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職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)實(shí)驗(yàn)
DNA的瓊脂糖凝膠電泳一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>
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二、實(shí)驗(yàn)原理1.核酸分子是兩性解離分子,pH3.5時(shí)堿基上的氨基解離,而三個(gè)磷酸基團(tuán)中只有一個(gè)磷酸解離,所以分子帶正電,在電場(chǎng)中向負(fù)極泳動(dòng);而pH8.0-8.3時(shí),堿基幾乎不解離,而磷酸基團(tuán)解離,所以核酸分子帶負(fù)電,在電場(chǎng)中向正極泳動(dòng)。不同的核酸分子的電荷密度大致相同,因此對(duì)泳動(dòng)速度影響不大。職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)2.瓊脂糖凝膠電泳是常用的用于分離、鑒定DNA、RNA分子混合物的方法,這種電泳方法以瓊脂凝膠作為支持物,利用DNA分子在泳動(dòng)時(shí)的電荷效應(yīng)和分子篩效應(yīng),達(dá)到分離混合物的目的。DNA分子在高于其等電點(diǎn)的溶液中帶負(fù)電,在電場(chǎng)中向正極移動(dòng)。在一定的電場(chǎng)強(qiáng)度下,DNA分子的遷移速度取決于分子篩效應(yīng),即分子本身的大小,DNA分子的遷移速度與其相對(duì)分子量成反比。-+職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)
3.瓊脂糖是一種聚合鏈線性分子,含有不同濃度的瓊脂糖凝膠構(gòu)成的分子篩的網(wǎng)孔大小不同,可用于分離不同濃度范圍的核酸分子。瓊脂糖凝膠適合分離長(zhǎng)度100bp至60Kb的分子,選擇不同濃度的凝膠,可以分離不同大小范圍的DNA分子。職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)4.核酸電泳中常用的染色劑是溴化乙錠(EB)。溴化乙錠是一種扁平分子,可以嵌入核酸雙鏈的配對(duì)堿基之間。在紫外線照射EB-DNA復(fù)合物時(shí),可以發(fā)出熒光。熒光強(qiáng)度跟DNA的濃度呈正比。職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)三、實(shí)驗(yàn)試劑與儀器:1、儀器及耗材水平電泳槽、電泳儀、凝膠成像分析系統(tǒng)、微波爐、微量移液器、100mL或250mL錐形瓶、量筒、槍頭等2、試劑(1)50XTAE緩沖液(2MTris-乙酸,0.05MEDTA)。(2)6X上樣緩沖液:0.25%溴酚藍(lán),0.25%二甲苯青FF,30%甘油(3)
EB替代物、低熔點(diǎn)瓊脂糖(4)DNA樣品、DNAMarker職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)
溴酚蘭在0.5%~1.4%的瓊脂糖凝膠中的泳動(dòng)速度大約相當(dāng)于300bp的線性DNA的泳動(dòng)速度,而二甲苯青FF的泳動(dòng)速度相當(dāng)于4Kb的雙鏈線形DNA的泳動(dòng)速度。職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)四、實(shí)驗(yàn)步驟職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)1、按所分離的DNA分子的大小范圍和樣品數(shù)量,稱取適量的瓊脂糖粉末,放到一錐形瓶中,加入適量的1XTAE電泳緩沖液。然后置微波爐加熱至完全溶化,溶液透明。冷卻至60°C左右,在膠液內(nèi)加入適量的核酸染料(10μL/100ml)。2、取制膠板槽,膠槽四周封嚴(yán),水平放置膠槽,在一端插好梳子,向槽內(nèi)緩慢倒入已冷至60°C左右的膠液,使之形成均勻水平的膠面。3、待膠凝固后,將膠槽放到電泳槽內(nèi),使加樣孔端置負(fù)極端,注入1XTAE電泳緩沖液至液面覆蓋過膠面,小心拔出梳子。4、把待檢測(cè)的樣品,按以下量(1μI加樣緩沖液(6×)+5μI待測(cè)DNA樣品)在潔凈載玻片上小心混勻,用移液槍加至凝膠的加樣孔中,編好加樣順序。職業(yè)教育醫(yī)學(xué)生物技術(shù)專業(yè)教學(xué)資源庫(kù)5、接通電泳儀和電泳槽,并接通電源,調(diào)節(jié)穩(wěn)壓輸出,電壓最高不超過5V/cm,開始電泳。6、觀察溴酚蘭的帶(藍(lán)色)的移動(dòng)。當(dāng)其移動(dòng)至距膠板前沿約1cm處,可停止電泳。7、在紫外透視儀的樣品臺(tái)上重新鋪上一張保鮮膜,趕去氣泡平鋪,然后把凝膠放在上面。關(guān)上樣品室外門,打開紫外燈(36
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