又沒有其他的內(nèi)源性色氨酸合成體系,以致細(xì)菌難以支持自身的生長時(shí),就需要有衰減體系加以調(diào)節(jié)——通過不終止mRNA的合成來增加Trp酶的合成從而提高內(nèi)源色氨酸的濃度。第六十四頁,共七十八頁??梢姡核p機(jī)制在控制基因產(chǎn)物的量和產(chǎn)物種類的配比上起著快速靈敏的調(diào)節(jié)作用,使操縱基因表達(dá)更為精密、高效。第六十五頁,共七十八頁。第四節(jié)λ噬菌體基因組的表達(dá)調(diào)控第六十六頁,共七十八頁。第五節(jié)DNA重組對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控在某些細(xì)菌中,特定基因的表達(dá)與基因組內(nèi)DNA重排有關(guān)。如沙門氏菌具有運(yùn)動(dòng)鞭毛,它是由許多相同的鞭毛蛋白亞基裝配而成。沙門氏菌含有兩個(gè)不同的結(jié)構(gòu)基因H1和H2,它們編碼不同的鞭毛蛋白。第六十七頁,共七十八頁。H1基因表達(dá)則產(chǎn)生Hl型鞭毛蛋白,這時(shí)細(xì)菌就處于I相(Phasel);若是H2基因表達(dá)就產(chǎn)生H2鞭毛蛋白,細(xì)菌處于Ⅱ相(PhaseⅡ)。處于I相的細(xì)菌生長時(shí),其中少數(shù)細(xì)菌以103/每次細(xì)胞分裂的頻率而自發(fā)轉(zhuǎn)變?yōu)棰蛳嗉?xì)菌;處于Ⅱ相的細(xì)菌也以同樣的頻率轉(zhuǎn)變?yōu)镮相細(xì)菌,這一過程稱為相變(phasewariation)第六十八頁,共七十八頁。H2基因與另一個(gè)基因rH1緊密連鎖,同屬于一個(gè)操縱子。并協(xié)同表達(dá)。rHl編碼Hl基因的阻遏蛋白.當(dāng)H2和rH1表達(dá)時(shí),由于rHl阻遏物阻止了H1基因的表達(dá).就只合成H2鞭毛蛋白。如果H2基因和rHl基因被關(guān)閉不表達(dá),這時(shí)H1基因便表達(dá),合成Hl鞭毛蛋白。第六十九頁,共七十八頁。
相變的控制取決于含H2和rHl基因操縱子的啟動(dòng)基因所處的狀態(tài)。含有啟動(dòng)基因在內(nèi)的上游DNA長995核苷酸對(duì),兩邊各有一段長14核苷酸對(duì)的重復(fù),即IRL和IRR。H2基因的起始密碼子開始于IRR右邊的第17核苷酸對(duì)處,IRL和IRR之間的序列含有基因hin,它的產(chǎn)物是相變酶,可催化這段995核昔酸對(duì)序列發(fā)生包括hin基因在內(nèi)的倒位。第七十頁,共七十八頁。另外,在倒位前這段序列的第950一983核昔酸對(duì)區(qū)還含有一個(gè)促進(jìn)下游基因轉(zhuǎn)錄的啟動(dòng)子(p),它使H2和rH1基因表達(dá),于是細(xì)胞處于Ⅱ相。當(dāng)發(fā)生倒位以后,這個(gè)啟動(dòng)子便被移到序列的另一方,且方向改為朝左,H2和rH1失去啟動(dòng)子而失活,這時(shí)細(xì)胞內(nèi)沒有rH1阻遏蛋白,因而H1基因表達(dá),細(xì)胞轉(zhuǎn)變成I相。一旦這段DNA倒位依復(fù)原狀,細(xì)胞又將轉(zhuǎn)變?yōu)棰蛳唷5谄呤豁?,共七十八頁。沙門氏菌H1或H2基因選擇性表達(dá)及其調(diào)控第七十二頁,共七十八頁。這種鞭毛相的變化為何不能用基因突變來解釋?因?yàn)榈谝贿@種變化只發(fā)生在兩種鞭毛蛋白類型的相互轉(zhuǎn)變,而沙門氏菌的鞭毛蛋白類型有十幾種之多,如果是基因突變,那么也應(yīng)出現(xiàn)其他類型的鞭毛蛋白。再者,這種變化發(fā)生的頻率很高,從每代每105個(gè)細(xì)胞中改變一個(gè)到每代每103個(gè)細(xì)胞中改變一個(gè);第三,實(shí)驗(yàn)證明:相變的實(shí)質(zhì)是Hl或H2基因選擇性表達(dá)的結(jié)果。第七十三
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