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文檔簡(jiǎn)介
食源性致病菌檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)操作程序
福建省疾病預(yù)防控制中心
二0一二年十一月
一、生物樣本檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)操作程序
(一)糞便樣本的保存、運(yùn)送和檢測(cè)
表1糞便樣本的保存、運(yùn)送和檢測(cè)培養(yǎng)條件
培養(yǎng)基目標(biāo)病原體溫度
細(xì)菌標(biāo)本保1
Cary-Blair所有食源性致病菌室溫
存和運(yùn)送
增菌液1改良磷酸鹽緩沖液小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌4℃
2mEC增菌肉湯EHECO157:H7/STEC37℃
3Preston肉湯彎曲菌微需氧42℃
4SBG增菌液沙門(mén)氏菌37℃
53%氯化鈉堿性蛋白陳水弧菌37℃
選擇性分離1Mac平板EPECxSTECxETECx日EC、37℃
平板EAEC、志賀氏菌
2XLD平板志賀氏菌37℃
3mCCD平板彎曲菌微需氧42℃
4耶爾森氏菌選擇性平板小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌25℃
5科瑪嘉O157:H7顯色平板EHECO157:H737℃
6科瑪嘉沙門(mén)氏菌顯色平板沙門(mén)氏菌37℃
7科瑪嘉弧菌顯色平板弧菌37℃
TCBS平板
病毒標(biāo)本1采便盒輪狀病毒、諾如病毒、札如-20℃以下
病毒、星狀病毒、腺病毒
(二)檢驗(yàn)方法與流程
糞便樣本
塑料盒裝
Cary-blair棉拭子
糞便樣本
?1支1支1支1支1支棉拭子蘸1支棉拭子蘸1支棉拭子蘸
C-B棉拭子C-B棉拭子C-B棉拭子百棉拭「C-B棉拭子3SW取少量樣本取少量樣本取少量樣本
-20℃保存子蘸取少子蘸取少一:
量樣本量樣本
SBG3%氯化鈉mEC肉湯
送省疾控耶爾森
Mac和XLDCIN改良mCCDPreston
檢驗(yàn)Mac分離選擇培養(yǎng)改良PBS
分離分離肉湯增菌V■V
基分離冷增菌
科瑪嘉顯色科瑪嘉顯色培科瑪嘉顯色
培養(yǎng)基養(yǎng)基或TCBS培養(yǎng)基
輪狀病毒
VV
諾如病毒V
札如病毒志賀致瀉耶爾森彎曲菌沙門(mén)副溶O157:H7
星狀病毒
腺病毒
(RT-PCR)
鑒定
結(jié)果報(bào)告結(jié)果報(bào)告,菌株報(bào)送省疾控復(fù)核、分型、藥敏
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(三)沙門(mén)氏菌和志賀氏菌檢測(cè)操作程序
1范圍
本程序規(guī)定了糞便標(biāo)本中沙門(mén)氏菌{Salmonella)和志賀氏菌(Shigella)的檢驗(yàn)方
法。
2檢驗(yàn)程序
沙門(mén)氏菌和志賀氏菌檢驗(yàn)程序見(jiàn)圖1。
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圖1沙門(mén)氏菌和志賀氏菌檢驗(yàn)程序
3操作步驟
3.1標(biāo)本收集
標(biāo)本包括新鮮的或轉(zhuǎn)移至Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基的糞便或肛拭子。最優(yōu)標(biāo)本是轉(zhuǎn)移至
Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基的糞便拭子。肛拭子不是最佳標(biāo)本,僅在病人無(wú)糞便標(biāo)本時(shí)采用。
肛拭子收集后應(yīng)當(dāng)目測(cè),需要在拭子上明顯見(jiàn)到糞便。
所采集的標(biāo)本盡快檢驗(yàn),放入Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基中的標(biāo)本應(yīng)在冷藏條件下24h內(nèi)
送檢。新鮮的糞便標(biāo)本置于清潔、干燥、無(wú)肥皂或消毒液殘留的容器中,冷藏條件下8h
內(nèi)送檢。
3.2分離培養(yǎng)
3.2.1直接分離培養(yǎng)
新鮮糞便:無(wú)菌拭子采集少量糞便,盡量從可見(jiàn)血或黏液的部位收集;新鮮拭子在XLD
和MAC一區(qū)劃線;以1pL無(wú)菌接種環(huán)或接種針劃線分離。在標(biāo)本中再插入一個(gè)清潔的無(wú)
菌拭子,將拭子放入SBG增菌液。輕擰管蓋。注意:拭子表面有一層標(biāo)本即可,不可將過(guò)
量的標(biāo)本放入SBG增菌液。
肛拭子:操作程序同新鮮糞便。
轉(zhuǎn)移至Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基的糞便拭子:輕攪混合標(biāo)本;拭子在XLD和MAC一區(qū)
劃線;以1"無(wú)菌接種環(huán)或接種針劃線分離;在標(biāo)本中再插入一個(gè)清潔的無(wú)菌拭子,將拭
子放入SBG增菌液。輕擰管蓋。注意:拭子表面有一層標(biāo)本即可,不可將過(guò)量的標(biāo)本放入
SBG增菌液。
平板36℃±1℃培養(yǎng)18h?24h?
