分子醫(yī)學(xué)技能ppt課件-分子醫(yī)學(xué)技能-實(shí)驗(yàn)二

實(shí)驗(yàn)二

PCR檢測(cè)乙肝病毒

PCR分析apoB基因多態(tài)性實(shí)驗(yàn)二

PCR檢測(cè)乙肝病毒

PCR分析apoB基因多態(tài)性1PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖2乙肝病毒PCR實(shí)驗(yàn)操作apoB基因PCR多態(tài)性分析血清樣本處理（模板的制備）PCR檢測(cè)乙肝病毒PCR反應(yīng)上機(jī)口腔細(xì)胞總DNA（模板）apoB基因PCR實(shí)驗(yàn)操作PCR反應(yīng)上機(jī)實(shí)驗(yàn)安排乙肝病毒PCR實(shí)驗(yàn)操作apoB基因PCR多態(tài)性分析血清樣本處3PCR基本原理及相關(guān)知識(shí)PCR基本原理及相關(guān)知識(shí)4ThePolymeraseChainReactionSometimescalled"molecularphotocopying,"thepolymerasechainreaction(PCR)isafastandinexpensivetechniqueusedtoamplify,ormakemanycopiesof,smallsegmentsofDNA.Thetechnologyempowersscientiststoundergoanumberofprocesses,fromDNAfingerprintingtomappingthehumangenome.In1983,KaryMullisinventedthePCR.Theprocessisaninvaluabletooltotoday'smolecularbiologistsandbiotechnologycorporations.ThePolymeraseChainReaction5KaryB.MullisAshewrotelaterinScientificAmerican:"BeginningwithasinglemoleculeofthegeneticmaterialDNA,thePCRcangenerate100billionsimilarmoleculesinanafternoon.Thereactioniseasytoexecute.Itrequiresnomorethanatesttube,afewsimplereagentsandasourceofheat."(1944-)TheNobelPrizeinChemistry1993forhisinventionofthepolymerasechainreaction(PCR)method（1/2oftheprize

）KaryB.MullisAshewrotelat63stepand30cyclesforPCRStep1.DenaturationStep2.AnnealStep3.Extend30cyclescreateoverabillioncopiesofthesequence3stepand30cyclesforPCRSt7Step1.Denaturation（變性）Thereactionisfirstheatedtodenature(separate)thesidesofthedouble-strandedDNATemperature:~95degreesCelsius

Step1.Denaturation（變性）There8Step2.Anneal（退火）thencooledtoallowtheprimerstofindandbindtotheircomplementarysequencesontheseparatedstrands.Temperature:~55degreesCelsius

Step2.Anneal（退火）thencooled9Step3.Extend（延伸）thepolymerasetoextendtheprimersintonewcomplementarystrands.Temperature:~75degreesCelsius

Step3.Extend（延伸）thepolymera10RepeattheCyclesRepeatedheatingandcoolingcyclesmultiplythetargetDNAexponentially,sinceeachnewdoublestrandseparatestobecometwotemplatesforfurthersynthesis.Thisprocesscanthenberepeatedupto30timestocreateoverabillioncopiesofthesequence.RepeattheCyclesRepeatedheat111個(gè)循環(huán)后的結(jié)果第2個(gè)循環(huán)后的結(jié)果模版第1次的產(chǎn)物第2次的產(chǎn)物AABBCD1個(gè)循環(huán)后的結(jié)果第2個(gè)循環(huán)后的結(jié)果模版第1次的產(chǎn)物第2次的產(chǎn)12第3個(gè)循環(huán)后的結(jié)果第3次的產(chǎn)物第4個(gè)循環(huán)后的結(jié)果第4次的產(chǎn)物1A，1B，2C，2D，2EAB2C2D2E1A，1B，3C，3D，6（22+2）EAB3C3D6E第3個(gè)循環(huán)后的結(jié)果第3次的產(chǎn)物第4個(gè)循環(huán)后的結(jié)果第4次的產(chǎn)物13第N個(gè)循環(huán)后的結(jié)果第N次的產(chǎn)物1A，1B，（N-1）C，（N-1）D，(2n-2+2)

E……(2n-2+2)

EABN-1CN-1D第N個(gè)循環(huán)后的結(jié)果第N次的產(chǎn)物1A，1B，（N-1）C，（N14ComponentsforPCRReactionTemplate(dsDNA)Primers(TWOshortDNA:15-30nucleotidesinlength.Longerprimersprovidehigherspecificity

)P22Taqpolymerase（Thermusaquaticus）dNTPMix(dATP,dGTP,dTTP,dCTP)ReactionBuffer(includingMg2+)ComponentsforPCRReactionTem1510×PCR反應(yīng)緩沖液（buffer）：

