第章外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫MEDLINEPubMed

1、醫(yī)學(xué)信息檢索醫(yī)學(xué)信息檢索medical information retrieval課程負(fù)責(zé)人：黃曉鸝課程負(fù)責(zé)人：黃曉鸝第四章第四章 外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫 主講教師：談偉文主講教師：談偉文第一節(jié)第一節(jié) medline數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫第三節(jié)第三節(jié) ovid平臺(tái)及系列數(shù)據(jù)庫平臺(tái)及系列數(shù)據(jù)庫第四節(jié)第四節(jié) ebscohost全文數(shù)據(jù)庫全文數(shù)據(jù)庫第五節(jié)第五節(jié) sciencedirect全文數(shù)據(jù)庫全文數(shù)據(jù)庫第四章第四章 外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫書目數(shù)據(jù)庫書目數(shù)據(jù)庫全文數(shù)據(jù)庫全文數(shù)據(jù)庫medlineinternational pharmaceuti

2、cal abstractsovidpubmedovidebscoovidebscojournalsovidebmrdrug information full textlwwbmaoup第四章第四章 外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫外文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫acp journal clubcochrane database of systemic review(cdsr)database of abstracts of reviews effectiveness (dare)the cochrane central register of controlled trials（cctr）cochrane methodo

3、logy registerhealth technology assessmentnhs economic evaluation database medline with full textmedlineinternational pharmaceutical abstractsovidjournalsovidebmrdrug information full textmedlineinternational pharmaceutical abstractsovidovidebscosciencedirectmedlineinternational pharmaceutical abstra

4、ctsovid第一節(jié)第一節(jié) medline數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫一、一、medline概況概況二、數(shù)據(jù)的時(shí)間范圍和學(xué)科范圍二、數(shù)據(jù)的時(shí)間范圍和學(xué)科范圍三、檢索平臺(tái)三、檢索平臺(tái)第一節(jié)第一節(jié) medline數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫 一、一、 medline概況概況 medline 是是nlm建立的一個(gè)書目型數(shù)建立的一個(gè)書目型數(shù)據(jù)庫，是世界上著名的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫，據(jù)庫，是世界上著名的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫，是查找生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的重要來源。是查找生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的重要來源。第一節(jié)第一節(jié) medline數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫美國國立醫(yī)學(xué)圖書館美國國立醫(yī)學(xué)圖書館nlmmedlinemedical literature analysis and

5、 retrieval system醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)分析及檢索系統(tǒng)醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)分析及檢索系統(tǒng)medlars （1964年）年）medlars-on-linemedline （1971年）年）第一節(jié)第一節(jié) medline數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫 收錄收錄1946年至今年至今80多個(gè)國家地區(qū)的近多個(gè)國家地區(qū)的近5600種期刊上的文章及參考文獻(xiàn)種期刊上的文章及參考文獻(xiàn)1900多萬多萬篇篇，涉及涉及39個(gè)語種。個(gè)語種。 目前收錄的文獻(xiàn)以英文文獻(xiàn)為主，多目前收錄的文獻(xiàn)以英文文獻(xiàn)為主，多數(shù)文獻(xiàn)有英文摘要。數(shù)文獻(xiàn)有英文摘要。第一節(jié)第一節(jié) medline數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、數(shù)據(jù)的時(shí)間范圍和學(xué)科范圍二、數(shù)據(jù)的時(shí)間范圍和學(xué)科范圍 1946 生

6、物醫(yī)學(xué)和衛(wèi)生保健生物醫(yī)學(xué)和衛(wèi)生保健 生命科學(xué)、行為科學(xué)、化學(xué)、生物工程、生命科學(xué)、行為科學(xué)、化學(xué)、生物工程、基礎(chǔ)研究、臨床護(hù)理、公共衛(wèi)生、衛(wèi)生政策等基礎(chǔ)研究、臨床護(hù)理、公共衛(wèi)生、衛(wèi)生政策等 medline數(shù)據(jù)庫包括數(shù)據(jù)庫包括: 美國醫(yī)學(xué)索引美國醫(yī)學(xué)索引 (index medicus, im)牙科文獻(xiàn)索引牙科文獻(xiàn)索引 (index to dental literature)國際護(hù)理索引國際護(hù)理索引 (international nursing index)內(nèi)容構(gòu)成內(nèi)容構(gòu)成第一節(jié)第一節(jié) medline數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫三、三、檢索平臺(tái)檢索平臺(tái) 光盤版光盤版 如如sliverplatter（銀盤版）、銀盤

