BMK-細(xì)菌泛基因組測(cè)序服務(wù)合同模板

合同書本合同甲方委托乙方就(單位簡(jiǎn)稱)(數(shù)量)(物種)細(xì)菌泛基因組測(cè)序分析進(jìn)行專項(xiàng)技術(shù)服務(wù)，并支付相應(yīng)的技術(shù)服務(wù)報(bào)酬。雙方經(jīng)過(guò)平等協(xié)商，在真實(shí)、充分地表達(dá)各自意愿的基礎(chǔ)上，根據(jù)《中華人民共和國(guó)合同法》的規(guī)定，達(dá)成如下協(xié)議，并由雙方共同恪守。第一條定義:除非另有約定，本合同使用的下列術(shù)語(yǔ)應(yīng)具有如下界定的含義：“合同”或“本合同”：指本合同正文和其附件，共同構(gòu)成合同整體并相互補(bǔ)充；“交付成果”：指乙方根據(jù)本合同規(guī)定交付的服務(wù)成果，包括文庫(kù)、測(cè)序數(shù)據(jù)或分析結(jié)果等；“技術(shù)障礙”：指在乙方現(xiàn)有條件下無(wú)法克服的技術(shù)問(wèn)題，包括但不限于因合同約定的技術(shù)方法、技術(shù)路線、履行合同所使用的設(shè)備、儀器、軟件等本身的缺陷或局限性、生物特性、生物個(gè)體差異性等導(dǎo)致的無(wú)法克服的技術(shù)問(wèn)題；標(biāo)題：僅為方便參考而設(shè)，不影響本合同的解釋和意義。第二條甲方委托乙方進(jìn)行技術(shù)服務(wù)的內(nèi)容如下：建庫(kù)測(cè)序前樣品的質(zhì)檢乙方對(duì)甲方樣品進(jìn)行樣品檢測(cè)，樣品質(zhì)檢標(biāo)準(zhǔn)見附件；若樣品不滿足質(zhì)檢標(biāo)準(zhǔn)，乙方根據(jù)經(jīng)驗(yàn)會(huì)給甲方提供合理建議，由甲方最終確認(rèn)是否繼續(xù)實(shí)驗(yàn)或是重新提供樣品，乙方對(duì)于實(shí)驗(yàn)的最終結(jié)果不承擔(dān)責(zé)任。技術(shù)服務(wù)內(nèi)容及目標(biāo)樣品檢測(cè)合格后，構(gòu)建DNA測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序，并獲得測(cè)序數(shù)據(jù)。乙方采取以下技術(shù)路線進(jìn)行細(xì)菌泛基因組測(cè)序分析：樣品制備――上機(jī)測(cè)序――生物信息數(shù)據(jù)分析。技術(shù)服務(wù)的方式最終提交測(cè)序數(shù)據(jù)和項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告。分析結(jié)果具體包括以下幾個(gè)方面內(nèi)容具體分析內(nèi)容備注分析內(nèi)容1、數(shù)據(jù)質(zhì)控2、泛基因組組裝3、基因組情況評(píng)估4、基因組組分分析編碼基因預(yù)測(cè)（Prodigal）；重復(fù)序列注釋；非編碼RNA預(yù)測(cè)假基因預(yù)測(cè)CRSPR預(yù)測(cè)前噬菌體預(yù)測(cè)5、基因功能注釋通用數(shù)據(jù)庫(kù)注釋：GO,KEGG,COG,Swiss-prot,Nr,pfam，TrEMBL；專用數(shù)據(jù)庫(kù)注釋：CAZyme，ARDB，PHI，VFDB，TCDB；信號(hào)肽蛋白、跨膜蛋白、分泌蛋白預(yù)測(cè)6、個(gè)體間變異檢測(cè)SNP、InDel、SV檢測(cè)；水平基因轉(zhuǎn)移；7、比較基因組分析核心基因家族和物種特有基因分析；泛基因組組分分析；系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建；基因共線性分析；定制化信息分析分析內(nèi)容由甲方提出并填寫，由技術(shù)人員評(píng)估后給出價(jià)格及項(xiàng)目周期。