生物信息學(xué)智慧樹知到課后章節(jié)答案2023年下華東理工大學(xué)

生物信息學(xué)智慧樹知到課后章節(jié)答案2023年下華東理工大學(xué)華東理工大學(xué)

第一章測(cè)試

隨著人類基因組計(jì)劃的完成，以下哪些基因組計(jì)劃是近期啟動(dòng)的計(jì)劃

A:中國十萬人基因組計(jì)劃B:G10KC:我們所有人計(jì)劃D:英國十萬人基因組計(jì)劃

答案:中國十萬人基因組計(jì)劃;G10K;我們所有人計(jì)劃;英國十萬人基因組計(jì)劃

統(tǒng)計(jì)學(xué)是一門獨(dú)特學(xué)科，不是生物信息學(xué)研究工具和手段之一。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:錯(cuò)

生物信息學(xué)研究任務(wù)之一包括SNP的發(fā)現(xiàn)和鑒定，對(duì)于疾病機(jī)理和藥物開發(fā)靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)具有重要意義。

A:錯(cuò)B:對(duì)

答案:對(duì)

隨著越來越多大規(guī)模測(cè)序項(xiàng)目的完成，其中最重要的科學(xué)使命之一就是要通過比較基因組學(xué)方法了解物種的起源和進(jìn)化過程

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

高等生物基因組中含有大量的非編碼區(qū)，以及可能含有大量的外源病毒序列，只有通過生物信息學(xué)方法，解析其中功能和區(qū)域，為將來可能通過基因組編輯技術(shù)進(jìn)行疾病機(jī)制解析提供基礎(chǔ)

A:錯(cuò)B:對(duì)

答案:對(duì)

第二章測(cè)試

國際核酸數(shù)據(jù)庫由EMBL，DDBJ和GenBank組成，它們?cè)?988年形成國際核酸數(shù)據(jù)庫聯(lián)合中心，對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行

A:三方共享B:獨(dú)立分析C:數(shù)據(jù)同步更新D:數(shù)據(jù)格式相同

答案:三方共享;數(shù)據(jù)同步更新;數(shù)據(jù)格式相同

GenBank對(duì)于核酸數(shù)據(jù)的顯示方式有以下幾種

A:ASN.1B:FASTAC:GraphD:GBK

答案:ASN.1;FASTA;Graph;GBK

UniprotKB對(duì)于生物數(shù)據(jù)在不同數(shù)據(jù)庫中的鏈接、調(diào)用和標(biāo)簽轉(zhuǎn)換具有非常重要的作用

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

生物信息學(xué)的研究對(duì)象中包括各種數(shù)據(jù)庫，比如

A:UniprotB:PDBC:GenBankD:KEGG

答案:Uniprot;PDB;GenBank;KEGG

BLAST是基于局部比對(duì)算法，采用漸進(jìn)式比對(duì)方法，對(duì)數(shù)據(jù)分成字段等思路進(jìn)行的成對(duì)比對(duì)方法

A:錯(cuò)B:對(duì)

答案:對(duì)

第三章測(cè)試

全局序列比對(duì)用于整體相似性程度較低、在較小區(qū)域內(nèi)有局部相似性的兩個(gè)序列比對(duì)。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:錯(cuò)

以下哪些屬于蛋白質(zhì)打分矩陣？

A:PAM矩陣B:遺傳密碼矩陣C:疏水矩陣D:BLOSUM矩陣

答案:PAM矩陣;遺傳密碼矩陣;疏水矩陣;BLOSUM矩陣

傳統(tǒng)的基于動(dòng)態(tài)規(guī)劃的局部性比對(duì)性算法采用的是精確的序列比對(duì)，雖然有著較好的比較結(jié)果，但是算法的時(shí)間復(fù)雜度較高。

A:錯(cuò)B:對(duì)

答案:對(duì)

在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中比對(duì)蛋白質(zhì)序列，需要選擇一下那種blast模式？

A:tblastnB:blastpC:blastxD:blastn

答案:blastp

多序列比對(duì)就是兩條以上的序列進(jìn)行比對(duì)，可以用于進(jìn)化樹分析、尋找保守區(qū)域等。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

第四章測(cè)試

基因的預(yù)測(cè)軟件主要有

A:GENOMESCANB:CpGPlotC:PromoterscanD:GENSCAN

答案:GENOMESCAN;CpGPlot;GENSCAN

基因結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)是基因組測(cè)序后的最重要一個(gè)步驟，真核生物和原核生物因?yàn)槊艽a子表的不同，方法會(huì)有所不同。各種預(yù)測(cè)方法得到的結(jié)果也有所不同

