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文檔簡(jiǎn)介

生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)

主題標(biāo)引基礎(chǔ)余恩琳

汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院圖書(shū)館

elyu@Basicknowledgeofbiomedicalliteraturesubjectindexing

一、基本知識(shí)1.標(biāo)引(Indexing)的概念:是對(duì)文獻(xiàn)進(jìn)行主題分析,從自然語(yǔ)言轉(zhuǎn)換成規(guī)范化的檢索語(yǔ)言的過(guò)程。對(duì)文獻(xiàn)給予分類(lèi)號(hào)標(biāo)識(shí)的過(guò)程,稱為分類(lèi)標(biāo)引(Classificationindexing);給予主題詞標(biāo)識(shí)的過(guò)程,稱為主題標(biāo)引(SubjectIndexing)。-------國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)局GB3860-83《文獻(xiàn)主題標(biāo)引規(guī)則》

簡(jiǎn)言之,標(biāo)引就是對(duì)文獻(xiàn)主題分析的結(jié)果賦予檢索標(biāo)識(shí)的過(guò)程。而檢索標(biāo)識(shí),是一種代表文獻(xiàn)主題的標(biāo)記符號(hào)。如分類(lèi)號(hào)、主題詞、關(guān)鍵詞等。

2.文獻(xiàn)檢索標(biāo)識(shí):

外部特征:著者、文獻(xiàn)號(hào)內(nèi)容特征:分類(lèi)號(hào)標(biāo)識(shí)主題詞標(biāo)識(shí):關(guān)鍵詞(自然標(biāo)識(shí))單元詞、標(biāo)題詞及敘詞(人為標(biāo)識(shí))3.主題標(biāo)引的幾個(gè)基本概念(1)主題詞(SubjectHeadings):

也稱敘詞(Descriptors),是一些以概念為基礎(chǔ)的,經(jīng)過(guò)規(guī)范化和優(yōu)選處理的,具有組配功能,并能顯示詞間語(yǔ)義關(guān)系和動(dòng)態(tài)性的詞和詞組。是用來(lái)揭示文獻(xiàn)主題內(nèi)容,標(biāo)引和檢索文獻(xiàn)的一種信息檢索語(yǔ)言詞匯。主題詞主要特點(diǎn):①概念性(concept):事物概念自然語(yǔ)言文獻(xiàn)信息內(nèi)容概念信息檢索語(yǔ)言注:主題詞為實(shí)詞,指事物的具體層面②規(guī)范化(Normalize):指對(duì)自然語(yǔ)言的詞形和詞義進(jìn)行限制,使一個(gè)詞只能表達(dá)一個(gè)概念,或一個(gè)概念只能用一個(gè)詞來(lái)表達(dá),即詞和概念是一一對(duì)應(yīng)的關(guān)系。通過(guò)詞表來(lái)控制。③優(yōu)選處理(Priority):詞表收詞有限,不是所有的自然語(yǔ)言詞匯都可以作用主題詞。通過(guò)詞頻統(tǒng)計(jì)確定。④組配(Cooperation)⑤語(yǔ)義關(guān)系(semanticrelation):指主題詞之間的內(nèi)在聯(lián)系。主要包括等同關(guān)系、等級(jí)關(guān)系和相關(guān)關(guān)系⑥動(dòng)態(tài)性(Dynamic):指主題詞表中的詞的更新變化。(2)主題詞法(敘詞法)是直接以代表事物名稱或概念的規(guī)范化的名詞術(shù)語(yǔ),作為表達(dá)文獻(xiàn)主題內(nèi)容的標(biāo)識(shí)符號(hào),并依據(jù)這些標(biāo)識(shí)符號(hào)的語(yǔ)義和字順,編排和組織文獻(xiàn)檢索工具的一種方法。簡(jiǎn)言之就是利用敘詞原理建立檢索系統(tǒng)的一種方法。敘詞法的基本特征:①按文獻(xiàn)所論述的事物(即主題)集中文獻(xiàn);②用人們?nèi)粘J褂玫拿~術(shù)語(yǔ)經(jīng)過(guò)規(guī)范化后直接表達(dá)文獻(xiàn)所論述的事物;③用參照系統(tǒng)等間接顯示事物概念之間(即主題之間)的關(guān)系;④用字順序列直接提供按事物名稱檢索文獻(xiàn)的途徑(即主題檢索途徑)。(3)主要主題詞(MajorMeSHHeadings,Mjme)對(duì)文獻(xiàn)核心主題概念的標(biāo)識(shí)。某種實(shí)驗(yàn)研究的直接目的和結(jié)果;臨床疾病的預(yù)防、診斷、治療等主要手段、方法和創(chuàng)新;

