基于微衛(wèi)星和SNPs的草魚連鎖圖譜的共識A

1、 1. 基于微衛(wèi)星和SNPs的草魚連鎖圖譜的共識=A consensus linkage map of the grass carp (Ctenopharyngodon idella) based on microsatellites and SNPs關鍵詞 草魚；微衛(wèi)星；SNPs草魚是世界水產(chǎn)業(yè)淡水食用魚最重要品種之一。連鎖圖譜是是理解基因組進化的第一步。這項研究的目的是使用微衛(wèi)星和SNPs來生成映射重要經(jīng)濟性狀的QTL的新資源，并進行比較映射分析，闡明魚的基因組進化的新觀點，建立第一代草魚的遺傳圖譜。此圖提供了測繪表型變異的寶貴資源，并作為比較基因組學的參考方法，理解魚類基因組的進化，可以

2、補充草魚基因組測序項目。（，2010）2. 微衛(wèi)星DNA標記揭示的緬甸卷須鯪養(yǎng)殖群體和野生群體中的遺傳群體結構=Microsatellite DNA markers revealed genetic population structure among captive stocks and wild populations of mrigal, Cirrhinus cirrhosus in Myanmar關鍵詞 遺傳多樣性；卷須鯪；Cirrhinus cirrhosus；緬甸；水產(chǎn)養(yǎng)殖 采用微衛(wèi)星DNA標記研究了在緬甸卷須鯪的遺傳多樣性和種群結構。5個野生種群的211個個體和5個孵化場的216

3、個個體用6個微衛(wèi)星位點分析（Bgon22，LR3的，Lr12，Lr21，MFW1和MFW17）。作為對照，對來自越南北部一個孵化場的43個個體進行了分析。所有基因座的測試結果顯示只有兩個孵化場的樣本符合H W平衡。成對Fst的多維標度分析（MDS）和貝葉斯分析的結果顯示，來自緬甸的一個野生群和兩個孵化場的樣本與其它的高度摻和的樣本區(qū)別開來。（Aquaculture，299：3743，2010）3. 多起源大西洋鮭在塞納河的自然再繁殖=Natural recolonization of the Seine River by Atlantic salmon (Salmo salar) of mul

4、tiple origins關鍵詞淡水生態(tài)學；方法與技術；群體遺傳學；野生動物管理先前滅絕鮭魚種群的恢復常常是用放養(yǎng)計劃實現(xiàn)的，但是自然再繁殖還可以通過個體從附近種群的離群而實現(xiàn)。我們研究了新近再繁殖的塞納河的大西洋鮭(Salmo salar)的起源。河流的退化已經(jīng)導致了種群的滅絕，但自20世紀90年代起，水質(zhì)量已經(jīng)大幅改善。盡管還沒有種群形成，但最近視頻計數(shù)設備觀察到了162條鮭魚。7條魚用于形態(tài)學和遺傳學分析樣品。這些個體以17個微衛(wèi)星標記來基因分型，利用來自本地和遠處群體的基線樣本來確定他們最可能的種群起源。樣本個體中四個是幼鮭，三個是在多個海越冬的魚。遺傳分析顯示，這些魚一部分起源于附近

5、的一個種群，也有一部分源于遠的種群。根據(jù)群體持續(xù)性和管理討論了這個大河流被多起源遷移者的自然再繁殖。（Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences，67（1）：1-4，2010）4. 水生型呼吸空氣的黃曼龍鰓中 Na+/K+- ATP酶和V型H+-ATP酶的鹽度變化=Na+/K+-ATPase and vacuolar-type H+-ATPase in the gills of the aquatic air-breathing fish Trichogaster microlepis in response to salinity v

6、ariation關鍵詞Na+/K+- ATP酶；V型H+-ATP酶；滲透調(diào)節(jié)；黃曼龍水生型呼吸空氣的魚，黃曼龍（Trichogaster microlepis），生活在淡水和河口。我們評價了鰓中重要的滲透調(diào)節(jié)酶Na+/K+- ATP酶和V型H+-ATP酶在經(jīng)受去離子水(DW)，淡水(FW)和半咸水（鹽度10 g/L）時的變化。從免疫組化結果，我們發(fā)現(xiàn)三種不同的細胞群：（1）神經(jīng)激肽A免疫反應(NKA-IR)細胞，（2）NKA-IR和HA - IR細胞（3）毛細胞。在DW和10 g/L鹽水處理時板層與層間區(qū)域中NKA - IR細胞顯著增加。在DW中只有層狀區(qū)域的HA-IR細胞顯著增加。在層間區(qū)域