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

CpG島指的是一段（）bp長度的DNA序列，G+C含量達(dá)到（）以上，與基因的存在相關(guān)性達(dá)到60-80%以上

A:500，70B:50，50C:200，50D:100，25

答案:200，50

CodonW是密碼子偏好性分析軟件，以下哪些功能可以用該軟件分析

A:有效密碼子數(shù)B:密碼子偏性指數(shù)C:最優(yōu)密碼子使用頻率D:密碼子適應(yīng)指數(shù)

答案:有效密碼子數(shù);密碼子偏性指數(shù);最優(yōu)密碼子使用頻率;密碼子適應(yīng)指數(shù)

隨著鏈特異性轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)等的大量應(yīng)用，為基因的鑒定提供了一個(gè)更為直接的工具和數(shù)據(jù)庫

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

第五章測(cè)試

二代測(cè)序技術(shù)平臺(tái)包括

A:454平臺(tái)B:ABI3730C:IonTorrentD:IlluminaSolexa

答案:454平臺(tái);IlluminaSolexa

二代測(cè)序技術(shù)技術(shù)總體思路是統(tǒng)計(jì)學(xué)（大量重復(fù)）、分子生物學(xué)（如PCR和連接反應(yīng)）和微液滴/微流控化學(xué)反應(yīng)

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

IluminaSolexa對(duì)測(cè)序?qū)ο筮M(jìn)行測(cè)序時(shí)需要采用P5和P7引物進(jìn)行擴(kuò)增，其目的是與芯片中植入的寡核苷酸進(jìn)行配對(duì)，從而固定到芯片上，為后續(xù)邊測(cè)序邊合成打下良好基礎(chǔ)。

A:錯(cuò)B:對(duì)

答案:對(duì)

IluminaSolexa測(cè)序技術(shù)的核心步驟是邊測(cè)序邊合成(SBS)，其中每一步加入一種熒光標(biāo)記以及修飾過的堿基，其目的在于（）：

A:阻斷擴(kuò)增反應(yīng)B:保護(hù)堿基C:加強(qiáng)堿基配對(duì)D:增強(qiáng)熒光

答案:阻斷擴(kuò)增反應(yīng)

IluminaSolexa測(cè)序技術(shù)的技術(shù)缺點(diǎn)是不能測(cè)定很長的序列，其根本原因在于PCR擴(kuò)增摻入堿基時(shí)，難以做到所有反應(yīng)隨著時(shí)間和測(cè)序長度的平齊性。

A:錯(cuò)B:對(duì)

答案:對(duì)

與IlluminaSolexa相比，454測(cè)序技術(shù)平臺(tái)的缺點(diǎn)是熒光試劑成本高，而且會(huì)產(chǎn)生相同堿基的連續(xù)摻入。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

二代測(cè)序技術(shù)平臺(tái)因?yàn)椴捎么笠?guī)模平行測(cè)序思路，可以用于統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，因此有很多應(yīng)用領(lǐng)域

A:ChIP-seqB:RNA-seqC:sRNA-seqD:Tnseq

答案:ChIP-seq;RNA-seq;sRNA-seq;Tnseq

第六章測(cè)試

UniProt數(shù)據(jù)庫整合了哪三大數(shù)據(jù)庫資源？

A:Swiss-ProtB:TrEMBLC:KEGGD:PIR-PSD

答案:Swiss-Prot;TrEMBL;PIR-PSD

以下哪項(xiàng)參數(shù)無法通過一級(jí)序列的理化性質(zhì)計(jì)算獲得？

A:相對(duì)分子質(zhì)量B:等電點(diǎn)C:消光系數(shù)D:進(jìn)化關(guān)系

答案:進(jìn)化關(guān)系

疏水作用力是蛋白質(zhì)折疊的主要驅(qū)動(dòng)力，氨基酸親疏水性等分析為高級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)提供參。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

PDB數(shù)據(jù)庫中同時(shí)包含了利用實(shí)驗(yàn)解析和計(jì)算模擬的生物大分子的三維結(jié)構(gòu)信息。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:錯(cuò)

蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的方法包括哪些？

A:折疊識(shí)別B:序列比對(duì)C:從頭預(yù)測(cè)D:同源建模

答案:折疊識(shí)別;從頭預(yù)測(cè);同源建模

利用計(jì)算手段預(yù)測(cè)的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)能達(dá)到很高的準(zhǔn)確性，不需要再進(jìn)行優(yōu)化了。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:錯(cuò)

以下關(guān)于同源建模的說法中，表述錯(cuò)誤的是（）？

A:同源建模的理論基礎(chǔ)是一級(jí)序列相似的蛋白質(zhì)，其三維結(jié)構(gòu)也相似B:同源建模時(shí)只能選擇一個(gè)結(jié)構(gòu)作為模板來建模C:建模過程中需要對(duì)整體結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化并進(jìn)行合理性檢測(cè)D:同源建模時(shí)需要進(jìn)行序列比對(duì)分析模板序列與目標(biāo)序列之間的異同

