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4/4課題2多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴增DNA片段【學(xué)習(xí)目標(biāo)】1、通過嘗試PCR技術(shù)的基本操作,使學(xué)生體驗PCR這一常規(guī)的分子生物學(xué)試驗方法。2、通過觀看PCR相關(guān)視頻,結(jié)合教師講解,能夠理解PCR的原理,討論PCR的應(yīng)用?!緦W(xué)習(xí)重、難點】重點:PCR的原理和PCR的基本操作難點:PCR的原理【學(xué)習(xí)要點梳理】要點1多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是一種體外迅速擴增DNA片段的技術(shù),它能以極少量的DNA為模板,在幾小時內(nèi)復(fù)制出上百萬份的DNA拷貝。要點2PCR原理(1)在用PCR技術(shù)擴增DNA時,DNA的復(fù)制過程與細胞內(nèi)DNA的復(fù)制類似.細胞內(nèi)參與DNA復(fù)制的各種成分和基本條件以及各自的作用如下表:參與的組分在DNA復(fù)制中的作用解旋酶打開DNA雙鏈DNA母鏈提供DNA復(fù)制的模板4種脫氧核苷酸合成子鏈的原料DNA聚合酶催化合成DNA子鏈引物使DNA聚合酶能夠從引物的3’端開始連接脫氧核苷酸(2)DNA的方向通常將DNA的羥基(-OH)末端稱為3’端,而磷酸基團的末端稱為5’端。(3)引物引物是一小段DNA或RNA,它能與DNA母鏈的一段堿基序列互補配對。用于PCR的引物長度通常為20~30個核苷酸。引物的作用:DNA聚合酶不能從頭開始合成DNA,而只能從引物的3'端延伸DNA鏈,因此,DNA復(fù)制需要引物。(4)DNA的合成方向當(dāng)引物與DNA母鏈通過堿基互補配對結(jié)合后,DNA聚合酶就能從引物的3’端開始延伸DNA鏈,DNA的合成方向總是從子鏈的5’端向3’端延伸。(5)DNA的變性與復(fù)性在80-100℃(6)PCR對DNA雙鏈的解聚與結(jié)合控制PCR利用了DNA的熱變性原理,通過控制溫度來控制雙鏈的解聚與結(jié)合。(7)TaqDNA聚合酶的應(yīng)用PCR中的高溫會導(dǎo)致普通DNA聚合酶失活,而耐高溫的TaqDNA聚合酶解決了這個問題,大大增加了PCR的效率,使PCR技術(shù)趨向自動化。(8)PCR擴增DNA的基本條件PCR反應(yīng)需要在一定的緩沖溶液中提供:DNA模板,分別與兩條模板鏈相結(jié)合的兩種引物。四種脫氧核苷酸,耐熱的DNA聚合酶,同時通過控制溫度使DNA復(fù)制在體外反復(fù)進行。要點3PCR的反應(yīng)過程PCR一般要經(jīng)歷三十多次循環(huán),每次循環(huán)可以分為變性、復(fù)性和延伸三步。從第二輪循環(huán)開始,上一次循環(huán)的產(chǎn)物也作為模板參與反應(yīng),并且由引物Ⅰ延伸而成的DNA單鏈會與引物Ⅱ結(jié)合,進行DNA的延伸。這樣,DNA聚合酶只能特異地復(fù)制處于兩個引物之間的DNA序列,使這段固定長度的序列呈指數(shù)擴增。要點4實驗操作做PCR通常使用微量離心管,它是一種薄壁塑料管,總?cè)莘e為0.5mL。具體操作時,用微量移液器向微量離心管中依次加入各組分,再設(shè)計好PCR儀的循環(huán)程序就可以了。如果沒有PCR儀,可以設(shè)置3個恒溫水浴鍋,溫度分別為94℃、55℃和PCR的突出優(yōu)點是快速、高效、靈活和易于操作。要點5DNA含量的測定DNA在260nm的紫外線波段有一強烈的吸收峰(見下圖)??梢岳肈NA的這一特點進行DNA含量的測定。具體步驟如下:(1)將樣品進行50倍稀釋:取2LPCR反應(yīng)液,加入98L蒸餾水。(2)以蒸餾水作為空白對照,在波長260nm處,將紫外分光光度計的讀數(shù)調(diào)節(jié)至零。(3)加入步驟1中的DNA稀釋液100L至比色杯中,測定260nm處的光吸收值。(4)計算DNA含量。公式:DNA含量(g)=50×(260nm的讀數(shù))×稀釋倍數(shù)。要點6實驗注意事項(1)為避免外源DNA等因素的污染,PCR實驗中使用的微量離心管、槍頭、緩沖液以及蒸餾水等在使用前必須進行高壓蒸汽滅菌。(2)在微量離心管中添加反應(yīng)成分時,每吸取一種試劑后,移液器上的槍頭都必須更換。所有的成分都加入
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