3.2.2增菌培養(yǎng)
增菌液于36℃±1℃培養(yǎng)18h?24h,采用上述方法于科瑪嘉沙門(mén)氏菌顯色平板上劃
線分離,36七±1℃培養(yǎng)18h?24h。
3.3菌落特征
3.3.1選擇性平板上可疑菌落的特征見(jiàn)表1?
表1沙門(mén)氏菌屬和志賀氏菌屬在不同選擇性瓊脂平板上的菌落特征
選擇性瓊沙門(mén)氏菌傷寒沙門(mén)氏菌志賀氏菌屬
脂平板(大多數(shù))
MAC瓊菌落光滑、無(wú)色,直
脂徑2mm?3mm
XLD瓊脂菌落呈紅色,直徑2
mm?4mm
科瑪嘉顯紫色或酒紅色紫色或酒紅色
色培養(yǎng)基
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3.4純培養(yǎng)
挑取3個(gè)或以上可疑菌落,劃線接種5%羊血瓊脂平板,36匕±1℃培養(yǎng)18h?24h。
3.5初步鑒定
可疑菌落接種TSI瓊脂,賴氨酸脫陵酶培養(yǎng)基、動(dòng)力-靛基質(zhì)-鳥(niǎo)氨酸瓊脂(M。)、西蒙
氏檸檬酸鹽瓊脂和尿素瓊脂。沙門(mén)氏菌屬和志賀氏菌屬生化反應(yīng)初步鑒別見(jiàn)表2。
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表2沙門(mén)氏菌屬和志賀氏菌屬生化反應(yīng)初步鑒別表
項(xiàng)目沙門(mén)氏菌傷寒甲型副傷寒志賀氏菌屬
(大多數(shù))沙門(mén)氏菌沙門(mén)氏菌
TSI(斜面)KKKK
TSI(底層)AAAA
TSI(產(chǎn)氣)+-+十
TSI(硫化氫)+少量--
賴氨酸+4---
MIO(動(dòng)力)+++-
MIO(靛基質(zhì))---可變
MIO(鳥(niǎo)氨酸)+++痢疾志賀氏菌、福氏志賀
氏菌、鮑氏志賀氏菌:-
宋內(nèi)志賀氏菌:+
檸檬酸鹽(西蒙氏)+——-
尿素----
3.6血清學(xué)鑒定
挑取5%羊血瓊脂平板上的菌落,進(jìn)行沙門(mén)氏菌和志賀氏菌的血清學(xué)鑒定,設(shè)鹽水對(duì)照。
3.7確定鑒定
刮取5%羊血瓊脂平板上的單個(gè)菌落,進(jìn)行系統(tǒng)生化鑒定。
4結(jié)果與報(bào)告
報(bào)告糞便標(biāo)本中檢出沙門(mén)氏菌或志賀氏菌。
5菌株的保存和上送
培養(yǎng)物穿刺接種半固體培養(yǎng)基,輕擰管蓋,36℃±1℃培養(yǎng)24h,蓋緊管蓋。如果
需要長(zhǎng)期保存菌株,將0.7mL腦心浸液肉湯6h?12h培養(yǎng)物和0.3mL滅菌甘油加入滅
菌菌種管,立即放置-70°C保存。按照方案要求定期上送。
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(四)致瀉大腸埃希氏菌檢測(cè)操作程序
1范圍
本程序規(guī)定了糞便標(biāo)本中致瀉大腸埃希氏菌(Diarrheagenic詼的檢
驗(yàn)方法。
2操作步驟
2.1標(biāo)本收集
標(biāo)本包括新鮮的或轉(zhuǎn)移至Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基的糞便或肛拭子。最優(yōu)標(biāo)本是轉(zhuǎn)移至
Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基的糞便拭子。肛拭子不是最佳標(biāo)本,僅在病人無(wú)糞便標(biāo)本時(shí)采用。
肛拭子收集后應(yīng)當(dāng)目測(cè),需要在拭子上明顯見(jiàn)到糞便。
所采集的標(biāo)本盡快檢驗(yàn),放入Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基中的標(biāo)本應(yīng)在冷藏條件下24h內(nèi)
送檢。新鮮的糞便標(biāo)本置于清潔、干燥、無(wú)肥皂或消毒液殘留的容器中,冷藏條件下8h
內(nèi)送檢。
2.2直接分離培養(yǎng)
新鮮糞便:無(wú)菌拭子采集少量糞便,盡量從可見(jiàn)血或黏液的部位收集;新鮮拭子在MAC
一區(qū)劃線;以1PL無(wú)菌接種環(huán)或接種針劃線分離。
肛拭子:操作程序同新鮮糞便。
轉(zhuǎn)移至Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基的糞便拭子:輕攪混合標(biāo)本;拭子在MAC一區(qū)劃線;
以1PL無(wú)菌接種環(huán)或接種針劃線分離。
平板36℃+1℃培養(yǎng)18h?24h。
2.3菌落特征
挑取5個(gè)可疑大腸埃希氏菌菌落(粉紅色、突起、光滑、濕潤(rùn))直接保存半固體菌種
管;采用PCR檢測(cè)特異毒力基因方法鑒別5種致瀉大腸埃希氏菌。
3多重PCR鑒定
3.1標(biāo)準(zhǔn)菌株
標(biāo)準(zhǔn)菌株一覽表見(jiàn)表3O
表3標(biāo)準(zhǔn)菌株一覽表