7、，HA-IR 細胞數(shù)量在三種處理后并沒有區(qū)別。這些結果顯示黃曼龍在DW和鹽水處理后表現(xiàn)出滲透調(diào)節(jié)的能力。涉及離子調(diào)控的細胞類型也用免疫熒光染色進行了檢測；3種離子細胞發(fā)現(xiàn)與斑馬魚模型類似。（Comparative Biochemistry and Physiology, Part A， 155：309318，2010）5. 大西洋鮭種群的遺傳多樣性和有效群體大小的檢驗=An examination of genetic diversity and effective population size in Atlantic salmon populations關鍵詞群體遺傳學（種群研究）；野生生

8、物管理（保護）；檢驗This paper investigates genetic diversity and Ne ill four Populations of wild anadromous Atlantic salmon (Salmo salar L.) in Europe . To Improve understanding of high genetic diversity observed in the Populations with low effective size, we developed a model predicting present diversity as

9、 a function of past demographic history. This Suggested that high genetic diversity could be explained by a bottleneck Occurring within recent centuries rather than by gene flow. Previous Studies have demonstrated the efficiency of coalescence models to estimate Ne.（Genetics Research，91（6）: 395-412，

10、2009）6. 首次利用免疫相關的基因及病毒誘導蛋白基因進行的多基因基礎上鱖魚的的系統(tǒng)發(fā)生研究=Phylogenetic studies of sinipercid fish (Perciformes: Sinipercidae) based o n multiple genes, with first application of an immune-related gene, the virus-induced protein (viperin) gene.關鍵詞 免疫； 病毒誘導蛋白基因，鱖魚The sinipercid fish represent a group of 12 spec

11、ies of freshwater percoid fish endemic to East Asia. To date published morphological and molecular phylogenetics hypotheses of sinipercid fish are part congruent, and there are some areas of significant disagreement with respect to species relationships. The potential utilities of six different gene

12、s for phylogenetic resolution of closely related sinipercid species were also evaluated, with special interest in that of the novel virus-induced protein (viperin) gene. 2010 Elsevier Inc. All rights reserved.（Molecular Phylogenetics and Evolution，55（3）：1167-1176，2010）7. 錨泊線的疲勞損耗：單點系泊網(wǎng)籠系統(tǒng)的風險評估= Moor

13、ing line fatigue: A risk analysis for an SPM cage system關鍵詞錨泊線；風險評估；更換周期；疲勞失效；安全系數(shù)近年來，單點系泊（SPM）網(wǎng)籠系統(tǒng)因其良好的環(huán)保特性而廣受關注。但是諸如臺風、颶風一類的自然災害往往會對網(wǎng)籠系統(tǒng)的完整性造成危害。本實驗根據(jù)環(huán)境變量評估了網(wǎng)箱錨泊位置的風險系數(shù)。結果顯示直徑38mm的滌綸線的推薦更換周期為6.55年，當直徑增至50mm時，其安全系數(shù)增加0.5，更換周期延長至23.81年。（Aquacultural Engineering，42：8-16，2010)8. 魚類捕食行為對不同種質(zhì)采集器下紫貽貝種質(zhì)補充情

14、況的影響 = The role of fish predation on recruitment of Mytilus galloprovincialis on different artificial mussel collectors關鍵詞魚類捕食；紫貽貝；補充；避難所；人工采集器 魚類捕食貽貝幼體會干擾貽貝種質(zhì)數(shù)量的動態(tài)變化。本實驗中我們測量了魚類捕食行為存在和缺失時貽貝種質(zhì)密度的補充情況。結果顯示通常情況下魚類捕食行為的存在會降低貽貝種質(zhì)的補充密度，而在使用非絲狀環(huán)形繩時，捕食行為則沒有影響。此外，捕食行為不存在時，種質(zhì)補充密度不受采集器影響，但種質(zhì)數(shù)量可能受另一種因素影響，比如空間和

