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實驗十一植物組織總DNA的提取掌握用CTAB法提取植物總DNA的方法和基本原理。學(xué)習(xí)利用紫外分光光度法測定DNA溶液的濃度。一、實驗?zāi)康膶嶒炇恢参锝M織總DNA的提取掌握用CTAB法提取植物總1二、實驗原理
通常采用機械研磨的方法破碎植物的組織和細(xì)胞,由于植物細(xì)胞勻漿含有多種酶類(尤其是氧化酶類)對DNA的抽提產(chǎn)生不利的影響,在抽提緩沖液中需加入抗氧化劑或強還原劑(如巰基乙醇)以降低這些酶類的活性。在液氮中研磨,材料易于破碎,并減少研磨過程中各種酶類的作用。
CTAB,SDS等離子型表面活性劑,能溶解細(xì)胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,從而使DNA得以游離出來。二、實驗原理通常采用機械研磨的方法破碎植物的組2再加入苯酚和氯仿等有機溶劑,能使蛋白質(zhì)變性,并使抽提液分相,因核酸(DNA、RNA)水溶性很強,經(jīng)離心后即可從抽提液中除去細(xì)胞碎片和大部分蛋白質(zhì)。上清液中加入異丙醇或乙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于雙蒸水或TE溶液中,即得植物總DNA溶液。之后可加入RNA酶降解其中的RNA,再用氯仿除去RNA酶,得到較純的DNA制劑。再加入苯酚和氯仿等有機溶劑,能使蛋白質(zhì)變性,并使抽3
DNA的吸收光譜峰在260nm處,據(jù)計算,測定此波長下DNA溶液的OD值,當(dāng)OD260=1時,雙鏈DNA含量約為50μg/ml,據(jù)此可用紫外分光光度計測定溶液中DNA含量。由于蛋白質(zhì)的吸收峰在280nm處,在測定DNA含量時,還常計算OD260/OD280之值,如該值為1.8-2.0時,認(rèn)為已達(dá)到較高的純度,如低于此值,表明其內(nèi)含雜質(zhì)較多,可能影響酶切反應(yīng)。DNA的吸收光譜峰在260nm處,據(jù)計算,4水稻品種的幼苗葉片三、實驗材料水稻品種的幼苗葉片三、實驗材料5四、實驗器具、藥品試劑水浴鍋,研缽,微量移液器,槍頭,離心管,臺式離心機,液氮,恒溫箱,標(biāo)簽紙,紫外分光光度計,磁力攪拌機,剪刀等。2%CTAB抽提緩沖溶液,異丙醇,氯仿-異戊醇等四、實驗器具、藥品試劑水浴鍋,研缽,微量移液器,槍6
CTAB法流程圖植物材料裂解液上層溶液液氮研磨抽提細(xì)胞裂解干燥溶解離心洗滌異丙醇沉淀DNA溶液CTAB法流程圖植物材料裂解液上層溶液液氮研磨抽提細(xì)胞裂解7五、實驗方法(1)2%CTAB抽提緩沖液在65℃水浴中預(yù)熱。(2)取少量葉片(約0.2g)置于研缽中,用液氮磨至粉狀;(3)在液氮揮發(fā)將盡而植物組織尚未解凍時迅即加入700μl的2%CTAB抽提緩沖液,輕輕攪動;(4)將磨碎液分倒入1.5ml的滅菌離心管中,磨碎液的高度約占管的三分之二;(5)置于65℃的水浴槽或恒溫箱中,每隔10min輕輕搖動,40min后取出;1.DNA的提取
五、實驗方法(1)2%CTAB抽提緩沖液在65℃水浴中預(yù)熱8(6)冷卻2min后,加入氯仿-異戊醇(24:1)至滿管,劇烈振蕩2~3min,使兩者混合均勻;(7)放入離心機中10000rpm離心10min,與此同時,將600μl的異丙醇加入另一新的滅菌離心管中;(8)用移液器輕輕地吸取上清夜,轉(zhuǎn)入含有異丙醇的離心管內(nèi),將離心管慢慢上下?lián)u動30sec,使異丙醇與水層充分混合至能見到DNA絮狀物;(6)冷卻2min后,加入氯仿-異戊醇(24:1)至滿管,9(9)10000rpm離心1min后,立即倒掉液體,注意勿將白色DNA沉淀倒出,將離心管倒立于鋪開的紙巾上;(10)60sec后,直立離心管,加入720μl的75%乙醇及80μl5M的醋酸鈉,輕輕轉(zhuǎn)動,用手指彈管尖,使沉淀與管底的DNA塊狀物浮游于液體中;(11)放置30min,使DNA塊狀物的不純物溶解;(12)10000rpm離心1min后,倒掉液體,再加入800μl75%的乙醇,將DNA再洗30min;(9)10000rpm離心1min后,立即倒掉液體,注意10(13)10000rpm離心30sec后,立即倒掉液體,將離心管倒立于鋪開的紙巾上;數(shù)分鐘后,直立離心管,干燥DNA(自然風(fēng)干或用風(fēng)筒吹干);(14)加入50μl0.5×TE(含RNase)緩沖液,使DNA溶解,置于37℃恒溫箱約15h,使RNA消解;(15)置于-20℃保存、備用。(13)10000rpm離心30sec后,立即倒掉液體,11稱取樣品,液氮研磨,加入預(yù)熱的(65℃
)CTAB及β-巰基乙醇
保溫1h,期間不停的搖均吸取上清液,移至新的離心管中,加入等體積氯仿:異戊醇(24:1),輕緩顛倒混勻,10000rpm,10min取上清液,移至新的離心管中,加等體積氯仿:異戊醇,顛倒混勻,10000rpm,10min取上清液,加入0.6-0.7V的異丙醇(預(yù)冷),后4℃/-20℃保溫沉淀10000rpm,10min離心取沉淀,70%乙醇清洗兩次,吹干用TE溶解DNA,然后低溫保存稱取樣品,液氮研磨,加入預(yù)熱的(65℃)CTAB及β-巰12(1)葉片磨得越細(xì)越好。(2)移液器的使用。(3)由于植物細(xì)胞中含有大量的DNA酶,因此,除在抽提液中加入EDTA抑制酶的活性外,第一步的操作應(yīng)迅速,以免組織解凍,導(dǎo)致細(xì)胞裂解,釋放出DNA酶,使DNA降解。六、注意事項(1)葉片磨得越細(xì)越好。六、注意事項13七、作業(yè)(1)本實驗所得的植物總DNA制劑中含有哪些遺傳物質(zhì)?(2)在DNA抽提過程中造成DNA分子斷裂的主要因素有哪些?(3)本實驗中所用到下列試劑的作用各是
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