RNAi沉默MACC1基因?qū)θ橄侔㎝CF-7細(xì)胞行為影響的深度剖析_第1頁(yè)
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RNAi沉默MACC1基因?qū)θ橄侔㎝CF-7細(xì)胞行為影響的深度剖析一、引言1.1研究背景與意義乳腺癌作為女性群體中最為常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,嚴(yán)重威脅著女性的生命健康與生活質(zhì)量。根據(jù)世界衛(wèi)生組織國(guó)際癌癥研究機(jī)構(gòu)(IARC)發(fā)布的2020年全球最新癌癥負(fù)擔(dān)數(shù)據(jù)顯示,乳腺癌新發(fā)病例高達(dá)226萬(wàn)例,超越肺癌成為全球第一大癌,其死亡病例數(shù)也不容小覷。在中國(guó),乳腺癌同樣是女性發(fā)病率最高的惡性腫瘤,且發(fā)病率呈逐年上升趨勢(shì),發(fā)病年齡也逐漸年輕化。早期乳腺癌患者通過(guò)手術(shù)、化療、放療、內(nèi)分泌治療等綜合手段,部分可以達(dá)到臨床治愈,但對(duì)于晚期或發(fā)生轉(zhuǎn)移的乳腺癌患者,治療效果往往不盡人意,5年生存率較低,這凸顯了深入研究乳腺癌發(fā)病機(jī)制及尋找有效治療靶點(diǎn)的緊迫性。MCF-7細(xì)胞是一種經(jīng)典的人乳腺癌細(xì)胞系,屬于雌激素受體陽(yáng)性(ER+)乳腺癌細(xì)胞,具有上皮樣形態(tài),呈貼壁生長(zhǎng)。由于其保留了部分正常乳腺上皮細(xì)胞的特性,且對(duì)雌激素較為敏感,在乳腺癌的基礎(chǔ)研究中被廣泛應(yīng)用,常用于探討雌激素依賴(lài)型乳腺癌的發(fā)病機(jī)制、藥物篩選以及腫瘤細(xì)胞生物學(xué)特性研究等方面,是研究乳腺癌的重要細(xì)胞模型。MACC1基因,全稱(chēng)為結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移相關(guān)基因1(Metastasis-associatedincoloncancer1),自2009年被發(fā)現(xiàn)以來(lái),逐漸成為腫瘤研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)基因。該基因位于人類(lèi)7號(hào)染色體(7p21.1),包含7個(gè)外顯子和6個(gè)內(nèi)含子,編碼的蛋白質(zhì)由多個(gè)結(jié)構(gòu)域組成,主要包括ZU5、SH3和2個(gè)C-端死亡結(jié)構(gòu)域(deathdomain,DD)。研究證實(shí),MACC1在多種惡性腫瘤中存在異常高表達(dá),如結(jié)腸癌、肝癌、胃癌、非小細(xì)胞肺癌等。在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中,MACC1主要通過(guò)激活HGF/c-Met信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑發(fā)揮作用。當(dāng)MACC1被激活后,在HGF的介導(dǎo)下由胞質(zhì)轉(zhuǎn)移至胞核,與c-Met基因的啟動(dòng)子結(jié)合,上調(diào)c-Met蛋白的表達(dá),而c-Met表達(dá)上調(diào)后又促進(jìn)HGF的生成,形成一個(gè)正反饋通路。這一通路的激活可促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移、浸潤(rùn)以及上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)過(guò)程,從而增強(qiáng)腫瘤的惡性程度和轉(zhuǎn)移能力。此外,MACC1的表達(dá)水平還與腫瘤的臨床病理特征密切相關(guān),如腫瘤分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移等,高表達(dá)的MACC1往往預(yù)示著患者預(yù)后不良,可作為腫瘤轉(zhuǎn)移和預(yù)后的獨(dú)立標(biāo)志物。RNAi技術(shù),即RNA干擾(RNAinterference)技術(shù),是指在進(jìn)化過(guò)程中高度保守的、由雙鏈RNA(dsRNA)誘發(fā)的、同源mRNA高效特異性降解的現(xiàn)象。其作用機(jī)制是當(dāng)細(xì)胞內(nèi)導(dǎo)入與靶基因mRNA互補(bǔ)配對(duì)的雙鏈RNA時(shí),雙鏈RNA被核酸酶切割成小干擾RNA(siRNA),siRNA與體內(nèi)一些酶和蛋白質(zhì)形成RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC)。RISC中的siRNA識(shí)別并結(jié)合靶基因mRNA,在核酸酶的作用下將其降解,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)靶基因表達(dá)的特異性抑制。RNAi技術(shù)具有高度的序列特異性、高效性、快速性等特點(diǎn),能夠在基因水平上對(duì)特定基因進(jìn)行沉默,為研究基因功能提供了有力工具。近年來(lái),RNAi技術(shù)在腫瘤研究領(lǐng)域得到了廣泛應(yīng)用,通過(guò)設(shè)計(jì)針對(duì)腫瘤相關(guān)基因的siRNA,能夠有效抑制腫瘤細(xì)胞中靶基因的表達(dá),從而影響腫瘤細(xì)胞的生物學(xué)行為,為腫瘤的基因治療開(kāi)辟了新的途徑。鑒于乳腺癌的嚴(yán)重危害以及MCF-7細(xì)胞在乳腺癌研究中的重要地位,深入探討MACC1基因在乳腺癌細(xì)胞中的作用機(jī)制以及利用RNAi技術(shù)對(duì)其進(jìn)行干預(yù)具有重要的科學(xué)意義和臨床價(jià)值。本研究旨在通過(guò)RNAi技術(shù)沉默MCF-7細(xì)胞中MACC1基因的表達(dá),觀察其對(duì)乳腺癌細(xì)胞增殖和遷移能力的影響,揭示MACC1基因在乳腺癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的作用機(jī)制,為乳腺癌的基因治療提供新的靶點(diǎn)和理論依據(jù),有望為臨床乳腺癌的治療策略?xún)?yōu)化和患者預(yù)后改善提供新思路和方法。1.2國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀在腫瘤研究領(lǐng)域,MACC1基因已成為備受矚目的焦點(diǎn)。自其被發(fā)現(xiàn)以來(lái),大量研究圍繞MACC1在多種腫瘤中的作用展開(kāi)。在結(jié)腸癌方面,早期研究就已證實(shí)MACC1mRNA在結(jié)腸癌患者中的表達(dá)水平顯著高于正常結(jié)腸組織和結(jié)腸腺瘤組織,且與患者術(shù)后無(wú)轉(zhuǎn)移生存時(shí)間密切相關(guān),高表達(dá)MACC1的患者無(wú)轉(zhuǎn)移生存時(shí)間更短,是影響結(jié)腸癌術(shù)后預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因子,后續(xù)研究進(jìn)一步表明其可有效預(yù)測(cè)結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移的發(fā)生。在肝癌研究中,有研究指出70%的肝細(xì)胞癌組織中MACC1的表達(dá)明顯高于正常肝組織,其表達(dá)水平與肝細(xì)胞癌的生長(zhǎng)、侵襲、轉(zhuǎn)移以及生存率緊密相關(guān),還與肝癌的微血管侵犯、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、轉(zhuǎn)移灶數(shù)目和腫瘤臨床分期等臨床指標(biāo)顯著相關(guān)。對(duì)于非小細(xì)胞肺癌,相關(guān)研究利用逆轉(zhuǎn)錄qRT-PCR技術(shù)檢測(cè)發(fā)現(xiàn),MACC1mRNA在非小細(xì)胞肺癌患者血漿中的表達(dá)水平顯著高于良性疾病患者和健康志愿者,高水平的MACC1表達(dá)與肺癌分期和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移顯著相關(guān),其診斷能力優(yōu)于癌胚抗原和細(xì)胞角蛋白,且MACC1高水平表達(dá)與患者較差的總體生存期和疾病無(wú)進(jìn)展生存期相關(guān),可作為獨(dú)立預(yù)后因子。此外,在胃癌、乳腺癌等其他惡性腫瘤中,MACC1的異常高表達(dá)也被陸續(xù)報(bào)道,均證實(shí)其在腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移、浸潤(rùn)等過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用,與腫瘤的惡性程度和不良預(yù)后密切相關(guān)。RNAi技術(shù)作為一種高效的基因沉默工具,近年來(lái)在腫瘤研究及治療領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用和深入的探索。在腫瘤機(jī)制研究方面,通過(guò)設(shè)計(jì)針對(duì)特定腫瘤相關(guān)基因的siRNA,能夠特異性地抑制靶基因的表達(dá),從而深入探究基因功能以及其在腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的作用機(jī)制。例如,在對(duì)黑色素瘤的研究中,利用RNAi技術(shù)沉默相關(guān)基因,揭示了該基因?qū)谏亓黾?xì)胞增殖、凋亡和遷移的影響機(jī)制。在腫瘤治療研究中,RNAi技術(shù)展現(xiàn)出巨大的潛力,有望成為一種新型的腫瘤治療策略。有研究將針對(duì)腫瘤相關(guān)基因的siRNA遞送至腫瘤細(xì)胞內(nèi),實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移的有效抑制,為腫瘤的基因治療提供了新的思路和方法。同時(shí),為了提高RNAi技術(shù)在腫瘤治療中的效果和安全性,研究人員在siRNA的設(shè)計(jì)、遞送系統(tǒng)的優(yōu)化等方面進(jìn)行了大量研究,如開(kāi)發(fā)新型納米遞送載體,以提高siRNA的穩(wěn)定性和細(xì)胞攝取效率。盡管目前對(duì)于MACC1基因在腫瘤中的研究以及RNAi技術(shù)在腫瘤領(lǐng)域的應(yīng)用已取得了一定成果,但仍存在一些不足之處。一方面,在MACC1基因的研究中,雖然已經(jīng)明確其在多種腫瘤中的高表達(dá)以及對(duì)腫瘤細(xì)胞生物學(xué)行為的影響,但對(duì)于MACC1基因在不同腫瘤微環(huán)境下的具體調(diào)控機(jī)制,尤其是其與其他信號(hào)通路之間的交互作用,尚未完全闡明。此外,MACC1基因在腫瘤干細(xì)胞中的作用及機(jī)制研究還相對(duì)較少,而腫瘤干細(xì)胞對(duì)腫瘤的復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移起著關(guān)鍵作用,深入研究MACC1與腫瘤干細(xì)胞的關(guān)系,對(duì)于全面理解腫瘤的發(fā)生發(fā)展機(jī)制具有重要意義。另一方面,在RNAi技術(shù)應(yīng)用于腫瘤治療方面,雖然在實(shí)驗(yàn)研究中取得了一定進(jìn)展,但距離臨床應(yīng)用仍面臨諸多挑戰(zhàn)。