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文檔簡介
17/25非編碼RNA在表觀調控中的作用第一部分非編碼RNA的定義和分類 2第二部分非編碼RNA與組蛋白修飾的相互作用 3第三部分非編碼RNA調控DNA甲基化的機制 5第四部分非編碼RNA在基因沉默中的作用 8第五部分lncRNA作為轉錄因子募集者 10第六部分miRNA與mRNA靶基因的調控 12第七部分circRNA在表觀調控中的新興作用 14第八部分非編碼RNA在疾病中的表觀遺傳聯(lián)系 17
第一部分非編碼RNA的定義和分類非編碼RNA定義
非編碼RNA(ncRNA)是一類不編碼蛋白質的RNA分子。它們占整個人類轉錄組的98%以上,在調節(jié)基因表達中發(fā)揮著至關重要的作用。與編碼RNA(如信使RNA、轉運RNA和核糖體RNA)不同,ncRNA不翻譯成蛋白質。
ncRNA的分類
ncRNA根據大小、序列特征和功能分為多個子類:
大小RNA(sRNA)
*長度小于200個核苷酸
*包括微小RNA(miRNA)、小干擾RNA(siRNA)、Piwi相互作用RNA(piRNA)和轉座子衍生小干擾RNA(tsRNA)
*主要通過RNA干擾(RNAi)途徑調節(jié)基因表達
長鏈非編碼RNA(lncRNA)
*長度超過200個核苷酸
*異質性高,序列多樣
*調節(jié)基因表達的機制包括染色質重塑、轉錄激活和轉錄抑制
結構性ncRNA
*具有結構功能,參與核糖體、剪接體和其他RNA蛋白復合體的形成
*包括核糖體RNA(rRNA)、剪接體RNA(snRNA)、信號識別顆粒RNA(SRPRNA)和小核仁RNA(snoRNA)
其他ncRNA
*圓形RNA(circRNA):形成封閉的環(huán)形結構,在調節(jié)基因表達、翻譯和蛋白質穩(wěn)定性中發(fā)揮作用
*長反義RNA(eRNA):與編碼基因的互補鏈轉錄產生,可通過調控mRNA穩(wěn)定性或抑制翻譯來調節(jié)基因表達
*增強子RNA(enRNA):促進基因表達,但不編碼蛋白質
*抑制子RNA(isnRNA):抑制基因表達,但不編碼蛋白質
非編碼RNA功能
非編碼RNA在表觀調控中發(fā)揮著多方面的作用,包括:
*染色質修飾:調節(jié)組蛋白修飾和染色質開放性,影響基因可及性和轉錄活動
*轉錄調節(jié):參與轉錄激活和抑制,影響mRNA合成
*轉錄后調控:調控mRNA穩(wěn)定性、剪接和翻譯
*翻譯調節(jié):調節(jié)蛋白質合成
*RNA干擾:通過RNAi途徑抑制基因表達
研究表明,非編碼RNA在發(fā)育、分化、細胞周期調節(jié)和疾病發(fā)生中發(fā)揮著至關重要的作用。對ncRNA的深入研究對于理解基因調控機制和開發(fā)針對各種疾病的新型治療策略至關重要。第二部分非編碼RNA與組蛋白修飾的相互作用非編碼RNA與組蛋白修飾的相互作用
非編碼RNA(ncRNA)是一類不編碼蛋白質的RNA分子,在表觀調控中發(fā)揮著至關重要的作用。它們通過與組蛋白修飾相互作用,影響染色質結構和基因表達模式。
ncRNA與組蛋白甲基化的相互作用
*miRNA:miRNA可靶向組蛋白甲基化酶,抑制其活性,從而影響組蛋白甲基化水平。例如,miR-29可以靶向EZH2,抑制三甲基組蛋白H3賴氨酸27(H3K27me3),促進基因表達。
*lncRNA:lncRNA可以作為組蛋白甲基化酶的募集因子,將它們引導至特定的基因組位點。例如,lncRNAHOTAIR可以募集PRC2復合物,導致H3K27me3水平升高,從而抑制靶基因的表達。
ncRNA與組蛋白乙?;南嗷プ饔?/p>
*miRNA:miRNA可以靶向組蛋白脫乙酰酶(HDAC),抑制其活性,導致組蛋白乙?;缴?。例如,miR-137可以靶向HDAC4,促進H4K16ac乙?;せ畎谢虻谋磉_。
