浙江大學生物化學與分子生物學筆記8-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能-PPT幻燈片

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能研究方法X-Ray衍射NMR(核磁共振)MolecularModelingMutation/Function(分子生物學)結(jié)晶困難分子量不能太大理論不太完善費時費力蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能研究方法1、免疫體系中分子間的識別機制2、DNA與蛋白質(zhì)的相互作用3、蛋白水解酶與疾病4、膜蛋白、受體與信號轉(zhuǎn)導5、酶抑制劑與藥物開發(fā)本章主要內(nèi)容1.免疫體系分子的相互識別1免疫體系分子的相互識別兩種T細胞上的MHC分子是特異性識別的關(guān)鍵兩種不同的MHC分子TCR識別抗原TCR如何識別抗原MHC1分子的結(jié)構(gòu)容納抗原的口袋MHCI分子結(jié)構(gòu)2.蛋白質(zhì)與DNA的相互作用Helix-Turn-HelixHelix-Loop-HelixZinc-fingerLeucinezipper非特異性:特異性:Histones2蛋白質(zhì)與DNA的相互作用核小體上DNA與組蛋白的接觸點核小體的組蛋白與DNA核小體上的DNA堿基組成分布核小體的DNA堿基組成分布蛋白質(zhì)與DNA的相互作用Helix-turn-helix，HTHHelix-turn-helixHTH的分子識別機制HTH的分子識別機制HLH結(jié)構(gòu)特征HLH的結(jié)構(gòu)特征Leucine-zipper的結(jié)構(gòu)特征Lwucine-zipper結(jié)構(gòu)特征Alphahelix截面圖上Ca的位置LeucineZipper蛋白的剪刀型結(jié)合模式LeucineZipper蛋白與DNA的結(jié)合模式Zinc-finger蛋白結(jié)構(gòu)特征Zinc-finger蛋白結(jié)構(gòu)特征研究蛋白在DNA上的結(jié)合位點的FootPrintingFoot-Printing3.蛋白水解酶與人體疾病Cardiovasculardieseases心血管疾病HemophiliaA/B血友病Programmedcelldeath/appotosis細胞凋亡Alzheimerdisease癡呆Cancermetastasis癌細胞轉(zhuǎn)移Pulmonaryemphysema/pancreatitis/arthritisParasitedisease:malaria/Tcruzain瘧疾InfluenzaA&AIDS甲型流感與愛滋病3蛋白水解酶與人體疾病血栓形成與消除血栓形成與消失LifeCycleofInfluenzaAvirus甲型流感病毒生活史A型流感病毒的H抗原蛋白的結(jié)構(gòu)域受蛋白水解酶活化后才有感染細胞的能力H抗原蛋白的結(jié)構(gòu)域AIDS病毒生活史有個必須的ProteaseAIDS病毒生活史癌細胞的轉(zhuǎn)移需要蛋白水解酶的幫助癌細胞的轉(zhuǎn)移4.膜蛋白、受體與信號轉(zhuǎn)導4膜蛋白_受體與信號轉(zhuǎn)導白介素-6的信號轉(zhuǎn)導IL-6的信號轉(zhuǎn)導FGF的信號轉(zhuǎn)導幾條信號轉(zhuǎn)導途徑5.酶抑制劑與藥物開發(fā)5酶抑制劑與藥物開發(fā)真正意義上的抗流感病毒藥物ZanamivirSialicacidGS4104真正意義上的抗流感病毒藥物金剛烷(Amantadine)的結(jié)構(gòu)作用于MatrixProtein2(M2)蛋白Amantadine結(jié)構(gòu)作用于DNA聚合酶的抗病毒藥物病毒DNA聚合酶的抑制劑，真核生物的DNA聚合酶不敏感抗病毒藥物抗AIDS病毒

的藥物（I）抗AIDS藥物I核苷類抗AIDS藥物作用原理核苷類藥物作用原理HIVprotease

HIVprotease作用于AIDS病毒專有的蛋白水解酶抗AIDS病毒的藥物（II）Viracept(Nelfinavir,Agouron,1998)Crivivian(Indinavir,Merck,1997)Invirase(Sequinavir,Roche,1995)Norvir(Ritonavir,Abbot,1997)抗AIDS藥物II抗病毒感染藥物的開發(fā)抗病毒感染抗癌藥物的研究動態(tài)MMPinhibitorcdk2/cdk4inhibitorPoly(ADP-ribose)polymerase(PARP)inhibitorGlycinamideRibonucleotideformyltransferase(GRFT)inhibitorVDGFreceptorblocker等等，等等抗癌藥物研究動態(tài)6.新方向與新技術(shù)1、Proteomics2、Proteinchips3、Display/molecularevolutionengineering4、Two-hybridsystem5、Geneknockoutmice

新研究方法與技術(shù)WhatisProteomics?Proteomics什么是生物芯片技術(shù)？以微點陣排列技術(shù)（MicroarrayTechnology）將生物大分子固定到適當?shù)墓腆w載體上，方便各種生化和分子生物學的操作。生物芯片技術(shù)蛋白質(zhì)芯片篩選新藥的原理受體、酶的微點陣與中草藥抽提物反應后再與受熒光標記的配體或底物結(jié)合以激光進行檢測不出現(xiàn)熒光的點表明中草藥樣品中含有與這些點上的蛋白質(zhì)相互作用的物質(zhì)，因此是作用于這些位點的新藥候補熒