菌株名稱標(biāo)準(zhǔn)號(hào)來(lái)源
EPECCMCC44155中國(guó)食品藥品檢定研究院
STEC具有stxl、5加2毒力基因中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病所
ETECCMCC44815中國(guó)食品藥品檢定研究院
EIECCMCC44825中國(guó)食品藥品檢定研究院
EAEC042血清型中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病所
大腸埃希氏菌ATCC25922WHO
3.2引物合成
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多重PCR引物序列見(jiàn)表4。
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表4五種致瀉大腸埃希氏菌目的基因引物序列
片段大小
目標(biāo)菌目標(biāo)基因引物序列
(bp)
EPECsSTECescV-F5'-ATTCTGGCTCTCTTCTTCTTTATGGCTG-3'544
escV-R5Z-CGTCCCCnTTACAAACTTCATCGC-3Z
EPECbfpB-V5'-GACACCTCAnGCTGAAGTCG-3,910
bfpB-R5'-CCAGAACACCTCCGTTATGC-3'
STEC5'-CGATGTTAGGGTTTGTTACTGTGACAG
stxlA-F244
C?3'
stxlA-R5Z-AATGCCACGCnCCCAGAATTG-3/
stx2A-?5'-GTTTTGACCATCTTCGTCTGATTATTGAG-3'324
sfx2A-R5Z-AGCGTAAGGCnCTGCTGTGAC-3,
ETEC日t-F5'-GAACAGGAGGHTCTGCGTTAGGTG-3'655
Elt-R5'-CTTTGAATGGCTIIIIII1GGGAGTC-3'
5'-CCTCTTTTAGYCAGACARCTGAATCAS
estla-F157
TTG-3,
5'-CAGGCAGGATTACAACAAAGTTCA
estta-R
CAG3
esttb-F5'-TGTCTTECACCTTTCGCTC-3'171
esttb-R5'-CGGTACAAGCAGGATTACAACAC-3f
ElEC5'-CGATCAAGAATCCCTAACAGAAGAATC
invE-F766
AC-3'
5,-CGATAGATGGCGAGAAATTATATC
invE-R
CCG3
EAECastA-V5'-TGCCATCAACACAGTATATCCG-3Z102
QSM-R5'-ACGGCTHGTAGTCCTTCCAT-3"
aggR-F5'-ACGCAGAGTTGCCTGATAAAG-3'400
aggR-R5'-AATACAGAATCGTCAGCATCAGC-3'
Pic-F5'-AAATGTCAGTGAACCGACGATTGG-3"1111
Pic-R5Z-AGCCGTnCCGCAGAAGCC-3Z
通用5'-AAAGTGTGGGTCAATAATCAGGAA
uidA-F1487
GTG-3z
uidA-R5'-ATGCCAGTCCAGCGTETGCS
3.3標(biāo)本處理
刮取營(yíng)養(yǎng)平板上的過(guò)夜新鮮培養(yǎng)物1環(huán)?2環(huán),至裝有1mL0.85%滅菌生理鹽水的
Eppendorf管內(nèi),混勻。4℃~8℃,12000r/min離心15min,棄去上清。沉淀加入
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100pL滅菌去離子水中,混勻。100℃煮沸12min,12000r/min離心5min,上清即為
PCR擴(kuò)增模板,可直接用于PCR反應(yīng)。
3.4多重PCR
五種致瀉大腸埃希氏菌目的基因多重PCR擴(kuò)增加樣體系見(jiàn)表5。PCR反應(yīng)條件:預(yù)變
性94℃5min。變性94℃30s,復(fù)性63℃30s,延伸72℃1.5min,30個(gè)循環(huán)。
最后72℃延伸5min。
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表5五種致瀉大腸埃希氏菌目的基因多重PCR擴(kuò)增加樣體系
試劑加樣體積(PL)
dH2O8.3
lOxPCRBuffer2.5
25mMMgCI22.5
2.5mMdNTPs3.0
25pMescV-F0.4
25pMescV-R0.4
25pMbfpB-F0.1
25pMbfpB-R0.1
25pMstxlA-F0.2
25pMstxlA-R0.2
25pMstx2A-F0.4
25pMstx2A-R0.4
25pMe/t-F0.1
25pMe/t-R0.1
25pMestla-F0.4
25pMestla-R0.4
25pMesttb-F0.2
25pMestlb-R0.2
25|JMinvE-F0.2
