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病毒基因組生物信息分析系統(tǒng)的構(gòu)建及關(guān)鍵技術(shù)研究的任務(wù)書一、任務(wù)概述病毒基因組生物信息分析系統(tǒng)是一種用于分析病毒基因組的軟件系統(tǒng),其主要作用是通過對病毒基因組序列的分析,揭示病毒的遺傳特征、生物學(xué)功能及演化等方面的信息,為病毒研究以及防控工作提供有力的支持。本研究任務(wù)主要圍繞病毒基因組生物信息分析系統(tǒng)的構(gòu)建及關(guān)鍵技術(shù)研究展開,旨在通過開展相關(guān)技術(shù)研究,構(gòu)建一套功能完備、易使用、高效穩(wěn)定的病毒基因組生物信息分析系統(tǒng),為病毒的研究及防控工作提供一定的技術(shù)支撐。二、主要研究內(nèi)容1.基于云計算技術(shù)的病毒基因組序列分析平臺構(gòu)建:設(shè)計并實現(xiàn)一套基于云計算技術(shù)的病毒基因組序列分析平臺,包括數(shù)據(jù)存儲、分析流程控制、結(jié)果展示等功能模塊,實現(xiàn)對病毒基因組序列的高效分析。2.病毒基因組序列預(yù)處理技術(shù)研究:針對病毒基因組序列存在的質(zhì)量問題及表達水平差異等問題,提出有效的病毒基因組序列預(yù)處理技術(shù),對原始序列進行質(zhì)檢、去除污染序列、序列校正、表達水平歸一化等預(yù)處理過程,為后續(xù)分析提供高質(zhì)量的序列數(shù)據(jù)。3.多重序列比對技術(shù)研究:設(shè)計并實現(xiàn)一種高效穩(wěn)定的多重序列比對算法,對病毒基因組序列進行比對,實現(xiàn)序列間的比對和比較,揭示病毒基因組序列的共性和變異性,為后續(xù)進一步分析提供數(shù)據(jù)支持。4.病毒功能注釋技術(shù)研究:通過對比已知病毒序列庫,對病毒基因進行功能注釋,了解病毒基因組的特征和生物學(xué)功能,實現(xiàn)對病毒基因組的全面分析。5.病毒演化樹構(gòu)建技術(shù)研究:基于多重序列比對結(jié)果,使用適當(dāng)?shù)倪M化模型對病毒序列進行進化分析,構(gòu)建病毒演化樹,揭示病毒的發(fā)生、演化及傳播規(guī)律,為病毒研究和防控提供參考依據(jù)。三、技術(shù)指標(biāo)要求1.構(gòu)建的平臺應(yīng)具備數(shù)據(jù)存儲、任務(wù)調(diào)度、分析流程控制、結(jié)果展示及管理等功能。2.預(yù)處理技術(shù)的有效率應(yīng)達到90%以上,能夠去除污染序列、校正序列質(zhì)量、歸一化表達水平等過程。3.多重序列比對技術(shù)的準(zhǔn)確度應(yīng)達到90%以上,同時具備高效穩(wěn)定的特點。4.功能注釋技術(shù)的注釋準(zhǔn)確率應(yīng)達到90%以上,信息準(zhǔn)確、完整。5.演化樹構(gòu)建技術(shù)的準(zhǔn)確度應(yīng)達到90%以上,同時具備高效穩(wěn)定的特點。四、研究成果要求1.病毒基因組生物信息分析系統(tǒng)的構(gòu)建,包括系統(tǒng)設(shè)計、軟件開發(fā)及功能實現(xiàn)等。2.相關(guān)技術(shù)論文,包括創(chuàng)新點、研究方法、研究結(jié)果、技術(shù)難點等。3.相關(guān)技術(shù)報告,包括技術(shù)分析、數(shù)據(jù)分析、研究進展等。4.病毒基因組序列庫,包含大量已知及未知病毒基因組序列,并附有詳細的序列注釋信息。5.相關(guān)技術(shù)指南及用戶手冊,包括系統(tǒng)安裝、使用流程、參數(shù)設(shè)置等。五、注意事項1.本任務(wù)要求有較強的計算機、生物、醫(yī)
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