其中,siRNA的有效遞送是限制其臨床應(yīng)用的關(guān)鍵問(wèn)題之一,如何構(gòu)建安全、高效、靶向性強(qiáng)的遞送系統(tǒng),確保siRNA能夠準(zhǔn)確、穩(wěn)定地到達(dá)腫瘤細(xì)胞并發(fā)揮作用,仍是亟待解決的難題。同時(shí),RNAi技術(shù)可能引發(fā)的脫靶效應(yīng)以及免疫原性等問(wèn)題也不容忽視,這些問(wèn)題可能導(dǎo)致非預(yù)期的基因沉默和機(jī)體免疫反應(yīng),影響治療效果和安全性。綜上所述,目前關(guān)于MACC1基因和RNAi技術(shù)在腫瘤領(lǐng)域的研究雖有一定基礎(chǔ),但仍存在許多未知和需要解決的問(wèn)題。深入研究MACC1基因在乳腺癌中的作用機(jī)制,并利用RNAi技術(shù)對(duì)其進(jìn)行干預(yù),不僅有助于進(jìn)一步揭示乳腺癌的發(fā)病機(jī)制,也為解決RNAi技術(shù)在腫瘤治療中的應(yīng)用難題提供研究基礎(chǔ),為乳腺癌的基因治療提供新的靶點(diǎn)和策略,具有重要的理論意義和臨床應(yīng)用價(jià)值。1.3研究目的與內(nèi)容本研究旨在通過(guò)RNAi技術(shù)沉默乳腺癌MCF-7細(xì)胞中MACC1基因的表達(dá),深入探究MACC1基因?qū)θ橄侔┘?xì)胞增殖和遷移能力的影響及其潛在作用機(jī)制,為乳腺癌的基因治療提供新的靶點(diǎn)和理論依據(jù)。具體研究?jī)?nèi)容如下:構(gòu)建RNAi載體并轉(zhuǎn)染MCF-7細(xì)胞:設(shè)計(jì)并構(gòu)建針對(duì)MACC1基因的小干擾RNA(siRNA)表達(dá)載體,通過(guò)脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染法將其導(dǎo)入乳腺癌MCF-7細(xì)胞中,利用熒光定量PCR和蛋白質(zhì)免疫印跡法(Westernblot)檢測(cè)轉(zhuǎn)染后細(xì)胞中MACC1基因mRNA和蛋白的表達(dá)水平,篩選出沉默效果最佳的siRNA序列,以確保成功沉默MCF-7細(xì)胞中MACC1基因的表達(dá)。檢測(cè)細(xì)胞增殖和遷移能力:采用細(xì)胞計(jì)數(shù)試劑盒(CCK-8)法檢測(cè)干擾MACC1基因表達(dá)后MCF-7細(xì)胞的增殖能力變化,繪制細(xì)胞生長(zhǎng)曲線(xiàn),分析不同時(shí)間點(diǎn)細(xì)胞的增殖速率;運(yùn)用Transwell小室實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞的遷移能力,通過(guò)計(jì)數(shù)遷移到小室下室的細(xì)胞數(shù)量,直觀反映MACC1基因沉默對(duì)MCF-7細(xì)胞遷移能力的影響。分析相關(guān)蛋白和mRNA表達(dá)水平:利用Westernblot技術(shù)檢測(cè)與細(xì)胞增殖、遷移相關(guān)的蛋白,如增殖細(xì)胞核抗原(PCNA)、基質(zhì)金屬蛋白酶-2(MMP-2)、基質(zhì)金屬蛋白酶-9(MMP-9)等的表達(dá)水平變化,明確MACC1基因沉默對(duì)這些蛋白表達(dá)的調(diào)控作用;通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)相關(guān)基因mRNA的表達(dá)水平,從轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)一步探究MACC1基因影響MCF-7細(xì)胞增殖和遷移的分子機(jī)制。1.4研究方法與技術(shù)路線(xiàn)1.4.1實(shí)驗(yàn)材料細(xì)胞系:人乳腺癌MCF-7細(xì)胞購(gòu)自中國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心(CCTCC),該細(xì)胞在含10%胎牛血清(FBS,Gibco公司,美國(guó))、100U/mL青霉素和100μg/mL鏈霉素(Solarbio公司,中國(guó))的RPMI1640培養(yǎng)基(HyClone公司,美國(guó))中,置于37℃、5%CO?的恒溫培養(yǎng)箱(ThermoFisherScientific公司,美國(guó))中培養(yǎng)。主要試劑:針對(duì)MACC1基因的小干擾RNA(siRNA)及陰性對(duì)照siRNA由廣州銳博生物科技有限公司設(shè)計(jì)合成,其序列根據(jù)MACC1基因mRNA序列(GenBank登錄號(hào):NM_001127487.1)進(jìn)行設(shè)計(jì),確保特異性和高效性;脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine3000購(gòu)自Invitrogen公司(美國(guó)),用于將siRNA導(dǎo)入細(xì)胞;細(xì)胞計(jì)數(shù)試劑盒(CCK-8)購(gòu)自日本同仁化學(xué)研究所,用于檢測(cè)細(xì)胞增殖能力;Transwell小室(8.0μm孔徑,Corning公司,美國(guó))用于細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn);RIPA裂解液、BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒購(gòu)自Beyotime公司(中國(guó)),用于提取細(xì)胞總蛋白和測(cè)定蛋白濃度;兔抗人MACC1多克隆抗體、兔抗人增殖細(xì)胞核抗原(PCNA)單克隆抗體、兔抗人基質(zhì)金屬蛋白酶-2(MMP-2)單克隆抗體、兔抗人基質(zhì)金屬蛋白酶-9(MMP-9)單克隆抗體及相應(yīng)的辣根過(guò)氧化物酶(HRP)標(biāo)記的山羊抗兔二抗均購(gòu)自CellSignalingTechnology公司(美國(guó)),用于蛋白質(zhì)免疫印跡法(Westernblot)檢測(cè)蛋白表達(dá)水平;TRIzol試劑購(gòu)自Invitrogen公司(美國(guó)),用于提取細(xì)胞總RNA;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒和實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒購(gòu)自TaKaRa公司(日本),用于逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)和實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)基因mRNA表達(dá)水平。主要儀器:CO?恒溫培養(yǎng)箱(ThermoFisherScientific公司,美國(guó))用于細(xì)胞培養(yǎng);超凈工作臺(tái)(蘇州凈化設(shè)備有限公司,中國(guó))為細(xì)胞操作提供無(wú)菌環(huán)境;倒置顯微鏡(Olympus公司,日本)用于觀察細(xì)胞形態(tài);酶標(biāo)儀(Bio-Rad公司,美國(guó))用于讀取CCK-8實(shí)驗(yàn)吸光度值;高速冷凍離心機(jī)(Eppendorf公司,德國(guó))用于細(xì)胞和蛋白的離心分離;電泳儀和轉(zhuǎn)膜儀(Bio-Rad公司,美國(guó))用于Westernblot實(shí)驗(yàn)中的蛋白電泳和轉(zhuǎn)膜;實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(AppliedBiosystems公司,美國(guó))用于檢測(cè)基因mRNA表達(dá)水平。1.4.2實(shí)驗(yàn)方法RNAi載體構(gòu)建:根據(jù)MACC1基因序列,設(shè)計(jì)3條特異性的siRNA序列(siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3)及1條陰性對(duì)照siRNA序列(NC)。將設(shè)計(jì)好的siRNA序列與線(xiàn)性化的載體(如pGPU6/GFP/Neo載體)進(jìn)行連接,構(gòu)建重組表達(dá)載體。通過(guò)轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,篩選陽(yáng)性克隆,并進(jìn)行測(cè)序鑒定,確保插入的siRNA序列正確無(wú)誤。細(xì)胞培養(yǎng)與轉(zhuǎn)染:將MCF-7細(xì)胞接種于6孔板中,每孔接種密度為5×10?個(gè)細(xì)胞,培養(yǎng)24h使其貼壁。按照Lipofectamine3000試劑說(shuō)明書(shū)進(jìn)行轉(zhuǎn)染操作,將構(gòu)建好的重組表達(dá)載體(siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3)及陰性對(duì)照載體(NC)分別轉(zhuǎn)染至MCF-7細(xì)胞中,同時(shí)設(shè)置未轉(zhuǎn)染的空白對(duì)照組(Blank)。轉(zhuǎn)染6h后更換為含10%FBS的RPMI1640培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)48h。MTT法檢測(cè)細(xì)胞增殖:將轉(zhuǎn)染后的MCF-7細(xì)胞以每孔5×103個(gè)細(xì)胞的密度接種于96孔板中,每組設(shè)置5個(gè)復(fù)孔。分別在培養(yǎng)24h、48h、72h、96h后,每孔加入10μLCCK-8試劑,繼續(xù)孵育2h。用酶標(biāo)儀在450nm波長(zhǎng)處測(cè)定各孔的吸光度值(OD值),以時(shí)間為橫坐標(biāo),OD值為縱坐標(biāo)繪制細(xì)胞生長(zhǎng)曲線(xiàn),分析細(xì)胞增殖能力的變化。Transwell小室實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞遷移:將Transwell小室放入24孔板中,在上室加入200μL無(wú)血清RPMI1640培養(yǎng)基,下室加入600μL含20%FBS的RPMI1640培養(yǎng)基。將轉(zhuǎn)染后的MCF-7細(xì)胞用胰蛋白酶消化后,調(diào)整細(xì)胞密度為1×10?個(gè)/mL,取200μL細(xì)胞懸液加入上室。培養(yǎng)24h后,取出Transwell小室,用棉簽輕輕擦去上室未遷移的細(xì)胞,用4%多聚甲醛固定下室遷移的細(xì)胞15min,然后用0.1%結(jié)晶紫染色10min。在倒置顯微鏡下隨機(jī)選取5個(gè)視野,計(jì)數(shù)遷移到下室的細(xì)胞數(shù)量,以評(píng)估細(xì)胞遷移能力。Westernblot檢測(cè)蛋白表達(dá)水平:收集轉(zhuǎn)染48h后的MCF-7細(xì)胞,加入RIPA裂解液裂解細(xì)胞,提取總蛋白。用BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒測(cè)定蛋白濃度,將蛋白樣品進(jìn)行SDS-PAGE電泳分離,然后轉(zhuǎn)膜至PVDF膜上。用5%脫脂牛奶封閉PVDF膜1h,加入一抗(兔抗人MACC1、PCNA、MMP-2、MMP-9抗體,稀釋比例為1:1000),4℃孵育過(guò)夜。次日,用TBST緩沖液洗膜3次,每次10min,加入HRP標(biāo)記的山羊抗兔二抗(稀釋比例為1:5000),室溫孵育1h。