15、食物限制下的種內(nèi)競爭；而魚類捕食行為存在時，不同采集器下測得的種質(zhì)密度有明顯區(qū)別，這說明可以通過改變采集器的材質(zhì)和纏繞方式來增強貽貝幼體的附著強度，并為其營造躲避魚類捕食的避難所。（Aquacultural Engineering，42：25-30，2010)9. 蝦和石莼混養(yǎng)：一個降低人工飼養(yǎng)提高蝦質(zhì)量的選擇= Shrimp/Ulva co-culture: A sustainable alternative to diminish the need for artificial feed and improve shrimp quality關鍵詞混養(yǎng)；石莼；海藻；商業(yè)飼料；蝦體組成；類胡蘿

16、卜素摘要：本實驗測評了凡納濱對蝦幼體和石莼混養(yǎng)條件下不同喂養(yǎng)方式的效果，對照組為沒有石莼混養(yǎng)的對蝦幼體。結果顯示混養(yǎng)條件下水體的混濁度明顯降低。雖然存活率不存在差異，但混養(yǎng)時蝦體攝食石莼，提高了人工飼料的轉(zhuǎn)化率和生長率，而且減少了蝦體的脂質(zhì)含量，類胡蘿卜素含量也有明顯提高。（Aquaculture，301：6468，2010）10. 長期的高溫下養(yǎng)殖對紅螯螯蝦存活、發(fā)育和繁殖參數(shù)的影響=Effect oflong-term exposure to high temperature on survival, growth and reproductive parameters of the “r

17、edclaw” crayfish Cherax quadricarinatus關鍵詞紅螯螯蝦；性腺發(fā)育；繁殖參數(shù)；存活；溫度本實驗主要研究了溫度對紅螯螯蝦從性別分化早期到性成熟期間存活、發(fā)育和繁殖參數(shù)的影響。結果表明雄蝦和雌蝦在不同溫度（27和30）下的存活率無差別，而且高溫會誘導20%的雌蝦提前產(chǎn)卵和促進雄蝦的精子發(fā)生，但同時也會減緩雄蝦的生長。由此我們推斷長時間的30養(yǎng)殖利于雌蝦的卵巢成熟和產(chǎn)卵，但這并不利于雄蝦的性成熟，也會導致產(chǎn)量下降。（Aquaculture，302：49-56；2010）11. 脂肪酸作示蹤物研究魚類食譜和給食歷史=Unraveling diet and feedi

18、ng histories of fish using fatty acids as natural tracers 關鍵詞布氏棘鯛；食譜；脂肪酸；營養(yǎng)狀況；溫度；轉(zhuǎn)換率了解魚類給食史對解釋魚類棲息地的重要性有很大作用。本實驗嘗試利用脂肪酸作示蹤物來揭示魚類食譜與給食時期（代表食物轉(zhuǎn)化率）和溫度（代表代謝作用的影響）的關系。將魚體在不同溫度（16和23）下用兩種不同飼料分別喂養(yǎng)不同時間（7天和42天）。測試魚體不同脂肪酸成分，結果顯示脂肪酸總量受喂食飼料和喂食時長影響，但與溫度無關。這說明總脂肪酸量可以用作研究魚類給食史的示蹤物，進而研究魚類在棲息地間的遷徙情況。（Journal of Expe

19、rimental Marine Biology and Ecology，386 ：61-68，2010)12. 海洋雜魚可用作養(yǎng)殖魚類病毒的檢測來源=Trash fish can be a source of betanodaviruses for cultured marine fish 關鍵詞雜魚；軟體動物；betanodaviruses；海洋魚類；PCR本實驗采集了360例用作養(yǎng)殖海洋魚類飼料的雜魚和軟體動物，分別采取樣品的腦部或眼睛，利用RT-PCR和nested PCR技術檢測betanodaviruses（羅達病毒科的一種）外殼蛋白的基因。結果發(fā)現(xiàn)日本竹莢魚和日本魷對betanod