*lncRNA:lncRNA可以作為組蛋白乙?;福℉AT)的共激活因子,增強其活性。例如,lncRNAMALAT1可以與HATp300結合,促進H3K9ac乙?;?,激活靶基因的表達。
ncRNA與組蛋白磷酸化的相互作用
*miRNA:miRNA可以靶向組蛋白激酶或磷酸酶,調節(jié)組蛋白磷酸化狀態(tài)。例如,miR-34a可以靶向組蛋白激酶AURKA,抑制H3S10ph磷酸化,減弱基因轉錄。
*lncRNA:lncRNA可以作為組蛋白激酶或磷酸酶的競爭性抑制劑,調節(jié)組蛋白磷酸化水平。例如,lncRNAANRIL可以與組蛋白激酶CDK1結合,抑制H3S10ph磷酸化,影響基因表達。
ncRNA與組蛋白泛素化的相互作用
ncRNA參與了組蛋白泛素化的調控,影響染色質結構和基因表達。
*miRNA:miRNA可以靶向組蛋白泛素化酶(E3連接酶),抑制或促進其活性。例如,miR-125b可以靶向E3連接酶BMI1,促進H2AK119ub泛素化,抑制靶基因的表達。
*lncRNA:lncRNA可以募集E3連接酶至特定的基因組位點,促進組蛋白泛素化。例如,lncRNANEAT1可以募集E3連接酶RNF168,介導H2BK120ub泛素化,影響基因表達。
結論
非編碼RNA與組蛋白修飾之間的相互作用是表觀調控網絡中的關鍵組成部分。通過與組蛋白甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化相互作用,ncRNA可以影響染色質結構,調節(jié)基因表達模式,參與細胞發(fā)育、分化和疾病發(fā)生等多種生物學過程。深入了解這些相互作用對于闡明表觀調控機制和開發(fā)基于ncRNA的表觀治療策略具有重要意義。第三部分非編碼RNA調控DNA甲基化的機制非編碼RNA調控DNA甲基化的機制
非編碼RNA(ncRNA)在表觀調控中發(fā)揮著至關重要的作用,包括調控DNA甲基化。DNA甲基化是一種表觀修飾,涉及在DNA分子中胞嘧啶殘基的第5個碳原子(C5)上添加甲基,從而抑制基因轉錄。ncRNA通過多種機制調控DNA甲基化,包括:
miRNA介導的沉默
*微小RNA(miRNA)是一類長度約為22個核苷酸的ncRNA,通過與靶mRNA的3'非翻譯區(qū)(UTR)結合來介導轉錄后基因沉默。
*miRNA可靶向參與DNA甲基化過程的關鍵酶,如DNA甲基轉移酶1(DNMT1),從而抑制mRNA的翻譯并降低DNMT1的活性。
*例如,miRNA-29b可直接靶向DNMT1mRNA,抑制其表達并調節(jié)DNA甲基化模式。
lncRNA介導的招募
*長鏈非編碼RNA(lncRNA)是長度超過200個核苷酸的ncRNA,參與多種生物過程,包括表觀調控。
*lncRNA可通過招募蛋白質復合物和酶至特定基因組位點來影響DNA甲基化。
*例如,lncRNAHOTAIR可與多梳抑制復合物2(PRC2)相互作用,將PRC2募集至靶基因啟動子區(qū)域,促進H3K27me3組蛋白修飾,從而誘導基因沉默并促進DNA甲基化。
circRNA介導的吸附
*環(huán)狀RNA(circRNA)是一類共價閉合且不具有多腺苷酸尾巴的ncRNA,對表觀調控具有重要影響。
*circRNA可通過充當“海綿”吸附miRNA,從而間接調控DNA甲基化。
*例如,circRNACDR1as可與miRNA-148a結合,抑制其靶向DNMT1mRNA的活性,從而上調DNMT1表達并促進DNA甲基化。
其他機制
除了上述機制外,ncRNA還通過其他途徑調控DNA甲基化,包括:
*snRNA介導的識別:小核RNA(snRNA)參與剪接體復合體的形成,可在DNA甲基化位點識別特定的RNA序列。
*snoRNA介導的指導:小核仁RNA(snoRNA)可指導甲基化酶至rRNA中特定的序列,從而影響DNA甲基化的模式。
*RNA編輯:ncRNA可通過編輯靶mRNA中的堿基序列來調控DNA甲基化。
表觀重編程
ncRNA在表觀重編程過程中也非常重要,即在發(fā)育特定階段或疾病狀態(tài)下,表觀標記被重新設置的過程。