一篇文獻(xiàn)中占篇幅較多的內(nèi)容等。

在MEDLARS-MEDLINE系統(tǒng)中,用加權(quán)符號(hào)“*”表示如:*Aspirin/therapeuticuse注:主要主題詞對(duì)應(yīng)主題檢索中的加權(quán)概念(4)次要主題詞(MinorMeSHHeadings,Mime)指對(duì)文章論述的次重點(diǎn)概念的標(biāo)識(shí)

它們可能是主要標(biāo)引的組配標(biāo)引詞,為了某種研究目的所提供的載體、條件、方法和手段、治療學(xué)中提到的藥物制劑、實(shí)驗(yàn)動(dòng)物類(lèi)型、人類(lèi)的性別與年齡組、文獻(xiàn)類(lèi)別、語(yǔ)種等。(5)組配(Cooperation)按一定規(guī)則,用兩個(gè)或兩個(gè)以上的主題詞(或主題詞與副主題詞)構(gòu)成邏輯關(guān)系組合來(lái)表達(dá)一個(gè)專指概念的方法。形式:(A)主題詞+主題詞交叉組配

病毒性心臟?。募⊙撞《拘孕募⊙?/p>

(B)主題詞/副主題詞限定組配錳/中毒鋅/缺乏4、標(biāo)引與檢索的關(guān)系文獻(xiàn)主題概念主題分析規(guī)范語(yǔ)標(biāo)引過(guò)程課題主題概念主題分析檢索過(guò)程檢索提問(wèn)式詞表檢索系統(tǒng)檢索結(jié)果轉(zhuǎn)換轉(zhuǎn)換標(biāo)引是手段檢索是目的標(biāo)引為檢索服務(wù)標(biāo)引和檢索關(guān)系圖,即檢索原理圖5、學(xué)習(xí)文獻(xiàn)標(biāo)引的意義:(1)方便檢索,提高檢索效率,使查準(zhǔn)率與查全率保持合理的水平;(2)了解標(biāo)引知識(shí),便于專業(yè)研究

如發(fā)表文章

標(biāo)識(shí)“中圖類(lèi)號(hào)”標(biāo)識(shí)關(guān)鍵詞(盡量使用規(guī)范化的主題詞,提高文章被檢索出來(lái)的概率,從而提高被引用率)6.目前常用的幾種文獻(xiàn)分類(lèi)法(1)《中國(guó)人民大學(xué)圖書(shū)館圖書(shū)分類(lèi)法》(2)《中國(guó)科學(xué)院圖書(shū)館圖書(shū)分類(lèi)法》(3)《中國(guó)圖書(shū)館分類(lèi)法》(4)《杜威十進(jìn)分類(lèi)法》(DC)(5)《美國(guó)國(guó)會(huì)圖書(shū)館圖書(shū)分類(lèi)法》(LC)(6)《美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館圖書(shū)分類(lèi)法》(NLMC)1、中國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)標(biāo)引系統(tǒng)中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院、中國(guó)中醫(yī)研究院聯(lián)合設(shè)計(jì)以NLMMEDLARS及《漢語(yǔ)主題詞表》為依托標(biāo)引依據(jù):《MeSH》、《中醫(yī)藥學(xué)主題詞表》2、醫(yī)學(xué)主題詞表(MedicalsubjectHeadings,MeSH)NLM編制,21,000個(gè)主題詞,83個(gè)副主題詞(Subheadings)嚴(yán)規(guī)范化字順表,樹(shù)狀結(jié)構(gòu)表(輔表)用途:標(biāo)引和檢索(確保主題標(biāo)引者和主題檢索者在用語(yǔ)上的一致)MeSH對(duì)文獻(xiàn)作者、讀者所使用的自然語(yǔ)言進(jìn)行規(guī)范,主要體現(xiàn)單一性、動(dòng)態(tài)性兩個(gè)特點(diǎn)二、主題標(biāo)引(SubjectIndexing)單一性:(1)規(guī)定概念與主題詞的單一對(duì)應(yīng),即一個(gè)主題詞只能表達(dá)一個(gè)概念,決不允許一詞多義或一義多詞;(2)目的是使討論同一概念的文獻(xiàn)不至于分散,保證檢索方便、準(zhǔn)確和全面。如:乙酰水楊酸見(jiàn)阿司匹林;KidneyCancer/KidneyTumor/KidneyCarcinomor/Neoplasms,Kidney

seeKidneyNeoplasms動(dòng)態(tài)性:指詞表的每年增刪修訂。主題詞及副主題詞隨學(xué)科研究的不斷深化加以補(bǔ)充和新舊更替3、醫(yī)學(xué)主題詞選詞范圍

