醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索—循證實踐的基礎(chǔ)-BASIC

1、醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索 循證實踐的基礎(chǔ),張俊華 商洪才,2008/04/03,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心 教育部循證醫(yī)學(xué)網(wǎng)上合作研究中心天津分中心 天津中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)藥研究院臨床療效評價中心,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,2,主要內(nèi)容,文獻(xiàn)檢索的重要性 醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫簡介 檢索策略的制訂 循證醫(yī)學(xué)信息檢索舉例,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,3,文獻(xiàn)的重要性,子曰：“夏禮，吾能言之，杞不足征也；殷禮，吾能言之， 宋不足征也。文獻(xiàn)不足故也。足，則吾能征之矣?！闭撜Z八佾,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,4,豐富的醫(yī)學(xué)典籍，是中醫(yī)學(xué)的寶藏,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,5,信息的重要性,您寫過綜述嗎？填過標(biāo)書嗎？做過實驗

2、嗎？發(fā)過文章嗎？無論哪一種，都離不開文獻(xiàn)/檢索,文獻(xiàn)資料是科學(xué)研究的“成炊之米”，無價之寶；是進(jìn)行科技決策的依據(jù)去重、糾錯、指導(dǎo)、預(yù)測,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,6,信息資源,文獻(xiàn)來源：報紙、教科書、雜志、會議文集、學(xué)術(shù)論文、網(wǎng)絡(luò)、專業(yè)數(shù)據(jù)庫 正是在網(wǎng)絡(luò)技術(shù)，數(shù)據(jù)庫技術(shù)廣泛應(yīng)用，成為循證醫(yī)學(xué)快速發(fā)展的條件。,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,7,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,9,醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫簡介,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,10,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,11,醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫簡介,印刷版、電子版,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,12,中文數(shù)據(jù)庫簡介,中國科技信息所,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,13,

3、英文文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,14,CNKI,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,15,CNKI簡介,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,16,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,17,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,18,簡單檢索,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,19,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,20,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,21,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,22,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,23,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,24,CNKI-高級檢索,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,25,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,26,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,27,PubMed,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,28,簡介,

4、由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（National Library of Medicine - NLM）國家生物技術(shù)信息中心（National Center for Biotechnology Information - NCBI）向因特網(wǎng)用戶提供免費MEDLINE檢索服務(wù)(1997-6-26) 檢索服務(wù)具有收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、訪問速度快等優(yōu)點。,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,29,二、PubMed收錄范圍（1）,（一）MEDLINE 全世界70多個國家和地區(qū)的4800余種生物醫(yī)學(xué)期刊 自1966年至今數(shù)據(jù)1400萬余條 內(nèi)容每周更新一次，內(nèi)容涉及醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、牙科學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、 衛(wèi)生保健和前臨床

5、科學(xué)等。 標(biāo)識PubMed - indexed for MEDLINE (二) OLDMEDLINE 1950 年到1965年全世界生物醫(yī)學(xué)期刊 目前數(shù)據(jù)大約200多萬條 標(biāo)識PubMed - OLDMEDLINE for Pre1966 （三）In Process Citations 1996年8月開始增加該數(shù)據(jù)庫，只提供基本的引文信息和文摘， 每天更新，經(jīng)過標(biāo)引以后進(jìn)入MEDLINE，并從PreMEDLINE 中刪除這些記錄。 標(biāo)識MEDLINE in process,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,30,二、PubMed收錄范圍（2）,（四）Publisher Supplied Citati

6、on 接受出版商提供的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)，這種數(shù)據(jù)帶有MEDLINE record in process的說明，其標(biāo)識為Record as supplied by publisher。 每天都在不停地向In Process Citations數(shù)據(jù)庫中傳送，但其 中有些條目由于超出了MEDLARS數(shù)據(jù)庫的收錄范圍，將 永 遠(yuǎn)不會被In Process Citations或MEDLINE條目所取代 (例如 在綜合性的科學(xué)雜志Science或Nature上發(fā)表的地理學(xué) 文章)，其標(biāo)識符有PubMed - as supplied by publisher 或 PubMed 。 先于印刷版的文獻(xiàn) ，其標(biāo)識為Epu