*在胚胎發(fā)育期間,ncRNA可調節(jié)DNA甲基化模式的重新建立,確定細胞命運和建立組織特異性表觀景觀。
*在癌癥中,ncRNA在腫瘤表觀發(fā)生中發(fā)揮關鍵作用,包括調節(jié)DNA甲基化模式。
結論
非編碼RNA通過多種機制調控DNA甲基化,從而影響基因表達和表觀景觀的建立。這些機制涉及miRNA介導的沉默、lncRNA介導的招募、circRNA介導的吸附以及其他途徑。ncRNA在表觀調控中的重要性為理解復雜疾病的病理生理學以及開發(fā)新的治療策略提供了新的見解。第四部分非編碼RNA在基因沉默中的作用關鍵詞關鍵要點非編碼RNA在基因沉默中的作用
主題名稱:RNA干擾(RNAi)
1.RNAi是一種由小干擾RNA(siRNA)介導的基因沉默機制。
2.siRNA與互補mRNA結合,觸發(fā)其降解,從而抑制基因表達。
3.RNAi是一種強大的研究工具,用于闡明基因功能和開發(fā)治療策略。
主題名稱:微小RNA(miRNA)
非編碼RNA在基因沉默中的作用
非編碼RNA(ncRNA)是轉錄產物中不編碼蛋白質的一類RNA分子,在基因調控中發(fā)揮著關鍵作用。其中,ncRNA參與基因沉默具有舉足輕重的意義,包括調控染色質結構、轉錄起始和RNA降解等多個方面。
染色質結構調控
ncRNA通過調節(jié)染色質結構,影響基因的可及性和轉錄活性。
*組蛋白修飾:某些ncRNA可以引導染色質修飾酶復合物定位到特定染色質區(qū)域。例如,X染色體失活中涉及的XISTRNA與組蛋白脫乙?;笍秃衔铮℉DAC)結合,介導靶基因座的組蛋白乙?;?,導致染色質濃縮和轉錄沉默。
*DNA甲基化:ncRNA還可以調控DNA甲基化,這是基因沉默的另一個表觀遺傳標記。例如,小分子RNA(smRNA)可以通過RNA誘導的轉錄沉默(RITS)復合物靶向DNA甲基化酶,介導基因沉默。
轉錄起始調控
ncRNA可以干擾轉錄起始過程,從而抑制基因表達。
*啟動子干擾:長鏈非編碼RNA(lncRNA)可以通過與轉錄因子或RNA聚合酶結合,阻礙轉錄因子募集或RNA聚合酶延伸,抑制基因轉錄。例如,lncRNAANRIL參與染色體11q13位點的基因沉默,通過干擾轉錄因子E2F1和RNA聚合酶II復合物的募集。
*調控輔助因子:ncRNA還可以調節(jié)轉錄起始所需的輔助因子。例如,smRNA可以通過結合轉錄共激活因子PRC2復合物中EZH2蛋白,抑制EZH2的H3K27me3組蛋白甲基化活性,從而干擾轉錄活化。
RNA降解調控
ncRNA可以通過介導靶RNA降解來實現(xiàn)基因沉默。
*微小RNA(miRNA):miRNA是20-22個核苷酸長的ncRNA分子,通過與靶mRNA的3'非翻譯區(qū)(UTR)結合,引導mRNA的切割和降解。miRNA調控廣泛,參與多種細胞過程,包括發(fā)育、分化和疾病發(fā)生。
*小干擾RNA(siRNA):siRNA是21-23個核苷酸長的ncRNA分子,與mRNA形成完全匹配的雙鏈體,觸發(fā)靶mRNA的切割和降解。siRNA主要用于RNA干擾(RNAi)技術,可以高效而特異地抑制基因表達。
其他機制
除了以上主要機制外,ncRNA還通過其他方式參與基因沉默。例如:
*輔助循環(huán)RNA(circRNA):circRNA是一種共價閉合的環(huán)狀RNA分子,可以作為microRNA海綿,通過與microRNA結合,抑制其對靶mRNA的降解。
*轉錄終止:某些ncRNA可以充當轉錄終止因子,阻礙RNA聚合酶的延伸,導致轉錄終止和基因沉默。
*翻譯抑制:ncRNA可以通過與核糖體結合,干擾翻譯起始或延伸過程,抑制蛋白質合成。
結論
非編碼RNA在基因沉默中發(fā)揮著多方面的作用,包括調節(jié)染色質結構、轉錄起始、RNA降解以及其他機制。通過這些作用,ncRNA參與基因調控網絡,影響細胞分化、發(fā)育和疾病過程。深入了解ncRNA在基因沉默中的作用對于闡明表觀遺傳調控機制和疾病治療具有重要意義。第五部分lncRNA作為轉錄因子募集者非編碼RNA在表觀調控中的作用
