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文檔簡(jiǎn)介
ICS13.100
C50
DB32
江蘇省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB32/T3762.17—2021
新型冠狀病毒檢測(cè)技術(shù)規(guī)范
第17部分:核酸檢測(cè)用假病毒陽(yáng)性質(zhì)控品
TechnicalspecificationsforSARS-CoV-2detection
Part17:Pseudoviruspositivecontrolmaterialfornucleicaciddetection
2021-12-09發(fā)布2022-01-09實(shí)施
江蘇省市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布
DB32/T3762.17—2021
新型冠狀病毒檢測(cè)技術(shù)規(guī)范第17部分:核酸檢測(cè)用假病毒陽(yáng)性質(zhì)控品
1范圍
本文件規(guī)定了新型冠狀病毒核酸檢測(cè)用假病毒類(lèi)弱陽(yáng)性質(zhì)控品的術(shù)語(yǔ)和定義、縮略語(yǔ)、試劑和材料、
儀器和設(shè)備、假病毒原液的技術(shù)要求、質(zhì)控品的制備和質(zhì)控品的技術(shù)要求。
本文件適用于新型冠狀病毒核酸檢測(cè)用假病毒類(lèi)弱陽(yáng)性質(zhì)控品的技術(shù)要求以及評(píng)價(jià)方法。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
JJF1006一級(jí)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)技術(shù)規(guī)范
JJF1343標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)定值的通用原則及統(tǒng)計(jì)學(xué)原理
3術(shù)語(yǔ)和定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件。
3.1
質(zhì)控品controlmaterial
用于體外診斷的質(zhì)量控制物質(zhì),是一種旨在用于醫(yī)學(xué)用途的檢測(cè)系統(tǒng)中使用的物質(zhì)、材料、物品或
設(shè)備,其目的是評(píng)價(jià)或驗(yàn)證測(cè)量精密度、測(cè)量準(zhǔn)確度、由于試劑或分析儀器的變化檢測(cè)系統(tǒng)可能產(chǎn)生的
分析偏差等性能特征,可用于能力驗(yàn)證、實(shí)驗(yàn)室內(nèi)質(zhì)量控制。
3.2
假病毒pseudovirus
一種具有病毒擬似的物理結(jié)構(gòu)和特異性核酸序列的病毒樣粒子,其分析特性與真實(shí)病毒相似,但不
具備自我復(fù)制和感染的能力。
3.3
假病毒質(zhì)控品pseudoviruscontrolmaterial
由假病毒原料定量分裝后制成,能夠參與到病毒檢測(cè)從提取到擴(kuò)增的全過(guò)程;具有生物安全性的同
時(shí)可作為測(cè)量標(biāo)準(zhǔn),用于病毒核酸定性和定量測(cè)量方法的驗(yàn)證評(píng)價(jià)以及實(shí)驗(yàn)室的質(zhì)量控制。
3.4
計(jì)量溯源性metrologicaltraceability
1
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通過(guò)一條具有規(guī)定不確定度的不間斷的比較鏈,使測(cè)量結(jié)果或測(cè)量標(biāo)準(zhǔn)的值能夠與規(guī)定的參考標(biāo)準(zhǔn)
(通常是與國(guó)家測(cè)量標(biāo)準(zhǔn)或國(guó)際測(cè)量標(biāo)準(zhǔn))聯(lián)系起來(lái)的特性。
3.5
同源性homology
兩個(gè)核酸分子的核苷酸序列間的相似程度。本文指假病毒質(zhì)控品中目的基因序列與相應(yīng)的真實(shí)病毒
參考毒株序列的一致性。
3.6
均勻性u(píng)niformity
