SciFinder檢索介紹PPT課件

1、Chemical Abstract Service化學(xué)文摘社,我們專注于：,推動研究、發(fā)展與創(chuàng)新 為全球科技與創(chuàng)新領(lǐng)域提供領(lǐng)先的、整合的，全面的信息解決方案 To encourage the increase and diffusion of chemical knowledge for the benefit of industry and education,第1頁/共102頁,Chemical Abstract Service化學(xué)文摘社今天：,全球最大的學(xué)協(xié)會組織 本部擁有800多博士從事文獻編輯工作 為全球超過1200多個學(xué)校提供SFS桌面檢索平臺,第2頁/共102頁,通過此次培訓(xùn)，您

2、可以掌握,掌握SciFinder中文獻檢索方法與分析 掌握SciFinder中結(jié)構(gòu)檢索的方法與分析 掌握SciFinder中結(jié)構(gòu)的設(shè)計和定義 掌握SciFInder中的反應(yīng)檢索與分析 了解SciFinder最新的版本SciFinder Web,第3頁/共102頁,提綱,SciFinder介紹 SciFinder中的檢索方法 SciFinder中的文獻檢索與分析 SciFinder中的物質(zhì)檢索與分析 SciFinder中的反應(yīng)檢索與分析 SciFinder Web介紹,第4頁/共102頁,SciFinder介紹,由CAS自主開發(fā)研究的. 一站式的信息檢索平臺，可以檢索全球最大的，有關(guān)生物化學(xué)，化

3、學(xué)，化學(xué)工程，醫(yī)藥等化學(xué)相關(guān)學(xué)科的信息 從中可以檢索來自專利，期刊的文獻 . 最大的二次文獻數(shù)據(jù)庫. 全球最大的物質(zhì)數(shù)據(jù)庫。 ,第5頁/共102頁,期刊,專利,論文,會議報告,溶劑，催化劑，產(chǎn)率等,物質(zhì),基因,合成信息,SciFinder介紹,第6頁/共102頁,SciFinder介紹,第7頁/共102頁,提綱,SciFinder介紹 SciFinder中的檢索方法 SciFinder中的文獻檢索與分析 SciFinder中的物質(zhì)檢索與分析 SciFinder中的反應(yīng)檢索與分析 SciFinder Web介紹,第8頁/共102頁,SciFinder中的檢索方法,主題,機構(gòu)名,專利號,作者名,結(jié)

4、構(gòu)，亞結(jié)構(gòu),俗名,分子式,官能團,相似結(jié)構(gòu),第9頁/共102頁,SciFinder中的檢索方法,所以， 在SciFinder 中， 只要得到一點信息，就可以獲得最為全面的 文獻 物質(zhì) 反應(yīng),第10頁/共102頁,提綱,SciFinder介紹 SciFinder中的檢索方法 SciFinder中的文獻檢索與分析 SciFinder中的物質(zhì)檢索與分析 SciFinder中的反應(yīng)檢索與分析 SciFinder Web介紹,第11頁/共102頁,第12頁/共102頁,主題檢索舉例,第13頁/共102頁,提出問題 獲得有關(guān)血清白蛋白制備的納米顆粒的參考文獻,存在問題： 主要用于哪些方面的研究 國際上哪些

5、機構(gòu)的研究處于領(lǐng)先水平 獲得和顆粒大小和形狀有關(guān)的參考文獻,第14頁/共102頁,我們用Nanoparticle with serum albumin來做初次的檢索,“Closely associated with one another”表示在同一個句子當(dāng)中出現(xiàn),第15頁/共102頁,獲取文摘,獲取全文,分析/限定,我們注意到所列文獻中出現(xiàn)了 Nanoparticles 這樣的詞 那是SciFinder能夠自動識別同義詞，近義詞，縮寫，并有截詞，斷詞等功能,第16頁/共102頁,系統(tǒng)分類工具,第17頁/共102頁,一共11種分析手段,分析工具提供11種分析方法，包括索引詞，作者名，機構(gòu)名，文

6、獻類型，期刊名稱，出版年限等。 在這些分析工具中， 索引詞（Index Term）：可以幫助我們對文獻的內(nèi)容進行大致的了解 學(xué)科分析（CA Section Title）：可以幫助我們對文獻進行學(xué)科分類,第18頁/共102頁,一共7種限定手段,限定工具提供7種限定方法，包括主題詞，作者名，機構(gòu)名，文獻類型等。 在這些限定工具中， 主題詞（Research Topics）：可以讓我們用我們關(guān)心的主題詞再次限定文獻 文獻類型（Document Type）：可以讓我們直接獲得我們感興趣的文獻類型,第19頁/共102頁,分析工具-組織機構(gòu)名分析,第20頁/共102頁,分析工具-出版年限分析,第21頁/共