已作成商品化的產(chǎn)品，它包括：250~500mmol/LKCl；

100~500mmol/LTris-HAC（pH8.4）；

15~20mmol/LMgCl2（對(duì)Taq酶的活性影響很大，一般濃度為1.5~2.0mmol/L，實(shí)際應(yīng)用時(shí)根據(jù)反應(yīng)體系的情況進(jìn)行調(diào)整）；

0.1%明膠或牛血清白蛋白10×PCR反應(yīng)緩沖液（buffer）：16

影響PCR的主要因素①

PCR反應(yīng)體系的各個(gè)組分模板的質(zhì)量、引物的設(shè)計(jì)、Taq酶的活性②

PCR循環(huán)的溫度與時(shí)間預(yù)變性、變性、退火、延伸③

PCR循環(huán)的次數(shù)和平臺(tái)效應(yīng)④

操作環(huán)境避免污染

影響PCR的主要因素17一般PCR實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)：樣品反應(yīng)不同的退火溫度梯度不同的Mg2＋濃度不同的模板濃度陰性對(duì)照反應(yīng)陽(yáng)性對(duì)照反應(yīng)一般PCR實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)：樣品反應(yīng)18PCR方法的特點(diǎn)：操作簡(jiǎn)便、時(shí)間短、特異性高、靈敏度高、實(shí)用性強(qiáng)；廣泛的應(yīng)用于醫(yī)學(xué)診斷、分子生物學(xué)、分子克隆、基因診斷、法醫(yī)學(xué)、考古學(xué)等各個(gè)領(lǐng)域。PCR方法的特點(diǎn)：操作簡(jiǎn)便、時(shí)間短、特異性高、靈敏度高、實(shí)用19二、PCR試劑盒檢測(cè)HBVDNA

實(shí)驗(yàn)操作及注意事項(xiàng)

二、PCR試劑盒檢測(cè)HBVDNA20HBV檢測(cè)試劑盒介紹構(gòu)成：DNA提取液檢測(cè)反應(yīng)管（PCR反應(yīng)體系，上樣buffer，石蠟油）陽(yáng)性模板設(shè)計(jì)：反應(yīng)管中有針對(duì)HBV的特異性引物，若出現(xiàn)與陽(yáng)性對(duì)照相同的結(jié)果，則說(shuō)明待測(cè)樣品中含有HBVHBV檢測(cè)試劑盒介紹構(gòu)成：21PCR實(shí)驗(yàn)具體操作PCR實(shí)驗(yàn)具體操作221、待測(cè)血清中DNA簡(jiǎn)單制備待測(cè)血清40ml+

40mlDNA提取液，混勻

沸水浴10min，10000rpm×5min樣品模板（用做檢測(cè)）無(wú)菌水40ml+

40mlDNA提取液

沸水浴10min，10000rpm×5min上清空白模板（做陰性反應(yīng)）上清1、待測(cè)血清中DNA簡(jiǎn)單制備待測(cè)血清40ml+

40m23實(shí)驗(yàn)分組陽(yáng)性反應(yīng)1個(gè)陰性反應(yīng)1個(gè)樣品檢測(cè)反應(yīng)4個(gè)陽(yáng)性模板2ul空白模板2ul樣品模板2ul混勻，6000rpm×5s，上PCR儀實(shí)驗(yàn)分組陽(yáng)性反應(yīng)1個(gè)陰性反應(yīng)1個(gè)樣品檢測(cè)反應(yīng)4個(gè)陽(yáng)性模板2u2493℃×3min預(yù)變性

94℃，30s55℃，30s72℃，30s

72℃保溫5min30個(gè)循環(huán)PCR反應(yīng)程序：93℃×3min預(yù)變性30個(gè)循環(huán)PCR反應(yīng)程序：三、PCR檢測(cè)

人apoB基因多態(tài)性分析PCR實(shí)驗(yàn)操作及注意事項(xiàng)

三、PCR檢測(cè)

人apoB基因多態(tài)性分析26實(shí)驗(yàn)?zāi)康募邦A(yù)期結(jié)果目的：檢測(cè)來(lái)自不同樣本的基因多樣性檢測(cè)技術(shù)：apoB基因的PCR預(yù)期結(jié)果：瓊脂糖電泳條帶的差異實(shí)驗(yàn)?zāi)康募邦A(yù)期結(jié)果目的：27apoB多態(tài)性分析的基本實(shí)驗(yàn)過(guò)程來(lái)源不同的待測(cè)樣本PCR擴(kuò)增目的基因瓊脂糖電泳結(jié)果比較分析apoB多態(tài)性分析的基本實(shí)驗(yàn)過(guò)程來(lái)源不同的待測(cè)樣本PCR擴(kuò)增28實(shí)驗(yàn)主要步驟apoB基因PCR，1人1份分裝PCR反應(yīng)液每份21ul（包括：