售后服務(wù)甲方可以在分析完成日后的三個(gè)月內(nèi)針對(duì)原有數(shù)據(jù)、結(jié)果、分析方法等方面的疑問(wèn)咨詢乙方，乙方在一個(gè)月內(nèi)給甲方提供整理分析類服務(wù)，三個(gè)月內(nèi)提供問(wèn)題解答服務(wù)，咨詢范圍只限于合同中的服務(wù)內(nèi)容。注：乙方提供給甲方的分析內(nèi)容以合同為準(zhǔn)，任何口頭承諾均無(wú)效。第三條乙方應(yīng)按下列要求完成技術(shù)服務(wù)工作：技術(shù)服務(wù)地點(diǎn)：北京xx生物科技有限公司技術(shù)服務(wù)期限：2個(gè)月（樣品數(shù)≤10；不包括高級(jí)及個(gè)性化分析時(shí)間）3個(gè)月（樣品數(shù)≤30；不包括高級(jí)及個(gè)性化分析時(shí)間）4個(gè)月（樣品數(shù)≤50；不包括高級(jí)及個(gè)性化分析時(shí)間）技術(shù)服務(wù)進(jìn)度：乙方在收到甲方樣品及《樣品信息單》后開始樣品檢測(cè)，DNA樣品檢測(cè)合格且預(yù)付款到位后的90個(gè)工作日內(nèi)完成樣品制備、全部測(cè)序反應(yīng)及相應(yīng)的信息分析；乙方在甲方認(rèn)可項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告且尾款到位后的5個(gè)工作日內(nèi)向甲方提供項(xiàng)目所有原始數(shù)據(jù)和分析結(jié)果；甲乙雙方溝通或等待對(duì)方反饋所花費(fèi)的時(shí)間不包括在95個(gè)工作日內(nèi)。技術(shù)服務(wù)質(zhì)量：完成X樣品的細(xì)菌泛基因組測(cè)序，平均每個(gè)樣品測(cè)序深度≥100X。第四條為保證乙方有效進(jìn)行技術(shù)服務(wù)工作，甲方應(yīng)當(dāng)向乙方提供下列工作條件和協(xié)作事項(xiàng)：提供技術(shù)資料和工作條件：甲方一次性提供乙方要求的DNA或菌體（確定樣本類型），且達(dá)到乙方樣品標(biāo)準(zhǔn)，具體標(biāo)準(zhǔn)見附件；甲方需詳細(xì)填寫《樣品信息單》，寄送樣品時(shí)必須隨同樣品寄送紙質(zhì)版信息單，并同時(shí)發(fā)送電子版給乙方。因樣品信息單填寫不完整、填寫錯(cuò)誤或不及時(shí)發(fā)送造成的檢測(cè)錯(cuò)誤、項(xiàng)目延期等后果，均由甲方承擔(dān)；按照第五條的條款約定支付乙方服務(wù)費(fèi)用。甲方提供上述工作條件和協(xié)作事項(xiàng)的時(shí)間及方式：在本合同簽訂5天內(nèi)，以書面和電子郵件兩種形式提供《樣品信息單》。其他：無(wú)第五條甲方向乙方支付技術(shù)服務(wù)報(bào)酬及支付方式為：技術(shù)服務(wù)費(fèi)總額為：人民幣貳拾萬(wàn)元整（￥200,000.00）；技術(shù)服務(wù)費(fèi)由甲方分期（一次或分期）支付乙方。具體支付方式和時(shí)間如下：合同生效的5個(gè)工作日之內(nèi)，甲方把相當(dāng)于協(xié)議金額的80%預(yù)付款人民幣拾陸萬(wàn)元整（￥160,000.00）轉(zhuǎn)入乙方帳戶；完成全部項(xiàng)目且達(dá)到合同指標(biāo)要求后，乙方5個(gè)工作日內(nèi)提交項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告，甲方把相當(dāng)于協(xié)議金額的20%尾款人民幣肆萬(wàn)元整（￥40,000.00）轉(zhuǎn)入乙方帳戶；乙方合同蓋章后，在郵寄合同時(shí)，預(yù)付款發(fā)票與合同一起郵寄。