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文檔簡介
乳糖操縱子的調(diào)控機(jī)理乳糖操縱子的調(diào)控機(jī)理乳糖操縱子的調(diào)控機(jī)理基因表達(dá)主要包括(基因)轉(zhuǎn)錄和(蛋白質(zhì))翻譯使信息分子DNA轉(zhuǎn)變成有功能蛋白質(zhì)的過程,這一過程在體內(nèi)受到精密的調(diào)控,以保證功能的有序性。這一調(diào)控稱為基因表達(dá)的調(diào)控,簡稱基因調(diào)控?;虮磉_(dá)過程分為基因活化、轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后加工、翻譯、翻譯后加工等階段。在上述各環(huán)節(jié)都存在基因表達(dá)調(diào)控的控制點(diǎn)?;虮磉_(dá)調(diào)控2020/11/32
基因表達(dá)主要包括(基因)轉(zhuǎn)錄和(蛋白質(zhì))翻譯使信息分子DNA轉(zhuǎn)變成有功能蛋白質(zhì)的過程,這一過程在體內(nèi)受到精密的調(diào)控,以保證功能的有序性。這一調(diào)控稱為基因表達(dá)的調(diào)控,簡稱基因調(diào)控?;虮磉_(dá)過程分為基因活化、轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后加工、翻譯、翻譯后加工等階段。在上述各環(huán)節(jié)都存在基因表達(dá)調(diào)控的控制點(diǎn)?;虮磉_(dá)調(diào)控2020/11/32
2020/11/33
基因表達(dá)及其調(diào)控的特點(diǎn)組成性基因表達(dá)(constitutivegeneexpression)管家基因的表達(dá)方式,較少受環(huán)境影響,在個(gè)體各生長階段的幾乎全部組織中持續(xù)表達(dá)或變化很小。管家基因(housekeepinggene)在一個(gè)生物個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá)的基因。2020/11/34
誘導(dǎo)表達(dá)(inductionexpression)有一些基因表達(dá)極易受環(huán)境影響,在特定環(huán)境信號(hào)刺激下,基因的表達(dá)開放或增強(qiáng)。阻遏表達(dá)(repressionexpression)在特定環(huán)境信號(hào)刺激下,基因的表達(dá)關(guān)閉或減弱。協(xié)調(diào)表達(dá):在生物體內(nèi),各種代謝途徑有條不紊地進(jìn)行,這是在一定機(jī)制控制下,功能相關(guān)的一組基因,協(xié)調(diào)一致,共同表達(dá)。2020/11/35
基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義適應(yīng)環(huán)境、維持生長和增殖維持個(gè)體發(fā)育與分化基因表達(dá)調(diào)控的環(huán)節(jié):基因活化、轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后加工、翻譯、翻譯后加工2020/11/36
第一節(jié)原核生物基因表達(dá)調(diào)控一、轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是原核生物的主要調(diào)控環(huán)節(jié)
原核生物基因多以操縱子形式存在。操縱子由調(diào)控區(qū)和信息區(qū)組成。上游調(diào)控區(qū)包括啟動(dòng)子與操縱元件二部分。啟動(dòng)子是同RNA聚合酶結(jié)合并啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的特異性DNA序列,操縱元件是特異的阻遏物結(jié)合區(qū)。2020/11/37
影響原核生物轉(zhuǎn)錄的因素
1、啟動(dòng)子
2、σ因子的種類與濃度
3、阻遏蛋白
4、正調(diào)控蛋白