lncRNA作為轉錄因子募集者
長鏈非編碼RNA(lncRNA)作為轉錄調控的關鍵作用因子,在表觀調控中發(fā)揮著至關重要的作用。lncRNA通過募集轉錄因子,對基因表達осуществляет精細調控。
募集轉錄因子的機制
lncRNA募集轉錄因子的機制主要包括以下幾個方面:
*直接相互作用:lncRNA可以與轉錄因子的特定結構域直接相互作用,從而將轉錄因子錨定到特定的基因啟動子或增強子上。例如,lncRNAH19與轉錄抑制因子YY1相互作用,阻止YY1與雌激素受體α結合,抑制雌激素介導的基因表達。
*形成復合物:lncRNA可以通過形成復合物來募集轉錄因子。例如,lncRNAANRIL與Polycomb抑制復合物2(PRC2)相互作用,并將其募集到目標基因啟動子,抑制基因表達。
*調控轉錄因子的修飾:lncRNA可以通過調控轉錄因子的表觀遺傳修飾來影響其活性。例如,lncRNAXIST可以抑制轉錄因子JARID2的H3K4me3去甲基化活性,從而促進目標基因的表達。
轉錄因子募集的意義
lncRNA募集轉錄因子具有以下重要意義:
*基因表達特異性:lncRNA對特定基因啟動子的親和力,確保了轉錄因子的特異性募集,從而實現(xiàn)對基因表達的精細調控。
*表觀遺傳修飾:lncRNA介導的轉錄因子募集可以改變目標基因啟動子的表觀遺傳狀態(tài),穩(wěn)定基因表達的調控。
*細胞命運和疾?。簂ncRNA募集轉錄因子在細胞分化、發(fā)育和疾病發(fā)生中發(fā)揮關鍵作用。例如,lncRNAMEG3募集轉錄因子p53,抑制腫瘤細胞的增殖。
實例
*HOTAIR:lncRNAHOTAIR與PRC2相互作用,將PRC2募集到HOXD基因座,抑制HOXD基因的表達,在乳腺癌的發(fā)病中發(fā)揮作用。
*MALAT1:lncRNAMALAT1與轉錄因子SRF相互作用,增強SRF對目標基因啟動子的親和力,在肺癌的發(fā)生中發(fā)揮作用。
*NEAT1:lncRNANEAT1與轉錄因子NF-κB相互作用,阻斷NF-κB對目標基因的激活,在炎癥反應中發(fā)揮抑制作用。
結論
lncRNA作為轉錄因子募集者,在表觀調控中發(fā)揮著重要的作用。通過募集轉錄因子,lncRNA可以特異性調控基因表達,影響細胞命運和疾病發(fā)生。對lncRNA-轉錄因子相互作用的深入研究,將為理解表觀調控機制和開發(fā)新的治療策略提供新的見解。第六部分miRNA與mRNA靶基因的調控關鍵詞關鍵要點【miRNA與mRNA靶基因的調控】:
1.miRNA與mRNA靶基因的結合:miRNA通過堿基互補原則與mRNA3'端非翻譯區(qū)的靶序列結合,誘發(fā)mRNA降解或翻譯抑制。
2.miRNA靶基因調控的機制:miRNA調控mRNA靶基因的機制主要包括mRNA降解和翻譯抑制兩種途徑,其通過與mRNA靶序列的結合抑制mRNA的穩(wěn)定性或翻譯效率。
3.miRNA在基因調控中的作用:miRNA參與各種生物學過程的調控,包括發(fā)育、分化、細胞增殖、凋亡和代謝等。DysregulatedmiRNA表達與癌癥、神經退行性疾病和其他人類疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關。
【miRNA生物合成】:
miRNA與mRNA靶基因的調控
miRNA(微小RNA)是一類長度為20-25個核苷酸的小分子非編碼RNA,在真核生物中廣泛存在。miRNA主要通過與mRNA3'非翻譯區(qū)的序列互補結合,抑制mRNA的翻譯或降解,從而在轉錄后水平調控基因表達。
miRNA與mRNA靶基因的結合機制
