浙江大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)筆記8-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能-PPT幻燈片

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能研究方法X-Ray衍射NMR(核磁共振)MolecularModelingMutation/Function(分子生物學(xué))結(jié)晶困難分子量不能太大理論不太完善費(fèi)時(shí)費(fèi)力蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能研究方法1、免疫體系中分子間的識(shí)別機(jī)制2、DNA與蛋白質(zhì)的相互作用3、蛋白水解酶與疾病4、膜蛋白、受體與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)5、酶抑制劑與藥物開發(fā)本章主要內(nèi)容1.免疫體系分子的相互識(shí)別1免疫體系分子的相互識(shí)別兩種T細(xì)胞上的MHC分子是特異性識(shí)別的關(guān)鍵兩種不同的MHC分子TCR識(shí)別抗原TCR如何識(shí)別抗原MHC1分子的結(jié)構(gòu)容納抗原的口袋MHCI分子結(jié)構(gòu)2.蛋白質(zhì)與DNA的相互作用Helix-Turn-HelixHelix-Loop-HelixZinc-fingerLeucinezipper非特異性:特異性:Histones2蛋白質(zhì)與DNA的相互作用核小體上DNA與組蛋白的接觸點(diǎn)核小體的組蛋白與DNA核小體上的DNA堿基組成分布核小體的DNA堿基組成分布蛋白質(zhì)與DNA的相互作用Helix-turn-helix，HTHHelix-turn-helixHTH的分子識(shí)別機(jī)制HTH的分子識(shí)別機(jī)制HLH結(jié)構(gòu)特征HLH的結(jié)構(gòu)特征Leucine-zipper的結(jié)構(gòu)特征Lwucine-zipper結(jié)構(gòu)特征Alphahelix截面圖上Ca的位置LeucineZipper蛋白的剪刀型結(jié)合模式LeucineZipper蛋白與DNA的結(jié)合模式Zinc-finger蛋白結(jié)構(gòu)特征Zinc-finger蛋白結(jié)構(gòu)特征研究蛋白在DNA上的結(jié)合位點(diǎn)的FootPrintingFoot-Printing3.蛋白水解酶與人體疾病Cardiovasculardieseases心血管疾病HemophiliaA/B血友病Programmedcelldeath/appotosis細(xì)胞凋亡Alzheimerdisease癡呆Cancermetastasis癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移Pulmonaryemphysema/pancreatitis/arthritisParasitedisease:malaria/Tcruzain瘧疾InfluenzaA&AIDS甲型流感與愛滋病3蛋白水解酶與人體疾病血栓形成與消除血栓形成與消失LifeCycleofInfluenzaAvirus甲型流感病毒生活史A型流感病毒的H抗原蛋白的結(jié)構(gòu)域受蛋白水解酶活化后才有感染細(xì)胞的能力H抗原蛋白的結(jié)構(gòu)域AIDS病毒生活史有個(gè)必須的ProteaseAIDS病毒生活史癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移需要蛋白水解酶的幫助癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移4.膜蛋白、受體與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)4膜蛋白_受體與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)白介素-6的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)IL-6的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)FGF的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)幾條信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑5.酶抑制劑與藥物開發(fā)5酶抑制劑與藥物開發(fā)真正意義上的抗流感病毒藥物ZanamivirSialicacidGS4104真正意義上的抗流感病毒藥物金剛烷(Amantadine)的結(jié)構(gòu)作用于MatrixProtein2(M2)蛋白Amantadine結(jié)構(gòu)作用于DNA聚合酶的抗病毒藥物病毒DNA聚合酶的抑制劑，真核生物的DNA聚合酶不敏感抗病毒藥物抗AIDS病毒

的藥物（I）抗AIDS藥物I核苷類抗AIDS藥物作用原理核苷類藥物作用原理HIVprotease

HIVprotease作用于AIDS病毒專有的蛋白水解酶抗AIDS病毒的藥物（II）Viracept(Nelfinavir,Agouron,1998)Crivivian(Indinavir,Merck,1997)Invirase(Sequinavir,Roche,1995)Norvir(Ritonavir,Abbot,1997)抗AIDS藥物II抗病毒感染藥物的開發(fā)抗病毒感染抗癌藥物的研究動(dòng)態(tài)MMPinhibitorcdk2/cdk4inhibitorPoly(ADP-ribose)polymerase(PARP)inhibitorGlycinamideRibonucleotideformyltransferase(GRFT)inhibitorVDGFreceptorblocker等等，等等抗癌藥物研究動(dòng)態(tài)6.新方向與新技術(shù)1、Proteomics2、Proteinchips3、Display/molecularevolutionengineering4、Two-hybridsystem5、Geneknockoutmice

新研究方法與技術(shù)WhatisProteomics?Proteomics什么是生物芯片技術(shù)？以微點(diǎn)陣排列技術(shù)（MicroarrayTechnology）將生物大分子固定到適當(dāng)?shù)墓腆w載體上，方便各種生化和分子生物學(xué)的操作。生物芯片技術(shù)蛋白質(zhì)芯片篩選新藥的原理受體、酶的微點(diǎn)陣與中草藥抽提物反應(yīng)后再與受熒光標(biāo)記的配體或底物結(jié)合以激光進(jìn)行檢測(cè)不出現(xiàn)熒光的點(diǎn)表明中草藥樣品中含有與這些點(diǎn)上的蛋白質(zhì)相互作用的物質(zhì)，因此是作用于這些位點(diǎn)的新藥候補(bǔ)熒