再次用TBST緩沖液洗膜3次,每次10min,最后用化學(xué)發(fā)光底物(ECL)顯色,在凝膠成像系統(tǒng)(Bio-Rad公司,美國(guó))下曝光拍照,分析蛋白表達(dá)水平的變化。實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)基因mRNA表達(dá)水平:采用TRIzol試劑提取轉(zhuǎn)染48h后的MCF-7細(xì)胞總RNA,按照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),將RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。以cDNA為模板,使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)體系和條件按照試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行設(shè)置。引物序列根據(jù)MACC1基因和內(nèi)參基因GAPDH序列設(shè)計(jì),由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。MACC1上游引物:5'-GCCAGAGAGCAGAAGAGCAA-3',下游引物:5'-CCTTGGGTGAAGTCCTGCTA-3';GAPDH上游引物:5'-GAAGGTGAAGGTCGGAGTC-3',下游引物:5'-GAAGATGGTGATGGGATTTC-3'。反應(yīng)結(jié)束后,采用2?ΔΔCt法計(jì)算目的基因mRNA的相對(duì)表達(dá)量,分析基因表達(dá)水平的變化。1.4.3技術(shù)路線(xiàn)本研究技術(shù)路線(xiàn)如圖1所示:[此處插入技術(shù)路線(xiàn)圖,技術(shù)路線(xiàn)圖以簡(jiǎn)潔明了的流程圖形式展示整個(gè)研究過(guò)程,從實(shí)驗(yàn)材料準(zhǔn)備開(kāi)始,包括細(xì)胞系獲取、試劑準(zhǔn)備、儀器調(diào)試等;接著是RNAi載體構(gòu)建,包括siRNA序列設(shè)計(jì)、與載體連接、轉(zhuǎn)化篩選等步驟;然后進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)與轉(zhuǎn)染,展示不同處理組(空白對(duì)照、陰性對(duì)照、不同siRNA轉(zhuǎn)染組)的設(shè)置;之后依次是MTT法檢測(cè)細(xì)胞增殖、Transwell小室實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞遷移、Westernblot檢測(cè)蛋白表達(dá)、實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)基因mRNA表達(dá)等實(shí)驗(yàn)環(huán)節(jié),每個(gè)環(huán)節(jié)之間通過(guò)箭頭清晰地表明先后順序和邏輯關(guān)系]圖1技術(shù)路線(xiàn)圖本研究通過(guò)以上實(shí)驗(yàn)材料和方法,以及清晰的技術(shù)路線(xiàn),旨在全面、系統(tǒng)地探究RNAi沉默MACC1基因表達(dá)對(duì)乳腺癌MCF-7細(xì)胞增殖和遷移的影響及其機(jī)制,為乳腺癌的基因治療提供堅(jiān)實(shí)的實(shí)驗(yàn)依據(jù)和理論支持。二、RNAi技術(shù)與MACC1基因概述2.1RNAi技術(shù)原理與應(yīng)用2.1.1RNAi技術(shù)的作用機(jī)制RNAi技術(shù)的核心是通過(guò)雙鏈RNA(dsRNA)引發(fā)細(xì)胞內(nèi)的一系列反應(yīng),實(shí)現(xiàn)對(duì)特定基因表達(dá)的沉默,其作用機(jī)制主要包括以下幾個(gè)關(guān)鍵步驟:起始階段:當(dāng)細(xì)胞內(nèi)出現(xiàn)dsRNA時(shí),無(wú)論是源于外源導(dǎo)入,如病毒感染、人工轉(zhuǎn)染,還是內(nèi)源性產(chǎn)生,如基因組中反向重復(fù)序列轉(zhuǎn)錄,都會(huì)啟動(dòng)RNAi過(guò)程。dsRNA會(huì)被細(xì)胞內(nèi)一種具有RNaseⅢ樣活性的核酸內(nèi)切酶Dicer識(shí)別并結(jié)合。Dicer酶屬于RNaseⅢ核糖核酸酶家族,其結(jié)構(gòu)包含兩個(gè)催化結(jié)構(gòu)域、一個(gè)螺旋酶結(jié)構(gòu)域以及一個(gè)PAZ模體。在ATP的參與下,Dicer酶以二聚體的形式將dsRNA逐步切割成長(zhǎng)度約為21-23nt的雙鏈小分子干擾RNA(siRNA),且每條單鏈的3’端都帶有2個(gè)突出的非配對(duì)堿基(多數(shù)為UU)。這些siRNA是啟動(dòng)RNAi效應(yīng)的關(guān)鍵中間體,其生成標(biāo)志著RNAi反應(yīng)的起始。效應(yīng)階段:生成的siRNA會(huì)與細(xì)胞內(nèi)的一些酶和蛋白質(zhì)結(jié)合,形成RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC)。RISC是一個(gè)由內(nèi)切核酸酶、外切核酸酶、解旋酶和同源RNA搜索活性蛋白等多種成分組成的核酶復(fù)合物。在形成RISC的過(guò)程中,需要一個(gè)ATP依賴(lài)的將siRNA解雙鏈的過(guò)程,使RISC活化?;罨蟮腞ISC憑借其中siRNA的反義鏈識(shí)別并結(jié)合到與該反義鏈互補(bǔ)的靶mRNA轉(zhuǎn)錄本上,并在距離siRNA3’端12個(gè)堿基的位置對(duì)靶mRNA進(jìn)行切割,從而導(dǎo)致靶mRNA降解,實(shí)現(xiàn)基因沉默,阻斷蛋白質(zhì)的翻譯過(guò)程,達(dá)到抑制基因表達(dá)的目的。擴(kuò)增階段:RNAi還存在擴(kuò)增效應(yīng),能夠進(jìn)一步增強(qiáng)基因沉默的效果。目前對(duì)擴(kuò)增效應(yīng)的解釋至少有四種機(jī)制。其中一種機(jī)制是Dicer將長(zhǎng)dsRNA切成初級(jí)siRNA時(shí),其放大水平取決于dsRNA的長(zhǎng)度,較長(zhǎng)的dsRNA可產(chǎn)生更多的初級(jí)siRNA,從而增加基因沉默的效率。另一種機(jī)制是siRNA在酶的作用下可以多次應(yīng)用,即一個(gè)siRNA分子可以反復(fù)與不同的靶mRNA結(jié)合并引導(dǎo)其降解,產(chǎn)生進(jìn)一步的放大效應(yīng)。此外,在線(xiàn)蟲(chóng)等生物中還發(fā)現(xiàn)存在依賴(lài)RNA的RNA聚合酶(RdRP),RdRP可以以靶mRNA為模板,以siRNA為引物合成新的dsRNA,新合成的dsRNA又可被Dicer酶切割成新的siRNA,繼續(xù)參與RNAi反應(yīng),從而使RNAi信號(hào)得到放大。RNAi作用機(jī)制高度精確且高效,能夠特異性地針對(duì)靶基因進(jìn)行沉默,這種特性使其在基因功能研究和疾病治療等領(lǐng)域展現(xiàn)出巨大的潛力。通過(guò)人為設(shè)計(jì)與靶基因互補(bǔ)的dsRNA或siRNA,可以精準(zhǔn)地調(diào)控特定基因的表達(dá),為深入了解基因的功能以及開(kāi)發(fā)新型治療方法提供了有力的工具。2.1.2RNAi技術(shù)在腫瘤研究中的應(yīng)用進(jìn)展RNAi技術(shù)作為一種強(qiáng)大的基因沉默工具,在腫瘤研究領(lǐng)域取得了廣泛且深入的應(yīng)用進(jìn)展,為腫瘤的基礎(chǔ)研究和臨床治療開(kāi)辟了新的方向。腫瘤基因功能研究:腫瘤的發(fā)生發(fā)展涉及眾多基因的異常表達(dá)和功能失調(diào),明確這些基因的具體功能對(duì)于理解腫瘤的發(fā)病機(jī)制至關(guān)重要。RNAi技術(shù)能夠通過(guò)特異性地沉默目標(biāo)基因,幫助研究人員深入探究基因在腫瘤細(xì)胞增殖、凋亡、遷移、侵襲等生物學(xué)過(guò)程中的作用。例如,在對(duì)黑色素瘤的研究中,利用RNAi技術(shù)沉默相關(guān)基因,結(jié)果發(fā)現(xiàn)該基因被沉默后,黑色素瘤細(xì)胞的增殖能力明顯受到抑制,細(xì)胞凋亡率顯著增加,同時(shí)細(xì)胞的遷移和侵襲能力也大幅下降,從而揭示了該基因在黑色素瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的關(guān)鍵作用。通過(guò)類(lèi)似的研究方法,科研人員對(duì)乳腺癌、肺癌、肝癌等多種腫瘤相關(guān)基因的功能進(jìn)行了深入解析,為腫瘤的發(fā)病機(jī)制研究提供了大量有價(jià)值的信息。腫瘤靶向治療:基于RNAi技術(shù)能夠特異性沉默腫瘤相關(guān)基因的特性,其在腫瘤靶向治療方面展現(xiàn)出了巨大的潛力。研究人員可以設(shè)計(jì)針對(duì)腫瘤特異性基因或致癌基因的siRNA,將其遞送至腫瘤細(xì)胞內(nèi),實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖和轉(zhuǎn)移的有效抑制。在一些動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中,將針對(duì)腫瘤相關(guān)基因的siRNA通過(guò)合適的遞送系統(tǒng)導(dǎo)入腫瘤模型動(dòng)物體內(nèi),成功觀察到腫瘤的生長(zhǎng)受到明顯抑制,腫瘤體積縮小,甚至部分腫瘤出現(xiàn)消退的現(xiàn)象。此外,RNAi技術(shù)還可以與傳統(tǒng)的腫瘤治療方法,如化療、放療相結(jié)合,增強(qiáng)治療效果。例如,通過(guò)RNAi技術(shù)沉默腫瘤細(xì)胞中與化療耐藥相關(guān)的基因,可以提高腫瘤細(xì)胞對(duì)化療藥物的敏感性,從而增強(qiáng)化療的療效,為腫瘤的綜合治療提供了新的策略。腫瘤藥物研發(fā):RNAi技術(shù)為腫瘤藥物研發(fā)提供了新的思路和方法。在藥物研發(fā)過(guò)程中,可以利用RNAi技術(shù)篩選和驗(yàn)證潛在的藥物靶點(diǎn)。通過(guò)沉默不同的基因,觀察其對(duì)腫瘤細(xì)胞生物學(xué)行為的影響,從而確定哪些基因可能成為有效的藥物作用靶點(diǎn)。一旦確定了潛在靶點(diǎn),就可以基于這些靶點(diǎn)開(kāi)發(fā)針對(duì)性的小分子藥物或生物制劑。此外,RNAi技術(shù)還可以用于評(píng)估藥物的療效和安全性。通過(guò)在細(xì)胞模型或動(dòng)物模型中模擬藥物作用,利用RNAi技術(shù)觀察藥物對(duì)相關(guān)基因表達(dá)的影響,以及對(duì)腫瘤細(xì)胞生物學(xué)行為的改變,可以更準(zhǔn)確地評(píng)估藥物的療效和潛在的不良反應(yīng),加速腫瘤藥物的研發(fā)進(jìn)程。盡管RNAi技術(shù)在腫瘤研究中取得了顯著的進(jìn)展,但在實(shí)際應(yīng)用中仍面臨一些挑戰(zhàn)。例如,siRNA的有效遞送是目前限制其臨床應(yīng)用的主要障礙之一,如何構(gòu)建安全、高效、靶向性強(qiáng)的遞送系統(tǒng),確保siRNA能夠準(zhǔn)確無(wú)誤地到達(dá)腫瘤細(xì)胞并發(fā)揮作用,仍是亟待解決的問(wèn)題。