miRNA與mRNA靶基因的結合是一個復雜的生理過程,主要依賴miRNA的種子序列與mRNA靶位點的配對。種子序列是miRNA5'端的2-8個核苷酸,通常是保守的序列。mRNA靶位點通常位于3'非翻譯區(qū)的開放閱讀框上游,長度為6-8個核苷酸。
當miRNA與mRNA靶位點完全或部分配對時,AGO蛋白(miRNA引導復合物的一部分)會結合到miRNA上,形成miRNA-mRNA雙鏈體。這個雙鏈體可以通過以下兩種機制抑制mRNA的表達:
翻譯抑制:AGO蛋白可阻礙翻譯起始復合物的組裝,阻止mRNA的翻譯。
mRNA降解:AGO蛋白可以募集其他蛋白,如GW182和TNRC6,形成一個降解復合物,將mRNA降解。
miRNA調控mRNA靶基因的范圍和特異性
miRNA能夠調控大量mRNA靶基因的表達,估計每個miRNA可以靶向數(shù)百個mRNA。miRNA的靶位點特異性主要取決于種子序列的配對程度。完全匹配的種子序列通常導致強烈的抑制作用,而部分匹配的種子序列可能導致較弱的抑制作用或不存在抑制作用。
miRNA對靶基因表達的調控機制
miRNA對靶基因表達的調控機制主要包括:
*直接結合靶mRNA:miRNA與mRNA靶位點直接結合,抑制翻譯或mRNA降解。
*間接調控轉錄因子:miRNA可以靶向轉錄因子的mRNA,抑制其表達,從而間接調控靶基因的轉錄。
*表觀遺傳修飾:miRNA可以與DNA甲基化和組蛋白修飾復合物相互作用,影響靶基因的表觀遺傳狀態(tài),從而調控基因表達。
miRNA在表觀調控中的作用
miRNA在表觀調控中發(fā)揮著重要作用,通過調控基因表達影響細胞分化、發(fā)育、細胞周期的進行以及疾病的發(fā)展。例如:
*細胞分化:miRNA在干細胞分化和組織特異性表達中扮演著關鍵角色。
*發(fā)育:miRNA參與胚胎發(fā)育的各個階段,調控器官形成和組織發(fā)育。
*細胞周期:miRNA調控細胞周期的各個階段,包括細胞增殖、DNA復制和細胞死亡。
*疾?。簃iRNA在癌癥、心臟病、神經系統(tǒng)疾病等多種疾病中發(fā)揮著重要作用,靶向關鍵基因,導致基因表達異常和疾病的發(fā)生發(fā)展。
總之,miRNA通過與mRNA靶位點的結合,抑制翻譯或降解mRNA,從而在轉錄后水平調控基因表達。miRNA在表觀調控中發(fā)揮著重要作用,參與細胞分化、發(fā)育、細胞周期進行以及疾病的發(fā)展。對miRNA和mRNA靶基因調控機制的研究有助于我們理解基因表達的調控機制和疾病的發(fā)生發(fā)展,為疾病的診斷和治療提供新的靶點。第七部分circRNA在表觀調控中的新興作用關鍵詞關鍵要點circRNA在表觀調控中的新興作用
circRNA作為miRNA海綿
1.circRNA通過與miRNA結合,抑制miRNA活性,從而間接調控miRNA靶基因的表達。
2.circRNA與miRNA的結合特異性受circRNA序列和結構的影響,不同circRNA可以結合不同的miRNA集合。
3.circRNA-miRNA相互作用對細胞發(fā)育、分化和疾病發(fā)生具有重要影響,為開發(fā)新的治療靶點提供了可能性。
circRNA作為轉錄因子調控元件
circRNA在表觀調控中的新興作用
環(huán)狀RNA(circRNA)是一類具有封閉環(huán)狀結構的非編碼RNA分子,近年來在表觀調控中被發(fā)現(xiàn)具有重要作用。circRNA通過與微小RNA(miRNA)、RNA結合蛋白(RBP)和DNA甲基化酶等表觀調控因子相互作用,影響基因表達和染色質重塑,從而參與多種生物學過程。
circRNA與miRNA的相互作用
circRNA可以作為miRNA海綿,通過與miRNA結合,抑制其對靶基因mRNA的降解,從而解除miRNA對靶基因的抑制效應。例如,circ-Foxo3可結合miR-132,抑制其對Foxo3mRNA的降解,從而促進Foxo3的表達,發(fā)揮抗腫瘤作用。
circRNA與RBP的相互作用