開具單位與合同中甲方名稱保持一致，發(fā)票開具內(nèi)容為測(cè)序技術(shù)服務(wù)費(fèi)；如因甲方樣品不合格而造成合同終止，乙方向甲方收取實(shí)際已發(fā)生費(fèi)用：樣品檢測(cè)費(fèi)用￥200.00/樣本/次。如果合同繼續(xù)，每個(gè)樣品免費(fèi)檢測(cè)2次，超出的部分，按照￥200.00/樣本/次收費(fèi)；若甲方需要乙方進(jìn)行樣品提取，則甲方需要向乙方支付提取費(fèi)用￥200.00/樣本。乙方開戶銀行名稱、地址和帳號(hào)為：開戶銀行：中國(guó)工商銀行股份有限公司北京順義支行帳號(hào)：0200005909200203276第六條雙方確定因履行本合同應(yīng)遵守的保密義務(wù)如下：甲方：保密內(nèi)容:未經(jīng)乙方書面同意，甲方不得將本項(xiàng)目的任何技術(shù)資料等涉及乙方機(jī)密的信息泄漏給第三方；涉密人員范圍:除乙方外的所有人員或單位；保密期限：自合同生效日起3年；泄密責(zé)任：違反合同約定，擅自將有關(guān)技術(shù)資料或涉及乙方機(jī)密的技術(shù)引用、發(fā)表或提供給第三方，應(yīng)支付數(shù)額為報(bào)酬總額100％的違約金，并且承擔(dān)由此帶給乙方的一切經(jīng)濟(jì)損失。乙方： 保密內(nèi)容:未經(jīng)甲方的書面同意，乙方不得將本項(xiàng)目的任何研究材料等涉及甲方科研內(nèi)容或成果的相關(guān)資料泄露給第三方；涉密人員范圍:除甲方外的所有人員或單位；保密期限：自合同生效日起3年；泄密責(zé)任：違反合同約定、擅自將有關(guān)資料或涉及甲方研究?jī)?nèi)容或本項(xiàng)目的研究成果引用，發(fā)表或提供給第三方，應(yīng)支付數(shù)額為報(bào)酬總額100％的違約金，并且承擔(dān)由此帶給甲方的一切經(jīng)濟(jì)損失。在不涉及泄漏技術(shù)秘密及科研內(nèi)容、研究成果的前提下，乙方可以將本合同用于技術(shù)服務(wù)合同的認(rèn)定。第七條本合同的變更必須由雙方協(xié)商一致，并以書面形式確定：但有下列情形之一的，一方可以向另一方提出變更合同權(quán)利與義務(wù)的請(qǐng)求，另一方應(yīng)當(dāng)在15個(gè)工作日內(nèi)予以答復(fù)；逾期未予答復(fù)的，視為同意：甲方提供的工作條件不符合乙方要求，但甲方堅(jiān)持要求履行合同；因不可克服的技術(shù)障礙導(dǎo)致合同無(wú)法正常履行。第八條雙方確定以下列標(biāo)準(zhǔn)和方式對(duì)乙方的技術(shù)服務(wù)工作成果進(jìn)行驗(yàn)收：乙方完成技術(shù)服務(wù)工作的形式：最終提交所有原始數(shù)據(jù)，分析結(jié)果及項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告；技術(shù)服務(wù)工作成果的驗(yàn)收標(biāo)準(zhǔn)：達(dá)到第三條第4點(diǎn)的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)；技術(shù)服務(wù)工作成果的驗(yàn)收方法：甲方通過(guò)對(duì)乙方提供的測(cè)序數(shù)據(jù)及分析結(jié)果進(jìn)行書面或郵件確認(rèn)；驗(yàn)收的時(shí)間和地點(diǎn)：年月日，北京。第九條雙方確定成果歸屬按照以下方式：在本合同有效期內(nèi)，甲方利用乙方提交的技術(shù)服務(wù)工作成果所完成的新的技術(shù)成果，歸甲（甲、雙）方所有。