20、aviruses病毒檢測呈陽性，且兩者的nested PCR產(chǎn)物與RGNNV病毒基因型有98%相似性。將樣品上取得的betanodaviruses病毒注射進七組實驗魚體內(nèi)，發(fā)現(xiàn)魚體呈現(xiàn)明顯的病毒性神經(jīng)壞死，致死率高達90-100%。這說明雜魚和軟體動物可作為betanodaviruses病毒的取樣來源，并可以用作養(yǎng)殖魚類VNN病毒爆發(fā)的監(jiān)測點。（Aquaculture，302：158163，2010）13. 太平洋牡蠣的生殖成效與其對夏季死亡率感受性的關系=Reproductive effort of Pacific oysters: A trait associated with susce

21、ptibility to summer mortality關鍵詞 雙殼類軟體動物；太平洋牡蠣；繁殖；選擇品系；夏季死亡率太平洋牡蠣在夏季的死亡率是牡蠣種群、生存環(huán)境和寄生病原體共同作用的結果，這集中表現(xiàn)在其生殖狀況上。由于夏季死亡率影響表現(xiàn)為基因變異，所以利用雙向選擇培育抗性R和感性S品系，進行性腺的生理研究。結果顯示抗性品系的性腺面積明顯低于感性品系，而切片顯示兩者配子發(fā)生時期基本一致。這表明生殖成效與抗夏季死亡呈負相關。法國的太平洋牡蠣的夏季死亡率可能主要受繁殖引起生理紊亂和代謝失調(diào)影響，但也不排除其它因素，如病原體等。（Aquaculture，304：95-99，2010）14. 棲息地

22、大小、群居和共生行為：評價Betaeus lilianae 中的資源壟斷假說和與Platyxanthus crenulatus 的合作關系=Refuge size, group living and symbiosis: testing the “resource economic monopolization” hypothesis with the shrimp Betaeus lilianae and description of its partnership with the crab Platyxanthus crenulatus 關鍵詞經(jīng)濟壟斷；群居；棲息地范圍；蝦；共生棲息地大

23、小是控制海洋生物種群分布的主要因素，本實驗用潮間蝦Betaeus lilianae來驗證較大棲息地范圍內(nèi)的種群是群居性而非單個或成對生活，同時我們也考慮到該物種的生活史以及與其共生的一種蟹類Platyxanthus crenulatus。結果發(fā)現(xiàn)該蝦行群居生活，且種群更偏向于雌性的性別比率，這與棲息地大小無關。相對生長分析顯示雄蝦和雌蝦中主螯的異速生長為正向，且雄蝦的相對生長更快。以上結果表明Betaeus lilianae行群居生活，但交配系統(tǒng)既非一雌一雄的單配，也非隨機交配。（Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 389：85

24、-92，2010）15. 無機磷肥減少對Saugeye幼魚產(chǎn)量影響的實驗評估=Experimental evaluation of the impacts of reduced inorganic phosphorus fertilization rates on juvenile saugeye production關鍵詞saugeye；施肥；磷；浮游生物 為維持一定數(shù)量的幼魚而確定最佳施肥率時的藻類組分、水質(zhì)和浮游動物生物量仍然是一個難題。本實驗的目的是測定育種池中的磷含量（30g/L）高于需求量時是否會降低浮游動物生物量和魚苗的存活率。結果顯示在氮含量維持恒定的情況下，磷酸鹽的降低并未影

25、響saugeye幼魚的生長，也未影響浮游動物豐度，浮游植物生物量和物種組成也無較大差異。在鱸魚池中降低磷肥含量可能會避免高pH值、游離氨、低溶氧量、大型水生植物泛濫和高營養(yǎng)鹽水分的流失。（Aquaculture，304：22-33，2010）1. 芒果果肉的熱物性=Thermophysical properties of mango pulp (Mangifera indica L. cv. Tommy Atkins) 關鍵詞熱物性；密度；熱導率；熱容性在20-80下測定了水分含量在0.9-0.52 kg kg-1時芒果果肉的密度、熱容性和熱導率等理化性質(zhì)。獲得的實驗數(shù)據(jù)與多元線性模型計算的水