7、102頁,分析工具-期刊名分析,第22頁/共102頁,一級目錄,二級目錄,點擊感興趣的二級分類，在這里可以出現(xiàn)一些索引詞條,系統(tǒng)分類工具Categorize,第23頁/共102頁,查看更加細(xì)節(jié)的內(nèi)容,第24頁/共102頁,第25頁/共102頁,文獻檢索小結(jié),SciFinder 文獻檢索小結(jié),向SciFinder 提一個最為廣泛的問題 可以通過SciFinder 的Analyze/Refine功能來不斷的修正我們 的檢索思路 可以通過SciFinder 的Analyze/Refine功能來縮小檢索的范圍 可以通過SciFinder 的Analyze/Refine功能來獲取新的知識點和靈感 嘗試將

8、不同的Analyze/Refine功能組合起來用，會有更多的收益 使用Categorize可以讓系統(tǒng)來實現(xiàn)自動分類 通過Get Related來獲得更多的信息，可以實現(xiàn)從文獻到物質(zhì)，反應(yīng)，引文的鏈接,第26頁/共102頁,提綱,SciFinder介紹 SciFinder中的檢索方法 SciFinder中的文獻檢索與分析 SciFinder中的物質(zhì)檢索與分析 SciFinder中的反應(yīng)檢索與分析 SciFinder Web介紹,第27頁/共102頁,當(dāng)我們知道一個物質(zhì)的名稱，CAS注冊號，或者商品名，俗名等時。,第28頁/共102頁,第29頁/共102頁,第30頁/共102頁,如果我們知道的是物

9、質(zhì)的結(jié)構(gòu)或者分子式，可以,第31頁/共102頁,結(jié)構(gòu)檢索舉例,第32頁/共102頁,結(jié)構(gòu)工具,第33頁/共102頁,結(jié)構(gòu)相關(guān)工具,鉛筆,元素周期表,可變基團,重復(fù)基團工具,結(jié)構(gòu)模版,橡皮,正電子,選擇工具,原子鎖定工具,碳鏈工具,常用基團,R基團定義工具,可變位置連接工具,多元環(huán)工具,旋轉(zhuǎn)工具,負(fù)電子,環(huán)鎖定工具,索套選擇工具,第34頁/共102頁,精確結(jié)構(gòu)檢索,第35頁/共102頁,得到物質(zhì)的鹽，或者其他的混合物,第36頁/共102頁,但是有的時候我們需要獲得一些通式結(jié)構(gòu)信息,我想找到包含以下通式結(jié)構(gòu)的物質(zhì),R1,R2,R3=任意基團,第37頁/共102頁,亞結(jié)構(gòu)檢索,第38頁/共102頁,

10、得到物質(zhì)的修飾信息,33246種修飾信息,第39頁/共102頁,實際上 我們有的時候，更多關(guān)注的是結(jié)構(gòu)上面的信息,修飾信息？ 修飾上某一特定原子后該原子的修飾信息？ ,第40頁/共102頁,第41頁/共102頁,修正結(jié)構(gòu),第42頁/共102頁,對所得結(jié)果再次使用真實原子附屬性分析,第43頁/共102頁,有的時候， 我們對我們關(guān)心的結(jié)構(gòu)只有一定的了解，不確定的信息太多 我們來看我們所要找的結(jié)構(gòu)：,結(jié)構(gòu)中含有苯環(huán)，苯環(huán)上含有一個雜環(huán) 雜環(huán)為5元環(huán)，6元環(huán)或7元環(huán)，且雜原子不能直接接在苯環(huán)上 雜環(huán)上原子必須是O或者S 苯環(huán)上與雜環(huán)相鄰的位置接個Br 苯環(huán)上某2個處于間位的C必須有1個C接鹵素，但是接

11、什么鹵素不確定 該2個位置之間的C必須接一個基團，該基團可以是H，OH，X,第44頁/共102頁,得到具備一定條件的結(jié)構(gòu)信息,問題： 存在多少種環(huán)結(jié)構(gòu) X= F，Cl， Br，I 分別有多少種物質(zhì) R2=H，OH，X分別有多少物質(zhì),R1= O,S R2= H,OH,X,第45頁/共102頁,第46頁/共102頁,環(huán)骨架分析,第47頁/共102頁,可變基團分析,第48頁/共102頁,R基團分析,第49頁/共102頁,相似結(jié)構(gòu)檢索,第50頁/共102頁,得到相似結(jié)構(gòu)信息,第51頁/共102頁,SciFinder 的3種結(jié)構(gòu)檢索包容關(guān)系,精確結(jié)構(gòu)檢索：得到的是物質(zhì)的鹽，本身，聚合物，混合物 亞結(jié)構(gòu)檢