25|jMinvE-R0.2
25pMastA-F0.4
25pMastA-R0.4
25pMaggR-F0.2
25pMaggR-R0.2
25pMpic-F0.2
25pMpic-R0.2
25pMuidA-F0.2
25pMuidA-R0.2
3U/|jLTaq酶0.7
DNA模板2.0
3.5檢測(cè)結(jié)果的判定
取5pLPCR擴(kuò)增產(chǎn)物在2%瓊脂糖凝膠上電泳。根據(jù)特異性核酸條帶大小和數(shù)目判斷
致瀉大腸埃希氏菌的種類。見(jiàn)圖2。
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EPECEHECETECEIECEAECNIXMarker
圖2種致瀉大腸埃希氏菌目的基因多重PCR擴(kuò)增片段
注:圖中標(biāo)示EPEC、EHEC(STEC)、ETEC、EIEC、EAEC的泳道為反應(yīng)體系中僅存在
相應(yīng)的一種模板和12對(duì)引物同時(shí)擴(kuò)增后出現(xiàn)的片段,而MIX泳道為將五種致瀉大腸埃希
氏菌混合后與12對(duì)引物同時(shí)擴(kuò)增后出現(xiàn)的片段。
4血清學(xué)鑒定
4.1挑取PCR擴(kuò)增陽(yáng)性菌種,營(yíng)養(yǎng)平板分離,36七±1°C培養(yǎng)過(guò)夜。
4.2根據(jù)PCR鑒定結(jié)果,用相應(yīng)致病大腸血清。多價(jià)、單價(jià)、K、H診斷血清進(jìn)行血清
玻片凝集試驗(yàn)進(jìn)行診斷。見(jiàn)表6。
表6常見(jiàn)致瀉大腸埃希氏菌的。血清群及血清型
嬰幼兒腹瀉成人和兒童腹瀉
EPECETECEIECSTECEAEC
。28。
。20。26。44。6:將5舊16。8火40小9O157.H/O9K99
C
086O:H:H-0112
。55Gm。8K25舊9847。26及2舊11。101居9
O]140)190125O|1舊27O|5'H|10124O111
012601270128O:H-0136
20。25:心舊420103
014201580143
。25收8舊一O27:H70145
027*H20。63舊1201440104
。73此5。78舊110152
O]64
。78舊12O85:H7
。114舊21。“5:舊5丁)
O127.H12O128.H/
?!?8舊21?!?9舊28
。148舊28。149舊4
。159舊4Oi59-H20
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。159舊34O166:H27
O,69:H-
注:1:無(wú)動(dòng)力的變異
4.3報(bào)告血清學(xué)實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
5生化鑒定
5.1對(duì)PCR陽(yáng)性、血清學(xué)可分型及不可分型菌株進(jìn)行系統(tǒng)生化鑒定。
5.2報(bào)告最終鑒定結(jié)果。
6菌株保存和上送
4℃或室溫保存的半固體培養(yǎng)基保菌菌種至少2套(穿刺接種后36℃培養(yǎng)過(guò)夜即可)
或30%甘油肉湯凍存管-70°C保存菌株至少2套。按照要求定期上送。
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(五)大腸埃希氏菌O157:H7檢測(cè)操作程序
1范圍
本程序規(guī)定了糞便標(biāo)本中大腸埃希氏菌O157:H7(Aa?e〃c/?/b8〃657:H7)的檢驗(yàn)
方法。
2檢驗(yàn)程序
大腸埃希氏菌657:H7檢驗(yàn)程序見(jiàn)圖3。
圖3大腸埃希氏菌。157舊7檢驗(yàn)程序
3操作步驟
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3.1標(biāo)本收集
標(biāo)本包括新鮮的或轉(zhuǎn)移至Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基的糞便或肛拭子。最優(yōu)標(biāo)本是轉(zhuǎn)移至
Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基的糞便拭子。肛拭子不是最佳標(biāo)本,僅在病人無(wú)糞便標(biāo)本時(shí)采用。
肛拭子收集后應(yīng)當(dāng)目測(cè),需要在拭子上明顯見(jiàn)到糞便。
所采集的標(biāo)本盡快檢驗(yàn),放入Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基中的標(biāo)本應(yīng)在冷藏條件下24h內(nèi)
送檢。新鮮的糞便標(biāo)本置于清潔、干燥、無(wú)肥皂或消毒液殘留的容器中,冷藏條件下8h
內(nèi)送檢。
3.2增菌培養(yǎng)
增菌液采用添加20mg/L新生霉素的改良EC肉湯(mEC)。將采集的一支便拭子
