




版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶(hù)提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡(jiǎn)介
經(jīng)典word整理文檔,僅參考,轉(zhuǎn)Word此處可刪除頁(yè)眉頁(yè)腳。本資料屬于網(wǎng)絡(luò)整理,如有侵權(quán),請(qǐng)聯(lián)系刪除,謝謝!PrimerPremier5.0是由加拿大的Premier公司開(kāi)發(fā)的專(zhuān)業(yè)用于PCR或測(cè)序引物軟件,和PlasmidPremier2.02一起是該公司推出的最新的軟件產(chǎn)品。其主要界面同樣也是分為序列編輯窗口(Genetank),引物設(shè)計(jì)窗口(PrimerDesign),酶切分析窗口(RestrictionSites)和紋基分析窗口(Motif)。這里我們主要介紹其引物設(shè)計(jì)功能,其他功能的介紹請(qǐng)參看PlasmidPremier2.02。打開(kāi)程序首先進(jìn)入的是序列編輯參看,與PlasmidPremier相比,用戶(hù)進(jìn)行校正,保證輸入的正確和快速。點(diǎn)擊該界面的按鈕即可進(jìn)入到程序的引物設(shè)計(jì)窗口。5括給引物的打分,引物以及產(chǎn)物的起始位置、長(zhǎng)度、Tm值、GC%消光系數(shù)、簡(jiǎn)間二聚體結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè),左邊是顯示是否存在以上各種對(duì)PCR擴(kuò)增有影響的結(jié)構(gòu),出可靠的評(píng)價(jià)。PCR引物的范圍,以及最終PCR產(chǎn)物的長(zhǎng)度和引物的長(zhǎng)度等。并通過(guò)來(lái)點(diǎn)擊按鈕來(lái)設(shè)置一些搜尋參數(shù):這些參數(shù)包括引物的Tm值,GC比,有簡(jiǎn)并性堿基,3’端穩(wěn)定性,引物的穩(wěn)定性,重復(fù)序列,二聚體/發(fā)卡結(jié)構(gòu)和與模板及可能的雜質(zhì)DNA(需要從另外本身根據(jù)一定的標(biāo)準(zhǔn)分成從極高嚴(yán)謹(jǐn)性到極低嚴(yán)謹(jǐn)性5一步搜尋。搜尋到引物結(jié)果最終顯示在下面的窗口中:rating示引物的各種信息。包括其各種參數(shù)和各種可能存在的不利結(jié)構(gòu)。其中用File菜單中的Parameter命令可以對(duì)系統(tǒng)參數(shù),PCR反應(yīng)條件和程序打件按照引物濃度,單價(jià)離子濃度,Mg離子濃度,Na鹽濃度等。而打分系統(tǒng)是參照的以下公式:利用該打分系統(tǒng)可以為對(duì)引物進(jìn)行有效評(píng)估和和在引物之間進(jìn)行對(duì)比選擇提供有效的有效的依據(jù)。最后還可以在利用引物編輯窗口對(duì)程序自動(dòng)找到的或手工找到的再次搜尋找出其最合適的引發(fā)位置。種數(shù)據(jù)報(bào)告,主要通過(guò)Report菜單和Graph菜單中命令來(lái)實(shí)現(xiàn):另外,PrimerPremier在引物設(shè)計(jì)上一個(gè)比較獨(dú)到的功能,就是能輔助進(jìn)行巢式PCR引物設(shè)計(jì),在首先進(jìn)行了引物自動(dòng)搜索后,即可通過(guò)Function菜單中Multiplex/NestedPrimer命令進(jìn)入巢式PCR引物設(shè)計(jì),通過(guò)點(diǎn)中代表各個(gè)引物來(lái)判斷引物是否適合于作為巢式PCR的引物。另外該菜單中的Database命令可以讓用戶(hù)建立自己的引物數(shù)據(jù)庫(kù),方便于查找和對(duì)照。整體而言,PrimerPremier這個(gè)軟件在引物設(shè)計(jì)方面還是比較優(yōu)秀的,能PCR的影響還需要根據(jù)錯(cuò)配是否發(fā)生在引物的3’來(lái)判斷,3’發(fā)生的錯(cuò)配要比其他位置的錯(cuò)配對(duì)引物的引發(fā)效方面程序未能進(jìn)行量化,只有通過(guò)用戶(hù)根據(jù)經(jīng)驗(yàn)判斷;另外,程序?qū)τ诋a(chǎn)物的Tm值和引物Tm值之間的差異也為能給出評(píng)價(jià),如果二者差異較大(如>22℃
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶(hù)所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 人人文庫(kù)網(wǎng)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶(hù)上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶(hù)上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶(hù)因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 網(wǎng)絡(luò)工程師考試知識(shí)準(zhǔn)備與2025年試題答案指南
- 如何看待社會(huì)暴力與政治沖突的關(guān)系試題及答案
- 未來(lái)問(wèn)題西方政治制度的治理理論與實(shí)踐試題及答案
- 西方的公民權(quán)利與政治參與機(jī)會(huì)試題及答案
- 軟考網(wǎng)絡(luò)工程師重點(diǎn)考點(diǎn)試題及答案
- 機(jī)電工程模擬實(shí)習(xí)題目試題及答案
- 2024年獨(dú)立運(yùn)行風(fēng)力發(fā)電機(jī)組控制器及逆變器資金申請(qǐng)報(bào)告代可行性研究報(bào)告
- 西方女性在政治中的影響試題及答案
- 機(jī)電工程市場(chǎng)需求試題及答案
- 網(wǎng)絡(luò)安全問(wèn)題的應(yīng)對(duì)措施與試題及答案
- 植物的植物生物技術(shù)
- 醫(yī)院檢驗(yàn)科實(shí)驗(yàn)室生物安全管理手冊(cè)
- 公交車(chē)司機(jī)急救培訓(xùn)課件
- 慢性阻塞性肺疾病的緊急救治與護(hù)理細(xì)節(jié)
- DB53-T 1215-2023 陸生野生動(dòng)物收容救護(hù)技術(shù)規(guī)范
- 第二批罕見(jiàn)病目錄2023版
- GB/T 15231-2023玻璃纖維增強(qiáng)水泥性能試驗(yàn)方法
- 虛擬維護(hù)助手-使用VR技術(shù)幫助維護(hù)人員進(jìn)行設(shè)備維修和保養(yǎng)
- 印章移交清單
- 豬病防治考試復(fù)習(xí)題庫(kù)(含答案)
- 籃球興趣班訓(xùn)練計(jì)劃
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論