5、倒位蛋白通過DNA重組倒位而調(diào)節(jié)基因表達(dá)
6、衰減子
7、RNA聚合酶抑制物2020/11/38
1、啟動(dòng)子促進(jìn)DNA轉(zhuǎn)錄的DNA順序,是DNA分子上可與RNApol結(jié)合并使之轉(zhuǎn)錄的部位。又稱啟動(dòng)基因,但啟動(dòng)子本身不被轉(zhuǎn)錄。
如E.coli啟動(dòng)子全長約40∽60bp,3個(gè)功能部位,2個(gè)重要功能:(1)起始部位:轉(zhuǎn)錄合成的第一個(gè)互補(bǔ)堿基對(duì),用+1表示,左為上游,右為下游,用負(fù)、正表示,沒有O的位置。(2)結(jié)合部位:
RNApol與啟動(dòng)子結(jié)合位置,位于-10bp,同源性強(qiáng),又稱TATAbox或pribnow盒。(3)識(shí)別部位:位于-35bp,RNApol識(shí)別啟動(dòng)子部位,保守性極強(qiáng)。2020/11/39
(1)決定轉(zhuǎn)錄方向及那一條DNA鏈作模板。(以信息鏈的互補(bǔ)鏈作模板,轉(zhuǎn)錄mRNA與信息鏈一致)(2)決定轉(zhuǎn)錄效率。E.coli啟動(dòng)子,在-35、-10的兩個(gè)區(qū)序列稱為一致性序列。通過比較大量的E.coli啟動(dòng)子,表明這兩個(gè)序列中各堿基的出現(xiàn)頻率為-35區(qū):TGACA;-10區(qū):TATAAT。如果某一個(gè)啟動(dòng)子與上述序列越接近,基因的轉(zhuǎn)錄效率越強(qiáng)。反之就弱。啟動(dòng)子功能::2020/11/310原核生物轉(zhuǎn)錄起始區(qū)的一致性序列2020/11/311
2、σ因子的種類與濃度不同的因子σ可以競爭性的結(jié)合RNA聚合酶,環(huán)境變化可產(chǎn)生特定的σ因子,從而打開一套特定的基因。通過對(duì)大腸桿菌基因組序列分析后,發(fā)現(xiàn)存在6種σ因子,并根據(jù)其相對(duì)分子質(zhì)量的大小或編碼基因進(jìn)行命名。σ因子σ70σ54σ38σ32σ28σ24編碼基因rpoDrpoNrpoHrpoSrpoFrpoE主要功能參與碳代謝過程基因的調(diào)控參與多數(shù)氮源利用基因的調(diào)控參與分裂間期特異基因表達(dá)調(diào)控?zé)狍w克基因的表達(dá)調(diào)控鞭毛趨化相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控過渡熱休克基因的表達(dá)調(diào)控2020/11/312
3、阻遏蛋白阻遏蛋白是一類在轉(zhuǎn)錄水平對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)生負(fù)調(diào)控作用的蛋白質(zhì)。根據(jù)其作用特征可分為負(fù)控誘導(dǎo)和負(fù)控阻遏二大類。在負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)中,阻遏蛋白不與效應(yīng)物(誘導(dǎo)物)結(jié)合時(shí),結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄;在負(fù)控阻遏系統(tǒng)中,阻遏蛋白與效應(yīng)物結(jié)合時(shí),結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄。阻遏蛋白作用部位是操縱區(qū)。2020/11/313
4、正調(diào)控蛋白正調(diào)控蛋白結(jié)合于特異DNA序列后,具有促進(jìn)基因的轉(zhuǎn)錄,這種基因表達(dá)調(diào)控的方式稱為正調(diào)控。根據(jù)正調(diào)控蛋白的作用性質(zhì)分為正控誘導(dǎo)系統(tǒng)和正控阻遏系統(tǒng)。在正控誘導(dǎo)系統(tǒng)中,效應(yīng)物分子(誘導(dǎo)物)的存在使正調(diào)控蛋白處于活性狀態(tài);在正控阻遏系統(tǒng)中,效應(yīng)物分子的存在使激活蛋白處于非活性狀態(tài)。2020/11/314