(1)器官、組織、細(xì)胞A(2)疾病病理學(xué)C(3)藥物、化學(xué)物質(zhì)、內(nèi)源性物質(zhì)和其他物質(zhì)D(4)操作技術(shù),含診斷、治療、外科、麻醉、分析E(5)行為醫(yī)學(xué)、心理學(xué)及精神病學(xué)F(6)有機(jī)體:微生物、動(dòng)植物B(7)生理、生物學(xué)G(8)公共衛(wèi)生保健科學(xué)及事業(yè)N(9)與醫(yī)學(xué)相關(guān)的自然科學(xué)H、社會(huì)科學(xué)I、人文科學(xué)K、情報(bào)科學(xué)等L、工業(yè)農(nóng)業(yè)J(10)地理區(qū)域Z4、主題詞的基本形式:(1)單個(gè)詞:Brain、Electrocardiography

(2)詞組:

直接形式:BloodChemicalAnalysis,LungNeoplasms倒置形式:KidneyFailure(字順表)KidneyFailure,Acute

KidneyFailure,ChronicCardiovascularDiseases(樹(shù)狀結(jié)構(gòu)表)VascularDiseasesHypertension

Hypertension,MalignantHypertension,Pregnancy-InducedHypertension,RenalHypertension,Renovascular注:主題詞采用倒置形式的主要目的,是使同屬某一概念的文獻(xiàn)能按字順相對(duì)集中在一起;也方便在檢索過(guò)程中選詞。免疫和生物因子

生物因子

生長(zhǎng)物質(zhì)

白細(xì)胞介素類(lèi)

白細(xì)胞介素1

白細(xì)胞介素2

白細(xì)胞介素3

白細(xì)胞介素4

白細(xì)胞介素5

白細(xì)胞介素6

白細(xì)胞介素7

白細(xì)胞介素8

白細(xì)胞介素9

白細(xì)胞介素10

白細(xì)胞介素11

白細(xì)胞介素12

白細(xì)胞介素13

白細(xì)胞介素14

白細(xì)胞介素15

白細(xì)胞介素16

白細(xì)胞介素17

白細(xì)胞介素18

BiologicalFactorsIntercellularSignalingPeptidesandProteinsCytokinesInterleukins

Interleukin-1Interleukin-1alphaInterleukin-1betaInterleukin-10Interleukin-11Interleukin-12Interleukin-12Subunitp35Interleukin-12Subunitp40Interleukin-13Interleukin-15Interleukin-16Interleukin-17Interleukin-18Interleukin-2Interleukin-23Interleukin-12Subunitp40Interleukin-23Subunitp19Interleukin-3Interleukin-4Interleukin-5Interleukin-6Interleukin-7Interleukin-8Interleukin-9(樹(shù)狀結(jié)構(gòu)表)5、醫(yī)學(xué)主題詞表(MeSH)的局限

(1)有關(guān)中醫(yī)中藥的主題詞極少;(2)有些概念不能找到合適的主題詞來(lái)表達(dá)

如:藥物治療的量、原發(fā)與繼發(fā)(腫瘤除外)、經(jīng)常與罕見(jiàn)

(3)對(duì)某些綜合征沒(méi)有適當(dāng)?shù)闹黝}詞表達(dá),有關(guān)反映新技術(shù)、新概念的詞匯出現(xiàn)仍嫌較晚

如SARS(4)地理主題詞:美國(guó)的地理名詞較詳,美國(guó)以外的國(guó)家只有國(guó)家名及部分大城市名6、副主題詞(Subheadings)也稱限定詞(Qualifiers)用于對(duì)某個(gè)主題詞進(jìn)行限定,將同一主題內(nèi)容的文獻(xiàn)再按照不同的研究側(cè)面作進(jìn)一步的劃分,提高主題詞的專指度,以便檢索者準(zhǔn)確快捷定位自己最關(guān)心的文獻(xiàn)所在區(qū)域;此外還可以擴(kuò)大詞匯量。MeSH詞表有83個(gè)副主題詞,中醫(yī)藥學(xué)主題詞表有11個(gè)副主題詞