7、b ahead of print,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,31,目前每年增加60余萬條文獻(xiàn)記錄,每周更新; 英文資料占90，3/4有摘要; 在全部記錄中有76%的文獻(xiàn)為英文； 在2000年以來的記錄中90%的文獻(xiàn)為英文； 收錄中文刊60余種,概況,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,32,與MEDLINE的區(qū)別,收錄范圍廣：收錄MEDLINE未收錄的部分生命科學(xué)相關(guān)的非醫(yī)學(xué)專業(yè)期刊（物理、天文、化學(xué)等） 收錄記錄新：在MEDLINE數(shù)據(jù)標(biāo)引前的最新題錄 文獻(xiàn)類型全：提供電子原文鏈接 免費開放,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,33,一個或多個檢索詞，如自由詞、主題詞、人名等，系統(tǒng)默認(rèn)空格為AND檢索 布

8、爾邏輯運算符（AND，OR或NOT），但布爾邏輯運算符必須大寫。 字段標(biāo)識符緊跟所要限制的檢索詞，其他檢索條件放在 后面 字段限制檢索:在字段標(biāo)識外加 如 anginati 若刊名與MeSH詞表中的詞相同，則需要用刊名字段標(biāo)識ta加以限定。如：gene therapy，應(yīng)輸入 gene therapyta 單個詞的刊名也要用ta加以限定。如：scanningta 作者名太簡單，如jama，輸入時用AU限定,基本檢索規(guī)則,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,34,（二）截詞檢索功能 允許使用“*”號作為通配符進(jìn)行截詞檢索。如：鍵入“bacter *”，系統(tǒng)會找到那些前一部分是bacter的單詞（如bac

9、teria，bacterium，bacteriophage等），并對其分別進(jìn)行檢索。 如果這類詞少于150個，PubMed會逐詞檢索，若超過150個，PubMed將顯示如下警告信息：“Wildcard search forterm*used only the first 150 variations.Lengthen the root word to search for all endings”。 截詞功能只限于單詞，對詞組無效。如：“infection*”包括“infections”，但不包括“infection control”等。 使用截詞功能時，PubMed系統(tǒng)會自動關(guān)閉詞匯轉(zhuǎn)換功能

10、。如：heart attack 將不映射到 MeSH 詞 Myocardial Infarction （三）強制檢索功能 允許使用雙引號（“”）來強制系統(tǒng)進(jìn)行短語檢索。例如“Single cell”，系統(tǒng)會將其作為一個不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫的全部字段中進(jìn)行檢索。 使用雙引號檢索，會自動關(guān)閉詞匯轉(zhuǎn)換功能。,基本檢索規(guī)則,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,35,字段標(biāo)識符一覽表,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,36,/sites/entrez/,Nucleotide(DNA序列)數(shù)據(jù)庫,Protein氨基酸（蛋白質(zhì)）序列數(shù)據(jù)庫,Genome(基因組序列)數(shù)

11、據(jù)庫，提供所有基因與染色體紀(jì)錄與圖片的查詢服務(wù)，這個庫中數(shù)以百萬的基因序列是由龐大的基因排序工作得來的,Structure（分子結(jié)構(gòu)模型）數(shù)據(jù)庫，這個數(shù)據(jù)庫保存的是由X線晶體成像、NMR分光光度法建立的三維分子結(jié)構(gòu)。,OMIM(人類孟德爾遺傳學(xué))在線數(shù)據(jù)庫,Books(相關(guān)圖書)可鏈接到相關(guān)參考書籍的文摘頁,Journals(期刊)數(shù)據(jù)庫,選擇數(shù)據(jù)庫,輸入檢索詞,點擊開始檢索,PMC（PubMed Central）,特征欄,主頁,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,37,可免費提供全文的生命科學(xué)文獻(xiàn),對公眾提供臨床科研的當(dāng)前信息,毒理學(xué)數(shù)據(jù)庫,連接到NLM提 供的其他服務(wù),購買原文 （大約$5/篇）,