5、倒位蛋白通過DNA重組倒位而調(diào)節(jié)基因表達(dá)倒位蛋白是一種位點(diǎn)特異性的重組酶。2020/11/315
6、衰減子
衰減子又稱為弱化子,位于一些操縱子中第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因之前,是一段能減弱轉(zhuǎn)錄作用的序列。如色氨酸操縱子序列內(nèi)含有一段衰減子序列.7、RNA聚合酶抑制物細(xì)菌在缺乏氨基酸的環(huán)境中,RNA聚合酶活性降低,RNA(rRNA,tRNA)合成減少或停止,這種現(xiàn)象稱為嚴(yán)謹(jǐn)反應(yīng)。機(jī)制:當(dāng)氨基酸缺乏時(shí),游離核糖體與空載的tRNA增加,在ATP存在下,產(chǎn)生pppGpp和ppGpp,后者與RNA聚合酶結(jié)合形成復(fù)合物,進(jìn)而使RNA聚合酶構(gòu)象變化,活性降低。2020/11/316
二、轉(zhuǎn)錄的調(diào)控機(jī)制在大腸桿菌的許多操縱子中,基因的轉(zhuǎn)錄不是由單一因子調(diào)控的,而是通過負(fù)調(diào)控因子和正調(diào)控因子進(jìn)行復(fù)合調(diào)控的。比較典型的是一些糖代謝有關(guān)的操縱子。乳糖操縱子調(diào)控的機(jī)制阿拉伯糖操縱子的調(diào)控機(jī)制色氨酸操縱子的調(diào)控機(jī)制2020/11/317
操縱子模型的提出
—莫洛(Monod)和雅各布(Jacob)
獲1965年諾貝爾生理學(xué)和醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)2020/11/318
(1)人們?cè)缭谏蟼€(gè)世紀(jì)初就發(fā)現(xiàn)了酵母中酶的誘導(dǎo)現(xiàn)象。即分解底物的酶只有底物存在時(shí)才出現(xiàn)。酶受底物的誘導(dǎo),這種可誘導(dǎo)現(xiàn)象在細(xì)菌中普遍存在。在培養(yǎng)基中加入適合底物-乳糖或半乳糖后2~3分鐘,β一半乳糖苷酶可迅速達(dá)到5000個(gè)酶分子,增加了1000倍,占細(xì)菌蛋白總量的5~10%。(β一半乳糖苷酶水解乳糖→半乳糖+葡萄糖2個(gè)單糖)。
若撤消底物,該酶合成迅速停止,就象當(dāng)初迅速合成一樣。從60年代乳糖操縱子模型提出→1966年分離得到該操縱子的阻遏蛋白→1975年乳糖操縱子的堿基序列已全部測(cè)定清楚了。1.乳糖操縱子的調(diào)控機(jī)理(可誘導(dǎo)的操縱子)2020/11/319
(2)乳糖操縱子(Lactoseoperon,Lacoperon)結(jié)構(gòu)示意圖
CAPCAMPIPOZYA結(jié)構(gòu)基因區(qū)(信息區(qū))RNApol調(diào)控區(qū)調(diào)控區(qū)I-調(diào)節(jié)基因P-啟動(dòng)子O-操縱基因(OP有一定的重疊)CAP結(jié)合位點(diǎn)結(jié)構(gòu)基因Z-β半乳糖苷酶基因(β-galactosidase)Y-半乳糖苷透酶(乳糖透酶)(β-galotosideporinerase)A-硫代半乳糖轉(zhuǎn)乙?;福╰ransacetylase)2020/11/320(3)調(diào)控機(jī)理
乳糖操縱子的轉(zhuǎn)錄起始受到CAP和阻遏蛋白的雙重調(diào)控,即正、負(fù)調(diào)控。
①CAP(正控):通過結(jié)合到啟動(dòng)子上游CAP結(jié)合位點(diǎn),促進(jìn)RNApol與P的結(jié)合,才能有效的轉(zhuǎn)錄,原因是:
Lacp是弱啟動(dòng)子,與一致序列的差異極大,CAP位點(diǎn)結(jié)合cAMP-CAP復(fù)合物后,改變了RNApol空間結(jié)構(gòu),增強(qiáng)了RNApol與P的結(jié)合的牢固性。所以CAP是Lacoperon的正控因子。