在本合同有效期內(nèi)，乙方利用甲方提供的技術(shù)資料和工作條件所完成的新的技術(shù)升級(jí)與軟件開發(fā)，歸乙（乙、雙）方所有。第十條雙方確定，按以下約定承擔(dān)各自的違約責(zé)任：如因甲方樣品、資料不合格或未能按時(shí)到位等原因?qū)е碌捻?xiàng)目延誤等損失由甲方承擔(dān)責(zé)任；如因乙方原因不能按時(shí)完成項(xiàng)目，由乙方承擔(dān)責(zé)任。乙方應(yīng)及時(shí)與甲方溝通協(xié)商項(xiàng)目延期方式；樣品經(jīng)檢測(cè)不合格，若甲方仍堅(jiān)持進(jìn)行項(xiàng)目，則甲方需按正常價(jià)格付費(fèi)，乙方將不保證約定的技術(shù)指標(biāo)。由此而造成的損失，乙方不承擔(dān)責(zé)任；簽約各方理解，生物技術(shù)服務(wù)帶有不確定性和技術(shù)風(fēng)險(xiǎn)。如因不可克服的技術(shù)障礙導(dǎo)致本項(xiàng)目不能完成，簽約各方協(xié)商后中止項(xiàng)目，按照乙方實(shí)際已完成的工作量計(jì)算費(fèi)用，雙方各承擔(dān)50%的損失；如因不可抗拒的客觀因素導(dǎo)致的項(xiàng)目延誤或不能繼續(xù)履行時(shí)，雙方各承擔(dān)已發(fā)生成本費(fèi)用的50%。不可抗拒力包括地震、洪水、戰(zhàn)爭(zhēng)、軍事行動(dòng)、法律或政府政策等相關(guān)因素。第十一條雙方確定，在本合同有效期內(nèi)，甲方指定為甲方項(xiàng)目聯(lián)系人，乙方指定為乙方項(xiàng)目聯(lián)系人。項(xiàng)目聯(lián)系人承擔(dān)以下責(zé)任：項(xiàng)目進(jìn)展的及時(shí)溝通；項(xiàng)目進(jìn)行過(guò)程中遇到問(wèn)題共同協(xié)調(diào)解決；及時(shí)提供協(xié)議雙方所必須的工作條件。一方變更項(xiàng)目聯(lián)系人的，應(yīng)當(dāng)及時(shí)以書面形式通知另一方。未及時(shí)通知并影響本合同履行或造成損失的，應(yīng)承擔(dān)相應(yīng)的責(zé)任。第十二條雙方確定，出現(xiàn)下列情形，致使本合同的履行成為不必要或不可能的，可以解除本合同：發(fā)生不可抗力；因?qū)Ψ竭`約使合同不能繼續(xù)履行或沒有必要繼續(xù)履行且征得對(duì)方同意。第十三條雙方因履行本合同而發(fā)生的爭(zhēng)議，應(yīng)協(xié)商、調(diào)解解決。協(xié)商、調(diào)解不成的，確定按以下第1種方式處理：提交北京仲裁委員會(huì)仲裁；依法向人民法院起訴。第十四條與履行本合同有關(guān)的下列技術(shù)文件，經(jīng)雙方以書面方式確認(rèn)后，為本合同的組成部分：附件《DNA測(cè)序樣品要求及注意事項(xiàng)》第十五條雙方約定本合同其他相關(guān)事項(xiàng)為：數(shù)據(jù)提交在項(xiàng)目過(guò)程中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)和相關(guān)生物信息分析結(jié)果文件，如果小于20G乙方可提供云盤下載；大于20G的數(shù)據(jù)，由甲方提供移動(dòng)硬盤，乙方提供移動(dòng)硬盤傳輸服務(wù)。數(shù)據(jù)保存為方便甲方測(cè)序數(shù)據(jù)的使用，乙方承諾在最終數(shù)據(jù)提供后，繼續(xù)保留數(shù)據(jù)3個(gè)月，若甲方未在屆滿期前書面提出繼續(xù)保留數(shù)據(jù)，乙方將在屆滿期后自動(dòng)刪除；如果甲方在屆滿期前書面提出繼續(xù)保存數(shù)據(jù)，則需簽訂補(bǔ)充協(xié)議并根據(jù)實(shí)際存儲(chǔ)數(shù)據(jù)量與存儲(chǔ)時(shí)間進(jìn)行計(jì)費(fèi)。