12、為注冊用戶（免費注冊）提供的檢索策略存儲空間，可以生成檢索歷史信息，并可以及時更新,為臨床醫(yī)生準(zhǔn)備，關(guān)注于四個領(lǐng)域：療法，診斷，病因，和預(yù)后,Citation Matcher-是一個填空式的表格，允許用戶通過輸入刊物的引文信息來定位特定文章，特定一期內(nèi)容，或者整個刊物的內(nèi)容。,通過標(biāo)題，關(guān)鍵詞，標(biāo)題縮寫，或者ISSN號，在PubMed和其他Entrez數(shù)據(jù)庫中檢索期刊標(biāo)題，還可以察看提供全文的刊物的列表。,可以在分層結(jié)構(gòu)中瀏覽MeSH的詞匯表,PubMed數(shù)據(jù)庫的覆蓋范圍和刊物信息,關(guān)于PubMed系統(tǒng)更新和未來發(fā)展,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,38,作者AU,題名TI,來源SO,PubMed

13、中文獻(xiàn)的類型（狀態(tài)）,收錄情況,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,39,鏈接圖標(biāo),天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,40,簡單檢索,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,41,Limits限定檢索,作者（Author）：系統(tǒng)有提示 期刊（Journal） 全文（Full Text 或 Free Full Text ） 日期（Dates） 人類或動物研究（Humans or Animals ） 文獻(xiàn)類型（Type of Article ） 性別（Gender ）、語種（Languages ）、年齡（Ages ）、文獻(xiàn)子集限定（Subsets ） 自由詞可以結(jié)合以上各種限定進(jìn)行。,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,42,天津

14、中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,43,限定檢索窗口全貌,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,44,添加作者檢索,添加期刊檢索,限定記錄有全文、免費全文或摘要,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,45,限定記錄有全文、免費全文或摘要,文獻(xiàn)發(fā)表時間限定,記錄添加到PubMed時間限定,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,46,人類與動物限定,性別限定,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,47,文獻(xiàn)語種限定,文獻(xiàn)子集限定,文獻(xiàn)類型限定,研究對象年齡組限定,檢索字段限定,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,48,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,49,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,50,？,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,51,主題詞,那么為什么要使用醫(yī)學(xué)主題

15、詞呢？ 我們先來看個比喻，如果有人問你感冒了嗎？你會不會回答“沒有啦，我只是有點著涼發(fā)燒而已”呢？當(dāng)然不會，因為你知道感冒就是著涼發(fā)燒。但一個檢索系統(tǒng)，如果你不告訴它的話，它就有可能不知道這一點。在期刊中，對于同一個概念往往可能有不同的描述形式，如Tumor和cancer都是指腫瘤。當(dāng)一個查詢者希望查閱腫瘤和diet(飲食)相關(guān)的文獻(xiàn)時，他可能會輸入Tumor，也可能輸入cancer作為關(guān)鍵字，但其實這兩者之間是沒有區(qū)別的。一個愚蠢的檢索系統(tǒng)可能就認(rèn)識不到這點，而像PubMed這樣的“智能化”檢索系統(tǒng)就能夠準(zhǔn)確的意識到這點，從而不會造成檢索結(jié)果的遺漏。,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,52,主題詞

16、,何為MeSH？ MeSH其實是Medical Subject Headings的縮略詞，即醫(yī)學(xué)主題詞，是用規(guī)范化的醫(yī)學(xué)術(shù)語來描述生物醫(yī)學(xué)概念。NIH的工作人員按MeSH詞表規(guī)定，瀏覽生物醫(yī)學(xué)期刊全文后標(biāo)引出每篇文獻(xiàn)中的MeSH主題詞，其中論述文獻(xiàn)中心的主題詞稱主要主題詞（major topic headings），論述主題某一方面的內(nèi)容的詞稱為副主題詞。 主題詞檢索法雖然稍嫌繁瑣，但其檢索結(jié)果的準(zhǔn)確性高，遺漏率低，是最佳的檢索方法，一旦熟練掌握，將使得我們的檢索工作事半功倍。,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,53,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,54,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,55,天津中醫(yī)藥大學(xué)

17、循證醫(yī)學(xué)中心,56,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,57,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,58,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,59,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,60,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,61,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,62,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,63,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,64,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,65,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,66,Details：顯示計算機響應(yīng)的本次檢索式。,點擊“URL”,Details功能介紹,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,67,/sites/entrez?Db=pubmed&Cmd=Detail