②阻遏蛋白(負(fù)控)調(diào)節(jié)基因I(除Lacoperon用I外,其余均用R)產(chǎn)生的阻遏蛋白結(jié)合到操縱基因O上,由于啟動(dòng)子p與操縱基因有一定的重疊,妨礙RNApol與P的結(jié)合,就抑制了結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄,誘導(dǎo)物(或稱效應(yīng)物)可以去阻遏,實(shí)現(xiàn)對(duì)基因的轉(zhuǎn)錄,這是Lacoperon的負(fù)控機(jī)制。2020/11/321
CAP結(jié)合到CAP位點(diǎn)發(fā)揮正控作用,乳糖誘導(dǎo)去阻遏,這樣1個(gè)操縱子中的1組基因就有2道開關(guān),只有2道開關(guān)同時(shí)打開時(shí),基因才能轉(zhuǎn)錄。2個(gè)CAP分子和RNApol在Lacp一致序列上排列CAPCAP-35RNApol-10IPOZYADNAmRNA阻遏蛋白效應(yīng)物(半乳糖)ZYA基因產(chǎn)物(酶)CAP2020/11/322
細(xì)菌優(yōu)先利用葡萄糖(G)-葡萄糖效應(yīng)如果細(xì)菌生長環(huán)境中,乳糖、葡萄糖同時(shí)存在,盡管有誘導(dǎo)物乳糖存在,但細(xì)菌優(yōu)先利用葡萄糖,不予理睬乳糖,在G耗盡之前,Lacoperon也不會(huì)表達(dá)。也就是說G阻礙了Lacoperon的表達(dá)。這種G效應(yīng)在半乳糖、阿拉伯糖操縱子中也存在。
G效應(yīng)的原因是:①G降解代謝產(chǎn)物可以抑制腺苷環(huán)化酶、激活磷酸二酯酶,結(jié)果使胞內(nèi)cAMP下降;CAP的正調(diào)控需要結(jié)合cAMP形成復(fù)合物才能結(jié)合到CAP結(jié)合位點(diǎn);②當(dāng)G耗盡,cAMP開始集累↑,cAMP和CAP結(jié)合→使CAP變構(gòu)才能結(jié)合到CAP結(jié)合位點(diǎn)上,促進(jìn)RNApol與P結(jié)合。
2020/11/323
結(jié)合乳糖、葡萄糖存在與否及與操縱子正、負(fù)控因素、基因開放與關(guān)閉情況如下:葡萄糖(G)乳糖基因開放基因關(guān)閉機(jī)理簡述(學(xué)生填充)
×√√CAP正控、乳糖去阻遏、基因開放、轉(zhuǎn)錄進(jìn)行
××√不能誘導(dǎo)去阻遏,CAP即使結(jié)合,基因未開放√×√細(xì)菌優(yōu)先用G,無CAP結(jié)合,無誘導(dǎo)去阻遏√√√cAMP-CAP復(fù)合物無,CAP位點(diǎn)空,乳糖去阻遏,基因未開放①②③④2020/11/3242.色氨酸操縱子(trpoperon)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)E.coli的色氨酸操縱子有五個(gè)結(jié)構(gòu)基因E、D、C、B、A基因編碼三種酶,用于合成色氨酸,上游調(diào)控區(qū)由啟動(dòng)子(P)和操縱基因(O)組成調(diào)節(jié)基因R:編碼阻遏蛋白2020/11/325
2020/11/326
無色氨酸—操縱子基因開始轉(zhuǎn)錄,此后轉(zhuǎn)錄速率受轉(zhuǎn)錄衰減機(jī)制(attenuation)調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)基因與O之間有一個(gè)L基因,在L基因內(nèi)存在一個(gè)衰減子。衰減子:有4段特殊的序列,可形成不依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)。前導(dǎo)肽編碼區(qū)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中含兩個(gè)相鄰的色氨酸密碼子,這兩個(gè)密碼子以及原核生物中轉(zhuǎn)錄與翻譯偶聯(lián)是產(chǎn)生衰減作用的基礎(chǔ)。1234終止密碼前導(dǎo)肽編碼區(qū)UUUUU四個(gè)片段之間形成發(fā)夾能力:1/2>2/3>3/4,四個(gè)片段形成何種發(fā)夾結(jié)構(gòu),是由L基因轉(zhuǎn)錄物的翻譯過程控制的。2020/11/327
當(dāng)有色氨酸時(shí)無色氨酸時(shí)2020/11/328