1:10接種于6mLmEC肉湯,36七±1℃恒溫?fù)u床增菌培養(yǎng)6h(如無(wú)搖床,36℃±1℃
恒溫增菌培養(yǎng)9h?12h)。
3.3大腸埃希氏菌O157:H7膠體金試紙快速篩查
3.3.1將膠體金試紙從袋中取出,平放于潔凈、干燥的工作臺(tái)上,編號(hào);
3.3.2用加樣器吸取樣品增菌液150pL,加入檢測(cè)卡一端的加樣孔;
3.3.32min?20min內(nèi)讀取結(jié)果。陰性樣品在視窗上部出現(xiàn)一條單一的紅色對(duì)照線,這
表明試劑已正確流動(dòng)且檢測(cè)過(guò)程已發(fā)生。陽(yáng)性樣品將顯示兩條紅色帶,這表明檢出0157
抗原。如果紅色條帶出現(xiàn),實(shí)驗(yàn)失敗,應(yīng)考慮重做。
3.4免疫磁珠集菌
將0157膠體金試紙呈陽(yáng)性的mEC增菌肉湯,進(jìn)行免疫磁珠集菌。
3.4.1取下磁鐵板,將編好號(hào)的1.5mL的Eppendorf離心管,置入DynalMPC-M架上。
3.4.2輕柔混勻抗0157免疫磁珠(反復(fù)顛倒,直到管底沉淀完全消失),吸取抗0157
免疫磁珠,置入每只編號(hào)的Eppendorf離心管中20口1_。
3.4.3取膠體金試紙陽(yáng)性增菌培養(yǎng)物1mL,加入上述對(duì)應(yīng)的Eppendorf離心管中。蓋緊
蓋子。輕輕顛倒混勻。
3.4.4置于DynalMX3旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)器上,室溫下,旋轉(zhuǎn)30min(如果沒(méi)有旋轉(zhuǎn)器,可人工
旋轉(zhuǎn))。
3.4.5將磁鐵板插入DynalMPC-M管架中,反復(fù)顛倒數(shù)次,將抗0157免疫磁珠吸附沉
淀在Eppendorf離心管壁上。吸去上清(包括殘留在管蓋上的液體),并棄掉。
3.4.6將磁鐵板從DynalMPC-M架抽出。每只Eppendorf離心管中加入1mL
PBS-Tween20(PH7.4),輕輕顛倒混勻,重新懸浮免疫磁珠。
3.4.7重復(fù)3.4.5?3.4.6步驟
3.4.8重復(fù)3.4.5步驟。
3.4.9用50pLPBS-Tween20重新懸浮免疫磁珠細(xì)菌混合物。
3.5接種選擇性平板
將50pL免疫磁珠細(xì)菌混合物用接種環(huán)劃線或L棒涂布分別接種于O157:H7科瑪嘉顯
色平板或山梨醇麥康凱平板(SMAC)各一塊,36七±1°C培養(yǎng)18h?24h;
在SMAC平板上O157:H7菌落應(yīng)為扁平、透明或半透明、表面光滑濕潤(rùn)、不發(fā)酵山
梨醇乳白色菌落,極少部分遲緩發(fā)酵山梨醇,呈紅色。邊緣光滑,直徑約2mm。在0157:
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H7科瑪嘉顯色培養(yǎng)基上呈淡紫色或紫紅色菌落。
3.6初步鑒定
對(duì)疑似菌落染色為革蘭陰性桿菌者,在上述平板挑取疑似菌落10?20個(gè),轉(zhuǎn)種克氏雙
糖(KIA)培養(yǎng)基,36℃±1匕培養(yǎng)16h-20ho如其生長(zhǎng)性狀為葡萄糖(+)、乳糖(+)、
產(chǎn)氣(+)、硫化氫(-)者。
3.7診斷血清凝集試驗(yàn)
可疑菌株可用大腸埃希氏菌0157抗血清和0157單克隆抗體進(jìn)行玻片凝集,凝集強(qiáng)
度達(dá)(+++),再用H7抗血清凝集鑒定。同時(shí)設(shè)鹽水做對(duì)照。上述,冷凍,真空抽干,并
于真空狀態(tài)下封口保存。若患者不能自然排除O157:H7與腸桿菌科的某些菌種存在抗原交
叉現(xiàn)象,例如:弗勞地檸檬酸桿菌、赫爾曼埃希氏菌、沙門(mén)氏菌、小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌
等,一般可通過(guò)單克隆抗體解決,但弗勞地枸椽酸桿菌與O157:H7的O抗原交叉反應(yīng)用
單克隆抗體也無(wú)法辨別,只可通過(guò)檢測(cè)O抗原編碼基因鑒別。
3.8API20E生化鑒定試劑盒
采用API20E生化鑒定試劑盒進(jìn)行鑒定,生化反應(yīng)編碼:大多為5144172,極少數(shù)為
1144172或5144162。
4菌株保存和定期上送
4℃或室溫保存的半固體培養(yǎng)基保菌菌種至少2套(穿刺接種后36℃培養(yǎng)過(guò)夜即可)
或30%甘油肉湯凍存管-7。℃保存菌株至少2套。按照方案要求定期上送。
5多重PCR毒力基因鑒定
PCR擴(kuò)增0157、H7編碼基因,并且檢測(cè)s次/、stx2、h/y.eae毒力基因。典型的
造成人類感染的大腸埃希氏菌O157:H7為。157+、H7+,并且攜帶志賀毒素、溶血素與粘
附抹平因子:stxl+.$嶼、/?>、eae^,我國(guó)大部分657:H7菌株不攜帶以/,為stxl-.
