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1、. 實(shí)驗(yàn)三 等電聚焦電泳法測(cè)定蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?了解等電聚焦的原理。通過(guò)蛋白質(zhì)等電點(diǎn)的測(cè)定,掌握聚丙烯酰胺凝膠垂直管式等電聚焦電泳技術(shù)。二、實(shí)驗(yàn)原理 等電聚焦(isoelectric focusing,簡(jiǎn)稱ief)是六十年代中期出現(xiàn)的新技術(shù)。近年來(lái)等電聚焦技術(shù)有了新的進(jìn)展,已迅速發(fā)展成為一門成熟的近代生化實(shí)驗(yàn)技術(shù)。目前等電聚焦技術(shù)已可以分辨等電點(diǎn)(pi)只差0.001ph單位的生物分子。由于其分辨力高,重復(fù)性好,樣品容量大,操作簡(jiǎn)便迅速,在生物化學(xué)、分子生物學(xué)及臨床醫(yī)學(xué)研究中得到廣泛的應(yīng)用。 蛋白質(zhì)分子是典型的兩性電解質(zhì)分子。它在大于其等電點(diǎn)的ph環(huán)境中解離成帶負(fù)電荷的陰離子,向電場(chǎng)
2、的正極泳動(dòng),在小于其等電點(diǎn)的ph環(huán)境中解離成帶正由荷的陽(yáng)離子,向電場(chǎng)的負(fù)極泳動(dòng)。這種泳動(dòng)只有在等于其等電點(diǎn)的ph環(huán)境中,即蛋白質(zhì)所帶的凈電荷為零時(shí)才能停止。如果在一個(gè)有ph梯度的環(huán)境中,對(duì)各種不同等電點(diǎn)的蛋白質(zhì)混合樣品進(jìn)行電泳,則在電場(chǎng)作用下,不管這些蛋白質(zhì)分子的原始分布如何,各種蛋白質(zhì)分子將按照它們各自的等電點(diǎn)大小在ph梯度中相對(duì)應(yīng)的位置處進(jìn)行聚焦,經(jīng)過(guò)一定時(shí)間的電泳以后,不同等電點(diǎn)的蛋白質(zhì)分子便分別聚焦于不同的位置 。這種按等電點(diǎn)的大小,生物分子在ph梯度的某一相應(yīng)位置上進(jìn)行聚焦的行為就稱為“等電聚焦”。等電聚焦的特點(diǎn)就在于它利用了一種稱為兩性電解質(zhì)載體的物質(zhì)在電場(chǎng)中構(gòu)成連續(xù)的ph梯度,使
3、蛋白質(zhì)或其他具有兩性電解質(zhì)性質(zhì)的樣品進(jìn)行聚焦,從而達(dá)到分離、測(cè)定和鑒定的目的。 兩性電解質(zhì)載體,實(shí)際上是許多異構(gòu)和同系物的混合物,它們是一系列多羧基多氨基脂肪族化合物,分子量在3001000之間。常用的進(jìn)口兩性電解質(zhì)為瑞典pharmacia-lkb公司生產(chǎn)的ampholine 和pharmalyte,價(jià)格昂貴。國(guó)產(chǎn)的有中國(guó)軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院放射醫(yī)學(xué)研究所和上海生化所生產(chǎn)的兩性電解質(zhì),價(jià)格便宜,質(zhì)量尚佳。兩性電解質(zhì)在直流電場(chǎng)的作用下,能形成一個(gè)從正極到負(fù)極的ph值逐漸升高的平滑連續(xù)的ph梯度。若不同的ph值的兩性電解質(zhì)的含量與pi值的分布越均勻,則ph梯度的線性就越好。對(duì)ampholine兩性電解質(zhì)
