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堿裂解法提取質(zhì)粒第1頁,課件共12頁,創(chuàng)作于2023年2月
通過質(zhì)粒的一些特性、質(zhì)粒DNA的提取、測定,學(xué)習(xí)用堿變性法提取質(zhì)粒DNA的方法,掌握堿裂解法提取質(zhì)粒DNA的原理及操作。一、實驗?zāi)康牡?頁,課件共12頁,創(chuàng)作于2023年2月質(zhì)粒(Plasmid):質(zhì)粒是細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)一種自我復(fù)制的環(huán)狀雙鏈DNA分子,能穩(wěn)定地獨立存在于染色體外,并傳遞到子代,一般不整合到宿主染色體上。在細(xì)胞內(nèi)它們常以共價閉環(huán)的超螺旋形式存在。存在于細(xì)菌、放線菌、真菌以及一些動植物細(xì)胞中,在細(xì)菌細(xì)胞中最多。二、實驗原理第3頁,課件共12頁,創(chuàng)作于2023年2月第4頁,課件共12頁,創(chuàng)作于2023年2月質(zhì)粒已成為目前最常用的基因克隆的載體分子,具有以下特點:
易于鑒定;在受體細(xì)胞中可以獨立復(fù)制;易于篩選;易于導(dǎo)入受體細(xì)胞。
第5頁,課件共12頁,創(chuàng)作于2023年2月二、實驗原理高堿細(xì)菌的細(xì)胞壁破裂,內(nèi)容物釋放①染色體DNA斷裂成不同長度的線性雙鏈DNA;②線性雙鏈DNA片段中的氫鍵斷裂,雙鏈解離變性。①質(zhì)粒DNA不發(fā)生斷裂,保持雙鏈閉合環(huán)狀;②雙鏈DNA并不完全分離。高酸中和至中性變性的染色體DNA與變性的蛋白質(zhì)以及細(xì)胞碎片凝聚成網(wǎng)絡(luò)狀大分子不溶性沉淀物質(zhì)粒DNA又恢復(fù)天然構(gòu)型,溶解在上清液中純化RNA酶消化除去RNA,并用酚抽提法除去殘留的蛋白質(zhì)第6頁,課件共12頁,創(chuàng)作于2023年2月SDS是一種陰離子表面活性劑,它既能使細(xì)菌細(xì)胞裂解,又能使一些蛋白質(zhì)變性,所以SDS處理細(xì)菌細(xì)胞后,會導(dǎo)致細(xì)菌細(xì)胞壁的破裂,從而使質(zhì)粒DNA以及基因組DNA從細(xì)胞中同時釋放出來。釋放出來的DNA遇到強堿性(NaOH)環(huán)境,就會變性。然后,用酸性乙酸鉀來中和溶液,使溶液處于中性,質(zhì)粒DNA將迅速復(fù)性,而基因組DNA,由于分子巨大,難以復(fù)性。離心后,質(zhì)粒DNA將在上清中,而基因組DNA則與細(xì)胞碎片一起沉淀到離心管的底部。通過這種方法即可將質(zhì)粒DNA從細(xì)菌中提取出來。第7頁,課件共12頁,創(chuàng)作于2023年2月三、主要試劑及作用溶液Ⅰ:由葡萄糖、EDTA、Tris-HCl組成(保護、緩沖)葡萄糖的作用是增加溶液的粘度,減少抽提過程中的機械剪切作用,防止破壞質(zhì)粒(保護作用)EDTA
的作用是絡(luò)合掉鎂等二價金屬離子,防止DNA酶對質(zhì)粒分子的降解作用(保護作用)Tris-HCl使溶菌液維持溶菌作用的最適PH范圍(緩沖作用)8第8頁,課件共12頁,創(chuàng)作于2023年2月
溶液II:由SDS(十二烷基硫酸鈉)與NaOH組成(裂解、變性)SDS的作用是解聚核蛋白并與蛋白質(zhì)分子結(jié)合使之變性(裂解細(xì)胞和蛋白質(zhì)變性作用)NaOH(PH>12)的作用是破壞氫鍵,使DNA分子變性(DNA變性作用)9第9頁,課件共12頁,創(chuàng)作于2023年2月溶液III:HAc和KAc組成的高鹽溶液(復(fù)性,分離)HAc溶液能中和溶液Ⅱ的堿性,使染色體DNA變性而發(fā)生纏繞,并使質(zhì)粒DNA復(fù)性。KAc會與SDS形成溶解度很低的鹽,并與蛋白質(zhì)形成沉淀而除去;溶液中的DNA也會與蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物纏繞成大分子而與小分子質(zhì)粒DNA分離。第10頁,課件共12頁,創(chuàng)作于2023年2月四、試劑配制
溶液Ⅰ:50mM葡萄糖,25mMTris-HCl(pH8.0),10mMEDTA(pH8.0)。
1MTris-HCl(pH8.0)12.5ml,0.5MEDTA(pH8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH2O至500ml。高壓滅菌15min,貯存于4℃。溶液Ⅱ:0.2NNaOH,1%SDS。2NNaOH1ml,10%SDS1ml,加ddH2O至10ml。使用前臨時配置。
3.溶液Ⅲ:醋酸鉀(KAc)緩沖液,pH4.8。5MKAc300ml,冰醋酸57.5ml,加ddH2O至500ml。4℃保存?zhèn)溆?。?1頁,課件共12頁,創(chuàng)作于2023年2月4.TE:10mMTris-HCl(pH8.0),1mMEDTA(pH8.0)。1MTris-HCl(pH8.0)1ml,0.5MEDTA(pH8.0)0.2ml,加ddH2O至100ml。15lbf/in2高壓濕熱滅菌20min,4℃保存?zhèn)溆谩?.苯酚/氯仿/異戊醇(25:24:1)6.乙醇(無水乙醇、70%乙醇)7.5×TBE:Tris堿54g,硼酸27.5g,EDTA-Na2·2H2O4.65g,加ddH2O至1000ml。15lbf/in2高壓濕熱滅菌20min,4℃保存?zhèn)溆谩?.R
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