circRNA還可以與RBP相互作用,調控RBP的活性或定位。例如,circ-AKT3可結合Ago2,抑制其與miRNA的結合,從而影響miRNA的靶向效應。此外,circ-ANRIL可與hnRNPU蛋白相互作用,促進hnRNPU在啟動子區(qū)域的招募,抑制基因轉錄。
circRNA與DNA甲基化的調控
circRNA參與了DNA甲基化的調控。circ-ZNF609可與DNMT1甲基化酶相互作用,增強DNMT1的活性,促進靶基因啟動子區(qū)域的甲基化,抑制基因表達。相反,circ-SHPRH可與TET1脫甲基化酶相互作用,增強TET1的活性,促進靶基因啟動子區(qū)域的脫甲基化,促進基因表達。
circRNA在疾病中的表觀調控作用
circRNA在表觀調控中的異常表達與多種疾病相關。在癌癥中,circRNA的異常表達可以促進腫瘤發(fā)生和發(fā)展。例如,circ-PVT1在多種癌癥中高表達,可通過抑制miR-125b的活性,促進VEGF的表達,促進腫瘤血管生成和轉移。
在神經退行性疾病中,circRNA的異常表達也參與了病理過程。例如,circ-CDR1as在阿爾茨海默病患者中下調,可通過調控BACE1的表達,影響淀粉樣蛋白β(Aβ)的產生,參與疾病的發(fā)生。
circRNA作為表觀調控靶點的潛力
circRNA在表觀調控中的作用使其成為潛在的治療靶點。通過靶向調控circRNA的表達或功能,可以糾正表觀調控異常,治療相關疾病。例如,靶向抑制circ-PVT1可抑制腫瘤生長和轉移,為癌癥治療提供新的思路。
結論
circRNA在表觀調控中的作用日益受到重視,其與miRNA、RBP和DNA甲基化酶的相互作用,參與了多種生物學過程。circRNA的異常表達與多種疾病相關,使其成為潛在的治療靶點。深入研究circRNA的表觀調控機制,將為疾病的診斷、治療和預防提供新的策略。第八部分非編碼RNA在疾病中的表觀遺傳聯(lián)系非編碼RNA在疾病中的表觀遺傳聯(lián)系
非編碼RNA(ncRNA)是一類廣泛轉錄但缺乏明顯蛋白編碼能力的RNA分子。近年來,研究表明ncRNA在表觀調控中發(fā)揮著至關重要的作用,影響基因表達模式,從而與多種疾病的發(fā)生和發(fā)展密切相關。
miRNA與癌癥
微小RNA(miRNA)是長度為20-24個核苷酸的一類小分子ncRNA。它們通過與靶mRNA的3'非翻譯區(qū)(UTR)結合,抑制mRNA翻譯或導致mRNA降解。研究發(fā)現(xiàn),miRNA在癌癥發(fā)生和發(fā)展中具有雙重作用:
*抑癌miRNA:某些miRNA通過靶向致癌基因,抑制癌細胞的增殖、侵襲和轉移。例如,miR-15和miR-16被認為是肺癌的重要抑癌基因。
*促癌miRNA:其他miRNA通過靶向抑癌基因,促進癌細胞的生長和生存。例如,miR-21被發(fā)現(xiàn)過度表達于多種癌癥中,可促進腫瘤血管生成和轉移。
lncRNA與代謝疾病
長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類長度大于200個核苷酸的ncRNA。它們參與多種表觀遺傳機制,調節(jié)基因表達并影響細胞代謝。lncRNA在代謝疾病中的作用主要體現(xiàn)在以下方面:
*肥胖:某些lncRNA與肥胖和相關代謝疾病有關。例如,lncRNAH19可通過抑制脂聯(lián)素的表達,促進脂肪組織的形成和肥胖。
*糖尿?。簂ncRNA參與胰島素信號通路和葡萄糖穩(wěn)態(tài)的調控。例如,lncRNAXIST可在2型糖尿病患者中過度表達,并抑制胰島素敏感性。
circRNA與心血管疾病
環(huán)狀RNA(circRNA)是一類共價閉合的單鏈ncRNA。它們不易降解,在細胞中具有相對較長的壽命。circRNA在心血管疾病中的作用逐漸受到關注:
*心肌梗死:某些circRNA在心肌梗死后表達失調。例如,circRNA_0124648在心肌梗死的早期診斷中具有潛在價值。
