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文檔簡(jiǎn)介
1、畢赤酵母的培養(yǎng) 巴斯德畢赤酵母是甲醇營(yíng)養(yǎng)型酵母中的一類能夠利用甲醇作為唯一碳源和能源的酵母菌。與其它酵母一樣,在無(wú)性生長(zhǎng)期主要以單倍體形式存在,當(dāng)環(huán)境營(yíng)養(yǎng)限制時(shí),常誘導(dǎo)2個(gè)生理類型不同的接合型單倍體細(xì)胞交配,融合成雙倍體。比赤酵母表達(dá)常用的培養(yǎng)基:1 LB培養(yǎng)基 胰蛋白胨 1% 酵母粉 0.5% 氯化鈉 1% PH 7.0-大腸桿菌培養(yǎng) 制作平板加入2%的瓊脂粉,121攝氏度20分鐘,可于室溫保存。 用于培養(yǎng) pPICZ A 原核宿主菌 TOP10F時(shí)可加入 Zeocin 25ug / mL(博來(lái)霉素,抗菌素)宿主細(xì)胞His- -誘變?cè)斐傻?。MD-酵母轉(zhuǎn)化篩選培養(yǎng)基(營(yíng)養(yǎng)缺陷型His-)13.
2、4g/L酵母基本氮源;0.4mg/L生物素;20g/L葡萄糖用于表達(dá)的畢赤酵母都屬于組氨酸缺陷型的只有染色體上成功整合入重組質(zhì)粒載體基因的畢赤酵母菌株才能在組氨酸缺失的MD培養(yǎng)基生長(zhǎng),以此篩選出重組子。MM-酵母轉(zhuǎn)化進(jìn)一步篩選培養(yǎng)基僅能滿足微生物野生型菌株生長(zhǎng)需要的培養(yǎng)基,成為基本培養(yǎng)基(minimal medium,MM),有時(shí)用符號(hào)“ ”來(lái)表示。不同微生物的基本培養(yǎng)基是不相同的。2 LLB 培養(yǎng)基 胰蛋白胨 1% 酵母粉 0.5% 氯化鈉 0.5% PH 7.0制作平板時(shí)加入 2瓊脂粉。 121高壓滅菌 20min。 可于室溫保存數(shù)月。 用于培養(yǎng) pPICZ A 原核宿主菌 TOP10F時(shí)
3、,加入 Zeocin 25ug / ml,可以 4條件下保存 12 周. 3 YPD培養(yǎng)基 酵母粉1%,胰蛋白胨2%,葡萄糖2%,固體加2%的瓊脂粉,YPD 培養(yǎng)基可常溫保存,是畢赤酵母的最基本培養(yǎng)基,瓊脂 YPD 平板在 4可保存 幾個(gè)月。加入 Zeocin 100ug / ml,成為 YPDZ 培養(yǎng)基,可以 4條件下保存 12 周。4 BMGY培養(yǎng)基 酵母粉1% 蛋白胨2%, 磷酸鉀緩沖溶液平PH 6 100mmol/L YNB(酵母氮源)1.34% 生物素(4×10 -5 )%甘油1%,畢赤酵母誘導(dǎo)表達(dá)前培養(yǎng)基,YNB和Biotin過(guò)濾除菌。培養(yǎng)24小時(shí)后,一 般靜置
4、過(guò)夜,待酵母沉淀后倒掉BMGY培養(yǎng)基,改換BMMY培養(yǎng)基,進(jìn)入誘導(dǎo)表達(dá)階段。5 BMMY培養(yǎng)基 酵母粉1% 蛋白胨2%,磷酸鉀緩沖溶液平PH 6 100mmol/L YNB 1.34% 生物素(4×10 -5 )% 甘油1% 甲醇3%,畢赤酵母誘導(dǎo)表達(dá)培養(yǎng)基,YNB和Biotin過(guò)濾除菌。搖瓶培養(yǎng)時(shí)每24小時(shí) 之后加入3%的甲醇誘導(dǎo),一般誘導(dǎo)72小時(shí)。6 YPDS + Zeocin 培養(yǎng)基 酵母粉1% 蛋白胨2% 葡萄糖2%,山梨醇1M, 瓊脂2%,博來(lái)霉素100mg/ml 不管是液體 YPDS 培養(yǎng)基,還是 YPDS + Zeocin 培養(yǎng)基,都必須存放 4條件下,有效
