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CCSB41DB21SpecificationforhealthassessmentofthegutmicrobiotaofPhocalargha遼寧省市場監(jiān)督管理局發(fā)布I本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利,本文件的發(fā)布機(jī)構(gòu)不承擔(dān)識別專利控股股份有限公司、長??h海洋與漁業(yè)綜合行政執(zhí)法隊、沈陽市現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研發(fā)服務(wù)中心。1斑海豹腸道微生物菌群健康評估規(guī)范本文件規(guī)定了斑海豹腸道微生物菌群的取樣方法、檢測方4.1樣本要求2采集斑海豹的糞便作為樣本?;筐B(yǎng)斑海豹應(yīng)為按照SC/T6073、SC/T9409和SC/T9606的相關(guān)要求4.3保存取樣后應(yīng)低溫保存,-20℃環(huán)境條件下可保存7天。-80℃環(huán)使用微量分光光度計測定其濃度和純度,并于-20℃環(huán)境條件使用341F-806R引物擴(kuò)增DNA樣本中的16SrRNA基因,擴(kuò)糖凝膠電泳檢測,使用凝膠回收試劑盒進(jìn)行切膠回收。采用雙鏈DNA定量試劑盒測定回收PCR產(chǎn)物的濃度,等量混合樣品的PCR產(chǎn)物。采用DNA文庫構(gòu)建試劑盒構(gòu)建測序文庫,并進(jìn)5.3物種分類學(xué)鑒定進(jìn)行聚類,每一個聚類代表一個細(xì)菌屬。使用QIIME挑選每一個聚類的代表褐色。稀軟、水狀、扁條、細(xì)條狀并伴有異常氣味的糞便為斑海豹不同年齡階段腸道微生物菌群健康指標(biāo)范圍參見表1。高于或低于某種菌屬的指梭桿菌屬Fusobacterium3/A
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