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分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)講義示例分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)講義示例CTAB法提取植物基因組DNA【實(shí)驗(yàn)背景】高等動物,高等植物的基因組相當(dāng)龐大,一些物種的特定基因組包括了該物種生長,發(fā)育,繁殖等各項(xiàng)生理活動的幾乎全部信息量,因而對真核細(xì)胞基因組的結(jié)構(gòu),組成,以及表達(dá)調(diào)控的研究是至關(guān)重要的,而提取要求是獲得純度高和收得率高?!緦?shí)驗(yàn)?zāi)康摹?、掌握植物材料基因組DNA的CTAB法提取分離基本原理的方法;2、掌握微量移液槍、液氮研磨、微量試管、高速離心機(jī)等使用操作技術(shù)?!緦?shí)驗(yàn)原理】植物組織采用液氮研磨達(dá)到細(xì)胞破碎,細(xì)胞內(nèi)容物采用CTAB分離蛋白質(zhì)、多糖,再有苯酚、氯仿、異戊醇混合液萃取純化,RNA由RNA酶消化,分離出的DNA由無水乙醇沉淀分離【材料儀器】材料:幼嫩的植物材料1.0g左右(紅葉石楠)儀器:移液槍、電子天平、恒溫水浴箱、高速離心機(jī)、EP管、液氮、研磨等?!緦?shí)驗(yàn)試劑】抽提緩沖液(2×CTAB溶液):2%CTAB(十六烷基三甲基溴化銨)、20mmol/LEDTA、1.4mol∕LNaCL、1%β-巰基乙醇、0.1%PVP(聚乙烯吡咯烷酮)、100mmol∕LTriS-HCl(pH=8.0)TE:10MmTris-HCl(pH=8.0),1mMEDTA其他試劑:液氮、RNA酶、氯仿、異戊醇、CTAB、無水乙醇、苯酚、EDTA等【實(shí)驗(yàn)操作】取1.0g植物材料,雙蒸水洗凈,并用濾紙吸干植物材料剪成0.5cm左右碎片,放入預(yù)冷的瓷研磨中。加入液氮速冷,研磨成細(xì)粉(越細(xì)越好)。轉(zhuǎn)入加有抽提緩沖液3.0ml的5ml離心管60℃水浴保溫1小時(不時轉(zhuǎn)動試管)分裝成2個2,mlEP管,15,000rpm,離心10分鐘取上清轉(zhuǎn)入另一個新的離心管,加入等體積氯仿:異戊醇(24:1),混合均勻抽提至水乳膠融狀。15,000rpm離心5分鐘上清液轉(zhuǎn)移到另一離心管中,加入0.8-1.0倍體積預(yù)冷異戊醇,-20C。保溫30分鐘一1小時,緩緩混勻DNA成絮狀折出15,000rpm,離心5分鐘,棄上清DNA沉淀用冰冷的70%乙醇洗2次揮發(fā)盡乙醇后,用200μlTE緩沖液溶解DNA,-20℃凍存?!咀⒁馐马?xiàng)】1、使用新鮮、幼嫩的材料,材料應(yīng)適量。2、如果樣品容易呈粘稠狀,可能含有較多的多糖。3、如果樣品溶液呈棕色,可能含有較多的.酚類物質(zhì)。4、操作過程中避免劇烈振蕩,器件、器皿和試劑需要高溫滅菌?!舅伎碱}】1、為什么要用新鮮、幼嫩的植物組織材料?2、為什么在操作過程中避免劇烈振蕩?3、為什么器件、器皿和試劑需要高溫滅菌?4、如何提高提取植物組織DNA的產(chǎn)量?苯酚:作為蛋白變性劑同時抑制了DNaSe的降解作用.用苯酚處理勻漿液時由于蛋白與DNA聯(lián)結(jié)鍵已斷蛋白分子表面又含有很多極性基團(tuán)與苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。氯仿:也可使蛋白質(zhì)變性并加速有機(jī)相與液相分層。異戊醇:有助于消除抽提過程中產(chǎn)生的氣泡。CTAB法原理CTAB(hexadecyltrimethylammonium匕「。^^巳十六烷基三甲基溴化銨),是一種陽離子去污劑,具有從低離子強(qiáng)度溶液中沉淀核酸與酸性多聚糖的特性。在高離子強(qiáng)度的溶液中(0.7mol∕LNa
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