5、1-2周。7 MGY培養(yǎng)基 34%YNB,1%甘油,4×10 -5 %生物素,將 800ml 滅菌水、100ml 的 10*YNB 母液、2ml 的 500*B 母液和 100ml 的 10*GY 母液混勻即可,4保存,保存期為 2 個(gè)月。8 MGYH培養(yǎng)基 MGY培養(yǎng)基+0.004%的組氨酸 MGYH 在 1000ml 的 MGY 培養(yǎng)基中加入 10ml 的 100*H 母液混勻,4保存,保存期為 2 個(gè)月。9 RD -5 Regeneration Dextrose Medium (葡萄糖再生培養(yǎng)基) (含有:1mol/L 的山梨醇;2%葡萄糖;1.34%YNB;4*10 %生物素
6、;0.005%氨基酸) (1). 將 186g 的山梨醇定容至 700ml,高壓滅菌;( 2). 冷卻后于 45水?。?(3). 將 100ml 的 10*D、100ml 的 10*YNB;2ml 的 500*B;10ml 的 100*AA 等母液和 88ml 無(wú)菌 水混勻,預(yù)熱至 45后,與步驟 2 的山梨醇溶液混合。4保存。 10 RDH Regeneration Dextrose Medium + Histidine (葡萄糖再生培養(yǎng)基 + 0.004%組氨酸) 在 RD 培養(yǎng)基配制的第三步中,在加入 10ml 的 100*H 母液,同時(shí)無(wú)菌水的體積減少至 78ml 即可,其余配制方法與
7、 RD 相同。4保存。11 RD 及 RDH 平板的制備 1. 將 186g 的山梨醇和 1520g 瓊脂粉定容至 700ml,高壓滅菌;冷卻后于 60水??; 2. 參照 RD/RDH 液體培養(yǎng)基配制的步驟 4, 100ml 的 10*D、 將 100ml 的 10*YNB; 的 500*B; 2ml 10ml 的 100*AA 等母液、 (10ml 的 100*H 母液)和 88(78)ml 無(wú)菌水混勻,預(yù)熱至 45 后,與步驟 1 的山梨醇/瓊脂液混勻; 3. 迅速制備平板。4可保存數(shù)月。12 RD 及 RDH 的 TOP 瓊脂的制備(常用于酵母菌的包被) 瓊脂的制備(常用于酵母菌的包被)
8、 (1).將 186g 的山梨醇和 7.510g 瓊脂粉定容至 700ml,高壓滅菌;冷卻后于 60水浴; 瓊脂粉 60 (2).參照 RD/RDH 液體培養(yǎng)基配制的步驟 4, 100ml 的 10*D、 將 100ml 的 10*YNB; 的 500*B; 2ml 10ml 的 100*AA 等母液、 (10ml 的 100*H 母液)和 88(78)ml 無(wú)菌水混勻,預(yù)熱至 45后, 與步驟 1 的山梨醇/瓊脂液混勻; (3).將該 TOP 瓊脂置于 45水浴冷卻、保溫,備用。13 MD 與 MDH -5 Minimal Dextrose Medium +(Histidine) 最小葡萄糖
9、培養(yǎng)基 +( 0.004 %組氨酸) (含有:1.34%YNB; ;4*10 % 生物素;2%葡萄糖) 1. 100ml 的 10*YNB;2ml 的 500*B 和 100ml10*D 母液,用 800ml 的無(wú)菌水定容至 1000ml 即可; 2. 如配制 MDH,可在上述的 MD 中加入 10ml 的 100*H 即可; 3. 如配制平板,可無(wú)菌水的滅菌前,加入 1520g 的瓊脂。4可保存數(shù)月。14 SOC 培養(yǎng)基: 培養(yǎng)基: Trypton Yeast Extract NaCl Glucose (1mol / L) 121高壓滅菌 20min,冷卻后,4保存。 l 0.5 0.05
