比較基因組學(xué)原理及應(yīng)用教學(xué)課件

比較基因組學(xué)原理及應(yīng)用成員:韓柳閻永偉黃繼馬壽光朱琳姜南李春麗比較基因組學(xué)相關(guān)概念韓柳基因組學(xué)概念及范疇基因組(genome)泛指一個(gè)有生命體、病毒或細(xì)胞器的全部遺傳物質(zhì);在真核生物,基因組是指一套染色體(單倍體)DNA?；蚪M學(xué)genomics)就是發(fā)展和應(yīng)用DNA制圖、測(cè)序新技術(shù)以及計(jì)算機(jī)程序,分析生命體(包括人類)全部基因組結(jié)構(gòu)及功能?；蚪M學(xué)概念亞領(lǐng)域內(nèi)容結(jié)構(gòu)基因組學(xué)整個(gè)基因組的遺傳制圖、物理制圖及DNA測(cè)序。功能基因組學(xué)認(rèn)識(shí)、分析整個(gè)基因組所包含的基因、非基因序列及其功能比較基因組學(xué)比較不同物種的整個(gè)基因組,增強(qiáng)對(duì)各個(gè)基因組功能及發(fā)育相關(guān)性的認(rèn)識(shí)比較基因組學(xué)概定義:比較基因組學(xué)(Comparativegenomics)是基于基因組圖譜和測(cè)序基礎(chǔ)上,對(duì)已知的基因和基因組結(jié)構(gòu)進(jìn)行比較,來(lái)了解基因的功能、表達(dá)機(jī)理和物種進(jìn)化的學(xué)科·研究?jī)?nèi)容:種間的比較基因組學(xué)和種內(nèi)的比較基因組學(xué)細(xì)菌基因組H能腸桿菌39個(gè)物種釀酒酵母其它基因組線蟲果蠅擬南芥遺傳圖微星SNPs小物理圖轉(zhuǎn)錄圖ESTS全長(zhǎng)cDM序列圖預(yù)測(cè)序遺傳圖微星SNP物理圖全長(zhǎng)cDNM轉(zhuǎn)錄圖預(yù)測(cè)序15%2工作草圖9O%,全長(zhǎng)00序列圖第22號(hào)染色體第21號(hào)染色體概念工具:1、FASTA2、BLAST3、CLUSTALW基因組分類:1、通過(guò)比較確知其功能的。2、在數(shù)據(jù)庫(kù)中有相匹配的蛋白,但不知道其功能。3、在現(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫(kù)中找不到任何相匹配的蛋白質(zhì)序列的新基因?；就瓿蒁NA序列分析的真核生物基因組比較物種完成總長(zhǎng)度已完成總長(zhǎng)占常染色質(zhì)基因數(shù)年份/M的百分?jǐn)?shù)/%百分?jǐn)?shù)/Mb/hb酵母20191293100483線蟲20199699100197果蠅200011697117擬南芥200011592100221人類第21染色體20003475100人類第22染色體20193470人類全基因組201926938412(PublicSequence)人類全基因組201926548399-9315(CeleraSequence部分真核、原核生物基因組成成份分析(A)人類v29TRYTRYmmnmttmnnnmmnh聞■■應(yīng)n,甲3)醉母50Ib■國(guó)D)大腸桿菌dnakcarBsokbKEY外顯子假基因■重復(fù)序列通過(guò)基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行比較基因組學(xué)研究例子尿殖道支原體帶有已知最小的基因組,可依此確定能自我復(fù)制的細(xì)胞必需的一套最少的核心基因流感嗜血桿菌的基因組為1.