7、版）、 cambridge、dialog 等等 網(wǎng)絡(luò)版網(wǎng)絡(luò)版 如如pubmed、ovid、ebsco、 wok、csa 等等第一節(jié)第一節(jié) medline數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫各版本數(shù)據(jù)相同，但處理方式、檢索規(guī)則有差異，如各版本數(shù)據(jù)相同，但處理方式、檢索規(guī)則有差異，如ovid-medline （1948-1948-，1996-1996-，1946-19651946-1965，加工中的數(shù)據(jù)），加工中的數(shù)據(jù)） pubmed （1946-1946-，包括加工中的數(shù)據(jù)），包括加工中的數(shù)據(jù)）pubmed檢索首頁檢索首頁 ovid- -medline文檔劃分示例文檔劃分示例第一節(jié)第一節(jié) medline數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫默認(rèn)

8、檢索規(guī)則不同默認(rèn)檢索規(guī)則不同ovid版：title, original title, abstract, name of substance word, subject heading word, keyword heading word, protocol supplementary concept, rare disease supplementary concept, unique identifierpubmed：6個(gè)自動(dòng)轉(zhuǎn)換表及全部字段個(gè)自動(dòng)轉(zhuǎn)換表及全部字段第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫一、數(shù)據(jù)庫概況一、數(shù)據(jù)庫概況二、檢索方法二、檢索方法（一）基本檢索（一）基本檢索（二）限制

9、檢索（二）限制檢索（三）高級(jí)檢索（三）高級(jí)檢索（四）主題詞庫（四）主題詞庫（五）更多資源（五）更多資源三、檢索結(jié)果管理三、檢索結(jié)果管理第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫一、數(shù)據(jù)庫概況一、數(shù)據(jù)庫概況 美國國立醫(yī)學(xué)圖書館美國國立醫(yī)學(xué)圖書館 (nlm) (nlm) national library of medicine national library of medicine 國家生物技術(shù)信息中心國家生物技術(shù)信息中心 (ncbi) (ncbi) national center for biotechnology information national center for biotechno

10、logy information pubmed pubmed提供生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)書目信息的數(shù)據(jù)庫。提供生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)書目信息的數(shù)據(jù)庫。 1997 1997年年6 6月在互聯(lián)網(wǎng)上免費(fèi)開放（包含月在互聯(lián)網(wǎng)上免費(fèi)開放（包含medlinemedline數(shù)據(jù)庫）。數(shù)據(jù)庫）。 數(shù)據(jù)量達(dá)數(shù)據(jù)量達(dá)2,3002,300多萬條，部分記錄還可直接在網(wǎng)上免費(fèi)獲得全文。多萬條，部分記錄還可直接在網(wǎng)上免費(fèi)獲得全文。 是基于網(wǎng)絡(luò)的生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng)，是是基于網(wǎng)絡(luò)的生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng)，是entrezentrez的一個(gè)組成部分。的一個(gè)組成部分。e n t r e z 系 統(tǒng)系 統(tǒng)pubmed網(wǎng)址網(wǎng)址http:/www.ncbi.

11、/sites/entrez/entrez/query.fcgihttp:/http:/ pubmed的構(gòu)成的構(gòu)成1. medline1. medline（1946-1946-，含，含oldmedlineoldmedline轉(zhuǎn)來的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)來的數(shù)據(jù) ）2. nlm2. nlm正在加工、評(píng)審和標(biāo)引的數(shù)據(jù)正在加工、評(píng)審和標(biāo)引的數(shù)據(jù)3. 3. 出版商最新提供、尚未確定出版商最新提供、尚未確定medlinemedline是否收錄的數(shù)據(jù)是否收錄的數(shù)據(jù)4. oldmedline4. oldmedli

12、ne（1946-19651946-1965，尚未轉(zhuǎn)入，尚未轉(zhuǎn)入medlinemedline的數(shù)據(jù)）的數(shù)據(jù)）5. medline5. medline不予收錄的各種數(shù)據(jù)不予收錄的各種數(shù)據(jù) 第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、檢索方法二、檢索方法（一）基本檢索（一）基本檢索1. 自動(dòng)詞語匹配（自動(dòng)詞語匹配（automatic term mapping，atm） mesh translation table journals translation table full author translation table author index full investigator (collab