10、2% 母液的配置注: 母液的配置注: 10*YNB (含有硫酸銨、無(wú)氨基酸的 13.4%酵母基礎(chǔ)氮源培養(yǎng)基) 4保存。34g 酵母 基礎(chǔ)氮源培養(yǎng)基(無(wú)硫酸銨)+100g 硫酸銨,溶于 1000ml 水中,過(guò)濾除菌。 500*B (0.02%生物素 Biotin) 4保存 保存期為 1 年。20mg 的生物素 溶于 100ml 水中,過(guò)濾除菌。 100*H (0.4%Histidine 組氨酸) 4保存 保存期為 1 年。400mg 的 L-組氨酸溶于 100ml 水中, (加熱至 50以促進(jìn)溶解) ,過(guò)濾除菌。 10*D (20%Dextrose 葡萄糖) 保存期為 1 年。200g 葡萄糖溶
11、于 1000ml 水中,滅 菌 15min 或過(guò)濾除菌。 10*M 過(guò)濾除菌。 (5%Methanol 甲醇) 保存期為 2 個(gè)月。將 5ml 的甲醇與 95ml 水混勻, 10*GY (10%Glycerol 甘油) 保存期為 1 年以上。將 100ml 甘油和 900ml 水混勻 后,高壓滅菌或過(guò)濾除菌。 100*AA 過(guò)濾除菌。 (0.5% of each Amino Acid,各種氨基酸) 4保存 保存期為 1 年。分 別將 500mg 的 L-谷氨酸、L-蛋氨酸、L-賴氨酸、L-亮氨酸和 L-異亮氨酸溶于 100ml 水中, 1M 磷酸鉀溶液(potassium phosphate
12、buffer,pH6.0) ,將 1mol/L 的 K2HPO4 溶液 132ml 與 1mol/L 的 KH2PO4 溶液 868ml 混勻,其 pH 為 6.0,如需調(diào)節(jié) pH,則使用磷酸和氫氧化鉀調(diào)節(jié) pH。10*YNB:34g 酵母 基礎(chǔ)氮源培養(yǎng)基(無(wú)硫酸銨)+100g 硫酸銨,溶于 1000ml 水中,過(guò)濾除菌。 500*B (0.02%生物素 Biotin) 4保存 保存期為 1 年。20mg 的生物素 溶于 100ml 水中,過(guò)濾除菌。 100*H (0.4%Histidine 組氨酸) 4保存 保存期為 1 年。400mg 的 L-組氨酸溶于 100ml 水
13、中, (加熱至 50以促進(jìn)溶解) ,過(guò)濾除菌。10*D (20%Dextrose 葡萄糖) 保存期為 1 年。200g 葡萄糖溶于 1000ml 水中,滅 菌 15min 或過(guò)濾除菌。10*M (5%Methanol 甲醇) 保存期為 2 個(gè)月。將 5ml 的甲醇與 95ml 水混勻,過(guò)濾除菌。 10*GY (10%Glycerol 甘油) 保存期為 1 年以上。將 100ml 甘油和 900ml 水混勻 后,高壓滅菌或過(guò)濾除菌。 100*AA 過(guò)濾除菌。 (0.5% of each Amino Acid,各種氨基酸) 4保存 保存期為1 年。分 別將 500
14、mg 的 L-谷氨酸、L-蛋氨酸、L-賴氨酸、L-亮氨酸和 L-異亮氨酸溶于 100ml 水中過(guò)濾除菌。 1M磷酸鉀溶液(potassium phosphate buffer,pH6.0) ,將 1mol/L 的 K2HPO4 溶液 132ml 與 1mol/L 的 KH2PO4 溶液 868ml 混勻,其 pH 為 6.0,如需調(diào)節(jié) pH,則使用磷酸和氫氧化鉀調(diào)節(jié)pH。畢赤酵母表達(dá)常用載體: 典型的巴斯德畢赤酵母表達(dá)載體載體包含醇氧化酶1(AOX1)基因的啟動(dòng)子 和轉(zhuǎn)錄終止子(5'AOX1 和 3'AOX1) ,它們被多克隆位點(diǎn)(MCS)分開(kāi),外源基 因可以在此插入。此載體還