同一批次生產(chǎn)的假病毒質(zhì)控品,每個(gè)最小包裝單元含有等量的目標(biāo)假病毒的狀態(tài)。通過(guò)測(cè)量取自不
同包裝單元或取自同一包裝單元的、特定量的樣品,定量測(cè)量結(jié)果落在規(guī)定不確定度范圍內(nèi),則可認(rèn)為
質(zhì)控品所含目標(biāo)假病毒的量是均勻的。
3.7
穩(wěn)定性stability
假病毒質(zhì)控品在特定的保存條件和保存時(shí)間內(nèi),假病毒的量保持在規(guī)定范圍內(nèi)的能力。
4縮略語(yǔ)
下列縮略語(yǔ)適用于本文件。
DMEM:Dulbecco改良培養(yǎng)基(Dulbecco’smodifiedeagle’smedium)
PCR:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerasechainreaction)
qPCR:熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(quantitativepolymerasechainreaction)
RT-PCR:逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(reversetranscriptionpolymerasechainreaction)
RT-qPCR:逆轉(zhuǎn)錄熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(reversetranscriptionquantitativepolymerasechain
reaction)
RNase:核糖核酸酶(ribonuclease)
5技術(shù)要求
5.1假病毒質(zhì)控品的技術(shù)要求主要分為兩個(gè)方面,包含對(duì)假病毒原液的技術(shù)要求,如假病毒內(nèi)靶標(biāo)
RNA序列的同源性、假病毒原液的雜質(zhì)殘留等;還包含對(duì)質(zhì)控品成品的技術(shù)要求,如靶標(biāo)RNA定值、
均勻性、穩(wěn)定性等。
5.2假病毒質(zhì)控品必須同時(shí)滿(mǎn)足以下8點(diǎn)技術(shù)要求,才能作為新型冠狀病毒核酸檢測(cè)用的弱陽(yáng)性質(zhì)控
品:
a)用于制備質(zhì)控品的原料假病毒含有與新冠核酸檢測(cè)的靶標(biāo)RNA序列一致的RNA;
b)用于制備質(zhì)控品的假病毒原液不含有cDNA雜質(zhì);
c)用于制備質(zhì)控品的假病毒原液無(wú)菌;
d)質(zhì)控品的靶標(biāo)RNA濃度為試劑盒檢出限的1.5-3倍左右,且定值結(jié)果具有計(jì)量溯源性;
2
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e)質(zhì)控品同批次均勻性合格;
f)質(zhì)控品短期、長(zhǎng)期及極端環(huán)境下穩(wěn)定性合格;
g)質(zhì)控品適用于至少8款獲批上市的新型冠狀病毒核酸檢測(cè)試劑盒。
6試劑和材料
6.1無(wú)酶水:GB/T6682中的一級(jí)水,應(yīng)為無(wú)RNA酶的水。
6.2PCR、RT-PCR、RT-qPCR、數(shù)字PCR相關(guān)試劑:商品化試劑。
6.3PCR引物、探針:參照權(quán)威機(jī)構(gòu)公布的序列或自行設(shè)計(jì)。
6.4RNase:商品化試劑。
6.5無(wú)RNA酶的各型號(hào)槍頭、EP管、PCR管、離心管、試管:商品化耗材。
6.6本文件中所有的化學(xué)試劑,除特別說(shuō)明外,全部為分析純級(jí)別試劑。
7儀器和設(shè)備
7.1生物安全柜。
7.2普通離心機(jī)、冷凍離心機(jī)。
7.3恒溫水浴鍋。
7.4PCR儀。
7.5核酸電泳儀。
7.6凝膠成像系統(tǒng)。
7.7熒光定量PCR儀。
7.8數(shù)字PCR系統(tǒng)。
7.9各型號(hào)移液器。
7.10培養(yǎng)箱。
8假病毒原液的技術(shù)要求
8.1靶標(biāo)RNA序列同源性的檢測(cè)
8.1.1檢測(cè)方法
8.1.1.1RT-PCR檢測(cè)
提取假病毒的RNA作為模板。選用中國(guó)疾病預(yù)防控制中心或世界衛(wèi)生組織推薦的(見(jiàn)表1)或根