色氨酸操縱子中的操縱基因和衰減子可以起雙重負(fù)調(diào)節(jié)作用。衰減子可能比操縱基因更靈敏,只要色氨酸一增多,即使不足以誘導(dǎo)阻遏蛋白結(jié)合操縱基因,就足可以使大量的mRNA提前終止。反之,當(dāng)色氨酸減少時(shí),即使失去了誘導(dǎo)阻遏蛋白的阻遏作用,但只要還可以維持前導(dǎo)肽的合成,仍繼續(xù)阻止轉(zhuǎn)錄。這樣可以保證細(xì)菌對(duì)色氨酸的充分利用。防止堆積。2020/11/329
3.阿拉伯糖操縱子(araoperon)調(diào)節(jié)機(jī)制結(jié)構(gòu)特點(diǎn)結(jié)構(gòu)基因B、A、D,分別編碼異構(gòu)酶(isomerase)、激酶(kinase)、表位酶(epimerase),催化阿拉伯糖轉(zhuǎn)變?yōu)?-磷酸木酮糖調(diào)控區(qū):調(diào)節(jié)基因?yàn)镃基因(編碼調(diào)控蛋白C蛋白)、啟動(dòng)子(P)、起始區(qū)(I)和操縱基因(O)構(gòu)成2020/11/330
2020/11/331二、翻譯水平的調(diào)控1、SD序列對(duì)翻譯的影響SD序列(Shine-Dalgarnosequence):mRNA起始密碼前的一段富含嘌呤核苷酸的序列。(9-12bp)?SD序列的差異對(duì)翻譯的影響?SD序列位置對(duì)翻譯的影響2020/11/3322020/11/3332、mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)隱蔽SD序列某些mRNA分子中,核糖體結(jié)合位點(diǎn)在一個(gè)二級(jí)結(jié)構(gòu)中(莖環(huán))中,使核糖體無法結(jié)合,只有打破莖環(huán)結(jié)構(gòu),核糖體才能結(jié)合。例如:帶有紅霉素抗性的細(xì)菌2020/11/334編碼區(qū)紅霉素甲基化酶核糖體23SmRNA上特定位點(diǎn)的一個(gè)腺嘌呤甲基化。紅霉素終止密碼子2020/11/335
細(xì)菌蛋白質(zhì)的合成速率的快速改變,不僅是轉(zhuǎn)錄與翻譯偶聯(lián),更重要的與mRNA的降解速度快有關(guān)。影響mRNA的降解因素:①細(xì)菌的生理狀態(tài)、環(huán)境因素;②
mRNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)及次級(jí)結(jié)構(gòu)的影響;③與mRNA的序列和結(jié)構(gòu)有關(guān)3、mRNA的穩(wěn)定性是調(diào)控翻譯的方式之一2020/11/336
有些mRNA編碼的蛋白質(zhì),本身也可以對(duì)相應(yīng)的mRNA的翻譯過程產(chǎn)生調(diào)節(jié)作用,這是一種自身翻譯調(diào)控作用。①核糖體蛋白翻譯的自身調(diào)控②翻譯的RF2調(diào)節(jié)自身的翻譯4、翻譯產(chǎn)物對(duì)mRNA的翻譯進(jìn)行調(diào)控UGAC25315編碼RF2蛋白mRNA2020/11/337
5、小分子RNA抑制特定mRNA的翻譯?小分子RNA調(diào)整基因表達(dá)產(chǎn)物的類型:大腸桿菌滲透壓調(diào)節(jié)基因ompR的產(chǎn)物OmpR蛋白,在不同滲透壓時(shí)具有不同的構(gòu)象。OmpR低滲結(jié)合ompF基因的調(diào)控區(qū),起正調(diào)控高滲結(jié)合ompC基因的調(diào)控區(qū),起正調(diào)控當(dāng)細(xì)菌從低滲到高滲狀態(tài)時(shí),不僅ompF基因抑制,其表達(dá)的mRNA的翻譯也抑制。2020/11/338
2020/11/339Tn10轉(zhuǎn)位酶基因表達(dá)在細(xì)菌中處于極低水平。這是因了一種小分子RNA阻遏物在翻譯水平上嚴(yán)格限制著Tn10轉(zhuǎn)位酶基因的表達(dá)。?小分子RNA控制特定基因的低水平表達(dá)2020/11/340