12、索：畫出來的結(jié)構(gòu)必須存在 相似結(jié)構(gòu)檢索：給出相似度在60分以上的物質(zhì),第52頁/共102頁,精確結(jié)構(gòu)檢索： 獲得物質(zhì)的鹽，聚合物，混合物，配合物等，母體結(jié)構(gòu)不能修改，不能修飾 亞結(jié)構(gòu)檢索： 所畫的結(jié)構(gòu)必須存在，母體結(jié)構(gòu)不能修改，但可以被修飾 相似結(jié)構(gòu)檢索： 獲得相似度在60分以上的結(jié)構(gòu)，母體結(jié)構(gòu)可以修改，也可以被修飾，用相似度來控制獲得的結(jié)果,物質(zhì)檢索小結(jié),第53頁/共102頁,分子式檢索舉例,第54頁/共102頁,分子式輸入規(guī)則 CH寫在前面，其他按照字母順序 對于多組分物質(zhì)，用“.” 將不同的組分分開 聚合物括號表示，括號外用x表示起始物，用n表示終產(chǎn)物 區(qū)分大小寫,第55頁/共102頁,

13、提綱,SciFinder介紹 SciFinder中的檢索方法 SciFinder中的文獻檢索與分析 SciFinder中的物質(zhì)檢索與分析 SciFinder中的反應(yīng)檢索與分析 SciFinder Web介紹,第56頁/共102頁,SciFinder 中的反應(yīng)檢索和分析,反應(yīng)查詢工具,第57頁/共102頁,SciFinder 中的反應(yīng)檢索和分析,反應(yīng)位置標(biāo)記工具,反應(yīng)箭頭,反應(yīng)官能團列表,反應(yīng)原子標(biāo)記工具,反應(yīng)角色工具,第58頁/共102頁,獲得特定物質(zhì)的合成方法,第59頁/共102頁,第60頁/共102頁,第61頁/共102頁,一共10種分析手段,分析工具提供反應(yīng)中的催化劑（Catalyst）

14、，溶劑（Solvent），反應(yīng)步數(shù)（Number of steps) ，產(chǎn)率( Product Yield) 等的分析,第62頁/共102頁,一共4種限定手段,限定工具，可以根據(jù)進一步的條件去限定反應(yīng)中出現(xiàn)的物質(zhì)（Reaction Structure),以及反應(yīng)類型（Reaction Classification）等,第63頁/共102頁,第64頁/共102頁,第65頁/共102頁,溶劑分析,第66頁/共102頁,或者，有的時候我們想獲得,某些官能團之間變化的反應(yīng) 某些特定物質(zhì)類似物的合成路線 結(jié)構(gòu)中包含某些特殊結(jié)構(gòu)要求的反應(yīng),拓展思路的反應(yīng)檢索,第67頁/共102頁,官能團之間的反應(yīng),第68

15、頁/共102頁,假如我們只想得到一步反應(yīng),第69頁/共102頁,假如我們規(guī)定反應(yīng)物必須是乙酰氯,第70頁/共102頁,那么如何獲得不是從乙酰氯出發(fā)的反應(yīng)呢？ 讓我們先返回初次檢索到的683條反應(yīng)。,第71頁/共102頁,再按照上面的檢索獲得從乙酰氯出發(fā)的反應(yīng)，一共16條,第72頁/共102頁,運用Combine功能將不需要的答案集排除,第73頁/共102頁,第74頁/共102頁,第75頁/共102頁,檢索思路回顧,獲得1步從酰鹵到醛的反應(yīng),限定反應(yīng)物獲得反應(yīng)物是乙酰氯的反應(yīng),運用Combine功能將乙酰氯是產(chǎn)物的反應(yīng)去除,第76頁/共102頁,COMBINE-組合答案集功能,可以對于任意兩個同