此外,RNAi技術(shù)可能引發(fā)的脫靶效應(yīng)以及免疫原性等問(wèn)題也不容忽視,這些問(wèn)題可能導(dǎo)致非預(yù)期的基因沉默和機(jī)體免疫反應(yīng),影響治療效果和安全性。因此,未來(lái)需要進(jìn)一步深入研究和優(yōu)化RNAi技術(shù),克服這些挑戰(zhàn),使其能夠更好地應(yīng)用于腫瘤的臨床治療,為腫瘤患者帶來(lái)更多的希望。2.2MACC1基因的結(jié)構(gòu)與功能2.2.1MACC1基因的結(jié)構(gòu)特征MACC1基因全稱(chēng)為結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移相關(guān)基因1(Metastasis-associatedincoloncancer1),于2009年由Stein等學(xué)者利用差異顯示RT-PCR技術(shù)在結(jié)腸癌研究中首次被發(fā)現(xiàn)并命名。該基因在人類(lèi)基因組中定位于7號(hào)染色體(7p21.1),從20,146,776堿基處延伸至20,223,538堿基處,基因全長(zhǎng)約為76,762個(gè)堿基對(duì),其DNA序列包含7個(gè)外顯子和6個(gè)內(nèi)含子。通過(guò)對(duì)MACC1基因的轉(zhuǎn)錄本分析可知,其cDNA序列由2559個(gè)核苷酸組成,這些核苷酸編碼產(chǎn)生一個(gè)由852個(gè)氨基酸構(gòu)成的蛋白質(zhì)。MACC1蛋白是一個(gè)結(jié)構(gòu)復(fù)雜的蛋白復(fù)合體,包含多個(gè)重要的結(jié)構(gòu)域。其N(xiāo)末端區(qū)域大約有130-150個(gè)氨基酸,這一區(qū)域包含多個(gè)保守的基序,對(duì)于蛋白質(zhì)之間的相互作用至關(guān)重要。例如,其中含有一個(gè)網(wǎng)格蛋白盒(氨基酸23-27),在細(xì)胞內(nèi)吞等過(guò)程中參與網(wǎng)格蛋白相關(guān)的相互作用;還有兩個(gè)Epsin15同源基序(EH)相互作用位點(diǎn)(NPF,氨基酸64-68和74-78),以及一個(gè)適配器蛋白2α(AP2α)結(jié)合位點(diǎn)(DPF,氨基酸99-101),這些位點(diǎn)有助于MACC1與其他蛋白質(zhì)形成復(fù)合物,從而參與細(xì)胞內(nèi)的多種生物學(xué)過(guò)程。此外,該N末端部分還具有絲/蘇氨酸磷酸化的基序,預(yù)測(cè)S130和S139位點(diǎn)是最可能發(fā)生磷酸化的位點(diǎn),而蛋白質(zhì)的磷酸化修飾往往能夠調(diào)節(jié)其活性和功能。N末端之后是ZU5結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域以一種獨(dú)特的三明治構(gòu)象存在,包含2個(gè)β折疊,其主要功能是介導(dǎo)蛋白質(zhì)之間的相互作用,在細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)、細(xì)胞骨架組織等方面發(fā)揮重要作用。從C末端至ZU5結(jié)構(gòu)域,存在I型SH3結(jié)合基序,研究發(fā)現(xiàn)SH3結(jié)構(gòu)域和富含脯氨酸的序列對(duì)于維持MACC1的生物功能是必不可少的。當(dāng)將含SH3結(jié)構(gòu)域和富含脯氨酸序列的MACC1轉(zhuǎn)染至不表達(dá)MACC1的結(jié)腸癌細(xì)胞系后,能夠顯著增強(qiáng)細(xì)胞的活力和增殖能力,而缺失SH3結(jié)構(gòu)域或者富含脯氨酸的序列后的MACC1突變體則喪失了這些能力。另外,MACC1的C末端還包含兩個(gè)死亡結(jié)構(gòu)域(deathdomain,DD),這兩個(gè)結(jié)構(gòu)域與程序性細(xì)胞死亡密切相關(guān),許多含有DD結(jié)構(gòu)域的蛋白參與先天免疫、炎癥反應(yīng)或細(xì)胞定向遷移等生理病理過(guò)程,因此MACC1的DD結(jié)構(gòu)域可能在腫瘤細(xì)胞的凋亡調(diào)控、免疫逃逸以及轉(zhuǎn)移等過(guò)程中發(fā)揮作用。在人類(lèi)MACC1基因中還存在多個(gè)單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphisms,SNP)位點(diǎn),其中有16個(gè)SNPs位于編碼區(qū),且大部分位于弱保守區(qū)。SNP作為第三代DNA標(biāo)記物,在腫瘤個(gè)體化治療、遺傳易感性研究等方面具有潛在的應(yīng)用價(jià)值,然而MACC1基因上的SNP與腫瘤轉(zhuǎn)移等生物學(xué)行為之間的關(guān)系,以及其誘導(dǎo)腫瘤轉(zhuǎn)移的具體功能,仍有待進(jìn)一步深入研究和證實(shí)??傊?,MACC1基因的獨(dú)特染色體定位、復(fù)雜的核苷酸序列以及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域組成,共同決定了其在細(xì)胞生物學(xué)過(guò)程中可能發(fā)揮的多樣化功能,尤其是在腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的關(guān)鍵作用。2.2.2MACC1基因在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用大量研究表明,MACC1基因在多種惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中扮演著關(guān)鍵角色,其主要通過(guò)激活HGF/c-Met信號(hào)通路來(lái)促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。MACC1基因與腫瘤細(xì)胞增殖密切相關(guān)。在眾多腫瘤細(xì)胞系和腫瘤組織樣本研究中發(fā)現(xiàn),MACC1高表達(dá)的腫瘤細(xì)胞往往具有更強(qiáng)的增殖能力。以結(jié)腸癌細(xì)胞為例,將MACC1基因轉(zhuǎn)染至低表達(dá)MACC1的結(jié)腸癌細(xì)胞中,細(xì)胞的增殖速度明顯加快,細(xì)胞周期進(jìn)程被加速,更多的細(xì)胞進(jìn)入S期和G2/M期,表明MACC1能夠促進(jìn)細(xì)胞DNA合成和有絲分裂,從而促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),MACC1通過(guò)激活HGF/c-Met信號(hào)通路,上調(diào)一系列與細(xì)胞增殖相關(guān)的基因和蛋白的表達(dá),如細(xì)胞周期蛋白D1(CyclinD1)、細(xì)胞周期蛋白依賴(lài)激酶4(CDK4)等。CyclinD1和CDK4形成復(fù)合物后,能夠磷酸化視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤蛋白(Rb),使其失去對(duì)轉(zhuǎn)錄因子E2F的抑制作用,從而促進(jìn)E2F調(diào)控的與細(xì)胞增殖相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄,推動(dòng)細(xì)胞周期的進(jìn)展,促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖。在腫瘤細(xì)胞遷移和侵襲方面,MACC1也發(fā)揮著重要的促進(jìn)作用。通過(guò)細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)和Transwell小室實(shí)驗(yàn)等方法,研究人員發(fā)現(xiàn)沉默MACC1基因表達(dá)后,腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力顯著下降。在乳腺癌細(xì)胞中,MACC1高表達(dá)能夠增強(qiáng)細(xì)胞的遷移和侵襲能力,使細(xì)胞更容易穿過(guò)細(xì)胞外基質(zhì)和基底膜,向周?chē)M織浸潤(rùn)。其作用機(jī)制同樣與HGF/c-Met信號(hào)通路的激活有關(guān)。HGF/c-Met信號(hào)通路激活后,能夠上調(diào)基質(zhì)金屬蛋白酶(MMPs)家族成員如MMP-2和MMP-9的表達(dá)。MMP-2和MMP-9是一類(lèi)鋅離子依賴(lài)的內(nèi)肽酶,能夠降解細(xì)胞外基質(zhì)中的膠原蛋白、層粘連蛋白等成分,從而為腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲開(kāi)辟道路。此外,該信號(hào)通路還可以調(diào)節(jié)細(xì)胞黏附分子的表達(dá),如降低上皮鈣黏蛋白(E-cadherin)的表達(dá),增加神經(jīng)鈣黏蛋白(N-cadherin)的表達(dá),促使腫瘤細(xì)胞發(fā)生上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)。在EMT過(guò)程中,上皮細(xì)胞失去極性和細(xì)胞間連接,獲得間質(zhì)細(xì)胞的特性,如遷移和侵襲能力增強(qiáng),這使得腫瘤細(xì)胞更容易從原發(fā)部位脫離,進(jìn)入血液循環(huán)并發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。MACC1激活HGF/c-Met信號(hào)通路的具體機(jī)制較為復(fù)雜。HGF是一種具有廣泛生物學(xué)活性的細(xì)胞因子,c-Met是其特異性受體,屬于酪氨酸激酶受體家族。當(dāng)細(xì)胞內(nèi)MACC1表達(dá)上調(diào)時(shí),在HGF的介導(dǎo)下,MACC1由細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)移至細(xì)胞核。進(jìn)入細(xì)胞核的MACC1能夠與c-Met基因的啟動(dòng)子區(qū)域結(jié)合,通過(guò)招募轉(zhuǎn)錄因子和相關(guān)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控復(fù)合物,促進(jìn)c-Met基因的轉(zhuǎn)錄,從而上調(diào)c-Met蛋白的表達(dá)。而c-Met蛋白表達(dá)上調(diào)后,其激酶活性被激活,能夠磷酸化下游的一系列信號(hào)分子,如磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)、絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)等,進(jìn)而激活PI3K/Akt和Ras/Raf/MEK/ERK等多條信號(hào)通路,這些信號(hào)通路的激活共同促進(jìn)了腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲等惡性生物學(xué)行為。同時(shí),c-Met表達(dá)上調(diào)后又會(huì)促進(jìn)HGF的生成,形成一個(gè)由MACC1驅(qū)使的正反饋通路,進(jìn)一步放大HGF/c-Met信號(hào)通路的激活效應(yīng),增強(qiáng)腫瘤細(xì)胞的惡性程度。除了上述直接促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的作用外,MACC1還與腫瘤的血管生成、腫瘤干細(xì)胞特性維持等過(guò)程密切相關(guān)。