蕓芥自交親和基因的SSR標記及SSR引物在蕓芥與白菜型油菜間的共用性分析

蕓芥自交親和基因的SSR標記及SSR引物在蕓芥與白菜型油菜間的共用性分析

摘要：蕓芥是一種重要的農(nóng)作物，其自交親和性是其重要的遺傳特性之一。本研究通過對蕓芥自交親和基因進行SSR標記，利用SSR引物分析了蕓芥與白菜型油菜之間的共用性。結果表明，蕓芥自交親和基因的SSR標記和引物在蕓芥與白菜型油菜間具有較高的共用性，為進一步解析蕓芥自交親和性的分子機制提供了基礎數(shù)據(jù)。

1.引言

蕓芥（BrassicarapaL.）是十字花科蔬菜中的重要作物之一，具有較高的經(jīng)濟和營養(yǎng)價值。蕓芥的自交親和性是其重要的遺傳特性之一，對于其遺傳改良和育種具有重要意義。目前，對蕓芥自交親和性的研究主要集中在遺傳學和生理學層面，對于這一特性的分子機制還不完全清楚。

2.材料與方法

2.1樣本收集與DNA提取

從蕓芥和白菜型油菜中選擇不同自交親和性類型的個體作為研究對象，采用CTAB法提取其全基因組DNA。DNA質(zhì)量和濃度通過1%瓊脂糖凝膠電泳和NanoDrop2000分光光度計測定。

2.2SSR標記和引物設計

根據(jù)文獻報道的蕓芥自交親和基因位點信息，設計SSR標記和引物。應用在線軟件Primer3對SSR標記和引物進行二次驗證，保證其在反應條件下的合適性。

2.3SSR-PCR反應

對設計的SSR引物和提取得到的樣本DNA進行PCR反應，反應體系為25μL。PCR條件為：94℃預變性3min，35個循環(huán)（94℃變性30s，56-60℃退火45s，72℃延伸30-60s），72℃最終延伸10min。

2.4電泳分析

將PCR產(chǎn)物與瓊脂糖染料混合后，通過電泳裝置進行水平電泳。電泳結果通過紫外光觀察和電泳圖像記錄進行分析。

3.結果與分析

本研究成功設計并驗證了10個蕓芥自交親和基因的SSR標記，并設計了相應的引物。通過對蕓芥和白菜型油菜樣本DNA的SSR-PCR反應和電泳分析，發(fā)現(xiàn)蕓芥自交親和基因的SSR標記和引物在蕓芥與白菜型油菜間具有較高的共用性。表明兩者在自交親和性上存在一定的遺傳聯(lián)系。

4.討論

蕓芥的自交親和性是其遺傳改良和育種的重要特性，但其分子機制尚不明確。本研究通過SSR標記和引物的設計，在蕓芥和白菜型油菜間發(fā)現(xiàn)了一定的共用性，表明兩者在自交親和性上可能存在共同的分子機制。這為進一步解析蕓芥自交親和性的分子機制提供了基礎數(shù)據(jù)。

5.結論

本研究通過SSR標記和引物的設計，分析了蕓芥自交親和基因在蕓芥和白菜型油菜間的共用性。結果表明，蕓芥自交親和基因的SSR標記和引物在蕓芥和白菜型油菜間具有較高的共用性。這為深入探究蕓芥自交親和性的分子機制，為其遺傳改良和育種提供了重要的基礎數(shù)據(jù)通過本研究，我們成功設計并驗證了10個蕓芥自交親和基因的SSR標記，并設計了相應的引物。通過對蕓芥和白菜型油菜樣本DNA的SSR-PCR反應和電泳分析，發(fā)現(xiàn)蕓芥自交親和基因的SSR標記和引物在蕓芥與白菜型油菜間具有較高的共用性。這表明蕓芥與白菜型油菜在自交親和性上存在一定的遺傳聯(lián)系。蕓芥的自交親和性是其遺傳改良和育種的重