16、類型的集合進行AND,OR,NOT的操作,第77頁/共102頁,*.SFR格式保存-書簽格式保存功能,將結(jié)果保存成書簽，可以使用SFS再次打開，繼續(xù)進行檢索，也可以對同類的書簽進行COMBINE操作,第78頁/共102頁,獲得某些物質(zhì)的類似合成路線,想獲得1步合成該物質(zhì)的反應(yīng),第79頁/共102頁,亞結(jié)構(gòu)反應(yīng)檢索,必須的條件： 羥基接的C必須是CH2 整個C鏈不允許是某個環(huán)結(jié)構(gòu)的部分結(jié)構(gòu) 其余的3個C原子鏈接什么基團對反應(yīng)沒 有影響,據(jù)此，我們修改我們的檢索方式,第80頁/共102頁,亞結(jié)構(gòu)反應(yīng)檢索,用環(huán)鎖定功能，鎖定C鏈，保證其不成為環(huán)結(jié)構(gòu)的一部分,用原子鎖定功能，鎖定C原子，保證C 原子上

17、兩個H不被取代,第81頁/共102頁,第82頁/共102頁,對反應(yīng)位置和原子有特定要求的反應(yīng),O原子反應(yīng)前后必須配對 C=O鍵必須發(fā)生反應(yīng) 除已有的環(huán)外，不能成環(huán),第83頁/共102頁,用mapping tool鍵標(biāo)示O原子反應(yīng)前后位置,用site marking tool鍵標(biāo)示C=O鍵反應(yīng)的位置。,用Lock out ring tool鍵鎖定環(huán),對反應(yīng)作出條件限定,第84頁/共102頁,第85頁/共102頁,SciFinder 反應(yīng)檢索小結(jié),多用Analyze/Refine，來獲得催化劑，溶劑，產(chǎn)率等信息 如果反應(yīng)只涉及基團之間的變化，用官能團反應(yīng)可以獲得更多的參考 信息 當(dāng)無法找到具體反應(yīng)

18、，或者檢索結(jié)果并不滿意，嘗試用亞結(jié)構(gòu)反應(yīng)查 詢，可以獲得更多的參考信息,第86頁/共102頁,提綱,SciFinder介紹 SciFinder中的檢索方法 SciFinder中的文獻檢索與分析 SciFinder中的物質(zhì)檢索與分析 SciFinder中的反應(yīng)檢索與分析 SciFinder Web介紹,第87頁/共102頁,SciFinder Web介紹,SciFinder Web是通過Web來訪問SciFinder數(shù)據(jù)庫的方式 友好的用戶界面 更加詳盡的文獻信息和詳盡的物質(zhì)信息 即時跟蹤特定研究領(lǐng)域的全球最新動態(tài) 永久的信息分享鏈接 ,第88頁/共102頁,SciFinder Web是通過We

19、b來訪問SciFinder數(shù)據(jù)庫的方式,第89頁/共102頁,友好的用戶界面,第90頁/共102頁,更加詳盡的文獻信息和詳盡的物質(zhì)信息,對于苯這個物質(zhì)，在哪些文獻類型中有過報道,對于苯這個物質(zhì)，在專利和非專利文獻中的情況,第91頁/共102頁,即時跟蹤特定研究領(lǐng)域的全球最新動態(tài),第92頁/共102頁,永久的信息分享鏈接,第93頁/共102頁,請合理使用SciFinder !,千萬不要過量下載! 只下載自己要看 的記錄（縮小范圍） 不要用“迅雷”，“快車”之類的工具下載記錄 不使用請關(guān)閉客戶端程序,一旦發(fā)生過量下載，CAS將視情節(jié)嚴(yán)重采取不同的限制措施 全IP范圍內(nèi)取消全部下載功能，包括*.SF

20、R 格式的下載 全IP范圍內(nèi)取消部分檢索功能 情況嚴(yán)重的，將暫定SciFinder的使用,第94頁/共102頁,那么，當(dāng)我們遇到大量記錄時，該怎么做？,這些記錄真的是我們想要的嗎？ 如果真的都想要，我們需要花多少時間把這些記錄全部看完？ 所以希望大家能夠： 多使用Analyze/Refine工具去分析限定文獻 遇到較多記錄時，使用*.SFR格式保存,第95頁/共102頁,SciFinder Scholar的程序安裝,SciFinder Scholar 客戶端程序： SciFinder Scholar2007.exe 安裝過程中，提示： Do you have a disk labeled Custom Site Files? （選擇 No） site.prf （site）文件 只需將 site.prf 文件復(fù)制粘貼到 X:ScholarCHLR目錄下 還可安裝 ViewerLite用于查看3D結(jié)構(gòu),第96頁/共102頁,運行SciFinder Scholar,第97頁/共102頁,可能1：（并發(fā)用戶數(shù)限制）,解決方法：請耐心等候 ！,第98頁/共102頁,可能2：（網(wǎng)絡(luò)故障）,解決方法：檢查網(wǎng)絡(luò),