stx3、heae+0
多重PCR各對(duì)引物序列見(jiàn)表7。
表7多重PCR毒力基因鑒定的引物
目標(biāo)基因引物序列片段大?。╞p)
stx}F5-ATAAATCGCCATTCGTTGACTAC-3'180
R5'-AGAACGCCCACTGAGATCATC-3'
stx2F5'-GGCACTGTCTGAAACTGCTCC-3'255
R5-TCGCCAGTTATCTGACATTCT-3,
eaeAF5'-GACCCGGCACAAGCATAAGC-31384
R5-CCACCTGCAGCAACAAGAGG-3'
hlyAF5-GCATCATCAAGCGTACGTTCC-3,534
R5'-AATGAGCCAAGCTGGTTAAGC
T-31
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rfbo\57F5'-CGGACATCCATGTGATATGG-3'259
R5-TTGCCTATGTACAGCTAATCC-3'
5.1模板DNA提取:用熱裂解法,將純化的可疑菌株接種5mL營(yíng)養(yǎng)肉湯,36℃±1℃
培養(yǎng)6卜或過(guò)夜,10000「/^1小離心5^1小,棄上清;加入1mL生理鹽水,震蕩分散細(xì)菌,
】0000「/|71心離心5|^5棄上清;沉淀加】00pL無(wú)菌蒸播水,重新震蕩懸浮后置100℃
水浴10min;10000「/171心離心5171小,上清用于PCR擴(kuò)增。陽(yáng)性和陰性對(duì)照分別為我們
保存的產(chǎn)志賀氏毒素1和2的大腸埃希氏菌O157:H7和不具備上述6種基因的大腸埃希氏
菌,同法制備。
5.2多重PCR反應(yīng)體系:模板DNA提取液5pL,10XPCR緩沖液5pL,分別加終濃度
1.5mMMgCI2,0.2mMdNTP,每種引物500nM,TaqDNA聚合酶1.5pL,最后加無(wú)菌
蒸僧水至總體積50IJLO
5.3多重PCR反應(yīng)條件:除變性溫度由95℃改為94℃和增加最后72℃延伸外,均按
Paton法。1?10循環(huán),94℃1min變性;65℃2min退火;72℃1.5min延伸。”?
