蛋白質(zhì)組學(xué)系列講座01Proteomics醫(yī)學(xué)及生命科學(xué)研究的利器

?蛋白質(zhì)組學(xué)系列講座：Proteomics:

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知識金牌知識金牌CONTENTS課程目錄

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01蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)——概念與應(yīng)用知識金牌解

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蛋白質(zhì)組（proteome=protein+genome）一種細(xì)胞，組織或生物體的完整基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)組學(xué)（proteomics）以蛋白質(zhì)組為研究對象，研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)研究內(nèi)容蛋白質(zhì)的表達(dá)水平翻譯后修飾蛋白與蛋白的相互作用蛋白質(zhì)細(xì)胞內(nèi)定位蛋白質(zhì)組學(xué)概述知識金牌組學(xué)發(fā)展DNARNAProteinsMetabolitesLipids內(nèi)源性小分子（＜1000Da）GenotypeGenomics‐What

could

occur（可能發(fā)生什么）Transcriptomics‐What

may

occur（可能發(fā)生什么）Proteomics‐What

is

occurring（正在發(fā)生什么）Metabolomic,

Lipidomics‐What

has

occurred（已經(jīng)發(fā)生什么）Penotype解

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知識金牌影響因子：8.712案例解

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知識金牌案例解

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知識金牌案例Inflammation解

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LC-MS/MS

analyses

allowed

us

to

reliably

quantify

618

proteins

from

urine

concentrates

of

215

human

subjects.

Comparing

the

T1Dcohort

with

the

HS

cohort,

37

and20

proteins

are

increased

and

decreased

in

abundance,respectively

(n

>1.3;adjustedp-value<0.05).知識金牌蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展Nature

2014Nature

2014Science 2015Science 2017Science

2017解

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知識金牌蛋白組學(xué)技術(shù)定性Shotgun蛋白復(fù)合物組成、修飾位點檢測相對定量2D/DIGE/Label

free/iTRAQ/TMT/SILAC/DIA/SWATH蛋白表達(dá)水平變化修飾定量iTRAQ(磷酸化）Label

free（磷酸化、乙?；?、泛素化、甲基化、糖基化、琥珀酰化）絕對定量PRM/WB/ELISA/IHC目標(biāo)蛋白含量數(shù)據(jù)驗證解

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知識金牌Orbitrap

FusionQ-EXACTIVE常見質(zhì)譜儀介紹Tripple

TOF

5600+解

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知識金牌質(zhì)譜檢測到的m/z與理論數(shù)據(jù)庫里的m/z比對，匹配度最高的為檢測到的蛋白解

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蛋白質(zhì)定性原理知識金牌液質(zhì)聯(lián)用分析LC-M/SMS2D-LCMS/MS樣品前處理蛋白提取酶解還原烷基化標(biāo)記修飾富集數(shù)據(jù)庫檢索PD/SequestMaxquantPEAKSUniprot/NCBIGenome

DB生信分析GOKEGGSTRINGMSMS/MS基于質(zhì)譜的蛋白組學(xué)實驗流程解

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蛋白質(zhì)組學(xué)的兩大應(yīng)用知識金牌Summary

of

RNA-Seq應(yīng)用范圍：將要發(fā)生什么蛋白質(zhì)組學(xué)與RNA-Seq解

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知識金牌蛋白質(zhì)組學(xué)與蛋白質(zhì)芯片解

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知識金牌1、蛋白質(zhì)組學(xué)是近年來快速發(fā)展的一項高通量研究蛋白質(zhì)功能的技術(shù)。2、蛋白質(zhì)組學(xué)直接以在生命體中發(fā)揮功能的基本單位：蛋白質(zhì)中進(jìn)行研究。3、蛋白質(zhì)組學(xué)基于快速發(fā)展的質(zhì)譜技術(shù)和生信分析技術(shù)，以準(zhǔn)確定性，精確定量為主要特點，

對生命科學(xué)研究具有重要意義。4、蛋白質(zhì)組學(xué)的定性定量原理。5、蛋白質(zhì)組學(xué)的兩大應(yīng)用。6