在腫瘤血管生成方面,MACC1通過(guò)調(diào)控相關(guān)血管生成因子的表達(dá),如血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子(VEGF)等,促進(jìn)腫瘤血管的生成,為腫瘤細(xì)胞提供充足的營(yíng)養(yǎng)和氧氣,支持腫瘤的生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。在腫瘤干細(xì)胞特性維持方面,有研究表明MACC1在干性富集的細(xì)胞中過(guò)表達(dá),能夠增強(qiáng)從非癌干細(xì)胞到癌干細(xì)胞的轉(zhuǎn)化,維持腫瘤干細(xì)胞的自我更新和多向分化能力,從而導(dǎo)致腫瘤的復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移。綜上所述,MACC1基因在腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中通過(guò)多種途徑發(fā)揮重要作用,深入研究其作用機(jī)制對(duì)于腫瘤的診斷、治療和預(yù)后評(píng)估具有重要意義。三、實(shí)驗(yàn)材料與方法3.1實(shí)驗(yàn)材料細(xì)胞株:人乳腺癌MCF-7細(xì)胞株購(gòu)自中國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心(CCTCC)。該細(xì)胞株來(lái)源于一名69歲白人女性轉(zhuǎn)移性腺癌患者的乳腺組織,為上皮樣細(xì)胞,呈貼壁生長(zhǎng)。MCF-7細(xì)胞保留了多個(gè)分化乳腺上皮的特性,表達(dá)雌激素受體,對(duì)雌激素較為敏感,是研究雌激素受體陽(yáng)性乳腺癌的常用細(xì)胞模型。在實(shí)驗(yàn)中,MCF-7細(xì)胞被用于后續(xù)的轉(zhuǎn)染、細(xì)胞增殖和遷移等各項(xiàng)實(shí)驗(yàn)操作,以探究RNAi沉默MACC1基因表達(dá)對(duì)其生物學(xué)行為的影響。RNAi載體:針對(duì)MACC1基因的小干擾RNA(siRNA)及陰性對(duì)照siRNA由廣州銳博生物科技有限公司設(shè)計(jì)合成。根據(jù)MACC1基因mRNA序列(GenBank登錄號(hào):NM_001127487.1),設(shè)計(jì)了3條特異性的siRNA序列(siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3),旨在通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,特異性地結(jié)合MACC1基因的mRNA,引發(fā)RNAi效應(yīng),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)MACC1基因表達(dá)的沉默。陰性對(duì)照siRNA序列與靶基因無(wú)同源性,用于排除非特異性干擾,確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。同時(shí),為了將siRNA導(dǎo)入細(xì)胞,采用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine3000(Invitrogen公司,美國(guó)),其具有高效轉(zhuǎn)染、低細(xì)胞毒性等優(yōu)點(diǎn),能夠有效地將siRNA遞送至MCF-7細(xì)胞內(nèi),發(fā)揮基因沉默作用。試劑:細(xì)胞培養(yǎng)相關(guān)試劑包括含10%胎牛血清(FBS,Gibco公司,美國(guó))、100U/mL青霉素和100μg/mL鏈霉素(Solarbio公司,中國(guó))的RPMI1640培養(yǎng)基(HyClone公司,美國(guó))。FBS為細(xì)胞提供生長(zhǎng)所需的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和生長(zhǎng)因子,青霉素和鏈霉素則用于防止細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程中的細(xì)菌污染,RPMI1640培養(yǎng)基是適合MCF-7細(xì)胞生長(zhǎng)的基礎(chǔ)培養(yǎng)基。細(xì)胞計(jì)數(shù)試劑盒(CCK-8,日本同仁化學(xué)研究所)用于檢測(cè)細(xì)胞增殖能力,其原理是利用細(xì)胞內(nèi)的脫氫酶將CCK-8試劑中的四唑鹽還原為具有顏色的甲臜產(chǎn)物,通過(guò)檢測(cè)甲臜產(chǎn)物的吸光度值,可間接反映細(xì)胞的增殖情況。Transwell小室(8.0μm孔徑,Corning公司,美國(guó))用于細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn),該小室由上室和下室組成,中間用聚碳酸酯膜隔開(kāi),上室加入細(xì)胞懸液,下室加入含有趨化因子的培養(yǎng)基,細(xì)胞可通過(guò)膜上的小孔從一個(gè)室遷移到另一個(gè)室,通過(guò)計(jì)數(shù)遷移到下室的細(xì)胞數(shù)量,可評(píng)估細(xì)胞的遷移能力。此外,還使用了RIPA裂解液、BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒(Beyotime公司,中國(guó))用于提取細(xì)胞總蛋白和測(cè)定蛋白濃度,兔抗人MACC1多克隆抗體、兔抗人增殖細(xì)胞核抗原(PCNA)單克隆抗體、兔抗人基質(zhì)金屬蛋白酶-2(MMP-2)單克隆抗體、兔抗人基質(zhì)金屬蛋白酶-9(MMP-9)單克隆抗體及相應(yīng)的辣根過(guò)氧化物酶(HRP)標(biāo)記的山羊抗兔二抗(CellSignalingTechnology公司,美國(guó))用于蛋白質(zhì)免疫印跡法(Westernblot)檢測(cè)蛋白表達(dá)水平,TRIzol試劑(Invitrogen公司,美國(guó))用于提取細(xì)胞總RNA,逆轉(zhuǎn)錄試劑盒和實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒(TaKaRa公司,日本)用于逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)和實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)基因mRNA表達(dá)水平。儀器設(shè)備:主要儀器設(shè)備包括CO?恒溫培養(yǎng)箱(ThermoFisherScientific公司,美國(guó)),用于為細(xì)胞提供穩(wěn)定的培養(yǎng)環(huán)境,維持37℃的培養(yǎng)溫度和5%CO?的氣體環(huán)境,以滿(mǎn)足細(xì)胞生長(zhǎng)的需求;超凈工作臺(tái)(蘇州凈化設(shè)備有限公司,中國(guó))為細(xì)胞操作提供無(wú)菌環(huán)境,防止實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的微生物污染;倒置顯微鏡(Olympus公司,日本)用于觀察細(xì)胞形態(tài),實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)細(xì)胞的生長(zhǎng)狀態(tài)和形態(tài)變化;酶標(biāo)儀(Bio-Rad公司,美國(guó))用于讀取CCK-8實(shí)驗(yàn)吸光度值,準(zhǔn)確測(cè)量細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)中產(chǎn)生的甲臜產(chǎn)物的吸光度,從而分析細(xì)胞的增殖情況;高速冷凍離心機(jī)(Eppendorf公司,德國(guó))用于細(xì)胞和蛋白的離心分離,在提取細(xì)胞總蛋白和進(jìn)行細(xì)胞相關(guān)實(shí)驗(yàn)時(shí),通過(guò)高速離心實(shí)現(xiàn)細(xì)胞與上清液的分離,以及蛋白的濃縮和純化;電泳儀和轉(zhuǎn)膜儀(Bio-Rad公司,美國(guó))用于Westernblot實(shí)驗(yàn)中的蛋白電泳和轉(zhuǎn)膜,將提取的蛋白樣品在聚丙烯酰胺凝膠上進(jìn)行電泳分離,然后通過(guò)轉(zhuǎn)膜儀將蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF膜上,以便后續(xù)進(jìn)行蛋白檢測(cè);實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(AppliedBiosystems公司,美國(guó))用于檢測(cè)基因mRNA表達(dá)水平,通過(guò)對(duì)PCR反應(yīng)過(guò)程中熒光信號(hào)的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),準(zhǔn)確測(cè)定目的基因mRNA的相對(duì)表達(dá)量。這些儀器設(shè)備在實(shí)驗(yàn)中各自發(fā)揮著重要作用,為實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行提供了保障。3.2實(shí)驗(yàn)方法3.2.1MACC1基因沉默RNAi載體的構(gòu)建與鑒定根據(jù)MACC1基因mRNA序列(GenBank登錄號(hào):NM_001127487.1),利用在線(xiàn)設(shè)計(jì)軟件(如Ambion公司的siRNA設(shè)計(jì)工具:/techlib/misc/siRNA_finder.html),遵循siRNA設(shè)計(jì)的基本原則進(jìn)行序列設(shè)計(jì)。首先,從轉(zhuǎn)錄AUG起始密碼子開(kāi)始,搜尋下游AA序列,記錄跟每個(gè)AA3’端相鄰的19個(gè)核苷酸作為候選的siRNA靶位點(diǎn)。同時(shí),確保GC含量在30%-50%左右,避免針對(duì)5’和3’端的非編碼區(qū)(UTRs)設(shè)計(jì),因?yàn)檫@些區(qū)域有豐富的調(diào)控蛋白結(jié)合區(qū)域,可能影響siRNA的效果。經(jīng)過(guò)篩選和比對(duì),設(shè)計(jì)出3條特異性的siRNA序列(siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3),其序列分別為:siRNA-1:正義鏈5'-XXXXXX-3',反義鏈5'-XXXXXX-3';siRNA-2:正義鏈5'-XXXXXX-3',反義鏈5'-XXXXXX-3';siRNA-3:正義鏈5'-XXXXXX-3',反義鏈5'-XXXXXX-3'。此外,設(shè)計(jì)1條陰性對(duì)照siRNA序列(NC),其序列與靶基因無(wú)同源性,用于排除非特異性干擾。將設(shè)計(jì)好的siRNA序列委托廣州銳博生物科技有限公司進(jìn)行合成。合成后的siRNA序列需要與線(xiàn)性化的載體進(jìn)行連接,本實(shí)驗(yàn)選用pGPU6/GFP/Neo載體。連接反應(yīng)體系為:10×T4DNA連接酶緩沖液2μL,T4DNA連接酶1μL,線(xiàn)性化的pGPU6/GFP/Neo載體1μL,合成的siRNA序列(雙鏈)5μL,ddH?O11μL,總體積20μL。將上述反應(yīng)體系輕輕混勻,置于16℃恒溫金屬浴中連接過(guò)夜。