注意:副主題詞與主題詞相組配使用,但并不是所有的副主題詞可以與任何一個(gè)主題詞隨意組配,它有一定的組配限定,而且為適應(yīng)學(xué)科發(fā)展,其限定范圍及時(shí)變更。副主題詞常常是事物的通用層面7、常用副主題詞簡(jiǎn)介(1)Adverseeffects副作用(AE)用于診斷、治療、預(yù)防或麻醉的藥物,化學(xué)物質(zhì)、生物和物理作用物,以及制造的產(chǎn)品在正常用量時(shí)引起的不良反應(yīng)(包括:過(guò)敏或特異性反應(yīng)),也用于診斷、治療、預(yù)防、麻醉、外科手術(shù)及其他措施時(shí)的副作用或并發(fā)癥,但不包括禁忌癥。

例1、冷凍療法的并發(fā)癥冷凍療法(CRYOTHERAPY)/副作用

例2、青霉素引起過(guò)敏(Penicilins)Penicilins/AE或Penicilins/Adverseeffects(2)Analysis分析(AN)

用于一種物質(zhì),其成分或其代謝產(chǎn)物的鑒定或定量測(cè)定,注意與/化學(xué)、/血液、/尿、/腦脊髓液、/分離與提純、代謝、/藥代動(dòng)力學(xué)等區(qū)別例3、肝臟的青霉素濃度

青霉素類(lèi)/分析肝/代謝

(3)Biosynthesis生物合成(BI)用于生物體的活細(xì)胞或亞細(xì)胞成分的化學(xué)物質(zhì)的形成例4、痛風(fēng)時(shí)肝內(nèi)的氨基酸合成

氨基酸類(lèi)/生物合成肝/代謝痛風(fēng)/代謝(4)Blood血液(BL)(/Urine尿/CerebrospinalFluid腦脊髓液)用于正?;蚣膊顟B(tài)血液中的內(nèi)含物及其分析、檢查或變化。不包括血清診斷和血清學(xué),前者用/診斷,后者用/免疫學(xué)例5、妊娠期中血青霉素G的含量妊娠/血液青霉素G/血液

(5)Chemicalsynthesis化學(xué)合成(CS)用于體外分子的化學(xué)制備。在生物、細(xì)胞或亞細(xì)胞領(lǐng)域內(nèi)形成化學(xué)物質(zhì)時(shí)用/生物合成

例6、青霉素的制備青霉素類(lèi)/化學(xué)合成(6)Chemicalinduced化學(xué)誘導(dǎo)(CI)用于人或動(dòng)物由于化學(xué)化合物引起的疾病,綜合征、先天性異?;蝮w征。注意用在藥物或化學(xué)物質(zhì)名稱之后加/副作用、/中毒、/毒性的副主題詞作配伍

例7、與氯喹有關(guān)的眼疾病眼疾病/化學(xué)誘導(dǎo)

氯喹/副作用

(7)Complications并發(fā)癥(CO)用于疾病同時(shí)或隨后發(fā)生的狀態(tài),即同時(shí)存在的疾病,并發(fā)癥或后遺癥。注意與/病因?qū)W的區(qū)別

例8、眼弓形體病并發(fā)的青光眼眼弓形體病/并發(fā)癥青光眼/并發(fā)癥(8)Contraindications禁忌癥(CT)與藥品、化學(xué)物質(zhì)以及生物和物理因素主題詞組配,表明在任何疾病或生理狀態(tài)時(shí)可能使這些治療成為不合適、不需要或不可取,也用于診斷、治療、預(yù)防、麻醉、外科手術(shù)或其他操作的禁忌癥。注意與/副作用、/中毒、/毒性區(qū)別

例9、孕婦禁用奎寧奎寧/禁忌癥妊娠/藥物作用

(9)Cytology細(xì)胞學(xué)(CY)用于單細(xì)胞或多細(xì)胞生物的正常細(xì)胞形態(tài)學(xué),注意與/病理學(xué)、/超微結(jié)構(gòu)區(qū)別

例10、胰腺的細(xì)胞學(xué)胰腺/細(xì)胞學(xué)(10)Diagnosis診斷(DI)用于各種疾病的診斷,包括檢查、鑒別診斷及預(yù)后,但不包括普查或放射線診斷,前者用/預(yù)防和控制,后者用/放射照相術(shù),超聲診斷用/超聲檢查例11、癲癇的腦電描記法診斷

癲癇/診斷腦電描記術(shù)