據(jù)靶標(biāo)RNA自行設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增。設(shè)置以水為模板的陰性對(duì)照,以含靶標(biāo)RNA的標(biāo)
準(zhǔn)物質(zhì)為模板的陽(yáng)性對(duì)照。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)電泳分離、回收反應(yīng)產(chǎn)物。
3
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表1中國(guó)疾病預(yù)防控制中心、世界衛(wèi)生組織推薦的新型冠狀病毒核酸檢測(cè)引物和探針序列
目標(biāo)基因引物/探針序列(5’—3’)
FCCCTGTGGGTTTTACACTTAA
ORF1abRACGATTGTGCATCAGCTGA
P5'-FAM-CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG-BHQ1-3'
FGGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT
NRCAGACATTTTGCTCTCAAGCTG
P5'-FAM-TTGCTGCTGCTTGACAGATT-TAMRA-3'
FACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGT
ERATATTGCAGCAGTACGCACACA
P5'-FAM-ACACTAGCCATCCTTACTGCGCTTCG-BBQ-3'
8.1.1.2測(cè)序及溯源性分析
將8.1.1.1的產(chǎn)物測(cè)序。測(cè)序結(jié)果與相應(yīng)的新型冠狀病毒核酸檢測(cè)靶標(biāo)RNA的參考序列進(jìn)行比
對(duì)。
8.1.2結(jié)果判定
在RT-PCR陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照都成立的情況下:
a)若滿(mǎn)足假病毒RNA的RT-PCR產(chǎn)物的電泳結(jié)果為陽(yáng)性且測(cè)序結(jié)果比對(duì)一致,則為合格;
b)若假病毒RNART-PCR產(chǎn)物的電泳結(jié)果為陰性,則表明假病毒未包裹病毒RNA,或假病毒
核酸提取失敗,應(yīng)重新制備假病毒或提取核酸。
8.2cDNA雜質(zhì)的檢測(cè)
8.2.1檢測(cè)方法
分別以未做核酸提取的假病毒原液和假病毒中提取的RNA為模板,使用推薦的或自行設(shè)計(jì)的引
物和探針或商品化試劑盒進(jìn)行qPCR擴(kuò)增。設(shè)置以水為模板的陰性對(duì)照,以重組質(zhì)粒為模板的陽(yáng)性對(duì)
照。
8.2.2結(jié)果判定
在陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照都成立的情況下:
a)若未提取的假病毒原液和/或假病毒提取的RNA的qPCR結(jié)果為陽(yáng)性,即出現(xiàn)典型的S型
擴(kuò)增曲線或依據(jù)試劑盒說(shuō)明書(shū)判定,則表明原液中或假病毒內(nèi)含有cDNA雜質(zhì),即為不合格,
應(yīng)重新消化去除cDNA雜質(zhì)。
b)若未提取的假病毒原液和假病毒提取的RNA的qPCR結(jié)果為陰性,即未起峰或依據(jù)試劑盒
說(shuō)明書(shū)判定,說(shuō)明無(wú)cDNA,即為合格。
8.3無(wú)菌檢測(cè)
用DMEM培養(yǎng)基37℃培養(yǎng)假病毒原液24h,溶液澄清,無(wú)菌生長(zhǎng),即為合格。
9質(zhì)控品的制備
4
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對(duì)結(jié)果判定為合格的假病毒原液,根據(jù)需要使用適當(dāng)?shù)娜軇?duì)假病毒原料進(jìn)行稀釋后,分裝至凍存
管,直接或凍干后-20℃保存。具體制備過(guò)程本文件不作贅述。
10質(zhì)控品的技術(shù)要求
10.1新型冠狀病毒靶標(biāo)RNA的定量
10.1.1基本要求