小分子RNA在翻譯水平上對(duì)Tn10轉(zhuǎn)位酶基因表達(dá)調(diào)控2020/11/341真核生物基因表達(dá)的調(diào)控DNA水平的調(diào)控轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控翻譯水平的調(diào)控翻譯后水平的調(diào)控2020/11/342DNA水平的調(diào)控1、染色質(zhì)的丟失:低等生物的細(xì)胞發(fā)育過程中及動(dòng)物紅細(xì)胞成熟過程中,發(fā)現(xiàn)有染色質(zhì)的丟失。2、基因擴(kuò)增:增加基因的拷貝數(shù)是調(diào)控基因表達(dá)活性的一種有效方式。藥物:誘導(dǎo)抗藥性基因的擴(kuò)增;腫瘤細(xì)胞:原癌基因拷貝數(shù)異常增加3、基因重排:基因片段改變?cè)暯禹樞?,重排為完整的轉(zhuǎn)錄單位如免疫球蛋白基因在B淋巴細(xì)胞分化和漿細(xì)胞生成過程中重排,奠定了其多樣性的基礎(chǔ)。2020/11/343
4、DNA甲基化:在真核生物基因表達(dá)中,基因甲基化程度高,基因表達(dá)降低;去甲基化:基因表達(dá)增加。5、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控:真核生物的染色體或染色質(zhì)由DNA與組蛋白、非組蛋白及少量RNA及其它物質(zhì)結(jié)合而成。具有核小體結(jié)構(gòu)。非組蛋白(高遷移組分)與組蛋白競爭結(jié)合DNA,解除組蛋白對(duì)基因表達(dá)的抑制。2020/11/344
轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是真核生物基因調(diào)控中最重要調(diào)控主要通過順式作用元件、反式作用因子、RNA聚合酶的相互作用來完成的。同時(shí)轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控主要通過上述三者作用影響轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成。2020/11/345(一)轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成真核生物的RNA聚合酶識(shí)別的不是單純的DNA序列,而是由一個(gè)通用轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactor,TF)與DNA形成的蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物.形成過程:1、TFIID結(jié)合TATA盒2、RNA聚合酶Ⅱ結(jié)合TFⅡD,形成閉合的復(fù)合物3、其它TF與RNA聚合酶形成開放的復(fù)合物在轉(zhuǎn)錄調(diào)控過程中,反式作用因子的主要作用:是促進(jìn)或抑制TFIID結(jié)合TATA盒或RNA聚合酶結(jié)合TFⅡD,形成閉合的復(fù)合物以及轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成。2020/11/346
(二)、反式作用因子
真核細(xì)胞內(nèi)含有大量的能識(shí)別、結(jié)合特異性序列的DNA結(jié)合蛋白,其主要功能是使基因開放或關(guān)閉,稱為反式作用因子,通常是一類細(xì)胞核內(nèi)蛋白質(zhì)因子。反式作用因子特點(diǎn):1、常含有三個(gè)功能結(jié)構(gòu)域:DNA識(shí)別結(jié)合域;轉(zhuǎn)錄活性域;結(jié)合其他蛋白的結(jié)合域2、能識(shí)別并結(jié)合順式作用元件。3、對(duì)基因的表達(dá)具有正調(diào)控與負(fù)調(diào)控作用。2020/11/347
DNA結(jié)合域(DNA-bindingdomain)鋅指結(jié)構(gòu)(Zincfingermotif)同源結(jié)構(gòu)域(Homodomain):螺旋-回折-螺旋亮氨酸拉鏈(Leucinezipper)螺旋-環(huán)-螺旋(Helix-loop-helixstructure)堿性α