4、的要求是緩沖能力強(qiáng),有良好的導(dǎo)電性,分子量要小,不干擾被分析的樣品等。 在聚焦過(guò)程中和聚焦結(jié)束取消了外加電場(chǎng)后,如保持ph梯度的穩(wěn)定是極為重要的。為了防止擴(kuò)散,穩(wěn)定ph梯度,就必須加入一種抗對(duì)流和擴(kuò)散的支持介質(zhì),最常用的這種支持介質(zhì)就是聚丙烯酰胺凝膠。當(dāng)進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠等電聚焦電泳時(shí),凝膠柱內(nèi)即產(chǎn)生ph梯度,當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)樣品電泳到凝膠柱內(nèi)某一部位,而此部位的ph值正好等于該蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)時(shí),該蛋白質(zhì)即聚焦形成一條區(qū)帶,只要測(cè)出此區(qū)帶所處部位的ph值,即為其等電點(diǎn)。電泳時(shí)間越長(zhǎng),蛋白質(zhì)聚焦的區(qū)帶就越集中,越狹窄,因而提高了分辨率。這是等電聚焦的一大優(yōu)點(diǎn),不像一般的其他電泳,電泳時(shí)間過(guò)長(zhǎng)則區(qū)帶擴(kuò)散。
5、所以等電聚焦電泳法不僅可以測(cè)定等電點(diǎn),而且能將不同等電點(diǎn)的混合的生物大分子進(jìn)行分離和鑒定。精品. 早期的等電聚焦電泳是垂直管式的,其特點(diǎn)是體系是封閉的,不與空氣接觸,可防止樣品氧化。近年來(lái),又發(fā)展了超薄層水平板式等電聚焦電泳。此法的優(yōu)點(diǎn)是加樣數(shù)量多,節(jié)省兩性電解質(zhì),電泳后固定、染色、干燥都十分迅速簡(jiǎn)便,其最大優(yōu)點(diǎn)是防止了電極液的電滲作用而引起正負(fù)兩極ph梯度的漂變。 測(cè)定ph梯度的方法有四種: 1. 將膠條切成小塊,用水浸泡后,用精密ph試紙或進(jìn)口的細(xì)長(zhǎng)ph復(fù)合電極測(cè)定ph值,然后作圖。 2. 用表面ph微電極直接測(cè)定膠條各部分的ph值,然后作圖。3. 用一套已知不同的pi值的蛋白質(zhì)作為標(biāo)準(zhǔn),
6、測(cè)定ph梯度的標(biāo)準(zhǔn)曲線。4. 將膠條于70冰凍后切成1mm的薄片,加入0.5ml 0.01m kcl,用微電極測(cè)其ph。三、儀器和用具 1. 電泳儀 2. 垂直管式園盤電泳槽一套 3. 注射器與針頭 4. 移液管:10ml、5ml、2ml、1ml、0.1ml 5. 小燒杯若干 6. 培養(yǎng)皿一套 7. 直尺 8. 小刀 9. 精密ph試紙和帶細(xì)長(zhǎng)復(fù)合ph電極的ph計(jì) 10. 塑料薄膜和橡皮筋四、試劑 1. 丙烯酰胺 2. 甲叉雙丙烯酰胺 3. 兩性電解質(zhì)ampholine(40%,ph3.59.5) 4. 過(guò)硫酸胺(催化劑) 5. temed(四甲基乙二胺)(加速劑) 6. 磷酸 7. naoh
7、 8. 三氯乙酸(tca)五、溶液配制 1. 丙烯酰胺貯液(30%丙烯酰胺,交聯(lián)度2.6%):,30g丙烯酰胺和0.8g甲叉雙丙烯酰胺溶于h2o,定容至100ml,濾去不溶物后存于棕色瓶,4可保存數(shù)月。(全班公用)(另一配方為29.1g 丙烯酰胺和0.9g 甲叉雙丙烯酰胺溶于h2o,定容至100ml,交聯(lián)度為3.0%)。 2. 兩性電解質(zhì)amphline(40%)的加入量為:50ml /ml 膠液。 3. 過(guò)硫酸胺:配成1mg/ml的濃度,當(dāng)天配制,配100ml全班公用。膠液中的加入量為精品.0.5mg/ml膠液。 4. temed:膠液中的加入量為1ml/ml膠液。 5. 蛋白質(zhì)樣品:選用兩
8、種等電點(diǎn)相差較大的蛋白質(zhì),每根垂直管中每種蛋白質(zhì)的加樣量控制在100mg。蛋白質(zhì)樣品配制成各為5mg/ml的濃度。配2.5ml全班公用。 6. 固定液:10%的三氯乙酸,每組配50ml。7. 陽(yáng)極電極液:0.1m h3po4 3.4ml 濃磷酸(85%)加h2o至500ml,每個(gè)電泳槽用500ml。 8. 陰極電極液:0.5m naoh 2g naoh 加h2o溶解至500ml,每個(gè)電泳槽用500ml。六、操作步驟 1. 配膠 膠濃度 5.0% 4.8% 5.0%膠液總體積 8ml 10ml 12ml丙烯酰胺貯液 1.33ml 1.60ml 2.0mlampholine 0.40ml 0.50