采用核酸提取方法提取假病毒質(zhì)控品的RNA,采用RT-qPCR法或數(shù)字PCR法對(duì)靶標(biāo)RNA
的濃度進(jìn)行定值。使用推薦的或自行設(shè)計(jì)的引物和探針或商品化試劑盒進(jìn)行定值。核酸提取方法和靶標(biāo)
RNA濃度的定值方法均應(yīng)通過(guò)適宜的國(guó)家有證標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的驗(yàn)證方可采用。
10.1.2RT-qPCR定量法
10.1.2.1使用RT-qPCR法進(jìn)行定量時(shí),所使用的具體方法應(yīng)為針對(duì)新型冠狀病毒靶標(biāo)RNA片段
設(shè)計(jì)建立的方法。
10.1.2.2標(biāo)準(zhǔn)品可以為拷貝數(shù)已知的新型冠狀病毒RNA或cDNA,或含有相關(guān)目的DNA片段的
重組質(zhì)粒。
10.1.2.3將標(biāo)準(zhǔn)品以10倍進(jìn)行梯度稀釋至少5個(gè)梯度,分別以每個(gè)梯度的標(biāo)準(zhǔn)品溶液作為模板,
進(jìn)行RT-qPCR反應(yīng),根據(jù)各梯度標(biāo)準(zhǔn)品的Ct值和濃度制定標(biāo)準(zhǔn)曲線和公式。
10.1.2.4根據(jù)質(zhì)控品RNA的Ct值,利用標(biāo)準(zhǔn)曲線和公式計(jì)算出質(zhì)控品中新型冠狀病毒靶標(biāo)RNA
的濃度。
10.1.3數(shù)字PCR定量法
10.1.3.1使用數(shù)字PCR法進(jìn)行定量時(shí),所使用的具體方法應(yīng)為針對(duì)新型冠狀病毒靶標(biāo)RNA片段設(shè)
計(jì)建立的方法。
10.1.3.2提取假病毒RNA,上樣至數(shù)字PCR反應(yīng)體系,進(jìn)行數(shù)字PCR反應(yīng)。按照式(1)計(jì)算質(zhì)
控品RNA的濃度。
CA
C1(1)
B
C—質(zhì)控品中靶標(biāo)RNA的原始濃度,單位為拷貝每微升;
C1—數(shù)字PCR檢測(cè)結(jié)果所示的靶標(biāo)RNA的濃度,單位為拷貝每微升;
A—數(shù)字PCR反應(yīng)體系中靶標(biāo)RNA的稀釋倍數(shù);
B—核酸提取時(shí)靶標(biāo)RNA的濃縮倍數(shù)。
10.1.4靶標(biāo)RNA濃度的計(jì)算
定值結(jié)果采取10.1.2或10.1.3所述的方法進(jìn)行靶標(biāo)RNA的濃度計(jì)算,質(zhì)控品濃度為新冠核酸
檢測(cè)試劑盒檢出限的1.5-3倍左右即為合格。
10.2均勻性檢測(cè)
10.2.1檢測(cè)方法
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按照J(rèn)JF1006和JJF1343的要求,依據(jù)每一批次質(zhì)控品的制備數(shù)量,隨機(jī)抽樣選擇不同數(shù)量的包
裝單元進(jìn)行均勻性檢測(cè)。對(duì)質(zhì)控品進(jìn)行核酸提取后,按10.1.2或10.1.3的方法進(jìn)行靶標(biāo)RNA濃度
測(cè)定,計(jì)算每一個(gè)包裝單元靶標(biāo)RNA的濃度。
10.2.2均勻性判定
對(duì)所得數(shù)據(jù)按照J(rèn)JF1006和JJF1343的統(tǒng)計(jì)學(xué)要求進(jìn)行檢驗(yàn),若結(jié)果無(wú)顯著性差異,則質(zhì)控品
均勻性良好,即為合格。若存在顯著性差異,即為均勻性不合格。
10.3穩(wěn)定性檢測(cè)
10.3.1短期穩(wěn)定性
短期穩(wěn)定性評(píng)價(jià)質(zhì)控品在使用溫度(20±5)℃和運(yùn)輸溫度4℃下的穩(wěn)定性。按JJF1006和JJF1343
的方法進(jìn)行評(píng)價(jià)。按10.1.2或10.1.3的方法進(jìn)行靶標(biāo)RNA濃度測(cè)定。
10.3.2長(zhǎng)期穩(wěn)定性
長(zhǎng)期穩(wěn)定性評(píng)價(jià)質(zhì)控品在存儲(chǔ)溫度
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