螺旋(Alkalineα-helix)2020/11/348Zinc-fingers
鋅指最常見DNA結(jié)合域之一約有30個(gè)AA殘基其中4個(gè)AA殘基(2個(gè)Cys,2個(gè)His或4個(gè)Cys)配位鍵
Zn2+
鋅指與DNA雙螺旋大溝結(jié)合。存在于多種真核轉(zhuǎn)錄因子具多個(gè)鋅指結(jié)構(gòu)2020/11/349
鋅指結(jié)構(gòu)2020/11/350123456789蛋白質(zhì)圖15-10圖15-112020/11/351同源結(jié)構(gòu)域:螺旋-回折-螺旋2020/11/352
堿性-亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)NH2COOH堿性氨基酸區(qū)特點(diǎn):是蛋白質(zhì)分子的肽鏈上每隔6個(gè)氨基酸就有一個(gè)亮氨酸殘基,結(jié)果就導(dǎo)致這些亮氨酸殘基都在α螺旋的同一個(gè)方向出現(xiàn)。兩個(gè)相同的結(jié)構(gòu)的兩排亮氨酸殘基就能以疏水性作用力結(jié)合成二聚體,這二聚體的另一端的肽段富含堿性氨基酸殘基,借其正電荷與DNA雙螺旋鏈上帶負(fù)電荷的磷酸基團(tuán)結(jié)合。若不形成二聚體則對(duì)DNA的親和結(jié)合力明顯降低亮氨酸拉鏈區(qū)2020/11/353圖15-132020/11/354
2020/11/355:
α-螺旋有兼性:疏水性基因一側(cè)以及由堿性氨基酸組成的親水性一側(cè)。形成二聚體:通過疏水性區(qū)域相互結(jié)合,而形成同二聚體或異二聚體。有利于與DNA結(jié)合:通過堿性氨基酸區(qū)結(jié)合DNA。helix-loop-helix
:螺旋-環(huán)-螺旋2020/11/356二聚體2020/11/357
轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域是反式作用因子的轉(zhuǎn)錄激活區(qū),通常在反式作用因子的DNA結(jié)合域以外由80到100個(gè)氨基酸組成的區(qū)域。轉(zhuǎn)錄因子通常具有一個(gè)以上的轉(zhuǎn)錄活化區(qū)。轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)模型有以下幾種:1、酸性α-螺旋結(jié)構(gòu)域:帶較多負(fù)電荷,能形成親脂性α-
螺旋(糖皮質(zhì)激素受體)2、富含谷氨酰胺結(jié)構(gòu)域(轉(zhuǎn)錄因子SP1)3、富含脯氨酸結(jié)構(gòu)域:CTFNF-12020/11/358
(三)、轉(zhuǎn)錄起始是由多種激活的反式作用因子進(jìn)行復(fù)合調(diào)控1、反式作用因子激活方式:(1)、通過基因表達(dá)產(chǎn)生反式作用因子是激活方式之一。通常這種激活方式又稱為表達(dá)方式調(diào)節(jié)。這類因子一合成出來就有活性,它們只是在需要時(shí)才合成,并迅速通過蛋白水解酶迅速降解。(2)、共價(jià)修飾調(diào)節(jié)蛋白活性。這類因子通??赏ㄟ^磷酸化-去磷酸化、糖基化修飾方式來調(diào)節(jié)其蛋白活性。2020/11/359
(3)、與配體結(jié)合引起功能變化:許多激素的受體也是反式作用因子,本身對(duì)基因轉(zhuǎn)錄無調(diào)節(jié)作用。當(dāng)激素進(jìn)入細(xì)胞后,受體與激素結(jié)合,才能結(jié)合于DNA,調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。(4)、蛋白與蛋白相互作用:蛋白與蛋白之間的解離或形成復(fù)合體,是許多細(xì)胞內(nèi)反式作用因子活性調(diào)節(jié)的重要方式。如c-myc蛋白單一作用靶DNA,其效率低,但與其配體max蛋白形成異二聚體形式作用,效率大增。2020/11/360