26、分含量和溫度函數(shù)值很好的擬合（解釋方差值> 99.1）。在一定條件范圍內(nèi)，水分含量比溫度更能影響所研究的理化性質(zhì)。(Journal of Food Engineering，97：563568，2010)2. 使用瞬時熱流探針法同時測量3種果汁的熱物性=Simultaneous estimation of the thermophysical properties of three kinds of fruit juices based on the measured result by a transient heat flow probe method關鍵詞熱導率；熱擴散系數(shù)；比熱；探

27、針法；果汁本文研究了三種果汁（葡萄汁、橙汁和菠蘿）在不同溫度（1050）和濃度(1050%）下的熱物性?；谀壳笆褂玫奶结樌碚摲椒ㄌ岢隽四芡瑫r測定熱物性的一種新方法。插入樣品后探針溫度變化通過熱傳導方程計算出，從而測定了溶液的兩個參數(shù)值。使用這些參數(shù)值，能夠測定每個樣品的熱導率和熱擴散系數(shù)。根據(jù)熱擴散系數(shù)的定義估算了每個樣品的比熱。通過濃度和溫度的函數(shù)表示了這些熱物性。(Journal of Food Engineering，96：607613，2010)3. 非躍變型枇杷果肉的冷害中所涉及的乙烯信號轉(zhuǎn)導因素=Ethylene signal transduction elements invo

28、lved in chilling injury in non-climacteric loquat fruit關鍵詞冷害；乙烯信號轉(zhuǎn)導；枇杷；非躍變果實；1 -甲基環(huán)丙烯枇杷是一種亞熱帶水果，一些栽培品種如洛陽青(LYQ)易受冷害（CI），而其他諸如白沙（BS）卻有抗性。雖然枇杷是非躍變果實、但乙烯卻具有調(diào)節(jié)冷害后熟的效果。因此，調(diào)查了乙烯信號對洛陽青和白沙品種水果冷害的作用。在成熟水果中分離、測定了三個乙烯受體基因、 一個CTR1類似基因和一個EIN3類似基因。這些基因在兩個品種的果實間表達都有差異。轉(zhuǎn)錄水平或者在水果生長時下降（兩個品種的EjERS1a蛋白和洛陽青的EjEIL1蛋白）或在水

29、果中間階段的衰退前增加（兩個品種的EjETR1、EjERS1b和EjCTR1蛋白和白沙的 EjEIL1蛋白）。收獲后在貯存期間主要品種的表達水平上有差異，而不是在表達模式上。 低溫下EjETR1、EjCTR1和EjEIL1基因表達增加，而洛陽青果實在冷害時EjETR1和EjEIL1基因表達顯著增加。經(jīng)乙烯處理、1 -甲基環(huán)丙烯（1-MCP）和低溫條件下這些基因表達都有差異，且證實乙烯具有調(diào)控枇杷果實冷害的作用。（Journal of Experimental Botany，61（1）：179190, 2010）4. 桃子收獲后赤霉素處理防止糠化的相關生理與分子變化=Physiological

30、and molecular changes associated with prevention of woolliness in peach following pre-harvest application of gibberellic acid關鍵詞赤霉素；桃；成熟度；冷藏；氣調(diào)；乙烯；凍害本文研究了桃子經(jīng)赤霉素（GA3）處理后在果實開始（T1）和結束（T2）軟化時、冷藏（CS）和氣調(diào)處理（CA/ CS）時，以及采摘后不噴灑赤霉素（對照）并冷藏時，果實的大小、重量、成熟度、糠化度及相關基因的表達和相關蛋白的變化。桃子不噴赤霉素且冷藏時：糠化度很大，囊泡運輸基因mRNA高豐度表達，細胞壁松

31、弛、乙烯合成和熱休克蛋白（HSPs）有關基因的mRNA低豐度表達。早期噴灑赤霉素不能延遲成熟但可誘導增加果實的大??；此外，經(jīng)冷藏后它可誘發(fā)呼吸躍變并防止產(chǎn)生糠化。經(jīng)赤霉素或氣調(diào)（CA/ CS）處理后引起細胞壁代謝、線粒體熱休克蛋白、1 -氨基環(huán)丙烷-1-羧酸氧化酶（ACCO）基因mRNA高豐度表達，從而阻止了糠化。赤霉素處理產(chǎn)生獨特的反應，引起HSP40-1er、HSP40-2er、HSPCTR2、-甘露糖苷酶和 -1-阿拉伯糖苷酶蛋白或基因高豐度表達。(Postharvest Biology and Technology，57：1926，2010)5. 類Thaumatin蛋白及其