*心力衰竭:circRNA參與心肌細胞的凋亡和心力衰竭的發(fā)生。例如,circRNA_0010594已被發(fā)現(xiàn)可通過調控p53通路,抑制心肌細胞凋亡。
其他ncRNA與神經系統(tǒng)疾病
除了miRNA、lncRNA和circRNA外,其他類型的ncRNA也在神經系統(tǒng)疾病中發(fā)揮著表觀遺傳作用:
*小核仁RNA(snoRNA):snoRNA參與神經系統(tǒng)發(fā)育和神經退行性疾病。例如,snoRNAHBII-52可通過靶向神經元特異性基因,調節(jié)神經元功能。
*Piwi相互作用RNA(piRNA):piRNA在生殖細胞系中表達,參與轉座子和重復序列的沉默。在神經系統(tǒng)疾病中,piRNA可調節(jié)神經元的表觀遺傳修飾和突觸可塑性。
結論
非編碼RNA在疾病中的表觀遺傳聯(lián)系是一個不斷發(fā)展的研究領域。通過了解ncRNA在表觀調控中的作用,我們可以深入理解疾病的分子機制,并開發(fā)針對性治療策略。未來,ncRNA有望成為疾病診斷、預后和治療的新型靶點。關鍵詞關鍵要點非編碼RNA的定義和分類
主題名稱:非編碼RNA的定義
關鍵要點:
1.非編碼RNA(ncRNA)是指不編碼蛋白質的RNA分子。
2.ncRNA與基因組的轉錄產物不同,不會被翻譯成蛋白質,而是執(zhí)行其他生物學功能。
3.ncRNA可以根據大小、序列特征和功能進行分類。
主題名稱:非編碼RNA的分類
關鍵要點:
1.大小分類:
a.小非編碼RNA(snoRNA、miRNA、siRNA)長度小于200個核苷酸。
b.長非編碼RNA(lncRNA)長度超過200個核苷酸,通常在1000-100,000個核苷酸之間。
2.序列特征分類:
a.內含子:基因組中被剪接去除的RNA序列。
b.結構RNA:具有復雜的三級結構并執(zhí)行特定功能的RNA分子,如轉運RNA(tRNA)和核糖體RNA(rRNA)。
3.功能分類:
a.調控性ncRNA:參與基因表達調控,如miRNA和siRNA。
b.結構性ncRNA:形成細胞內的復雜結構,如rRNA和tRNA。
c.催化性ncRNA:具有酶活性,如核酶。關鍵詞關鍵要點主題名稱:lncRNA與組蛋白甲基化調控
關鍵要點:
1.lncRNA可以通過與甲基化酶或去甲基酶結合,調節(jié)染色質組蛋白的甲基化狀態(tài)。
2.lncRNA可作為甲基化酶或去甲基酶的募集因子,引導這些酶靶向特定的基因位點。
3.lncRNA的甲基化狀態(tài)本身也影響其與甲基化酶或去甲基酶的相互作用,從而調節(jié)表觀調控過程。
主題名稱:lncRNA與組蛋白乙?;{控
關鍵要點:
1.lncRNA可以與組蛋白乙?;福℉AT)或組蛋白脫乙?;福℉DAC)結合,調節(jié)組蛋白乙酰化水平。
2.lncRNA可作為HAT或HDAC的募集因子,引導這些酶靶向特定的基因位點。
3.lncRNA的乙?;癄顟B(tài)也影響其與HAT或HDAC的相互作用,從而調節(jié)表觀調控過程。
主題名稱:lncRNA與組蛋白磷酸化調控
關鍵要點:
1.lncRNA可以與組蛋白激酶或組蛋白磷酸酶結合,調節(jié)組蛋白磷酸化水平。
2.lncRNA可作為組蛋白激酶或組蛋白磷酸酶的募集因子,引導這些酶靶向特定的基因位點。
3.lncRNA磷酸化狀態(tài)影響其與組蛋白激酶或組蛋白磷酸酶的相互作用,從而調控表觀調控過程。
主題名稱:lncRNA與組蛋白泛素化調控
關鍵要點:
1.lncRNA可以與E3泛素連接酶或泛素酶結合,調節(jié)組蛋白泛素化水平。
2.lncRNA可作為E3泛素連接酶或泛素酶的募集因子,引導這些酶靶向特定的基因位點。
3.lncRNA泛素化狀態(tài)也影響其與E3泛素連接酶或泛素酶的相互作用,從而調節(jié)表觀調控過程。
主題名稱:lncRNA與組蛋白SUMO化調控
關鍵要點:
1.lncRNA可以與SUMO化酶或SUMO化酶結合,調節(jié)組蛋白SUMO化水平。