25循環(huán),94℃1min;60℃2min;72℃1.5min。26?35循環(huán),94℃1min;65℃
2min;72℃2.5mino最后72℃10mino
5.4擴(kuò)增產(chǎn)物用含EB(0.5|jg/mL)的2%瓊脂糖電泳,陽(yáng)陰性對(duì)照正常,紫外燈下觀察
結(jié)果,照相記錄。
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(六)副溶血性弧菌檢驗(yàn)操作程序
1范圍
本程序規(guī)定了糞便標(biāo)本中副溶血性弧菌(Vibrioparahaemo/yticus)的檢驗(yàn)方法。
2檢驗(yàn)程序
副溶血性弧菌檢驗(yàn)程序見(jiàn)圖4。
圖4副溶血性弧菌檢驗(yàn)程序
3操作步驟
3.1標(biāo)本收集
標(biāo)本包括新鮮的或轉(zhuǎn)移至Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基的糞便或肛拭子。最優(yōu)標(biāo)本是轉(zhuǎn)移至
Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基的糞便拭子。肛拭子不是最佳標(biāo)本,僅在病人無(wú)糞便標(biāo)本時(shí)采用。
肛拭子收集后應(yīng)當(dāng)目測(cè),需要在拭子上明顯見(jiàn)到糞便。
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所采集的標(biāo)本盡快檢驗(yàn),放入Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基中的標(biāo)本應(yīng)在室溫條件下24h內(nèi)
送檢。新鮮的糞便標(biāo)本置于清潔、干燥、無(wú)肥皂或消毒液殘留的容器中,室溫條件下8h
內(nèi)送檢。
3.2分離培養(yǎng)
新鮮糞便:無(wú)菌拭子采集少量糞便,將拭子放入3%氯化鈉堿性蛋白陳水。輕擰管蓋。
注意:拭子表面有一層標(biāo)本即可,不可將過(guò)量的標(biāo)本放入堿性蛋白月東水。
肛拭子:操作程序同新鮮糞便。
轉(zhuǎn)移至Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基的糞便拭子:輕攪混合標(biāo)本;將拭子放入3%氯化鈉堿性
蛋白月東水。輕擰管蓋。注意:拭子表面有一層標(biāo)本即可,不可將過(guò)量的標(biāo)本放入堿性蛋白
陳水。
堿性蛋白月東水于36℃±1匕培養(yǎng)12h?16h,于TCBS平板或科瑪嘉弧菌顯色培養(yǎng)基
平板上劃線分離,36℃±1℃培養(yǎng)18h?24h。
3.3菌落特征
典型的副溶血性弧菌在TCBS上呈圓形、半透明、表面光滑的綠色菌落,用接種環(huán)輕觸,
有類似口香糖的質(zhì)感,直徑2mm?3mm。從培養(yǎng)箱取出TCBS平板后,應(yīng)盡快(不超過(guò)
1h)挑取菌落或標(biāo)記要挑取的菌落。典型的副溶血性弧菌在科瑪嘉弧菌顯色培養(yǎng)基上呈圓
形、半透明、表面光滑的粉紫色菌落,直徑2mm?3mm。
3.4純培養(yǎng)
挑取3個(gè)或以上可疑菌落,劃線接種3%氯化鈉胰蛋白月東大豆瓊脂平板,36℃±1℃
培養(yǎng)18h~24h。
3.5初步鑒定
3.5.1氧化酶試驗(yàn):挑選純培養(yǎng)的單個(gè)菌落進(jìn)行氧化酶試驗(yàn),副溶血性弧菌為氧化酶陽(yáng)性。
3.5.2挑取純培養(yǎng)的單個(gè)可疑菌落,轉(zhuǎn)種3%氯化鈉三糖鐵瓊脂斜面并穿刺底層,36℃
±1七培養(yǎng)24h觀察結(jié)果。副溶血性弧菌在3%氯化鈉三糖鐵瓊脂中的反應(yīng)為底層變黃不
變黑,無(wú)氣泡,斜面顏色不變或紅色加深,有動(dòng)力。
3.5.3嗜鹽性試驗(yàn):挑取純培養(yǎng)的單個(gè)可疑菌落,分別接種0%、6%、8%和10%不同氯
化鈉濃度的胰月東水,36°C±1°C培養(yǎng)24h,觀察液體混濁情況。副溶血性弧菌在無(wú)氯化
鈉和10%氮化鈉的胰陳水中不生長(zhǎng)或微弱生長(zhǎng),在6%氯化鈉和8%氯化鈉的胰陳水中生長(zhǎng)
旺盛。
3.6確定鑒定
刮取3%氯化鈉胰蛋白月東大豆瓊脂平板上的單個(gè)菌落,進(jìn)行系統(tǒng)生化鑒定試劑盒鑒定。
4血清學(xué)分型
4.1制備:接種兩管3%氯化鈉胰蛋白月東大豆瓊脂試管斜面,36七±1匕培養(yǎng)18h?24h。
用含3%氯化鈉的5%甘油溶液沖洗3%氯化鈉胰蛋白月東大豆瓊脂斜面培養(yǎng)物,獲得濃厚的菌
懸液。
4.2K抗原的鑒定:取一管上述制備好的菌懸液,首先用多價(jià)K抗血清進(jìn)行檢測(cè),出現(xiàn)凝
集反應(yīng)時(shí)再用單個(gè)的抗血清進(jìn)行檢測(cè)。用蠟筆在一張玻片上劃出適當(dāng)數(shù)量的間隔和一個(gè)對(duì)