13、orator) translation table investigator (collaborator) index第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、檢索方法二、檢索方法（一）基本檢索（一）基本檢索2. 詞組檢索詞組檢索 智能擴(kuò)展檢索智能擴(kuò)展檢索 例如：輸入例如：輸入 lung cancerlung neoplasmsmesh terms or (lungall fields and neoplasmsall fields) or lung neoplasmsall fields or (lungall fields and cancerall fields) or lung can

14、cerall fields第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫查看詳細(xì)檢索式（查看詳細(xì)檢索式（search details）第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、檢索方法二、檢索方法（一）基本檢索（一）基本檢索2. 詞組檢索詞組檢索 強(qiáng)制檢索強(qiáng)制檢索 運(yùn)算符（運(yùn)算符（“” ） 例如例如 kidney allograft 執(zhí)行強(qiáng)制檢索時(shí)，系統(tǒng)自動(dòng)關(guān)閉執(zhí)行強(qiáng)制檢索時(shí)，系統(tǒng)自動(dòng)關(guān)閉atm功能；但如沒有結(jié)功能；但如沒有結(jié)果，系統(tǒng)會(huì)重新啟動(dòng)果，系統(tǒng)會(huì)重新啟動(dòng)atm功能功能第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、檢索方法二、檢索方法（一）基本檢索（一）基本檢索3. 截詞檢索截詞檢索 （*代表代表0

15、到任意個(gè)字符，到任意個(gè)字符，不不限于單詞，限于單詞，atm關(guān)閉）關(guān)閉）4. 布爾邏輯檢索布爾邏輯檢索 （and、or、not，左，左右，括號(hào)內(nèi)優(yōu)先）右，括號(hào)內(nèi)優(yōu)先）5. 字段限制檢索字段限制檢索 （，例如，例如 high blood pressureti）（一）基本檢索舉例（一）基本檢索舉例1. 關(guān)鍵詞或表達(dá)式檢索關(guān)鍵詞或表達(dá)式檢索:例例 robotics and cerebrovascular accident2. 著者姓名檢索著者姓名檢索: 例例 harvey b pollard 或或 pollard hb3. 限定字段檢索：限定字段檢索： 例例 pollardau 或或 asthmati

16、4. 刊名檢索刊名檢索: 例例 american journal of hypertension 或或 am j hypertens 或或 0895-70615.截詞檢索截詞檢索: 例例 myocardi* , cardio*第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫關(guān)鍵詞或邏輯表達(dá)式檢索舉例關(guān)鍵詞或邏輯表達(dá)式檢索舉例在此直接輸入著者檢索舉例著者檢索舉例在此直接輸入在此直接輸入 期刊檢索舉例期刊檢索舉例截詞檢索舉例截詞檢索舉例在此直接輸入第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、檢索方法二、檢索方法（二）限制檢索（二）限制檢索 原原limit功能，目前已經(jīng)歸入功能，目前已經(jīng)歸入“檢索結(jié)果管理檢索結(jié)

17、果管理”部分的部分的filters中，用中，用show additional filters可以設(shè)置全部限可以設(shè)置全部限定條件定條件二、檢索方法二、檢索方法（三）高級(jí)檢索（三）高級(jí)檢索（advanced） 包括包括 builder 和和 history 兩部分兩部分1. 構(gòu)建布爾邏輯檢索表達(dá)式（構(gòu)建布爾邏輯檢索表達(dá)式（builder）2. 檢索歷史（檢索歷史（ history ）3. 顯示索引列表（顯示索引列表（ show index list ）第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、檢索方法二、檢索方法（三）高級(jí)檢索（三）高級(jí)檢索（advanced）

18、 1. 構(gòu)建布爾邏輯檢索表達(dá)式（構(gòu)建布爾邏輯檢索表達(dá)式（builder）第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、檢索方法二、檢索方法（三）高級(jí)檢索（三）高級(jí)檢索（advanced） 2. 檢索歷史（檢索歷史（history）第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、檢索方法二、檢索方法（三）高級(jí)檢索（三）高級(jí)檢索（advanced） 3. 顯示索引列表（顯示索引列表（show index list）第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、檢索方法二、檢索方法（四）主題詞庫（四）主題詞庫（mesh database）主題詞和副主題詞主題詞和副主題詞 主題