18、sSearch&Term=(%22salvia+miltiorrhiza%22%5BTIAB%5D+NOT+Medline%5BSB%5D)+OR+%22salvia+miltiorrhiza%22%5BMeSH+Terms%5D+OR+danshen%5BText+Word%5D,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,68,保存該檢索式至收藏夾,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,69,檢索策略的制訂,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,70,檢索策略制訂的目的 保證檢索的規(guī)范、可靠、可重復(fù) 檢索策略制訂的原則 以問題為基礎(chǔ)，以目的為導(dǎo)向； 中西有別，病證有異； 檢索策略制訂的內(nèi)容 關(guān)鍵詞/主題詞的初定； 數(shù)據(jù)庫/出

19、版商的選擇（如MEDLINE-OVID）； 檢索時限（包括年份范圍和執(zhí)檢時間） 檢索式的表述和保存,檢索策略的制訂,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,71,檢索策略制訂的步驟,擬定檢索詞,將問題分解為若干要素,選擇覆蓋問題的數(shù)據(jù)庫,確定擬弄清的問題,制訂檢索式,修訂檢索策略,病因/診斷/治療/預(yù)后,MeSH/Text Word,EBM/文摘/全文,AND/OR/NOT,保存檢索策略和檢索結(jié)果,P: 問題/對象 I: 干預(yù)措施 C: 對照措施 O: 結(jié)局/結(jié)果 T: 研究類型,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,72,Boolean Operator 布爾邏輯算符,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,73,檢索的方向

20、性,臨床循證實踐,證據(jù)生產(chǎn)過程,衛(wèi)生保健研究證據(jù)的結(jié)構(gòu)“5S”模型,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,74,循證醫(yī)學(xué)信息檢索實例,查證用證,系統(tǒng)評價,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,75,臨床證據(jù)的獲取FOR EBCP,全世界每年有200多萬篇有關(guān)生物醫(yī)學(xué)的文章發(fā)表在2萬多種醫(yī)學(xué)刊物上，一個內(nèi)科臨床醫(yī)師需要每天閱讀19篇本專業(yè)的文獻(xiàn)才能基本掌握本學(xué)科的進(jìn)展1,1.Davidoff F. Evidence-based medicine:a new journal to help doctors identify the information they need. BMJ 1995,醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)量浩若煙海，

21、但其質(zhì)量良莠不齊 有限的時間和無限的醫(yī)學(xué)知識,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,76,臨床證據(jù)的獲取FOR EBCP,有沒有一種既實用，又靠譜，還不傷腦筋的證據(jù)呢？,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,77,臨床證據(jù)的獲取FOR EBCP,鑒于此，循證醫(yī)學(xué)的倡導(dǎo)者開始聯(lián)合出版公司研發(fā)“循證的專家意見”，推出值得信賴又便于臨床醫(yī)生使用的新型循證醫(yī)學(xué)資源，這類資源具有以下共同特點： 1根據(jù)PICO原則清楚表述臨床問題； 2納入標(biāo)準(zhǔn)明確，文獻(xiàn)檢索全面； 3嚴(yán)格評價臨床研究的質(zhì)量和可靠性； 4針對臨床問題，分級給出推薦處理意見； 5. 電子版形式（網(wǎng)絡(luò)、光盤、PDA）推出， 檢索方便，層次分明，即時更新。,天津中醫(yī)

22、藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,78,綜述（系統(tǒng)評價）,計算機輔助決策系統(tǒng),摘要,原始臨床研究,總結(jié)（手冊/指南）,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,79,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,80,對發(fā)展中國家免費,Turning Research Into Practice,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,81,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,82,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,83,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,84,InfoPOEMs,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,85,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,86,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,87,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,88,SR,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,89,循證信息檢索 Systematic review,系統(tǒng)評價（Systematic review）是一種按照嚴(yán)格的納入標(biāo)準(zhǔn)廣泛收集關(guān)于某一醫(yī)療衛(wèi)生問題的所有研究，對納入研究進(jìn)行全面的質(zhì)量評價，并進(jìn)行定性分析和/或定量合并，以對該問題進(jìn)行系統(tǒng)總結(jié)的研究方法 檢索要求：此前所有,天津中醫(yī)藥大學(xué)循證醫(yī)學(xué)中心,90,檢索方式 電子數(shù)據(jù)庫檢