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準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆遺傳變異及克隆遺傳結(jié)構(gòu)的研究的開題報(bào)告一、選題背景與意義準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆(Astragalussquarrosus)是我國(guó)西北高寒草原的重要植物資源之一,具有重要的草原保護(hù)和修復(fù)作用。但是由于其天然資源的過度開采和環(huán)境的惡化,造成了其自然種群數(shù)量和分布范圍的不斷減少,給其生存和繁殖帶來(lái)了極大的威脅。因此對(duì)準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆的遺傳多樣性、種內(nèi)遺傳變異及其克隆遺傳結(jié)構(gòu)的研究具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。二、研究目的(1)探究準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆的遺傳多樣性及其種內(nèi)遺傳變異情況。(2)分析準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆的克隆遺傳結(jié)構(gòu),了解其克隆繁殖能力及分布情況。(3)為保護(hù)準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆資源,提供科學(xué)的保護(hù)和管理策略。三、研究方法(1)樣本采集:在不同地理位置及不同生境下,采集準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆的種群樣本,并記錄樣本的地理位置和生長(zhǎng)環(huán)境等信息。(2)DNA提取和PCR擴(kuò)增:利用CTAB法提取樣本總DNA,用SSR分子標(biāo)記對(duì)樣本進(jìn)行PCR擴(kuò)增,篩選優(yōu)化后SSR擴(kuò)增條件。(3)數(shù)據(jù)分析:利用PhyloViz軟件分析SSR數(shù)據(jù),計(jì)算準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆的遺傳多樣性和遺傳變異情況;利用POPGENE軟件計(jì)算其種內(nèi)遺傳多樣性和群體遺傳分化情況,并繪制遺傳多樣性和遺傳變異的分子標(biāo)記指紋圖;利用基于ClonalFrame軟件的Bayesian方法分析其克隆遺傳結(jié)構(gòu)。四、研究預(yù)期結(jié)果(1)明確準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆的遺傳多樣性和群體遺傳分化情況。(2)發(fā)現(xiàn)準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆中存在的克隆繁殖事件,以及各克隆體的分布情況和數(shù)目。(3)為保護(hù)準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆資源提供科學(xué)的理論依據(jù)和保護(hù)策略。五、研究實(shí)施方案(1)樣本采集:在高寒草原以及鹽堿地等環(huán)境中,采集準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆的種群樣本,同時(shí)記錄其GPS坐標(biāo)、海拔、植被等信息。(2)分子標(biāo)記分析:利用CTAB方法提取樣本總DNA,并進(jìn)行SSR標(biāo)記的篩選優(yōu)化。利用PhyloViz軟件分析SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù),計(jì)算準(zhǔn)噶爾無(wú)葉豆的遺傳多樣性和遺傳變異情況;利用POPGENE軟件計(jì)算其種內(nèi)遺傳多樣性和群體遺傳分化情況,并繪制遺傳多樣性和遺傳變異的分子標(biāo)記指紋圖。(3)克隆遺傳結(jié)構(gòu)分析:利用基于ClonalFrame軟件的Bayesian方法分析其克隆遺傳結(jié)構(gòu)。(4)數(shù)據(jù)分析:對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,并利用ArcGIS軟件將樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行空間分析。六、研究進(jìn)度安排本研究計(jì)劃分為兩年進(jìn)行,第一年主要進(jìn)行樣本采集和分子標(biāo)記分析;第二年主要進(jìn)行克隆遺傳結(jié)構(gòu)分析和數(shù)據(jù)分析,并編寫論文。具體進(jìn)度安排如下:第一年:6月-9月,樣本采集和DNA提??;10月-12月,PCR擴(kuò)增和數(shù)據(jù)拓維。第二年:3月-6月,克隆遺傳結(jié)構(gòu)分析;7月-9月,數(shù)據(jù)分析和結(jié)果呈現(xiàn);10月-12月,論文撰寫和修改。七、研究預(yù)算根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要和各項(xiàng)支出安排,預(yù)計(jì)本研究所需要的經(jīng)費(fèi)為50萬(wàn)元。其中,包
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