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蛋白質(zhì)的分子式一、蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)層次二、穩(wěn)定各級結(jié)構(gòu)的作用力一級結(jié)構(gòu):肽鍵、二硫鍵共價鍵二級結(jié)構(gòu):氫鍵(主要作用力)超二級結(jié)構(gòu)疏水相互作用結(jié)構(gòu)域范德華力(引力與斥力)三級結(jié)構(gòu)離子鍵四級結(jié)構(gòu)配位鍵三、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)1.定義:蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是指多肽鏈中氨基酸的序列,包括二硫鍵位置。2.主要化學(xué)鍵:肽鍵,有些蛋白質(zhì)還包括二硫鍵。3.一級結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特定生物功能的基礎(chǔ)。四、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)1.定義:多肽鏈主鏈按一定方向折疊卷曲,通過氫鍵形成局部空間構(gòu)象。2.主要的化學(xué)鍵:氫鍵。3.基本類型:a-螺旋①3.6個氨基酸殘基上升一圈,螺距0.54nm,每個aa上升0.15nm,右手螺旋。②氫鍵:螺旋3.613。③二面角:φ=-57°,ψ=-47°④r-基團分布于螺旋外側(cè)。⑤影響因素:1.同性電荷aa相斥。2.側(cè)鏈較大。3.gly二面角廣泛。4.pro形不成氫鍵。β-折疊①兩條或多條幾乎完全伸展的肽鏈平行排列,通過鏈間氫鍵交聯(lián)形成。主鏈呈鋸齒狀構(gòu)象。②相鄰aa的軸心距0.35nm。③側(cè)鏈r交替分布在片層平面的上、下方。④分平行式和反平行式。β-轉(zhuǎn)角1.定義:蛋白質(zhì)多肽鏈上的180°回折結(jié)構(gòu),也稱發(fā)夾結(jié)構(gòu)。2.特點:a.一般由4個連續(xù)的aa組成。b.g1y和pro易出現(xiàn)在β-轉(zhuǎn)角。c.第1個aa殘基c=0與第4個aa殘基n-h之間形成氫鍵。不規(guī)則卷曲:指肽鏈結(jié)構(gòu)沒有確定的規(guī)則性,靠氫鍵維持。五、蛋白質(zhì)的超二級結(jié)構(gòu)1.定義:幾個相鄰的二級結(jié)構(gòu)單元組合并相互作用,形成規(guī)則的(空間上可識別的)二級結(jié)構(gòu)組合。2.常見類型:aa、βββ、βaβ。六、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域1.定義:是球狀蛋白的折疊單位。在超二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,多肽鏈進一步彎曲折疊成一個或多個(空間上可區(qū)分的)球形局部三維實體。七、蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)1.定義:多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)、超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域的基礎(chǔ)上,進一步卷曲折疊,形成更復(fù)雜的球形分子結(jié)構(gòu)。即肽鏈中所有原子在三維空間中的相對排列位置。2.化學(xué)鍵:疏水作用、離子鍵、氫鍵、范德華力等。3.特點:?親水基團位于分子表面,形成親水層面。(增加了蛋白質(zhì)在細(xì)胞當(dāng)中的溶解性)?疏水基團位于分子內(nèi)部,形成疏水核心。(肌紅蛋白)八、蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)1.定義:由兩個或兩個以上亞單位或具有三級結(jié)構(gòu)的亞單位通過二級鍵相互締合形成的具有特定三維結(jié)構(gòu)的締合體。是寡聚蛋白質(zhì)。2.在四級結(jié)構(gòu)中,每個具有完整三級結(jié)構(gòu)
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