15、包含組氨醇脫氫酶基因(HIS4)選擇標(biāo)記及 3'AOX1 區(qū)。當(dāng)整合型載體轉(zhuǎn)化受體時(shí),它的 5'AOX1 和 3'AOX1 能與染色體上的同源基因重組,從而使整個(gè)載體連同外源基因插入到受體染色體上, 外源基因在 5'AOX1 啟動(dòng)子控制下表達(dá)。畢赤酵母本身不分泌內(nèi)源蛋白,而外源蛋白的分泌需要具有引導(dǎo)分泌的信號(hào)序列。而由 89 個(gè)氨基酸組成的釀酒酵母的分泌信號(hào) 交配因 子(-factor)引導(dǎo)序列已經(jīng)成功地引導(dǎo)了幾種外源蛋白的分泌。 分泌表達(dá)載體主要有:pPIC9,pPIC9K,pHIL-S1,pPICZ A,pYAM75P 等。胞內(nèi)表達(dá)載體主要 有 : pHIL
16、-D2 , pA0815 , pPIC3K , pPICZ , pHWO10 , pGAPZ , pGAPZa(Invitrogen), pPIC3.5K 等。工程菌株 Y11430,MG1003,GS115 (AOX1) KM71, , SMD1168。 畢赤酵母宿主菌常用的有 GS115 和 KM71 兩種, 都具有 HIS4 營(yíng)養(yǎng)缺陷標(biāo)記。其中,GS115 茵株具有 AOX1 基因,是 Mut,即 表型為 Muts, 甲醇利用正常型; KM71 菌株的 AOX1 位點(diǎn)彼 ARG4 基因插入, 而 即甲醇利用緩慢型,兩種菌株都適用于一般的酵母轉(zhuǎn)化方法。多拷貝表達(dá)菌株的 獲得方式: 與自主復(fù)
17、制的質(zhì)粒型表達(dá)載體不同,整合型表達(dá)載體的拷貝數(shù)可以 有很大的變化。含多拷貝外源基因的表達(dá)菌株合成蛋白的量也較多。體內(nèi)整合可 通過(guò)高遺傳霉素抗性,篩選可能的多拷貝插入;而體外整合可通過(guò)連接產(chǎn)生外源 基因的串聯(lián)插入。多拷貝表達(dá)菌株的獲得方式有兩種:一種是利用 SDS-PAGE 電泳、免疫雜交或菌落點(diǎn)雜交方法在大量的轉(zhuǎn)化子中進(jìn)行自然篩選。得到產(chǎn)量高 的表達(dá)菌株。另一種在轉(zhuǎn)化前將多個(gè)表達(dá)盒拷貝插入到單個(gè)載體中,而后再通過(guò)交換整合到受體染色體上。表達(dá)蛋白純化方法: 酵母系統(tǒng)表達(dá)的蛋白一般都具 有活性,所以都采用較溫和的純化方式來(lái)純化目的蛋白,分泌型表達(dá)的蛋白有利 于純化,可用硫酸銨沉淀,然后用離子交換,凝膠過(guò)濾層析,疏水層析等方法進(jìn) 一步純化。具體的方法和操作應(yīng)按所處理的目的蛋白的性質(zhì)選擇。2. 畢赤酵母利用的優(yōu)缺點(diǎn)分析 Pichia.pastoris酵母菌體內(nèi)無(wú)天然質(zhì)粒,所以表達(dá)載體需與宿主染色體發(fā)生同源重組,將外源基因表達(dá)框架整合于染色體中以實(shí)現(xiàn)外源基因的表達(dá)。包括啟動(dòng)子、外源基因克隆位點(diǎn)、終止序列、篩選標(biāo)記等。表達(dá)載體都是穿梭質(zhì)粒,先在大腸桿菌復(fù)制擴(kuò)增
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