樣品保存為方便甲方樣品管理，乙方承諾在提交項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告和數(shù)據(jù)提交后，繼續(xù)保留數(shù)據(jù)3個(gè)月，若甲方未在屆滿期前書面提出返還樣品，乙方將在屆滿期后自動(dòng)處理；如果甲方在屆滿期前書面提出返還樣品，則需填寫《樣品返還信息表》并提交給相應(yīng)的客服人員進(jìn)行樣品返還事宜。第十六條本合同一式6份，具有同等法律效力。由甲、乙雙方各持3份。

第十七條本合同經(jīng)雙方法定代表人或項(xiàng)目聯(lián)系人簽字蓋章后生效，聲明：xx法定代表人xx委托宋軍行使合同審批權(quán)和簽署權(quán)。甲方：（蓋章）法定代表人／委托代理人：（簽名）年月日乙方：（蓋章）法定代表人／委托代理人：（簽名）年月日登記機(jī)關(guān)審查登記欄：經(jīng)辦人：技術(shù)合同登記機(jī)關(guān)（專用章）年月日

附件《DNA測(cè)序樣品要求及注意事項(xiàng)》樣品要求：樣本類型樣品量(單次)樣品質(zhì)量DNA濃度≥50ng/μL總量≥2μg（Qubit）OD260/280=1.7-2.2；260吸收峰正常；主帶清晰，無(wú)降解或輕度降解；無(wú)蛋白質(zhì)、RNA污染或肉眼可見的雜質(zhì)污染。菌體細(xì)菌泛基因組送樣量：體積≥2ml菌液類：挑取單菌落于一定體積（50-100mL）液體培養(yǎng)基中適宜溫度下培養(yǎng)過(guò)夜，至菌體處于旺盛生長(zhǎng)的對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期（此時(shí)菌液OD600一般達(dá)0.6-0.8），而后轉(zhuǎn)入無(wú)菌的50mL離心管，用parafilm膜封好，外層用塑膠袋包裹以防止管子破裂液體滲漏，冰袋或干冰寄送。菌體類：將按照以上方法培養(yǎng)好的菌液，2) 將適量體積的菌液轉(zhuǎn)移至2mL旋蓋尖底離心管（無(wú)菌，無(wú)核酸酶）中，于室溫下14000Xg離心1min，棄盡培養(yǎng)基，將細(xì)菌沉淀迅速置于液氮中冷凍3-4小時(shí)，然后轉(zhuǎn)移至-80℃或液氮中長(zhǎng)期保存；用parafilm膜封好樣品管管口，若放置于50mL離心管中或封口袋中，里面添加棉花等固定（切勿在50mL管內(nèi)或其他支撐物內(nèi)加入液氮等危險(xiǎn)品），干冰運(yùn)輸。平板類：涂布平板培養(yǎng)的微生物，用parafilm膜封好，外層用塑膠袋包裹，以平板方式活菌送樣即可；寄送時(shí)添加海綿或泡沫做減震處理，常溫或冰袋寄送。電泳要求：主帶清晰，無(wú)降解或輕度降解，無(wú)蛋白或多糖污染。(請(qǐng)盡量保證DNA片段的完整性，距送樣日最近的電泳結(jié)果)合格樣品如下圖：19329bp19329bp7743bp4254bp3472bp6223bp6223bp樣品信息：請(qǐng)附加一份詳細(xì)的樣品信息單，盡可能涵蓋上述樣品要求的所有信息和圖片。提取及檢測(cè)注意事項(xiàng)：DNA提?。赫?qǐng)盡量使用新鮮的純培養(yǎng)菌液或菌落(確保無(wú)雜菌污染，且處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)中期最佳)提取DNA。請(qǐng)使用專用的細(xì)菌或真菌DNA提取試劑盒，以獲得足量且高純度DNA樣品。DNA檢測(cè)：瓊脂糖電泳上樣量：200-500ng，若上樣體積較小建議用ddH2O補(bǔ)至5μl。Marker：λDNA/HindIII或其它有20Kb以上條帶的DNALadde