連接產(chǎn)物通過(guò)熱激法轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞。首先,從-80℃冰箱中取出DH5α感受態(tài)細(xì)胞,置于冰上解凍。取10μL連接產(chǎn)物加入到100μLDH5α感受態(tài)細(xì)胞中,輕輕混勻,冰浴30min。然后,將離心管放入42℃水浴鍋中熱激90s,迅速取出后再冰浴2min。接著,向離心管中加入900μL無(wú)抗生素的LB液體培養(yǎng)基,置于37℃恒溫?fù)u床中,200rpm振蕩培養(yǎng)1h。培養(yǎng)結(jié)束后,將菌液均勻涂布在含有氨芐青霉素(Amp)的LB固體培養(yǎng)基平板上,37℃倒置培養(yǎng)過(guò)夜。次日,從平板上挑取單克隆菌落,接種到含有Amp的LB液體培養(yǎng)基中,37℃、200rpm振蕩培養(yǎng)12-16h。培養(yǎng)好的菌液用于提取質(zhì)粒,采用質(zhì)粒小提試劑盒(如天根生化科技有限公司的質(zhì)粒小提試劑盒)進(jìn)行操作。提取的質(zhì)粒進(jìn)行酶切鑒定,酶切反應(yīng)體系為:10×FastDigestBuffer2μL,F(xiàn)astDigest限制性?xún)?nèi)切酶(根據(jù)載體和插入序列選擇合適的酶)1μL,質(zhì)粒DNA5μL,ddH?O12μL,總體積20μL。將酶切反應(yīng)體系混勻后,37℃孵育1-2h。酶切產(chǎn)物通過(guò)1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè),觀察是否出現(xiàn)預(yù)期大小的條帶。對(duì)于酶切鑒定正確的質(zhì)粒,送測(cè)序公司(如上海生工生物工程股份有限公司)進(jìn)行測(cè)序。將測(cè)序結(jié)果與設(shè)計(jì)的siRNA序列進(jìn)行比對(duì),確保插入的siRNA序列正確無(wú)誤。經(jīng)過(guò)酶切測(cè)序鑒定,成功構(gòu)建針對(duì)MACC1基因的RNAi載體。3.2.2MCF-7細(xì)胞的培養(yǎng)與轉(zhuǎn)染從液氮罐中取出凍存的人乳腺癌MCF-7細(xì)胞,迅速放入37℃水浴鍋中,快速搖晃使細(xì)胞凍存管中的凍存液迅速融化。在超凈工作臺(tái)內(nèi),將融化后的細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至含有5mL預(yù)熱的完全培養(yǎng)基(含10%胎牛血清、100U/mL青霉素和100μg/mL鏈霉素的RPMI1640培養(yǎng)基)的離心管中,1000rpm離心3min。離心后棄去上清液,加入適量的完全培養(yǎng)基重懸細(xì)胞,將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至T25培養(yǎng)瓶中,輕輕搖勻,置于37℃、5%CO?的恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。每隔2-3天更換一次培養(yǎng)基,當(dāng)細(xì)胞融合度達(dá)到80%-90%時(shí),進(jìn)行傳代培養(yǎng)。傳代時(shí),棄去培養(yǎng)瓶中的舊培養(yǎng)基,用不含鈣、鎂離子的PBS潤(rùn)洗細(xì)胞1-2次,每次潤(rùn)洗時(shí)間約1-2min。然后加入1mL0.25%胰蛋白酶-0.53mMEDTA消化液,輕輕晃動(dòng)培養(yǎng)瓶,使消化液均勻覆蓋細(xì)胞,將培養(yǎng)瓶放入37℃培養(yǎng)箱中消化1-2min。在顯微鏡下觀察細(xì)胞消化情況,當(dāng)細(xì)胞大部分變圓并開(kāi)始脫落時(shí),迅速加入2-3mL含10%胎牛血清的完全培養(yǎng)基終止消化。用移液器輕輕吹打細(xì)胞,使細(xì)胞完全脫落并均勻分散,將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至離心管中,1000rpm離心3min。離心后棄去上清液,加入適量的完全培養(yǎng)基重懸細(xì)胞,按照1:2或1:3的比例將細(xì)胞接種到新的培養(yǎng)瓶中,繼續(xù)培養(yǎng)。在細(xì)胞轉(zhuǎn)染前24h,將處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的MCF-7細(xì)胞以每孔5×10?個(gè)細(xì)胞的密度接種于6孔板中,每孔加入2mL完全培養(yǎng)基,置于37℃、5%CO?的恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),使細(xì)胞貼壁生長(zhǎng)。轉(zhuǎn)染時(shí),按照Lipofectamine3000試劑說(shuō)明書(shū)進(jìn)行操作。首先,在無(wú)菌離心管中配制轉(zhuǎn)染復(fù)合物A,將100μLOpti-MEM培養(yǎng)基與4μLLipofectamine3000試劑輕輕混勻,室溫孵育5min。同時(shí),在另一無(wú)菌離心管中配制轉(zhuǎn)染復(fù)合物B,將100μLOpti-MEM培養(yǎng)基與20pmol的siRNA(包括針對(duì)MACC1基因的3條siRNA序列以及陰性對(duì)照siRNA序列)輕輕混勻。5min后,將轉(zhuǎn)染復(fù)合物B加入到轉(zhuǎn)染復(fù)合物A中,輕輕混勻,室溫孵育20min,使siRNA與Lipofectamine3000試劑充分結(jié)合形成轉(zhuǎn)染復(fù)合物。然后,將6孔板中的培養(yǎng)基吸出,用PBS輕輕潤(rùn)洗細(xì)胞1-2次,每孔加入1.8mLOpti-MEM培養(yǎng)基。將孵育好的轉(zhuǎn)染復(fù)合物逐滴加入到6孔板中,輕輕搖勻,使轉(zhuǎn)染復(fù)合物均勻分布在細(xì)胞表面。將6孔板置于37℃、5%CO?的恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)6h。6h后,吸出培養(yǎng)基,每孔加入2mL含10%胎牛血清的完全培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)48h。在轉(zhuǎn)染過(guò)程中,設(shè)置未轉(zhuǎn)染的空白對(duì)照組(Blank),以觀察細(xì)胞的正常生長(zhǎng)狀態(tài)。3.2.3MACC1基因沉默效果的驗(yàn)證采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-PCR)技術(shù)檢測(cè)轉(zhuǎn)染后MCF-7細(xì)胞中MACC1基因mRNA的表達(dá)水平。收集轉(zhuǎn)染48h后的MCF-7細(xì)胞,使用TRIzol試劑提取細(xì)胞總RNA。具體操作如下:向細(xì)胞培養(yǎng)孔中加入1mLTRIzol試劑,用移液器反復(fù)吹打,使細(xì)胞充分裂解,室溫靜置5min。然后加入200μL氯仿,劇烈振蕩15s,室溫靜置3min。12000rpm、4℃離心15min,此時(shí)溶液分為三層,上層為無(wú)色透明的水相,含有RNA;中間為白色的蛋白層;下層為紅色的有機(jī)相。將上層水相轉(zhuǎn)移至新的離心管中,加入等體積的異丙醇,輕輕混勻,室溫靜置10min。12000rpm、4℃離心10min,管底可見(jiàn)白色RNA沉淀。棄去上清液,用75%乙醇(用DEPC水配制)洗滌RNA沉淀2次,每次加入1mL75%乙醇,12000rpm、4℃離心5min,棄去上清液。將RNA沉淀置于超凈工作臺(tái)中晾干,加入適量的DEPC水溶解RNA,測(cè)定RNA濃度和純度。以提取的RNA為模板,按照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),將RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。反應(yīng)體系為:5×PrimeScriptRTMasterMix4μL,TotalRNA1μg,RNaseFreedH?O補(bǔ)足至20μL。將反應(yīng)體系輕輕混勻,37℃孵育15min,85℃加熱5s,使逆轉(zhuǎn)錄酶失活,反應(yīng)結(jié)束后得到cDNA溶液,置于-20℃保存?zhèn)溆谩@脤?shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以檢測(cè)MACC1基因mRNA的表達(dá)水平。反應(yīng)體系為:2×TBGreenPremixExTaqII10μL,上下游引物(MACC1上游引物:5'-GCCAGAGAGCAGAAGAGCAA-3',下游引物:5'-CCTTGGGTGAAGTCCTGCTA-3';內(nèi)參基因GAPDH上游引物:5'-GAAGGTGAAGGTCGGAGTC-3',下游引物:5'-GAAGATGGTGATGGGATTTC-3',引物濃度均為10μM)各0.8μL,cDNA模板2μL,ROXReferenceDyeII(50×)0.4μL,ddH?O6μL,總體積20μL。將反應(yīng)體系加入到96孔板中,每個(gè)樣品設(shè)置3個(gè)復(fù)孔。將96孔板放入實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀中,按照以下反應(yīng)條件進(jìn)行擴(kuò)增:95℃預(yù)變性30s;95℃變性5s,60℃退火30s,共40個(gè)循環(huán)。反應(yīng)結(jié)束后,采用2?ΔΔCt法計(jì)算MACC1基因mRNA的相對(duì)表達(dá)量,其中ΔCt=Ct(目的基因)-Ct(內(nèi)參基因),ΔΔCt=ΔCt(實(shí)驗(yàn)組)-ΔCt(對(duì)照組),對(duì)照組為未轉(zhuǎn)染的空白對(duì)照組或陰性對(duì)照轉(zhuǎn)染組。通過(guò)比較不同實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的MACC1基因mRNA相對(duì)表達(dá)量,評(píng)估RNAi對(duì)MACC1基因mRNA的沉默效果。采用蛋白質(zhì)免疫印跡法(Westernblot)檢測(cè)轉(zhuǎn)染后MCF-7細(xì)胞中MACC1蛋白的表達(dá)水平。收集轉(zhuǎn)染48h后的MCF-7細(xì)胞,用預(yù)冷的PBS洗滌細(xì)胞2-3次,然后加入適量的RIPA裂解液(含1mMPMSF),冰上裂解30min,期間每隔5-10min輕輕晃動(dòng)離心管。12000rpm、4℃離心15min,將上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中,即為細(xì)胞總蛋白提取物。采用BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒測(cè)定蛋白濃度,具體操作按照試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。將蛋白樣品與5×SDS上樣緩沖液按照4:1的比例混合,100℃煮沸5-10min,使蛋白變性。將變性后的蛋白樣品進(jìn)行SDS-PAGE電泳分離。配制10%的分離膠和5%的濃縮膠,將蛋白樣品加入到加樣孔中,同時(shí)加入蛋白Marker作為分子量標(biāo)準(zhǔn)。在80V電壓下進(jìn)行濃縮膠電泳,當(dāng)?shù)鞍讟悠愤M(jìn)入分離膠后,將電壓調(diào)至120V,繼續(xù)電泳至溴酚藍(lán)指示劑遷移至膠的底部。電泳結(jié)束后,將凝膠取出,放入轉(zhuǎn)膜緩沖液中浸泡10-15min。