2.lncRNA可作為SUMO化酶或SUMO化酶的募集因子,引導這些酶靶向特定的基因位點。
3.lncRNASUMO化狀態(tài)影響其與SUMO化酶或SUMO化酶的相互作用,從而調控表觀調控過程。
主題名稱:lncRNA與多個組蛋白修飾之間的相互作用
關鍵要點:
1.lncRNA可以同時與多種組蛋白修飾酶或去修飾酶相互作用,形成復雜的調控網絡。
2.lncRNA的修飾狀態(tài)影響其與不同組蛋白修飾酶或去修飾酶的相互作用,調控表觀調控的精細化過程。
3.lncRNA介導的組蛋白修飾的交叉調控為表觀調控的可塑性和動態(tài)性提供了機制基礎。關鍵詞關鍵要點主題名稱:miRNA調控DNA甲基化
關鍵要點:
1.miRNA靶向DNA甲基化酶(DNMTs)或TET(5mC氧化酶),從而影響目標基因的甲基化狀態(tài)。
2.miRNA可以上調或下調DNMTs或TET的表達,進而調節(jié)DNA甲基化水平和基因表達。
3.miRNA通過序列互補性與DNMTs或TET的mRNA結合,抑制其翻譯或降解其mRNA。
主題名稱:lncRNA調控DNA甲基化
關鍵要點:
1.lncRNA可以充當DNMTs或TET的轉錄調控因子,直接影響其活性。
2.lncRNA可以形成RNA-DNA三聯(lián)體,干擾DNA甲基轉移過程或TET介導的5mC氧化。
3.lncRNA可以募集蛋白質復合物到特定染色質區(qū),調節(jié)DNA甲基化狀態(tài)并影響基因表達。
主題名稱:circRNA調控DNA甲基化
關鍵要點:
1.circRNA可通過與DNMTs或TET結合,調節(jié)其活性或靶向特定基因組區(qū)域。
2.circRNA可以作為miRNA的競爭性內源RNA(ceRNA),間接影響miRNA對DNMTs或TET的調控。
3.circRNA可以參與調控DNA甲基化的時間和空間特異性,影響細胞命運和疾病進展。關鍵詞關鍵要點主題名稱:lncRNA作為轉錄因子的募集者
關鍵要點:
1.lncRNA可以充當轉錄因子的腳手架,為其提供結合位點,從而促進轉錄因子的靶向調控。例如,lncRNAHOTTIP可以招募PRC2復合物,加強靶基因位點的H3K27me3修飾,抑制基因轉錄。
2.lncRNA還可以通過競爭性結合轉錄因子,調控轉錄因子的可用性。例如,lncRNAMALAT1可以與SRF轉錄因子競爭性結合,從而抑制SRF轉錄活性,調控細胞增殖和凋亡。
主題名稱:lncRNA介導轉錄因子構象變化
關鍵要點:
1.lncRNA可以與轉錄因子結合,改變其構象,從而調節(jié)轉錄因子的活性。例如,lncRNANKILA可以與p53轉錄因子結合,誘導p53發(fā)生構象變化,增強其促凋亡活性。
2.lncRNA還可以通過改變轉錄因子與其他蛋白的相互作用,調節(jié)轉錄因子的構象。例如,lncRNANEAT1可以與轉錄因子YY1結合,促進YY1與BRD4的相互作用,從而調控靶基因的轉錄。
主題名稱:lncRNA穩(wěn)定轉錄因子蛋白
關鍵要點:
1.lncRNA可以與轉錄因子結合,穩(wěn)定轉錄因子的蛋白水平,從而延長轉錄因子的活性時間。例如,lncRNASPRY4-IT1可以與轉錄因子SPRY4結合,抑制SPRY4的泛素化和降解,增強SPRY4的轉錄抑制活性。
2.lncRNA還可以通過調節(jié)轉錄因子的轉錄后修飾,穩(wěn)定轉錄因子的蛋白水平。例如,lncRNAGAS5可以與RNA結合蛋白HuR結合,抑制HuR介導的轉錄因子FOXM1的翻譯抑制,增強FOXM1的穩(wěn)定性。
主題名稱:lncRNA調控轉錄因子翻譯
關鍵要點:
1.lncRNA可以與轉錄因子的mRNA結合,調控轉錄因子的翻譯效率。例如,lncRNALINC00152可以與轉錄因子CEBPA的mRNA結合,抑制其翻譯,從而抑制CEBPA的轉錄激活活性。
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