答案:同源建模時(shí)只能選擇一個(gè)結(jié)構(gòu)作為模板來建模

以下分子力場(chǎng)中，不屬于非鍵作用的是（）？

A:氫鍵相互作用B:靜電相互作用C:范德華相互作用D:鍵的伸縮

答案:鍵的伸縮

分子對(duì)接可以分為哪幾種類型？

A:柔性對(duì)接B:半剛性對(duì)接C:剛性對(duì)接D:半柔性對(duì)接

答案:柔性對(duì)接;剛性對(duì)接;半柔性對(duì)接

分子動(dòng)力學(xué)模擬可以獲得蛋白質(zhì)在溶液中一段時(shí)間內(nèi)的運(yùn)動(dòng)情況，但是消耗計(jì)算資源。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

第七章測(cè)試

代謝物組分析可在代謝靶標(biāo)分析、代謝物譜分析和代謝指紋分析三個(gè)層次上開展。

A:錯(cuò)B:對(duì)

答案:對(duì)

代謝網(wǎng)絡(luò)研究所建立的模型可分為計(jì)量模型、調(diào)控模型和動(dòng)力學(xué)模型三種。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

13C代謝通量分析中，測(cè)量丙氨酸同位素豐度時(shí)，最多能測(cè)量出幾種同位素異構(gòu)體的信息？

A:2B:16C:8D:4

答案:8

代謝物組研究的對(duì)象是什么？

A:轉(zhuǎn)錄物B:內(nèi)源性化合物C:蛋白D:基因

答案:內(nèi)源性化合物

下面哪些測(cè)量值可作為流平衡分析的約束條件？

A:基因序列B:同位素豐度C:產(chǎn)物生成速率D:蛋白序列

答案:同位素豐度;產(chǎn)物生成速率

下面哪些方法可用在代謝物組學(xué)分析中應(yīng)用？

A:質(zhì)譜法B:測(cè)序法C:核磁共振法D:光譜法

答案:質(zhì)譜法;核磁共振法;光譜法

常用的代謝物分離方法包括哪些？

A:氣相色譜法B:梯度離心法C:液相色譜法D:毛細(xì)管電泳法

答案:氣相色譜法;液相色譜法;毛細(xì)管電泳法

流平衡分析不但考慮了代謝反應(yīng)的化學(xué)計(jì)量信息，也包含了代謝反應(yīng)的調(diào)控信息。

A:錯(cuò)B:對(duì)

答案:錯(cuò)

全基因組代謝網(wǎng)絡(luò)模型是基于基因-蛋白-代謝反應(yīng)三者之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系建立起來的？

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

在主成分分析中，兩個(gè)樣品在得分圖上的距離越近，它們屬于同一類別的可能性就越大。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

第八章測(cè)試

系統(tǒng)生物學(xué)是在系統(tǒng)層面上研究生命現(xiàn)象的一門學(xué)科，最基本的模型是網(wǎng)絡(luò)模型。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

以下哪些屬于生物網(wǎng)絡(luò)？

A:蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)B:代謝網(wǎng)絡(luò)C:基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)D:信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)

答案:蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò);代謝網(wǎng)絡(luò);基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò);信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)

在代謝網(wǎng)絡(luò)中，每一個(gè)節(jié)點(diǎn)代表一個(gè)（）？

A:基因B:代謝物C:酶D:反應(yīng)

答案:代謝物

網(wǎng)絡(luò)可以分為有向網(wǎng)絡(luò)和無向網(wǎng)絡(luò)，生物網(wǎng)絡(luò)都是無向網(wǎng)絡(luò)。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:錯(cuò)

R是生物信息分析中非常重要的工具，可以實(shí)現(xiàn)以下哪些功能？

A:生態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)分析B:聚類分析C:進(jìn)化樹分析D:測(cè)序數(shù)據(jù)分析

答案:生態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)分析;聚類分析;進(jìn)化樹分析;測(cè)序數(shù)據(jù)分析

R語言中，需要安裝軟件包時(shí)需要調(diào)用的命令是（）？

A:install.packages()B:require()C:library()D:help()

答案:install.packages()

利用R可以繪制并分析基因芯片數(shù)據(jù)的火山圖來顯示差異基因及p-value。

A:對(duì)B:錯(cuò)

答案:對(duì)

在生物信息學(xué)研究中使用Linux系統(tǒng)的優(yōu)勢(shì)在于？

A:Linux系統(tǒng)支持多種平臺(tái)，并且不斷更新B:Linux系統(tǒng)支持集群計(jì)算機(jī)的使用C:Linux系統(tǒng)是科學(xué)研究的通用平臺(tái)D:Linux系統(tǒng)是免費(fèi)的

答案:Linux系統(tǒng)支持多種平臺(tái)，并且不斷更新;Linux系統(tǒng)支持集群計(jì)算機(jī)的使