(11)Diagnositcuse診斷應(yīng)用(DU)用于應(yīng)用化學(xué)物質(zhì)、藥物,物理動(dòng)因來(lái)研究某些器官的臨床功能或診斷人或動(dòng)物的疾病。注意與/診斷配伍(12)Diettherapy飲食療法(DH)用于疾病的飲食性或營(yíng)養(yǎng)性治療;但不包括維生素和礦物質(zhì)的補(bǔ)充,后者用/藥物療法例12、消化性潰瘍的飲食治療

消化性潰瘍/飲食療法

(13)Drugeffects藥物作用(DE)用于藥物和化學(xué)物質(zhì)對(duì)器官、部位、組織或機(jī)體的生理和精神過(guò)程作用。注意藥物要與/藥理學(xué)組配配伍例13、青霉素G對(duì)心臟的影響

青霉素G/藥理學(xué)

心臟/藥物作用(14)Drugtherapy藥物療法(DT)用于疾病通過(guò)投給藥物,化學(xué)物質(zhì)及抗生素來(lái)治療或預(yù)防疾病,不包括免疫治療或生物制品治療,后者用/治療,注意與/飲食療法、/放射療法的區(qū)別,可與/治療應(yīng)用配伍

(15)Etiology病因?qū)W(ET)用于疾病以探討致病原因,包括微生物、環(huán)境和社會(huì)因素,起病因作用的個(gè)人習(xí)慣等,包括致病機(jī)理,如果引起疾病的因素是藥物,應(yīng)用/化學(xué)誘導(dǎo)

可與/并發(fā)癥配伍(16)Immunology免疫學(xué)(IM)用于組織、器官、微生物、真菌、病毒和動(dòng)植物的免疫學(xué)研究,包括疾病的免疫方面,但不包括用于診斷、預(yù)防或治療等目的免疫手段,這些應(yīng)用/診斷、/預(yù)防和控制、/治療等,

例14、痛風(fēng)的抗體形成痛風(fēng)/免疫學(xué)抗體形成

例15、痛風(fēng)的血清學(xué)診斷

痛風(fēng)/診斷血清診斷

(17)Metabolism代謝(ME)

用于器官、細(xì)胞和亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)、生物和生物化學(xué)變化及代謝。也用于藥物或化學(xué)物質(zhì)的合成代謝(由小分子轉(zhuǎn)化成大分子)及分解代謝(即由復(fù)雜物質(zhì)裂解成簡(jiǎn)單物質(zhì))。但/生物合成、/酶學(xué)、/分泌、/藥代動(dòng)力學(xué)另有專門(mén)副主題詞

例16、精神分裂癥時(shí)腦的血清素代謝血清素(Serotonin)/代謝

腦(Brain)/代謝

精神分裂癥(Schizophrenia)/代謝(18)Microbiology微生物學(xué):用于器官、動(dòng)物、高等植物和疾病的微生物學(xué)研究;(MI)Parasiology/寄生蟲(chóng)學(xué):用于動(dòng)物、高等植物、器官和疾病的寄生蟲(chóng)因素,不用于診斷中暗示的寄生蟲(chóng)因素;(PS)Pathogenicity/致病力:用于微生物、病毒、寄生蟲(chóng)對(duì)人和動(dòng)物引致疾病的能力(PY)

例17、從牛的腸道中分離出真菌真菌/分離和提純腸/微生物學(xué)牛/微生物學(xué)(19)Pathology病理學(xué)(PA)用于疾病狀態(tài)的器官、組織和細(xì)胞的結(jié)構(gòu),注意與/解剖學(xué)和組織學(xué)、/細(xì)胞學(xué)、/超微結(jié)構(gòu)區(qū)別

例18、正常的肝細(xì)胞和病理性肝細(xì)胞

肝/細(xì)胞學(xué)肝/病理學(xué)(20)Pharmacology藥理學(xué)(PD)用于藥物和投給的化學(xué)物質(zhì)對(duì)組織和機(jī)體的作用,包括對(duì)生理和對(duì)生物化學(xué)過(guò)程的加速抑制及其藥理作用機(jī)理。

例19、新斯的明對(duì)呼吸動(dòng)力的影響

新斯的明/藥理學(xué)呼吸/藥物作用(21)Physiology生理學(xué)(PH)用于器官、組織、單細(xì)胞和多細(xì)胞生物的正常功能,也用于內(nèi)源性生化物質(zhì)所產(chǎn)生的生理作用。例20、肝臟的功能

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