19、詞主題詞標(biāo)記文獻(xiàn)的主題或重點(diǎn)，便于查全、查準(zhǔn)標(biāo)記文獻(xiàn)的主題或重點(diǎn)，便于查全、查準(zhǔn) mesh表表2013年共收主題詞年共收主題詞26,853（26 ,142）個(gè)。）個(gè)。 副主題詞副主題詞對(duì)主題詞進(jìn)行限定，描述某個(gè)主題范對(duì)主題詞進(jìn)行限定，描述某個(gè)主題范圍內(nèi)的某個(gè)方面，如藥物副作用、疾病的診斷、治療等。圍內(nèi)的某個(gè)方面，如藥物副作用、疾病的診斷、治療等。 mesh詞表目前共設(shè)副主題詞詞表目前共設(shè)副主題詞83個(gè)個(gè) 用副主題詞限定主題詞，提高檢索的準(zhǔn)確性（查準(zhǔn)率）。用副主題詞限定主題詞，提高檢索的準(zhǔn)確性（查準(zhǔn)率）。第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、檢索方法二、

20、檢索方法（五）更多資源（五）更多資源 1. 期刊數(shù)據(jù)庫期刊數(shù)據(jù)庫第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、檢索方法二、檢索方法（五）更多資源（五）更多資源 2. 臨床咨詢臨床咨詢 clinical study categories systematic reviews medical genetics 第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫二、檢索方法二、檢索方法（五）更多資源（五）更多資源 3. 特定文獻(xiàn)檢索特定文獻(xiàn)檢索第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫三、檢索結(jié)果管理三、檢索結(jié)果管理（一）檢索結(jié)果的顯示（一）檢索結(jié)果的顯示（display settings）（二）檢索結(jié)果的分組篩選（二

21、）檢索結(jié)果的分組篩選（filters）（三）檢索結(jié)果的保存及其他輸出方式（三）檢索結(jié)果的保存及其他輸出方式（send to）（四）其他輔助功能（四）其他輔助功能第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫三、檢索結(jié)果管理三、檢索結(jié)果管理（一）檢索結(jié)果的顯示（一）檢索結(jié)果的顯示（display settings） 1. 顯示格式顯示格式 2. 每頁顯示數(shù)量每頁顯示數(shù)量 3. 排序排序免費(fèi)全文免費(fèi)全文全文鏈接全文鏈接第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫三、檢索結(jié)果管理三、檢索結(jié)果管理（二）檢索結(jié)果的分組篩選（二）檢索結(jié)果的分組篩選（filters） 1. 文獻(xiàn)類型（文獻(xiàn)類型（article types

22、） 2. 出版日期（出版日期（publication dates） 3. 文獻(xiàn)可獲取性（文獻(xiàn)可獲取性（text availability） 4. 物種（物種（species） 5. 顯示更多篩選條件（顯示更多篩選條件（show additional filters）filters檢索結(jié)果的分組篩選檢索結(jié)果的分組篩選第二節(jié)第二節(jié) pubmed數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫三、檢索結(jié)果管理三、檢索結(jié)果管理（三）檢索結(jié)果的保存及其他輸出方式（三）檢索結(jié)果的保存及其他輸出方式（send to）clipboard剪貼板剪貼板用于臨時(shí)存儲(chǔ)檢索結(jié)果，可以多次存入用于臨時(shí)存儲(chǔ)檢索結(jié)果，可以多次存入系統(tǒng)允許剪貼板最多容納系統(tǒng)允許

23、剪貼板最多容納500條記錄條記錄停止操作停止操作8小時(shí)后剪貼板中記錄將丟失小時(shí)后剪貼板中記錄將丟失便于集中存儲(chǔ)和打印便于集中存儲(chǔ)和打印find related datafind related data等其他功能等其他功能三、檢索結(jié)果管理三、檢索結(jié)果管理（四）其他輔助功能（四）其他輔助功能 results by year pmc images search for cardio* titles with your search terms free full-text articles in pubmed central find related data search details recent activitymy ncbimy ncbi練習(xí)題練習(xí)題 1. 1. 在在ovid medline(r) in-process & other non-indexed ovid medline(r) in-process & other non-indexed citationscitations中能否用主題詞檢索？為什么？中能否用主題詞檢索？為什么？ 2. 2. 用用pubmedpubmed檢索檢索“