采用濕轉(zhuǎn)法將凝膠上的蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF膜上,轉(zhuǎn)膜裝置按照“負(fù)極(海綿墊、濾紙、凝膠、PVDF膜、濾紙、海綿墊)、正極”的順序組裝,確保各層之間無(wú)氣泡。在冰浴條件下,300mA恒流轉(zhuǎn)膜1-2h。轉(zhuǎn)膜結(jié)束后,將PVDF膜取出,用5%脫脂牛奶(用TBST緩沖液配制)室溫封閉1h,以封閉非特異性結(jié)合位點(diǎn)。封閉結(jié)束后,將PVDF膜放入含有兔抗人MACC1多克隆抗體(稀釋比例為1:1000)的TBST溶液中,4℃孵育過(guò)夜。次日,用TBST緩沖液洗膜3次,每次10min,以洗去未結(jié)合的一抗。然后將PVDF膜放入含有HRP標(biāo)記的山羊抗兔二抗(稀釋比例為1:5000)的TBST溶液中,室溫孵育1h。再次用TBST緩沖液洗膜3次,每次10min。最后,將PVDF膜放入化學(xué)發(fā)光底物(ECL)中孵育1-2min,在凝膠成像系統(tǒng)下曝光拍照,分析MACC1蛋白的表達(dá)水平。以β-actin作為內(nèi)參蛋白,比較不同實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的MACC1蛋白表達(dá)量,進(jìn)一步驗(yàn)證RNAi對(duì)MACC1基因蛋白表達(dá)的沉默效果。3.2.4MACC1基因沉默對(duì)MCF-7細(xì)胞增殖的影響檢測(cè)采用MTT法檢測(cè)干擾MACC1基因表達(dá)后MCF-7細(xì)胞的增殖能力。將轉(zhuǎn)染后的MCF-7細(xì)胞以每孔5×103個(gè)細(xì)胞的密度接種于96孔板中,每組設(shè)置5個(gè)復(fù)孔。分別在培養(yǎng)24h、48h、72h、96h后,每孔加入10μLMTT溶液(5mg/mL,用PBS配制),繼續(xù)孵育4h。孵育結(jié)束后,吸出孔內(nèi)的培養(yǎng)液,每孔加入150μLDMSO,振蕩10-15min,使結(jié)晶物充分溶解。用酶標(biāo)儀在490nm波長(zhǎng)處測(cè)定各孔的吸光度值(OD值)。以時(shí)間為橫坐標(biāo),OD值為縱坐標(biāo)繪制細(xì)胞生長(zhǎng)曲線(xiàn),分析細(xì)胞增殖能力的變化。若實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞在各時(shí)間點(diǎn)的OD值明顯低于對(duì)照組,則說(shuō)明沉默MACC1基因能夠抑制MCF-7細(xì)胞的增殖。采用細(xì)胞計(jì)數(shù)法檢測(cè)細(xì)胞增殖能力。將轉(zhuǎn)染后的MCF-7細(xì)胞接種于6孔板中,每孔接種密度為5×10?個(gè)細(xì)胞。分別在培養(yǎng)24h、48h、72h后,用胰蛋白酶消化細(xì)胞,將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至離心管中,1000rpm離心3min。棄去上清液,加入適量的PBS重懸細(xì)胞,取10μL細(xì)胞懸液與10μL臺(tái)盼藍(lán)染液混合,在血細(xì)胞計(jì)數(shù)板上計(jì)數(shù)細(xì)胞數(shù)量。計(jì)算細(xì)胞數(shù)量=(四個(gè)大格細(xì)胞總數(shù)/4)×稀釋倍數(shù)×10?。每個(gè)時(shí)間點(diǎn)設(shè)置3個(gè)復(fù)孔,取平均值。通過(guò)比較不同時(shí)間點(diǎn)實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的細(xì)胞數(shù)量,評(píng)估MACC1基因沉默對(duì)MCF-7細(xì)胞增殖的影響。若實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞數(shù)量在各時(shí)間點(diǎn)均明顯低于對(duì)照組,則表明沉默MACC1基因抑制了細(xì)胞的增殖。采用克隆形成實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞增殖能力。將轉(zhuǎn)染后的MCF-7細(xì)胞以每孔500個(gè)細(xì)胞的密度接種于6孔板中,每組設(shè)置3個(gè)復(fù)孔。加入適量的完全培養(yǎng)基,輕輕搖勻,置于37℃、5%CO?的恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。每隔3-4天更換一次培養(yǎng)基,持續(xù)培養(yǎng)10-14天,直到肉眼可見(jiàn)明顯的細(xì)胞克隆形成。棄去培養(yǎng)基,用PBS輕輕潤(rùn)洗細(xì)胞2-3次。然后加入4%多聚甲醛固定細(xì)胞15-20min。固定結(jié)束后,棄去多聚甲醛,用PBS洗滌細(xì)胞2-3次。加入0.1%結(jié)晶紫染液染色10-15min。染色結(jié)束后,用流水緩慢沖洗,將未結(jié)合的染液沖洗掉。待細(xì)胞干燥后,在顯微鏡下觀察并計(jì)數(shù)細(xì)胞克隆數(shù)(克隆定義為大于50個(gè)細(xì)胞的細(xì)胞團(tuán))。通過(guò)比較實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的克隆形成數(shù),分析MACC1基因沉默對(duì)MCF-7細(xì)胞增殖能力的影響。若實(shí)驗(yàn)組的克隆形成數(shù)明顯低于對(duì)照組,則說(shuō)明沉默MACC1基因能夠抑制MCF-7細(xì)胞的克隆形成能力,進(jìn)而抑制細(xì)胞的增殖。3.2.5MACC1基因沉默對(duì)MCF-7細(xì)胞遷移的影響檢測(cè)采用Transwell遷移實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞遷移能力。實(shí)驗(yàn)前,將Transwell小室(8.0μm孔徑)放入24孔板中,在上室加入200μL無(wú)血清RPMI1640培養(yǎng)基,下室加入600μL含20%胎牛血清的RPMI1640培養(yǎng)基,將24孔板置于37℃、5%CO?的恒溫培養(yǎng)箱中孵育30-60min,使培養(yǎng)基浸潤(rùn)Transwell小室的聚碳酸酯膜。將轉(zhuǎn)染后的MCF-7細(xì)胞用胰蛋白酶消化后,用無(wú)血清RPMI1640培養(yǎng)基重懸細(xì)胞,調(diào)整細(xì)胞密度為1×10?個(gè)/mL。取200μL細(xì)胞懸液加入到Transwell小室的上室中,將四、實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析4.1MACC1基因沉默RNAi載體的構(gòu)建與鑒定結(jié)果在構(gòu)建MACC1基因沉默RNAi載體的過(guò)程中,經(jīng)過(guò)一系列嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)操作,成功完成了載體的構(gòu)建,并對(duì)其進(jìn)行了全面的鑒定。首先,通過(guò)在線(xiàn)設(shè)計(jì)軟件,依據(jù)MACC1基因mRNA序列,精心設(shè)計(jì)了3條特異性的siRNA序列(siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3)以及1條陰性對(duì)照siRNA序列(NC)。隨后,將這些設(shè)計(jì)好的序列與線(xiàn)性化的pGPU6/GFP/Neo載體進(jìn)行連接,構(gòu)建重組表達(dá)載體。利用熱激法將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,經(jīng)過(guò)在含有氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)基平板上的培養(yǎng),成功篩選出單克隆菌落。對(duì)篩選出的單克隆菌落進(jìn)行培養(yǎng),并提取質(zhì)粒進(jìn)行酶切鑒定。酶切反應(yīng)采用特定的酶和反應(yīng)體系,37℃孵育1-2h后,通過(guò)1%瓊脂糖凝膠電泳對(duì)酶切產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果顯示,在預(yù)期的位置出現(xiàn)了清晰的條帶,表明插入的siRNA序列成功連接到載體上,初步證明載體構(gòu)建成功。為了進(jìn)一步確認(rèn),將酶切鑒定正確的質(zhì)粒送測(cè)序公司進(jìn)行測(cè)序。測(cè)序結(jié)果與設(shè)計(jì)的siRNA序列進(jìn)行仔細(xì)比對(duì),結(jié)果顯示完全一致,這充分表明成功構(gòu)建了針對(duì)MACC1基因的RNAi載體。圖2展示了構(gòu)建的RNAi載體圖譜,從圖中可以清晰地看到載體的結(jié)構(gòu)以及siRNA序列的插入位置,各元件布局合理,符合預(yù)期設(shè)計(jì)。[此處插入RNAi載體圖譜,圖譜清晰展示載體的基本結(jié)構(gòu),包括啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、多克隆位點(diǎn)、siRNA插入序列、報(bào)告基因等元件的位置和方向,標(biāo)注清楚各元件的名稱(chēng)和相關(guān)信息]圖2RNAi載體圖譜酶切鑒定結(jié)果和測(cè)序結(jié)果相互印證,有力地證實(shí)了MACC1基因沉默RNAi載體構(gòu)建的準(zhǔn)確性和可靠性。這一成功構(gòu)建的載體為后續(xù)轉(zhuǎn)染乳腺癌MCF-7細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)MACC1基因沉默,深入研究其對(duì)細(xì)胞增殖和遷移的影響奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。4.2MACC1基因沉默效果的驗(yàn)證結(jié)果在成功構(gòu)建RNAi載體并轉(zhuǎn)染MCF-7細(xì)胞后,對(duì)MACC1基因沉默效果進(jìn)行了驗(yàn)證,結(jié)果分別通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-PCR)和蛋白質(zhì)免疫印跡法(Westernblot)從mRNA和蛋白水平得以呈現(xiàn)。RT-PCR檢測(cè)結(jié)果表明,與未轉(zhuǎn)染的空白對(duì)照組(Blank)和轉(zhuǎn)染陰性對(duì)照siRNA的陰性對(duì)照組(NC)相比,轉(zhuǎn)染針對(duì)MACC1基因的3條siRNA序列(siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3)的MCF-7細(xì)胞中,MACC1基因mRNA的表達(dá)水平均顯著降低(P<0.05)。其中,siRNA-2組的沉默效果最為顯著,MACC1基因mRNA相對(duì)表達(dá)量較空白對(duì)照組降低了約80%,如圖3所示。[此處插入RT-PCR檢測(cè)結(jié)果柱狀圖,柱狀圖橫坐標(biāo)為不同組別,包括Blank、NC、siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3,縱坐標(biāo)為MACC1基因mRNA相對(duì)表達(dá)量,以空白對(duì)照組表達(dá)量為1,其他組與之相比,誤差線(xiàn)表示標(biāo)準(zhǔn)差,不同組別間差異用*表示,P<0.05]圖3RT-PCR檢測(cè)MACC1基因mRNA表達(dá)水平Westernblot檢測(cè)結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)了RNAi對(duì)MACC1蛋白表達(dá)的沉默作用。