9、ml 0.60mltemed 0.008ml 0.010ml 0.012ml蛋白質(zhì)樣品 0.080ml 0.100ml 0.120mlh2o 2.26ml 2.79ml 3.27ml過(guò)硫酸銨(1mg/ml) 4.0ml 5.0ml 6.0ml 裝管數(shù) 4支 5支 6支 過(guò)硫酸銨是膠聚合的催化劑,因此最后加入,加畢,立即搖勻,因膠很快就會(huì)聚合,必須立即裝管。通?;瘜W(xué)聚合的膠液,需在過(guò)硫酸銨加入前進(jìn)行減壓抽氣處理,本實(shí)驗(yàn)將此抽氣步驟省略并不影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。 2. 裝管 每個(gè)學(xué)生裝兩支管,每組裝四支。先用肥皂洗手,然后將圓盤電泳槽的玻璃管洗凈,底端用塑料薄膜和橡皮筋封口,垂直放在試管架上,用移液管將配
10、好的膠液移入管內(nèi),(每根玻璃管的容量約為1.51.8ml),液面加至距管口1mm處,用注射器輕輕加入少許h2o,進(jìn)行水封,以消除彎月面使膠柱頂端平坦。膠管垂直聚合約30分鐘,聚合完成時(shí)可觀察到水封下的折光面。精品.3. 裝槽和電泳用濾紙條吸去膠管上端的水封,除去下端的薄膜,水封端向上,將膠管垂直插入圓盤電泳槽內(nèi),調(diào)節(jié)好各管的高度,記下管號(hào)。每支管約1/3在上槽,2/3在下槽。上槽加入500ml 0.1m h3po4,下槽加入500ml 0.1m naoh,淹沒(méi)各管口和電極,用注射器或滴管吸去管口的氣泡。上槽接正極,下槽接負(fù)極,開(kāi)啟電泳儀,恒壓160v,聚焦2至3小時(shí),至電流近于零不再降低時(shí),停
11、止電泳。4. 剝膠 取下膠管,用h2o 將膠管和兩端洗2次,用注射器沿管壁輕輕插入針頭,在轉(zhuǎn)動(dòng)膠管和內(nèi)插針頭的同時(shí)分別向膠管兩端注入h2o少許,膠條即自行滑出,若不滑出可用洗耳球輕輕擠出。膠條置于小培養(yǎng)皿內(nèi),記住正極端為“頭”,負(fù)極端為“尾”,若分不清時(shí),可用ph試紙鑒定,酸性端為正,堿性端為負(fù)。 5. 固定取2支膠條置于一個(gè)小培養(yǎng)皿內(nèi),倒入10%三氯乙酸溶液至沒(méi)過(guò)膠條,進(jìn)行固定,約半小時(shí)后,即可看到膠條內(nèi)蛋白質(zhì)的白色沉淀帶。固定完畢,倒出固定液,用直尺量出膠條長(zhǎng)度“l(fā)2”和正極端到蛋白質(zhì)白色沉淀帶中心(即聚焦部位)的長(zhǎng)度“l(fā)”。固定后的膠條可在康強(qiáng)860紫外/可見(jiàn)分光光度計(jì)上用280nm或238nm波長(zhǎng)作凝膠掃描,然后用掃描圖作相應(yīng)的測(cè)量和計(jì)算。6. 測(cè)定ph梯度 將放在另一個(gè)培養(yǎng)皿內(nèi)未固定的膠條,用直尺量出待測(cè)ph膠條的長(zhǎng)度“l(fā)1”。按照由正極至負(fù)極的順序,用鑷子和小刀依次將膠條切成10mm長(zhǎng)的小段,分別置于小試管中,加入1ml h2o,浸泡半小時(shí)以上或過(guò)夜,用仔細(xì)校正后的帶細(xì)長(zhǎng)ph復(fù)合電極的ph計(jì)測(cè)出每管浸出液的ph值。七、數(shù)據(jù)處理 1. 以膠條長(zhǎng)度(mm)為橫座標(biāo),ph值為縱座標(biāo)作圖,得到一條ph梯度曲線。所測(cè)每管的ph值為10mm膠條的ph的混合平均值。作圖時(shí)
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