32、對桃子冷害的保護作用=Thaumatin-like proteins and their possible role in protection against chilling injury in peach fruit關鍵詞桃；細胞壁蛋白；二維聚丙烯酰胺凝膠電泳；實時定量RTPCR；絮??；糠化桃子極易腐壞，在室溫下成熟后可迅速腐敗，但可以用冷藏減慢腐敗過程。使用二維聚丙烯酰胺凝膠電泳分析了兩個桃子品種的細胞壁蛋白組成及收獲后與冷藏（5下 3周）條件下總蛋白的組成。這兩個桃子品種為：Oded-白色、果肉柔軟、核不分離、早季栽培可以抗凍害； Hermoza-白色、果肉柔軟、核分離、中季栽培易受

33、冷害。貯藏后，通過氨基酸序列確定了細胞壁中分子量從18 kDa至60 kDa的多肽是類Thaumatin蛋白1的前體和類Thaumatin蛋白2的前體。實時定量RT-PCR分析表明，兩個品種在貯藏期間類Thaumatin蛋白1前體轉(zhuǎn)錄表達顯著。但是，在5下經(jīng)1周和2周冷藏后的，抗冷害的Oded品種其類Thaumatin蛋白1的前體轉(zhuǎn)錄水平比Hermoza品種明顯高。在抗性桃品種中類Thaumatin蛋白1前體的轉(zhuǎn)錄表達在前期積累表明，類Thaumatin蛋白1前體（或類Thaumatin蛋白2前體）可能與冷害下保護有關。雖然冷害敏感品種Hermoza的細胞壁中類Thaumatin蛋白表達到較高

34、的水平，但轉(zhuǎn)錄表達的動力學表明早期出現(xiàn)這種蛋白家族的轉(zhuǎn)錄可能參與保護核果發(fā)生冷害時劇烈的細胞壁結構變化，防止糠化的產(chǎn)生。(Postharvest Biology and Technology，57：7785，2010)6. 冷藏番茄果實的細胞壁代謝=Cell wall metabolism in cold-stored tomato fruit關鍵詞番茄；寒害；果實后熟；細胞壁；果膠酶本文研究了低溫對番茄果實細胞壁代謝的影響。在果實成熟階段收獲， 20下后熟1-12天或在3下儲存3個星期，然后在20下后熟。低溫對果實的后熟影響很小。果皮組織在果實儲存的2個星期中僅有少量的果膠溶解和解聚。在冷藏

35、中果膠酶（PG）的表達水平、果膠酶蛋白質(zhì)積累和組織中果膠酶活性都降低。果膠酶蛋白豐度和果膠酶活性的減低程度超過了果膠酶表達水平，這表明低溫影響轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)。低溫也使蘋果菌素1（LeEXP1）基因的表達減少，但蘋果菌素1蛋白積累水平?jīng)]有受到影響。 -半乳糖苷酶的活性在冷藏期間的冷凍果實中和早期的后熟期間最高，但-半乳糖苷酶基因的表達（TBG4）沒受影響。雖然低溫沒有影響果膠甲酯酶（PME）的活性，但冷藏水果組織中PME1基因表達較低。葡聚糖內(nèi)切酶（(EGase）的活性和葡聚糖內(nèi)切酶基因（Cel1）表達不受低溫影響。低溫對果膠酶的活性、蛋白質(zhì)積累、基因表達的顯著影響與果膠的溶解和解聚沒有必然聯(lián)系。(Postharvest Biology and Technology，57：106113，2010)7. 由共軛大豆油/玉米秸稈構成的生物復合材料的熱物性=Thermophysical properties of conjugated soybean oil/corn stover biocomposites關鍵詞再生資源；復合材料；豆油；玉米秸稈；天然纖維本文研究了共軛大豆油樹脂和玉米秸天然纖維作為新型“綠色”復合材料。玉米