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照間隔。在每個(gè)間隔內(nèi)各滴加一滴菌懸液,并對(duì)應(yīng)加入一滴K抗血清。在對(duì)照間隔內(nèi)加一
滴3%氯化鈉溶液。輕微傾斜玻片,使各成分相混合,再前后傾動(dòng)玻片1min。陽(yáng)性凝集反
應(yīng)應(yīng)可以立即觀察到。
4.3??乖蔫b定:將另外一管的菌懸液轉(zhuǎn)移到離心管內(nèi),121℃高壓1h。高壓后4000
r/min離心15min,棄去上層液體,沉淀用生理鹽水洗三次,每次4000r/min離心15min,
最后一次離心后留少許上層液體,混勻制成菌懸液。用蠟筆將玻片劃分成相等的間隔。在
每個(gè)間隔內(nèi)加入一滴菌懸液,將。群血清分別加一滴到間隔內(nèi),最后一個(gè)間隔加一滴生理
鹽水作為自凝對(duì)照。輕微傾斜玻片,使各成分相混合,再前后傾動(dòng)玻片1min。陽(yáng)性凝集反
應(yīng)應(yīng)可以立即觀察到。如果未見(jiàn)到與。群血清的凝集反應(yīng),將菌懸液】21七再次高壓】h
后,重新檢測(cè)。如果仍舊為陰性,則培養(yǎng)物的??乖瓕儆谖粗8鶕?jù)表8報(bào)告血清學(xué)分型
結(jié)果。
表8副溶血性弧菌的抗原
。群K型
11,5,20,25,26,32,38,41,56,58,60,64,69
23,28
4,5,6,7,25,29,30,31,33,37,43,45,48,54,56,57,58,
3
59,72,75
44,8,9,10,11,12,13,34,42,49,53,55,63,67,68,73
515,17,30,47,60,61,68
618,46
719
820,21,22,39,41,70,74
923,44
1024,71
1119,36,40,46,50,51,61
1219,52,61,66
1365
5PCR毒力基因鑒定
PCR法檢測(cè)/仍(耐熱直接溶血素基因)和trh(TDH相關(guān)溶血素基因)毒力基因,引
物序列見(jiàn)表9。
5.1模板DNA提?。鹤訲CBS或科瑪嘉弧菌顯色平板上挑取3個(gè)可疑菌落,劃線含3%氮
化鈉的胰蛋白月東大豆瓊脂平板。純化菌株在含3%氯化鈉的腦心浸液肉湯中36℃±1七過(guò)
夜生長(zhǎng),10000xg離心10min。沉淀用無(wú)菌生理鹽水洗滌2次,重新懸浮于雙蒸水中,
煮沸10min。細(xì)菌裂解物立即用于PCR或-20均保存?zhèn)溆谩?/p>
5.2PCR反應(yīng)體系中包括含DNA的細(xì)菌裂解物2pL,20pmol/L的引物貯存液各1ML,
dNTP貯存液(各種dNTP的濃度為2.5mmol/l)1pL,Taq聚合酶0.3pL(TaKaRa),
10XPCR緩沖液5pL,總體積50pL。
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5.3反應(yīng)體系94℃預(yù)變性5minePCR的循環(huán)條件見(jiàn)表9。反應(yīng)體系72℃再延伸5min。
所有反應(yīng)均設(shè)立陽(yáng)性對(duì)照和陰性DNA對(duì)照。PCR產(chǎn)物在2%的瓊脂凝膠中120V電泳,EB
染色,照相。
5.4PCR產(chǎn)物在2%的瓊脂凝膠中120V電泳,EB染色,照相。
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表9鑒定致病性副溶血性弧菌的引物
目標(biāo)基因引物序列片段大小PCR條件循環(huán)
(bp)次數(shù)
七77基因TDH-L5'-AGCHCCATCTGTCCCTTn-3z43494℃1min30
TDH-2:5'-ATTACCACTACCACTCTC55℃1min
ATA-3'72℃1min
仍基因R2:5'-GGCTCAAAATGGTTAAGCG-3Z25094℃1min30
R6:5Z-CATnCCGCTCTCATATGC-3,55℃1min
72℃1min
6結(jié)果與報(bào)告
當(dāng)檢出的可疑菌落生化性狀符合表10要求時(shí),報(bào)告糞便標(biāo)本中檢出副溶血性弧菌。副
溶血性弧菌主要性狀與其他弧菌的鑒別見(jiàn)表11。
7菌株的保存和上送
培養(yǎng)物穿刺接種3%氯化鈉半固體培養(yǎng)基,輕擰管蓋,36℃±1七培養(yǎng)24h,蓋緊管
蓋。也可以在動(dòng)力試驗(yàn)培養(yǎng)基24h培養(yǎng)物上加入一層滅菌礦物油。室溫貯存培養(yǎng)物,不要
冷藏。如果需要長(zhǎng)期保存菌株,將0.7mL3%氯化鈉腦心浸液肉湯6h?12h培養(yǎng)物和0.3
mL滅菌甘油加入滅菌菌種管,立即放置-7?!鉉保存。按照方案要求定期上送。
表10副溶血性弧菌的生化性狀
試驗(yàn)項(xiàng)目
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