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文檔簡介
第五章
核苷酸
提要
一、堿基
二、核苷
三、核苷酸
堿基
嘧啶
①胞嘧啶(DNA,RNA)②尿嘧啶(RNA)③胸腺嘧啶(DNA)嘌呤
①腺嘌呤(DNA,RNA)②鳥嘌呤(DNA,RNA)嘧啶環(huán)和嘌呤環(huán)的編號以及各種堿基的化學(xué)結(jié)構(gòu)
茶堿和咖啡因的化學(xué)結(jié)構(gòu)
堿基的性質(zhì)
?堿基幾乎不溶于水,這與其芳香族的雜環(huán)結(jié)構(gòu)有關(guān)。
?互變異構(gòu)
?酸堿解離
?強(qiáng)烈的紫外吸收,其最大吸收值在260nm。
堿基的互變異構(gòu)
核糖和脫氧核糖
?D-核糖
存在于RNA?2-脫氧-D-核糖
存在于DNA?差別:-2'-OHvs2'-H?這種差別影響到二級結(jié)構(gòu)和穩(wěn)定性。
核苷
?核苷是由戊糖和堿基通過β-N糖苷鍵形成的糖苷。核苷中的戊糖有D-核糖和2-脫氧-D-核糖兩種,它們都以呋喃型環(huán)狀結(jié)構(gòu)存在。前者形成核糖核苷,后者形成脫氧核苷。核苷中的糖苷鍵由戊糖的異頭體C原子與嘧啶堿基的N1或嘌呤堿基N9形成。為了避免堿基環(huán)上原子的編號與呋喃糖環(huán)上原子編號混淆,在呋喃環(huán)上各原子編號的阿拉伯?dāng)?shù)字后需加“′”.
?在核苷中,堿基在糖苷鍵上的旋轉(zhuǎn)受到空間位阻的限制。結(jié)果核苷和核苷酸能以順式和反式兩種構(gòu)象存在。順式核苷的堿基與戊糖環(huán)在同一個(gè)方向,反式核苷的堿基與戊糖環(huán)在相反的方向。
?由于嘧啶環(huán)O2和戊糖環(huán)C5′之間的空間位阻,嘧啶核苷通常為反式構(gòu)象。嘌呤核苷可采取兩種構(gòu)象。自由的嘌呤核苷(特別是鳥苷)更容易形成順式構(gòu)象,但是,DNA和RNA螺旋中的嘌呤核苷主要為反式構(gòu)象。
嘧啶核苷和嘌呤核苷的化學(xué)結(jié)構(gòu)
幾種修飾核苷
核苷酸
?核苷酸是核苷的戊糖羥基的磷酸酯。核糖核苷的磷酸酯為核糖核苷酸,脫氧核苷的磷酸酯為脫氧核苷酸。理論上,核苷的5′-OH、3′-OH和2′-OH均可以被磷酸化而分別形成核苷-5′-磷酸、核苷-3′-磷酸和核苷-2′-磷酸。但是,自然界的核苷酸多為核苷-5′-磷酸。
?核苷單磷酸(NMP)是指核苷的單磷酸酯。核苷單磷酸可以通過一次成酐反應(yīng)形成核苷二磷酸(NDP)。核苷二磷酸再通過一次成酐反應(yīng)生成核苷三磷酸(NTP)。為了將核苷二磷酸和核苷三磷酸上不同的磷酸根區(qū)分開來,將直接與戊糖5′-羥基相連的磷酸定為α磷酸根,其余兩個(gè)磷酸根從里到外依次被稱為β磷酸根和γ磷酸根。
常見的核糖核苷酸的化學(xué)結(jié)構(gòu)
AMP、ADP和ATP環(huán)核苷酸的化學(xué)結(jié)構(gòu)
核苷酸的生物功能
①能量貨幣,通常是ATP,有時(shí)使用UTP(糖原合成)、CTP(磷脂合成)和GTP(蛋白質(zhì)合成);
②核酸合成的前體:NTP→RNA,dNTP→DNA;
③信息傳導(dǎo),例如cAMP和cGMP作為某些激素的第二信使,鳥苷酸能構(gòu)調(diào)節(jié)G蛋白的活性;
④作為其它物質(zhì)的前體或輔酶/輔基的成分,如ADP為輔酶I和II的組分,鳥苷酸作為第一類內(nèi)含子的輔酶;
⑤活化的中間物,如UDPGlc和CDP-乙醇胺分別參與糖原和磷脂酰乙醇胺的合成;
⑥作為酶的別構(gòu)效應(yīng)物參與代謝的調(diào)節(jié),如ATP為磷酸果糖激酶-1的負(fù)別構(gòu)效應(yīng)物,AMP作為糖原磷酸化酶的正別構(gòu)效應(yīng)物;⑦調(diào)節(jié)基因表達(dá)。例如鳥苷-5‘
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