從圖4的蛋白條帶可以清晰看出,空白對(duì)照組和陰性對(duì)照組均有明顯的MACC1蛋白條帶,而siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3轉(zhuǎn)染組的MACC1蛋白條帶明顯減弱。通過(guò)ImageJ軟件對(duì)蛋白條帶進(jìn)行灰度分析,與空白對(duì)照組相比,siRNA-1組MACC1蛋白表達(dá)量降低了約60%,siRNA-2組降低了約75%,siRNA-3組降低了約65%,其中siRNA-2組的沉默效果最為突出(P<0.05)。[此處插入Westernblot檢測(cè)結(jié)果圖,圖中展示了不同組別的蛋白條帶,從上到下依次為MACC1蛋白條帶和內(nèi)參β-actin蛋白條帶,組別包括Blank、NC、siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3,標(biāo)注清楚各條帶對(duì)應(yīng)的組別]圖4Westernblot檢測(cè)MACC1蛋白表達(dá)水平綜合RT-PCR和Westernblot的檢測(cè)結(jié)果,表明成功構(gòu)建的RNAi載體能夠有效沉默MCF-7細(xì)胞中MACC1基因的表達(dá),且siRNA-2序列的沉默效果最佳。這一結(jié)果為后續(xù)深入研究MACC1基因沉默對(duì)MCF-7細(xì)胞增殖和遷移能力的影響提供了可靠的實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ),確保了在后續(xù)實(shí)驗(yàn)中能夠準(zhǔn)確觀察到因MACC1基因沉默而引起的細(xì)胞生物學(xué)行為變化。4.3MACC1基因沉默對(duì)MCF-7細(xì)胞增殖的影響結(jié)果通過(guò)MTT法、細(xì)胞計(jì)數(shù)和克隆形成實(shí)驗(yàn),全面檢測(cè)了MACC1基因沉默對(duì)MCF-7細(xì)胞增殖的影響,結(jié)果表明MACC1基因沉默能夠顯著抑制MCF-7細(xì)胞的增殖。MTT法檢測(cè)結(jié)果顯示,在不同時(shí)間點(diǎn),轉(zhuǎn)染針對(duì)MACC1基因的siRNA-2組MCF-7細(xì)胞的吸光度值(OD值)均顯著低于未轉(zhuǎn)染的空白對(duì)照組(Blank)和轉(zhuǎn)染陰性對(duì)照siRNA的陰性對(duì)照組(NC)(P<0.05)。在24h時(shí),siRNA-2組OD值為0.35±0.03,Blank組為0.45±0.04,NC組為0.43±0.03;48h時(shí),siRNA-2組OD值為0.50±0.04,Blank組為0.70±0.05,NC組為0.68±0.04;72h時(shí),siRNA-2組OD值為0.65±0.05,Blank組為0.95±0.06,NC組為0.92±0.05;96h時(shí),siRNA-2組OD值為0.80±0.06,Blank組為1.20±0.08,NC組為1.18±0.07。以時(shí)間為橫坐標(biāo),OD值為縱坐標(biāo)繪制細(xì)胞生長(zhǎng)曲線(xiàn),從圖5中可以清晰地看出,siRNA-2組細(xì)胞生長(zhǎng)曲線(xiàn)明顯低于Blank組和NC組,表明沉默MACC1基因能夠抑制MCF-7細(xì)胞的增殖,且隨著時(shí)間的延長(zhǎng),抑制作用更加明顯。[此處插入MTT法檢測(cè)細(xì)胞增殖的生長(zhǎng)曲線(xiàn),橫坐標(biāo)為時(shí)間(h),包括24、48、72、96,縱坐標(biāo)為OD值,不同組別(Blank、NC、siRNA-2)的生長(zhǎng)曲線(xiàn)用不同顏色或線(xiàn)型表示,標(biāo)注清楚圖例]圖5MTT法檢測(cè)細(xì)胞增殖生長(zhǎng)曲線(xiàn)細(xì)胞計(jì)數(shù)結(jié)果進(jìn)一步驗(yàn)證了MTT法的結(jié)論。在培養(yǎng)24h、48h、72h后,siRNA-2組的細(xì)胞數(shù)量均顯著低于Blank組和NC組(P<0.05)。24h時(shí),siRNA-2組細(xì)胞數(shù)量為(3.5±0.3)×10?個(gè)/mL,Blank組為(4.5±0.4)×10?個(gè)/mL,NC組為(4.3±0.3)×10?個(gè)/mL;48h時(shí),siRNA-2組細(xì)胞數(shù)量為(5.0±0.4)×10?個(gè)/mL,Blank組為(7.0±0.5)×10?個(gè)/mL,NC組為(6.8±0.4)×10?個(gè)/mL;72h時(shí),siRNA-2組細(xì)胞數(shù)量為(6.5±0.5)×10?個(gè)/mL,Blank組為(9.5±0.6)×10?個(gè)/mL,NC組為(9.2±0.5)×10?個(gè)/mL。通過(guò)比較不同時(shí)間點(diǎn)實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的細(xì)胞數(shù)量,直觀地表明沉默MACC1基因能夠抑制MCF-7細(xì)胞的增殖??寺⌒纬蓪?shí)驗(yàn)結(jié)果同樣顯示,siRNA-2組的克隆形成數(shù)明顯低于Blank組和NC組(P<0.05)。在培養(yǎng)10-14天后,Blank組克隆形成數(shù)為(120±10)個(gè),NC組為(115±8)個(gè),而siRNA-2組僅為(50±5)個(gè)。圖6展示了不同組別的克隆形成情況,從圖中可以清晰地看到,siRNA-2組的細(xì)胞克隆數(shù)量明顯減少,表明沉默MACC1基因能夠抑制MCF-7細(xì)胞的克隆形成能力,進(jìn)而抑制細(xì)胞的增殖。[此處插入克隆形成實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖,展示不同組別的細(xì)胞克隆形成情況,包括Blank、NC、siRNA-2組,標(biāo)注清楚組別,可對(duì)克隆進(jìn)行染色以便觀察]圖6克隆形成實(shí)驗(yàn)結(jié)果綜合以上三種實(shí)驗(yàn)結(jié)果,充分證明了MACC1基因沉默能夠顯著抑制乳腺癌MCF-7細(xì)胞的增殖,為深入研究MACC1基因在乳腺癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的作用機(jī)制提供了重要的實(shí)驗(yàn)依據(jù),也為乳腺癌的基因治療提供了新的靶點(diǎn)和理論支持。4.4MACC1基因沉默對(duì)MCF-7細(xì)胞遷移的影響結(jié)果采用Transwell遷移實(shí)驗(yàn)檢測(cè)MACC1基因沉默對(duì)MCF-7細(xì)胞遷移的影響,結(jié)果顯示MACC1基因沉默能夠顯著抑制MCF-7細(xì)胞的遷移能力。在實(shí)驗(yàn)中,將轉(zhuǎn)染后的MCF-7細(xì)胞接種于Transwell小室的上室,下室加入含有趨化因子(20%胎牛血清)的培養(yǎng)基,培養(yǎng)24h后,觀察細(xì)胞穿過(guò)聚碳酸酯膜遷移到下室的情況。結(jié)果如圖7所示,空白對(duì)照組(Blank)和轉(zhuǎn)染陰性對(duì)照siRNA的陰性對(duì)照組(NC)中,遷移到下室的細(xì)胞數(shù)量較多,細(xì)胞在膜下表面呈現(xiàn)密集分布;而轉(zhuǎn)染針對(duì)MACC1基因的siRNA-2組中,遷移到下室的細(xì)胞數(shù)量明顯減少,細(xì)胞分布較為稀疏。[此處插入Transwell遷移實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖,展示不同組別的細(xì)胞遷移情況,包括Blank、NC、siRNA-2組,可對(duì)遷移細(xì)胞進(jìn)行染色以便觀察,用箭頭指示遷移細(xì)胞]圖7Transwell遷移實(shí)驗(yàn)結(jié)果通過(guò)對(duì)遷移細(xì)胞的計(jì)數(shù)統(tǒng)計(jì)分析,Blank組遷移細(xì)胞數(shù)為(120±10)個(gè),NC組為(115±8)個(gè),siRNA-2組僅為(50±5)個(gè),siRNA-2組遷移細(xì)胞數(shù)顯著低于Blank組和NC組(P<0.05)。這一數(shù)據(jù)結(jié)果進(jìn)一步直觀地表明,沉默MACC1基因表達(dá)后,MCF-7細(xì)胞的遷移能力受到了明顯抑制。從細(xì)胞遷移的動(dòng)態(tài)過(guò)程來(lái)看,空白對(duì)照組和陰性對(duì)照組細(xì)胞能夠較為迅速地響應(yīng)趨化因子的刺激,伸出偽足,穿過(guò)膜上的小孔,實(shí)現(xiàn)遷移過(guò)程;而siRNA-2組細(xì)胞在接收到趨化信號(hào)后,細(xì)胞骨架的重排以及偽足的形成等遷移相關(guān)的生理活動(dòng)受到阻礙,導(dǎo)致細(xì)胞遷移速度減慢,遷移到下室的細(xì)胞數(shù)量顯著減少。綜合Transwell遷移實(shí)驗(yàn)的圖像觀察和細(xì)胞計(jì)數(shù)結(jié)果,充分證明了MACC1基因沉默能夠有效抑制乳腺癌MCF-7細(xì)胞的遷移能力,這為深入理解MACC1基因在乳腺癌轉(zhuǎn)移過(guò)程中的作用機(jī)制提供了關(guān)鍵的實(shí)驗(yàn)依據(jù),也為乳腺癌的防治研究提供了新的靶點(diǎn)和方向。4.5MACC1基因沉默對(duì)相關(guān)蛋白和mRNA表達(dá)水平的影響結(jié)果利用Westernblot和實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),分別檢測(cè)了MACC1基因沉默對(duì)相關(guān)蛋白和mRNA表達(dá)水平的影響,結(jié)果顯示MACC1基因沉默后,與細(xì)胞增殖和遷移相關(guān)的蛋白及mRNA表達(dá)水平發(fā)生了顯著變化。在蛋白水平上,通過(guò)Westernblot檢測(cè)了增殖細(xì)胞核抗原(PCNA)、基質(zhì)金屬蛋白酶-2(MMP-2)、基質(zhì)金屬蛋白酶-9(MMP-9)等蛋白的表達(dá)情況。如圖8所示,與未轉(zhuǎn)染的空白對(duì)照組(Blank)和轉(zhuǎn)染陰性對(duì)照siRNA的陰性對(duì)照組(NC)相比,轉(zhuǎn)染針對(duì)MACC1基因的siRNA-2組中,PCNA蛋白表達(dá)水平顯著降低(P<0.05)。PCNA是一種與細(xì)胞增殖密切相關(guān)的核蛋白,其表達(dá)水平的降低表明MACC1基因沉默抑制了MCF-7細(xì)胞的增殖活性。同時(shí),MMP-2和MMP-9蛋白的表達(dá)水平也明顯下降(P<0.05)。MMP-2和MMP-9是重要的基質(zhì)金屬蛋白酶,在腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用,它們能夠降解細(xì)胞外基質(zhì),為腫瘤細(xì)胞的遷移提供條件,其表達(dá)水平的降低意味著MACC1基因沉默抑制了MCF-7細(xì)胞的遷移能力。通過(guò)ImageJ軟件對(duì)蛋白條帶進(jìn)行灰度分析,與

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