反式作用因子激活后,通過識(shí)別并結(jié)合基因上游的啟動(dòng)子元件或增強(qiáng)子中的保守序列,從而發(fā)揮其對(duì)下游基因的調(diào)節(jié)作用。那么反式作用因子又是如何影響下游基因活性呢?目前提出反式作用因子有以下幾種作用模式:1、成環(huán):當(dāng)反式作用因子與增強(qiáng)子結(jié)合后,利用DNA的柔曲性,彎曲成環(huán),使增強(qiáng)子區(qū)域與RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)靠近,直接接觸而發(fā)揮作用。2、扭曲:反式作用因子通過與DNA結(jié)合后,通過DNA變形,扭曲而發(fā)生構(gòu)型改變,使通用轉(zhuǎn)錄因子與RNA聚合酶結(jié)合更適合。3、滑動(dòng):4、連鎖反應(yīng):2020/11/361組合式基因調(diào)控(conbinatorialgeneregulation):指在反式作用因子在對(duì)基因表達(dá)調(diào)控時(shí),并非由單一因子完成,而是由幾種反式作用因子組合而發(fā)揮特定作用。在組合式基因調(diào)控中每一種作用因子如果單獨(dú)作用,可能是正調(diào)控或負(fù)調(diào)控,但由多因子的作用效應(yīng),并不是幾個(gè)因子的簡單加合的結(jié)果。反式作用因子的組合式調(diào)控作用2020/11/362
三、mRNA的加工和運(yùn)輸可形成轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控(一)、5`端加帽和3`端加多聚腺苷酸尾具有調(diào)控意義1、5`形成一個(gè)m7GpppNp-2、3`形成一個(gè)100∽200個(gè)腺苷酸,即poly(A)3、核糖體的組裝在細(xì)胞核內(nèi),可能保護(hù)rRNA不被降解;4、tRNA在合成后,形成特定的空間構(gòu)象,也使其具有抵抗降解的機(jī)制。2020/11/363(二)、mRNA的選擇剪接亦可調(diào)控基因表達(dá)mRNA的選擇剪接是指真核細(xì)胞基因表達(dá)所轉(zhuǎn)錄出的前體mRNA的剪接過程中,參加拼接的外顯子可以不按其在基因組的線性分布次序拼接,內(nèi)含子也可以不被切除而保留,即一個(gè)外顯子或內(nèi)含子是否出現(xiàn)在成熟的mRNA中是可以選擇的。這種剪接稱mRNA選擇剪接。mRNA選擇剪接方式:外顯子選擇(optionalexon)
互斥外顯子內(nèi)部剪接位點(diǎn)內(nèi)含子選擇(optionalintron)2020/11/364
2020/11/365
Bax基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的選擇剪接123456選擇剪接產(chǎn)生α、β、γ三種蛋白123456共含192個(gè)密碼子1123456終止密碼子共218個(gè)密碼子13456共151個(gè)密碼子2020/11/366
(三)、mRNA運(yùn)輸控制調(diào)節(jié)進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)的mRNA量mRNA的運(yùn)輸是受控制的。成熟的mRNA并不是全部進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)。大約只有20%的mRNA進(jìn)入胞漿,留在核內(nèi)的RNA大約在1小時(shí)內(nèi)降解。RNA通過核膜的運(yùn)輸是一個(gè)主動(dòng)運(yùn)輸過程,RNA運(yùn)輸出核孔的機(jī)制,目前不清。2020/11/367
四、翻譯水平的調(diào)節(jié)或控制(一)、蛋白翻譯起始可受特定因素的調(diào)控1、阻遏蛋白的調(diào)控:可以結(jié)合到mRNA的5`端5`端非編碼區(qū)鐵反應(yīng)元件鐵結(jié)合調(diào)節(jié)蛋白鐵編碼鐵蛋白的基因信息區(qū)2020/11/368
2、翻譯起始因子調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)合成速度eIF-2是蛋白質(zhì)合成過程
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